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Parcours Biologie Humaine et Santé mention Biologie Le parcours Biologie Humaine et Santé partage certaines UE fondamentales avec le parcours Biologie Moléculaire et Cellulaire , et les associent avec des UE qui sont une introduction aux enseignements des Masters proposés dans le domaine du médicament et des sciences de la santé (UE assurées par des enseignants des UFR scientifiques, pharmaceutiques et médicales). Il prépare aux Masters suivants (Université Paris 11) : Génomes, Cellules, Développement, Evolution (GCDE) Ingéniérie Structurale et Fonctionnelle des Biomolécules (ISFB) Signalisation Cellulaire, Neurosciences (SCN) Santé publique De la conception à la qualité des médicaments et autres produits de santé Cibles biologiques, développement préclinique et clinique des produits de santé Physico-chimie, formulation, vectorisation et production des produits de santé Cancérologie (M2 après M1 GCDE, ISFB, SCN) Biologie et thérapies innovantes des grandes fonctions Le parcours BHS peut être suivi en intégrant le Magistère de Biotechnologies , pour l'année L3. Semestr e S1 Biologie cellulaire et moléculaire Cycles biologiques chez les animaux et les végétaux Mathématiques de la modélisation I Architecture de la matière : de l'atome aux macromolécules biologiques Introduc tion à la Géologie : éléments de dynamiqu e et d'histoi re terrestr e Projet profession nel UE au choix S1 UE au choix S1 UE au choix S1 S2 Diversité du vivant et évolution Approche génétique et écologique du monde vivant Optique, Energie, Evolution des systèmes Introduction aux molécules organiques Langues Méthodolog ie 1 Stage de géologie: Bassin de Paris- Normandie UE au choix S2 UE au choix S2 UE au choix S2 S3 Biochimie Biologie moléculaire Introduction à l'analyse génétique Mathématiques de la modélisation II Langues Histoire des sciences UE au choix S3 UE au choix S3 UE au choix S3

Parcours Biologie Humaine et Santé

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Parcours Biologie Humaine et Sant mention BiologieLe parcours Biologie Humaine et Sant partage certaines UE fondamentales avec le parcours Biologie Molculaire et Cellulaire, et les associent avec des UE qui sont une introduction aux enseignements des Masters proposs dans le domaine du mdicament et des sciences de la sant (UE assures par des enseignants des UFR scientifiques, pharmaceutiques et mdicales). Il prpare aux Masters suivants (Universit Paris 11) :

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Gnomes, Cellules, Dveloppement, Evolution (GCDE) Ingnirie Structurale et Fonctionnelle des Biomolcules (ISFB) Signalisation Cellulaire, Neurosciences (SCN) Sant publique De la conception la qualit des mdicaments et autres produits de sant Cibles biologiques, dveloppement prclinique et clinique des produits de sant Physico-chimie, formulation, vectorisation et production des produits de sant Cancrologie (M2 aprs M1 GCDE, ISFB, SCN) Biologie et thrapies innovantes des grandes fonctions

Le parcours BHS peut tre suivi en intgrant le Magistre de Biotechnologies, pour l'anne L3.

Semestre

S1

Biologie cellulaire et molculaire

Cycles biologiques chez les animaux et les vgtaux

Introduction la Architecture de la Gologie: matire : de l'atome Mathmatiques de lments Projet aux la modlisation I de professionnel macromolcules dynamique biologiques et d'histoire terrestre Mthodologie 1 Stage de gologie: Bassin de ParisNormandie Histoire des sciences

UE au choix S1 UE au UE au choix choix S1 S1

S2

Diversit du vivant et volution

Approche gntique et cologique du monde vivant

Optique, Energie, Evolution des systmes

Introduction aux molcules organiques

Langues

UE au choix S2 UE au UE au choix choix S2 S2 UE au choix S3 UE au UE au choix choix S3 S3

S3

Biochimie

Biologie molculaire Biologie du dveloppement animal et vgtal Grandes fonctions des plantes Informatique applique la biologie Physiologie animale

Introduction l'analyse gntique Biologie du dveloppement animal et vgtal Grandes fonctions des plantes Informatique applique la biologie Physiologie animale Dynamique cellulaire

Mathmatiques de la modlisation II

Langues

S4

Biologie du dveloppement animal et vgtal Grandes fonctions des plantes Informatique applique la biologie Physiologie animale

