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M<'decine et Maladies Infectieuses 12 SpecM - 1971-72 • SSl-S56
Les anaerohies pathogenes ell milieu hospitalierA_ propos de l'isolel1Lent de 107 souches CL Nantes :
ident.iiication, sensibilite aux untibiotioues'A. St:DALLIAN **, Claudie FROCRAIN ** et Denise MOINARD **
Depuis deux ans, nous avons eM amenes au Centre hospitalier universitairede Nantes a ie ire des isolements de germes anaerobres stricts.
De nombreux travaux ont ete consacres deja par les auteurs, aux infectionsprovoouees par ces becterles.
II nous a paru cependant interessent de donner, lei, les resultet» de nosisolements, dans un but pratique. celui de voir la sensibilite de ces germes auxantibiotiques au Centre hospitalier universitaire de Nantes.
L'isolement et I'identification des anaerobles strictssont longs et dellcats, Si, dans la rnajortte des cas,les germes sporules sont facilement lsoles, il n'enest pas de merne pour les germes dits «de la florede Veillon » .
Les infections sont generalement provoquees pardes associations microbiennes : anaerobles assoclesentre eux ou avec des aerobles. Ces germes viventen symbiose et se developpent lentement lorsqu'i1ssont en culture pure.
Devant ces difficultes iJ n'est pas possible dedonner une reponse valable avec un antibiogrammeavant quinze jours, et parfois rnerne, les isolementsdemandent plusieurs semaines.
MATERIEL ET TECHNIQUE
ORIGINE DES SOUCHES
Tous les germes que nous envisageons ICI, ontete lsoles a partir de produits pathologiques.
Hemoculture,
Le sang parvient soit en veinotube, soit en flaconde Castaneda (B.D. Merleux). Le sang des veinotubesest systernatlquernent ensemence en bouillon cceurcervelle (B.D. Merleux) pour les germes aerobles,et en bouillon anaeroble (125 ml de milieu a la resazurine de B.D. Merieux, regenere avant I'emploi). Leshernocultures sont systernatlquernent replquees aubout de 24 heures, 4 jours et 15 [ours, sur desmilieux aerobles et anaerobies. Les flacons de Castaneda sont survellles : des que des colonies apparaissent sur la gelose, les flacons sont ouverts et Iemilieu est reensernence sur des milieux aerobies etanaerobles,
Suppurations diverses.
Les germes ont ete lsoles de differentes suppurations: abces de differentes localisations, pus pleuraux , pus peritoneaux.
• Communication presentee a la Reunion des Microbiologistes Medlcaux de l'Ouest de la France, Nantes,18-6-1971.
Systematiquement les pus sont ensernences surmilieux aerobles et sur bouillon anaeroble, (bouillona la resazurine de B.D. Merieux). Mais dans la plupart des cas, c'est devant "aspect du pus que I'ona suspecte la presence des anaerobtea : odeurputride, flore microbienne abondante et de diverstypes morphologiques apres coloration de gram. Onpratique alors, imrnedlaternent, un isolement du pussur mil ieu solide, mil ieu qul est lncube a 37 0C dansune atmosphere d'anaeroblose,
LES TECHNIQUES D'ISOLEMENT ET D'IDENTIFICATION
Ce sont celles qui sont preconlsees par H. Beerens dans son manuel «Infections humaines a bacteries anaerobies non tox lqenes » (2).
Pour certains groupes bacteriens , nous avonscomplete cette identification b iochimique en recherchant I'attaque d'autres hydrates de carbone. Nousavons fait ce complement d 'etude pour identifier lesdifferentes varletes des Bacteroides du groupe fragilis (ancien groupe des Eggerthella de Beerens).Les details des milieux utilises, ainsi que les caracteres d'identification de ces germes peuvent etreretrouves dans les travaux de H. Beerens (8) oude H. Werner (9).
RECHERCHE DE LA SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUES
En rnerne temps que !'identification biochimique,nous avons fait, pour chaque germe isole, un antibiogramme sur boite de gelose V.L. au sang, enanaerobiose (sachet de pyrogallol alcalin).
