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Oferta trabajos fin de máster Investigación
Biomédica
En Septiembre se colgará de la página de coordinación del máster la oferta definitiva de los TFMs. A esta oferta definitiva tendrán acceso los nuevos alumnos una vez formalizada la matrícula. En Septiembre habrá además unas jornadas en las que los profesores presentarán sus ofertas y en las cuales se tendrá la posibilidad de conocerlos. Hasta entonces hacemos visible esta oferta provisional para que los interesados en el Máster puedan visualizar los trabajos y si es su deseo puedan contactar vía correo electrónico con los profesores que responderán a sus dudas al respecto de los trabajos en los que muestren interés.
OFERTA 1
Directores: Miguel Abal/Lorena Alonso‐Alconada
Datos de Contacto: Oncoloxía Médica Traslacional; Instituto de Investigación Sanitaria de
Santiago (IDIS)
Título del Trabajo: Aproximación clínica a la metástasis: desde el nicho premetástasico a la
colonización tumoral
Resumen del Trabajo: El cáncer es una de las enfermedades más devastadoras en sociedades
modernas. En sus estadios iniciales el cáncer se presenta como una enfermedad con
alternativas clínicas eficaces. Sin embargo, la aparición de núcleos tumorales diseminados
cambia drásticamente el escenario clínico con tratamientos de eficacia limitada y
generalmente asociados a toxicidad, lo que compromete el éxito clínico. Nuestro objetivo es
proporcionar herramientas clínicas orientadas a la alteración de la secuencia de eventos que
conducen a la diseminación tumoral desde un abordaje multifocal que integra tanto al
paciente como a modelos de enfermedad, y tanto a la célula tumoral responsable de las
metástasis como al entorno determinante en el éxito del proceso de metástasis. En primer
lugar, buscamos conocimiento molecular y estructural más detallado de las células tumorales
circulantes (CTCs) precursoras de las lesiones metástasicas. En segundo lugar, la metástasis no
es meramente un proceso celular invasivo sino que va acompañado de una gran plasticidad
influenciada por el ambiente tumoral. Ambos favorecen en última instancia el anidamiento de
la CTC para colonizar la metástasis. En este sentido, evaluaremos cómo la comunicación que se
establece entre la CTC y su entorno a través de vesículas extracelulares (exosomas), es capaz
de acondicionar el tejido endotelial del huésped, y que representa la primera barrera física que
deben atravesar las células tumorales circulantes en su proceso colonizador. Estudiaremos
también el impacto de la proteína ANXA2, relacionada con la producción de exosomas, en la
aparición de recurrencias en cáncer de endometrio, el cáncer ginecológico más frecuente en
países desarrollados y que presenta una supervivencia a 5 años de sólo el 19% cuando se
produce metástasis a distancia.
OFERTA 2
DIRECTORES:
Isabel Moscoso Galán
Ricardo Lage Fernández
Datos de Contacto:
Título del Trabajo:
CARACTERIZACIÓN DE CARDIOTOXICIDAD ASOCIADA AL USO DE QUIMIOTERÁPICOS:
Resumen del Trabajo:
Estudios retrospectivos recientes demuestran una alta incidencia de enfermedades cardiovasculares (CV) asociadas al tratamiento con antineoplásicos, con diferente grado de importancia y de aparición variable tras el tratamiento, pero con un gran impacto en la calidad y esperanza de vida de los pacientes. A pesar de que la inclusión de nuevas terapias dirigidas ha reducido la toxicidad, un gran número de estudios muestran una elevada incidencia de complicaciones cardiovasculares graves asociadas a las mismas. En este sentido, la magnitud del problema no está clara dado que sólo en unos pocos casos se ha realizado una evaluación prospectiva de la función cardíaca y el elevado número de pacientes bajo terapia combinada además de los factores de riesgo intrínsecos al paciente aumenta la complejidad de las conclusiones de los mismos. La predisposición a la cardiotoxicidad (CT) es multifactorial, está determinada por la interacción entre factores genéticos y ambientales. La CT es en muchas ocasiones una limitación importante para el paciente a la hora de acceder esquema quimioterápico más adecuado, teniendo que recurrir a tratamientos alternativos con un menor grado de contraindicaciones y menor eficacia. Aunque la CT se refleja por el deterioro de la función cardiaca, también se han descrito cambios periféricos en el flujo hemodinámico y procesos trombogénicos. El desarrollo de problemas de CV después de o durante el uso de antineoplásicos está claramente determinado por diferentes factores: el tipo de quimioterapia, la vía de administración, la dosis acumulada, la edad y el sexo de los