UE au choix S4 (hors biologie) Stage Prparation aux mtiers de l'enseignement

S5

Microbiologie, biologie

Biochimie structurale protines et acides

Formation pratique biochimie-biologie

UE au choix 1

UE au choix 2

molculaire

nucliques

molculaire

S6

Biochimie mtabolisme nergtique

Gntique des eucaryotes : systmes modles et gntique humaine

TP de gntique d'un eucaryote

Physiologie cellulaire et intgrative (PCI1)

TP de physiologie cellulaire et intgrative (PCI2)

UE au choix

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Rcapitulatif Parcours

S3

Biol200 Biochimie5 ECTS, volume horaire: 48h CM:24 TD:24 , responsable : Pierre Le Marchal Secrtariat : Secrtariat L2 Biologie, Brigitte Escalier, 01 69 15 65 61, Btiment 336, bureau 105

Objectifs : Introduction la structure des molcules biologiques, au mtabolisme nergtique et l'enzymologie. Prrequis : Biologie cellulaire et molculaire Rsum :

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Structure et proprits des acides amins. Structure et fonctions des protines. Exemple des anticorps. Enzymes. Dfinitions. Bases de la cintique enzymatique. Inhibitions comptitive et non-comptitive. Structure des acides nucliques. Structure des composs osidiques (mono et polysaccharides). Mtabolisme nergtique. Exemples de voies mtaboliques et de leur rgulation. Notion de transduction des signaux. Rle central de l'ATP. Couplages entre ractions d'oxydo-rduction et synthse de l'ATP (phosphorylation oxydative).

Parcours : Biologie Humaine et Sant (BHS), BioInformatique et BioStatistiques (Biologie) (BIBSB), Biologie et Chimie (Biologie) (BIOCHB), Biologie et Chimie (chimie) (BIOCHC), L2 BioPlus (BIOPLUS), Cursus Bio-Concours (L1+L2) (BIOPREPA), Biologie Molculaire et Cellulaire (BMC), Biologie des Organismes aux cosystmes - Biologie Intgrative (BOEBI), Biologie des Organismes aux cosystmes - cologie (BOEE) Modalits de contrle des connaissances (sous rserve) : F= note finale, P = Partiel, E = Examen final, TD = Travaux Dirigs, TP = Travaux Pratiques, O = Oral.

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Les notes obtenues dans les parties TD, TP et O sont du Contrle Continu. Session 1 : F = 0.25 P + 0.75 E Session 2 : F =

Supplment au diplme : Structure des sucres. Notions de mtabolisme et de couplage nergtique. ATP : biosynthse et rle central dans les transports. Structure des acides amins et des protines. Notions d'enzymologie.

Biol201 Biologie molculaire5 ECTS, volume horaire: 49.5h CM:34.5 TD:15 , responsable : Jean-Pierre Rousset Secrtariat : Secrtariat L2 Biologie, Brigitte Escalier, 01 69 15 65 61, Btiment 336, bureau 105

Objectifs : Amener en 50h de cours et TD les tudiants un niveau de base sur les concepts de la biologie moleculaire. Ceci doit permettre ceux qui ne poursuivent pas aprs la Licence d'emporter un bagage consquent en biologie molculaire. Pour ceux qui poursuivent en Master, les notions acquises dans cette Unit leurs seront utiles dans une grande varit de parcours.

Prrequis : Biologie cellulaire et molculaire et Approche gntique et cologique du monde vivant Rsum : 1. 2. 3. 4. 5. ADN et Chromatine et gnome (2 cours) Rplication de l'ADN (5 cours) Transcription de l'ADN (6 cours) Maturation des ARN Traduction (3 cours)

Parcours : Biologie Humaine et Sant (BHS), BioInformatique et BioStatistiques (Biologie) (BIBSB), Biologie et Chimie (Biologie) (BIOCHB), L2 BioPlus (BIOPLUS), Cursus Bio-Concours (L1+L2) (BIOPREPA), Biologie Molculaire et Cellulaire (BMC), Biologie des Organismes aux cosystmes - Biologie Intgrative (BOEBI), Biologie des Organismes aux cosystmes cologie (BOEE) Modalits de contrle des connaissances (sous rserve) : F= note finale, P = Partiel, E = Examen final, TD = Travaux Dirigs, TP = Travaux Pratiques, O = Oral.

