SIG et surveillance épidémiologique du paludisme en Afrique

Catherine Martin

Mots clés: SIG, cartographie, indices paludométriques, indices démographiques, indices climatologiques, géo-références, endémicité palustre, transmission

Atelier Paludisme – 7ème édition – Institut Pasteur de Madagascar

24/08/2009

EVALUATION

par les FACILITATEURS

Code de classement

Excellente présentation : 5 étoiles colorées sur 5(voir diapositive de titre)

Adressez vos questions ou commentaires à :atelier.paludisme@pasteur.mg

Bonne lecture !

SIG et surveillance épidémiologique du paludisme en Afrique

Catherine Martin

Mots clés: SIG, cartographie, indices paludométriques, indices démographiques, indices climatologiques, géo-références, endémicité palustre, transmission

Atelier Paludisme – 7ème édition – Institut Pasteur de Madagascar

24/08/2009

EVALUATION

par les FACILITATEURS

Introduction des SIG dans la lutte contre le paludisme

Dynamique du paludisme: distribution et intensité de transmission sont trèshétérogènes.

En Afrique, on trouve un large spectre de situations épidémiologiques allant

du paludisme instable épidémique

au paludisme pérenne de haute intensité.

Critère important pour planifier les activités de lutte à tous les niveaux:

- continental

- national

- local.

Introduction des SIG dans la lutte contre le paludisme

Notre compréhension de l’endémicité palustre reste imparfaite en terme de:

- distribution Où?

- déterminants Pourquoi?

- quantification Combien?

- saisonnalité Quand?

Efforts conduits dans la cartographie de l’endémicité palustre etl’établissement des profils du risque du paludisme pour les populations

Introduction des SIG (Systèmes d’Informations Géographiques):programmes de cartographie électronique permettant de visualiser etd’analyser des données spatiales

Cartographie du paludisme: quels outils?

Données paludométriquesprévalence des parasitestaux d’incidence et de mortalitétaux d’inoculation entomologique…GEOREFERENCEES(latitude, longitude)

Données climatiquestempératures mensuelles min/maxprécipitations mensuelles…

Données environnementales par télédétection satelliteet/ou images radar:Indices de croissance des végétauxTempérature au sommet des nuages…

Collecte

Intégration - SIG

Cartographie du paludisme: quels outils?

Données paludométriquesprévalence des parasitestaux d’incidence et de mortalitétaux d’inoculation entomologique…GEOREFERENCEES(latitude, longitude)

Données climatiquestempératures mensuelles min/maxprécipitations mensuelles…

Données environnementales par télédétection satelliteet/ou images radar:Indices de croissance des végétauxTempérature au sommet des nuages…

Collecte

CARTESIntégration - SIG

Cartographier le risque palustre sur le continent africain

Initié en 1996

Financé par:Roll Back MalariaWellcome Trust UKSwiss Tropical Institute…

A partir de données et d’archives collectées au niveau de 10 000 sites de surveillance chaque point représente les résultats d’une étude particulière par sa date, son lieu, ses sources, sa méthode

Combinées à une modélisation de facteurs climatiques, démographiques et administratifs pour créer des cartes paludométriques intégrées

Modélisation prédictive permettant decompléter la collecte de données dansles zones où ces données manquent

Modèle de répartition du paludisme àl’échelle du continent avec unerésolution de 5x5km

Cartes définissant:durée de la saison de transmissionmodélisation de la prévalencerépartition des populations à risque

Cartes générées à l’échelle des continents et des pays

Cartographie au niveau national et du district - Kenya

Omumbo et al., 1998

Résolution limitée par le manque et larépartition hétérogène des données

Variabilité épidémiologique au niveau local

En intégrant des données sur:l’abondance des anophèlesla distribution des températuresla densité des populationsla topographie (altitude)la répartition des champs de riz (télédétection + radar)

Cartes de risque épidémique pour chaque district9/13 sites ont eu des alertes confirméesen accord avec les prédictions graphiques

Définir des zones prioritaires dans un programmed’Aspersion Intra-Domicilaire d’insecticide

Cartographie à l’échelle mondiale des limites de la transmission du paludisme

Hay et al., 2009

Hay et al., 2009

Modélisation de l’incertitude

Sur les indices paludométriques

Sur les indices démographiques

Cartes générées à l’échelle des continents et des pays

Cartographie du paludisme: quelles applications?

