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UNIVERSIDAD CENTRAL DEL ECUADOR FACULTAD DE VETERINARIA Y ZOOTECNIA CARRERA DE MEDICINA VETERINARIA Y ZOOTECNIA Aislamiento y caracterización de Yersinia enterocolitica patogénica de cerdos en la empresa Pública Metropolitana de Rastro Quito Trabajo de Investigación previo a la obtención del Título de Médico Veterinario y Zootecnista AUTORA: Ortiz Tapia Débora Samantha TUTOR: Burgos Vinueza Christian Vinicio Quito, 2019

Yersinia enterocolitica patogénica de cerdos en la Trabajo

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UNIVERSIDAD CENTRAL DEL ECUADOR

FACULTAD DE VETERINARIA Y ZOOTECNIA

CARRERA DE MEDICINA VETERINARIA Y ZOOTECNIA

Aislamiento y caracterización de Yersinia enterocolitica patogénica de cerdos en la

empresa Pública Metropolitana de Rastro Quito

Trabajo de Investigación previo a la obtención del Título de Médico Veterinario y

Zootecnista

AUTORA: Ortiz Tapia Débora Samantha

TUTOR: Burgos Vinueza Christian Vinicio

Quito, 2019

ii

Yo, Débora Samantha Ortiz Tapia en calidad de autora y titular de los derechos

morales y patrimoniales del trabajo de titulación “Aislamiento y caracterización de

Yersinia enterocolitica patogénica de cerdos en la Empresa Pública Metropolitana

de Rastro Quito”, modalidad presencial, de conformidad con el Art.114 del Código

Orgánico de la Economía Social de los Conocimientos, Creatividad e Innovación,

concedo a favor de la Universidad Central del Ecuador una licencia, gratuita,

intransferible y no exclusiva para el uso no comercial de la obra, con fines

estrictamente académicos. Conservo a mi favor todos los derechos de autor sobre

la obra, establecidos en la normativa citada.

Así mismo, autorizo a la Universidad Central del Ecuador para que realice la

digitalización y publicación de este trabajo de titulación en el repositorio virtual, de

conformidad a lo dispuesto en el Art. 144 de la Ley Orgánica de Educación Superior.

El Autor declara que la obra objeto de la presente autorización es original en su

forma de expresión y no infringe el derecho de autor de terceros, asumiendo la

responsabilidad por cualquier reclamación que pudiera presentarse por esta causa

y liberando a la Universidad de toda responsabilidad.

Firma:

Débora Samantha Ortiz Tapia

Cd. N° 1716567902

DERECHOS DE AUTOR

iii

APROBACIÓN DEL TUTOR

En mi calidad de tutor del trabajo de Titulación, presentado por DÉBORA

SAMANTHA ORTIZ TAPIA, para optar por el grado de Médico Veterinario y

Zootecnista; cuyo título es: AISLAMIENTO Y CARACTERIZACIÓN DE YERSINIA

ENTEROCOLITICA PATOGÉNICA DE CERDOS EN LA EMPRESA PÚBLICA

METROPOLITANA DE RASTRO QUITO, considero que dicho trabajo reúne los

requisitos y méritos necesarios en el campo metodológico y epistemológico, para

ser sometido a la evaluación por parte del tribunal examinador para continuar con

el proceso de titulación determinado por la Universidad Central del Ecuador.

En la ciudad de Quito, a los 5 días del mes de Agosto de 2019

Dr. Christian Vinicio Vinueza Burgos

Docente – Tutor

C.C. 1713266227

iv

APROBACIÓN DE LA PRESENTACIÓN ORAL/TRIBUNAL

AISLAMIENTO Y CARACTERIZACIÓN DE YERSINIA ENTEROCOLITICA

PATOGÉNICA DE CERDOS EN LA EMPRESA PÚBLICA METROPOLITANA DE

RASTRO QUITO

El tribunal constituido por:

Presidente / Lector 1: Dra. María Belén Cevallos

Lector 2: Dr. Alfonso Molina

Luego de calificar el Informe Final de Investigación del trabajo de titulación

denominado “AISLAMIENTO Y CARACTERIZACIÓN DE Yersinia enterocolitica

PATOGÉNICA DE CERDOS EN LA EMPRESA PÚBLICA METROPOLITANA DE

RASTRO QUITO” previo a la obtención del título (o grado académico de Médico

Veterinario Zootecnista presentada por la señorita Débora Samantha Ortiz Tapia.

Emite el siguiente veredicto (aprobado/reprobado) / ordena que se haga las

siguientes correcciones:

Fecha:

Docente Calificación Firma

Presidente / Lector 1:

Dra. María Belén Cevallos

Lector 2:

Dr. Alfonso Molina

v

Dedicatoria

A Jesús gracias por ponerme en el lugar y tiempo adecuado, por la familia que me

has dado. Esto es para ti mami y papi ustedes han sido el pilar base para luchar sin

rendirme, instruyéndome en amor, paciencia y perseverancia.

Hermana me has servido de ejemplo de fortaleza en una mujer, por ser luz en mis

dudas, por tus consejos estamos hoy aquí.

Hermano por mostrarme lo importante de no dejarse consumir de las presiones y

estrés que puede tener la vida, ser positiva y relajada, por tus chistes y porque no

tus tonterías.

A mi novio por amarme como soy, motivarme tanto personal como espiritualmente,

ayudarme ampliar el panorama, gracias por apoyarme en mis fracasos,

frustraciones, mis logros y alegrías. Por darme de tu tiempo, a veces tu hombro y

siempre tu mano para levantarnos juntos.

A cada una de las personas que aportaron, sumaron en mi vida con palabras de

ánimo, sonrisas, con bajones y a veces llantos esto es para ustedes.

vi

INDICE GENERAL

CAPITULO I ............................................................................................................ 1

INTRODUCCIÓN ................................................................................................. 1

CAPITULO II ........................................................................................................... 2

Objetivo General .................................................................................................. 2

Objetivos Específicos ........................................................................................... 2

CAPITULO III .......................................................................................................... 3

3. Marco Teórico ................................................................................................... 3

3.1 Historia ........................................................................................................ 3

3.2 Generalidades ............................................................................................ 4

3.3 Virulencia y vías de Transmisión ................................................................ 6

3.4 Yersinia enterocolitica en Animales de producción ..................................... 7

3.5 Yersinia en humanos .................................................................................. 8

3.6 Epidemiología ............................................................................................. 9

3.7 Métodos de aislamiento bacteriológico ..................................................... 10

3.8 Métodos de identificación molecular ......................................................... 11

CAPITULO IV ........................................................................................................ 12

4. Materiales Y Métodos ........................................................................................ 12

4.1 Diseño de investigación y Muestreo ......................................................... 12

4.2 Área de Muestreo ..................................................................................... 12

