azevedolab.net - Como Usar o PubMedComo Usar o PubMed Author Walter Filgueira de Azevedo Jr....

Preview:

Citation preview

Resumo

2

O PubMed é uma base de dados (site da

internet que você pode pesquisar por

palavras-chaves) que permite o acesso a

quase todos os artigos científicos das

áreas das ciências da saúde e da vida.

Para acessar o PubMed, basta digitar no

seu navegador

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/, que

você será direcionado para a página de

buscas. Você pode acessar também

digitando http://pubmed.gov/ no seu

navegador. Num texto claro e objetivo

aqui é descrito na forma de um tutorial

como podemos acessar as publicações

de um dado cientista no PubMed, bem

como pesquisar sobre assuntos e buscar

artigos de periódicos científicos

específicos.

O PubMed é uma base de dados (site da internet que você pode pesquisar por

palavras-chaves). Esse site permite o acesso a quase todos os artigos científicos da

área da saúde.

PubMed

3

Para acessar o PubMed, basta digitar no seu navegador

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/, que você será direcionado para a página abaixo.

Você pode acessar também digitando http://pubmed.gov/ no seu navegador.

PubMed-Acesso

4

PubMed-Busca

5

O campo com fundo branco permite a entrada de palavras-chaves, nomes de autores,

nome de revistas científicas entre outras formas de busca. Só temos que ter em mente

que a linguagem da ciência é o inglês, assim devemos usar os termos em inglês para

nossas buscas.

Para ilustrar, vamos fazer uma busca com a palavra-chave covid-19. Basta digitar o

termo covid-19 no campo indicado.

PubMed-Busca

6

Digitemos o termo e pressionamos o botão “Search”.

PubMed-Busca

7

Os resultados são mostrados na forma de uma listagem com todos os artigos que

trazem a palavra-chave “covid-19”. Veja que já temos 1153 artigos científicos

relacionados ao tema (busca realizada no dia 19/03/2020).

PubMed-Resultados da Busca

8

Cada artigo científico encontrado na busca traz título, autores e a revista científica

onde foi publicado o artigo. Veja abaixo.

PubMed-Resultados da Busca

9

TítuloAutores

Revista

Para acessarmos dados mais detalhados do artigo, basta clicarmos no título do artigo.

PubMed-Resultados da Busca

10

TítuloAutores

Revista

Agora as informações estão mais detalhadas, inclusive temos uma indicação de

artigos similares, que nos permite acessar as informações de outros artigos sobre os

assunto.

PubMed-Resultados da Busca

11

Título

Autores

Revista

Outro ponto a destacar, é que temos como acessar o texto integral do artigo, clicando

no link “Full Text”. Destaco que nem todos artigos são gratuitos como esse.

PubMed-Resultados da Busca

12

Título

Autores

Revista

PubMed-Resultados da Busca

13

Título

Autores

Revista

As revistas científicas sobrevivem com assinatura, venda do acesso aos artigos, ou

cobrando dos pesquisadores para publicação dos seus artigos. Assim, para as revistas

que cobram para acessar seus artigos, teremos informações sobre o artigo no

PubMed, mas não teremos o PDF com o texto completo do artigo.

PubMed-Resultados da Busca

14

Título

Autores

Revista

Agora não precisa se preocupar e começar a assinar todas as revistas científicas que

você tem interesse. Há um órgão do governo, chamado Coordenação de

Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (Capes) que paga as assinaturas de

um grande número de revistas científicas, inclusive na área da saúde.

PubMed-Resultados da Busca

15

Título

Autores

Revista

Todas as universidades brasileiras que fazem pesquisa científica podem acessar as

revistas científicas que a Capes assina. A PUCRS é uma universidade voltada para

pesquisa e seus estudantes têm acesso a essas revistas assinadas pela Capes.

PubMed-Resultados da Busca

16

Título

Autores

Revista

Para visualizar a lista de revistas científicas que são assinadas pela Capes, você pode

acessar o portal da capes: http://www.periodicos.capes.gov.br/

Veja, o conteúdo assinado está disponível para os acessos com IP identificado das

universidades participantes.

PubMed-Busca por Autor

17

Título

Autores

Revista

Fizemos uma pesquisa por assunto. Faremos agora uma pesquisa por autor. Vamos

supor que queremos encontrar todos os artigos de autoria do Christian G Mayer, que é

o segundo autor do artigo abaixo. Podemos obter a listagem de artigos clicando

diretamente no nome do autor.

18

Abaixo temos o resultado da busca. Foram encontrados 192 artigos do pesquisador

Christian G Mayer.

PubMed-Busca por Autor

19

Outra forma de acessarmos os artigos de um dado pesquisador, é digitando seu nome

diretamente no mecanismo de busca. A única diferença é que digitamos o sobrenome

e a abreviatura dos primeiros nomes, como indicado abaixo. Para buscarmos os

artigos de autoria e não sobre o autor colocamos [Author], como indicado abaixo.

PubMed-Busca por Autor

20

O resultado da busca está indicado abaixo. Veja que obtivemos os mesmos 192

artigos. Não necessariamente na mesma ordem mostrada na listagem anterior.

PubMed-Busca por Autor

21

Outro aspecto interessante de destacarmos, é o gráfico mostrado à esquerda. O

gráfico indica o número de artigos publicados em cada ano pelo autor.

PubMed-Busca por Autor

22

Vimos a busca por um autor. Podemos pesquisar dois ou mais autores. Por exemplo,

podemos buscar os artigos que Thirumalaisamy P Velavan e Christian G Meyer

publicaram juntos.

