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Test genético para el estudio
de portadores por NGS
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2
¿Qué es una prueba de cribado de portadores?
Fibrosis
quística
Síndrome
de X frágil
Síndrome de
Smith-Lemli-Opitz
Enfermedad
de Pompe
Síndrome
de Alport
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3
Atrofia muscular
espinal
Síndrome de
Tay-Sachs
¿Qué es una prueba de cribado de portadores?
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4
Atrofia muscular
espinal
Atrofia muscular
espinal
¿Qué es una prueba de cribado de portadores?
Alto riesgo preconcepcional
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La historia familiar no cuenta toda la historia
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preconGEN
Muestra de
Saliva y Sangre
Para
Hombre y Mujer
176 enfermedades
seleccionadas por su
gravedad y prevalencia
Resultados
disponibles en 15
días laborables
Proveedor líder en servicios de
diagnóstico médico en Europa
Experto en análisis
genético de portadores.
Más de 700.000 pacientes
analizados hasta la fecha
Test genético de cribado que permite
conocer si los progenitores son portadores
de enfermedades monogénicas recesivas
que puedan transmitir a su descendencia
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preconGEN: Panel de enfermedades
severas, clínicamente accionables
y prevalentes, maximizando la
tasa de detección para cada una
de ellas
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preconGEN: Panel de enfermedades
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preconGEN: Panel de enfermedades
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preconGEN: Panel de enfermedades
severas, clínicamente accionables
y prevalentes, maximizando la
tasa de detección para cada una
de ellas
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preconGEN: Tasa de detección
• La finalidad del panel es facilitar información relevante al especialista y a la pareja para poder tomar
decisiones acerca de las opciones reproductivas.
• preconGEN permite un estudio exhaustivo de los genes del panel, con una elevada tasa de detección para
cada patología, lo que permite identificar un mayor número de parejas con riesgo preconcepcional.
1 de cada 580 embarazos se verá afectado por alguna enfermedad
severa incluida en el panel de preconGEN 1
El riesgo natural de que un recién nacido presente alguna de las enfermedades del panel
es mayor que el riesgo de presentar síndrome de Down (1 de cada 750 recién nacidos).2
1. Imran S. Haque, et al. Modeled Fetal Risk of Genetic Diseases Identified by Expanded Carrier Screening. JAMA. 2016 Aug. 16;316(7):734-42. doi:10.1001/jama.2016.11139
2. Stylianos E. Antonarkis, et al. Chromose 21 and Down syndrome: From Genomics to Pathophysiology. Nature Reviews. October 2004
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El test realiza la secuenciación del exón completo de los genes incluidos en el panel, mediante
secuenciación masiva de nueva generación (NGS).
A diferencia de otras técnicas, detecta deleciones a lo largo de los genes analizados así como duplicaciones
en genes responsables de enfermedades prevalentes seleccionadas.
En el caso de genes complejos de estudiar (síndrome de X frágil, atrofia muscular espinal, hiperplasia
suprarrenal congénita, alfa talasemia, enfermedad de Gaucher), preconGEN realiza una evaluación
específica diferencial que incrementa la tasa de detección.
La tecnología de preconGEN permite aumentar la tasa de detección, llegando a
ser >99% para enfermedades como la fibrosis quística
preconGEN: Panel de enfermedades
Genotipado
Sólo detecta mutaciones conocidas en ciertas regiones de
los exones
• Secuenciación del exón completo Analiza el exón completo del gen, identificando la práctica
totalidad de las mutaciones relacionadas con patología
exón intrón exón
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RENDIMIENTO ANALÍTICO
SENSIBILIDAD (IC – 95%)
ESPECIFICIDAD (IC – 95%)
>99,97% (99,270% - 99,945%) >99,99% (99,992% - 99,999%)
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preconGEN: Maximizando la tasa de detección
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preconGEN: Alto Valor Predictivo Negativo (VPN)
Genotipado
Tasa de detección 30%
• Secuenciación del exón completo
Tasa de detección >99%
BAJO VPN ALTO VPN
>70% de las parejas
pueden no ser detectadas
Mínima probabilidad de no
detectar parejas en riesgo
Caso hipotético: Enfermedad autosómica recesiva A
Resultado
del test:
Resultado
del test:
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preconGEN: Resultados
El informe de resultados de preconGEN incluye:
Variantes patogénicas: Variantes relacionadas con patología.
Variantes probablemente patogénicas: Variantes probablemente relacionadas con patología.
Las variantes han sido clasificadas siguiendo las recomendaciones de las guías internacionales
de referencia.*
Analiza enfermedades severas siguiendo las guías de la ESHG1,
incluyendo aquellas cuyo análisis recomiendan sociedades
internacionales de prestigio como la ACMG y ACOG.2
1. Henneman L, Borry P, Chokoslivi D, et al. Responsible implementation of expanded carrier screening. European Journal of Human Genetics. 2016; 24,e1-e12.