4.3 Características de la unidad observacional .............................................. 12

4.4. Tamaño de la Muestra ............................................................................. 12

4.5 Factores de Estudio .................................................................................. 12

4.6 Toma de Muestras .................................................................................... 12

4.6.1 Hisopado de Tonsilas ............................................................................ 12

4.6.2 Contenido Cecal .................................................................................... 13

4.7 Procesamiento de las Muestras en Laboratorio ........................................ 13

4.8 Determinación de Genes de Virulencia ..................................................... 15

vii

4.8.1 Preparación de la Master Mix ................................................................ 15

4.9 Identificación de serotipos O:3 y O:9 de Y. enterocolitica ......................... 16

4.9.1 Preparación de la Master mix ................................................................ 16

4.9.3 PCR ....................................................................................................... 17

4.10. Electroforesis ......................................................................................... 17

CAPITULO V ......................................................................................................... 18

5. Resultados Y Discusión ............................................................................... 18

5.1 Identificación y Fenotipificación de Yersinia spp. ...................................... 18

5.2 Resultados de genes de virulencia ........................................................... 19

5.3 Serotipificación mediante PCR ................................................................. 20

5.3 Discusión .................................................................................................. 21

CAPITULO VI ........................................................................................................ 25

6. Conclusiones .................................................................................................. 25

5. BIBLIOGRAFÍA .............................................................................................. 26

ANEXOS ............................................................................................................ 33

Anexo 1. .......................................................................................................... 33

2.1 Materiales de Laboratorio para toma de muestras ................................ 33

Anexo 2 ........................................................................................................... 34

2.8 Materiales para determinación de Genes de Virulencia ........................ 34

Anexo 3 ........................................................................................................... 35

2.9 Materiales para identificación de serotipos O:3 y O:9 ............................ 35

Anexo 4. .......................................................................................................... 36

Reactivos y cantidades necesarias para una reacción de PCR para

determinar genes de virulencia .................................................................... 36

Anexo 5. .......................................................................................................... 37

Reactivos y cantidades necesarias para una reacción de PCR para

determinar serotipos de Y. enterocolitica..................................................... 37

Anexo 6 ........................................................................................................... 38

Flujograma de Hisopado de Amígdalas ....................................................... 38

Anexo 7 ........................................................................................................... 39

viii

Flujograma de Contenido Cecal .................................................................. 39

Anexo 8 ........................................................................................................... 40

Índice de Tablas

Tabla 1. Clasificación de Cepas patógenas y no patógenas del Género Yersinia

spp .......................................................................................................................... 4

Tabla 2 Relación entre biotipos, serotipos, patogenicidad y virulencia de Y.

enterocolitica ........................................................................................................... 5

Tabla 3. Biotipos de Yersinia enterocolitica ........................................................... 14

Tabla 4 Primers para PCR de identificación de genes de virulencia de Yersinia

enterocolitica ......................................................................................................... 15

Tabla 5 Programa del Termociclador para los genes ail,virF y Yst ........................ 16

Tabla 6 Primers para la diferenciación de serotipos O:3 y O:9 de Y. enterocolitica

mediante PCR. ...................................................................................................... 16

Tabla 7 Programa del Termociclador para los genes rfbC y per. .......................... 17

Tabla 8 Resultados de la biotipificación de los aislados de Yersinia spp. originados

en cerdos positivos. ............................................................................................... 18

Índice de Figuras

Figura 1 Identificación genes de Virulencia mediante PCR. .................................. 19

Figura 2 Identificación de los serotipos O:3 y O:9 por PCR. ................................. 20

ix

TITULO: Aislamiento y caracterización de Yersinia enterocolitica patogénica

de cerdos en la empresa pública metropolitana de rastro Quito.

Autora: Débora Samantha Ortiz Tapia

Tutor: Dr. Christian Vinicio Vinueza Burgos

Resumen

El objetivo de este estudio fue, determinar la presencia de Yersinia enterocolitica

en hisopado de amígdalas y contenido cecal de cerdos que ingresan a la Empresa

Pública Metropolitana de Rastro Quito. Analizando mediante PCR la existencia de

genes de virulencia ail, virF, y yst, en cepas positivas a Yersinia enterocolitica.

Analizando 116 cerdos tomando 2 muestras por animal. Obteniendo 7 cerdos

positivos a Yersinia spp, de los que 4 fueron identificados como Y. enterocolitica.

Estas muestras positivas se analizaron mediante PCR, los resultados demostraron

ser negativos a todos genes de virulencia.

PALABRAS CLAVE: Y. ENTEROCOLITICA, GENES DE VIRULENCIA,

HISOPADO DE AMÍGDALAS, CONTENIDO CECAL, PATOGÉNICA.

x

TITTLE: Isolation and characterization of pathogenic Yersinia enterocolitica of

pigs in the Empresa Metropolitana De Rastro Quito.

Author: Débora Samantha Ortiz Tapia

Tutor: Dr. Christian Vinicio Vinueza Burgos

ABSTRACT

The objetive of this estudy was to determine the presence of Yersinia

enterocolitic in tonsil swabs and secum content of pigs that enter to the Empresa

Metropolitana De Rastro Quito. Analizyng through PCR the existence of

virulence genes ail, virF, and virF, and yst, in positive strains of Yersinia

enterocolitic. Materials and metodology : An analysis of 116 pigs was carried out

taking 2 samples per animal. Seven pigs were found to be positive for Yersinia

spp, of wich 4 were identified as Y. enterocolitica. These positive samples were

analyzed by PCR, the results proved to be negative to virulence genes.

KEYWORDS: Y. ENTEROCOLITICA, VIRULENCE GENES, TONSIL SWABS,

CECAL CONTENT, PATHOGENIC.

1

CAPITULO I

INTRODUCCIÓN

Las enfermedades transmitidas por los alimentos (ETAs) son causadas por diversos

organismos patógenos que pueden ser ingeridos a través de agua o alimentos

contaminados (Olea et al., 2012). Según la OMS, (2017) 1 de cada 10 personas

enferma por ETAs.

El género Yersinia está ampliamente distribuido en el medio ambiente y los

animales, el reservorio principal de cepas patógenas de Yersinia enterocolitica es el

cerdo (Bottone, 1997). La ingesta de carne contaminada, con insuficiente cocción o

verduras lavadas con agua contaminada por heces de cerdos infectados, producen

cuadros diarreicos en los humanos (Rusak et al., 2014).

En 2017 la Unión Europea reportó 1,77 casos de Yersiniosis en humanos por cada

100,000 habitantes (EFSA, 2018). En el Ecuador se reportan brotes de ETAs

causadas por varios agentes. En 2019, el Ministerio de Salud Pública reportó un

33.91% semanal de transgresiones alimentarias causada por agentes que no fueron

identificados como Salmonella spp., E. coli o Shigella spp. (MSP, 2019).

Debido al riesgo que ésta bacteria puede presentar y la poca información que se

tiene de la misma, se considera a la presencia de Yersinia spp en cerdos de

consumo en el Ecuador como una enfermedad transmitida por los alimentos de

importancia en la Salud Pública.

2

CAPITULO II

Objetivo General

Determinar la presencia de Yersinia enterocolitica a través de pruebas

microbiológicas en cerdos en la Empresa Pública Metropolitana de Rastro

Quito.

Objetivos Específicos

Evaluar la presencia de Yersinia enterocolitica en hisopado de amígdalas y

contenido cecal de cerdos que ingresan a la Empresa Pública Metropolitana

de Rastro Quito.

Determinar mediante PCR la existencia de genes de virulencia ail, virF, yst,

en cepas positivas a Yersinia enterocolitica y conocer su patogenicidad por

la presencia de dos de tres genes en cada una de las muestras.

3

CAPITULO III

3. Marco Teórico

3.1 Historia

En sus inicios el Género Yersinia fue descrito como, una bacteria Gram negativa,

cocobacilar, e integrada como parte de la familia Pasteurellaceae (Bottone, E.,

1977). Yersinia pseudotuberculosis y Yersinia pestis fueron las primeras especies

de importancia veterinaria declarada, al causar enfermedades epizoóticas

especialmente en roedores. En 1953 varios brotes asociados a Y.

pseudotuberculosis fueron reportados en Estados Unidos (Bottone, E., 1977).

