KLASIFIKACIJA ANIMALNIHVIRUSA

Klasifikacija virusa- nedovren posaoStalno napredovanje saznanja o virusimaBiofizike, biohemijske osobina, graa, hemijski sastav na molekularnom i submolekularnom nivouNain nastanka virusnih bolesti

Klasifikacija virusa- nedovren posaoImena virusa po bolestima (morbili, mumps, polio)Lokalitet na kojima su prvi put zabeleena virusna oboljenja (semliki forest desease virus, coxsackie, sendai)Izazivai tumora po nauniku i vrsti tumora (virus Rousovog sarkoma, papova virusi papiloma, polyoma..)Prenosioci virusa Arbo virusi, nematode prenosivi poliedarski (ikosaedarni) virusi - nepovirusi

Klasifikacija virusa- nedovren posaoPromene na tkivima adenovirusi degeneraciju adenoida, respiratorni sincicijalni virus (RSV), Picorna mali virusi sa RNKEcho virusi (enteric cytopathogenic human orphan) Reo (respiratory enteric orphan)Neujednaenost stavova po pitanju klasif. virusa

Klasifikacija virusa- nedovren posaoSeroloke razlike razlike u virusnim proteinima - serotipSerotipovi su pronaeni kod brojnih virusa rotavirusi, slinavka i ap

Klasifikacija virusa- nedovren posaoPredlagane klasifikacije:Klinika simptomatologija i tropizam virusaBinomna nomenklatura (Linne) tana definicija vrste?Krajem 30-tih godina Holmes je red Virales podelio u tri podreda:PhaginaePhytophaginaeZoophaginaePorodice, rodove i vrste prema najvanijim obelejima bolesti

Klasifikacija virusa- nedovren posao50-tih - Holmesova klasifikacija zamenjena podelom virusa na grupe sline rodovima Herpes virusi, Adenovirusi, Poxvirusi...)Od 1962. predlau se sledee osobine:Veliina, oblik, struktura, NK, antigenska struktura

Klasifikacija virusa- nedovren posao1966. Gibbs, Harrison, Watson i Wildy formula virusa sa osam osobina:NK, broj lanaca NKrelativna Mw NK, procenat NK u virusu, oblik virusne estice, oblik nukleokapsida, prijemivi domain, prenosilac virusa

Klasifikacija virusa- nedovren posaoLanni graa virusnih proteina i kodovi za te proteineBellet relativna Mw NK, udeo GC parovaPuno predloga

Meunarodni komitet za taksonomiju virusa - ICTV1966. u Moskvi Me. odbor za nomenklaturu virusa (Int. Comitee on Nomenclature of Viruses)1971.Virusi podeljeni na 43 grupe1981. Meunarodni odbor za taksonomiju virusa (ICTV) nova klasifikacija virusa

Meunarodni komitet za taksonomiju virusa - ICTV

OSNOVNI KRITERIJUMI ZA KLASIFIKACIJU VIRUSAtip i karakt. nukleinske kiselinemorfologija i veliina virusne partikulesimetrija kapsidabroj kapsomeravirion: sa ili bez omotaa i osteljivost na etarmesto sklapanjamesto sticanja omotaa

OSNOVNE SISTEMATSKE KATEGORIJE VIRUSARed (ordo)Familija (family)Podfamilija (subfamily)Rod (genus)Vrsta ( species )Vie taksonomske kategorije poput klase, razdela se ne koriste u takosnomiji virusa

NOMENKLATURA VIRUSAPO ICTV-uRed viralesFamiliju - viridaePodfamilije - virinaeRod - virus

NOMENKLATURA VIRUSAPO ICTV-uMnoga ranije koriena imena se koriste za ime familje ili roda pikorna virusi PicornaviridaeSvaka grupa ima svoj sufiks i formalno ime italik i poetno veliko slovo npr. Genus Morbillivirus

KLASIFIKACIJA VIRUSA NA OSNOVU EPIDEMIOLOKIH KRETRIJUMA, TROPIZMA, NAINA PRENOENJACrevni virusi Reo-, Picorna- Coronaviridae,Respiratorne virusi Orthomyxoviridae, Adenoviridae, Paramyxoviridae, Picornavridae..Arbovirusi prenose ubodom zglavkara (Togaviridae, Flaviviridae....Onkogeni virusi Herpesviridae, Papovaviridae, Hepadnaviridae.....

