25
1

Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

Embed Size (px)

DESCRIPTION

Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance - Travaux Dirigés de la 3e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - RASON Marie-Ange et RANDRIANARIVELOJOSIA Milijaona

Citation preview

Page 1: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

1

�������������� � ������ ��������������������� �� ����������������� � ������ ��������������������� �� ���

��������� ������������������ ���������������

��������� ������ ������������ ���������� ������ ������������ ��������� �������� ��������� ������������ �������� ��������� ����

��������������� ���������������������������������������������� �������������������������������

����������������������������������������������������������������������������������������������������������

Page 2: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

2

������������������������������������������������������������������

������������������

�� ������

��������������� �� ���������������������� �� ������������������������������� �������������� ��������������

�� ������ �������� �� ������� �� ���

����������������������������� ������������� ����

�� ���� �� ����

Page 3: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

3

�������������!��������������������� ��������������!��������������������� ����������� ����������

������������� ����������������� ����

!! "�#$%&'$%'$���$())(�*+"�#$%&'$%'$���$())(�*+

!! "�#$��,-.�*)++"�#$��,-.�*)++

� ���������� ���������

!! ��� ������/� ����� ���/������/�����0��������������� ������/� ����� ���/������/�����0������������

!! ��� ������������� ��������������� ���������� �����������/�1���� ������������� ��������������� ���������� �����������/�1�

&�����������2�/�������0�������� ����������&�����������2�/�������0�������� ����������

��$�������� ��3��������$�������� ��3������

���������������

���2��� ����4

"�����#

Page 4: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

4

���������� ������� �� ���������� ������� ��

55 6�� ������� ��/����0���������/���7��������������� ��8����� �����6�� ������� ��/����0���������/���7��������������� ��8����� �����������������/�����������2�� �������������/�����������2�� ���������99 :����� ������ ����������;:����� ������ ����������;99 ���������;���������;99 �����<�����/���������� ��0���;�����<�����/���������� ��0���;99 ��!!��7����������;��7����������;99 ,�3 �����������/���������8�/���������7����;,�3 �����������/���������8�/���������7����;

55 ,��������� �������������������������������� �������� ��/����0���,��������� �������������������������������� �������� ��/����0������/��/�1�����0������/��/�1�����0���

Page 5: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

5

�� �������� �� ������ �������� �� ��������������

����������� ����������������� ������#�'=�%�&$��,$-+�()�#�'=�%�&$��,$-+�()�������(�())*��(�())*

$�������������%�&'�&(�)) $�������������%�&'�&(�)) ���������������������������������� ���/�())*>�.*4?@?���/�())*>�.*4?@?!!?+?+A����A���� �����������������������3���������3������������%��������%�������� ())(>�@.4*.?B())(>�@.4*.?B!!.@.@

*������ �������������������*������ ������������������������� &���������=�%����&���������=�%���������������������� �������� *-+->�(.4C(+*-+->�(.4C(+!!(-(-,������=�,������=�����D����/�D����/������� �1�1 *-BC>�C(4�@@+*-BC>�C(4�@@+!!?*?*

* ������������* �������������� ����� � ��� ����� � �

����� �����

�� ���1/��

� ��������E�4

"������#

$������$������ ���������������������/��1�����������/��1���������������� %1������1%1������1*--+>�(+4�B@*--+>�(+4�B@!!-*-*

*��������������*�������������� ������������������ %��3���������� ��D����/���� �1 ())@>�+)4**-!(@

Page 6: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

6

+���������������'����������������������������������+���������������'����������������������������������

Page 7: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

7

+����� ��������!���������������+����� ��������!��������������� !����������!���������������� ��� ��!"�,�������� ���� ��!"�,�������� �

+

�1/�2�������!C�

�&A�/�����������&A�/������������ 3�������������� 3������������ "�,�����������"�,�����������

������

Page 8: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

8

$�������-� �������������������������������$�������-� �������������������������������

��%��/���������������������� ���%��/���������������������� �����������8��8�� �����������������������3��������3���

�� %����������%����������$)./�$)./�����������������������������������3�������?)F�����3�������?)F�

Page 9: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

9

A 3019 3126 3174 3221 3053 3288 2593 2464 3185 2963 3017 3174B 2582 2951 2315 875 1006 870 2472 2446 2484 2570 2772 2608C 1737 1767 1685 102 100 110 1678 1552 1557 1526 1716 1732D 482 415 595 120 106 101 702 651 541 695 762 795E 164 138 192 82 77 85 112 122 119 218 327 276F 96 133 94 90 73 75 66 72 87 110 155 131G 90 108 3040 78 104 3340 105 76 3552 111 122 2943H 103 100 3276 101 114 3045 77 104 3187 113 135 3017