RESULTATS
De 1969 a 1971, nous avons lsole 107 germesanaerobles stricts, se repart lssant en 23 germessporules et 84 souches appartenant a la flore deVe illon.
•• Laboratoire de Bacterloloq le A, Hotel-D leu , C.H.R. deNantes.
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LES ANAEROBIES SPORULES
Parmi ces germes, Ie plus frequent c'est lncontestablement Clostridium perfringens, pulsque 17souches sur 23 appartiennent a cette espece.
Les autres Clostridium isoles sont: Clostridiumcedematiens (2 fois), Clostridium septicum (1 fois),Clostridium bifermantans (1 fois). Enfin, nous avonslsole deux Plectridium tetani.
Types de prelsvements dans lesquels sont isoles cesgermes.
C'est dans les hernocultures que ron isole Ieplus frequernment Clostridium perfringens. Les etiolog ies sont variables: bacterlemles chez des cirrhotiques, septlcernles apres intervention chirurgicale,ou chez des diabetlques.
Nous indiquons dans Ie tableau I la repartitionde ces germes sporules dans les differents produitspathologiques.
Hemo,ul ture Pus pleural Suppurationsdiverses
C1. pel'fri">iens 11 2 4
Autres 2 0 2clcstridiu.~
PZe,.tridiun0 0 2
~
Tableau I. - Repartition des anaerobles sporules selon Ietype de prelevernent,
Senslbllite aux antibiotiques.
La senslbllite aux antibiotiques est assez constante selon les souches. Ces germes sont generalement sensibles aux beta-lactamlnes, aux macrolides,au chloramphenicol, a la nitrofurantoine. lis sont tousresistants a la novobiocine. Nous resumons, dansIe tableau II, Ie pourcentage de souches sensiblespour chaque antibiotique.
ANTIBIOTIQUE Pour,entage ANTIBIOTIQUE Pourcentagedien~m~is dien~m~is
Ampi,illine 100 Erythromy,ine 95,5
C~phalosporlne 100 Spiramyclne 95,5
Synergistine 100 l in'(X:ly,Jne 95,5
Chlora:::pMnicol 100 P~nlcill i ne 91
Nitrofurantoine 100 THracycl ine 82
MHhicilline 95,S Acide fusidique 47
Novobiocine 0
Tableau II. - Pourcentages de bacterles anaerobles sporulees sensibles aux antibiotiques.
LES ANAEROBIES DE LA FLORE DE VEILLON
Les 84 anaerobies que nous avons tsoles dedifferents produits pathologiques representant 20 especes bacteriennes dlfferentes.
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Nous allons envisager separernent les anaerobiesgram-positifs et les anaerobles gram-negatifs.
Les anaeroblas gram-positifs.
42 bacterles gram-positives ont ete lsolees etldentiflees au C.H.U. de Nantes. Nous indiquons,dans Ie tableau III, la repartition de ces germes dansles differents produits pathologiques.
a) Les baciffes gram-positifs:
Nous avons lsole 14 bacilles gram -positifs anaerobie slricts. Ce sont essentiellement des corynebacteries anaerobies strictes, lndentlflees a Corynebacterium liquefaciens (ou acnes), et une seulefois un Bifidobacterium dans une hemoculture,
Abc!s divers
Hemotulture liquide pleural en associationavec d'autres
germes
9 6 27
Tableau III. - Repartition des bacterles gram-positivesdans les differents produits palhologiques.
ANTlBIOTlQUEPourcentage
ANTIBIOTlQUEPourcentage
de souches de souchessensibles sensibles
A:::picill ine 100 Spiral1lyclnr 92
Cephalosporine 100 Llncooyclne 92
Synergistine 100 RlfaJTIyclne 92
Chloran:pMnicol 100 Erythromy,ine 90
Nitrofurantoine 97 THracycl ine 90
Methicill ine 95 Aclde fus idique 68
P~n i 'ill i ne n Novo~ iocine 15
Tableau IV. - Pourcentages de bacterles gram-positivessensibles aux antibiotiques.
