genplaza.com.trgenplaza.com.tr/wp-content/uploads/2016/09/SYNGENE_GBOX... · 2016-09-08 · KULLANICILARIN&DİKKATİNE!! Bukılavuzunhazırlanmasında!tüm!olasılıklar!göz!önünde!bulundurulduğundan,!Synoptics!Limited

G:BOX Kullanım Kılavuzu

Sayı 01 Ağu 2014

KULLANICILARIN DİKKATİNE

Bu kılavuzun hazırlanmasında tüm olasılıklar göz önünde bulundurulduğundan, Synoptics Limited bulunabilecek herhangi bir yanlışlıktan ötürü sorumluluk kabul etmez.

Synoptics Limited hem bu yayında hem de tanıtılan üründe haber vermeden değişiklik yapma hakkını saklı tutar.

Bu yayının hiçbir kısmı çoğaltılamaz, bir sistemde saklanamaz ya da telif hakkı sahibinin izni olmadan elektronik, mekanik, fotokopi, kayıt ya da başka türlü yollarla aktarılamaz.

Synoptics Limited’e bağlı Syngene tarafından yayımlanmıştır.

G:BOX Kullanım Kılavuzu Güvenlik -‐ 1

GÜVENLİK TALİMATLARI

Güvenlik Uygulamaları

Bu belge G:BOX Sistemiyle çalışırken alınması gereken önlemleri ve genel güvenlik uygulamalarını tanıtmaktadır.

Bu öneriler destek olması amacıyla yazılmıştır, kullanıcının ülkesindeki güvenlik kurallarının yerine geçmemektedir. Burada verilen bilgiler uyulması gereken güvenlik prosedürlerinin tamamını kapsamamaktadır. Güvenli bir laboratuvar ortamının sağlanmasının kullanıcı ve kullanıcının bağlı olduğu organizasyonun sorumluluğu olduğu unutulmamalıdır.

Ürünle çalışmaya başlamadan önce G:BOX Sistem ile birlikte verilen bütün belgeleri dikkate alınız. Bu belgede ve diğer belgelerde verilen güvenlik bilgilerini dikkatlice okuyunuz. Ürünü kurarken, kullanırken ya da bakımını yaparken, belirtilen talimatlara uyunuz.

Uyarı Bildirimleri

Bu kılavuzdaki uyarılar bir bilginin altını çizmek için ya da kişisel yaralanmaların ve diğer insanların yaralanmalarının önüne geçmek için mutlaka uyulması gereken talimatları belirtmek içindir.

UYARILAR aşağıdaki şekillerde görülür:

UYARI

Temizlemeden önce ana voltajı kapatınız ve ana kabloyu sökünüz.

UYARI

Ürünün tüm kullanıcılarının aşağıda belirtilen önlemleri okuyup anladığından emin olunuz.

UYARI

Ürünün yanına ya da üzerine önlemlerin bir kopyasını asmanız önerilmektedir.

Önlemler

G:BOX sistemini kullanırken aşağıdaki önlemler alınmalıdır:

• G:BOX’ın kurulacağı alanda belirtilen voltajın olduğundan emin olunuz.

• Ürünü kapatmadan ve ana kabloyu sökmeden, G:BOX’ın yan ya da arka panellerini açmayınız.

Güvenlik -‐ 2 G:BOX Kullanım Kılavuzu

Genel Kullanım Koşulları

G:BOX Sistemleri Uluslararası Elektroteknik Komisyonu (IEC) tarafından belirlenen güvenlik gereksinimleri dikkate alınarak tasarlanmış ve test edilmiştir. G:BOX sistemleri, IEC sınıf 1’e (topraklı) uygun olan IEC61010-‐1 (Ölçme, kontrol ve laboratuvar kullanımı için elektronik aletlerin güvenlik gereksinimleri) uymaktadır. Bu nedenle AB direktifi 73/23 / EEC gereksinimlerini karşılamaktadır.

Eğer mümkünse cihaz çalışırken ve açıkken herhangi bir ayarlama, tamirat ya da bakım yapmaktan kaçınınız. Buna rağmen, ürün çalışırken bunların yapılması gerekiyorsa, olabilecek tehlikelere karşı bilinçli bir kişinin işlemleri yapması gerekmektedir.

G:BOX kullanımının tehlikeli olduğu durumların ortaya çıkması durumunda, ürünü çalıştırmayınız. G:BOX kullanımı şu durumlarda tehlike oluşturabilir:

• Gözle görülen bir hasar varsa

• Yapılmak istenilen ölçümü yapamıyorsa

• Taşıma sırasında herhangi bir sorun olduysa

• Olumsuz koşullarda uzun süre saklandıysa

Ortam Koşulları

G:BOX Sistemleri yalnızca aşağıda belirtilen koşullarda kullanılmalıdır:

• İç mekanlarda

• Rakımı 2000 metrenin altında olan yelerde

• Ortam sıcaklığının 5°C ile 40°C arasında olduğu yerlerde

• 31°C’ye kadarki sıcaklıklar için bağıl nem oranı %80’in altında olan ve 40°C’de bağıl nem oranı %50 olan yerler

• Belirtilen voltaj değerinin %10’unu geçmeyecek şekilde elektrik dalgalanmalarının olduğu yerler

UYARI

Bu cihazla birlikte verilen koruma, bu parametrelere uymayan ortam koşulları nedeniyle bozulabilir.


Elektrik Güvenliği

G:BOX Sistemleri kullanıcıyı olası elektrik tehlikelerine karşı koruyacak şekilde tasarlanmıştır. Bu kısımda tavsiye edilen bazı elektrik güvenlik uygulamaları anlatılacaktır.

UYARI

Cihazın içinde bazı kısımlarda ölümcül voltaj bulunmaktadır.

Cihaz elektriğe bağlıyken, cihazın kapaklarını sökmek parçalara zarar verebilir.

Güç düğmesi kapalıyken bile, yüksek voltaj hala devam ediyor olabilir. Ürün tüm voltaj kaynaklarından ayrıldığı halde, cihaz içindeki kondansatörler hala yüklü olabilir.

G:BOX uygun bir elektriksel destekle bağlanmalıdır. Bu destek düzgün yüklenmiş koruyucu iletkene sahip olmalı ve cihazla bağlantısı yapılmadan önce yetkili bir elektrikçi tarafından kontrol edilmelidir.

UYARI

G:BOX’ın içindeki ya da dışındaki koruyucu iletkenin kesilmesi ya da terminaller bağlantısının kesilmesi, cihazı tehlikeli yapmaktadır.

Koruyucu iletkenin bilerek kesilmesi yasaktır.

UYARI

Cihaz üzerindeki ana prizin engellenmemiş olduğundan emin olunuz, örneğin ana kablonun rahatça çıkarılabilmesi için boşluk bırakınız.

UYARI

Ana güç kablosunun yenilenmesi gerektiğinde, yedek kablonun kullanım amacı için uygun olduğundan emin olunuz.

G:BOX ile çalışırken:

• Cihazı koruyucu iletken bağlantısı olan bir prize takınız.

• Herhangi bir parçası ya da kapağı çıkarılmış cihazı çalıştırmayınız.

• G:BOX Sistem belgelerinde belirtildiği şeklin dışında herhangi bir değişiklik yapmaktan kaçınınız.

• Herhangi bir ekleme, değiştirme, bakım ya da tamir işlemi için cihazı açmadan önce cihazın elektrikle olan bağlantısını kesiniz. Açılmış olan cihazda daha ileri düzeyde bir ekleme, bakım ya da tamir işleminin yalnızca tedarikçinin servis mühendisi tarafından yapılması gerekmektedir.

• Cihazın elektriksel açıdan kullanılmasının uygun olmaması durumunda, cihazı çalıştırmayınız ve izinsiz kullanıma karşı emniyete alınız. Cihazın emniyet güvenliği şu durumlarda bozulmaktadır:


• Gözle görülür hasar varsa

• Olumsuz koşullarda uzun süre saklandıysa

• Taşıma sırasında herhangi bir sorun olduysa

Sigorta Değiştirme

Kullanıcının değiştirebileceği iki sigorta vardır:

• Bunlar cihazın arka panelinde bulunan ana prizde bulunur ve sadece ana güç kablosunun çıkarılması sonucu ulaşılabilir.

Sigortaları değiştirmek için:

UYARI

Cihazı kapatınız ve ana güç kablosunu elektrik desteğinden çıkarınız.

• Sigorta tutacağını yavaşça çıkarınız.

• Aynı özelliklere sahip yeni sigortaları takınız. Tüm ülkeler için cihazdaki sigorta şu özellikte olmalıdır: 20 mm x 5 mm IEC127 T 6.3 A H 250V.

• Sigorta tutacağını takınız.

Not: GelVue Transilüminatör gibi aksesuarların kendi sigortaları olabilir.

Not: Sigortaları değiştirdikten sonra cihaz düzgün çalışmıyorsa ya da sigortalar mütemadiyen atıyorsa, tedarikçiyle iletişime geçiniz.

Elektrik Koruma

• Yalıtım: Dış devreler için Class I değeri. Yalnızca IEC 61010-‐1, IEC 60950 ve buna eşdeğer standartlarda belirtilen gereksinimleri karşılayan ekipmanı kullanınız.

• Yükleme Kategorisi: Cihazlar şebeke kaynağı üzerindeki geçici aşırı gerilimlere dayanabilmektedir. Geçici aşırı gerilimlerin normal seviyesi IEC 60364-‐4-‐443 kategori II’dir.

• Kirlenme Derecesi 2: Genelde yalnızca iletken olmayan kirlilik oluşmaktadır; fakat bazen yoğunlaşmadan kaynaklanan geçici iletkenlik olabilmektedir.

EMC Uygunluğu

EC Yönergesi

G:BOX sistemi 89/336/EEC ve 93/68/EEC’de belirtilen EC yönergesi gereksinimleri karşılayacak şekilde tasarlanmış ve test edilmiştir. Cihaz EMC standartı olan EN61326 (Ölçüm, Kontrol ve Laboratuvar Kullanımı için elektrik EMC standartı) ve EN55011 (ISM) sınıf A (rf emisyonları) ile uyumludur.


FCC Kuralları ve Düzenlemeleri

G:BOX özellikle endüstride, ticarette ve medikal testlerde kullanılan dijital bir araçtır. FCC Kural ve Düzenlemelerinin 15. Kısmında belirtilen teknik standartlardan 15.103 (c ) kısmına dayanarak muaf tutulmuştur.

