Upload
jurgen-cools
View
234
Download
4
Embed Size (px)
Citation preview
Synthetische Biologie
http://2008.igem.org/Team:KULeuvenEndy 2005 Nature
• synthetische biologie is ‘de ingenieursvisie op biologie’
• combineert biologie en ingenieursprincipes om nieuwe biologische functies en systemen te ontwerpen en te bouwen
• die nieuwe functies zijn vaak nuttig voor mens, dier of milieu groot potentieel!
• een biologische signaalfilter bouwen met biobouwblokken• bacteriële microsensor
Centrum voor Microbiële en Plantengenetica
De cel als computer
de signaalfilter was een onderdeel van het iGEM 2008 project van de K.U.Leuven: Dr. Coli, the bacterial drug delivery system
een biologische signaalfilter bouwen met biobouwblokken
in silico ontwerp:bouw model & simuleer zodat filter aan ontwerpcriteria voldoet (i.e. specifieke signalen al dan niet wegfilteren)
inspiratie voor een moleculair biologische signaalfilter uit de natuur: coherente feed forward loop met AND-poort(Shen-Orr 2002 Nature genetics)
inputsignaal
outputsignaal
BioBricks: www.partsregistry.org
kies geschikte biobouwblokken (BioBricks) en bouw de filter in het labo
Input RiboKey T7 RNAPol
OutputAND
beschermt achterliggende genetische circuits tegen random fluctuaties in inputsignaal
ga via FACS analyse na of de filter aan de ontwerpcriteria voldoet
bacteriële microsensorinputsignaal (bijv. vervuilende component in afvalwater, DNA schade, cellulaire respons tegen bepaald medicijn,…)
outputsignaal dat met een microchip kan uitgelezen worden
voordeel van biosensor met hele cellen: we kunnen een bacterie – met de hulp van synthetische biologie – omvormen tot een complexe sensor, die complexe omzettingen kan uitvoeren dankzij aangepaste biologische reactiewegen(i.t.t. bijv. biosensor met enkel één enzyme)
gebruik maken van de vele mogelijkheden van bacteriën (receptoren, regulatoren)
signaal opvangen
biologische AND poort:signalen combineren
biologische signaalfilter:signalen filteren
signaal verwerken
expertise IMEC: neuro-electronicabacterieel elektrisch signaal
signaal uitlezen
thesis focust vooral op dit deel:- interface tussen bacterie en microchip- bacteriële elektrische signalen uitmeten en responskarakteristieken opstellen