Global Biodiversity Information Facility GLOBAL BIODIVERSITY INFORMATION FACILITY Beatriz Torres Senior Prog. Off. - Outreach and Cap. Building Identification

Global Biodiversity Information Facility

GLOBALBIODIVERSITY

INFORMATIONFACILITY

Beatriz Torres Senior Prog. Off. - Outreach and Cap.

Building

Identification d’une strategie pour le partenariat CHM pour le periode 2008-

2012 Bruxelles, 2-3 mai 2007

WWW.GBIF.ORG

Contribution du GBIF à le reforcement des

capacités et utilisation des donnés

pour le “decision-making”


Sommaire:Sommaire:

Le GBIF: mission, objectives, developments actuelles, collaborations.

Examples: utilisation de donnés pour la science et ”decision-making”

Ideés pour la construction de synergies et collaboration avec les CHM Belgiques et partenaires.


Defi: donnés peu utile si c’est ne pas accessibleDefi: donnés peu utile si c’est ne pas accessible

L’information sur la biodiversité est dispersée dans la littérature et sur des milliard de publications, projects, etiquettes dans des centaines d’institutions partout dans le monde

Liée au papier, elle doit être digitalisée pour redevenir utile et pertinente

Donnés peu utile si c’est ne pas accessible


Systeme mondiale d’information sur la biodiversité (GBIF)

Systeme mondiale d’information sur la biodiversité (GBIF)

Creé 2001 pour rendre les données scientifiques relatifs à la biodiversité librement et universellement disponible, (sous forme digitalisée) à travers Internet.

Moyen: Créer des systèmes

interopérables, formant ainsi un réseau distribué de base de données


GBIF: Un effort conjointGBIF: Un effort conjoint

Un projet scientifique coopératif entre pays, économies et organisations internationales

Pour libérer les donnés ->Principalement au niveau des espèces et des spécimens

Pour établir des liens avec les niveaux moléculaires, génétiques et écosystémiques.

Liens avec publications


GBIF travailGBIF travail

A ce jour, 198 fournisseurs de données, 1037 collections ou

dispositifs d’observation

connectés représentant

121 millions de données

disponibles.


Bases de données

hétérogènes

Web Services

Données structurées et standardisées

Utilisateur

GBIF.net

requete/reponse

requete/reponse

requete/reponse

Internet


GBIF dans l’Afrique et l’AsieGBIF dans l’Afrique et l’Asie

Membre Votant Membre Associé

Guinée Equatorial Benin, Burkina Faso, Cameroun, Guinée, Madagascar, Maroc

Afrique du Sud, Tanzania Ghana

Japan, Koree Inde, Indonesie, Pakistan, Philippines, PNG

Organisations: ASEAN, ASEANET, BIOnet, EASIANET, ICIPE, OBIS-Fishbase, UICN


Clarifications necessaire:Clarifications necessaire:

Le GBIF n’est pas une énorme base de données centrale qui stocke tout sur des serveurs à Copenhague !

GBIF est basé sur un système distribué relié à un portail central (www.gbif.net) et des portails locaux, interrogeant les données à distance !

Les données restent en local et sous le contrôle et la responsabilité totale de leur propriétaire (Data Provider(s) or Owners)


Ouvert à tousOuvert à tous

Tout pays peut devenir membre votant s’il accepte de:

Signer l’entente multilatérale (MoU) Faire une contribution financière

équitable Partager des données de biodiversité Établir un nœud national de réseau


Priorité du travail Priorité du travail I. INFORMATIQUE Accès aux données et transopérabilité

Data Access and Database Interoperability (DADI)

• Catalogue de noms des éspeces Electronic Catalogue of Names of Known Organisms (ECAT)

II. CONTENT• Digitalisation des spécimens des collections et

éspeces DIGITIII. PARTICIPATION

• Rayonnement et formation Outreach and Capacity Building (OCB) NOEUDS

IV. Campaigns: 2010, pollinators, amazon, etc.


Web-tools et StandardsWeb-tools et Standards Possibilité de 2 formats standards afin de « mapper » les

données: - ABCD2.06 (1457 champs) - DarwinCore (50 champs) + extensions Possibilité de 2 applications de « mapping »: - BPS (Biocase Provider Software) - DiGIR (Distributed Generic Information

Retrieval) Outils de géoreférencement

http://www.tdwg.org/

Accessibilité des données via le Portail des données du GBIF (http://www.gbif.net) ou Portail spécifique