UV Güvenliği

G:BOX epi orta dalga UV tüpleri kullanmaktadır. Çekmece açıldığında görüntü yakalama yazılımı otomatik olarak UV ışığını kapatacaktır.

Uyarı Etiketleri

Cihaza bağlı olan uyarı etiketleri belirli tehlikelere karşı dikkat çekmektedir. Olası tehlikeler ve bu tehlikelere karşı alınması gereken önlemler hakkıknda daha detaylı bilgi için bu kılavuza ya da cihazla birlikte verilen diğer belgelere başvurunuz.

UYARI

Olası kişisel yaralanmaların ve cihaza zarar verilmesinin önüne geçmek için, sistemdeki tüm bileşenleri KAPATINIZ ve yeni bir elektrik bağlantısı kurarken ya da herhangi bir değişiklik yaparken ana güç kablosunu çıkarınız.


Bu sayfa boş bırakılmıştır.


İçindekiler

G:BOX’ı Kutusundan Çıkarma 1 Paketten Çıkarma ........................................................................................................ 1

Görsel Kontrol ….............................................................................................................. 1

Ana Kutuyu Açma …....................................................................................................... 1

GENEL BAKIŞ 4 G:BOX’a Genel Bir Bakış ................................................................................................ 4

GBOX Serisi ................................................................................................................... 5

GeneSys Yazılımı ........................................................................................................... 7

YAZILIM KURULUMU 10 Minimum Sistem Gereksinimleri ................................................................................. 10

Yazılım Kurulumu …….................................................................................................. 10

Kurulum Programını Çalıştırma ..................................................................................... 10

Ürün Donanım Bilgisini Seçme ...................................................................................... 11

Hedef Yerdeki Kurulum Klasörünü Seçme .................................................................... 11

Start Menu Klasörünü Seçme ....................................................................................... 12

Aygıt Sürücüsü Yükleme Sihirbazını Kullanarak Cihaz Sürücülerini Kurma ................... 12

KULLANMA 15 Kullanıcı Kontrolleri ................................................................................................... 15

Arka Panel .................................................................................................................... 15

Dokunmatik Ekran Bilgisayar ....................................................................................... 15

Bağlı Bilgisayar .............................................................................................................. 15

Cihaz Kurulumu -‐ Standart Karanlık Oda ..................................................................... 15

Cihaz Kurulumu -‐ Stretch Karanlık Oda ....................................................................... 16

Kullanıcının Monte Edebileceği Aksesuarlar ................................................................ 18

Işıklar .......................................................................................................................... 18

Filtreler ....................................................................................................................... 20 Cihazı Açma ................................................................................................................ 21

Donanım Detaylarını Girme ........................................................................................ 27 Kişisel Tercihleri Girme ............................................................................................... 29 Temel Ekran Görüntüleme Boyunu Ayarlama ............................................................. 31

Tavsiye Edilen Işık / Boya / Aksesuar ve Diğer Uygulama Tabloları .............................. 33

İçindekiler -‐ 1


Test Örneklerini Yükleme ....................................................................................... 33

Siyah Yansıtmaz Ekran ................................................................................................ 33

Ultra-‐ince Mavi LED Transilüminatör ……. .................................................................. 34

Beyaz Işık Pedi ……………………....................................................................................... 34

Kenar Işık Ünitesi ........................................................................................................ 34

Otomatik Görüntü Yakalama Modu ............................................................................ 35

Standart Görünümü Kullanarak Otomatik Görüntü Yakalama ................................... 35

Standart Görünümü Kullanarak Manuel Görüntü Yakalama ..................................... 37

Klasik Görünümü Kullanarak Otomatik Görüntü Yakalama ........................................ 37

Otomatik Görüntü Yakalama Temel İş Akışı ............................................................... 38

Otomatik Görüntü Yakalama -‐ Adım 1 Örnek Seçimi .................................................. 38

Otomatik Görüntü Yakalama -‐ Adım 2 Boya Seçimi ................................................... 41

Otomatik Görüntü Yakalama -‐ Adım 3 Protokol Seçimi ............................................. 42

Otomatik Görüntü Yakalama -‐ Adım 4 Örnek Konumlandırma ................................ 44

Otomatik Görüntü Yakalama -‐ Görüntüyü Yakalama ................................................ 51

Otomatik Görüntü Yakalama -‐ Yakalamadan Sonraki Görüntü Eylemleri ................. 53

Otomatik Görüntü Yakalama -‐ Blot / Chemi ............................................................... 53

Manuel Görüntü Yakalama Modu ................................................................................ 59

Manuel Görüntü Yakalama – Başlangıç ..................................................................... 59

Manuel Görüntü Yakalama – Tek Görüntü ................................................................. 61

Manuel Görüntü Yakalama -‐ Seriler ........................................................................... 70

Manuel Görüntü Yakalama -‐ Katkı Serileri ................................................................. 76

Manuel Görüntü Yakalama – Çoklu Görüntü .............................................................. 80

Manuel Görüntü Yakalama -‐ Yakalamadan Sonraki Görüntü Eylemleri .................... 86

YAPILANDIRMA -‐ KAYDETME, AÇMA ve DÜZENLEME 87 Giriş ............................................................................................................................ 87

Yapılandırma Yapma ve Kaydetme .............................................................................. 87

Standart Görünüm Ana Ekranından ............................................................................ 87

Otomatik Görüntü Yakalama Modunda ....................................................................... 89

Manuel Görüntü Yakalama Modunda .......................................................................... 91

Yapılandırmaları Kullanma .......................................................................................... 92

Yapılandırmayı Açma .................................................................................................... 93

Yapılandırmayı Silme .................................................................................................... 93

Kaydedilmiş Yapılandırmayı Düzenleme ...................................................................... 94



GÖRÜNTÜ FONKSİYONLARI 95

Görüntüleri Yükleme Ekranı ....................................................................................... 95

Görüntüleri Yükleme Ekranındaki Görüntü Eylemleri ................................................ 97

Görüntüleri İnceleme Ekranı ......................................................................................... 97

Görüntüleri İnceleme Ekranı – Tek Görüntüler ........................................................... 97

Görüntüleri İnceleme Ekranı – Çoklu Görüntüler ........................................................ 98

Görüntüleri İnceleme Ekranı –Görüntü Sergileme Seçenekleri ................................... 98

Görüntüleri İnceleme Ekranı – Tek Görüntüleri Yeni Bir Çoklu Görüntüde

Birleştirme ……………………………………………………………………………………………………………. 102

Görüntü Düzenleme Ekranı …........................................................................................ 104

Görüntü Düzenleme Ekranı – Görüntü Düzenleme Ana Seçenekleri .……………………..……….. 104

Görüntü Düzenleme Ekranı -‐ Genel Seçenekler................................................................... 105

Görüntü Düzenleme Ekranı -‐ Annote Seçeneği .................................................................... 107

Görüntü Düzenleme Ekranı -‐ Arttırma Seçeneği ................................................................. 110

Görüntü Düzenleme Ekranı -‐ Genel / Açıklama / Arttırma Seçeneklerinin

Ortak Kontrolleri ………………………………………………………………………………………………................ 113

Görüntü Düzenleme Ekranı -‐ 3D Görünüm Seçeneği .......................................................... 115

Görüntü Düzenleme Ekranı – Tüm Seçeneklerin Ortak Kontrolleri ..................................... 117

Ortak Ekran İşlevleri ve Gereçler ............................................................................... 119

Görüntüleri Kaydetmek .............................................................................................. 119

Çıktı Alma .................................................................................................................... 125

KULLANICI BAKIMI 133 G:BOX’a Bakma ......................................................................................................... 133

G:BOX’ı Temizleme .......................................................................................................... 133

Sygene ile İletişime Geçme ............................................................................................ 133

G:BOX Sorun Giderme ................................................................................................... 135

ORTADAN KALDIRMA 136 G:BOX’ı Ortadan Kaldırırken .................................................................................. 136

Atık Elektrik ve Elektronik Araç Gereçler (WEEE) Yönergesi .................................... 136

G:BOX Ürünleri İçin WEEE Talimatları ......................................................………… ..… 136 İçindekiler -‐ 3


Bu sayfa boş bırakılmıştır.



G:BOX’I KUTUSUNDAN ÇIKARMA

Paketten Çıkarma

Görsel Kontrol

G:BOX’ın teslim edilmesinin ardından:

• Kutu açılırken kartonların içeriklerini paketin üzerindeki listeden kontrol ediniz.

• Listede yer alan her bir maddenin hasarlı olup olmadığını kontrol ediniz ve hasarı belgeleyiniz.

• Eğer herhangi bir madde kayıpsa ya da hasarlıysa, derhal distribütörünüzle iletişime geçiniz.

Ana Kutuyu Açma

G:BOX kayışlarla tutturulmuş büyük bir kartonla paketlenmiştir. Bazı ürünler sadece karton olarak gönderilirken, bazıları tahta bir palete tutturulmuş kartonla gönderilmektedir. Aksesuarlar bir ya da daha fazla kartonla ayrı olarak gönderilmektedir.

Tipik bir G:BOX ürününün kutusunu açmak için:

UYARI

G:BOX ürünlerinin güvenle taşınabilmesi için iki kişi gerekmektedir. G:BOX ürünlerinin bütün ağırlığı yaklaşık olarak 37 kg (Standart modellerde) ya da 45 kg’dır (Esnek modellerde).

STANDART G:BOX’I KUTUSUNDAN ÇIKARMA ESNEK G:BOX’I KUTUSUNDAN ÇIKARMA

G:BOX’ın orijinal paketi

G:BOX Chemi’nin orijinal paketi

Kayışları ve bandı çıkarınız.

Kayışları çıkarınız ve kartonu açınız.

1

2 G:BOX Kullanım Kılavuzu

Kartonu açınız.

Kartonu dikkatlice çıkarınız.

Kartonu çıkarınız ve G:BOX’I yavaşça kaldırınız.

G:BOX Chemi’nin etrafındaki köpüğü çıkarınız.

Kamerayı takınız, transilüminatörü yerine yerleştiriniz ve kamera kapağını koyunuz.

G:BOX Chemi’yi yavaşça kaldırınız. Kamerayı takınız, transilüminatörü yerine yerleştiriniz ve

kamera kapağını koyunuz.

G:BOX kullanıma hazırdır.

G:BOX Chemi kullanıma hazırdır.