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Les notes obtenues dans les parties TD, TP et O sont du Contrle Continu. Session 1 : F = 1 E Session 2 : F = 1 E

Supplment au diplme : Comprendre la base molculaire du maintien (rplication) et de la transmission (transcription, traduction) de l'information. Pralable pour aborder les aspects mthodologiques et conceptuels en L3.

Biol202 Introduction l'analyse gntique5 ECTS, volume horaire: 49.5h CM:19.5 TD:30 , responsable : Chantal Astier, Fabienne Chalvet Secrtariat : Secrtariat L2 Biologie, Brigitte Escalier, 01 69 15 65 61, Btiment 336, bureau 105

Objectifs : Apprentissage des mthodologies gntiques appliques aux procaryotes et aux eucaryotes. Prrequis : Approche gntique et cologique du monde vivant Rsum : CM :

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Gnomes des virus, bactries et eucaryotes Mutagense Cribles gntiques Marqueurs gntiques Dominance et rcessivit Le gne dfini par un groupe de complmentation Test de recombinaison et cartographie gntique Transferts de gnes chez les bactries et leurs virus

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Transgnse et transposition Systmes modles pour les maladies humaines Introduction aux interactions gniques et l'pigntique Gntique quantitative

Les TD illustreront ces contenus sous forme de prsentation d'exemples et de problmes Parcours : Biologie Humaine et Sant (BHS), BioInformatique et BioStatistiques (Biologie) (BIBSB), Biologie et Chimie (Biologie) (BIOCHB), L2 BioPlus (BIOPLUS), Cursus Bio-Concours (L1+L2) (BIOPREPA), Biologie Molculaire et Cellulaire (BMC), Biologie des Organismes aux cosystmes - Biologie Intgrative (BOEBI), Biologie des Organismes aux cosystmes cologie (BOEE) Modalits de contrle des connaissances (sous rserve) : F= note finale, P = Partiel, E = Examen final, TD = Travaux Dirigs, TP = Travaux Pratiques, O = Oral.

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Les notes obtenues dans les parties TD, TP et O sont du Contrle Continu. Session 1 : F = 0.3 P + 0.7 E Session 2 : F = 1 E

Supplment au diplme : dfinir

UE obligatoire (au S5 pour BIBSI et BIBSM)Math291 Mathmatiques de la modlisation II5 ECTS, volume horaire: 50h CM:20h TD:30h , responsable : Nathalie Castelle, Jacek Graczyk, Bruno Schapira Secrtariat : Secrtariat L2 Biologie, Brigitte Escalier, 01 69 15 65 61, Btiment 336, bureau 105

Objectifs : Le cours est compos de deux parties distinctes : * la premire partie expose les outils probabilistes ncessaires pour construire une mthodologie statistique, fait travaille r les tudiants sur des donnes issues des modles d'volution. L'objectif est que l'tudiant sache choisir et mettre en oeuvre diffrents tests d'hypothses pour analyser des donnes exprimentales. * la seconde partie prsente l'utilisation des quations diffrentielles pour mo dliser des systmes biologiques. L'objectif est que l'tudiant sache crire l'quation associe un problme donn, connaissent les solutions d'quations diffrentielles classiques et sache faire une tude qualitative et numrique d'quations diffrentie lles. Prrequis : Mathmatiques de la modlisation I Rsum : Partie I (30 heures) : Probabilits et statistiques. Rappels et complments de probabilit

Tests d'hypothses (choix et mise en oeuvre, test sur la valeur de la probabilit d'un vnement, tests sur des chantillons gaussiens, tests du chi2). Etude de donnes biologiques prsentes des enseignants de biologie Partie II (20 heures) : Equation diffrentielles et mthodes numriques. Gnralits sur les quations diffrentielles (exemples, conditions initiales, reprsentation graphique, mthode d'Euler) Equations variables sparables, quations diffrentielles linaires d'ordre 1 et 2 Etude qualitative d'quations diffrentielles Exemples de systmes dynamiques en dimension 2. Etude de systmes biologiques prsents par des enseignants de biologie Aide la russite - aide au travail universitaire : 12h de TD (sur 30h au total) sont assurs par des enseignants biologistes Parcours : Biologie Humaine et Sant (BHS), BioInformatique et BioStatistiques (Biologie) (BIBSB), Biologie et Chimie (Biologie) (BIOCHB), Biologie Molculaire et Cellulaire (BMC), Biologie des Organismes aux cosystmes - Biologie Intgrative (BOEBI), Biologie des Organismes aux cosystmes - cologie (BOEE) Modalits de contrle des connaissances (sous rserve) : F= note finale, P = Partiel, E = Examen final, TD = Travaux Dirigs, TP = Travaux Pratiques, O = Oral. Les notes obtenues dans les parties TD, TP et O sont du Contrle Continu.