Accessibilité des informations liées aux GBIF (http://www.gbif.org)


Haute biodiversitéHaute concentration d'infos sur la biodiversité

GBIF travaille pour la repatriation de données aux pays du origin


Repatriament des donnés aux pays du origin Repatriament des donnés aux pays du origin

Colombie: 199,223 specimen

records 29,115 taxa 109 collections 52 providers 17 countries

Madagascar: 125,129 specimen

records 13,353 taxa 72 collections 41 data providers 15 countries

GBIF facilitates easy access to biodiversity data that are held by organizations and natural history collections around the world. Two examples:


FormationFormation

IT: protocols DiGIR (TAPIR) Georeferenciation Données sensibles Data modeling (models predictives) MENTORING CEPDEC (Tanzanie) SEP (francophonie)


Benefices au membres du GBIFBenefices au membres du GBIF

Seed Money Awards (ECAT + DIGIT): +4 mill USD. Digitizer les donnés et pour les catalogues des noms (ECAT 95% complete by 2011).

Demo Projects: projects pilots, tools (200K USD) Reenforcement des capacités: In 3+ years: 15+

ateliers (Anglais, Francaise et Espanol) Repatriation des donnés.

Data Portal Prototype + 120 million biodiversity data available (specimens + observational). Freely available at www.gbif.net


Principles:Principles:

Open sharing of biodiversity data Data served does not belong to GBIF Donnés belongs to the data providers Data providers get full attribution GBIF ne metter pas les IPRs on les donnés

(accords en place pour l’utilisation and pour partages les donnés)

Distributed network architecture Standards et protocols




Species: Lithocarpus celebica Rehder (Fagaceae)

(plus 21 other records)






Distribution de Sterna sandwichensis especes migratrice


Utilisation des donnés: applications practiques:Utilisation des donnés: applications practiques:

Ou on doit metre les Parc Nationals? Prediction de la ocurrence d’especes

invasives. Model l’impact de change global de

climat sur la biodiversité. Model nouvelles presences des

maladies (vector), etc.


Modeling and predicting invasive species invasions

Modeling and predicting invasive species invasions

The Asian long-horned beetle invaded the United States from China in packing material

Source: Town Peterson


Distribution model applied to North America based on climatic conditionsDistribution model applied to North America based on climatic conditions

Places where the asian long-horned beetle has been recorded in the USA (Chicago and NY)

Red: Highest Probability of invasion

Source: Town Peterson


CHM (CHM-IAC) Global Taxonomy Initiative (GTI) Global Strategy for Plant

Conservation (GSPC) 2010 target + indicateurs Espaces Protegés Especes invasives Establisement of ”baseline data et

monitoring”

GBIF et la CBD:


GBIF Reinforcements des capacités: GBIF Reinforcements des capacités:

Formation: 15 + atelier (bioinformatique, georeferenciation, data modeling, qualités des donnés. Donnés sensibles. IT protocols DiGIR (TAPIR)

Mentoring: Collaboration N-S, S-S Capacités institutional: Projects

pour les pays en development: CEPDEC et SEP


Sud-experts PlantesSud-experts Plantes

L’initiative Sud Expert Plantes du Ministère français des Affaires Etrangères soutient l'effort de nombreux pays en développement pour connaître, préserver et valoriser durablement leurs ressources végétales. Elle apporte dans ce domaine un appui aux structures de recherche et aux programmes d'enseignement, et finance par appel d'offres plusieurs projets scientifiques favorisant les synergies Sud-Sud, Sud-Nord et interdisciplinaires.


SEPSEP

L'initiative est programmée sur 4 ans (2006-2009) et couvre 4 grandes régions

1. Afrique de l'Ouest ; 2. Afrique Centrale ; 3. Océan indien ; 4. Asie du Sud-Est.


Sud-experts Plantes:Sud-experts Plantes:

Afrique de l’Ouest : Bénin, Burkina-Faso, Côte d’Ivoire, Guinée, Mali, Niger, Sénégal, Togo

Afrique Centrale : Cameroun, Rep. Afrique Centrale, Congo, R.D. Congo, Gabon, Tchad.


SEP ...SEP ...

Océan indien : Comores, Madagascar

Asie du Sud-Est : Cambodge, Laos, Vietnam


Components SEPComponents SEP

1. Formation et séminaires d’échanges entre scientifiques, politiques et acteurs:

Permettre à chaque étudiant d’obtenir une formation d’excellence de niveau international afin d’être un interlocuteur à part entière dans le ou les domaines de son choix.

