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Sumario TDWG Annual Meeting 2006 Missouri Botanical Garden-St Louis, Missouri, U.S.A. 15-22 Octubre 2006 Silvia Lusa Unidad de Coordinación GBIF-ES www.gbif.es [email protected] Reunión Anual TDWG 2006 Sumario

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  • Silvia Lusa Unidad de Coordinacin GBIF-ES www.gbif.es [email protected] [email protected] Sumario TDWG Annual Meeting 2006 Missouri Botanical Garden-St Louis, Missouri, U.S.A. 15-22 Octubre 2006 Acerca del TDWG TDWG (Taxonomic Databases Working Group ) Grupo de trabajo internacional sobre bases de datos taxonmicas Es una organizacin sin nimo de lucro, afiliada a la Unin Internacional de Ciencias Biolgicas (IUBS), formada para: establecer colaboraciones internacionales entre diferentes proyectos de bases de datos biolgicas promover la divulgacin de la informacin sobre los organismos vivos para beneficio de la sociedad. Para conseguir sus objetivos el TDWG: Desarrolla, adopta y promueve estndares para el intercambio de datos sobre los organismos vivos. Acta como foro de discusin a travs de reuniones, publicaciones y newsletter
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  • Silvia Lusa Unidad de Coordinacin GBIF-ES www.gbif.es [email protected] [email protected] Sumario TDWG Annual Meeting 2006 Missouri Botanical Garden-St Louis, Missouri, U.S.A. 15-22 Octubre 2006 Nueva Constitucin [Nombre] TDWG (Biodiversity Information Standars) Nueva constitucin: http://wiki.tdwg.org/twiki/pub/Process/WebHome/TDWG_Constitution_2006-08-16.pdf http://wiki.tdwg.org/twiki/pub/Process/WebHome/TDWG_Constitution_2006-08-16.pdf Establece como miembros a dirigirse a los creadores, administradores y usuarios de informacin sobre biodiversidad vs proyectos de bases de datos biolgicas El Comit Ejecutivo aumenta sus atribuciones debido al cambio en la nueva infraestructura de trabajo Nuevo articulo 10. Votaciones: Las decisiones han de estar basadas en el consenso en vez de en una mayora simple. El comit ejecutivo asegurar ese consenso mediante mecanismos como revisiones y peticiones de comentarios pblicos. Si no se alcanza un consenso, el comit ejecutivo convocar una votacin sobre el tema en cuestin El sistema de votacin seguir siendo el mecanismo de eleccin del comit ejecutivo, officers y de todo aqul proceso que dicta la actual constitucin
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  • Silvia Lusa Unidad de Coordinacin GBIF-ES www.gbif.es [email protected] [email protected] Sumario TDWG Annual Meeting 2006 Missouri Botanical Garden-St Louis, Missouri, U.S.A. 15-22 Octubre 2006 Nueva estructura organizativa Nueva estructura organizada a travs de: Interest Group Supervisar el progreso de los estndares as como el estatus de los mismos (uso activo, sustitucin/retirada) Actualizaciones de estatutos Task Group Para realizar tareas productos concretos (estndar) Para crear un IG TG se requiere de la elaboracin y aprovacin (Comit Ejecutivo) de unos estatutos (intenciones, actividades, etc) y un convener En proceso. Los antiguos subgrupos estn readaptando su estructura Borrador de cmo posible escenario futuro: http://tdwg2006.tdwg.org/fileadmin/2006meeting/documents/TDWG _Group_Structure_WorkingDraft_061014.pdf
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  • Silvia Lusa Unidad de Coordinacin GBIF-ES www.gbif.es [email protected] [email protected] Sumario TDWG Annual Meeting 2006 Missouri Botanical Garden-St Louis, Missouri, U.S.A. 15-22 Octubre 2006 Extensin EFG-Geocase Extensin EFG del esquema ABCD Ser el estndar del Task Group:ABCDEFG del Interest Group: Primary Biodiversity Data Para datos de colecciones paleontolgicas, geolgicas (minerales,fsiles, rocas) Compatible con la extensin DarwinCoPE (DarwinCore Paleontology Extension) XML Schema (http://eim.metapath.org/ABCDEFGWeb/EFG- 1.XSD.html)http://eim.metapath.org/ABCDEFGWeb/EFG- 1.XSD.html GeoCASE = BioCASE+EFG (http://projects.naturkundemuseum- berlin.de/synthesys_activity_d/index.htm)http://projects.naturkundemuseum- berlin.de/synthesys_activity_d/index.htm Prximo workshop: Berln Enero 2007 (dirigido a instituciones dispuestas a usar este esquema)