pacientes y el uso de esquemas combinados. La CT varía desde anormalidades subclínicas asintomáticas (cambios en el electrocardiograma y la disminución de la fracción de eyección del ventrículo izquierdo (FEVI)) a efectos graves, como insuficiencia cardiaca (IC) o síndrome coronario agudo. Los tratamientos citostáticos tradicionales, especialmente las antraciclinas, producen daños irreversibles normalmente asociados con la muerte de los cardiomiocitos. La hipertensión, las arritmias, la disfunción ventricular y el fallo cardiaco son las complicaciones descritas más comunes de los nuevos fármacos contra el cáncer; parecen ser reversibles y más benignas ya que se asocian con la hibernación celular. Entre las complicaciones más frecuentes derivadas de la CT, que destacan por su gravedad, son la IC y la isquemia. Diferentes estudios atribuyen una incidencia variable de la disfunción ventricular y el fallo cardíaco dependiendo del tratamiento. Sin embargo, existe una gran preocupación acerca de una amplia gama de antineoplásicos utilizados como son las antraciclinas, los antimetabolitos, los agentes quelantes y los anticuerpos monoclonales, que presentan incidencias de CT mayores de 25%. Actualmente, la CT se determina mediante la evaluación de los cambios en la FEVI, no obstante, dichos cambios se producen cuando el daño es irreversible. Además, varios estudios han demostrado que el daño miocárdico por agentes antitumorales eleva los niveles de troponina I (cTnI) y T (hs-cTnT) en la sangre antes que se detecten cambios en la FEVI y que por tanto podría ser capaz de predecir, en una fase temprana la disfunción miocárdica del ventrículo izquierdo y quizás su gravedad. Los datos obtenidos hasta ahora, sugieren que el desencadenante de la IC asociada a la CT está en el daño a nivel mitocondrial que se produce en los cardiomiocitos debido a la formación de radicales libres, el estrés oxidativo, la disminución en los niveles de ATP, disminución de la expresión de SERCA en el retículo, estrés de retículo, daño estructural y funcional que finalmente desencadena la muerte de los cardiomiocitos. Existen evidencias clínicas de que el
abordaje profiláctico de la misma con agentes cardioprotectores previene la disfunción ventricular así como el fallo cardiaco en pacientes sometidos a quimioterapia. ‐ Monitorización de la función cardíaca durante el tratamiento con agentes cardiotóxicos en la
terapia antineoplásica.
La identificación de grupos de riesgo y de métodos de detección precoz de toxicidad cardiovascular podría ser de gran utilidad para desarrollar estrategias de seguimiento de estos pacientes. En el momento actual no existe ninguna escala clínica que permita predecir el riesgo de CT; las manifestaciones clínicas de enfermedad son tardías, las pruebas funcionales cardiológicas podrían detectar alteraciones cardiovasculares asintomáticas pero se utilizan sin un fundamento basado en experiencia clínica sólida y es probable que nuevos marcadores de daño miocárdico y nuevos parámetros de función ventricular por imagen sean más sensibles que las pruebas funcionales empleadas actualmente para la detección precoz de CT. ‐ Agentes cardioprotectores para la prevención de la CT. Abordaje profiláctico.
Teniendo en cuenta el origen oxidativo de la CT asociada al tratamiento individualizado con antraciclinas o combinado con los inhibidores de ErB2 y los datos actuales que sugieren la acción antioxidante de las estatinas, los β-bloqueantes y los ACEi, nos planteamos si el uso de agentes cardioprotectores habituales podrían prevenir la muerte del cardiomiocito. OFERTA 3 Director:
Dr. Oreste Gualillo . Investigador Estatutario A, SERGAS
Datos de Contacto: Dr. Oreste Gualillo, PharmD, PhD SERGAS, Xerencia Xestión Integrada de Santiago Santiago University Clinical Hospital IDIS: Instituto de Investigación Sanitaria de Santiago NEIRID Lab, NeuroEndocrine Interactions in Rheumatology and Inflammatory Diseases, Research Area, Laboratory nº 9 Building C, Level -2 Trav. Choupana sn 15706 Santiago de Compostela SPAIN Ph. & Fax: +34+981+950905 Labphone: +34+981+955091 [email protected] [email protected] Skype Me as: gualactarus
Título del Trabajo:
Estudio de las relaciones entre factores nutracéuticos (fracción aromática del aceite virgen
extra de oliva EVOO), procesos inflamatorios y respuesta inmune en las enfermedades
reumáticas y en la fisiopatología del cartílago articular.
Resumen del Trabajo:
Ensayos de actividad farmacológica en sistema de cultivo celular in vitro de condrocitos, sinoviocitos y células óseas. Diana de estudio: oxido nítrico sintasa inducible, Ciclooxigenasa,
Adipokinas.
