View
71
Download
0
Category
Preview:
DESCRIPTION
taksonomi tumbuhan
Citation preview
ANALISIS KEKERABATAN
TUJUAN Mengetahui jauh-dekatnya hubungan kekerabatan antara takson-takson (OTU=Operational Taxonomy Unit) yang diuji
PENDEKATANFENETIK - Berdasarkan derajat kesamaan dari ciri-ciri yang dipilih- Tanpa memperhatikan faktor evolusi - Hasilnya dalam bentuk Fenogram/Dendrogram
PENDEKATAN (lanjutan)Phylogenetik - Berdasarkan kesamaan ciri moyangnya- Memperhatikan faktor evolusi- Hasilnya Cladogram
Prinsip Kerja Analisis FenetikMenentukan Operational Taxonomy Unit (OUT)Menentukan ciri dan sifat ciri,lalu ditentukan kode numerik (choding characters)Menghitung nilai koefisien kesamaan, setiap OUT yang diujiMembuat Dendrogram=pohon kekerabatan
Penghitungan Nilai KoefisienNilai Koefisien KesamaanNilai koefisien Ketidaksamaan
MENUNJUKAN JARAK KEKERABATAN
MetodeJaccardSimple Matching Coeficient (SMC) Besarnya nilai perbandingan antara jumlah total ciri berkode sama pada dua OTU dibagi dengan jumlah total ciriDengan Rumus : Sij = a + d pDimana Sij= Nilai Koefisien kesamaan antara OTUi dan OTUj, a dan d adalah jumlah ciri berkode sama, p adalah jumlah total ciri
Contoh
Nilai Koefisien kesamaanOTU A & B = 3/5=0,6 A & C = 4/5=0,8 A & D = 2/5=0,4 B & C = 2/5=0,4 B & D = 2/5=0,4 C & D = 1/5= 0,2 Nilai Koefisien disusun ke dalam matriks
Matriks Nilai kesamaan
Clustering MethodsSingle Linkage Clustering Nilai koefisien kesamaan paling besar Complete Linkage Clustering Nilai koefisien kesamaan paling kecilAverage linkage Clustering rata-rata nilai koefisien kesamaan
Contoh Dendrogram
Recommended