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résumé des applications de l'analyse microbiologique
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[email protected] - 2007-2008
TSQA - cours 25
Georges DaubeGeorges Daube
Université de LiègeUniversité de Liège
Faculté de Médecine VétérinaireFaculté de Médecine Vétérinaire
Microbiologie des Denrées AlimentairesMicrobiologie des Denrées AlimentairesSart-TilmanSart-Tilman, bât. B43bis, bât. B43bis
4000 Liège4000 Liège
téltél. 04-366.40.15 fax 04-366.40.44. 04-366.40.15 fax 04-366.40.44
http://www.http://www.mdaoamdaoa..ulgulg..acac..bebe
Technologie, SécuritéTechnologie, Sécuritéet Qualité des Alimentset Qualité des Aliments
Cours 25Applications de l’analyse microbiologique
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TSQA - cours 25
Flores recherchées ou dénombréesFlores recherchées ou dénombrées
!! Différents types de germesDifférents types de germes
–– Germes indicateursGermes indicateurs
»» Contamination fécaleContamination fécale
»» Traitement thermiqueTraitement thermique
»» TechnologiquesTechnologiques
»» Défauts dDéfauts d’’hygiènehygiène
–– Germes indexGermes index
»» Risque dRisque d’’un micro-organisme pathogèneun micro-organisme pathogène
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Flores recherchées ou dénombréesFlores recherchées ou dénombrées
!! Différents types de germesDifférents types de germes
–– Germes pathogènesGermes pathogènes
»» Bactéries, virus, parasitesBactéries, virus, parasites
–– Germes technologiquesGermes technologiques
»» Yaourt, beurre, kéfir, Yaourt, beurre, kéfir, etcetc..
–– Germes altérantsGermes altérants
»» Shewanella putrefasciensShewanella putrefasciens, , LeuconostocLeuconostoc, , BrochothrixBrochothrix
thermosphactathermosphacta
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Flores recherchées ou dénombréesFlores recherchées ou dénombrées
!! Différents types de germesDifférents types de germes
–– Germes indicateursGermes indicateurs
–– Germes indexGermes index
versusversus
–– Germes pathogènesGermes pathogènes
–– Germes technologiquesGermes technologiques
–– Germes altérantsGermes altérants
Un même germe peut se retrouver dans plusieursUn même germe peut se retrouver dans plusieurs
catégoriescatégories
= signification indirecte= signification indirecte
= signification directe= signification directe
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Flores recherchées ou dénombréesFlores recherchées ou dénombrées
!! Microflores «Microflores « totalestotales » »
–– Germes aérobies mésophiles à 30°CGermes aérobies mésophiles à 30°C
–– Germes anaérobies à 37°CGermes anaérobies à 37°C
–– Flore Flore psychrotrophe psychrotrophe (4°C, 7°C, 14°C)(4°C, 7°C, 14°C)
–– Flore sporulée aérobie à 30°CFlore sporulée aérobie à 30°C
–– Flore sporulée anaérobie à 37°CFlore sporulée anaérobie à 37°C
–– Micro-organismes contaminantsMicro-organismes contaminants
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Flores recherchées ou dénombréesFlores recherchées ou dénombrées
!! Microflores «Microflores « lactique»lactique»
–– Gram + non sporulées souvent immobilesGram + non sporulées souvent immobiles
–– Fermentaires uniquementFermentaires uniquement
–– Aéro-anaérobies Aéro-anaérobies facultativesfacultatives
–– Capacités de synthèse faiblesCapacités de synthèse faibles
–– Surtout Surtout LactococcusLactococcus, , StreptococcusStreptococcus,,LeuconostocLeuconostoc, , Pediococcus Pediococcus et et LactobacillusLactobacillus
–– Altération de la viande :Altération de la viande : BrochothrixBrochothrixthermosphactathermosphacta
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Flores recherchées ou dénombréesFlores recherchées ou dénombrées
!! LevuresLevures
!!Champignon unicellulaire se reproduisantChampignon unicellulaire se reproduisant
par bourgeonnement ou fissionpar bourgeonnement ou fission
!! MoisissuresMoisissures
!! Champignon caractérisé par un thalleChampignon caractérisé par un thalle
filamenteuxfilamenteux
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Flores recherchées ou dénombréesFlores recherchées ou dénombrées
EntérobactériesEntérobactéries
Coliformes totauxColiformes totaux