OFERTA 4
Profesor tutor/Director: Jesús R. Requena Datos de Contacto: [email protected] CIMUS, lab SS6 Título del Trabajo: Estudios estructurales de priones recombinantes/Estudos estructurais de prions recombinantes/Structural studies of recombinant prions Resumen del Trabajo: Prions are infectious proteins. They constitute a fascinating new biological entity. The most notorious prion, PrPSc, is the causal agent of the transmissible spongiform encephalopathies, a group of fatal neurodegenerative diseases that affect humans and animals. But, how is it possible for a protein to be infectious? Proteins that can behave as prions present themselves in two alternative conformations: a “normal” conformation and a “prion” conformation. Transition from the normal to the prion conformation is therefore just a simple conformational change. But what is unique about such transition is that, being extremely improbable under normal circumstances, it is catalyzed by the presence of proteins in the prion conformation. In other words, once formed, prions act as templates and favor transformation of precursor proteins into more prions in a lethal self‐perpetuating spree. What is the molecular basis of this process? We do not know the details, but we are beginning to unveil that it involves hydrogen bonds and steric constraints not unlike those operating during replication of nucleic acids, the quintessential process of molecular information transmission. But unfortunately we will not fully understand these processes until we understand the structure of PrPSc. And this is a difficult task: PrPSc is an insoluble aggregate, and classic high resolution techniques such as NMR or X‐ray crystallography are useless. However, critical pieces of structural information have been gathered in the last years, and our lab has made some key contributions to that endeavor. For example, we know that PrPSc is an amyloid. In this context, the recent development of methods to prepare recombinant PrPSc (recPrPSc, i.e., prions prepared by misfolding recombinant PrP in vitro) offer exciting opportunities for structural studies. With this in mind, the objective of this TFM proposal is to carry out structural studies of recombinant bank vole (Myodes glareolus) PrPSc using an array of biochemical and analytical techniques. The M.Sc. student will express PrP and purify it by means of Ni‐NTA chromatography. The purity and nature of preparations will be assessed by SDS‐PAGE and WB. He/she will then convert this PrP to recPrPSc by application of state‐of‐the‐art methods developed by Dr. Joaquín Castilla (CIC‐bioGUNE, Bilbao) that will need to be set up in our lab. Recombinant PrPSc samples will be biochemically characterized (resistance to proteases) and their infectious nature assessed by inoculation to transgenic mice expressing the bank vole PrP gene. Infectious recombinant PrPSc will be subjected to structural studies using limited proteolysis and electron microscopy. In limited proteolysis studies, the sample is subjected to treatment with proteinase K (PK), a non‐specific protease that cleaves preferentially at sites within "loose" regions (i.e., exhibiting "random coil" or "loop"
conformation), sparing stretches with a more compact structure, i.e., ‐strands. Cleavage sites will be identified by means of mass spectrometry‐based analysis of PK‐resistant fragments. Samples will also be studied by negative stain transmission electron microscopy. We expect to gather through these experiments very valuable structural information. The M.Sc. will thus have a chance to participate in an exciting research project expected to eventually result in a publication (in which he/she will share authorship) and gain experience in a wide range of protein biochemistry techniques. He/she will also interact with our collaborators in Bilbao and Canada. His/her studies might be continued in the future in the
form of a doctoral research project. For more information and/or to visit the Requena lab at CIMUS, please contact Jesús Requena at: [email protected] OFERTAS 5 y 6
Director: Eduardo Fernández Megía
Datos de Contacto: 8818 15727 / [email protected] / https://www.facebook.com/MegiaLab
Título del Trabajo: Micelas Dendríticas para el Transporte Selectivo de Fármacos
Resumen del Trabajo:
El transporte de fármacos es un área de investigación multidisciplinar que ha experimentado un gran avance en la última década. Su finalidad es la encapsulación, direccionamiento y liberación controlada de fármacos en tejidos/células diana mediante el uso de vectores. Dentro de estos, los sistemas nanométricos son particularmente atractivos ya que aseguran un prolongado tiempo de circulación en el flujo sanguíneo. Su desarrollo se ha visto favorecido por dos descubrimientos clave: (i) la reducción de inmunogenicidad, aumento de estabilidad in vivo y del tiempo de circulación mediante modificación con polímeros hidrofílicos biocompatibles, como poli(etilen glicol) (PEG), y (ii) el enhanced permeability and retention (EPR) effect, que explica la acumulación selectiva de sistemas nanométricos en tumores sólidos por la presencia de fenestraciones en la vasculatura y un pobre drenaje linfático.
En este contexto, las micelas poliméricas formadas a partir de copolímeros de bloque PEG-dendrímero (ver figura) son particularmente atractivas debido a su fácil modificación estructural, capacidad de autoensamblaje, y elevada estabilidad. Estas micelas poseen un núcleo dendrítico rodeado de cadenas flexibles de PEG que proporcionan estabilidad coloidal, solubilidad y prolongados tiempos de circulación. Estas características unidas a su tamaño nanométrico favorecen su acumulación selectiva en tumores sólidos por EPR.