5. Aksesuarları dikkatlice kutudan çıkarınız.

TİPİK AKSESUARLAR

Ana güç kablosu -‐ kullanılacak ülkeye uygundur Karanlık Oda ile kamera arasındaki güç kablosu (9-‐yönlü D-‐tipi jack) Karanlık Oda ile lens kablosuDarkroom to lens lead (15-‐yönlü D-‐tipi dişi ile 15-‐yönlü D-‐tipi erkek) Kamera ile PC kablosu (USB Mini-‐B ile USB Tip A) Karanlık Oda ile PC kablosu; sıralı kablo (9-‐yönlü D-‐tipi erkek ile 9-‐yönlü D-‐tipi dişi) ile birlikte serial/USB dönüştürücüsü (9-‐yönlü D-‐tipi erkek ile USB Tip A) Emisyon Filtreleri LED Modülleri (Çiftler halinde) Transilüminatör Ultraparlak LED mavi ışık transilüminatörü Kenar ışık ünitesi Görünür ışık dönüştürme ekranı Siyah yansıtmaz ekran Beyaz ışık pedi


GENEL BAKIŞ

G:BOX’a Genel Bir Bakış

G:BOX ürünleri yüksek çözünürlüklü, , çoklu uygulamalı görüntü analiz sistemleridir. G:BOX kemilüminesans, floresan blot ve jelleri ve hatta 2D jelleri kapsayan çok geniş çapta görüntüleme uygulamaları için kullanılabilir.

Temel G:BOX ürünleri iki bileşen içermektedir:

Karanlık Oda – Bu görüntülenecek örneğin olduğu yer için tamamen siyah bir ortam hazırlar. Örnekler ekran üzerinde, transilüminatör ya da beyaz ışık pediyle direkt Karanlık Odaya konulabilir.

G:BOX’ın daha uygun modellerinde standart ölçülerde bir Karanlık Oda kullanılır. İdeal modellerde GeneSys yazılımı tarafından kontrol edilen daha gelişmiş bir Karanlık Oda vardır.

Görüntüleme Sistemi -‐ Örnekler özelleşmiş ışık kaynak ya da kaynaklarıyla direkt olarak ya da özel filtreler tarafından aydınlatılır. 6 çeşit ışık kaynağı bulunmaktadır:

• Karanlık Odanın üst kısımlarına yerleştirilmiş bilinen dalga boylarında LED ışıklar (kırmızı, yeşil, mavi ve IR). Bunlar örneği üstten aydınlatmaktadır. Ayrıca bunlar modüler ünitelerdir, kullanıcı tarafından değiştirilebilmektedir.

• Ürünün her iki tarafında LED ışık modüllerinin üzerinde bilinen dalga boylarında UV lambaları (254-‐nm, 302-‐nm ve 365-‐nm). Bunlar örneği üstten aydınlatmaktadır.

• Transilüminatörler üzerindeki mavi LED ışıkları, bunlar örneklerin yan taraflarının aydınlatılmasını sağlar.

• Transilüminatör üzerindeki UV ışıkları, bunlar örneklerin yan taraflarının aydınlatılmasını sağlar.

• Kenardaki jellerin aydınlatılması için kenar ışık ünitesindeki LED ışıklar ve fiber optikler

• UV transilüminatörü üzerindeki görünür ışık dönüştürücü ekranı için alternatif olan beyaz ışık pedi

Bunlara ek olarak, örneklerin uygun pozisyonunu ayarlamada genel aydınlatma sağlaması için Karanlık Odanın her iki tarafında bulunan beyaz LED ışıkları bulunmaktadır.

Karanlık Oda ile lens/kamera arasında 7 filtrenin konulabileceği bir döndürme ekranı bulunmaktadır. Ekran, GeneSys yazılımına spesifik olacak her filtrenin yerine ve özelliklerine endekslidir.

G:BOX ürünleri 3.8, 4, 4.2, 6 ve 9 milyon pikselli yeni nesil kameralara sahiptir. Bu da sisteme seçkin bir hassasiyet ve çok yönlülük sağlamaktadır.

G:BOX Kullanım Kılavuzu 5

G:BOX Serisi

G:BOX serisi aşağıdaki gibi detaylandırılan beş model içermektedir:

öZELLİKLER

G:BOX F3 G:BOX Chemi XRQ

G:BOX Chemi XT4

G:BOX Chemi XX6

G:BOX Chemi XX9

Görüntü çözünürlüğü (megapiksel) 3.8 4 4.2 6 9

Etki çözünürlüğü (megapiksel) 15.3 16 16.76 18 27

A/D 12/16 bit 16 bit 16 bit 16 bit 16 bit

Gri tonları 65 536 65 536 65 536 65 536 65 536

Quantum efficiency 425nmde (?) 52% 73% 53% 73% 73%

Düzenlemeli soğutma n/a -‐57C -‐57C -‐57C -‐57C

Lens (motor tahrikli) f1.2 f1.2 geribeslemeli

f0.95 ile otofokus

f0.95ile otofokus

f0.95ile otofokus

Filtre tekerleği (7 pozisyon) ● ● ● ● ●

UV filtresi* ● ● ● ● ●

Bilgisayarla kullanım ● ● ● ● ●

Karanlık Oda -‐ standart ● ●

Karanlık Oda -‐ Motor tahrikli zeminle geliştirilmiş

● ● ●

EPI LED beyaz ışıkları ● ● ● ● ●

EPI UV 302nm** ● ● ● ● ●

EPI kırmızı LED modülü ● ● ● ●

EPI mavi LED modülü ● ● ● ●

EPI yeşil LED modülü ● ● ● ●

EPI kırmızı LED modülü Çoklu işlem için M serileri

● ● ● ●

EPI mavi LED modülü çoklu işlem için M serileri

● ● ● ●

EPI yeşil LED modülü Çoklu işlemler için M serileri

● ● ● ●

EPI IR LED modülü ● ● ● ●

IR multiplexing kiti (680 -‐ 800nm) ● ● ● ●

Görünür ışık dönüştürücüsü (33 x 31 cm) ● ● ● ● ●

Görünür lekeler için beyaz ışık pedi (20 x 14 or 20 x 30 cm)

● ● ● ● ●


UltraBright LED blue light transilluminator (20 x 16 cm)

● ● ● ● ●

Kenar ışık ünitesi (26.5 x 20 cm) ● ● ● ● ●

UV transilüminatör 302nm (20 x 20 cm)*** ● ● ● ● ●

Maksimum görüntü alanı (cm) 25.5 x 21 30.5 x 22.7 19 x 19 22.1 x 17.6 22.1 x 17.6

Minimum görüntü alanı (cm) 4.5 x 3.8 5.5 x 4 9 x 9 10 x 8 10 x 8

E x B x D (cm) 57 x 84 x 45 57 x 84 x 45 57 x 99 x 55 57 x 99 x 55 57 x 99 x 55

Ağırlık(kg) 37 37 45 45 45

Besleme Gerilimi (V ac) 115 / 240 115 / 240 115 / 240 115 / 240 115 / 240 * Diğer emisyon filtreleri mevcuttur. ** Diğer dalga boyları mevcuttur *** Diğer boyutlar ve dalga boyları mevcuttur. available including dual wavelength G:BOX serisindeki modeller aşağıda detaylı olarak anlatılan uygulamaları yapmak için uygundur:

UYGULAMALAR

G:BOX F3 G:BOX Chemi XRQ G:BOX Chemi XT4 G:BOX Chemi XX6 G:BOX Chemi XX9

Rutin floresan ve görünür jel görüntüleme için uygun fiyatlı sistem

Floresan ve görünür jeller ve kemilüminesans Western blot için uygun fiyatlı sistem

Optimum performans sistemi. Gelişmiş kemilüminesans western blot, çoklu jeller ve floresan ve görünür jel ve blotların rutin görüntülemelerinde yüksek hassasiyet

Optimum performans sistemi. Gelişmiş kemilüminesans western blot, çoklu jeller,IR ve floresan ve görünür jel ve blotların rutin görüntülemelerinde yüksek hassasiyet. 2D’yi de içeren gelişmiş uygulamalarda yüksek uzaysal çözünürlük

Optimum performans sistemi. Gelişmiş kemilüminesans western blot, çoklu jeller,IR ve floresan ve görünür jel ve blotların rutin görüntülemelerinde çok yüksek hassasiyet. 2D’yi de içeren gelişmiş uygulamalarda optimum uzaysal çözünürlük

İyi uzaysal görüntü için yüksek çözünürlüklü 3.8MP kamera

Yüksek çözünürlük, yüksek QE (425nm’de %73), uzun pozlama zamanları için soğutmayla desteklenmiş 4MP kamera –kemilüminesans için uygundur

Yüksek hassasiyetli yüksek çözünürlüklü 4.2 MP kamera. Uzun pozlama zamanları için gelişmiş soğutma

Çok yüksek çözünürlük, yüksek QE ( 425nm’de %73’ten fazla), 6MP kamera, kemilüminesans için çok iyi bir hassasiyet sağlar.

Optimum yüksek çözünütlük, yüksek QE (425nm’de %73), 9MP kamera, kemilüminesans için çok iyi bir hassasiyet sağlar.

15.3MP’ye kadar etkili çözünürlük

16MP’ye kadar etkili çözünürlük

16.76MP’ye kadar etkili çözünürlük

18MP’ye kadar etkili çözünürlük.

27MP’ye kadar etkili çözünürlük

Geribildirimli motor tahrikli lens





Örnek konumlandırmak için beyaz LED ışıklandırması, görünür ışık uygulamaları ve kolorimetrik işaretleyiciler





Motor tahrikli 7 pozisyonlu filtre tekerleği ve uygulamayı geliştirmek için UV filtresi





GeneSys kullanılarak otomatik ve manuel kontrol





Hızlı görüntüleme için önceden tanımlanmış 1-‐tık protokolleri






Kullanıcının kaydedebileceği sınrısız protokol





DNA görüntülemek için UV transilüminatörle kullanım





Protein jelleri gibi uygulamalarda görünür ışık için dönüştürücü ekran kullanımı





Güvenli boya uygulamaları için mavi LED ultraparlak transilüminatör ile kullanım





GeneTools analiz yazılımının sınırsız kopyasını içerme





IQ/OQ yeterlik protokolleri geçerli





LED EPI aydınlatma seçenekleri için dahili ışık köprüleri




LICOR® ve DyLight boyaları kullanarak IR blotlarını görüntülemek için IR çoklu kiti, LED EPI modeülleri ve filtrelerin kullanımı

GeneSys otofokus fonksiyonu tarafından kontrol edilen çeşitli konumlar, motor tahrikli olan ve büyük küçük jel formatlarına uyumlu zemin



Kırmızı, yeşil ya da mavi LED EPI modülleri kullanılarak güçlü otomatik çoklu yakalama protokolü






2D jel görüntülemesi için

kenar ışık ünitesinin kullanımı (DIGE).