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Session 1 : F = 0.37P + 0.5E +0.13E Session 2 : F = 0.5E

Supplment au diplme : Mise en oeuvre de tests statistiques sur des donnes biologiques. Modlisation et tude d'quations diffrentielles associes des problmes biologiques

Lang201 Langues2.5 ECTS Secrtariat : Langues, Langues, 01 69 15 74 53, 01 69 15 72 07, Btiment 337

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Anglais (Lang2011) Allemand (Lang2012) Espagnol (Lang2013) Italien (Lang2014) Russe (Lang2015)

Hist201 Histoire des sciences2.5 ECTS, volume horaire: 25h CM:10 TD:15 , responsable : Hlne Gispert

Objectifs : L'objectif de cet enseignement est de conduire tous les tudiants exercer leur rflexion sur les sciences en s'appuyant sur leur histoire. On cherchera faire saisir les dynamiques, au cours de l'histoire, de la construction des savoirs et des pratiques scientifiques, leurs enjeux tant pistmologiques que sociaux, tout en tant attentifs la rsonance contemporaine d'un tel enseignement. Cela conduit recourir une maquette qui permette d'engager effectivement les tudiants dans une telle rflexion critique ; celle-ci combinera enseignements magistraux et conduite en TD d'un projet de ralisation de poster sur un sujet donn. Rsum :

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Cours magistraux (I): Grands moments, grandes ruptures en histoire des sciences (Antiquit : Babylone-Egypte, Grce ; Monde arabe ; XVIIe et Rvolution scientifique) Travail sur dossier avec finalisation poster en sances de TD sur un dossier propos par les enseignants relevant d'un des 4 thmes : rvolution scientifique et rupture pistmologique, interactions entre disciplines, acteurs et institutions, expriences et instrumentation. Cours magistraux (II) : Retour sur l'histoire de champs disciplinaires : questions pistmologiques

Aide la russite - aide au travail universitaire :

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travail de TD par trinme en grands groupes avec co-encadrement fiche hebdomadaire de suivi de travail par trinme

Ouvrages de rfrence : Il n'y a pas d'ouvrage de rfrence particulier. Des rfrences sont indiques dans les dossiers et l'tudiant pourra consulter les ouvrages gnraux du fond histoire des sciences de la Bibliothque universitaire Parcours : Algbre, Analyse et Gomtrie (AAG), Biologie Humaine et Sant (BHS), BioInformatique et BioStatistiques (Biologie) (BIBSB), Bioinformatique et Biostatistiques - I (BIBSI), Bioinformatique, Biostatistiques M (BIBSM), Biologie et Chimie (Biologie) (BIOCHB), Biologie et Chimie (chimie) (BIOCHC), Biologie Molculaire et Cellulaire (BMC), Biologie des Organismes aux cosystmes - Biologie Intgrative (BOEBI), Biologie des Organismes aux cosystmes - cologie (BOEE), Chimie-physique (CH-PH), Chimie (CHI), Economie et Mathmatiques (ECOM), Gosciences (GEOS), Informatique (INFO), Informatique et ses fondements mathmatiques (INFO-MATH), Mathmatiques et Applications (MAP), Matriaux (MAT), Mathmatiques et Informatique (MATHINFO), Mathmatiques fondamentales et appliques, et magistre de Mathmatiques (MFA), Mthodes Informatiques Appliques la Gestion des Entreprises (MIAGE), Physique et applications (PAPP-P), Physique et applications (Math renforce) (PAPP-PM), Magistre PCM (PCM), Magistre et Physique fondamentale (PFON-P), Magistre et Physique fondamentale (Math renforce) (PFON-PM), Physique et Chimie (PHCHC), Physique et Chimie (PHCHP), Information, Systmes, Technologie (PIST-P), Information, Systmes, Technologie (Math renforce) (PIST-PM), Optronique (PLPO-P), Optronique (Math renforce) (PLPO-PM), Physique et mcanique (PMEC-P), Physique et mcanique (Math renforce) (PMEC-PM) Modalits de contrle des connaissances (sous rserve) : Note Finale = moyenne de l'examen et du contrle continu Supplment au diplme : Elments de chronologie d'histoire gnrale des sciences et rflexion historique et pistmologique partir de dossiers tudier.