En este proyecto desarrollamos micelas basadas en copolímeros PEG-dendrímero con grupos funcionales que permiten su unión covalente y reversible a fármacos antitumorales, antiinflamatorios, antibióticos y antifúngicos. Se pretende aprovechar la naturaleza hidrofóbica de los fármacos para producir un cambio en el balance hidrofilia-hidrofobia de los copolímeros que resulte en la formación de micelas. Una vez en el sitio de acción (tumor o endosoma), las micelas serán desestabilizadas mediante estímulos externos, por ejemplo bajo pH o presencia de determinados metabolitos. La persona responsable se encargará de la síntesis de los copolímeros PEG-dendrímero y de la preparación y caracterización de las micelas con fármacos anticancerígenos: doxorubicina, gemcitabina y camptotecina. Se analizará la capacidad de encapsulación de los fármacos, la estabilidad de las micelas, su internalización celular, citotoxicidad, así como su biodistribución y farmacocinética. Por último en los sistemas más prometedores se evaluará la eficacia de las micelas in vivo.
OH
OH
O
OOMe
OOH
NH2O
OH
OH
O
Doxorrubicina(Antitumoral)
Fluorescence images of A549 cells treated with Dox-encapsulated micelles (red).Colocalization assay with Lysotracker green and Hoechst
OX3
O
X
3
O
X3
O
Release studiesof Dox at
different pHvalues
-----------Cell viability ofA549 at 24 h inthe presence of
Dox, Dox-loaded micelle,
and PEG-dendrimer
Visible Lysotracker GreenHoechst 33342 DOX Merge
OFERTA 7
Director: Antonio González Martínez‐Pedrayo
Datos de Contacto: Laboratorio de Investigación 10 (planta ‐2 de consultas). Hospital Clínico
Universitario de Santiago. Travesía de Choupana sn. 15706‐ Santiago de Compostela.
Tfno: 981950903; email: [email protected]
Fecha y lugar de la entrevista: concertar en las fechas previstas
Título del Trabajo: Biomarcadores de respuesta al tratamiento en la artritis reumatoide
Resumen del Trabajo:
Nuestro grupo lidera un programa de investigación en España financiado por el ISCIII para la
búsqueda de biomarcadores de respuesta al tratamiento en la artritis reumatoide (AR). En este
programa participan otros 14 grupos de investigación y es previsible que tenga financiación
hasta 2021. La AR es una enfermedad compleja en la que participan desde un componente
genético a factores ambientales, como el tabaquismo, pasando por alteraciones inmunológicas
y que puede causar una gran incapacidad además de acortar la esperanza de vida de los
pacientes. Los tratamientos actuales están basados en disminuir la inflamación e incluyen
fármacos con dianas moleculares específicas como los inhibidores del TNF o de la IL6, otros
bloquean la coestimulación necesaria para activa los linfocitos T o eliminan a la mayoría de los
linfocitos B. Sin embargo, todos ellos fracasan en una fracción importante de pacientes,
probablemente debido a la heterogeneidad de la enfermedad. Esta heterogeneidad de
respuesta se ha convertido en un reto crítico ya que muchos pacientes están tratados de
forma subóptima por falta de biomarcadores que nos indiquen el mejor fármaco para cada
paciente. De hecho, el cambio de un tratamiento a otro resulta en control de la enfermedad en
un porcentaje significativo de pacientes. Por ello, la medicina personalizada se ha convertido
en un objetivo urgente en el tratamiento de la AR. Ya se han llevado a cabo numerosos
estudios explorando el tejido sinovial, el líquido sinovial, el suero y la orina en busca de
biomarcadores. Se han utilizado técnicas proteómicas, análisis de autoanticuerpos,
microarrays de expresión de RNA, estudios de genes candidatos y de genoma completo,
citometría de flujo y cultivos celulares. Se han encontrado bastantes posibles biomarcadores,
sin embargo, pocos han sido validados. Algunos han sido identificados y validados gracias a
nuestro grupo, como un polimorfismo en PTPRC, un polimorfismo de FCGR2A, la
incompatibilidad en el alotipo de las IgG1 y los niveles de proteínas del suero identificadas
mediante proteómica. Vamos a seguir validando estos y otros resultados, pues el camino
desde el descubrimiento al uso en la práctica para orientar el tratamiento de los pacientes es
largo. Además, estamos realizando estudios de expresión génica en subpoblaciones de
linfocitos y de monocitos, estudios de metilación, de autoanticuerpos y de fenotipos celulares
para identificar otros posibles biomarcadores. Todos estudios son sólo posibles por la
colaboración entusiasta y generosa de muchos pacientes, reumatólogos e investigadores en
nuestro centro y en los centros colaboradores.
Nuestro objetivo es encontrar biomarcadores que ayuden a elegir el fármaco más prometedor
para cada paciente con AR y, al mismo, tiempo conocer mejor la enfermedad.
Nuestro objetivo es que est a orientar la elección del mejor fármaco para los pacientes con AR.