KLASIFIKACIJA VIRUSA NA OSNOVU NUKLEINSKE KISELINEdsDNA virusissDNA virusi (prevode se u dsDNA)dsRNA virusi-reovirusi (prvo se stvara +RNA a zatim dsRNA)negativni ssRNA virusi (RNA se prevodi u +RNA)pozitivni ssRNA virusi ( +RNA se koristi direktno kao iRNA )DNA i RNA retrovirusi ( prevode DNA u RNA transkripcijom a zatim RNA slui kao matrica koja uz pomo enzima reverzne transkriptaze stvara DNA)

KLASIFIKACIJA VIRUSA NA OSNOVU SIMETRIJE KAPSIDANa osnovu simetrije kapsida postoje tri oblika virusa:Ikosaedarni Helikalni (spiralni)Kompleksni

KLASIFIKACIJA RNK VIRUSAPorodica PicornaviridaePorodica CaliciviridaePorodica Reoviridae Porodica FlaviviridaePorodica TogaviridaePorodica Retroviridae Porodica OrthomyxoviridaePorodica ParamyxoviridaePorodica Rhabdoviridae Porodica FiloviridaePorodica CoronaviridaePorodica ArenaviridaePorodica BunyaviridaePOrodica Deltaviridae

PORODICA PICORNAVIRIDAEgenus Enterovirusgenus HeparnavirusNajmanji RNK virusi (24 30nm)Ikosaedarne simetrijeNemaju omota rezistentni su na etar i organske rastvarae+ssRNK (+RNK=iRNK)Razmnoavaju se u citoplazmiOslobaaju se razaranjem elije

poliovirus type 1

PORODICA PICORNAVIRIDAEgenus Enterovirusgenus HeparnavirusZa ljude su patogeni:-polio virus-coxsackie virusi-echo virusi-humani entero virusi-virus hepatitis A-rinovirusi

PORODICA CALICIVIRIDAEGenus Calicivirus (jedini rod)Virion nema omota Ikosaedarne su simetrije (35-40 nm)+ssRNKRazmnoavaju se u citoplazmi elije Oslobaaju se razaranjem elije Mogu izazavati gastroenteritise kod ljudi.Norwalk virus i hepatitis E

PORODICA TOGAVIRIDAEGenus AlphavirusGenus RubivirusSadre omota oko nukleokapsida Ikosaedarne su simetrije (60-70 nm)+ss RNK Razmnoavaju se u citoplazmi i dobijaju omota od elijske membrane, naputajui eliju.Za ljude su patogeni:virus rubellae

PORODICA FLAVIVIRIDAEGenus Flavivirus (jedini rod)Virion poseduje omota oko nukleokapsida Ikosaedralni kapsid +ss RNK, linearna nesegmentiranaRazmnoavaju se u citoplazmi, razmnoavaju se u artropodama i kimenjacimaZa ljude su patogeni:ute grozniceVirus groznice Zapadnog NilaHepatitis C

PORODICA CORONAVIRIDAEGenus Coronavirus (jedini rod)Virusi su sa omotaem i helikalne simetrije+ss RNK (infektivna RNK), linearna, nesegmentiranaRazmoavaju se u citoplazmi Corona virusi najee uzrokuju kod ljudi obine prehlade, infekcije gornjih delova respiratornog traktaVirus SARS-a

Humani korona virus

PORODICA RHABDOVIRIDAEGenus VesiculovirusGenus LyssavirusVirusi su tapiastog oblika bullet shapedPoseduju omota Helikalne su simetrije linearna -ssRNK (komplementarna sa iRNK). Razmnoavaju se u citoplazmi elije i stiu spoljnji omota od citoplazmatske membrane.

Za ljude su patogeni iz roda Lysavirus:virus rabiesa - besnilaMokola virus i dr.

Virus besnila

PORODICA FILOVIRIDAEGenus FilovirusMogu biti razliitih filamentoznih oblika i poseduju omota (l=80 nm)-ssRNK linearna nesegmentirana Razmnoavaju se u citoplazmi elije Za ljude su patogeni:Marburg virusEbola virus

Ebola virus

PORODICA ORTHOMYXOVIRIDAEGenus Influenzavirus (virus influenzae A i B)

Virusi poseduju spoljni omota, Helikalne su simetrije. -ssRNK segmentiran ( 8 segmenata)Razmnoavaju se u citoplazmi i jedru inficirane elije Za ljude su patogeni:virus influenzae A i Bvirus influenzae C

Virus influence

PORODICA PARAMYXOVIRIDAEGenus ParamyxovirusGenus MorbilivirusGenus Pneumovirus Virusi su obavijeni omotaem, Helikalne su simetrije -ssRNK linearan nesegmentiranRazmnoavaju se u citoplazmi eljie.Za ljude su patogeni:virus parainfluenzae 1, 2, 3, 4. (uzronici bronhitisa, bronhiolitisa i pneumonije)virus mumpsa (uzronik zauaka)virus morbilla (uzronik malih boginja)

Virus mumpsa

PORODICA BUNYAVIRIDAEVirusi su sferini sa helikalnim nukleokapsidom Imaju spoljnji omota -ssRNK cirkularna RNK u tri segmentaRazmnoavaju se u citoplazmi elije.Encefalitisi I razliite grozniceZa ljude su patogeni:Bunyamavera virus Trojica virusHantan virus