Además, patógenos denominados por entonces como “aislados tipo Yersinia”

fueron encontrados en personas, confirmando su importancia en medicina humana

(Bottone, E., 1977)

Van Loghem propone la creación del Género Yersinia en 1894, esto en honor a E.

Yersin quien fue el primero en aislar Bacillus pestis (ahora denominada Yersinia

Pestis). En 1954 utilizando análisis computarizado se determinó relaciones

cercanas, lo que le permitió integrarse a la familia de las Enterobacteriaceae

(Bottone, E., 1977).

Se propone el nombre de Yersinia X para unir Y. pseudotuberculosis y Y. pestis, sin

embargo, existían otro tipo de aislados no identificados de origen entérico, que

tuvieron similitud entre cepas europeas, americanas de origen animal y humano.

Frederiksen en 1964 propone el nombre de Yersinia enterocolitica para todos los

aislados, sin embargo existía diferencias en la prueba bioquímica del indol, que no

quedaba clara para el nuevo género (Bottone, E., 1997).

En 1984 se incluía el género Yersinia con una especie más, Y. enterocolitica. en la

8ª edición del Manual Bergey (Reinés, 2012).

4

3.2 Generalidades

Actualmente el Género Yersinia posee 18 especies, pertenecientes a la familia

Enterobacteriaceae de la clase Gammaproteobacteria del Filum Proteobacteria

(Van Damme, 2013), 3 de ellas son caracterizadas como patógenas para el ser

humano (Tabla 1) (Fredriksson-Ahomaa et al., 2018).

El género Yersinia spp. según el CDC (Centers for Disease Control and Prevention)

es responsable de gran parte de los trastornos intestinales en humanos (CDC,

2016). Además es una importante infección alimentaria según la Unión Europea en

2015 (EFSA, 2007; Morka et al., 2018).

Las bacterias del género Yersinia son Gram negativas, de forma cocobacilar, no

formadora de esporas, anaerobias facultativas, oxidasa negativa y catalasa

positivas (Chlebicz & Slizewska, 2018; Van Damme, 2013). Son psicrófilas pudiendo

crecer entre 0°C a 45 °C, con una temperatura óptima de 22°C a 30°C donde son

móviles (Van Damme, 2013).

Tabla 1. Clasificación de Cepas patógenas y no patógenas del género Yersinia spp.

Cepas no patógenas o Ambientales Cepas Patógenas

Y. aldovae, Y. aleksiciae, Y. pestis,

Y. kristensenii, Y. bercovieri, Y. pseudotuberculosis

Y. massiliensis, Y. frederiksenii, Y. enterocolitica

Y. mollaretii, Y. intermedia,

Y. nurmii, Y. similis,

Y. pekkanenii,

Y. ruckeri a

Y. entomophaga b

Y. wautersii,

Y. rohdei,

a Patógeno para peces. b patógeno específico de los insectos. (Fredriksson-

Ahomaa et al., 2018; Van Damme, 2013).

Estudios genéticos han determinado todo el genoma de este patógeno (Hall et al.,

2015), información que ha permitido subdividir a Y. enterocolitica, en Y.

5

enterocolitica subespecie enterocolitica que comprende cepas altamente patógenas

del biotipo 1B y Y. enterocolitica subespecie paleartica que comprende cepas poco

patógenas o apatógenas, dando lugar a 6 grupos filogenéticos (Fredriksson-

Ahomaa et al., 2018; Hall et al., 2015).

Se han identificado 6 biotipos y alrededor de 30 serotipos. Los biotipos se identifican

mediante sus propiedades bioquímicas, con al menos cinco pruebas que diferencian

cada uno. Las cepas pertenecientes al biotipo 1A no son patógenas, los biotipos 1B,

2, 3, 4 y 5 se consideran patógenos para los humanos (Joutsen & Fredriksson-

Ahomaa, 2016; Mastrodonato et al., 2018; Wannet et al., 2001; Zadernowska et al.,

2013).

La serotipificación de Y. enterocolitica se realiza con el antígeno de superficie (O)

clasificándose en más de 30 serotipos (Joutsen & Fredriksson-Ahomaa, 2016).

Según Van Damme, (2013) los biotipos a su vez se pueden subdividir en 3 patotipos

basados en su potencial patógeno (Tabla 2).

Tabla 2 Relación entre biotipos, serotipos, patogenicidad y virulencia de Y. enterocolitica

Biotipo Serotipo(s) Patogenicidad apYV bHPI

1A O:4; O:5; O:6,30; O:6,31; O:7,13;

O:10; O:14; O:16; O:21; O:22; O:25;

O:37; O:41,42; O:46; O:47; O:57

Ninguna a baja - -

1B O:9; O:4; O:3; O:32; O:8;

O:13a,13b; O:16; O:18; O:20; O:21;

O:25; O:41,42

Elevada + +

2 O:5,27; O:9 ; O:27 Baja a

moderada

+ -

3 O:1,2,3; O:3; O:5,27 Baja a

moderada

+ -

4 O:3 Baja a

moderada

+ -

6

5 O:2,3 Baja a

moderada

+ -

a pYV: Plásmido de Virulencia para Yersinia, b HPI: Isla de alta patogenicidad.

(Adaptada de Van Dame 2013 y 2010)

La actividad de la ureasa diferencia a Yersinia spp de otras especies, determinando

el nivel patógeno de Y. enterocolitica. Las cepas patogénicas de esta bacteria son

urea positiva (Hilbert et al., 2003; Joutsen & Fredriksson-Ahomaa, 2016).

Este patógeno posee una resistencia natural a las penicilinas por su actividad de la

B-lactamasa (Fredriksson-Ahomaa, 2017). Es ampliamente tolerante a tratamientos

alcalinos, en especial con hidróxido de potasio el cual es usado para reducir

bacterias contaminantes en los aislamientos de Y. enterocolitica (Iso, 2017).

3.3 Virulencia y vías de Transmisión

El cerdo es considerado como el principal reservorio de cepas patógenas de Y.

enterocolitica (Zadernowska et al., 2013). Se estima que el consumo de esta carne

es responsable hasta del 71.6 % de infecciones de Y. enterocolitica en Europa (Van

Damme, 2013). El contacto directo con estos animales también se ha vinculado a

infecciones por esta bacteria, además se reporta un aumento de anticuerpos contra

la misma en trabajadores relacionados con la manipulación de cerdos como

criadores y empleados en matadero (Van Damme, 2013).

La vía de transmisión de este patógeno es principalmente fecal oral (Fredriksson-

Ahomaa, 2017). Afecta al ser humano cuando este ingiere agua o alimentos

contaminados (Petsios et al., 2016; Van Damme, 2013; Zadernowska et al., 2013).

Las cepas patógenas ingresan al estómago, pasan al intestino, atraviesan a la

mucosa intestinal e infectan los tejidos adyacentes, son altamente invasivas y

resistentes contra la respuesta inmune del hospedador (Fredriksson-Ahomaa et al.,

2006; Petsios et al., 2016).

La patogenicidad de Y. enterocolitica es multifactorial y porta varios genes de

virulencia que pueden estar codificados en el plásmido de virulencia o en el

cromosoma bacteriano (Dube, 2009; Fredriksson-Ahomaa et al., 2006). Los genes

7

codificados en el plásmido son virF y YadA, estos se encuentran en el pYV

(plásmido de Virulencia de Yersinia). Los genes de virulencia cromosómica más

importantes son yst, inv, ail (Fredriksson-ahomaa et al., 2006; Mazzette et al., 2015;

Zadernowska et al., 2013).