La senslblllte aux antibiotiques de ces germesest tres grande. Dans son ensemble, elle est tressuperposable aux autres germes gram-positifs. Nouslndlquons, dans Ie tableau IV, Ie pourcentage desouches sensibles pour chaque antibiotique.
b) Les cocci gram-positifs:
Nous avons lsole des staphylocoques et desstreptocoques anaerobles stricts - 20 souches destaphylocoques anaerobles qui se reparttssent de lamaniere suivante:
- Staphylococcus anaerobius (5 fois) ;
- Staphylococcus asacharolyticus (5 fois) ;
- Staphylococcus variabilis (4 fois);
- Staphylococcus prevoti (1 fois);
- Staphylococcus lactilyticus (1 fois);
- Staphylococcus aerogenes (1 fois);
- Staphylococcus sp. (3 fois).
Streptocoques et diplocoques anaerobles.
Nous avons isole 8 de ces germes qui se repartissent ainsi:
- Streptococcus putridus (4 fois: 2 fois dans unehemoculture, 1 fois dans un abces, 1 fois dansun liquide d'ascite) ;
- Streptococcus intermedius (1 fois, lsole d'unegangrene gazeuse);
- Streptococcus micros (1 fois, lsole d'un pus decavlte pulmonaire);
- Diplicoccus paleopneumoniae (1 fois , lsole d'unehemoculture) ;
- Diplococcus magnus (1 fo ls, lsole dans un puspleural) .
Senslbllite aux antibiotiques.
Les 42 bacterles gram-positives sont tres sensibles aux antibiotiques.
- Ie chloramphenicol est actif sur toutes lessouches;
- les beta - lactamines sont actives sur presquetoutes les souches;
les macrol ides, les synergistines, la tetracycline,la rifamycine ont une bonne act ivite malqrequelques variations ;
- la novobiocine est beaucoup moins active.
Nous indiquons, dans Ie tableau IV, Ie pourcentage de souches sensibles pour chaque antibiotique.
Les bacteries anaerobles gram-negatives.
42 souches de bacilles qram -neqatlls ont etelsolees de divers produits pathologiques, dont 26 Bacteroides du groupe fragilis. et 16 autres bacillesgram-negatifs se repart lssant en differents genres.
La classification des bacilles gram-negatifs subitactuellement de grosses modifications. Le SousCornlte de classification a propose, en aoat 1970, aMexico, leur repartition en trois genres (Bacteroides,Fusobacterium, Leptotrichia). Nous ne voulons pasprendre partl, lei, sur un problema de taxonomiebactertenne. Cependant, nous suivrons certainesrecommandations du Sous-Cornlte de classificationdes bacilles qrarn-neqatifs anaerobies, en particulierpour les Bacteroides du groupe fragilis, pour lesquelsplusieurs travaux ont permis d'en faire un groupebien individualise (ancien groupe des Eggerthellade Beerens ou Ristella de Prevot).
a) Les Bacteroides du groupe fragilis.
Ces germes sont identifies par un certain nombrede caracteres. Mais iI est possible de separer, al 'lnterleur de ce groupe, dlfferentes especes, d'apresl'etude de fermentation de d ifferents hydrates decarbone et la recherche de /'indole (9).
Actuellement, on distingue dans ce groupe: Bactero ides frag ilis, B. thet iaotaomicron. B. ovatus,B. vulgatus, B. distason is (tableau V).
Nous avons lsole au laboratoire de bacterioloqle :8 B. fragiUs, 7 B. theta iotaomicron, 3 B. vulgatus,4 B. distason is et 4 Bacteroides appartenant a cegroupe, mais dont no us n'avons pas pousse plusloin les identifications. Nous indiquons, dans Ietableau VI, la repartition de ces germes dans lesdlfferents produits pathologiques.