OFERTA 8
Profesor tutor/Director: Juan Zalvide Torrente
Datos de Contacto:
Despacho P1D7 del CIMUS.
Tel: 881815414.
Correo: [email protected]
Título del Trabajo: células madre pluripotenciales y diferenciación.
Resumen del Trabajo:
El tema del trabajo es el estudio de células madre (stem cells) pluripotenciales y su capacidad
de diferenciación tras la manipulación genética de proteinquinasas tipo Ste20 y proteínas
asociadas.
El control de la diferenciación de células madre es esencial si queremos utilizarlas como
herramienta terapéutica. Sin embargo, es tal vez el campo de la biología de las células madre
en el que más queda por saber. El estudio de esta parte de la biología de las células madre se
ha centrado hasta ahora sobre todo en mecanismos epigenéticos y de regulación
transcripcional en general, pero sabemos poco sobre su regulación por proteínquinasas y en
respuesta a estímulos externos. Es esta parte en la que estamos interesados en el laboratorio,
concretamente en la familia GCKIII de quinasas Ste20 y sus proteínas adaptadoras, de las que
existen evidencias preliminares de su papel en este proceso.
El trabajo consistirá en el manejo de células madre pluripotenciales y su diferenciación. Se
podrán inactivar genes relevantes mediante técnicas de interferencia de RNA y/o CrispR/Cas9,
y se estudiará su capacidad de diferenciación.
OFERTA 9
Profesor tutor/Director: Celia M Pombo Ramos
Datos de Contacto:
Edificio CIMUS. Despacho 6, planta 1
Extensión: 15413.
Correo: [email protected]
http://cellstress.weebly.com/
Título del Trabajo:
Estrés metabólico y diabetes tipo II.
Resumen del Trabajo:
La diabetes tipo 2 es una de las dolencias más importantes en el mundo, y provoca un gran
número de complicaciones que afectan al nivel de vida de las personas que la padecen y
suponen una gran carga para los sistemas de salud.
Una de las señas de identidad del desarrollo de la diabetes tipo II es la resistencia hepática a la
insulina lo que conlleva a que el hígado aumente la producción de la gluconeogénesis
aumentando la glucosa en sangre por encima de los niveles basales de una persona sana.
En nuestro laboratorio estamos estudiando la respuesta de las kinasas de estrés en varias
circunstancias entre otras al estrés metabólico que precede al desarrollo de la diabetes tipo II.
En este aspecto hemos encontrado que en modelos animales de obesidad la kinasa Mst3
aumenta su actividad; por el contrario en estos mismos modelos de obesidad pero en los que
está inhibida la expresión de esta kinasa, por destrucción del gen (ratones KO Mst3), hemos
visto que el aumento de glucosa en sangre vía gluconeogénesis está significativamente
disminuido.
En estos momentos estamos ahondando en los mecanismos moleculares de la regulación de la
gluconeogénesis por esta kinasa con el fin de poder trasladar a la clínica la posible aplicación
de inhibidores de la misma para el tratamiento de la elevación de la glucosa en las personas
con diabetes tipo II.
El trabajo de la persona que se incorpore al grupo a través del TFM consistiría en por un lado
valorar la repuesta de la kinasa Mst3 a activadores de las rutas implicadas en gluconeogénesis
(glucagón, estímulos beta adrenérgicos‐adrenalina y noradrenalina‐ y glucocorticoides),
estudiar la efectividad de un inhibidor de la kinasa en la respuesta gluconeogénica en diversos
modelos celulares y animales y además estudiar los niveles de activación de la kinasa en
muestras humanas procedentes de hígados de individuos con hígado graso y/u obesos.
La experiencia del grupo en el estudio de respuesta a estrés está avalada por diversas
publicaciones que podéis consultar en el medline.
Se busca gente interesada en realizar la tesis doctoral y seguir la carrera investigadora.
OFERTA 10
Profesores tutores (Directores) / Profesores titores (Directores) /Supervisors: Dra.
Montserrat Nogueira y Dr. Francisco J Salgado
Datos de contacto / Datos de contacto / Address: Grupo “Biología del Linfocito”.
Departamento de Bioquímica y Biología Molecular. Laboratorio BQ1, 2ª planta del Centro de
Investigaciones Biológicas de la USC (CIBUS). Universidad de Santiago de Compostela. C/ Lope
Gómez de Marzoa s/n, 15782. Campus Vida. Santiago de Compostela. A Coruña. España.