El pYV con aproximadamente 70kb, permite la replicación dentro de los tejidos

linfoides de los huéspedes (Petsios et al., 2016). También codifica a una proteína

de membrana externa el YadA, que impulsa la unión de las células, a los

componentes de la matriz extracelular como el colágeno (Van Damme, 2013;

Zadernowska et al., 2013).

El gen yst codifica una enterotoxina estable al calor, factor que es asociado a

cuadros de diarrea durante la infección (Harnett et al., 1996; Mazzette et al., 2015).

El gen inv codifica a proteínas de membrana, que se une a receptores de las células

epiteliales en las células M del intestino, permitiendo la absorción de las bacterias

en la etapa primaria de la infección (Petsios et al., 2016; Van Damme, 2013). El gen

ail codifica a proteínas que se relaciona con la unión e invasión en la célula huésped,

permite la propagación bacteriana a la linfa mesentérica y es característica de cepas

patógenas, también defiende a las bacterias del sistema inmunitario del hospedador

(Petsios et al., 2016; Zadernowska, A., et al. 2013).

Las cepas 1B de Y. enterocolitica son altamente patógenas, ya que expresan una

isla de alta patogenicidad (HPI) en el cromosoma. Este grupo de genes está

encargado de la absorción de hierro y de la propagación sistémica de éstas

bacterias en el hospedador (Joutsen et al., 2016; Van Damme, 2013)

3.4 Yersinia enterocolitica en Animales de producción

Este patógeno ha sido detectado en una amplia variedad de animales, incluyendo

perros, ovejas, vacas, cabras, pollos y jabalíes. El cerdo es el único animal en el

que se puede encontrar biotipos patógenos de Y. enterocolitica por lo que se

considera como reservorio primario de esta (Fredriksson-Ahomaa, 2017; Van

Damme et al., 2013). La yersiniosis tiene una mayor presentación en animales

8

jóvenes o que han sido sometidos a situaciones de estrés (Fredriksson-Ahomaa,

2017).

Algunos estudios señalan que animales que han adquirido Y. enterocolitica son

asintomáticos (Bottone, E., 2015; Fredriksson-Ahomaa, 2017). Esta bacteria ha sido

aislada en tonsilas, así como en el intestino y heces de cerdos saludables. Estudios

en cerdos de matadero demostraron una relación de 6 veces a 1 de los aislamientos

obtenidos de tonsilas frente a los aislados de heces y contenido intestinal de Y.

enterocolitica patógena (Nesbakken et al., 2006). Estos hechos resaltan la

importancia para la recuperación de este patógeno tomando las muestras en

tonsilas de cerdos (Nesbakken et al., 2006).

Los cerdos de engorde a la edad de sacrificio que son portadores de Y.

enterocolitica en sus amígdalas, pueden representar un factor de riesgo para

contaminar la canal durante el sacrificio y la evisceración (Fredriksson-Ahomaa et

al., 2001; Virtanen et al., 2011).

3.5 Yersinia en humanos

La Yersiniosis causada por Y. enterocolitica se presenta en humanos con síndromes

gastrointestinales, como enteritis aguda, ileítis terminal, linfadenitis mesentérica

(Falcão & Falcão, 2006; Rusak et al., 2014), puede producir infecciones en sitios

extra intestinales, abscesos en hígado o el riñón, faringitis, neumonía, encefalitis,

entre otras (Van Damme, 2013).

La presentación clínica de la enfermedad está dada por el hospedador, la edad,

enfermedades presentes o características propias de la cepa, su serotipo o biotipo

(Van Damme, 2013). Niños menores a 5 años presentan diarrea aguda, mientras

que niños mayores y adolescentes presentan linfadenitis mesentérica simulando

síntomas de una falsa apendicitis. En adultos se produce una leve diarrea, sin

embargo, presentan secuelas post infección como eritema nodoso y artritis reactiva.

Estas secuelas pueden ser más agresivas si los pacientes poseen enfermedades

inmunosupresoras o están cursando con enfermedades secundarias (Fredriksson-

Ahomaa, 2017; Petsios et al., 2016).

9

3.6 Epidemiología

Países desarrollados monitorean cuidadosamente las infecciones por Y.

enterocolitica mientras que, países en vías de desarrollo no disponen de técnicas

diagnósticas ideales (Chlebicz & Slizewska, 2018; Falcão & Falcão, 2006).

El Centro de Control y Prevención de Enfermedades (CDC), reportó que en los

Estados Unidos en 2016, la Yersiniosis afectó a 117.000 habitantes (Chlebicz &

Slizewska, 2018). Se estima que las infecciones por este patógeno producen un

34.4% de hospitalizaciones con un 2% de mortalidad (Scallan et al,. 2011). Estudios

realizados entre 2006 y 2008 a 31 patógenos demostraron que 950 casos fueron

positivos a Y. enterocolitica comprobadas en laboratorio, de estas un 90% fueron

adquiridas por una ETA, también se determinó que 122.8 casos no obtuvieron un

diagnóstico definitivo. Se considera que por cada caso confirmado de infección por

Y. enterocolitica existen 123 casos de Yersiniosis que no se confirman (Scallan et

al., 2011).

Según la EFSA (2018) la Unión Europea en 2017 reportó para humanos 6.823 casos

de Yersiniosis, lo que significa 1.77 casos por cada 100.000 habitantes. En 529

muestras de cerdos se encontró 4.4% casos positivos. La EFSA reporta también

una disminución de casos de Yersiniosis en humanos comparada con el 2016, de

2.8%, sin embargo esta enfermedad sigue siendo de constante reporte de la Unión

Europea en casos humanos (EFSA, 2018).

En América Latina existen pocos estudios de la presencia de este patógeno. Así, en

Argentina se obtuvieron aislados de Y. enterocolitica que no provinieron de brotes

por ETAs, sino de aislados obtenidos en alimentos (Mastrodonato et al., 2018). Chile

realizó un estudio por tres años de Y. enterocolitica en niños, demostrando una

incidencia de 1.4% y aislamientos en alimentos del 2% (Mastrodonato et al., 2018;

Prado et al., 1992).

Brasil no reporta frecuentemente casos de aislamientos de este patógeno por la

baja ocurrencia y la ausencia de técnicas ideales para el aislamiento (Falcão &

Falcão, 2006).

10

Ecuador no posee estudios específicos de Y. enterocolitica, los datos que se pueden

obtener son a través de la gaceta Nacional Epidemiológica y el Ministerio de Salud

Pública reportado como brotes ETA, en el 2019 se presentaron en un 33.91% en

3.235 casos (MSP, 2019).

3.7 Métodos de aislamiento bacteriológico

Existe diversas formas de aislar cepas patógenas de Y. enterocolitica. Los medios

de enriquecimiento líquidos se recomiendan para incrementar el número de células

de este patógeno antes de ser inoculados en medios sólidos siguiendo los

protocolos de aislamiento de esta bacteria (Iso, 2017; Petsios et al., 2016).

Por la naturaleza psicrófila de las cepas de esta bacteria, se utiliza bajas

temperaturas para alcanzar una mayor densidad de población (Petsios et al., 2016;

Zadernowska et al., 2013).