OPTBiol200 UE au choix S35 ECTS

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Analyse gntique chez les Microorganismes (Biol250) Dcouverte du paysagisme (Biol252) Les antibiotiques : de l'origine aux nouvelles perspectives (Biol254) B Importance de l'alimentation et de l'apport en oxygne dans le maintien des fonctions vitales de l'organisme ( iol255) OGM entre science et socit (Biol258) Physiologie intgrative (Biol259) sciences de l'environnement et Ecologie (Biol261) Energtique des transformations biologiques en milieu aqueux (Chim201b) Chimie Organique et bioorganique (Chim252) Odeurs et couleurs (Chim293) Que cache l'eau ? Analyses Physico-chimiques des eaux naturelles. (Chim294) Muses scientifiques (Comm201)

S4Biol203 Biologie du dveloppement animal et vgtal5 ECTS, volume horaire: 51h CM:27 TD:24 , responsable : Maurice Wegnez, Martin Kreis Secrtariat : Secrtariat L2 Biologie, Brigitte Escalier, 01 69 15 65 61, Btiment 336, bureau 105

Objectifs : Cours : le but du module sera de prsenter les concepts de base de la discipline et les principales modalits du dveloppement (Animaux : Drosophile, Nmatode, Poisson-Zbre, Xnope, Poulet, Souris; Vgtaux : Arabidopsis). TP/TD : susciter la rflexion des tudiants, les former l'esprit critique. Prrequis : aucun Rsum : Cours : BIOLOGIE DU DVELOPPEMENT ANIMAL : Concepts de base, Homologie, clone, dtermination, diffrenciation, induction, voies de signalisation, apoptose... Modles, pour chaque modle, les aspects suivants seront traits :

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Description du dveloppement Apport de chaque modle dans le contexte actuel et historique de la discipline Aspects thiques

Seront voqus galement les problmes thiques et de socit qui dcoulent des avances rcentes de la discipline, particulirement en qui concerne les nouvelles possibilits de clonage. BIOLOGIE DU DVELOPPEMENT VGTAL Dveloppement de l'embryon, de la fleur et des fruits ; fonctionnement du mristme. Mcanismes molculaires de l'action des phytohormones. TD :

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Dveloppement et volution de l'organe visuel : unit ou diversit ? Les cellules de crte neurale : chimres caille / poule Le dveloppement des Insectes Analyse de textes de vulgarisation ayant trait la Biologie du Dveloppement Dveloppement de l'embryon et de la fleur d'Arabidopsis Mode d'action des phytohormones

Parcours : Biologie Humaine et Sant (BHS), BioInformatique et BioStatistiques (Biologie) (BIBSB), Cursus Bio-Concours (L1+L2) (BIOPREPA), Biologie Molculaire et Cellulaire (BMC), Biologie des Organismes aux cosystmes - Biologie Intgrative (BOEBI), Biologie des Organismes aux cosystmes - cologie (BOEE) Modalits de contrle des connaissances (sous rserve) : F= note finale, P = Partiel, E = Examen final, TD = Travaux Dirigs, TP = Travaux Pratiques, O = Oral.

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Les notes obtenues dans les parties TD, TP et O sont du Contrle Continu. Session 1 : F =0.7 E + 0.3 TD Session 2 : F =

Supplment au diplme : Sont prsents les concepts de base de la discipline et les principales modalits du dveloppement, tant che les z animaux (modles Drosophile, Nmatode, Vertbr) que chez les vgtaux (Arabidopsis).

UE fondamentale au choixBiol204 Grandes fonctions des plantes5 ECTS, volume horaire: 51h CM:22 TD:9.5 TP:19.5 , responsable : Graham Noctor (cours), Aline Mah ( TP/TD) Secrtariat : Secrtariat L2 Biologie, Brigitte Escalier, 01 69 15 65 61, Btiment 336, bureau 105