Ces bacteries gram-negatives sont parmi les plusfrequernrnent lsolees des produits pathologiques. Ellespossedent, en outre, une importante resistance auxantibiotiques. Elles sont toujours res lstantes auxbeta-lactarnlnes, au groupe de la col istine-polymyxine.Leur sensibilite vis-a-vis de la spiramycine est mediocre. Par contre, elles sont generalement tres sen sibles aux tetracyclines et au chloramphenicol. Nousresumons, dans Ie tableau VII, Ie comportement deces germes aux antibiotiques en indiquant Ie pourcentage de souches sensibles.
b) Les autres bacilles gram-m!Jgatifs.
Nous avons isole : 5 Fusobacterium fusiformis,3 Bacteroides melaninogenicus (ou Ristella melaninogenica), 2 Sphaerophorus (Fusobacterium) funduliformis, 2 Rlstella (Fusobacterium) perfaetens, 2 Ristella putida (Bactero ides putidus) et 1.Fusobacteriumnon ldentlfte.
Nous indiquons dans Ie tableau VIII, la repartitionde ces germes dans les differents produits patholog iques.
Sensibilite aux antibiotiques.
Ces germes sont generalement tres sensibles auxantibiotiques, en particulier ils sont sensibles auxbeta-lactamlnes et au groupe de la colistine-polymyxine.
Nous resumons, dans Ie tableau IX. Ie comportement de ces germes aux antibiotiques.
II faut noter que toutes nos souches de F. fusiformis et de Sphaerophorus ont ete sensibles auxantibiotiques etudles. Les souches les plus reslstantes aux beta-Iactamlnes ont ete B. me/aninogenicuset B. putidus. D'autre part, nous avons eu une seulesouche realstante a la colistlne, il s'aqlssalt de B. putidus.
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VI I- U ec :>: « '" < :>:
B. the ta iotaorioron + + + + + + + + 0 0
8 . ot.'.2tus + + + + + + + + 0 +
B. dis ta scn i s 0 + + + + + 0 + v 0
B. IJUlgatu3 0 + 0 0 + 0 + + 0 0
9 . [ra . ilis 0 + 0 + + 0 0 0 0 0
Tableau V. - Caracteres dislinclifs des Bacteroides tragil isd'apres H. WERNER (ZbJ. Bakler. J. Orig., 1969, 2/0,192-200): H. BEERENS (Ann. Inst. Pasteur Lille, 1971 -
a paraitre).
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fl 0 •
•~f asulfobeizoare : 0 .que de oreJi isolo»5 mg par mprime
e etaSII '!Obell; Oale e I line in vention fran cai. eC'eSI ci cet e ter que Ie SO ~UP ED oit sa solubi ite.
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o ution obte J • p rf i e, lirnpide, an de ·t.______..._._._..._.... -_._-- -- _a..... . .. ..__. ._._... _
P. lCAUT IO. S• 1' / aut (n en u 1 .e J\ I. c 1C00~cr. e C c: Ie---- -. ..__...._-_._-_._-_.__._...._.._--- _._------- --- - - - -
B. thetaio-Bacteroides groupe
B. fragitis B. vulqatus B. dietaeonie fiad- tis dont 11 i-taomicren dentff~cation n1a- pasp' ~vsseeus otn
Hemocu1ture 6 3 1 2 1
pus pleuralou 1 1 0 0 2liquide d'ascite
suppurations '1 3 2 2 1diverses
Tableau VI. - Repartition des Bacteroides du groupe fragilis.
ANTIBIOTIQUEPourcentagede souchessensibles
Chloramphenicol 100
Nitrofurantoine 96
Tetracycline 80
Spf ramyc ine 69
Perric i l l ine a
Ampicilline a
Cephalosporine a
Colistine a
Polymyxine aTableau VII . - Pourcentage de Bacteroides fragilis sen
sibles aux antib iotiques
Hemocul ture pus ple ural Abc~s dhers
F. f': s ifo= is 0 I 4
B. meZoninoge"w.. 0 0 3
F. perfaeter...s 0 0 2
R . putuw 0 0 Z
Sph.fw.duUfo=is 2 0 0
Tableau VIII . - Repartition des bacilles gram-negatifs anaerob les stricts (autres que les Bactero ides du groupe fragilis).