Después de un enriquecimiento con Tripticasa Agar caldo (TSB) se recomienda el

tratamiento alcalino, para reducir el nivel de contaminantes que se pueden

desarrollar durante el mismo (Iso, 2017; Petsios et al., 2016). El medio de mayor

uso es Cefsulodin–irgasan–novobiocin (CIN) para el aislamiento de Y.

enterocolitica. Este medio contiene antimicrobianos selectivos como cefsulodina,

irgasan y novobiocina, que inhibe el crecimiento de algunos miembros bacterianos

de la familia Enterobacteriaceae (Petsios et al., 2016; Van Damme, 2013;

Zadernowska et al., 2013).

Dentro de las ventajas que proporcionada el agar CIN tenemos: mayor recuperación

de cepas clínicas, mejor visualización de la morfología de las colonias, en relación

a otros medios de cultivo como Salmonella-Shigella Modificado (SSDC) y

MacConkey (MAC), propiedades que le permiten diferenciar Y. enterocolitica de

otras bacterias Gram negativas (Fredriksson-Ahomaa, 2017; Petsios et al., 2016).

Esta bacteria forma colonias características menores a 2mm, con centro rojo

profundo por la fermentación del manitol, con un borde translucido denominado

como “ojo de buey” (Iso, 2017; Zadernowska et al., 2013). La apariencia de la

colonia varía con el serotipo, puede ser irregular o con un centro rojo elevado como

11

“huevo frito” cuando son observadas a través de un estereosmicroscopio. Se

recomienda una incubación a 30°C para evitar la pérdida de plásmidos de virulencia

(Van Damme, 2013; Zadernowska et al., 2013)

Aunque el medio CIN se recomienda para el aislamiento de Y. enterocolitica posee

ciertas restricciones como permitir el crecimiento de ciertas especies de

enterobacterias que producen colonias similares en apariencia a Y. enterocolitica.

También inhibe el crecimiento de algunas cepas serotipo O:3, no posee una

diferenciación entre cepas patógenas, apatógenas u otro tipo de Yersinia spp

(Petsios et al., 2016).

3.8 Métodos de identificación molecular

Los métodos de detección molecular se basan en secuenciación genómica y

detección de genes de virulencia. Para la identificación de Y. enterocolitica se utiliza

métodos como: PCR (simple, multiplex y en tiempo real), enzimas de digestión

enzimática y electroforesis de campo pulsado (PFGE) (Fredriksson-Ahomaa M., et

al 2001; Petsios et al., 2016). En aislados de muestras de alimentos que no son

completamente puras se usa Hibridación de Colonias, Microarrays y métodos de

amplificación isotérmica (Petsios et al., 2016). Estudios basados en ADN pueden

detectar el patógeno con mayor sensibilidad y rapidez que usando métodos de

cultivo (Petsios et al., 2016).

12

CAPITULO IV

4. Materiales Y Métodos

4.1 Diseño de investigación y Muestreo

Tipo de investigación Observacional – Transversal

4.2 Área de Muestreo

El presente proyecto se realizó en cerdos faenados en la Empresa Pública

Metropolitana de Rastro Quito.

4.3 Características de la unidad observacional

La unidad epidemiológica se considera a un animal por productor con dos muestras

por cerdo (hisopado de amígdalas y contenido cecal), sean machos o hembras que

lleguen a la Empresa Metropolitana de Rastro Quito.

4.4. Tamaño de la Muestra

Por conveniencia del investigador basado en el tiempo que se tiene para concluir

los estudios de pregrado en este estudio se obtuvieron 116 muestras de cerdos en

5 meses.

4.5 Factores de Estudio

Variable Independiente: Número de cerdos muestreados durante el estudio.

Variable Dependiente: Número de cerdos positivos al aislamiento de Y.

enterocolitica.

4.6 Toma de Muestras

Dos tipos de muestras:

4.6.1 Hisopado de Tonsilas

Se tomó una torunda de algodón estéril realizando un barrido en las amígdalas

de cerdo, con precaución de no contaminar la muestra con otras áreas de la

13

boca. La torunda fue colocada en un frasco estéril, previamente rotulado y

almacenado para su transportación en refrigeración.

En el frasco con la torunda se colocó 5 ml de agua estéril, más 15 ml de PBS

para su enriquecimiento.

4.6.2 Contenido Cecal

Con una torunda de algodón con alcohol al 96% se limpió el ciego, para luego

con un bisturí estéril cortar 3 cm aproximadamente.

Fueron tomados 50 gr de contenido cecal en un frasco estéril previamente

etiquetado, rotulado y almacenado para su transportación en refrigeración.

En una funda estéril rotulada se pesó 5 gr de contenido cecal, más 15 ml de

PBS para su enriquecimiento.

Los materiales y elaboración de medios se pueden ver en el anexo 1.

4.7 Procesamiento de las Muestras en Laboratorio

El flujograma del procesamiento de las muestras se puede ver en el Anexos 6 y 7.

De manera resumida los pasos para el aislamiento de Y. enterocolitica fueron:

Se incubó las muestras a 30° C por 48 horas.

Post enriquecimiento, fue preparada solución salina al 9% más 0,5g KOH y se

dispensó en tubos estériles 4,5ml por tubo.

Se tomó 0.5 ml de cada muestra enriquecida en PSB y se añadió al tubo con

4,5ml de solución KOH al 5%.

Se homogenizó la muestra a través de Vortex por 20 segundos,

inmediatamente se tomó del tubo 1ul de muestra, se estrió por agotamiento en

Agar CIN. Las muestras fueron incubadas por 24 horas a 30°C.

Se comprobó la morfología macroscópica de las colonias mediante el

estereomicroscopio. Para esto se utilizó un espejo, con un haz de luz

proyectado a 45 grados desde la parte trasera de la caja Petri.

Las colonias típicas de Y. enterocolitica presentaron el centro rojo y borde

transparente (ojo de buey) con diámetro no mayor a 2 mm como positivos.

14

Colonias características en CIN se sometieron a cinco pruebas bioquímicas

divididas en dos fases. La primera fase las muestras se sembraron en agar

Kliger, caldo urea a 30°C por 24h siendo positivas cuando se obtiene un

resultado negativo a fermentación de lactosa, positivo a fermentación de

glucosa, (K/A) y urea positiva. En la segunda fase de identificación, las

muestras fueron biotipificadas mediante las pruebas bioquímicas de esculina,

xilosa e indol. La interpretación de estos resultados se realizó con los criterios

que se muestran en la Tabla 3.

Tabla 3. Biotipos de Yersinia enterocolitica

Reacción Biotipos Descripción

1ª* 1b 2 3 4 5

Esculina + - - - - - Esculina positiva: Colonias café

oscuro.

Esculina negativo: colonias

transparentes o blancas.

Xilosa + + + + - **Dd Xilosa Positiva: forma un color

amarillo.

Xilosa Negativo: forma un color

rosado

Indol + + + - - - Indol positivo: formación de un halo

rosado.

Indol negativo: formación de un halo

café.

*Cepas de biotipos no patógenos. **Dd: reacción débil o retrasada.

Fuente: Tabla modificada de normal ISO 10273:2017.

Lisado celular

● Con el aza de 1μl se tomó una colonia típica del cultivo bacteriano, llenando el

orificio del aza.

● En un microtubo con 300μl de buffer TE 1X se suspendió y homogenizó el

material tomado.

● Se colocó el microtubo por 20 minutos en el termobloque a temperatura de 95C°.

15

● Se recuperó el sobrenadante en otro microtubo cuidando de no topar el pellet

que se formó en el fondo del envase con la punta de la micropipeta.