Coliformes Coliformes thermotolérantsthermotolérants
Escherichia coliEscherichia coli
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Flores recherchées ou dénombréesFlores recherchées ou dénombrées
!! EntérobactériesEntérobactéries
!!Gram - non sporulé, oxydase -, résistant sels biliairesGram - non sporulé, oxydase -, résistant sels biliaires
–– à 30°C :à 30°C :
»» Indicateur de traitement thermiqueIndicateur de traitement thermique
»» Indicateur de Indicateur de recontaminationrecontamination
»» Indicateur dIndicateur d’’altérationaltération
–– à 37°Cà 37°C
»» Indicateur de traitement thermiqueIndicateur de traitement thermique
»» Indicateur de Indicateur de recontaminationrecontamination
»» Indicateur dIndicateur d’’altérationaltération
»» Index dIndex d’’entérobactérie pathogèneentérobactérie pathogène
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Flores recherchées ou dénombréesFlores recherchées ou dénombrées
!! ColiformesColiformes
!!Gram - non sporulé, oxydase -, résistant sels biliaires,Gram - non sporulé, oxydase -, résistant sels biliaires,lactose +lactose +
–– Totaux à 30°C :Totaux à 30°C :
»» Indicateur de traitement thermique (±)Indicateur de traitement thermique (±)
»» Indicateur de Indicateur de recontamination recontamination (±)(±)
»» Indicateur dIndicateur d’’altération (±)altération (±)
–– Thermotolérants Thermotolérants (ex «(ex « fécauxfécaux » ») à 44°C:) à 44°C:
»» Indicateur de contamination fécale (±)Indicateur de contamination fécale (±)
»» Index dIndex d’’entérobactérie pathogèneentérobactérie pathogène
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Flores recherchées ou dénombréesFlores recherchées ou dénombrées
!! Escherichia coliEscherichia coli
!!Gram - non sporulé, oxydase -, résistant selsGram - non sporulé, oxydase -, résistant sels
biliaires, lactose +, biliaires, lactose +, bèta-glucuronidase bèta-glucuronidase + (ou+ (ou
autres propriétés)autres propriétés)
–– à 44°C:à 44°C:
»» Indicateur de contamination fécaleIndicateur de contamination fécale
»» Index dIndex d’’entérobactérie pathogèneentérobactérie pathogène
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Flores recherchées ou dénombréesFlores recherchées ou dénombrées
EntérobactériesEntérobactéries
Escherichia coliEscherichia coli
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Flores recherchées ou dénombréesFlores recherchées ou dénombrées
!! Propriétés attendues dPropriétés attendues d’’un bon indicateurs de contaminationun bon indicateurs de contamination
fécalefécale
–– Spécificité de lSpécificité de l’’origine fécaleorigine fécale
–– Micro-organisme toujours présent et majoritaireMicro-organisme toujours présent et majoritaire
–– Résistance importante dans le milieu ou lRésistance importante dans le milieu ou l’’alimentaliment
–– Résistance comparable aux germes pathogènes dRésistance comparable aux germes pathogènes d’’origine fécaleorigine fécale
–– Pas de croissance dans le milieu ou lPas de croissance dans le milieu ou l’’alimentaliment
–– Méthodes de recherche et de dénombrement simples, rapidesMéthodes de recherche et de dénombrement simples, rapides
et fiableset fiables
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Flores recherchées ou dénombréesFlores recherchées ou dénombrées
!! Différents indicateurs de contamination fécaleDifférents indicateurs de contamination fécale
–– Coliformes Coliformes thermotolérants thermotolérants (fécaux)(fécaux)
–– Entérocoques (Streptocoques fécaux)Entérocoques (Streptocoques fécaux)
–– ClostridiumClostridium sulfito-réducteurs sulfito-réducteurs
–– BactériophagesBactériophages
–– Escherichia coliEscherichia coli
–– Bifidobacterium spBifidobacterium sp
Qualité croissante
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Flores recherchées ou dénombréesFlores recherchées ou dénombrées
!! Différents indicateurs de contamination fécaleDifférents indicateurs de contamination fécale
–– Coliformes Coliformes thermotolérants thermotolérants (fécaux)(fécaux)
–– Entérocoques (Streptocoques fécaux)Entérocoques (Streptocoques fécaux)
–– ClostridiumClostridium sulfito-réducteurs sulfito-réducteurs
–– BactériophagesBactériophages
–– Escherichia coliEscherichia coli
–– Bifidobacterium spBifidobacterium sp