2D jel görüntülemesi için kenar ışık ünitesinin kullanımı (DIGE).

2D jel görüntülemesi için kenar ışık ünitesinin kullanımı (DIGE).

UYGULAMALAR

G:BOX F3 G:BOX Chemi XRQ

G:BOX Chemi XT4

G:BOX Chemi XX6

G:BOX Chemi XX9

DNA jelleri ● ● ● ● ●

Protein jelleri ● ● ● ● ●

Çoklu jeller -‐ 3 ya da daha fazla renk ● ● ● ●

Koloni sayımı ● ● ● ● ●

2D Jelleri (DIGE) ● ● ●

Kemilüminesans blotları ● ● ● ●


Kolorimetrik blotlar ● ● ● ● ●

Lekesiz görüntüleme ● ● ● ●

Filmler ● ● ● ● ●

IR görüntülemesi ● ● ● ●

Biyolüminesans ● ● ● ●

GFP bitki görüntüleme ● ● ● ●

GeneSys Yazılımı

GeneSys görüntü yakalama sistemi standart Windows ortamında çalışır ve uygulama esnasında kolaylık ve çeşitli bilimsel uygulamalarda zamandan tasarruf etmeyi sağlar.

Temel G:BOX ürünleri standart bir Windows ortamında çalışan bir bilgisayardaki GeneSys yazılımı tarafından kontrol edilir. Bir tanesi karanlık oda diğeri kamera için olmak üzere bilgisayarla G:BOX ürünü arasında iki kablo bağlantısı gerekmektedir.

Dijital kamera tarafından kaydedilen ham veriler G:BOX’ın temel çıktısı olan görüntü ve teknik dosyaları oluşturmak üzere GeneSys yazılımı tarafından işlenmektedir.

GeneSys yazılımı G:BOX donanımının hem otomatik hem de manuel kontrolüne olanak sağlamaktadır ve spesifik veri uygulamaları için dahili veritabanında sahiptir. Bu veritabanını otomatik yakalama modunda optimal örnek görüntüsünü elde etmek için donanım konfigürasyonunu en iyi şekilde kullanmaktadır. Veritabanı aşağıdaki bilgilerle ilişkilidir:

• Örnek biçimi; Jel, Blot, Diğer

• Blot çeşidi; Kemilüminesans, Floresans, Görünür

• Örnek çeşidi; Protein, DNA, RNA

• Kalıp çeşidi; Akrilamid, Agaroz

• Boya çeşitleri

• Aydınlatma çeşitleri


TİPİK STANDART G:BOX – ÖN KISIM TİPİK ESNEK G:BOX – ÖN KISIM

TİPİK STANDART G:BOX – KARANLIK ODA KAPISI AÇIK

KAMERA KAPAĞI

MANUEL ZEMİN YUKARI/AŞAĞI DÜĞMELERİ

GÖSTERGE IŞIKLARI

KARANLIK ODA KAPISI

KARANLIK ODA KAPISI MANUEL AÇMA

DÜĞMESİ

GÖSTERGE IŞIKLARI

KAMERA MODÜLÜ

TRANSİLÜMİNATÖR ÜNİTESİ

ELEKTROMANYETİK KAPI MIKNATISI

ÜST IŞIK ÜNİTELERİ -‐ HER İKİ TARAFTA


TİPİK ESNEK G:BOX – KARANLIK ODA KAPISI AÇIK

ZEMİN GEÇERSİZ DÜĞMESİ

GÖSTERGE IŞIKLARI

KAMERA MODÜLÜ

TRANSİLÜMİNATÖR ÜNİTESİ

ELEKTROMANYETİK KAPI MIKNATISI

ÜST IŞIK ÜNİTELERİ -‐ HER İKİ TARAFTA

OYNATILABİLİR ZEMN


YAZILIM KURULUMU

MİNİMUM SİSTEM GEREKSİNİMLERİ

GeneSys yazılımı aşağıda belirtilen Microsoft Windows işletim sistemlerinde çalışabilir:

Windows 7 Professional SP3 (32 bit ve 64 bit versiyonları) ya da Windows 8 Professional

Not: Windows işletim sistemlerinin Home versiyonları desteklenmemektedir.

Güncel sistem gereksinimleri için Sygene websitesinde FAQs Gel Documentation bölümüne ve Analysis bölümüne bakınız.

Yazılım Kurulumu

G:Box ürünleri, ürünün kontrol edileceği uygun bir bilgisayara yüklenmiş GeneSys sistemine gereksinim duymaktadır.

GeneSys yazılımı yalnızca yönetici hakkı olan Windows hesaplarından yüklenebilir. Kurulum işlemi aşağıdaki sırayı izlemektedir:

1. Kurulum Programını çalıştırma 2. Instrument Hardware Information seçme 3. Kurulum Klasörü Hedef Yeri Seçme 4. Başlat Menüsü Klasörü Seçme 5. Aygıt Sürücüsü Yükleme Sihirbazı kullanarak Cihaz Sürücülerini Yükleme

Kurulum Programını Çalıştırma

1. GeneSys USB /CD ROM’u takınız ve kurulum programını çalıştırınız. Aşağıdaki ekran görülecektir:

KURULUM-‐ GeneSys – GeneSYS KURULUM SİHİRBAZINA HOŞGELDİNİZ EKRANI

2. Next > butonunu tıklayınız. İlk Hardware Information (Donanım Bilgisi) ekranı görülecektir.


Cihaz Donanım Bilgisini Seçme

KURULUM – GeneSys -‐ İLK DONANIM BİLGİSİ EKRANI – CİHAZ ÇEŞİDİ

3. Uygun seçeneği işaretleyerek cihaz çeşidini seçiniz, örneğin G:BOX

4. Next > butonunu tıklayınız. İkinci Donanım Bilgisi ekranı görüntülenecektir.

5. Uygun seçeneği işaretleyerek cihazın modelini seçiniz.

KURULUM -‐ GeneSys -‐ İKİNCİ DONANIM BİLGİSİ EKRANI -‐ G:BOX Chemi-‐XX9 SEÇİLMİŞTİR

6. Next > butonunu tıklayınız. The Setup -‐ GeneSys Select Destination Location (Hedef Yeri Seçme) ekranı görüntülenecektir.

Kurulum Klasörü Hedef Yeri Seçme

KURULUM -‐ GeneSys – HEDEF YERİ SEÇME EKRANI


7. GeneSys yazılımının yüklenmesini istediğiniz klasörü seçiniz.

• Varsayılan klasörü kabul etmek için Next > butonunu tıklayınız.

• Değişik bir klasör seçmek için Browse... seçeneğini tıklayınız ve istenilen klasörü seçiniz ya da yeni bir klasör oluşturunuz. Daha sonra Next > butonunu tıklayınız.

Not: GeneSys yazılım kurulumu en az 80.7 MB’lik boş alana ihtiyaç duymaktadır.

8. The Setup -‐ GeneSys Select Start Menu Folder (Başlat Menüsü Klasörü Seçme)ekranı görüntülenecektir.

Başlat Menüsü Klasörü Seçme

KURULUM -‐ GeneSys – BAŞLAT MENÜSÜ KLASÖRÜ SEÇME EKRANI

9. GeneSys programının başlangıç kısayolunun yüklenmesini istediğiniz klasörü seçiniz:

• Varsayılan klasörü kabul etmek için Next > butonunu tıklayınız.

• Değişik bir klasör seçmek için Browse... seçeneğini tıklayınız ve istenilen klasörü seçiniz ya da yeni bir klasör oluşturunuz. Daha sonra Next > butonunu tıklayınız.

10. Ready to Install (Yüklemeye Hazır) ekranı görüntülenecektir. Kurulum işlemini başlatamk için Install butonunu tıklayınız.

KURULUM -‐ GeneSys – BAŞLAT MENÜSÜ KLASÖRÜ SEÇME

11. Device Driver Installation Wizard ekranı görüntülenecektir.


Aygıt Sürücüsü Yükleme Sihirbazını Cihaz Sürücüsünü Yükleme

Kurulum işleminin bu aşamasında bazı bilgisayarların kurulumu tamamlamak için gerek duyduğu yazılım sürücüleri yüklenir.

AYGIT SÜRÜCÜSÜ YÜKLEME SİHİRBAZI HOŞGELDİNİZ EKRANI

12. Next > butonunu tıklayınız. Sihirbaz (alt-‐program, GeneSys yazılımının bir parçasıdır) daha önce seçmiş olduğunuz cihazın çalışması için gerekli olan cihaz sürücülerini otomatik olarak bilgisayara yükleyecektir.

Cihaz sürücüleri yüklendikten sonra, ekranda ikinci Aygıt Sürücüsü Yükleme Sihirbazı ekranı belirecektir. Bu yüklenen cihaz sürücülerinin detaylarını göstermektedir.

AYGIT SÜRÜCÜSÜ YÜKLEME SİHİRBAZI WIZARD SONLANDIRMA EKRANI

13. Finish butonuna tıklayınız.

14. The Setup -‐ GeneSys Completing the GeneSys Setup Wizard (Kurulum – GeneSys GeneSys Kurulum Sihirbazı Tamamlanıyor) ekranı görüntüye gelecektir. Bu kurulum işleminin başarıyla tamamlandığını göstermektedir.


KURULUM – GeneSys GeneSys KURULUM SİHİRBAZI TAMAMLANIYOR EKRANI

15. Kurulum işlemini tamamlamak için Finish butonunu tıklayınız.

16. GeneSys USB /CD ROM’u çıkarınız.

GeneSys yazılımınız kullanıma hazırdır.

Not: Windows 7 ya da Windows 8 ile çalışan bilgisayara bağlanan G:BOX için iki çeşit kullanıcı girişi vardır; Kullanıcı ve Yönetici. Kullanıcı hesapları GeneSys yazılımında sınırlı ayrıcalıklara sahipken, Yönetici hesapları tam ayrıcalıklara sahiptir.

17. Masaüstünüzü kontrol ediniz, GeneSys simgesi görünür olmalıdır, .

GeneSys SİMGESİNİN GÖRÜLDÜĞÜ MASAÜSTÜ


KULLANMA

Kullanıcı Kontrolleri

Arka Panel

G:BOX cihazı arka panelinde iki Kullanıcı kontrolü vardır:

• Cihazı açıp/kapatmak için kullanılan bir ON/OFF düğmesi

• Otomatik mekanizma sıkışması ya da çok fazla güç çekmesi nedeniyle izole edilmiş zemin mekanizması güç kaynağını sıfırlamak için kullanılan zemin emniyet anahtarı .