Permettre aux Autorités d’agir pour la gestion des espèces et des espaces menacés.

Permettre aux Autorités d’organiser et de réglementer l’accès aux ressources et aux savoirs traditionnels, afin d’en partager les avantages.

Permettre aux universités d’intégrer dans leurs cycles de formation les modules dont elles ont besoin pour atteindre les objectifs précédents.


Components du SEPComponents du SEP

2. Appui aux institutions et réseaux (équipement et technologies de l’information):

Conditionnement, désinfection et montage des spécimens ;

Détermination, vérification des déterminations anciennes et rangement des planches d’herbier ;

Numérisation et informatisation des collections, selon les normes existantes ;

Connexion des herbiers et jardins botaniques à l’Internet ;

Connexion des bases de données des collections au portail GBIF ;

Exploitation locale des données.


Components du SEPComponents du SEP

3. Projets de recherche sur fonds compétitif:

Connaissance des patrimoines biologiques et culturels, systématique, révisions taxonomiques et élaboration de flores et d’outils d’aide à l’identification ;

Préservation des espèces et des espaces pour une exploitation durable ;

Bioprospection des ressources génétiques des plantes

Usages, politiques et gouvernance des ressources naturelles


CEPDECCEPDEC

Programe cadre (avec des agences de cooperation international) et les GBIF pour assister les pays en development (donnés pour decision-making)

Pour identifier complementarités avec des autres initiatives.

Ouvert to pays, regions et partenaires pour travailler ensemble

Project pilot -> Tanzanie


CEPDEC OutputsCEPDEC Outputs

Identification de besoins (access et utilisation des donnés)

Partenariats strategic pour le reinforcements de capacités et repatriment des donnés aux pays d’origin.

Development des noueds du GBIF nationals Reseau National (collaboration et transfer

of connaisance) Reinforcements des capacités Mobilisation des resources.


CEPDEC ImplementationCEPDEC Implementation

Niveau pays: resources et reinforcements des capacités -> pays to identifier, amener and ameliorer l’access et l’utilisation des donnés pour ameliorer l’activites scientific et manager des resources biologiques. Benefices pour la societé.

Coordination et nivel strategic: Formation des noeuds et expand les travaille dans les pays en cours des development.


Perspectives: collaboration avec les CHM Belgique-Partenaires

Perspectives: collaboration avec les CHM Belgique-Partenaires

GBIF contribution: notre experience et ”savoir faire” pour la interoperativité, tools, standards et protocols pour les bases de donnés.

Metre les documents GBIF (Francaise) IPRs experiences et materiels. PROLeg) Plan de Formation et collaboration: digitization

d’information, outils informatiques, georefenciation, data cleaning, IPRs, data modeling.

Contruire des synergies avec les projects: SEP, CEPDEC

Travallier ensemble avec des ”campaigns” ( Projects (CBD et conventions): change climatique,

2010, GSPC, invasives, etc. etc. Repatriment des donnés


Perspectives:Perspectives:

Identification des themes chaudes or d’interest national (effect de le change climatique sur la biodiversité, especes exotiques, polinisateurs, etc. Etc)

-> mobilisation de donnés, IT Tech transfer, ”bridge the digital divide”

-> nouvelle portail, nouvelles functionalities.


Invitation to joindre:Invitation to joindre:1. Access à ”seed money awards”2. Atelier de formation (bioinformatique)3. Support au Noeds GBIF Nodes 4. Access à an reseau international d’experts5. Projects de Mentoring6. GBIF Projects Demonstratives7. Ebbe Nielsen Award 8. Projects de repatriation des donnés aux pays

d’origin9. Campaigns


Nouvelle Portail du GBIFNouvelle Portail du GBIF


Remercimons de Beatriz à:Remercimons de Beatriz à:

• Guy Baillargeon (Canada)• Gäel Lancelont (France)• Patricia Mergen (Belgique)


Pour contacter le GBIFPour contacter le GBIF

Web site: www.gbif.org Data portal: www.gbif.net

GBIF SecretariatUniversitetsparken 152100 CopenhagenDenmark

E-mail: [email protected]: +45 3532 1470Fax: +45 3532 1480

New GBIF Secretariat headquarters, supported by grant from Aage V. Jensens Fonde

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