Exportación de datos a GBIF:

- Servicio de alojamiento de datos de la Unidad de Coordinación

- El modelo Darwin Core y su evolución - Exportar datos desde HERBAR

Silvia LusaUnidad de Coordinación GBIF-ES

http://www.gbif.es lusa@gbif.es

-----------------------------------------------------------Taller de Herbar para usuarios avanzados

28-30 Septiembre 2005

Taller de HERBAR para usuarios avanzados

Servicio de Alojamiento.La Unidad de Coordinación proporciona:

El software necesario (DiGIR) para integrar los datos en la red de GBIF y/o espacio en disco.

Dos opciones de uso:

a./-Instituciones con servidor de base de datos disponible (Oracle, MS-SQLServer, MySQL) y que no quieran/puedan instalar, configurar y mantener un servidor DiGIR

Conexión de nuestro DiGIR a una vista/tabla de su base de datos.

b./-Instituciones sin servidor de base de datos (MS-Access).

Espacio de disco en nuestros servidores para alojar la/s base/s de datos y conexión a nuestro DiGIR.

Esta segunda opción, es la utilizada por la mayoría de los proveedores de datos de este servicio.

• Para poder utilizar esta infraestructura , los proveedores de datos han de estar registrados

• La gestión y control de la base de datos, queda en manos del proveedor de datos.

La/s base/s de datos de cada proveedor tendrá/n entidad por sí misma/s, esto es, sus registros no serán en ningún caso anexados a otros ni serán usados para otro fin que el de responder a las peticiones de las consultas de la red de GBIF.

Servicio de Alojamiento.

Servicio de Alojamiento. Características técnicas del servicio

(caso de uso b.)

• Formato: la Unidad de Coordinación puede alojar archivos de bases de datos tanto en MS-Access (extensión de archivo .mdb) como en MySQL (extensión .frm/.MYD/.MYI).

• Espacio en disco: cada Proveedor de datos podrá disponer de un directorio con un espacio máximo de 250 Mb.

El tamaño de una base de datos depende del número de registros, pero a modo de ejemplo, unos 14.000 registros en MS-Access, ocupan

aproximadamente 8.5 Mb.

• Estándar de datos utilizado: cada colección constará de una única tabla

formada por los campos definidos según las especificaciones de DarwinCore versión 2:

Servicio de Alojamiento. Proceso a llevar a cabo por parte del Proveedor

de Datos

Petición de solicitud de información a la Unidad de Coordinaciónhttp:/www.gbif.es/Servicios.php

Recibo de e-mail con información acerca del servicio (subject: “Información previa”)http://www.gbif.es/Alojamiento/

Alta (aceptación del “Acuerdo de Intercambio de Datos en la Red de GBIF”)

Opción de uso a.(Institución con servidor de base de datos)

Opción de uso b.(Institución sin servidor de base de datos)

Recibo de e-mail con: (subject: “Solicitud datos de configuración”)

- Datos de la cuenta para ftp- Documento con instrucciones de instalación y configuración del programa cliente de ftp- Documento (formulario) a rellenar con datos de configuración necesarios

Envio de e-mail a la Unidad de Coordinación con:- Documento (formulario) completado con los datos de configuración- Confirmación de la transferencia de la base de datos a nuestros servidores

Integración de los datos alojados en el DiGIR de la Unidad de Coordinación en la red de GBIF

- Preparación de tabla/vista DarwinCore2.

- Envío a la Unidad de Coordinación de los datos del servidor necesarios para su conexión.

-Conexión y configuración de DiGIR por parte de la Unidad de Coordinación.

Servicio de Alojamiento.

Servicio de Alojamiento.

Servicio de Alojamiento. Integración de las bases de datos alojadas en la red

GBIF

Darwin Core 2

Darwin Core 2

DateLastModified * InstitutionCode * CollectionCode * CatalogNumber *ScientificName * BasisOfRecord Kingdom Phylum

Class Order Family Genus

Species Subspecies ScientificNameAuthor IdentifiedBy

YearIdentified MonthIdentified DayIdentified TypeStatus

CollectorNumber FieldNumber Collector YearCollected

MonthCollected DayCollected JulianDay TimeOfDay

ContinentOcean Country StateProvince County

Locality Longitude Latitude CoordinatePrecision

BoundingBox MinimumElevation MaximumElevation MinimumDepth

MaximumDepth Sex PreparationType IndividualCount

PreviousCatalogNumber RelationshipType RelatedCatalogItem Notes

* Indica los campos obligatorios. DateLastModified : Fecha y hora de la última modificación del registro según la norma ISO 8601. Va a ser el dato utilizado por el motor de indexación del portal internacional. Cad vez que el portal indexa, se comprueba para cada registro si este dato ha sido modificado, en caso afirmativo lo reindexa de nuevo.