● Luego se almacenó a -20C°.

4.8 Determinación de Genes de Virulencia

4.8.1 Preparación de la Master Mix

Para una reacción de PCR la mezcla se preparó con:

● Agua ultrapura (Nuclease-Free Water ® de Promega)

● Primers forward y reverse para cada uno de los 3 genes (Tabla 4).

● Kit Go Taq(R) Flexi DNA Polymerase de Promega, que incluye: GoTaq® Flexi

Buffer 5X, MgCl2 Solution 25Mm PCR, GoTaq® DNA Polymerase (5U/μl)

● dNTP (Nucleotide Mix® 10mM de Promega).

● Lisados de las enterobacterias en estudio.

● Como control de calidad se utilizó un control positivo, que corresponde al ADN

para los genes ail, virF y yst. Como control negativo se usó agua ultrapura (Atlas,

1991).

Tabla 4 Primers para PCR de identificación de genes de virulencia de Yersinia enterocolitica

Primer Secuencia Oligonucleótidos 5´- 3´ Pares de Bases

Ail-a TGGTTATGCGCAAAGCCATGT 356 Ail-b TGGAAGTGGGTTGAATTGCA

VirF-a GCTTTTGCTTGCCTTTAGCTCG 231 VirF-b AGAATACGTCGCTCGCTTATCC

Yst-a GTCTTCATTTGGAGGATTCGGC 134 Yst-b AATCACTACTGACTTCGGCTGG

Fuente: (Harnett et al., 1996) Elaborado por: La autora

Se realizó la master mix en un microtubo de 2ml y se repartió esta mezcla en

microtubos de 200μl o tubos para PCR. Las cantidades necesarias de reactivos para

una reacción se describen en el Anexo 4.

16

Tabla 5 Programa del Termociclador para los genes ail,virF y Yst.

Etapa Temperatura Cº

Tiempo Ciclos

Desnaturalización inicial del ADN 95 5:00 1

Desnaturalización del ADN 95 0:30 30

Hibridación de los primers 55 0:30

Extensión de la cadena 72 1:00

Elongación Final 72 7:00 1

Conservación de los amplicones 4 ∞ 1

Fuente: investigación directa Elaboración: La autora

4.9 Identificación de serotipos O:3 y O:9 de Y. enterocolitica

4.9.1 Preparación de la Master mix

Para una reacción de PCR la mezcla se preparó con:

Agua ultrapura (Nuclease-Free Water ® de Promega)

Primers forward y reverse para cada uno de los 2 genes (Tabla 6).

Kit Go Taq(R) Flexi DNA Polymerase de Promega, que incluye: GoTaq® Flexi

Buffer 5X, MgCl2 Solution 25Mm PCR, GoTaq® DNA Polymerase (5U/μl)

dNTP (Nucleotide Mix® 10mM de Promega).

Lisados de las Enterobacterias en estudio.

Como control de calidad se utilizó un control positivo, que corresponde al ADN

para los genes rfbC y per. Como control negativo se usó agua ultrapura (Atlas,

1991).

Tabla 6 Primers para la diferenciación de serotipos O:3 y O:9 de Y. enterocolitica mediante PCR.

Primer Secuencia Pares de Bases

rfbC CGC ATC TGG GAC ACT AAT TCG 405

per TGTGCTGAAGCTTTTGGATCT 181

Fuente: (Jacobsen et al., 2005) Elaborado por: la autora

Se realizó la master mix en un microtubo de 2ml y se repartió esta mezcla en

microtubos de 200μl o tubos para PCR. Las cantidades necesarias de reactivos para

una reacción se describen en el Anexo 5.

17

Tabla 7 Programa del Termociclador para los genes rfbC y per.

Etapa Temperatura Cº

Tiempo Ciclos

Desnaturalización inicial del ADN 95 5:00 1

Desnaturalización del ADN 95 0:30 30

Hibridación de los primers 55 0:30

Extensión de la cadena 72 1:00

Elongación Final 72 7:00 1

Conservación de los amplicones 4 ∞ 1

Fuente: investigación directa Elaboración: La autora

4.9.3 PCR

Se colocó los tubos para PCR en el termociclador con el programa correspondiente

al gen a identificarse. Los programas que se utilizaron para la identificación de estos

genes se indican en las tablas 5 y 7.

4.10. Electroforesis

Todos los productos de PCR se visualizaron realizando una electroforesis con las

siguientes condiciones:

Se preparó un gel de agarosa al 1,5 %, colocando 1.5 g de agarosa (Ultra Pure

Agarose Invitrogen (™) en 100ml de TAE 0,5X o TBE 1X (según el buffer que se

utilice en la cámara de electroforesis).

Se disolvió la mezcla calentándola en un microondas hasta llegar a ebullición.

Cuando esta llegó aproximadamente a los 50 C°, se agregó 0,8μl de Syber Safe

(SYBER®Safe, DNA gel Stain, Invitrogen™) por cada 10 ml de mezcla y fue

vertida en un molde anteriormente provisto con un peine que separa cada

reacción de PCR.

Se dejó solidificar por 15 minutos, retirando el peine y colocando el gel en la

cámara de electroforesis.

Se colocó 2,5μl de Ladder (Bench Top 100bp DNA Ladder de Promega) unido

con 2 μl de buffer de carga en el primer pocillo. En los siguientes pocillos, 5μl de

cada amplicón a ser identificado junto con los controles positivo y negativo.

Se programó la cámara de electroforesis a 100 voltios, 400 mA y 30 minutos.

Terminada la electroforesis, se colocó el gel en un transiluminador; sistema

digital de fotodocumentación de geles y se tomó una foto del resultado.

18

CAPITULO V

5. Resultados Y Discusión

5.1 Identificación y Fenotipificación de Yersinia spp.

En el estudio se analizaron muestras de 116 cerdos, de cada uno de ellos se tomó

muestras en tonsilas y en contenido cecal. Las muestras que obtuvieron resultados

positivos para la primera fase bioquímica Kliger y urea fueron 7, de las cuales 3

muestras se aislaron en ambos órganos. Tres muestras solo se aislaron en

contenido cecal y una muestra se aisló solamente en tonsilas.

Tabla 8 Resultados de la biotipificación de los aislados de Yersinia spp. originados en cerdos positivos.

#

Cerdo

Código Origen Esculina Indol Xilosa Resultado

1 U2068C Contenido cecal - - - Biotipo 4

2 U2080C Contenido cecal - - - Biotipo 4

U2080T Hisopado de tonsilas - - - Biotipo 4

3 U2086T(a) Hisopado de tonsilas - - - Biotipo 4

U2086T(b) Hisopado de tonsilas - + - Yersinia

spp.

4 U2089C Contenido cecal - + - Yersinia

spp.

5 U2127C Contenido cecal - - - Biotipo 4

U2127T Hisopado de tonsilas - + - Yersinia

spp.

6 U2132C Contenido cecal - + - Yersinia

spp.

7 U2133C Contenido cecal - + - Yersinia

spp.

U2133T Hisopado de tonsilas - + - Yersinia

spp.

19

De los 7 cerdos positivos 4 fueron identificados como Y. enterocolitica. Los aislados

de los otros 3 cerdos no pudieron ser identificados con las pruebas bioquímicas

utilizadas en este estudio (Tabla 3).

De los 4 cerdos positivos a Y. enterocolitica, se obtuvieron diferentes aislados. De

esta manera, dos cerdos fueron positivos en contenido cecal, 1 cerdo fue positivo

en tonsilas y 1 cerdo presentó aislamiento del mismo biotipo en ambos órganos.