Dokunmatik Ekran Bilgisayar

GeneSys yazılımının çalıştırıldığı bilgisayarın temizliğine ve temiz kalmasına yardımcı olması açısından dokunmatik ekran kullanılabilir. Bu ekran eldiven giyerken de oldukça rahat bir şekilde kullanılabilir ve gerektiğinde silinebilir.

Dokunmatik ekranı kullanarak yapılacak iki temel işlem vardır: Hafifçe vurma ve dokunup sürükleme.

• Hafifçe vurma, ‘geleneksel’ bilgisayar faresiyle yapılan tıklama işlemine karşılık gelmektedir.

• Çift hafifçe vurma, ‘geleneksel’ bilgisayar faresiyle yapılan çift tıklama işlemine karşılık gelmektedir.

• Dokunup sürükleme, ‘geleneksel’ bilgisayar faresiyle yapılan kaydırma ve sürükleme işlemlerine karşılık gelmektedir.

Bağlı Bilgisayar

G:BOX’a bağlı bilgisayarın klavye ve faresi normal olarak çalışmaktadır.

Cihaz Kurulumu – Standart Karanlık Oda

G:BOX’ın kurulduğu zeminin yüksekliğinden ve sağlamlığından emin olunuz.

Dikkat Aksi belirtilmedikçe hiçbir bileşene elektrik vemeyiniz.

Aşağıda belirtilen kablo bağlantılarını yapınız:

1. Cihazla priz arasındaki ana güç kablosunu bağlayınız. AÇMAYINIZ.

UYARI

Cihaz üzerindeki prizin engellenmediğinden emin olunuz, ana kablonun rahatça sökülmesine olanak sağlamak için boşluk bırakınız.

2. Karanlık Oda – kamera güç kablosunu karanlık oda üzerindeki 9-‐yönlü D-‐tipi priz ve kamera ünitesindeki jack arasına takınız.


3. Kamera üzerindeki USB Mini-‐B konnektörü ile kamera-‐bilgisayar kablosunu bağlayınız. Bilgisayara BAĞLAMAYINIZ.

4. Karanlık Odanın arkasındaki ON/OFF düğmesini kullanarak Karanlık Odaya elektrik veriniz.

5. Transilüminatörleri dağıtıcıya yükleyiniz. Karanlık odanın arkasındaki kısa kabloyu transilüminatörün arkasındaki prize bağlayınız. Ünitenin önündeki ON/OFF düğmesiyle transilüminatöre elektrik veriniz. Ünitenin önündeki transilüminatör güç dağıtıcısı düğmesini %100’e ayarlayınız.

6. Bilgisayarı çalıştırınız ve GeneSys yazılımını yükleyiniz.

7. Kamera-‐Bilgisayar kablosunu bilgisayar üzerindeki USB Tip A konnektörüne bağlayınız. Kamera ve bilgisayar arasındaki iletişim otomatik olarak başlayacaktır ve kamera sürücüleri bilgisayara yüklenecektir. Eğer bilgisayar ekranında sürücülerin geçersiz olduğunu ya da doğrulanamadığını belirten bir mesaj içeren uyarı kutusu belirirse, kurulumla devam etme seçeneğini seçiniz.

8. Karanlık Oda-‐Bilgisayar kablosunu karanlık odada bulunan 9-‐yönlü D-‐tipi konnektöre bağlayınız. Kablonun diğer ucunu ise serial/USB dönüştürücüsünün üzerindeki 9-‐yönlü D-‐tipi konnektöre bağlayınız. Daha sonra dönüştürücüyü bilgisayar üzerinde bulunan USB Tip A ile bağlayınız.

Not: Eğer bilgisayar sıralı 9-‐yönlü D-‐tipi erkek konnektöre sahipse, karanlık oda-‐bilgisayar kablosundaki 9-‐yönlü D-‐tipi dişi konnektör herhangi bir konnektöre bağlanmadan direkt olarak bilgisayara bağlanabilir.

Not: GeneSys yazılımı bilgisayarın en az gerçek renkli 1280 x 900 çözünürlüklü OpenGL ile uyumlu grafik kartına sahip olmasına ve DPI ayarının da normal boyutta (96 DPI) olmasına ihtiyaç duymaktadır.

9. GeneTools yazılımı otomatik olarak yüklenecektir.

10. GeneSys yazılımını başlatmak için simgesine çift tıklayınız.

Cihaz Kurulumu – Esnek Karanlık Oda

G:BOX’ı kurduğunuz zeminin yüksekliğinden ve sağlamlığından emin olunuz.

Dikkat Aksi belirtilmedikçe hiçbir bileşene elektrik vermeyiniz.

Aşağıda belirtilen kablo bağlantılarını yapınız.

1. Cihazla prizi ana güç kablosuyla bağlayınız. AÇMAYINIZ.

UYARI

Cihaz üzerindeki prizin engellenmediğinden emin olunuz, ana kablonun rahatça sökülmesine olanak sağlamak için boşluk bırakınız.

2. Zemindeki karanlık oda-‐zemin güç kablosunu karanlık odaya bağlayınız. Bu kablonun kalıcı olarak zemine bağlı olduğuna dikkat ediniz.


3. Karanlık oda-‐Kamera güç kablosunu karanlık odadaki 9-‐yönlü D-‐tipi prizle kamera ünitesindeki jack arasında bağlayınız.

4. Kamera-‐Bilgisayar kablosunu kamera üzerindeki USB Mini-‐B konnektörüyle bağlayınız. Bilgisayara BAĞLAMAYINIZ.

5. Karanlık odanın arkasındaki ON/OFF düğmesini kullanarak karanlık odaya elektrik veriniz.

6. Karanlık odanın kapısını açınız ve Örnek Tepsisinin sol arka köşesindeki mikro-‐düğmeye küçük bir nesne yerleştiriniz. Koyulan nesnenin mikro-‐düğmenin itilmiş halini koruduğundan emin olunuz. Manuel Zemin yukarı tuşuyla Kapı mıknatısının hemen altında bulunan zemin Override tuşuna eş zamanlı basarak zemini yükseltiniz. Zemini kapının üst kenarına gelene kadar yükseltiniz, daha sonra her iki tuşu bırakınız.

7. Micro-‐düğmedeki nesneyi kaldırınız.

8. Transilüminatörü zemin dağıtıcılarına yükleyiniz. Transilüminatörün arkasındaki prizle zemindeki kısa kabloyu bağlayınız. Transilüminatörü zemin dağıtıcılarına tamamen itiniz, mikro-‐düğmeyle bağlandığındaki sesi duyunuz. Ünitenin önündeki ON/OFF düğmesiyle transilüminatöre elektrik veriniz. Ünitenin önündeki transilüminatör güç düğmesini %100’e ayarlayınız.

9. Bilgisayarı çalıştırınız ve GeneSys yazılımını yükleyiniz.

10. Kamera-‐Bilgisayar kablosunu bilgisayar üzerindeki USB Tip A konnektörüyle bağlayınız. Kamera ve bilgisayar otomatik olarak iletişime geçecektir ve kamera sürücüleri bilgisayara yüklenmeye başlayacaktır. Eğer bilgisayar ekranında sürücülerin geçersiz olduğunu ya da doğrulanamadığını belirten bir mesaj içeren uyarı kutusu belirirse, yüklemeyle devam etme seçeneğini işaretleyiniz.

11. Karanlık Oda-‐Bilgisayar kablosunu Karanlık Odadaki 9-‐yönlü D-‐tipi konnektörle bağlayınız. Kablonun diğer ucunu serial/USB dönüştürücüsü üzerindeki 9-‐yönlü D-‐tipi konnektöre bağlayınız. Daha sonra dönüştürücüyü bilgisayardaki USB Tip A konnektörüne bağlayınız.

Not: Eğer bilgisayar sıralı 9-‐yönlü D-‐tipi erkek konnektöre sahipse, karanlık Oda-‐Bilgisayar kablosu üzerindeki 9-‐yönlü D-‐tipi dişi konnektör herhangi bir dönüştürücü eklemeden direkt olarak bilgisayara bağlanabilir.

Not: GeneSys yazılımı bilgisayarın en az gerçek renkli 1280 x 900 çözünürlüklü OpenGL ile uyumlu grafik kartına sahip olmasına ve DPI ayarının da normal boyutta (96 DPI) olmasına ihtiyaç duymaktadır.

12. GeneTools yazılımı otomatik olarak yüklenecektir.

13. GeneSys yazılımını başlatmak için simgesine çift tıklayınız.


Kullanıcının Monte Edebileceği Aksesuarlar

Işıklar

G:BOX cihazı aşağıdaki standart ışık kaynaklarıyla donatılmıştır:

• Karanlık Oda/Zeminin her iki tarafına konumlandırılmış iki UV ışığı ünitesi

• Karanlık Oda/Zeminin her iki tarafında hemen UV ışığı ünitesinin altına konumlandırılmış, her ikisi sekiz beyaz LED içeren bir şeritten oluşan iki LED Beyaz Işık ünitesi

• Karanlık Oda/Zeminin her iki tarafında LED Beyaz Işık Ünitesinin altına konumlandırılmış, her biri dört spesifik renk çıktısına sahip kullanıcının değiştirebileceği ışık modüllerinin olduğu iki kullanıcının değiştirebileceği ışık modülü kümesi

U

L

TEPE IŞIK KAYNAKLARI

UV IŞIK ÜNİTESİ

LED BEYAZ IŞIK ÜNİTESİ

LED IŞIK KÜMESİ


Değiştirilebilir Işık Modüllerinin daha önceden sipariş edilmesi durumunda, bunlar ayrı bir yastıklı kutuda aksesuar kartonunda gönderilecektir. Bunlar aşağıdaki şekilde yüklenir:

1. G:BOX’ı karanlık odanın arkasındaki ON/OFF düğmesini kullanarak kapatınız.

2. Karanlık odanın kapısını açınız.

3. Karanlık Oda/Zeminin her iki tarafında LED ışık kümelerini görmek mümkündür.

4. G:BOX ürünleri motor tahrikli bir Zemin, zeminin yan taraflarında olan ve zeminle birlikte hareket eden ışık kaynaklarından oluştuğunu unutmayınız. Bu zeminin pozisyonu değiştiğinde örnekle bağlantılı olan ışık kaynaklarını düzenlemektedir.

