Examen cytobactériologique urinaire (ECBU)

18 juin 2009 Michelle BOYER

L’examen cytobactériologique urinaire (ECBU) est l’analyse bactériologique la plus fréquemment pratiquée au laboratoire.

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Indications• Situations d’infection urinaire (IU) sauf

cystites aiguës simples d’évolution favorable.

• Dépistage des colonisations: grossesse,

chirurgie urinaire.

= 18€90

NOMENCLATURE DES ACTES DE BIOLOGIE MEDICALE

Etapes de l’ECBU: • Prélèvement, conservation

• Examen direct (cellules, bactéries)

• Culture, compte de germes.

1- Prélèvement, conservation

• L’urine est normalement stérile.

• Facilement contaminée par la flore commensale.

• Toilette, élimination du 1er jet.

• Flacon stérile

• Temps de stase ( au moins 4h)

• Problème des patients incontinents

• Recueil chez l’enfant: milieu de jet, poches

(= collecteur) à urines, moins de 30 mn

• 2h à température ambiante

• 24h à +4°

• Jusqu’à 48h en flacon + borate

Sinon:

• Modification du compte de germe

• Altération des cellules

2 - Examen direct Cytologie - bactériurie

Etape capitale pour le dépistage et le diagnostic rapide (Afssaps)

Résultat en urgence ( Pédiatrie)

Leucocyturie et hématurie:• mesure microscopique

• ou automatique

Mesure quantitative

Le seuil normal de la leucocyturie est de:

10/mm3 ou 104/ml

Si le comptage est automatisé, normes fabricant: ex: 25/mm3 adulte, 10/mm3 enfant

Le seuil de l’hématurie est de:

10/mm3 ou 104/ml

Si le comptage est automatisé, normes fabricant: ex: 20/mm3 adulte, 10/mm3 enfant

Autres éléments: Résultat semi-quantitatif• Cellules épithéliales• cristaux• Cylindres• Parasites

Bactériurie:

Résultat semi-quantitatif

• Par microscopie (coloration de Gram)

• ou automate + microscopie

Le seuil de détection est de 105 UFC/ml

identique pour les 2 techniques (microscopique ou automatique)

La coloration de Gram donne une orientation

sur le type de bactérie

Exemples:

Bacilles gram négatif polymicrobien

• La présence de bactéries:

Si + : ≥ 105 UFC/ml → Gram pour orientation du traitement

Si - : < 105 UFC/ml, mais IU possible!

Si flore variée (± cellules épithéliales): contamination

• La présence de leucocytes:

en faveur d’une IU si ≥ 10/mm3 ou ≥ 104 /ml +/- cylindres leucocytaires et amas de

leucocytes ( pyurie)

Mais…

La leucocyturie peut être absente au cours d’authentiques IU:

- prélèvement très précoce

- patients neutropéniques

- enfant de moins de 3 mois

- lyse des leucocytes (conservation)

Inversement…

La leucocyturie peut être présente et non spécifique d’IU:

ex: urétrite, vulvo-vaginite, maladie inflammatoire (Kawasaki), porteur de sonde, vessie neurologique…

• L’absence de leucocyturie et de bactériurie a une excellente valeur prédictive négative ( proche de 100%)

• La valeur prédictive positive est médiocre.

3 - Culture, identification, numération, antibiogramme

La culture est nécessaire pour:

• Préciser l’espèce bactérienne (IU mono ou bimicrobienne)

• Réaliser l’antibiogramme

Palmarès des bactéries ( CH de Roanne):

• Escherichia coli 50%

• Enterococcus sp. 10%

• Proteus mirabilis 5%

• Klebsiella pneumoniae 5%

La numération de germes en UFC/ml est nécessaire à l’interprétation.

Plusieurs seuils en fonction de la forme clinique et de l’espèce bactérienne.

• ≥ 103 UFC/ml: cystites aiguës à E.coli et

autres entérobactéries ou Staph. saprophyticus.

• ≥ 105 UFC/ml: cystites à autres bactéries ( entérocoque)

• ≥ 104 UFC/ml: pyélonéphrites et prostatites

Interprétation de l’ECBU:

doit prendre en compte

• L’état clinique du patient

(enfant < 3mois, personne âgée…)

• Les conditions de réalisation du prélèvement.

• L’existence d’une antibiothérapie.

Cas particuliers:

Symptômes urinaires + bactériurie à l’examen direct + culture stérile:

→ UI décapitée ( traitement ATB)

→ bactérie difficile à cultiver (ex:anaérobie)

Si la leucocyturie est présente + absence de bactériurie à l’examen direct + culture stérile:

→ tuberculose

→ traitement antibiotique

Prudence:

Si la leucocyturie est absente et la bactériologie significative:

→ IU chez le jeune enfant,

→ IU chez le neutropénique,

→ IU lorsque le prélèvement est très précoce

Très souvent:

Chez une femme: nombreuses cellules épithéliales + bacilles Gram positif (lactobacilles) à l’examen direct + culture

(103 ou 104 UFC/ml) flore polymorphe :

→ contamination vaginale