Le seul utilisé actuellementLe seul utilisé actuellement
pour les alimentspour les aliments
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Flores recherchées ou dénombréesFlores recherchées ou dénombrées
!! Autres indicateursAutres indicateurs–– Staphylococcus Staphylococcus aureusaureus (ou (ou coagulase coagulase +)+)
»» Indicateur de Indicateur de recontaminationrecontamination
»» Indicateur de rupture de chaîne du froidIndicateur de rupture de chaîne du froid
–– Pseudomonas spPseudomonas sp
»» Indicateur dIndicateur d’’altération (milieu à haut potentiel redox)altération (milieu à haut potentiel redox)
–– Brochothrix thermosphactaBrochothrix thermosphacta
»» Indicateur dIndicateur d’’altération (milieu à bas potentiel redox)altération (milieu à bas potentiel redox)
–– Levures-moisissuresLevures-moisissures
»» Indicateur dIndicateur d’’altération (milieu à haut potentiel redox)altération (milieu à haut potentiel redox)
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Analyses de denrées alimentairesAnalyses de denrées alimentaires
!! Suspension-mèreSuspension-mère–– Toutes denréesToutes denrées
–– Céréales et légumineusesCéréales et légumineuses
–– ConservesConserves
–– Gélatine alimentaireGélatine alimentaire
–– Lait et produits laitiersLait et produits laitiers
–– Aliments acides et acidifiantsAliments acides et acidifiants
–– Aliments à haute teneur en matière grasse (>20%)Aliments à haute teneur en matière grasse (>20%)
–– MargarinesMargarines
–– Produits de la pêcheProduits de la pêche
–– Herbes et produits déshydratésHerbes et produits déshydratés
–– Viande et produits à base de viandeViande et produits à base de viande
–– Cacao et produits en contenant (>20%)Cacao et produits en contenant (>20%)
–– EauEau
–– ŒŒufs et produits contenant des ufs et produits contenant des œœufsufs
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Analyses de denrées alimentairesAnalyses de denrées alimentaires
!! DénombrementDénombrement–– Germes totaux aérobies à 30°CGermes totaux aérobies à 30°C
–– Spores aérobies à 30°CSpores aérobies à 30°C
–– Germes totaux anaérobies à 37°CGermes totaux anaérobies à 37°C
–– Spores anaérobies à 37°CSpores anaérobies à 37°C
–– Germes Germes psychrotrophespsychrotrophes
–– Coliformes totauxColiformes totaux
–– Coliformes Coliformes thermotolérantsthermotolérants
–– Entérobactéries à 30°CEntérobactéries à 30°C
–– Entérobactéries à 37°CEntérobactéries à 37°C
–– Escherichia coliEscherichia coli
–– Staphylococcus Staphylococcus aureusaureus (ou (ou coagulase coagulase +)+)
–– EntérocoquesEntérocoques
–– Anaérobies Anaérobies sulfitoréducteurssulfitoréducteurs
–– Spores dSpores d’’anaérobies anaérobies sulfitosulfito-réducteurs-réducteurs
–– Clostridium Clostridium perfringensperfringens
–– Pseudomonas spPseudomonas sp
–– Brochothrix thermosphactaBrochothrix thermosphacta
–– Bactéries lactiquesBactéries lactiques
–– Bacillus cereusBacillus cereus
–– Levures-moisissuresLevures-moisissures
–– BactériophagesBactériophages
–– Legionella pneumophilaLegionella pneumophila
–– Micro-organismes du yaourtMicro-organismes du yaourt
–– Listeria Listeria sp sp ouou monocytogenesmonocytogenes
–– Vibrio parahaemolyticusVibrio parahaemolyticus
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Analyses de denrées alimentairesAnalyses de denrées alimentaires
!! RecherchesRecherches–– Escherichia coli Escherichia coli O157 O157 entérohémorragiquesentérohémorragiques
–– Salmonella Salmonella spsp
–– Listeria Listeria sp sp ouou monocytogenesmonocytogenes
–– Yersinia enterocoliticaYersinia enterocolitica, y compris les , y compris les sérotypes sérotypes pathogènespathogènes
–– Shigella spShigella sp
–– Campylobacter Campylobacter thermophilesthermophiles
–– Clostridium botulinumClostridium botulinum
–– Vibrio parahaemolyticusVibrio parahaemolyticus, , vulnificus vulnificus et et choleraecholerae
–– Entérotoxines Entérotoxines dede Staphylococcus Staphylococcus et toxines diarrhéiques deet toxines diarrhéiques de Bacillus cereusBacillus cereus
–– Toxines deToxines de Clostridium botulinumClostridium botulinum
–– Legionella spLegionella sp
–– NorovirusNorovirus, , RotavirusRotavirus, Hépatite A, Hépatite A