2. Edwards JG, Feldman G. Goldberg J, et al. Expanded Carrier Screening in Reproductive Medicine-points to Consider. A joint Statement of the American
College of Medical Genetics and Genomics, American College of Obstetricians and Gynecologists, National Society of Genetic Counselors, Perinatal Quality
Foundation, and Society for Maternal-Fetal Medicine Obstet Gynecol. 2015;125(3);653-662.
* ACMG (American College of Medical Genetics and Genomics), AMP (Association for Molecular Pathology)
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preconGEN: Resultados
• Cada uno de los miembros de la pareja puede ser identificado como portador o no portador de las
enfermedades analizadas. Ser portador es algo relativamente habitual, las personas portadoras
generalmente no presentan ningún síntoma.1
Cuando ambos progenitores son portadores de la misma enfermedad genética, existe un 25% de
riesgo de transmitirla a su descendencia. En estos casos se recomienda el asesoramiento genético
para la pareja1, en el que se presentarán diferentes opciones, tales como:
Pruebas de diagnóstico prenatal durante el embarazo
Diagnóstico Genético Preimplantacional (DGP)
Donación de óvulos o esperma
NO PORTADOR PORTADOR
No se han detectado mutaciones relacionadas con
patología en los genes analizados.
Se ha detectado alguna mutación en los genes
analizados, clasificando a la persona como portadora.
Ser portador no implica el desarrollo de la enfermedad.
1. Lazarin GA, Haque IS. Expanded carrier screening. A review of early implementation and literature. Seminars in Perinatology. 2016;40:24-34.
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preconGEN: Informe de resultados
Información
muestra,
paciente,
especialista
Estado portador/ no
portador
Mujer Hombre
Información breve de
la patología
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Métodos de cribado para determinar el riesgo durante el embarazo
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T21, T18, T13 Aneuploidías X,Y Paneles de
microdeleciones
Mayores tasas de falsos positivos Consejo genético más complejo
Relevancia Clínica Datos de validación Tasas de detección
Estandar actual
Nuevas Indicaciones?
Paneles ampliados: Nuevas indicaciones
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Paneles ampliados: Nuevas indicaciones de cribado?
Nombre Localización Frecuencia en
recién nacidos Tamaño Detectable
45,X Trisomy X
47,XXY 47,XYY Chromosomes XY 1/500 NA
Trisomy 16 Chromosome 16 <1/50,000 NA
Trisomy 9 Chromosome 9 <1/50,000 NA
22q 22q11 1/4,000 3Mb
Cri-du-chat 5p 1/50,000 5-40Mb
Angelman 15q 1/15,000 5-6Mb
Prader-Willi 15q 1/12,000 5-6Mb
1p36 1p 1/10,000 1.5-10Mb
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Paneles ampliados: Bajo valor predictivo positivo (VPP)
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Paneles ampliados: Bajo valor predictivo positivo (VPP)
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Anomalías Cromosómicas Tasa de detección Tasa de falsos positivos (TFP)
Trisomía 21 590/594 (99,5%) <0,1%
Trisomía 18 222/230 (97%) 0,1%
Trisomía 13 30/38 (79%) 0,1%
0,3%
Monosomía X 79/85 (93%) 1,0%
XXY, XXX, XYY ? ?
>1,0%
Microdeleciones 60-97% >1,5%
TFP TOTAL >3%
Chiu et al, 2011;
Chen et al, 2011;
Ehrich et al, 2011;
Palomaki et al, 2011;
Bianchi et al, 2012;
Sparks et al, 2012;
Ashoor et al, 2012;
Norton et al, 2012
Nicolaides et al, 2013;
Mazloom et al, 2013
http://www.verinata.com (12-
02-2014)
Anuncios comerciales/
presentación en FMF 2013
(datos no publicados)
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Paneles ampliados: Nuevas indicaciones?
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Frecuencia de CNVs en casos con
cariotipo normal
n Pathogenic
CNVs Frequency
Identifiable by
NIPT
Residual Risk
with “negative”
NIPT
Wapner et al.
2012 3060 33 1.1% 4 0.9%
courtesy of Ron Wapner July 2014
Paneles ampliados: Nuevas indicaciones?
sampled for AMA, pos screen, anxiety
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Pruebas de cribado antes del embarazo o en el 1r trimestre
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Los test genéticos son como ecografías del ADN
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Un tratamiento precoz mejora el pronóstico de algunas enfermedades
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30
[email protected] 900 400 442 www.synlab.es