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  • Silvia Lusa Unidad de Coordinacin GBIF-ES www.gbif.es [email protected] [email protected] Sumario TDWG Annual Meeting 2006 Missouri Botanical Garden-St Louis, Missouri, U.S.A. 15-22 Octubre 2006 TCS (Taxonomic Concept Schema) Ser el estndar del Task Group: TNC (Taxon Names and Concepts). Objetivo: Promover el estudio de la nomenclatura y los conceptos taxonmicos Desarrollan estndares y modelos de datos para representar la nomenclatura y la taxonoma y cmo se relaciona con modelos de informacin en biodiversidad (como los que describen especmenes y observaciones) wiki: http://wiki.tdwg.org/twiki/bin/view/TNC/WebHomehttp://wiki.tdwg.org/twiki/bin/view/TNC/WebHome Presentacin de la primera versin TCS1 el ao pasado, aprovada. incorporados los cambios TCS1.01 Objetivo del estndar: Permitir el intercambio de informacin entre de conceptos taxonmicos definidos en clasificaciones taxonmicas publicadas, en bases de datos. Representacin de un modelo abstracto para conceptos taxonmicos que pueda ser mapeado con los diversos modelos de los proveedores de este tipo de datos XML Schema : http://www.tdwg.org/uploads/media/v101.xsdhttp://www.tdwg.org/uploads/media/v101.xsd Documentacin: Gua de usuario http://www.tdwg.org/uploads/media/User_Guide_01.pdf http://www.tdwg.org/uploads/media/User_Guide_01.pdf Projectos que usan este estndar: SEEK (Science Environment for Ecological Knowledge ) Euro + Med EML (Ecological Metadata Language)
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  • Silvia Lusa Unidad de Coordinacin GBIF-ES www.gbif.es [email protected] [email protected] Sumario TDWG Annual Meeting 2006 Missouri Botanical Garden-St Louis, Missouri, U.S.A. 15-22 Octubre 2006 SDD (Structured Descriptive Data) Ser el Estndar del Task Group SDD del Interest Group: Descciptions (Species descriptions) Surge como sustitucin y modernizacin del anterior estndar: DELTA http://wiki.tdwg.org/twiki/bin/view/SDD/Primer/SddIntroduction Desarrolla un esquema para controlar cmo se construye el vocabulario para trabajar con descripciones. Para expresar y transferir informacin descriptiva de organismos biolgicos y taxones conceptos y caracteres descriptivos y conceptos y caracteres de jerarquizacin Incluye descripciones, ontologas, terminologa y herramientas de identificacin Version 1.1 es la aconsejada para implementaciones. Posibles usos de SDD: codificar descripciones cortas (sumarios) descripciones en lenguaje natural para creacin de claves Proyectos que lo usan LUCID 3 :software para identificacin y diagnosis UMB import/export generator acepta XML Schema y mapea produce cdigo java para import/export Electronic Field Guide (EFG) Project (http://efg.cs.umb.edu/SDD) UMB visual SDD editor
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  • Silvia Lusa Unidad de Coordinacin GBIF-ES www.gbif.es [email protected] [email protected] Sumario TDWG Annual Meeting 2006 Missouri Botanical Garden-St Louis, Missouri, U.S.A. 15-22 Octubre 2006 TAPIR (TDWG Access Protocol for Information Retrieval ) TAPIR es un WebService protocolo para acceso a datos estructurados provenientes de bases de datos distribuidas de estructura lgica y fsica diferentes TAPIR combina las caractersticas de los protocolos BioCASe y DiGIR protocolos y ampla las posibilidades de comunicacin entre aplicaciones cliente y proveedores de datos a travs de Internet Su potencialidad permite la interoperabilidad no solo entre especimenes u observaciones si no que se puede utilizar en otros dominios (geolgico, ecolgico, clima, secuenciacin gentica, geoespacial, etc.) Implementaciones: PyWrapper 2.0 de Biocase es la primera implementacin del TAPIR provider PHP DiGIR provider est siendo actualizada para integrar TAPIR La primera red en implementar TAPIR: Plant Genetic Resources Community CGIAR (Grupo Consultivo para la Investigacin Agrcola Internacional ) Generation Challenge Programme
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  • Silvia Lusa Unidad de Coordinacin GBIF-ES www.gbif.es [email protected] [email protected] Sumario TDWG Annual Meeting 2006 Missouri Botanical Garden-St Louis, Missouri, U.S.A. 15-22 Octubre 2006 TAPIR (TDWG Access Protocol for Information Retrieval ) Caractersticas: Trabaja con GUIDs TAPIR Request/Response requests pueden ser hechas en: documentos XML Key-Value Pairs (HTTP) responses siempre codificadas en XML Operaciones posibles: ping, metadata, capabilities (servicios), inventory y search XML Schema Definition (XSD) para describir y validar la estructura de los mensajes request/response No trabaja con un esquema en concreto Conceptual Schemas (XML Schema, RDF Schema) (DarwinCore, ABCD, TCS,NCD) Outputmodels-capabilities response Knownoutputmodels Anyoutputmodels (mappedConcepts) Especificaciones: http://www.tdwg.org/dav/subgroups/tapir/1.0/docs/TAPIRSpecification_20 06-12-06.html http://www.tdwg.org/dav/subgroups/tapir/1.0/docs/TAPIRSpecification_20 06-12-06.html Esquema: http://ww2.biocase.org/svn/tapir/trunk/protocol/tapir.xsdhttp://ww2.biocase.org/svn/tapir/trunk/protocol/tapir.xsd