Değiştirilebilir Işık Modülleri çiftler halinde tedarik edilmektedir:

• Her çiftten bir tanesi karanlık odanın iher iki tarafında bulunan LED ışık kümesine yüklenecektir.

• Işık modülleri en eşit aydınlatmayı sağlamak için direkt karşılıklı olarak yerleştirilmelidir.

• Işık modüllerinin birinin sağ el tarafında diğerinin sol el tarafında olması koşuluyla istenilen yere yüklenebileceği unutulmamalıdır.

• Değiştirilebilir ışık modülleri mödülün sol el tarafında bulunan beyaz bir etiketle kolaylıkla ayırt edilebilir.

5. Bir çift değiştirilebilir ışık modülünü tanımlayınız.

6. LED ışık kümesindeki herhangi bir boş modülü çıkarınız.

• Modülü çıkarmak için, alt ve üst kenarlarından nazikçe kavrayınız.

• Modülün alt kısmındaki klipse basınız.

• Modülü yuvasından kaydırınız.

7. LED ışık kümesinin sol el tarafından modülü yuvasına koyunuz:

• Modülü eklemek için, alt ve üst kenarlarından nazikçe kavrayınız.

• Modülü boş yuvaya kaydırınız.

• Yerine oturana kadar modülün ön tarafından hafifçe bastırınız.

Not: Yalnızca lensin etrafını saran plastiğe bastırınız, direkt olarak renkli lense BASTIRMAYINIZ.

8. Modüllerin ikincisini sağ el tarafındaki LED ışık kümesinde eşleşen yuvaya takınız. Note: Değiştirilebilir ışık modüllerini kullanırken oldukça dikkatli olunmalıdır. Modülü düşürmek modülün zarar görmesine ve bunun sonucunda kullanılmaz hale gelmesine neden olacaktır.


DEĞİŞTİRİLEBİLİR IŞIK MODÜLLERİ

Bu ışık kaynaklarına ilave olarak, ihtiyaç duyulması halinde karanlık oda çekmecesine ek ışık kaynakları konulabilir. Çekmecenin sağ el tarafındaki arka kısmında UV transilüminatör, Ultraparlak LED Mavi Işık, Kenar Işık Ünitesiya da Beyaz Işık Pedi gibi ışık kaynaklarına güç vermek amacıyla bir priz bulunmaktadır.

KARANLIK ODADAKİ UV TRANSİLÜMİNATÖR KARANLIK ODADAKİ UV TRANSİLÜMİNATÖR STANDARD G:BOX ESNEK G:BOX

Filtreler

G:BOX motor tahrikli bir filtre tutacağıyla birlikte gelmektedir. Bu cihazın üstüne yerleştirilmiştir, böylece filtre lensleri görüntüleme lenslerinin hemen altına gelecek şekilde konumlandırılmıştır. Yüklenecek olan yedi filtreye kadar yer mevcuttur. Bunlar 1-‐7 olarak numaralandırılmıştır, bu sayede filtre yerleri GeneSys yazılımı içinde tanımlanabilecektir.Filtre Tutacağına ulaşmak için Lens ver Kamera ünitelerinin çıkarılması gerekmektedir.

Eğer filtreler önceden sipariş edilmişse, gönderimden önce fabrikada kurulumları yapılacaktır. Eğer filtreler daha sonra satın alınmışsa ya da ayrı gönderilmişse, aşağıdaki adımları izleyerek kurulumu gerçekleştiriniz. 1. Başlığı çıkarınız.

2. Lens ve kamera ünitelerini çıkarınız.

3. Karanlık odanın üstündeki açıklıktan filtreler görünmektedir.


GÖRÜNÜR FİLTRE

4. Filtre tutacağındaki görünür filtre yuvasında herhangi bir filtrenin olup olmadığını kontrol ediniz. Eğer varsa, filtre tutacağını boş yuva görünene kadar parmağınızla yavaşça döndürünüz.

5. Özel bir allen anahtarı kullanarak filtre yuvasının her iki tarafındaki filtre tutucu çıtasında bulunan vidaları gevşetiniz.

6. Insert a Filter into the Filter Holder, making sure that the screw thread is facing upwards and that it fits snugly in the Filter Slot in the Holder, and under the two Filter Retaining Strips.

7. Filtre tutucu çıtasındaki vidaları fazla sıkıştırmamaya özen göstererek sıkılaştırınız.

8. Filtre adını ve filtre tutacağında oturduğu filtre yuvasını not ediniz. Her bir filtre yuvası açık bir biçimde numaralandırılmıştır.

9. Parmaklarınızı kullanarak, bir sonraki filtre yuvası ulaşılabilir olana dek filtre tutacağını nazikçe döndürünüz. Bütün filtreler yüklenene kadar bu işlemleri tekrar ediniz.

Not: Filtre tutacağını belirli bir yöne doğru döndürmek zorunda değilsiniz, makine çalışmaya başladığı an otomatik olarak varsayılan ayarlarına dönecektir.

10. Lens ve kamera ünitelerini takınız.

11. Başlığı takınız.

Cihazı Açmak

G:BOX’ı açmak için:

1. Bilgisayarınızı her zaman olduğu gibi açınız.

2. Cihazı ana güç kablosuyla prize bağlayınız.

3. Eğer bir düğmeyle verilmişse, güç prizini açınız.

4. Karanlık odanın arkasında bulunan ON/OFF düğmesini kullanarak cihazı açınız.

5. Cihazın önündeki yeşil gösterge ışığının yanıp yanmadığını kontrol ediniz.


GeneSys YAZILIM BAŞLATMA EKRANI

GeneSys yazılımı çalışmaya başladığında, Home ekranı görüntüye gelecektir. İlk önce GeneSys yazılımı varsayılan ayar olan Standard View’da (Standart Görünüm) başlayacaktır, daha sonra Home ekranı görüntüye gelecektir. Görünüm Standard View’dan Classic View’a (Klasik Görünüm) User Preferences (Kullanıcı Tercihleri) ekranından değiştirilebilir. Kişisel Tercihleri Girme başlığına bakınız.

GeneSys STANDART GÖRÜNÜM BAŞLANGIÇ EKRANI

GeneSys Standart Görünüm Başlangıç Ekran Düzeni

İŞ AKIŞI DURUM ÇUBUĞU

BİLGİ PANELİ

KULLANICININ

SEÇEBİLECEĞİ EYLEMLER

BAŞLIK ÇUBUĞU

NAVİGASYON SİMGELERİ


BAŞLIK ÇUBUĞU GeneSys programında nerede olduğunuzu gösteren simgeyi gösterir. Burada

simgesiyle başlangıç ekranında olduğunuz gösterilmektedir. GeneSys programındaki diğer ekranlarda bu buton sizi başlangıç ekranına döndürecektir.

Kamera çözünürlüğünü, bağlı olan donanımı ve program başlığını gösterir.

, buradaki yüklemede 9 MP kameralı G:BOX Chemi-‐XX9’un kurulu olduğu ve GeneSys programının çalıştığı görülmektedir.

simgesi sistem verilerine ulaşmayı sağlar, aşağıda görüldüğü gibi kamera donanımları ve programın versiyon bilgilerine buradan ulaşılabilir.

Burada küçültmek, büyütmek ve kapatmak için standart Windows simgeleri görülmektedir.

Görüntü yakalama işleminin birçok noktasında başlık çubuğunun sol tarafında işlemin hangi aşamasında olunduğunu gösteren simgeler vardır. Örneğin G:BOX otomatik pozlama yaptığında

Automatic Capture simgesi görünecektir, manuel pozlama yapıldığında ise

Manual Capture simgesi görünecektir.

KULLANICININ SEÇEBİLECEĞİ EYLEMLER Burada kullanıcının çeşitli temel eylemleri ya da görevleri seçebileceği düğmeler bulunmaktadır.

seçeneğinden bir jel örneği için otomatik görüntü yakalama işlemine kolayca ulaşılabilir.

seçeneğinden blot örneği için otomatik görüntü yakalama işlemine kolayca ulaşılabilir.

Seçeneğinden manuel görüntü yakalama işlemine ulaşılabilir.


BİLGİ PANELİ Bilgi ve görüntülerin görüldüğü kısımdır. Kullanıcının programdaki

yerine bağlı olarak birçok yapılandırma görülebilir.

Standard Görünüm Başlangıç ekranında Kaydedilmiş Protokolleri (Saved Protocols, aynı zamanda kullanıcı yapılandırmaları olarak da bilinir) ve protokollerin çeşit/seçim seçeneklerini görmek mümkündür.

İŞ AKIŞI DURUM ÇUBUĞU Çeşitli bilgi öğelerini göstermektedir:

Başlangıç simgesi (Başlangıç ekranında değilken)

İş Akışı Simgeleri – Bir aktiviteyi tamamlamak için yapılması gereken eylemleri yaparken kullanıcının hangi adımda olduğunu gösterir. Kullanıcı herhangibir simgeye tıkladığında, simgeyle iligili olan ekrana götürülür.

Birden fazla adım görüntülendiğinde, her bir simge arasında gri bir ok görülür. Bu geriye doğru her adımı göstermektedir.

Cihaz durumu, burada gösterilen simgesi, kameranın programla bağlantı kurduğunu göstermektedir. Bu simge duruma bağlı olarak değişir:

simgesi kamera ve karanlık odada bir terslik olmadığını ve kullanıma hazır olduğunu göstermektedir.

simgesi kameranın fazla ısındığını, ya da aksi durumda hazır olmadığını göstermektedir.

simgesi karanlık odanın programla bağlantı kurduğunu göstemektedir.

simgesi karanlık odanın bağlı olmadığını göstermektedir.

simgesi ne kameranın ne de karanlık odanın bağlı olduğunu göstermektedir.

Navigasyon simgeleri – Kullanıcının birçok Settings ya da System

Tools ekranında gezinmesine olanak sağlamaktadır. Görüntülenen simgeler programla yapılan eylemlere bağlı olarak görülmektedir.

NAVİGASYON SİMGELERİ Bu kısımda görülen simgeler

Görüntüleri Yükleme simgesi, Görüntüleri Yükleme ekranına gitmek için

Görüntüleri İnceleme simgesi, Görüntüleri İnceleme ekranına gitmek için

Ayarlar simgesi, Kullanıcı Tercihleri ekranına gitmek için

Donanım simgesi, Donanım ekranına gitmek için


GeneSys KLASİK GÖRÜNÜM BAŞLANGIÇ EKRANI

GeneSys Klasik Görünüm Başlangıç Ekran Düzeni


BAŞLIK ÇUBUĞU Standart Görünüm başlangıç ekranıyla aynıdır.