PORODICA ARENAVIRIDAEarena (gr. Pesak)spoljanji omota- pesak su nefunkcionalni ribozomiHelikalni nukleokapsid Cirkularna -ssRNK dva ili etiri segmenta Razmnoavaju se u citoplazmi elije.Za ljude su patogeni:virus limfocitarnog horiomeningitisaVirus Lasa groznice

PORODICA REOVIRIDAErespiratory enteric orphan Virusi nemaju spoljnji omota. (75 nm)Ikosaedarne su simetrije dsRNK u 10 segmenataTo su jedini virusi koji imaju genetske informacije kodirane u dvolananoj RNK Razmnoavaju se u citoplazmi domaina

Za ljude su patogeni:Rotavirus prolivi kod novorodjenadi

Humani rotavirus

PORODICA RETROVIRIDAE

Virusi poseduju omota Ikosaedralne simetrijedva identina molekula +ssRNK, vezane nekovalentnim vezama.Ovi virusi poseduju enzim reverznu transkriptazu Dve medicinski vane grupe1) onkovirus grupa sarkoma i leukemija viruse Humani T-leukemija virus (HTLV)2) lentivirus grupa (spori virusi)- HIV

KLASIFIKACIJA DNK VIRUSADNK virusi su svrstani u sledee porodice (familije):ParvoviridaePapovaviridaeAdenoviridaeHerpesviridaePoxviridaeHepadnaviridae

PORODICA PARVOVIRIDAEGenus ParvovirusSitni bez spoljanjeg omotaaIkosaedarne simetrije 32 kapsomere (prenik 22 nm) ssDNK linearanRazmnoavaju se u jedru elijenedefektni i defektni virusi (zahtevaju helper virus)Za ljude patogeni:-humani parvovirus B19 blaga bolest(erythema infectiosum)

PORODICA PAPOVAVIRIDAEGenus PapillomavirusBez omotaa (GOLI) Ikosaedarne simetrije 72 kapsomere (55 nm)Genom: krune dsDNKRazmnoavaju se u jedru elijeZa ljude su patogeni:-humani papilomavirusi HPV 1-48 (papilome tj. bradavice)

PORODICA ADENOVIRIDAEGenus Mastadenovirus humani adenovirusi

Nemaju omota Ikosaedarne simetrije sa 252 kapsomere (75 nm)dsDNK linearni molekulRazmnoavaju se u jedru elijeFaringitis i infekcije gornjih i donjih respiratornih putevaSarkome kod ivotinja ali ne tumore kod ljudi

00.001.0.01.001. Human adenovirus C

PORODICA HEPADNAVIRIDAEGenus HepadnavirusPoseduju dvostruki omota Mali virusi 42 nm Genom nepotpuni dvolanani, cirkularni DNKDNK polimeraza kompletira DNKRazmnoavanje u jedru jetrene elijeVrlo otporni virusiZa ljude su patogeni:-hepatitis B virus

Hepatitis B virus, Hepadnaviridae

PORODICA HERPESVIRIDAESpoljanji omota kompleksne graeNukleokaspid ikosaedarne simetrije (100 nm)Genom jedan molekul dsDNA linearanRazmnoavanje u jedru elijeIzazivaju latentne infekcije

PORODICA HERPESVIRIDAEHumani herpesvirusi:- herpes simplex tip 1 i 2 (oralni i genitalni)-varicella zoster virus-citomegalovirus-Epstein Barr-ov virus (infektivna mononukleoza)

PORODICA POXVIRIDAEOblik cigle (etvrtast) ili ovalan (elipsast)200-300nm (spadaju u najvee viruse)Kompleksna simetrijaSpoljanji omotaGenom jedan molekul dsDNKRazmnoavaju se u citoplazmi elije Predstavnici:- virus variole (velike boginje variola)- virus kravljih boginja

DeltavirusHepatitis delta virus (HDV)Spoljanji omota-ssRNK cirkularnaDefektan virus Za replikaciju potreban hepatitits B virusEnkodira povrinski antigen koji slui kao spoljanjii proteinski omota

http://www.virustaxonomyonline.comSeventh Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses (2000)This report describes the taxa and viruses approved by the ICTV between 1970 and 1999The ICTV has approved 3 orders, 56 families, 9 subfamilies, 233 genera and 1550 virus species. Descriptions of virus satellites, viroids and the agents of spongiform encephalopathies (prions) of humans and several animal and fungal species are included. Finally, a list of unassigned viruses is provided with a pertinent reference for each.

-ssRNA viruses

.

The Togaviridae and Flaviviridae, and to a lesser extent the Coronaviridae and Picornaviridae, families are the most prominent human pathogens. Important plant viruses affect major cereal grains causing severe crop damages worldwide and affecting the nutrition of entire populations.+ssRNA viruses

Retro virusi i dsRNA viruses