Welkombij het CMBI

Bioinformatica

Voorlichting BIOINFORMATICA

• Wat is bioinformatica?• Studeren aan deze faculteit (FNWI, KUN)• Bioinformatica vakken• Stagemogelijkheden• Masteropleiding• Beroepsperspectief

Wat is Bioinformatica?

Bio Informatica

+

Bioinformatica probeert met hulp van computers biologische, chemische en medische vragen te beantwoorden.

Wat is Bioinformatica?

Studeren aan deze faculteit

Jaar 1

Jaar 2

Jaar 3

Jaar 4

Jaar 5

VWO

Toekomstig beroep

Bachelortitel: Bachelor of Science

Mastertitel: Master of Science

Opleidingen- scheikunde- biologie & medische biologie- natuurwetenschappen- informatica- moleculaire levens- wetenschappen- life sciences

- wiskunde- natuur- en sterrenkunde- milieu- natuur- wetenschappen

Faculteit der Natuurwetenschappen,

Wiskunde en Informatica (FNWI)

5 subfaculteiten scheikundenatuurkundebiologiewiskundeinformatica

Bioinformatica = Masteropleiding

• Je kunt starten bij Bioinformatica Master als je een vooropleiding (bachelor) hebt in:-scheikunde-biologie-natuurwetenschappen-moleculaire levenswetenschappen-informatica-life sciences-biomedische gezondheidswetenschappen (medische faculteit)

Vakkenpakketten voor toelating tot de vooropleiding (bachelor)

ScheikundeN&T; N&G; M-profiel+WiskB1,Sk1,Nat1;WiskB+Nat

BiologieN&G; N&T

NatuurwetenschappenN&T; N&G+WiskB2; M-profiel+WiskB1,Sk1,Nat1

Moleculaire LevenswetenschappenN&T; N&G; M-profiel+WiskB1,Sk1,Nat1

InformaticaN&T; N&G+WiskB2

Bioinformatica vakken

• Je komt ons tijdens de vooropleiding al tegen!- Verplichte vakken- Keuze vakken- Hands-on

Voorbeeld uit Bioinformatica I

Welke tools en databases zijn er en hoe kun je ze toepassen?

Databases met sequenties en structuren van eiwitten (o.m. via WWW); Zoekprogramma’s om gelijkenissen te vinden; Voorspellen eigenschappen van eiwitten

Welke biowetenschappelijke vragen zijn hiermee te bestuderen?

Hoeveel lijkt de mens op de aap (evolutie en homologie)? Hoe zal dit onbekende eiwit zich gedragen en er uitzien?

Bioinformatica II

• Overzicht en details van eiwitstructuren• Hoe maak je een eiwit stabieler?• Het bouwen van een eiwitmodel (Homology Modelling)• Energieberekeningen• Realworld voorbeelden

Bioinformatica II:- Eiwitstructuur analyse- 4 ECTS- Voorkennis: bioinformatica I

Bioinformatica III

Bioinformatica III:- Genoom Analyse- 3 ECTS- Voorkennis:

bioinformatica I

Bioinformatica IV

Bioinformatica IV:- Computational Drug Discovery- 3 ECTS (optioneel: 4)- Voorkennis: bioinformatica I & II

Bioinformatica V

Bioinformatica V- applied bioinformatics- 6 ECTS- voorkennis bioinformatica 1- projectmatig a.h.v. casus- gericht op biologie; maar ook andere studenten zijn welkom

Stage mogelijkheden

• Invulling is afhankelijk van je eigen belangstelling en achtergrond!– Voorbereiding: Bioinformatica II of III– Bijvak & hoofdvak (6-12 maanden)– Ministages (8 weken, derde jaar)– Sommige stages zijn extern (andere

universiteit of buitenland)

Bioinformatica onderzoek op het CMBI

• Gert Vriend:– Bioinformatics of Protein Structures

• Martijn Huynen:– Computational Genomics

• Roland Siezen:– Bacterial Genomics

• Jacob de Vlieg:– Computational Drug Discovery

Samenwerking

Enkele Stagevoorbeelden

• Voorspellen thermostabiliserende mutaties in eiwitten “hoe verbeter je eigenschappen van enzymen door engineering”

• Plaats en omringing van ionen in eiwitstructuren“zijn er regels af te leiden volgens welke de ionen in de eiwitstructuren zitten”

• Voorspellen van humane ziektegenen“The GeneSeeker”

• Webadres huidige stageplaatsen:

http://www.cmbi.kun.nl/stages

Masteropleiding Bioinformatica

• Gestart in 2001/2002

• 2 jarige master opleiding bestaand uit:* 60 ECTS (1 jaar) tailormade vakkenpakket (bioinformatica,

maar ook breed in chemie, biologie, informatica en/of geneeskunde)* 60 ECTS (1 jaar) bioinformatica research

• Titel: Master of Science in Bioinformatics

• Vooropleiding: Bachelor in chemie, biologie, Moleculaire Levenswetenschappen, Natuurwetenschappen, biomedische gezondheidswetenschappen, geneeskunde, informatica, life sciences, HLO, HIO

• Second Master variant (1 jarige opleiding) voor mensen die al een mastertitel hebben

Beroepsperspectief (1)

• Een bioinformaticus beheerst altijd ten minste twee disciplines.

• Werkt vaak in multidisciplinaire teams

• Is overal nodig waar computers de bioweten-schappen binnendringen: voedselindustrie, medicijnontwikkeling, diagnostische tests (“even een druppeltje bloed meneer, en in twee minuten weten we of u ziek bent”), wasmiddelen (enzymen),plantveredeling, etc.

Beroepsperspectief (2)

VOORBEELDEN:

Chemicus-bioinformaticus zal zijn baan vinden in farmaceutische- of voedingsmiddelenindustrie

Bioloog-bioinformaticus gaat werken aan biologische datasets (o.a. genoom projecten)

Bioinformaticus die de IT ingaat heeft waarschijnlijk een informatica achtergrond

Bioinformaticus in ziekenhuis heeft waarschijnlijk gezondheidswetenschappen gestudeerd

Beroepsperspectief (3)

Grote vraag uit bedrijfsleven

Gunstige loopbaanperspectieven