KULLANICININ SEÇEBİLECEĞİ EYLEMLER Burada kullanıcının çeşitli eylemleri ve görevleri seçebileceği düğmeler bulunmaktadır. Bunlar:

simgesiyle otomatik görüntü yakalama işlemine kolayca ulaşılabilir. simgesiyle manuel görüntü yakalama işlemine kolayca ulaşılabilir. simgesiyle görüntülere göz atma işlemine kolayca ulaşılabilir. simgesiyle görüntüleri inceleme işlemine kolayca ulaşılabilir.

İŞ AKIŞI DURUM ÇUBUĞU

BİLGİ PANELİ KULLANICININ

SEÇEBİLECEĞİ EYLEMLER

BAŞLIK ÇUBUĞU


BİLGİ PANELİ Bilgi ve görüntülerin görüldüğü kısımdır. Kullanıcının programdaki yerine bağlı olarak birçok yapılandırma görülebilir.

Başlangıç ekranı iki bölüme ayrılmıştır:

Kullanıcı Yapılandırmaları (User Configurations-‐ Protocols olarak da görülebilir) – tekrarlanabilir iş akışlarını oluşturan kaydedilmiş özel ayar kombinasyonlarına buradan ulaşılabilir.

Sistem verileri – kamera donanımı ve program versiyon bilgilerine buradan ulaşılabilir.

İŞ AKIŞI DURUM ÇUBUĞU Çeşitli bilgi öğelerini göstermektedir:

Başlangıç simgesi (Başlangıç ekranında değilken)

İş Akışı Simgeleri – Bir aktiviteyi tamamlamak için yapılması gereken eylemleri yaparken kullanıcının hangi adımda olduğunu gösterir. Kullanıcı herhangibir simgeye tıkladığında, simgeyle iligili olan ekrana götürülür.

Birden fazla adım görüntülendiğinde, her bir simge arasında gri bir ok görülür. Bu geriye doğru her adımı göstermektedir.

Cihaz durumu, burada gösterilen simgesi, kameranın programla bağlantı kurduğunu göstermektedir. Bu simge duruma bağlı olarak değişir:

simgesi kamera ve karanlık odada bir terslik olmadığını ve kullanıma hazır olduğunu göstermektedir.

simgesi kameranın çok ısındığını ya da aksi durumda hazır olmadığını göstermektedir.

simgesi karanlık odanın programla bağlantı kurduğunu göstermektedir.

simgesi karanlık odanın bağlı olmadığını göstermektedir.

simgesi ne kameranın ne de karanlık odanın bağlı olduğunu göstermektedir.

Navigasyon Simgeleri -‐ Kullanıcının birçok Settings ya da System Tools ekranında gezinmesine olanak sağlamaktadır. Görüntülenen simgeler programla yapılan eylemlere bağlı olarak görülmektedir.


Burada görülmeyen simgeler gösterilmektedir:

Ayarlar simgesi, Kullanıcı Tercihleri ekranına gitmek için

Donanım simgesi, Donanım ekranına gitmek için


Donanım Detaylarını Girme

Artık G:BOX’ı kurduğunuza göre, GeneSys yazılımına yüklenilen ışık kaynakları ve filtrelerin detaylarını girmeniz gerekmektedir. Bu işlemin cihaz ilk kullanıldığında ve ek bir donanımın yüklendiği her seferde yapılması gerekmektedir.

1. Başlangıç ekranındaki Hardware (Donanım) simgesini seçiniz. Burada Donanım ekranı görülmektedir.

DONANIM EKRANI

2. Mevcut olan tüm seçenekleri incelemek için pencereyi aşağıya doğru kaydırınız.

3. Cihazınızda yüklü olan her bir donanım seçeneğini işaretleyiniz.

Not: Spesifik gereksinimlerinizi sipariş ederken belirlediyseniz, bu işlem Syngene tarafından yapılmış olabilir ve bütün donanım önceden kurulmuş olabilir. Buna rağmen, bu ekranda yapılan donanım seçimlerinin yüklenen donanımla uyuştuğunu kontrol etmek iyi bir pratik olacaktır.

4. Gri/siyah olan tercihler seçilmemiştir. Seçilen tercihler kırmızyla gösterilmektedir.

5. İlk Donanım penceresinde tüm donanım tercihleri seçildiğinde, Kaydet simgesini seçiniz.

6. Yazılıma daha fazla seçenek programlamak için Donanımı Düzenle simgesini seçerek Işıklar & Filtreler ekranına gidiniz.

IŞIKLAR & FİLTRELER EKRANI

Işıklar & Filtreler ekranı karanlık odanın her iki tarafına yüklenen ışık ünitelerinin çeşidini ve karanlık oda zeminine yüklenen aksesuar ışığı belirlemek için kullanılmaktadır.


7. Sol tarafta bulunan üç aydınlatma yeri için, Lower Lighting (Alt aydınlatma) , Left Light (Sol ışık) ve Right Light (Sağ ışık), data butonunu seçiniz ve aşağıdaki menüden o yere yüklenen ışık çeşidini seçiniz.

ALT AYDINLATMA MENÜSÜ SOL IŞIK MENÜSÜ

SAĞ IŞIK MENÜSÜ

8. Sağ tarafta bulunan filtre yerlerinden her biri için, data butonunu seçiniz ve aşağıdaki menüden o yere yüklenen filtre tipini seçiniz. (Görseldeki filtre pozisyonu 2dir)

IŞIKLAR & FİLTRELER EKRANI – FİLTRE SEÇİMİ


9. İkinci Donanım ekranında tüm ışık ve filtre tercihleri seçildikten sonra, Kaydet simgesini seçiniz.

Not: Donanım ekranından çıkmadan önce bütün tercihlerini kaydettiğinizden emin olunuz.

10. Başlangıç ekranına sönmek için simgesini seçiniz.

Kişisel Tercihleri Girme

G:BOX’a giriş yapan her kişi kendine özgü cihaz ayarları oluşturabilir, örneğin bir profil kişinin çalışma şeklini ve test sonuçlarıyla ne yaptığını yansıtır.

1. Başlangıç ekranındaki Ayarlar simgesini seçiniz. Burada User Preferences (Kişisel Tercihler) Ekranı görülmektedir.

KİŞİSEL TERCİHLER EKRANI

2. Tercihlerinizi ayarlayınız:

RAPOR AYARLARI

Rapor Ayarları bazı rapor ayarlarını önceden ayarlamanıza olanak sağlar. Bu tekrar eden testler yaptığınızda ve her bir test için benzer rapor hazırlamanız gerektiğinde size kolaylık sağlayacaktır. Ayarlanabilecek seçenekler:

• Full Report (Tam Rapor) – Bu kutuyu seçtiğinizde cihazı yaptığınız her test için tam rapor oluşturması için ayarlamış olursunuz. Tam raporun içeriği ek kutuların seçilmesiyle kontrol edilebilir, özelliği eklemek için kutuyu seçiniz:

o Görüntü o Dosya Tanımlama

o Yakalama Özellikleri

• Basic Report (Temel Rapor) – Bu kutuyu seçtiğinizde cihazı yaptığınız her test için temel rapor oluşturması için ayarlamış olursunuz. Ek özellikler:

o Basic Report Image Only (Temel rapor, yalnızca görüntü) – Eğer bu kutu işaretliyse, çıktısı alınan rapor yalnızca test için çekilen görüntüden oluşacaktır. Eğer bu kutu işaretlenmediyse, raporda görüntünün yanı sıra


dosya adı / kullanıcı adı / tarih/ zaman / örnek / filtre gibi temel birkaç bilgi de yer alacaktır.

o Preview Before Printing (Baskı Önizleme) – Eğer bu kutu işaretliyse, raporun basılmadan önceki görüntüsü ekrana gelecektir. Eğer seçili değilse, rapor herhangibir önizleme yapılmadan basılacaktır.

KAYDETME AYARLARI

·∙ Saving Defaults (Kaydetme Ayarları) –GeneSys yazılımının görüntülerinizi kaydedeceği dosyaların formatını ayarlamanıza ve seçmenize olanak sağlar. Bu kısımda tercihinizi ayarlamadığınızda, GeneSys yazılımı varsayılan ayar olarak *.sgd formatını kullanacaktır. Tercihinizi farklı bir formata ayarlamak için Use Default File Type (Varsayılan Dosya Çeşidini Kullan) seçeneğini kaldırınız ve aşağıdaki menüden tercih ettiğiniz dosya çeşidini seçiniz.

MEVCUT DOSYA FORMATLARI

EKRAN DEĞİŞTİRME MESAJ KUTULARI

• Ekran Değiştirme Mesaj Kutuları – yakalamaları ayarlarken ekrana gelen mesaj kutularını açıp kapatmanıza olanak sağlamaktadır. İki seçenek mevcuttur:

o Yansıtmaz ekran – Kutucuk işaretliyse, prompt açılır (varsayılan ayar). İşaretlenmediyse prompt kapatılır.

o Dönüştürücü Ekranlar – Kutucuk işaretliyse, prompt açılır (varsayılan ayar). İşaretlenmediyse prompt kapatılır.

• Otomatik Yakalama Varsayılanları – bu kutucuğu işaretlemeniz durumunda kemilüminesans görüntü yakalama işleminde örnek konumlandırma aşamasında GeneSys yazılımının otomatik olarak iç beyaz ışıkları açmasına ayarlamış olursunuz.

KAMERA AYARLARI

• Camera Settings (Kamera Ayarları) –Neutral Fielding işlemlerini yapabilmenize olanak sağlamaktadır. Örnek Konumlandırma ekranındaki Neutral Fielding kutusunu seçtiğinizde, GeneSys yazılımı çektiğiniz görüntüler için Neutral Fİelding verilerini varsayılan olarak ayarlar.

• Reset Neutral Field Data butonunu seçtiğinizde, aşağıdaki mesaj kutusu ekrana gelecektir:


RESET NEUTRAL FIELD DATA MESAJ KUTUSU

o Neutral fielding işlemlerini yapabilmek için Yes butonunu seçiniz.

o İptal etmek için No butonunu seçiniz.

BÖLGESEL GÜÇ FREKANSI

• Regional Power Frequency (Bölgesel Güç Frekansı) -‐ G:BOX’ınızı bulunduğunuz yerdeki güç frekansına göre ayarlamanıza olanak tanımaktadır. Tüm dünyada kullanılan iki tip frekans vardır, bunlar; 50 Hz ve 60 Hz. Yerel frekansınızın olduğu kutuyu işaretleyiniz.