Prrequis : aucun Rsum : 1. Comment se nourissent les plantes ? Cours (Graham Noctor - 10h) Dcouverte de la photosynthse Bases physicochimiques de la photosynthse Capture de la lumire et ractions photochimiques Transfert d'lectrons et synthse d'ATP Assimilation du CO2. Le cycle de Calvin Rapports photosynthse-respiration La photorespiration La photosynthse en C4 Rapports source-puits dans la nutrition vgtale Absorption et assimilation des minraux Fixation de l'azote EI/TP/TD (Aline Mah, Jackson Hoarau, Mariane Delarue, Hlne Vanacker - 18h) TP - Sparation chromatographique de pigments photosynthtiques (6h) TP - Mesures d'changes gazeux (7h) EI - La plante et l'eau (5h) 2. Comment se reproduisent les plantes ? Cours (Genevive Belliard - 10h) Introduction : Place des Angiospermes parmi les Vgtaux Organisation et fonction de la fleur La double fcondation et ses consquences Totipotence des cellules vgtales et reproduction asexue Modalits et rgimes de reproduction sexue Systmes favorisant l'allogamie et le brassage gntique Pollinisation = transport c'est dire dissmination des gamtes mles dans le pollen Importance de la polyplodie chez les plantes fleurs EI/TP/TD (Cline Charon, Darasinh Sihachakr, Emmanuel Picard, Pierre Dutuit, Marie Dufresne - 12h) TP/TD - Etude de la fleur des Dicotyldones (3h) TP/TD - Etude des inflorescences (3h) TP/TD - Etude de la fleur des Monocotyldones (3h) TP/TD - Fruits et graines (3h) Parcours :

Biologie Humaine et Sant (BHS), BioInformatique et BioStatistiques (Biologie) (BIBSB), Biologie et Chimie (Biologie) (BIOCHB), L2 BioPlus (BIOPLUS), Cursus Bio-Concours (L1+L2) (BIOPREPA), Biologie Molculaire et Cellulaire (BMC), Biologie des Organismes aux cosystmes - Biologie Intgrative (BOEBI), Biologie des Organismes aux cosystmes cologie (BOEE) Modalits de contrle des connaissances (sous rserve) : F= note finale, P = Partiel, E = Examen final, TD = Travaux Dirigs, TP = Travaux Pratiques, O = Oral.

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Les notes obtenues dans les parties TD, TP et O sont du Contrle Continu. Session 1 : F = 0.7 E + 0.3 TP Session 2 : F =

Supplment au diplme : Nutrition et reproduction des plantes : photosynthse, changes gazeux, nutrition azote, structures et fonctions de la fleur, diversit des fruits et des graines, reproduction asexue.

UE fondamentale au choixBiol205 Informatique applique la biologie5 ECTS, volume horaire: 50h CM:2 EI:36 TP:12 , responsable : Bruno Bost Secrtariat : Secrtariat L2 Biologie, Brigitte Escalier, 01 69 15 65 61, Btiment 336, bureau 105

Objectifs :

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Apprendre analyser et reprsenter les problmes biologiques en faisant appel une formalisation informatique. Ce travail constitue le pralable indispensable la cration de programmes informatiques appliqus aux problmatiques biologiques, mais fournira galement aux tudiants des outils pour apprhender diffremment les phnomnes biologiques, et ainsi mieux les comprendre. Apprendre les bases de la programmation structure (langage C). Fournir les bases indispensables pour le parcours BioInformatique et BioStatistiques (Biologie) en L3 (cette UE est conseille aux tudiants dsirant suivre ce parcours en L3).

Prrequis : aucun Rsum : Cours en amphi (2h) : introduction, rle de l'informatique en biologie, dfinitions. Enseignement intgr (cours + exercices) en salle informatique (12h = 4 sances de 3h) :

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Bases de l'utilisation d'un ordinateur : systmes d'exploitation, applications, gestion d'une arborescence de fichiers, types de fichiers. Bases de la programmation structure, en langage C, abords travers des exercices simples.

Enseignement intgr (cours + exercices) en salle de TD et en salle informatique (24h = 8 sances de 3h) : Deux problmes biologiques seront abords, avec pour chaque problme une sance de TD (3h) pour la partie analyse et algorithmique, et trois sances en salle informatique (9h) pour la ralisation du programme.

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Analyse de problmes biologiques : analyse, reformulation, et modlisation des problmes biologiques, en utilisant une formalisation et des raisonnements informatiques. Rdaction et analyse d'un cahier des charges. Structures de donnes et algorithmes : traduire l'analyse du problme en un ensemble de donnes, qui vont tre traites par l'ordinateur selon une squence d'oprations dfinies.

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Programmation en langage C : ralisation des programmes permettant de traiter le problme biologique abord. Rdaction d'une documentation technique (manuel utilisateur).