PourcentageANTIBIOTIQUE de souches
sensibles
Spiramycine 100
Chloramphenicol 100
Tetracycline 100
Nitrofurantoine 100
Colistine - 92Polymyxine
Pen ic i l l ine 74
Ampicill ine 74
Cephalosporine 74
Tableau IX. - Poucentage de Bacilles gram-negatifs,autres que Bacteroides frag llis, sensibles aux antibiotiques.
DISCUSSION ET CONCLUSION
Au cours de ces dernleres annees, nous avonslsole 107 germes anaerobles stricts au Centre hospitalier de Nantes, a partir de differents produitspathologiques et se repartlssant en 28 especes bacteriennes differentes. Insuffisamment recherches dansles produits pathologiques, ils sont souvent meconnus des cliniciens et leur nomenclature, encore fluctuante, gene leur vulgarisation.
L'interet de I'isolement, souvent fastidieux, deces germes anaercbles-strtcts est de pouvoir pratiquer un antibiogramme sur une souche lsolee etIdentitiee. Nous avans pu, ainsi, comparer nos resultats avec des stastistiques publ lees ai lleurs (1, 3, 4, 5).
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Generalernent, Ie comportement des anaeroblesvis-a-vis des antibiotiques est tout a fa it comparable.Cette constatation est interessante, car elle nouspermet d 'indiquer, dans les services c1iniques , lesantibiotiques qui seront probablement actifs, sansattendre les resultats de I'antibiogramme.
Les germes gram-positifs sont generalement tressensibles aux antibiotiques: beta-lactarnlnes, macrolides, synergistine, chloramphenicol et tetracyclinesont presque toujours actifs.
Les bacilles qrarn-neqatifs : leur sensiblllte estvariable; elle depend de l'espece bacterienne encause, les souches les plus reslstantes sont les
Bacteroides du groupe fragilis. Cependant, des antibiotiques comme Ie chloramphenicol, la spiramycineet la tetracycline sont, dans I'ensemble, tres actifs.
C'est pour les beta-lactamlnes et la colistine quenous trouvons les plus grosses differences: les Bacteroides du groupe fragilis (Eggerthella) sont toujours resistants aces antibiotiques. Les autresBacteroides (genre Ristella de Prevot) sont souventresistants aux beta-lactarnlnes, mais sensibles a lacolist ine .
Les germes ranges, actuellement, dans Ie gen reFusobacterium (Fusiformis et Sphaerophorus) sonttoujours sensibles aux beta-lactarnines et a la cellstine.
RESUME Depuis deux ans , nous avons Iscle au Laborato ire de Bacterloloqle du Centrehospital ier de Nantes , 107 germes anaerobies stricts, dont 23 germes sporules et84 souches appartenant a la flore de Veillon. Ces germes ont tous ete lsoles deproduits pathologiques.
Les germes qram-postufs sont tres sensibles aux antibiotiques. Pour lesbacilles qram-neqattts, leur comportement vis-a-vis des antibiotiques est variableet depend de l'espece en cause: les germes les plus resistants sont les Bacteroides du groupe frag ilis qui sent, en particulier, toujours resistants aux betalactamines et a la colistine.
SUMMARY For two years, in the Laboratory of Nantes Hospital Center, we have beenisolating 107 strictly anaerobe germs, among which 23 sporogenous germs and84 strains of Veillon's flora . All these germs were isolated from pathologicalproducts.
Grampositive germs are very sensitive to antibiotics. As for gramnegativebacilli, their behaviour to antibiotics is fluctuating and depends on the speciesconcerned: the most resistant germs are Bacteroides var. fragilis which are alwaysresistant to beta-Iactamins and colistin, in particular.
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