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  • Silvia Lusa Unidad de Coordinacin GBIF-ES www.gbif.es [email protected] [email protected] Sumario TDWG Annual Meeting 2006 Missouri Botanical Garden-St Louis, Missouri, U.S.A. 15-22 Octubre 2006 OTROS
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  • Silvia Lusa Unidad de Coordinacin GBIF-ES www.gbif.es [email protected] [email protected] Sumario TDWG Annual Meeting 2006 Missouri Botanical Garden-St Louis, Missouri, U.S.A. 15-22 Octubre 2006 Geospatial Probablemente se formar un Geospatial Interest Group (GIG) Objetivo: integracin de estndares, especificaciones, tecnologas y buenas prcticas entre la comunidad biolgica y la geoespacial Cooperacin TDWG-OGC (Open Geospatial Consortium): Firmado MoU http://www.opengeospatial.org/pressroom/pressreleaseshttp://www.opengeospatial.org/pressroom/pressreleases El TDWG y el the OGC colaborarn en el desarrollo de esquemas y perfiles del OGC como el GML (Geography Markup Language) y estndares del TDWG para la representacin de localizaciones de especimenes biolgicos, organismos y su distribucin, comunidades, movimientos, etc El proyecto BioGeomancer (http://www.biogeomancer.org/)http://www.biogeomancer.org/ Colaboracin entre expertos de historia natural y geoespaciales Est desarrollando WebServices y aplicaciones de escritorio que permitirn georeferenciar a los colectores, conservadores, etc El trabajo con estndares est basado en GML para la descripcin de los aspectos espaciales de los datos de historia natural. Integrando con DwC2 y ABCD
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  • Silvia Lusa Unidad de Coordinacin GBIF-ES www.gbif.es [email protected] [email protected] Sumario TDWG Annual Meeting 2006 Missouri Botanical Garden-St Louis, Missouri, U.S.A. 15-22 Octubre 2006 Imagenes Probablemente se formar un Images Interest Group (IIG) Objetivo: Desarrollar una estndarizacin en los mecanismos para el manejo y la transferencia de informacin descriptiva acerca de los media incluyendo Trabajo http://wiki.cs.umb.edu/twiki/bin/view/TDWGImagehttp://wiki.cs.umb.edu/twiki/bin/view/TDWGImage Manual de buenas prcticas para Imgenes de especmenes (enbi project). Uso de imgenes en sustitucin de los ejemplares Metadatos para la descripcin Formatos de archivo (JPEG2000 ) estndar ISO con nueva forma de codificar/decof imgenes, sonidos, pelculas Alta compresion Decodificacion de Regions of Interest (ROIs) posibilidades de embeber en una imagen de un especimen un ABCD XML record+pdf+ JPIP (JPEG2000 Interactive Protocol), necesario cliente (kdu_show client from Kakadu Software ) Estndares para el manejo de LSID para imgenes Qu debe de ir asociado al dato/metadato en la resolucin
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  • Silvia Lusa Unidad de Coordinacin GBIF-ES www.gbif.es [email protected] [email protected] Sumario TDWG Annual Meeting 2006 Missouri Botanical Garden-St Louis, Missouri, U.S.A. 15-22 Octubre 2006 Especies Invasivas Probablemente se formar un Interest Group: Invasive Species Information Systems - ISIS Objetivo: Trabajo con especies invasivas incluida taxonoma, distribuciones, terminologa, descripciones, herramientas de identificacin, etc Checklists mapas modelos Trabajan con GISIN (Global Invasive Species Information Network)
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  • Silvia Lusa Unidad de Coordinacin GBIF-ES www.gbif.es [email protected] [email protected] Sumario TDWG Annual Meeting 2006 Missouri Botanical Garden-St Louis, Missouri, U.S.A. 15-22 Octubre 2006 Monitorizacin DiGIR providers- The Big Dig The "Big Dig" es un proyecto de ecoforge.net desarrollado en 2006 por el Natural History Museum and Biodiversity Research Center of the University of Kansas. http://bigdig.ecoforge.net/ Servicio que genera de manera automtica informes del estado y las caractersticas de los DiGIR providers Status:Una vez al da Schema: Una vez a la semana Evalua el estado de las instalaciones de los DiGIR provider Examina registros y reporta las caractersticas del software instalado Status, versin, nmero de colecciones, nmero de registros, schema, tiempo de respuesta, encoding Ayuda a los administradores ante posibles problemas
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