La presencia encontrada en este estudio de Yersinia spp. fue de 6 % (n=116),

mientras que Y. enterocolitica se identificó en 3,44 % (n=116).

5.2 Resultados de genes de virulencia

Figura 1. Identificación genes de Virulencia mediante PCR. El primer carril

corresponde a un marcador de peso molecular (100pb a 1000pb), del segundo al

doceavo carril se encuentran las muestras clínicas. El control positivo está en el

carril trece con los genes ail (356pb), virF (231pb), yst (134pb) y en el carril catorce

el control negativo (agua ultrapura).

En el análisis de PCR realizado la muestra U2133c amplicó para el gen ail, pero

para ser considerada una cepa patógena, debe ser positiva a dos de los tres genes

20

analizados (Van Damme, 2013). Por lo tanto no se obtuvieron muestras positivas a

genes de virulencia (ail, virF y yst) analizados en este estudio (Figura 1).

5.3 Serotipificación mediante PCR

Figura 2 Identificación de los serotipos O:3 y O:9 por PCR.

El primer carril corresponde a un marcador de peso molecular (100pb a 1000pb),

del segundo al doceavo carril se encuentran las muestras clínicas. El control

positivo se encuentra en el carril trece con los genes rfbC O:3 (405pb) y per O:9

(181pb). El control negativo se encuentra en el carril catorce con (agua ultrapura).

En el análisis de PCR realizado, no se obtuvieron muestras positivas a los serotipos

O:3 y O:9 analizados en este estudio (Figura 2).

21

5.3 Discusión

El presente estudio se realizó en base a la norma ISO 10273:2017 para el

aislamiento de Yersinia enterocolitica patogénica. El agar CIN utilizado para el

aislamiento de Y. enterocolitica permite además el crecimiento de Enterobacterias

como Citrobacter, Enterobacter, Klebsiella y Serratia; sin embargo, las colonias

presentan tamaños superiores a los 3 mm (Zadernowska et al., 2013). Este fue el

caso de muchos aislamientos primarios realizados en este estudio, en los cuales se

observaron colonias típicas, pero con un diámetro mayor al esperado.

En Europa, esta bacteria ocupa el tercer lugar entre los patógenos entéricos

causantes de ETAs en humanos (Mazzette et al., 2015). Además, se ha asociado

al cerdo como el principal reservorio de cepas patógenas (Bottone, 2015;

Nesbakken et al.2003; Van Damme et al., 2013). Estudios realizados en Europa

reportaron prevalencias de Y. enterocolitica entre el 37.4% y 58% en cerdos de

consumo (EFSA, 2007; Van Damme et al., 2015). Por su lado Estados Unidos

presentó prevalencias del 5% y 25% (Bowman et al., 2007; Funk et al.,1998).

Latinoamérica presenta pocos estudios de este patógeno en cerdos. Así, un estudio

realizado en México encontró una prevalencia del 22% (n=100) (Elizalde et al.,

2001). En Brasil una investigación realizada en tonsilas de cerdo durante el 2017,

reportó el 25.2% (n=400) de muestras positivas a Y. enterocolitica. Sin embargo,

solo una muestra presentó genes de virulencia (Wildemann et al., 2017).

Los niveles de Y. enterocolitica reportados en Ecuador han sido los más bajos

dentro en el contexto latinoamericano. Así, un estudio realizado en una comunidad

rural Otón de Vélez en Yaruquí encontró 1 cerdo positivo (2.8%) de 36 animales

muestreados (Vasco et al., 2016). No obstante, los resultados que se encontraron

en el presente estudio mostraron la presencia de Yersinia spp. en aislados

originados en 7 cerdos (6%), de los cuales 4 fueron identificados como Y.

enterocolitica.

22

Los bajos porcentajes de aislamiento de Y. enterocolitica en nuestro estudio pueden

estar influenciados por el tipo de faenamiento que se realiza en Ecuador. Un estudio

de Fredriksson-Ahomaa et al., (2001) determinó que se provocaba una mayor

diseminación de este patógeno durante el faenamiento al cortar la cabeza de los

cerdos. Sin embargo, el proceso de faenamiento en el Ecuador es diferente al

europeo, manteniendo la cabeza del cerdo intacta en la línea de faenamiento. Otro

factor que hay que mencionar es la cantidad limitada de animales muestreados en

este estudio. Para futuros estudios, se sugiere aumentar el número de muestra a fin

de reducir el potencial sesgo de la estimación de esta bacteria en cerdos.

La importancia de Y. enterocolitica como ETA ha sido valorada en distintas matrices

alimenticias y casos clínicos humanos. Así, en Argentina se ha podido aislar Y.

enterocolitica en huevos, leche, salchichas y productos cárnicos. Sin embargo,

ninguno de estos ha sido asociado a brotes por contaminación de alimentos (Favier

et al., 2005; Lucero Estrada et al., 2011). Por otro lado, en Chile se reportó la

presencia de esta bacteria en cuadros diarreicos en niños (Prado et al., 1992). En

Colombia también se investigó este patógeno en diarreas humanas como posible

causante de ETAs, pero se obtuvieron resultados negativos del aislamiento

(Hernández et al., 2017).

Pese a que varios estudios han reportado un mayor número de aislamientos en

tonsilas que en contenido cecal (Nesbakken et al., 2003; Rahikainen et al, 2016;

Van Damme et al., 2014), el presente estudio obtuvo más aislamientos en contenido

cecal. Se ha argumentado que la presencia del patógeno en diferentes órganos

puede estar asociada a factores estacionales, transporte de los animales o estrés

(Rahikainen et al., 2016). Estas variables podrían explicar en parte nuestros

resultados, pero estudios complementarios son necesarios para verificar esta

hipótesis.

Los serotipos de mayor prevalencia en cerdos de origen europeo son O:3 y O:9

(Zadernowska et al., 2013). Mientras que el serotipo O:8 predomina en EE.UU

23

seguido en menor cantidad del O:3 (Bottone, 2015; Petsios et al., 2016;

Zadernowska et al., 2013). En América del Sur solo algunos países presentan

identificación de serotipos. Así, Rusak et al., (2014) determinó al serotipo O:3 en

cepas brasileñas y en México se encontraron los serotipos O:9 y O:3 (Elizalde

Castañeda et al., 2001).

De los cerdos positivos a Y. enterocolitica, 4 aislados fueron tipificados como biotipo

4, concordando con estudios realizados en Brasil y Estados Unidos donde este

biotipo es el prevalente (Bottone, 2015; Rusak et al., 2014). Sin embargo, otros

estudios realizados en Argentina y Europa reportan además del biotipo 4 como

ocasional, los biotipos 1A, 1B, 2, y 3 como los más prevalentes (Bottone, 2015;

Favier et al., 2005; Fredriksson-Ahomaa et al., 2001; Fredriksson-Ahomaa et al.,

2018; Estrada et al., 2011; Nesbakken et al., 2006; Laukkanen et al., 2010; Van

Damme et al., 2015; Vanantwerpenet al., 2015).

