Projektgruppen

Jørn Pedersen

Jan-Åke Eriksson, Minna Toivonen, Jukka Pösö

Ulrik S. Nielsen og Gert P. Aamand

NAV avlsværdital for HoldbarhedJørn Pedersen og Anders Fogh

Oversigt

• NAV-holdbarhedsprojektet

• Hvilke data indgår – og hvordan

• Model, heritabiliteter, genetiske korrelationer

• Resultater, ændringer

• Base

• Udvikling over tid (trends)

• Korrelationer mellem det gamle og nye indeks

• Relation til andre egenskaber

• Værdi i NTM

2

Tidligere anvendte holdbarhedsmodeller

• DNK, FIN: Funktionel holdbarhed = ydelseskorrigeret

Overlevelsesmodel (“Survival KIT”)

• SWE: Produktiv holdbarhed = ikke korrigeret for ydelse

Lineær model med 3 egenskaber:

• Overlevelse til 2. laktation – enten-eller egenskab

• Overlevelse til 3. laktation – enten-eller egenskab

• Overlevelse til 4. laktation – enten-eller egenskab

3

Projektgruppens opgaver

• Formål:

Udvikling af NAV avlsværdital for holdbarhed

• 3 race grupper: RDC, HOL(+DRH), JER• Ens model for alle 3 lande

• Ens genetiske parametre for alle 3 lande

• Produktiv holdbarhed dvs. ukorrigeret for ydelse

4

Opgaver i projektet

• Definition af egenskaben (projektgruppen)

• Model

• Beregning af genetiske parametre Heritabiliteter– genetiske og miljømæssige korrelationer

• Analyser

• “Rekursiv” - proces

5

Holdbarhedsegenskaber

• DAGE11: Dage fra 1. kælving til slutningen af 1. laktation (informationsegenskab)• DAGE12: Dage fra 1. kælving til slutningen af 2. laktation (informationsegenskab)

• DAGE13: Dage fra 1. kælving til slutningen af 3. laktation (avlsværdi)

• DAGE14: Dage fra 1. kælving til slutningen af 4. laktation (informationsegenskab)• DAGE15: Dage fra 1. kælving til slutningen af 5. laktation (informationsegenskab)

Maximalt 365 dage per laktation er inkluderet365 dage per laktation, hvis koen overlever til næste laktation

(dvs. ingen ”straf” for god frugtbarhed)

DAGE13 er den avlsværdi, som bliver omregnet til et indeks og bliver publiceret

6

Edit of data

Oplysninger om kælvninger og afgange kombineres

• Kun 1. til 5. laktation anvendes

• Køer, der indgår, har kælvet efter 1.1.1985 for DNK og SWE - og efter 1.1.1988 for FIN

• Alle køer skal starte med en 1. kælvning

• Alle kælvninger/laktationer, som indgår skal være fra samme besætning

• Efter besætningsskift anses observationerne for at være manglende (det der er i orden slettes ikke)

• Alder ved 1. kælvning skal ligge mellem 450 og 1280 dage • Køer med ukendt fødselsdato indgår ikke

7

“Opportunity” perioderEksempel: Hvis en ko afgår efter 20 dage i en laktation indgår oplysningen IKKE før

den har haft mulighed for at leve 365 dage

“Opportunity” perioder

• DAGE11: Oplysning anvendes først 365 dage efter 1. kælvning

• DAGE12: Oplysning anvendes først 365 dage efter 2. kælvning

• DAGE13: Oplysning anvendes først 365 dage efter 3. kælvning

• DAGE14: Oplysning anvendes først 365 dage efter 4. kælvning

• DAGE15: Oplysning anvendes først 365 dage efter 5. kælvning

Vigtig oplysning:

• Dato for dataudtræk

• Dato for besætningsophør (dato for sidst kendte 1. kælvning)8

Gennemsnit for HOL, RDM og JER med1. kælvning 2000-2004

9

DAGE11 DAGE12 DAGE13 DAGE14 DAGE15

HOL 327 539 659 719 747

RDM 327 541 663 723 751

JER 323 545 685 767 813

Minimum 0 0 0 0 0

Maksimum 365 730 1095 1460 1825

Animal Model Multi-trait med 5 egenskaber

Effekter i modellen• Alder ved 1. kælvning

• Kælvningssæson (år x måned - 1. kælvning)

• Besætning x 5 års periode (år for 1. kælvning)

• Heterosiseffekter (mange hos RDM/RDC)

• Genetiske grupper modelleret som fantom forældre (race x tid)

• Besætning x 1. kælvningsår (tilfældig)

• Ko (tilfældig genetisk effekt)