Les lments de programmation en langage C abords au cours de l'UE sont les suivants :

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donnes : variables, constantes (types simples et structurs, dclaration, utilisation) entres / sorties standards et dans des fichiers texte tests conditionnels, conditions logiques, oprateurs logiques boucles dfinies et indfinies programmation modulaire (fonctions) dition d'un programme, compilation, excution et tests

Travaux pratiques en salle informatique (4 sances de 3h) : travail en binome, dont l'objectif est la cration d'un programme appliqu un sujet biologique (fourni par les enseignants). Les tudiants devront dans un premier temps analyser le problme pos, puis dfinir une structure de donnes et un algorithme adapts la rsolution du problme, et enfin raliser le programme correspondant. L'valuation sera faite sur la base d'un compterendu prsentant les diffrentes tapes rsumes ci-dessus. Parcours : Biologie Humaine et Sant (BHS), BioInformatique et BioStatistiques (Biologie) (BIBSB), Biologie et Chimie (Biologie) (BIOCHB), L2 BioPlus (BIOPLUS), Biologie Molculaire et Cellulaire (BMC), Biologie des Organismes aux cosystmes Biologie Intgrative (BOEBI), Biologie des Organismes aux cosystmes - cologie (BOEE) Modalits de contrle des connaissances (sous rserve) : F= note finale, P = Partiel, E = Examen final, TD = Travaux Dirigs, TP = Travaux Pratiques, O = Oral.

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Les notes obtenues dans les parties TD, TP et O sont du Contrle Continu. Session 1 : F =0.67 E + 0.33 TP Session 2 : F = 0.67 E + 0.33 TP

Supplment au diplme : Analyser et modliser les problmes biologiques en faisant appel une formalisation informatique, Algorithmique et complexit, Structure de donnes, Bases de programmation structure (langage C).

UE fondamentale au choixBiol206 Physiologie animale5 ECTS, volume horaire: 49h CM:25 TP:18 TD:6 , responsable : Herv Daniel, Heather McLean Secrtariat : Secrtariat L2 Biologie, Brigitte Escalier, 01 69 15 65 61, Btiment 336, bureau 105

Objectifs : Cet enseignement consiste en une introduction aux mthodes et aux concepts de la physiologie animale avec comme types cellulaires principalement tudis les neurones, les cellules gliales, gustatives, sanguines et rnales. Il s'attache traiter les interactions fonctionnelles entre ces types cellulaires et prsente galement l'environnement liquidien de ces cellules, en insistant particulirement sur la rgulation de l'osmolarit, du pH et des divers volumes liquidiens extracellulaires. Les exemples analyss en dtail feront appel aux divers modles animaux vertbrs et invertbrs. Prrequis : aucun Rsum :

Cours (17 x 1h30) Physiologie cellulaire (13h30) Interactions fonctionnelles entre cellules gliales et neurones. Bases et techniques de l'lectrophysiologie cellulaire (courant impos, patch-clamp). Communications cellulaires : signaux lectriques (canaux ioniques sodiques et potassiques sous-tendant les potentiels d'action - conductance lmentaire, probabilit d'ouverture, courant global, courbes courant-voltage, inactivation, pharmacologie) et messagers chimiques (tude de la synapse neuromusculaire organisation fonctionnelle, rcepteurs ionotropes nicotiniques...). Un exemple de physiologie sensorielle : la sensibilit gustative (reconnaissance, transduction et codage des saveurs fondamentales). L'environnement liquidien de la cellule (12h) Les compartiments liquidiens de l'organisme : sang, lymphe et liquide interstitiel (mesures de leur volume, de leurs concentrations ioniques, changes entre ces compartiments). Rgulation de l' osmolarit, du volume et du pH des liquides extracellulaires. Le sang. L'hmostase. La lymphe et le systme lymphatique. Elments d'immunologie. Physiologie rnale. Travaux pratiques (6 x 3h) 1/ Batterie de diffusion (aupres la loi de Nernst) 2/ Activit lectrique du nerf sciatique 3/ Potentiel de membrane (Exprimentation Assiste par Ordinateur) 4/ Physiologie du got 5/ Mesure du volume sanguin et dosage du sodium et du potassium plasmatique 6/ Physiologie rnale (Exprimentation Assiste par Ordinateur) Travaux dirigs (4 x 1h30) 1/ Exploration fonctionnelle du rein 2/ Pouvoir tampon du sang 3/ Potentiel de la membrane 4/ Transports membranaires Parcours : Biologie Humaine et Sant (BHS), BioInformatique et BioStatistiques (Biologie) (BIBSB), Biologie et Chimie (Biologie) (BIOCHB), L2 BioPlus (BIOPLUS), Cursus Bio-Concours (L1+L2) (BIOPREPA), Biologie Molculaire et Cellulaire (BMC), Biologie des Organismes aux cosystmes - Biologie Intgrative (BOEBI), Biologie des Organismes aux cosystmes cologie (BOEE) Modalits de contrle des connaissances (sous rserve) : F= note finale, P = Partiel, E = Examen final, TD = Travaux Dirigs, TP = Travaux Pratiques, O = Oral.