Título del trabajo / Título do traballo / Title: "Estudio comparativo del secretoma de
diferentes poblaciones T cooperadoras humanas" / "Estudo comparativo do secretoma de
diferentes poboacións T cooperadoras humanas" / " Comparative study of the secretoma of
different human helper T populations"
Resumen del trabajo/Resumo do traballo/Summary:
Castellano
El grupo “Biología del Linfocito” (BioLinfo), referencia en el estudio de las células T
reguladoras, peptidasas y el proteoma del suero dentro de la USC, describió en 2012 la
existencia de bajos niveles de la peptidasa CD26/DPP4 en la membrana de células T
reguladoras (Treg) humanas en comparación con las células T efectoras (Tef). Trabajos
recientes indican que esta peptidasa es liberada en el plasma a través de procesos de
“shedding”, pero se sabe que está presente también en plasma asociada a vesículas
extracelulares. En base a esto, la hipótesis de partida del presente proyecto de TFM es que “el
secretoma vesicular y no vesicular de células Treg podría caracterizarse por diferentes niveles
de peptidasas en comparación con los de las células Tef”. Tomando ésta idea como punto de
partida, proponemos estudiar el secretoma de células Treg y células Tef humanas,
identificando (citometría de flujo, 2‐DE, western blot) la “huella celular” a través del tipo de
proteasas presentes.
Galego
O grupo "Bioloxía do Linfocito" (BioLinfo), referencia no estudo das células T
reguladoras, peptidasas e o proteoma do soro dentro da USC, describiu en 2012 a existencia
de baixos niveis da peptidasa CD26/DPP4 na membrana de células T reguladoras (Treg)
humanas en comparación coas células T efectoras (Tef). Traballos recentes indican que esta
peptidasa é liberada no plasma a través de procesos de "shedding", pero sábese que está
presente tamén en plasma asociada a vesículas extracelulares. En base a isto, a hipótese de
partida do presente proxecto de TFM é que o secretoma vesicular e non vesicular de células
Treg podería caracterizarse por diferentes niveis de peptidasas en comparación cos das células
Tef. Tomando esta idea como punto de partida, propoñemos estudar o secretoma de células
Treg e células Tef humanas, identificando (citometría de fluxo, 2‐DE, western blot) a "pegada
celular" a través do tipo de proteasas presentes.
English
The group "Biology of Lymphocytes" (BioLinfo), reference in the study of regulatory T
cells, peptidases and serum proteome at the USC, described in 2012 the existence of low levels
of the peptidase CD26/DPP4 in the membrane of human regulatory T cells (Treg) compared to
effector T cells (Teff). Recent studies indicate that this peptidase is released into the plasma
through a process of "shedding", but this marker is also known to be present in plasma in
association with extracellular vesicles. On this basis, the hypothesis of this project is that "both
the vesicular and the non‐vesicular secretome from Treg cells may be characterized by
different levels of peptidases compared to Teff cells". Taking this idea as a starting point, we
propose to study the secretoma of both human Treg cells and Teff cells, identifying (flow
cytometry, 2‐DE, western blot) the "cellular footprint" through these proteases.
Referencias bibliográficas/References:
Salgado FJ, Pérez‐Díaz A, Villanueva NM, Lamas O, Arias P, Nogueira M. CD26: a negative
selection marker for human Treg cells. Cytometry A. 2012 Oct;81(10):843‐55.
OFERTA 11
Profesor:
Jesús Casabiell Pintos. Profesor Titular del Departamento de Fisiología de la USC. Jesús Pérez Camiña. Investigador SERGAS del IDIS-Hospital Clínico Universitario de Santiago.
Datos de Contacto:
Jesús Pérez Camiña: Laboratorio de Endocrinología Celular (Lab. 4). Área de Endocrinología Molecular y Celular. Instituto de Investigación Sanitaria de Santiago, Hospital Clínico Universitario de Santiago. Santiago de Compostela. E-mail: jesú[email protected]. Telf.:981955072.
Jesús Casabiell Pintos: Departamento de Fisiología. Facultad de Veterinaria. Pabellón 2. Campus Universitario, 27002 Lugo. E-mail [email protected] Telef. 982820000, ext 22215.
Título del Trabajo:
Regeneración del músculo esquelético: de la célula madre satélite al miotubo.
Resumen del Trabajo:
En la actualidad, existe un gran interés en las terapias celulares dirigidas al tratamiento de
patologías caracterizadas por la degeneración del músculo esquelético. Sin embargo, estas
terapias no consiguen contrarrestar el daño ocurrido, por lo que existe una gran demanda de
tratamientos más efectivos que deben partir del conocimiento de los sistema moleculares
reguladores del proceso de miogénesis: de la célula satélite al miotubo. Pretendemos
establecer su potencial acción terapéutica para el tratamiento de patologías asociadas a la
regeneración muscular: distrofia muscular, atrofia muscular, sarcopenia y lesiones del músculo
esquelético.
OFERTAS 12 Y 13
Profesor tutor/Director: Director: Manuel Collado Rodríguez Tutor: Anxo Vidal Figueroa Datos de Contacto: [email protected] 981955441 Título del Trabajo: Células madre en cáncer y envejecimiento Resumen del Trabajo:
Los trabajos de TFM se dearrollarán en alguna de las líneas de trabajo del laboratorio.