PubMed-Busca por Autores

23

No mecanismo de busca digitamos: Velavan TP and Meyer CG [Author], como

indicado abaixo. Depois clicamos em “Search”. O “and’ garante a procura pelos artigos

dos dois.

PubMed-Busca por Autores

24

O resultado é mostrado abaixo. Veja que os dois autores têm 35 artigos em conjunto.

PubMed-Busca por Autores

25

Podemos pesquisar os artigos publicados por uma dada revista científica, para isto

digitamos o nome da revista seguido do termo [journal]. Como exemplo vamos

considerar a busca dos artigos da revista Current Medicinal Chemistry. Digitamos:

"current medicinal chemistry" [journal]. Depois clicamos “Search”.

PubMed-Busca por Revista

26

Os resultados são mostrados abaixo. Temos 5874 artigos da revista Current Medicinal

Chemistry.

Busca realizada em 19/03/2020.

PubMed-Busca por Revista

27

Podemos fazer a busca usando a abreviatura da revista, só temos que ter cuidado

para usar a abreviatura certa.

Digitamos: "curr med chem" [journal]. Depois clicamos “Search”.

PubMed-Busca por Revista

28

Obtivemos os mesmos 5874 artigos publicados na Current Medicinal Chemistry.

PubMed-Busca por Revista

29

Podemos usar o PubMed para buscarmos artigos de um dado assunto, publicado

numa determinada revista. Por exemplo, vamos considerar todos os artigos publicados

na Current Medicinal Chemistry sobre câncer. Digitamos no campo de busca: cancer

and “curr med chem” [journal]. Depois clicamos no “Search”.

PubMed-Busca por Assunto na Revista

30

O resultado da busca está mostrado abaixo. Achamos 1871 artigos sobre câncer na

revista Current Medicinal Chemistry.

PubMed-Busca por Assunto na Revista

31

De forma análoga, podemos pesquisar os artigos de um dado pesquisador em uma

revista. Digitamos: de azevedo wf [author] and "curr med chem" [journal]. Depois

clicamos “Search”.

PubMed-Busca por Autores na Revista

32

Foram encontrados 8 artigos deste autor na revista Current Medicinal Chemistry.

PubMed-Busca por Autores na Revista

33

O PubMed é a principal base de dados de artigos científicos na área da saúde. Seu

uso é fácil e intuitivo, só temos que ter em mente de usar as palavras-chaves em

inglês e ter cuidado na digitação dos termos técnicos. Na sua carreira acadêmica você

irá constantemente usar o PubMed para suas buscas.

PubMed-Considerações Finais

34

1) Use o PubMed e pesquise

os artigos de três

pesquisadores que você

admira.

2) Entre os pesquisadores

que você procurou no

PubMed, qual tem o maior

número de publicações?

Author

Prof. Azevedo is Frontiers Section Editor (Bioinformatics and Biophysics) of the Current Drug Targets,section editor (Bioinformatics in Drug Design and Discovery) of the Current Medicinal Chemistry, sectioneditor (Combinatorial/Medicinal Chemistry) for the Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening,member of the editorial board of Current Bioinformatics, and editor of Docking Screens for Drug Discovery(Methods of Molecular Biology)(Springer Nature). He is also member of the editorial board of PeerJ, PeerJPhysical Chemistry, Organic & Medicinal Chemistry International Journal, and section editor in chief(Bioinformatics) of the Bioengineering International. He graduated in Physics (BSc in Physics) from theUniversity of São Paulo (USP) in 1990. He completed a Master Degree in Applied Physics also from theUSP (1992), working under the supervision of Prof. Yvonne P. Mascarenhas, the founder of crystallographyin Brazil. His dissertation was about X-ray crystallography applied to organometallics compounds (DeAzevedo Jr. et al., 1995). During his PhD, he worked under the supervision of Prof. Sung-Hou Kim(University of California, Berkeley), on a split Ph.D. program with a fellowship from Brazilian ResearchCouncil (CNPq)(1993-1996). His PhD was about the crystallographic structure of CDK2 (De Azevedo Jr. etal., 1996). His current position is coordinator of the Structural Biochemistry Laboratory at Pontifical CatholicUniversity of Rio Grande do Sul (PUCRS). His research interests are interdisciplinary with two majoremphases: molecular simulations and protein-ligand interactions. He published over 190 scientific papersabout protein structures and computer models to assess intermolecular interactions involving biomoleculesand potential ligands (H-index: 37, RG Index > 41.0). These publications have over 4900 citations in theWeb of Science (Publons h-index: 37), more than 5600 citations in the Scopus (h-index: 41), and over 7100citations in the Google Scholar (h-index: 44).

35

37

Referências

Dennis D. How to Read Scientific Papers Quickly & Efficiently. Disponível em:

<https://medium.com/@drewdennis/how-to-read-scientific-papers-quickly-efficiently-e7030c4018fa>. Acessado

em 06 de junho de 2020.

Gasparyan AY, Yessirkepov M, Voronov AA, Koroleva AM, Kitas GD. Comprehensive Approach to Open Access

Publishing: Platforms and Tools. J Korean Med Sci.

2019;34(27):e184.

SCI® Journal Citation Reports®: a bibliometric analysis of science journals in the ISI® database. Philadelphia:

Institute for Scientific Information, Inc.®, 1993.

Swiontkowski M. Publons: The Next Step in Reviewer Recognition. J Bone Joint Surg Am. 2019;101(13):1137.

Última atualização em 06 de junho de 2020

Recommended