A pesar de que en el presente estudio se obtuvo el biotipo 4 que es considerado

patógeno (Van Damme, 2013), los estudios moleculares utilizados no identificaron

serotipos ni genes vinculados a cepas patógenas. Algunos estudios sugieren que

los subcultivos y el almacenamiento de cepas en diferentes medios de cultivo

ocasionan pérdida de plásmidos (Nesbakken et al., 2006; Vanantwerpen et al.,

2015), pudiendo explicar en cierta medida nuestros resultados. De igual forma la

literatura menciona que en cultivos repetitivos el pYV (plásmido de Virulencia de

Yersinia) se puede comportar de forma inestable. (Fredriksson-Ahomaa, 2017;

Laukkanen et al., 2010; Vanantwerpen et al., 2015; Zadernowska et al., 2013).

Sería recomendable realizar pruebas moleculares minimizando el número de

pasajes en medios de cultivo para corroborar esta hipótesis.

Si las cepas halladas en este estudio son verdaderamente apatógenas, podríamos

asumir que la patogenicidad de Y. enterocolitica en las muestras estudiadas es

limitada. De ser este el caso, la importancia de esta bacteria como patógeno

alimentario sería limitada.

24

La ausencia de datos sobre Y. enterocolitica en Latinoamérica dificulta tener una

idea epidemiológica regional sobre esta bacteria. Estudios futuros se hacen

necesarios para entender la dinámica de este patógeno en alimentos. Un mayor

número de animales analizados, muestreo en diferentes zonas geográficas y un

panel más amplio de pruebas para identificar varios serotipos podrían ser factores

que deben ser considerados.

El cerdo está entre los principales alimentos de consumo del país, por lo que se

requiere establecer procesos de investigación que profundicen los conocimientos

sobre este patógeno alimentario para ayudar a establecer políticas sanitarias

basadas en hechos científicos.

25

CAPITULO VI

6. Conclusiones

En este estudio se obtuvo una prevalencia baja de Y. enterocolitica en tonsilas

y en heces en comparación con estudios previos.

Los aislados de Y. enterocolitica no fueron positivos a la identificación de los

serotipos 0:3 y O:9, por lo que se debería investigar la presencia de otros

serotipos

A pesar de obtener un biotipo patógeno en nuestros aislados, no se

identificaron genes de virulencia, por lo que es probable que Y. enterocolitica

biotipo 4 en las muestras analizadas no sea patógena.

26

5. BIBLIOGRAFÍA

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33

Anexo 1.

ANEXOS Caldo TSB

Buffer TE 1X

2.1 Materiales de Laboratorio para

toma de muestras

Materiales

Frascos estériles

Fundas estériles

Muestra de contenido cecal

Algodón

Lámina de bisturí

Asas plásticas de 1μl para

siembra y estriaciones

Espejo

Lámpara de luz blanca

Reloj análogo

Gradilla

Aguja de inoculación

Reactivos

Agar Yersinia Selectivo (CIN)

Complemento de Agar Yersinia

(CIN)

Caldo PBS

Agar Urea

Agar Kliger

Agar Esculina

Agar Triptona / Indol

Agar Xilosa

Reactivo de Kovacks

Alcohol al 96%

Equipos

Mechero de bunsen o cámara

de seguridad

Estereoscopio

Incubadoras 30 ºC

Micropipeta 100 – 1000 μl

Vortex

34

Anexo 2

2.8 Materiales para determinación

de Genes de Virulencia

Materiales

Asas desechables de 1 μl

Cultivo bacteriano

Guantes desechables

Microtubos de 2ml

Microtubos de 200μl o tubos

para PCR

Gradilla para microtubos de 2ml

Gradilla fría para microtubos de

200μl

Puntas para micropipeta de 10

μl, 100 μl y 1000 μl

Frasco pyrex con tapa

Molde para colocar el gel de

agarosa

Reactivos

TE1X

Agua de grado Molecular

Buffer

Cloruro de magnesio (MgCl2)

Desoxirribonucleótidos

trifosfatados (dNTP)

Primers forward y reverse para

los genes ail, virF, yst.

Enzima ADN polimerasa (Taq)

Templado o molde de ADN

Agarosa

Cyber safe

TBE 1 X o TAE 0,5X

Equipos

Mechero de bunsen o cámara

de seguridad

Termobloque

Microcentrífuga

Micropipeta de 10μl, 100μl y

1000μl

Termociclador

Balanza analítica

Cámara de electroforesis

Transiluminador

Cámara fotográfica

35

Anexo 3

2.9 Materiales para identificación de

serotipos O:3 y O:9

Materiales

Asas desechables de 1 μl

Cultivo bacteriano

Guantes desechables

Microtubos de 2ml

Microtubos de 200μl o tubos

para PCR

Gradilla para microtubos de 2ml

Gradilla fría para microtubos de

200μl

Puntas para micropipeta de 10

μl, 100 μl y 1000 μl

Frasco pyrex con tapa

Molde para colocar el gel de

agarosa

Reactivos

TE1X

Agua de grado Molecular

Buffer

Cloruro de magnesio (MgCl2)

Desoxirribonucleótidos

trifosfatados (dNTP)

Primers forward y reverse para

los genes rfbC y per

Enzima ADN polimerasa (Taq)

Templado o molde de ADN

Agarosa

Cyber safe

TBE 1 X o TAE 0,5X

Equipos

Mechero de bunsen o cámara

de seguridad

Termobloque

Microcentrífuga

Micropipeta de 10μl, 100μl y de

1000μl

Termociclador

Balanza analítica

Cámara de electroforesis

Transiluminador

Cámara fotográfica

36

Anexo 4.

Reactivos y cantidades necesarias para una reacción de PCR para determinar

genes de virulencia

Reactivo C. Final Volumen para una

reacción

Cantidad Unidad Cantidad Unidad

Agua 4,28 μl

Template 1 μl

Buffer 1 X 3 μl

dNTP

Mix

0,2 mM 0,3 μl

MgCl2 2 mM 1,2 μl

ail-a 0,6 μM 0,9 μl

ail-b 0,6 μM 0,9 μl

virF-a 0,6 μM 0,9 μl

virF-b 0,6 μM 0,9 μl

Yst-a 0,5 μM 0,75 μl

Yst-b 0,5 μM 0,75 μl

Taq 0,04 U/μl 0,12 μl

Total 15 μl

Fuente: investigación directa (Harnett 1996) Elaboración: La autora

37

Anexo 5.

Reactivos y cantidades necesarias para una reacción de PCR para determinar

serotipos de Y. enterocolitica.

Reactivo C. Final Volumen para una

reacción

Cantidad Unidad Cantidad Unidad

Agua 6,38 μl

Template 1 μl

Buffer 1 X 3 μl

dNTP

Mix

0,2 mM 0,3 μl

MgCl2 2 mM 1,2 μl

rfbC-a 0,5 μM 0,75 μl

rfbC-b 0,5 μM 0,75 μl

per-a 0,5 μM 0,75 μl

per-b 0,5 μM 0,75 μl

Taq 0,04 U/μl 0,12 μl

Total 15 μl

Fuente: investigación directa (Jacobsen et al., 2005) Elaboración: La autora

38

Anexo 6

Flujograma de Hisopado de Amígdalas

39

Anexo 7

Flujograma de Contenido Cecal

40

Anexo 8

Buscar el órgano de estudio Limpieza con alcohol al 96%

Corte de 3cm de ciego Colocar en frasco estéril

Buscar el órgano de estudio Realizar barrido de órgano en estudio

41

Observación de colonias en agar CIN Colonia sospechosa

Crecimiento de algunas colonias Morfología similar a la buscada

Contaminación de otras colonias Siembra por duplicado

42

Colonias y tamaño específicas Siembra en agar esculina

Siembra en agar Kliger Siembra en xilosa, indol y urea