Il ruolo delle Microbiologie Cliniche nelle MTA

Mario Sarti – Microbiologia Clinica NOCSAE Baggiovara (Modena)

Stefano Pongolini – Istituto Zooprofilattico Sperimentale della Lombardia e della Emilia Romagna

Bologna 4/2/16

Campylobacter (6287 paz)

Salmonella (6287 paz)

Shigella (6287 paz)

Yersinia (245 paz)

E. coli STEC (698 paz)

Vibrio (37 paz)

Norovirus (109 paz)

Aeromonas (0 richieste)

169

131

1

4

1

0

8

2

Pazienti con positività per enteropatogeni dalle feci (anno 2015)

+ 2 pazienti con isolamento di L. monocytogenes da

emocoltura

Salmonella

disponibilità della ricerca nelle Microbiologie Cliniche ER ESTESA

Campylobacter

disponibilità della ricerca nelle Microbiologie Cliniche ER

Nota: diverse possibilità di metodi colturali con possibili diverse sensibilità diagnostiche , disponibili anche test immunoenzimatici

ESTESA

Shigella

disponibilità della ricerca nelle Microbiologie Cliniche ER

Nota: indicata dal nomenclatore nazionale come ricerca standard, di fatto spesso ricercata con attenzione solo sulla base di criteri clinico-anamnestici

ESTESA

Y. enterocolitica

disponibilità della ricerca nelle Microbiologie Cliniche ER

Nota: la richiesta dovrebbe essere mirata per la necessità di utilizzare terreni dedicati, può pero costituire un reperto occasionale nell’ambito di una coprocoltura standard

MEDIA

Shiga toxin-producing E. coli (STEC)/EHEC

disponibilità della ricerca nelle Microbiologie Cliniche ER

Nota: buona la disponibilità della ricerca colturale di EHEC O157 sorbitolo neg, scarsamente diffusa la possibilità di ricercare altri STEC

BUONA/SCARSA

Vibrio

disponibilità della ricerca nelle Microbiologie Cliniche ER

Nota: la richiesta deve essere mirata per la necessità di utilizzare terreni dedicati

MEDIA

Aeromonas

disponibilità della ricerca nelle Microbiologie Cliniche ER

Nota: la richiesta dovrebbe essere mirata per la necessità di utilizzare terreni dedicati, può però costituire un reperto occasionale nell’ambito di una coprocoltura standard o della coltura per Yersinia

SCARSA

Norovirus

disponibilità della ricerca nelle Microbiologie Cliniche ER

Nota: per lo più ricercato con tecniche immunoenzimatiche (sensibilità non ottimale), piuttosto che mediante biologia molecolare

MEDIA

S. aureus

disponibilità della ricerca nelle Microbiologie Cliniche ER SCARSA

Nota: possibile in teoria la ricerca del microrganismo nelle feci ma poco o per nulla disponibili i kit per la ricerca dell’enterotossina

C. perfringens

disponibilità della ricerca nelle Microbiologie Cliniche ER SCARSA

Nota: possibile in teoria in alcune Microbiologie Cliniche la ricerca del microrganismo nelle feci ma poco o per nulla disponibili i kit per la ricerca dell’enterotossina

B. cereus

disponibilità della ricerca nelle Microbiologie Cliniche ER SCARSA

Nota: possibile in teoria in alcune Microbiologie Cliniche la ricerca del microrganismo nelle feci (peraltro poco utile soprattutto se non quantitativa) ma non disponibili kit per la ricerca dell’enterotossina nei campioni clinici

nuove possibilità diagnostiche

BacteriaCampylobacter (jejuni, coli and upsaliensis)Clostridium difficile (Toxin A/B)Plesiomonas shigelloidesSalmonellaYersinia enterocoliticaVibrio (parahaemolyticus, vulnificus and cholerae)Enteroaggregative E. coli (EAEC)Enteropathogenic E. coli (EPEC)Enterotoxigenic E. coli (ETEC) lt/stShiga-like toxin-producing E. coli (STEC) stx1/stx2 E. coli O157Shigella/Enteroinvasive E. coli (EIEC)

ParasitesCryptosporidiumCyclospora cayetanensisEntamoeba histolyticaGiardia lamblia

VirusesAdenovirus F40/41AstrovirusNorovirus GI/GIIRotavirus ASapovirus (I, II, IV and V)

pannelli commerciali microarray

nuove possibilità diagnostiche

pannelli commerciali microarray

manualità estremamente limitata

tempo per il risultato: 1 h

costo a test: > 100 euro

Bambina di 8 anni, dal giorno precedente 12 scariche emorragicheavviato microarray sulla base delle caratteristiche del campione

(non richiesto) positività per STECRicerca immunoenzimatica tossina: negativa

Bambina di 6 anni, da due giorni comparsa di vasculite e profusa diarrea ematica

avviato microarray sulla base delle caratteristiche del campione (non richiesto) positività per STEC

Ricerca immunoenzimatica tossina: negativa

Un particolare ringraziamento per la collaborazione a:

dott. Massimo Confalonieri - Microbiologia Clinica Ospedale di Piacenza

dott.sa Maria Rita Rossi - Microbiologia Clinica Ospedale di Cona (Ferrara)