1. Senescencia celular: El proceso de senescencia celular fue descrito inicialmente como la
parada estable proliferativa que experimentan las células somáticas normales tras un periodo
prolongado de cultivo en el laboratorio, lo que llevó a pensar que este proceso era un reflejo
de lo que ocurría in vivo durante el envejecimiento del organismo. Posteriormente se observó
que este mismo proceso se daba en células sometidas a distintas agresiones que ponen en
riesgo la integridad celular. Una de estas agresiones es la activación oncogénica y por ello la
senescencia celular comenzó a ser entendida como un proceso básico de defensa antitumoral.
Hoy en día disponemos de un mayor entendimiento de la senescencia celular pero quedan aún
muchas cuestiones por resolver. Una de las áreas de mayor interés tiene que ver con la
comunicación celular que se establece por parte de las células que experimentan senescencia
hacia las de su entorno y que podría ser la base de efectos tanto positivos como negativos.
2. Reprogramación celular para el estudio del cáncer: La reprogramación a célula de
pluripotencia inducida es un proceso celular descrito en el 2006 por Shinya Yamanaka que
permite devolver al estado pluripotente embrionario a cualquier célula somática adulta.
Además de ofrecer una gran promesa en el área de la terapia celular, la reprogramación nos
permite el estudio de aspectos fundamentales relacionados con la biología celular. En nuestro
caso aplicamos la reprogramación celular combinando la expresión in vitro de factores de
reprogramación y de oncogenes para diseccionar la contribución de los genes del cáncer al
establecimiento de la identidad tumoral.
3. El gen de pluripotencia Sox2 en cáncer y envejecimiento: El gen Sox2 es esencial para el
correcto desarrollo de mamíferos. Su expresión en etapas tempranas embrionarias es crítica
para permitir la pluripotencia de las células madre embrionarias. A lo largo del desarrollo se
expresa en progenitores de todas las capas germinales y en el adulto su expresión se mantiene
en pequeñas poblaciones de distintos tejidos, cumpliendo un papel esencial en la definición de
esas poblaciones como células madre adultas. Además de su papel fisiológico, las células Sox2+
parecen estar asociadas al inicio tumoral en distintas situaciones. El estudio de la regulación de
este gen en cáncer es importante para entender mejor el proceso neoplásico.
El hecho de que las células Sox2+ sean progenitores/células madre adultas de diversos tejidos
nos permite, utilizando herramientas genéticas, testar una de las hipótesis clave que intenta
explicar la base del envejecimiento que apunta al desgaste del potencial de estas células.
OFERTA 14
Profesor tutor/Director: Roman Perez Fernandez
Datos de Contacto: CIMUS Piso 1 Despacho 3
Título del Trabajo: Cáncer de mama
Resumen del Trabajo: Evaluar factores de transcripción implicados en cáncer de mama, así
como posibles tratamientos , incluyendo análogos de vitamina D de nueva generación.
OFERTAS 15 y 16
Profesor tutor/Director: Miguel Fidalgo
Datos de Contacto:
Centro de Investigación en Medicina Molecular y Enfermedades Crónicas (CIMUS)
Universidad de Santiago de Compostela
Laboratorio P1L7, Avenida de Barcelona, 15782
Tel: 8818 ext:15393
Email: [email protected]
Título del Trabajo:
Resumen del Trabajo: Reprogramación celular y enfermedades asociadas con el
envejecimiento.
Se ofertan 2 plazas para la realización de TFM en un laboratorio de nueva creación en el CIMUS
que aspira a ser una referencia nacional e internacional en el desarrollo de nuevas estrategias
para desentrañar los mecanismos moleculares y la búsqueda de nuevas dianas terapéuticas en
fisiopatologías asociadas con el envejecimiento (cáncer, enfermedades metabólicas y
neurodegenerativas). Nuestro laboratorio utiliza células madre pluripotentes (iPSCs y ESCs)
como principal modelo para interrogar los mecanismos subyacentes (genómicos, epigenéticos
y proteómicos) asociados con el cambio de identidad celular a lo largo del proceso de
envejecimiento y patologías asociadas. Nosotros utilizaremos aproximaciones proteómicas (IP‐
MS, SILAC‐MS…), genéticas (RNAseq, ChIPseq, ATACseq, RIP/CLIP‐seq, GW‐RNAi, CRISPR‐
Cas9…) y análisis bioinformáticas de un modo similar a las utilizadas por el IP en su etapa
postdoctoral que han conllevado importantes descubrimientos en el campo de la pluripotencia
y reprogramación celular reflejado en prestigiosas publicaciones (e.g. Nature, Cell Stem Cell,
Nature Cell Biology, Molecular Cell, Stem Cell, PNAS…). Las 2 ofertas de TFM serán la
continuación de estudios ya avanzados (contactar con el PI para más información) en la que los
candidatos tendrán la oportunidad de adquirir experiencia en dos de las tecnologías más
poderosas desarrolladas en el campo de la biomediciana durante los últimos años (iPSC y
CRISPR‐cas9) y contribuir de manera significativa a descubrimientos relevantes con posibles
aplicaciones terapéuticas. Se espera que los candidatos estén altamente motivados y con
ganas de trabajar en equipo.