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Les notes obtenues dans les parties TD, TP et O sont du Contrle Continu. Session 1 : F = 0.6 E + 0.3 TD + 0.1 TP Session 2 : F =

Supplment au diplme :

Etude des interactions fonctionnelles entre diffrents types cellulaires (ex: transmission synaptique) ainsi qu'une prsentation de la rgulation de leurs environnements liquidiens (osmolarit et pH).

Biol207 Stage10 ECTS, volume horaire: 100h TD:25 TE:75 , responsable : Claire Huleux Secrtariat : Secrtariat L2 Biologie, Brigitte Escalier, 01 69 15 65 61, Btiment 336, bureau 105

Objectifs : Aider l'orientation et faciliter l'insertion professionnelle des tudiants. Apprendre les mthodes de recherche de stage. Dcouvrir le monde professionnel, ses mthodes de travail, ses exigences et ses ralits. Complter son bilan personnel et affiner son projet. Acqurir une dmarche scientifique. Mettre en pratique des connaissances thoriques. Acqurir des techniques et des mthodologies pour la rdaction du mmoire et l'expos oral. Prrequis : aucun Rsum : Bilan personnel et mthodologie (25h en L2S3) Cours magistral (4-6h)

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prsentation du bilan personnel prsentation des diffrents stages et des techniques de recherche de stage

TD (8 sances de 2h)

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Raliser son bilan de connaissances, de comptences et de motivations Ralisation de CV et lettre de motivation adapts la recherche de stage ou un objectif prcis Prparer un entretien ou comment se prsenter et donner les raisons de son choix de stage Apprendre rdiger un rapport de stage Rflchir la ncessit d'une bibliographie et apprendre la raliser Apprendre prparer et raliser la prsentation orale de son travail

Stages (75h en S4) Les stages peuvent se raliser dans des domai es varis comme l'cologie, la neurobiologie, la n biochimie, la biologie du dveloppement, la microbiologie, la bioinformatique, mais aussi la chimie, la communication scientifique, l'environnement, etc. Ils se droulent dans des laboratoires de recherche universitaire ou d'organismes de recherche (CNRS, INRA, CEA, INSERM...), mais aussi dans des laboratoires privs, en entreprises, ou encore dans des parcs rgionaux ou nationaux. Certains prennent la forme de stages de terrain. Aprs validation du sujet de stage, chaque tudiant est encadr sur son lieu de stage par un matre de stage, et suivi l'universit par un enseignant-rfrent dont le rle est de suivre le bon droulement du stage et de noter le mmoire et l'expos oral de l'tudiant. Parcours : Biologie Humaine et Sant (BHS), BioInformatique et BioStatistiques (Biologie) (BIBSB), Biologie et Chimie (Biologie) (BIOCHB), Biologie et Chimie (chimie) (BIOCHC), Biologie Molculaire et Cellulaire (BMC), Biologie des Organismes aux cosystmes - Biologie Intgrative (BOEBI), Biologie des Organismes aux cosystmes - cologie (BOEE) Modalits de contrle des connaissances (sous rserve) :

F= note finale, P = Partiel, E = Examen final, TD = Travaux Dirigs, TP = Travaux Pratiques, O = Oral.

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Les notes obtenues dans les parties TD, TP et O sont du Contrle Continu. Session 1 : F = Formation prparatoire aux stages (coef 0.1) + Rapport de stage crit (coef 0.25) + soutenance orale (coef 0.45) +apprciation du matre de stage (coef 0.2) Session 2 : F =

Supplment au diplme : Ralisation d'un bilan de comptences. Apprentissage de techniques, de mthodes de travail adapts au monde professionnel. Rdaction d'un mmoire et soutenance orale.