10

Genetiske parametreHeritabiliteter

11

DAGE11 DAGE12 DAGE13 DAGE14 DAGE15

HOL 0.035 0.052 0.062 0.069 0.072

RDM 0.029 0.044 0.057 0.066 0.072

JER 0.035 0.051 0.060 0.063 0.064

Holstein genetiske korrelationer

RDM og JER: Næsten samme resultater

12

DAGE11 DAGE12 DAGE13 DAGE14 DAGE15

DAGE11 0.94 0.89 0.86 0.84

DAGE12 0.99 0.97 0.96

DAGE13 0.996 0.989

DAGE14 0.998

DAGE15

Oversigt – hvor er vi nået til

• NAV-holdbarhedsprojektet

• Hvilke data indgår – og hvordan

• Model, heritabiliteter, genetiske korrelationer

• Resultater, ændringer

• Base: Generel ændring – tidsuafhængig

• Trends: Generel ændring – tidsafhængig

• Korrelationer: Individuelle ændringer

• Relation til andre egenskaber

• Værdi i NTM

13

Base ændringerTidligere: Tyre født 15.8.2002 – 15.8.2004August 2010: Køer født 15.8.2005 – 15.8.2007 Skyldes IKKE den nye model

14

Base ændring

VirkningI NTM

HOL ÷6.5 ÷0.72

RDM ÷2.0 ÷0.16

JER ÷5.7 ÷0.68

Holstein – udvikling i holdbarhedsindeks

15

RDM – udvikling i holdbarhedsindeks

Jersey – udvikling i holdbarhedsindeks

17

Korrelationer mellem det gamle og det nye holdbarhedsindeks pr. år

Tyre født 1997-2003

18

HOL RDC JER

DNK 0.81 0.77 0.73

FIN 0.84 0.80

SWE 0.86 0.84

19

Korrelationer pr. årgang: Individuelle ændringerHvorfor så lave korrelationer?

• FIN, DNK:

• Ikke ydelseskorrigeret holdbarhed

• Lineær model versus ”overlevelse” – tidlig afgang lidt tæller mere

• SWE:

• Dage baseret – versus enten-eller

• Dage baseret mod laktationsbaseret (den gamle svenske model havde stor sammenhæng med frugtbarhed)

• Lidt lavere korrelationer i DNK - end i FIN og SWE

• Mange faktorer – ikke en enkelt afgørende faktor20

RDC: Korrelationer med andre indekserGns. pr. år i perioden 1997-2003

YdelseFrugt-barhed

YverSundh.

Andre sygd. Krop Lemmer

Malkeorg.

DNK Gl -0.10 0.10 0.51 0.25 -0.30 0.21 0.32

Nyt 0.24 0.19 0.43 0.28 -0.27 0.13 0.24

FIN Gl -0.27 0.33 0.52 0.31 -0.14 0.11 0.40

Nyt 0.08 0.21 0.40 0.26 -0.02 0.11 0.35

SWE Gl 0.06 0.43 0.31 0.27 -0.06 0.06 0.19

Nyt 0.25 0.25 0.30 0.29 -0.10 0.07 0.19

Korrelationer mellem ny holdbarhed og andre egenskaber

Tyre født 1997-2003

22

YdelseFrugt-barhed

Yver-sund-hed

Andre syg-

domme Krop LemmerMalke-

organer

HOL 0.17 0.42 0.40 0.50 -0.14 0.13 0.25

RDM 0.24 0.19 0.43 0.28 -0.27 0.13 0.24

JER 0.14 0.12 0.47 0.29 -0.15 0.26 0.27

Standardisering af variationTyre født 1997-1998

23

Dage indeholdt i 1 indeksenhed

RDC HOL JER

DAGE11 1.15 1.25 1.34

DAGE12 3.70 4.15 4.09

DAGE13 6.75 7.24 7.12DAGE14 9.43 9.64 9.59

DAGE15 11.29 11.10 11.39

Værdi af holdbarhedindeks i NTMBasal økonomisk værdi er ikke påvirket (kr./dag)

Hvordan kan en ændret metode ændrer værdi/vægt:

• Ændret definition af egenskaben: Principielt uændret

• Ændret indhold af en indeksenhed (standardisering af variationen)

• Specielt for holdbarhed: Overførslen af værdi til Yversundhed, Andre sygdomme, Frugtbarhed, Malkeorganer og Lemmer&klove

Beslutning: Uændret vægtning

(0.11, 0.08, 0.12 for HOL+DRH, RDM og JER)24

Afslutning: NAV-holdbarhed

Ny fælles model er udviklet

• Baseændring – skyldes IKKE den nye model

• Store ændringer i genetisk fremgang

• Lidt store individuelle ændringer

Fremtidsplaner

• Evt. overlevelsesmodel

25

Anerkendelse

Det Europæiske Fællesskab og Fødevareministeriet ved Direktoratet for FødevareErhverv har deltaget i finansieringen af denne aktivitet.

DNA-ordog