OFERTA 17
Profesor tutor/Director:
Alejandro Blanco Verea
Datos de Contacto:
Instituto de Investigación Sanitaria de Santiago, Laboratorio nº 1. Hospital Clínico Universitario de Santiago, edif. consultas planta ‐2. Trav. da Choupana s/n. 15706 Santiago de Compostela. Telf.:981 955310 [email protected] Título del Trabajo:
Genética de cardiopatías hereditarias con riesgo de muerte súbita infantil
Resumen del Trabajo: La muerte súbita inexplicada en la infancia es un evento traumático, tanto para la familia inmediata como para los profesionales médicos. Cuando acontece en niños mayores de 1 año de edad se denomina muerte súbita inexplicada o síndrome de muerte arrítmica (SUDS / SADS), mientras que cuando ocurren en el primer año de vida se denomina síndrome de muerte súbita inexplicada en la infancia o del lactante (SUDI / SIDS). Cada vez existen más pruebas acerca de la implicación de las condiciones cardíacas hereditarias como la causa de estas muertes, y más recomendaciones resaltando la importancia del estudio genético. Esto tiene implicaciones de largo alcance para la familia con respecto al riesgo potencial para otros miembros de la familia y los embarazos futuros, proporcionando un desafío no sólo en el asesoramiento, sino también en la evaluación estructurada y la gestión de los familiares inmediatos. Con este trabajo planteamos el análisis y estudio de variantes genéticas en casos de muerte subita infantil o en niños diagnosticados de alguna cardiopatñia hereditaria asociada a muerte súbita cardíaca.
OFERTA 18
Profesor tutor/Director:
María Brion Martínez
Datos de Contacto:
Instituto de Investigación Sanitaria de Santiago, Laboratorio nº 1. Hospital Clínico Universitario de Santiago, edif. consultas planta ‐2. Trav. da Choupana s/n. 15706 Santiago de Compostela. Telf.:981 955310 [email protected]
Título del Trabajo:
Aplicaciones clínicas del test genético en los aneurismas y disecciones de la aorta torácica
Resumen del Trabajo: En los últimos años, la base genética del aneurisma y la disección de la aorta torácica, TAAD (del inglés thoracic aortic aneurysms and dissections), ha sido puesta de manifiesto en un subconjunto de pacientes. Hay una creciente evidencia para demostrar que la estratificación de riesgo clínico para la dilatación del aneurisma y la disección aguda puede estar basada en el genotipo de algunos de los genes conocidos, lo que permitiría un seguimiento médico y quirúrgico individualizado con el objetivo de reducir la morbilidad y la mortalidad. Además la determinación del genotipo de riesgo permitiría la identificación de familiares en riesgo mediante un análisis en cascada. Estudiaremos mediante secuenciación masiva casos procedentes de los servicios de
cardiología y de los institutos de medicina legal con el objetivo último de identificar variantes
genéticas causales o predictivas de aneurismas y disecciones de aorta torácica para el diseño
de procedimientos diagnósticos y terapéuticos alternativos dirigidos a las bases moleculares.
OFERTA 19
OFERTA TRABAJO FIN DE MASTER Profesor tutor/Director: Anxo Vidal/Carmen Rivas Datos de Contacto: Carmen Rivas, Cientifico titular del CSIC CIMUS, lab P2L7 [email protected] / [email protected] Titulo del Trabajo: Regulacion de la via de Ras por virus Resumen del Trabajo: Las proteinas Ras regulan un amplio espectro de funciones entre las que se encuentran la proliferacion y supervivencia celular. Ademas, la activacion de la via de Ras favorece la replicacion de distintos virus como el virus de la Hepatitis C o reovirus. Ademas, se ha demostrado que existe una relacion entre el oncogen Ras y la via del interferon. La activacion de la via de Ras puede reducir la expresion de interferon y la respuesta al mismo, lo que podria ser explotada por determinados agentes virales. Recientemente, hemos identificado un nuevo regulador de la via de Ras que sabemos se encuentra alterado en respuesta a la infeccion con determinados agentes virales o tras el tratamiento de las celulas con interferon. Por ello, en este proyecto planteamos estudiar el papel de este nuevo regulador en la relacion existente entre la via de Ras y la del interferon empleando los virus como herramienta. Esperamos que los resultados de este proyecto nos ayuden a entender un poco mejor la via de Ras y determinar los mecanismos moleculares que conectan dicha via con el interferon y la regulacion de la replicacion viral.