Chloroquine Amodiaquine Mefloquine Quinine

(� ��� �����������������������������(� ��� �����������������������������

���� �������� �� �������� �������� �� �������������� ������������������������������

$������ �������� ����0�����1���������� � �� �����������

2��������������

2�������������

Page 10: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

10

������������������������������������������������������������������

������������������

�� ������

��������������� �� ���������������������� �� ������������������������������� �������������� ��������������

�� ������ �������� �� ������� �� ���

����������������������������� ������������� ����

�� ���� �� ����

Page 11: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

11

��������� ��������� �������� ��������� ������������� ��������� �������� ��������� ����

�$(3 �����4����$(3 �����4���

�$(3+���������5�� �$(3+���������5��

(�(�66�$(�$(

���� �-�"�,������ �-�"�,��������������������

�$(3(2%��$(3(2%�

G ���1/���������E4"������#

Page 12: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

12

+�����4�����!���� ��������� +�����4�����!���� ���������

����/4$$����/4$$HHH����/����������7�HHH����/����������7���

Page 13: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

13

����������������������������������

$�����78$�����78"""""" �,1��������I�J�������=��,1��������I�J�������=�%:%:!!�����3�������3����""$$"" ���� �����������J���� =����� �����������J���� =�%:%:!!� �������� ���������

Page 14: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

14

�$(���+�����������������$(���+���������������� !���� ���� !���� ����

$���4���� �����������0�������������������� 0������8�� ������

+����4���� �����0���/������������� �������

���� ����������������� �0�������/�����<���������/� ���������� ������ 0�������/ ��7�0�������� ����=���/�3�������������K����/����13������������������0����������� 0������/����/�������������������7��������

(http://www.inrp.fr/Acces/biotic/biomol/techgen/html/telechar.htm)

Page 15: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

15

�$(���+�����$(���+����

Page 16: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

16

+�������������������������������������+������������������������������������������������������������� ����������������������������� �����

Page 17: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

17

(�(�66�$(����$(������� ����������$(�������� �$(����$(������� ����������$(��������

��/��7������������������L���� ��/���0�������%�������0����/��7������������������L���� ��/���0�������%�������0��

��!!�%�% ���������������������������� ����������� ���� ����������� ���� /�������������/�������������0�����7�������������������� ��������������0�����7�������������������� ����������������/�������/����� 7��� �������/��7��� �������/��� ���8����0����1����� ���8����0����1����

���������������� ��������/��� ���/���������� ���������������� ��������/��� ���/�����������%�%��

���/4$$HHH����!�1���7�$�,M�$�%$����������$�/����N������0���$��/��$��

���������� ������=�������=�,�����,�����())@>�C.@4�@CB())@>�C.@4�@CB!!@+��/7����@+��/7����� 7��0����� 7��0���� ��������������%���������������%�

Page 18: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

18

���� �-�"�,������ �-�"�,��������������������

������������������������������������������������������������� ��!����� ���������� ���������� ��!����� ���������� ��9�� ��9�� ��8���8�� � ��������� �������� ����<������/��������<������/����

�������� ����� �������� ����� 44

��O�3���������������/������O�3���������������/�������� /����������������3������ /����������������3�����13�����������13����������,��������,������������1������������ ��������1������������ ��������/����������/��7�����������/����������/��7����� ��2/���������2/�������

���/4$$HHH���������/���������7�$��3$/�����������$/�����/���/�/

Page 19: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

19

Page 20: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

20

�$(3(2%���(� �����2��������$(3(2%���(� �����2�������%����%������������ ��������� �

������������������������!������������������ ��!������������������ �� ������� 0�������������� 0������� ��&A�8���&A�8����������������� ���P1���������������������P1������������������

�/�<�������%=����7���������/��7� ������� � �/��������/�<�������%=����7���������/��7� ������� � �/���������:���������:��������� ������ ���� ���������� ����������� ��� ���������������/ ��7�0��������������������������/ ��7�0������������ 0������������� �������� 0������������� �������

� �����������/���������������������/�<�� � �����������/���������������������/�<�� � ����/���<�� � ����/���<�� ��������������/������������������/������������������ !�� �������������� ������!�� �������������� ������ !����������-�!����������-���������������������� ���������������������������������� �������������

������0��������� ��/����������0��������� ��/������������������������������� ���������������������������� ��9�� ��������� �����9�� ��������� ���� ����/������������/������������/������������/��������

Page 21: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

21

*������� �������� ������ ��������*������� �������� ������ ��������������������������������

����/�����0�������������G<����������/�����0�������������G<������ �����������������������������7����/�����������������7����/����������������������������������7� 07� 0

"������ "������

�1��� ��������1��� ������� /7��7������������������?*=�?-=�/7��7������������������?*=�?-=�;/<;/<

%1��������%1�������� /7��7������������������*.=�/7��7������������������*.=�;/<;/<=�*.@=�*.@

'��7���2���'��7���2��� /7��/�����������������@C.=�@C+=�?@)/7��/�����������������@C.=�@C+=�?@)

�//���������4�//���������4

������������������������������������������������������������7���7� ��������������/���/� /� �������������� �����/� �������������� ������� ��/�� ��/���'���O�����������'���O��������

Page 22: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

22

)������������ ��� ��� �����$(3(2%�)������������ ��� ��� �����$(3(2%�

@

%��������� ������ =���������� ���/��7�����������<���/7��7�������7����/�����

*4����0�������������������/��������3�����>�.��;.4��(#�� ������ ���7�������&A�>;6>6?6@4�� �����/�����7���/�������!*)B>�8�-�;@4��������������7����/����/� ��� ��������������

;///�� <A/��

*� ;�������>����?�����@�����.�����* 8�����7�����<�����A�����;/���;;���;>���;?���;@����;.��*

Page 23: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

23

��� ��������"%B�)�.!���"���$�C?! ��� ��������"%B�)�.!���"���$�C?!

�?!����$���"C.! �?!����$���"C.!

;///��

.//��

..;��

<A/���

??A��

%������ ������ 4���������������������������� ���P1�������������������,6�M

,��������������7����������-))/3�������(�7��������?+?/3����C(?/3���,�����/����/���� ���P1����,6!M�����0������/� ���������/����������� ���1/���������� �����G%!*)B���*4����0������������������"��QMR�>�;4�������2$*�>A�����������!*)B�>�>4�������?�7��������'��!*)B�>�?4��(#4�� ������ ���7>�@�-�;/4��2��/��������������� ��7����/����/� ��� �������������>�<A/��4��������� ���/����� ������ � >�..;�����??A��4������������/��������������������

;��������>��������?�������* @��������.�������8�������7�������<���������A������;/������*

Page 24: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

24

��� ���������� �������5 �5 �66)) �.!C"$���,�C?! �.!C"$���,�C?!

�?!C��"$�$,C.! �?!C��"$�$,C.!

%������ ������ 4�/�������������������������� ���P1���������������������!M

,��������������7�������� ��&A����-))/3�������(�7���������C(?/3����?+?/3��,�����/����/���� ���P1������!M����0������/� ����������/�������������������/���������%!*)B��*4����0���������������>;.4�2$*>A�����������!*)B�>�;84�?�7�������'��!*)B�>�;�-�.���� � ���� ���1/� /7��7�����!!*)B>�8'7'<';> ���� � ���� ���1/����2���/7��7����/������!*)B����� ����!*)B>�

;//��

<//��

??A��

..;��

<A/��

* ;������>������?�����@������.������8������7������<�����A���� ;/����;;���;>���;?����;@����;.�����;8���*

Page 25: Detection des mutations au niveau des marqueurs génétiques de la résistance

25

��� ����������� ��������+���+���66)) �.!C$$�,��C?! �.!C$$�,��C?!

�?!C��,�$$C.! �?!C��,�$$C.!

%������ ������ 4�/�������������������������� ���P1���'��7!M�

,��������������7�������� ��&A����B-)/3�������(�7���������CC-/3����??*/3���,�����/����/��� ���P1���'��7!M ����0������/� ����������/��������������������� �������%%!*)B��*4����0���������������>;74����������� �������� ����!*)B>�;�-�;84��2��/���������������������7����/����/� ��� �������������>�<A/��4��������� ���/����� ������ � >�..;�����??A��4�������������/�������������������������������������!*)B�� ��� � �� ���� �

<//�� <A/��

??A��

..;��

*��;���>����?���@���.���8���7���<���A��;/�;;�;>�;?�;@��;.�;8�;7�*

;//��