Cartes constituent des bases de données utilisables dans le cadre desactivités de lutte à diverses échelles

- par les planificateurs, les chercheurs et les bailleurs de fonds

- définition des stratégies d’intervention les mieux adaptées à une régionou un district (planification plus rationnelle des ressources et desactivités)

- suivi / monitorage des programmes en cours

Modélisation comme outil de veille sanitaire

Lutte contre l’émergence (ou réémergence) de foyers

Outil de DECISION

Cartographie du paludisme: perspectives?

Limites :

- le taux de parasites est une mesure moins directe que le tauxd’inoculation entomologique

- irrégularité de l’échantillonnage / collecte des données non-exhaustive

- résolution

- télédétection: lourd et coûteux

- carte ‘snapshot’ alors que l’épidémiologie est un concept dynamique

- importance de l’échelle d’étude

Projet MAP prometteur car conçu pour permettre des mises à jour

évolution de l’endémicité

inclusion de la dimension temporelle

Applicable et/ou combinable avec le suivi épidémiologique d’autresmaladies à transmission vectorielle vers une lutte plus efficace?

mét

hode

sou

tils

Les logiciels SIG comme outil bureautique

Logiciels de gestion de données épidémiologiques:

DIVA GIS, Map Info, Epi Map, …

Utilisation pour:

analyser et gérer des ressources

représenter un objet ou un phénomène réel et le localiser dans l’espace

produire des cartes afin d’illustrer un rapport, un article, …

La plupart de ces logiciels sont accessibles en ligne et des cartes spécifiques des différents pays/régions/districts peuvent être téléchargées (cartothèque) pour être ensuite « habillées » avec les données et informations collectées

Les logiciels SIG comme outil bureautique

Logiciels conviviaux permettant la visualisation, l’analyse et laprésentation des données épidémiologiques

Destinés aux différents acteurs de la lutte antipaludique sur le terrain(techniciens, personnels de santé, … ) et dans les structures de recherche

Exemple: création de cartes avec DIVA-GIS

Source: http://www.diva-gis.org/

Bibliographie Hay SI, Guerra CA, Gething PW, Patil AP, Tatem AJ, Noor AM, Kabaria CW, Manh BH, Elyazar IR, Brooker S, Smith DL,

Moyeed RA, Snow RW. A world malaria map: Plasmodium falciparum endemicity in 2007. PLoS Med. 2009 Mar24;6(3):e1000048.

Hay SI, Snow RW. The malaria Atlas Project: developing global maps of malaria risk. PLoS Med. 2006 Dec;3(12):e473

Kleinschmidt I, Bagayoko M, Clarke GP, Craig M, Le Sueur D. A spatial statistical approach to malaria mapping. Int JEpidemiol. 2000 Apr;29(2):355-61

Omumbo J, Ouma J, Rapuoda B, Craig MH, le Sueur D, Snow RW. Mapping malaria transmission intensity usinggeographical information systems (GIS): an example from Kenya. Ann Trop Med Parasitol. 1998 Jan;92(1):7-21.

Rakotomanana F, Jeanne I, Duchemin JB, Pietra V, Raharimalala L, Tombo ML, Ariey F. Approche géographique dans lalutte contre le paludisme dans la région des Hautes Terres Centrales à Madagascar. Arch Inst PasteurMadagascar. 2001;67(1-2):27-30

Rakotomanana F, Randremanana RV, Rabarijaona LP, Duchemin JB, Ratovonjato J, Ariey F, Rudant JP, Jeanne I.Determining areas that require indoor insecticide spraying using Multi Criteria Evaluation, a decision-support toolfor malaria vector control programmes in the Central Highlands of Madagascar. Int J Health Geogr. 2007 Jan29;6:2

Vers un Atlas du Risque de la Malaria en Afrique. Premier rapport technique de la collaboration MARA/ARMA. 1999.Centre de coordination MARA/ARMA Durban, Afrique du Sud ©MARA/ARMA (Mapping Malaria Risk in Africa /Atlas du Risque de la Malaria en Afrique) http://www.mara.org.za/

Malaria Atlas Project

Mots clés: SIG, cartographie, indices paludométriques, indices démographiques, indices climatologiques,

géo-références, endémicité palustre, transmission