YAZICI AYARLARI

• Printer Settings (Yazıcı Ayarları) – bir yazıcı seçmenize ve seçtiğiniz yazıcıda tercihlerinizi ayarlamanıza olanak sağlamaktadır, genelde bunlar geçerli oturumda ayarlanabilmektedir. Yazıcı ayarlarında sizin için mevcut olan seçenekler işletim sisteminize ve yazıcınızın marka ve modeline göre değişiklik göstermektedir.

GENEL AYARLAR

• Show labels on navigation buttons (Navigasyon düğmelerinde simgelerin etiketini gösterme) – Bu kutuyu işaretlediğinizde, navigasyon düğmeleri üzerinde etiketler görünür hale gelecektir.

Etiketler görünür

Etiketler görünmez

• Classic View (Klasik Görünüm) – Bu kutuyu seçtiğinizde varsayılan olan Standard View (Standart Görünüm) yerine Classic View (Klasik Görünüm) ekrana gelecektir.

3. Yaptığınız herhangi bir değişikliği kaydetmek için, Kaydet simgesini seçiniz. Kullanıcı Tercihleri ekranından kaydetmeden çıkmak istediğinizde, aşağıdaki mesaj kutusu ekrana gelecektir:

DEĞİŞİKLİKLERİ KAYDET MESAJ KUTUSU


4. Başlangıç ekranına dönmek için simgesini seçiniz.

Temel Ekran Görüntüleme Boyutunu Ayarlama

GeneSys varsayılan ayar olarak tam ekran boyutunda açılır. Başlık çubuğundaki Maximise/Restore

GeneSys düğmesi seçilerek ekran boyu ayarlanabilir ve sağ el köşesinin altındaki simgesi sürüklenerek görüntünün boyu yeniden ayarlanabilir.

STANDART GÖRÜNÜM BAŞLANGIÇ EKRANI – VARSAYILAN STANDART GÖRÜNÜM BAŞLANGIÇ EKRANI -‐ AYARLANMIŞ

KLASİK GÖRÜNÜM BAŞLANGIÇ EKRANI -‐ VARSAYILAN

KLASİK GÖRÜNÜM BAŞLANGIÇ EKRANI -‐ AYARLANMIŞ


Tavisye Edilen Işık / Boya / Aksesuar ve Diğer Uygulama Tabloları

IŞIK ve FİLTRE SEÇENEKLERİ

UYGULAMA ÖRNEK TİPİ IŞIK KAYNAĞI / AKSESUAR FİLTRE

Kemilüminesans Membran Yansıtmaz siyah ekran Filtre yok

Görünür bir markerla kemilüminesans

Membran Yansıtmaz siyah ekran Filtre yok

Floresan Jel (örn. EtBr™* / SYBR Gold™

Ultra-‐ince mavi ışık LED Transilüminatör

FiltUV/FiltSW

Jel (örn. Alexa Fluor, DyLight, Cy dyes, LI-‐COR)

RGB ve IR LED modülleri (çoklu ve çoklu olmayan)

Kırmızı LED Modülü -‐ Filt705M Yeşil LED Modülü -‐ Filt605M Mavi LED Modülü -‐ Filt525 IR LED Modülü -‐ FiltLY800

Membran (örn. Alexa Fluor, DyLight, Cy dyes, LICOR)

RGB ve IR LED modülleri (çoklu ve çoklu olmayan)

Kırmızı LED Modülü -‐ Filt705M Yeşil LED Modülü Filt605M Mavi LED Modülü -‐ Filt525 IR LED Modulü -‐ FiltLY800

Görünür ışık Jel (örn. Coomassie blue ve Silver stain)

Görünür ışık dönüştürücüsü

FiltUV

Membran (örn. Ponceau Red)

Görünür ışık dönüştürücüsü

FiltUV

* Ultra-‐ince mavi ışık LED transilüminatörüyle EtBr görüntülerken, soluk bantların tespit edilmesinin güç olabileceğini aklınızda bulundurunuz.

NEUTRAL FIELDING (NF) SEÇENEKLERİ

IŞIK KAYNAĞI NF EKRANI

Beyaz / görünüt ışık Görünür ışık dönüşütürücü ekranını NF ekranı olarak kullanınız.

UV ışık EtBr/UV ya da LP filtresi kullanılıyorsa buzlu NF ekranı olan Ultra-‐ince mavi ışık LED Transilüminatör üzerine mavi NF ekranı kullanınız. SP filtresi kullanılıyorsa, Ultra-‐ince mavi ışık LED transilüminatör üzerine buzlu NF ekran, daha sonra mavi NF ekranı kullanınız.

Epi-‐UV kısa ve uzun dalgaboylu ışık Ultra-‐ince mavi ışık LED Transilüminatör üzerine mavi NF ekran kullanınız.


Test Örneklerini Yükleme

Siyah Yansıtmaz Ekran

Siyah yansıtmaz ekran direkt transilüminatörün üzerine ya da transilüminatör henüz satın alınmamışsa boş bir kutu üzerine konulabilir. Ortaya gelecek şekilde yerleştiriniz.

Test örneğini siyah yansıtmaz ekranın ortasına yerleştiriniz.

Ultra-‐ince Mavi Işık LED Transilüminatör

UltraParlakt LED mavi ışık transilüminatörünün kullanılması gerekiyorsa, UV transilüminatörün yerine ymonte edilmelidir.

Test örneğini transilüminatör ekranı üzerine ortaya gelecek şekilde yerleştiriniz.

Beyaz Işık Pedi

Beyaz ışık pedinin kullanılması gerekiyorsa, UV transilüminatörün yerine monte edilmelidir.

Test örneğini beyaz ışık pedinin üzerine ortaya gelecek şekilde yerleştiriniz.

Kenar Işık Ünitesi

Kenar ışık ünitesinin kullanılması gerekiyorsa, UV transilüminatörün yerine monte edilmelidir.

Örneği kenar ışık ünitesinin arkasındaki siyah şerit üzerine koyunuz.

Otomatik Görüntü Yakalama Modu

Otomatik görüntü yakalamaya Home ekranından da ulaşılabilmektedir. Standart görünümde, örnek tanımlama işlemi kolaylaştırılmıştır; fakat örnek çeşidinizi belirttiğinizde işlemin geri kalan kısmı Klasik görünümle aynıdır.

Standart Görünümü Kullanarak Otomatik Görüntü Yakalama Modu

1. Karanlık odanın kapısını açınız ve örneği yerleştiriniz.

2. Örnek çeşidinize göre devam ediniz:

2a. Örneğiniz jel ise,

(i) Başlangıç ekranından simgesini seçiniz. Jel listesi ekrana gelecektir.


JEL LİSTESİ

(ii) Listeden jel çeşidinizi seçiniz. Örnek boyutu kutusu ekrana gelecektir.

Not: The G:BOX F3 geribeslemeli bir lense sahip değildir. Dolayısıyla örnek boyutu kutusu ekrana gelmeyecektir.

ÖRNEK BOYUTU KUTUSU

(iii) Beliren menüdeki standartlardan size uygun olan örnek boyutunu seçiniz ya da örneğinizin boyutlarını santimetre cinsinden aşağıdaki Size kutularına yazınız.

(iv) OK butonunu seçiniz. Dye Selection (Boya Seçimi) ekranı görünecektir. Automatic Image Capture -‐ Step 2 Dye Selection (Otomatik Görüntü Yakalama – Adım 2 Boya Seçimi) kısmıyla devam ediniz.

2b. Örneğiniz Blot ise,


Note: G:BOX F3 kemilüminesans örneklerini görüntüleyememektedir.

(i) Başlangıç ekranından simgesini seçiniz. Blot listesi ekrana gelecektir.

BLOT LİSTESİ

(ii) Listeden blot çeşidinizi seçiniz.

(iii) Listeden Chemi Blot (Single Image)’i seçiniz. Örnek boyutu kutusu ekrana gelecektir.

(iv) Beliren menüdeki standartlardan size uygun olanı seçiniz ya da örneğinizin boyutlarını santimetre cinsinden aşağıdaki Size kutularına yazınız.

(v) OK butonunu seçiniz. Dye Selection (Boya Seçimi) ekrana gelecektir. Automatic Image Capture -‐ Blot / Chemi Selected at Select Single Image ile devam ediniz.

(vi) Beliren listeden Chemi Blot (Series)’i seçiniz. Örnek boyutu kutusu ekrana gelecektir.

(vii) Beliren menüdeki standartlardan size uygun olanı seçiniz ya da örneğinizin boyutlarını santimetre cinsinden aşağıdaki Size kutularına yazınız.

(viii) Ok butonunu seçiniz. Chemi Series Capture ekranı görüntüye gelecektir. Automatic Image Capture -‐ Blot / Chemi Selected at Select Series ile devam ediniz.

(ix) Beliren listeden Fluorescence Blot ya da Visible Blot’ı seçiniz. Örnek boyutu kutusu ekrana gelecektir.

(x) Beliren menüdeki standartlardan size uygun olanı seçiniz ya da örneğinizin boyutlarını santimetre cinsinden aşağıdaki Size kutularına yazınız.

(xi) Dye Selection (Boya Seçimi) ekrana gelecektir. Automatic Image Capture -‐ Dye Selection ile devam ediniz.


Standart Görünümü Kullanarak Manuel Görüntü Yakalama

Standart Görünümün Başlangıç ekranından manuel görüntü yakalama ile, klasik görünüm başlangıç ekranından manuel görüntü yakalama aynı şekilde olmaktadır. Manual Image Capture Mode (Manuel Görüntü Yakalama Modu)’a gidiniz.

Klasik Görünümü Kullanarak Otomatik Görüntü Yakalama

Otomatik görüntü modunun temelinde yapılandırılmış bir iş akışı oluşturan bir dizi adım vardır. Kullanıcı iş akışı aracılığıyla örneği ve bu örneğin nasıl görüntüleceğini tanımlayan bir dizi adımdan geçer. Bu sayede önceden ayarlanmış ışık çeşitlerini kullanarak yazılımın optimum donanımı seçmesi sağlanmış olur. Bir sonraki aşamaya geçerken ekranın sağ alt köşesinde bulunan yeşil ‘sıçrayan’ top iş akışını yönlendirmektedir. Gri durum çubuğu ise iş akışının ilerleme düzeyini göstermektedir. Herhangi bir simgenin seçilmesi iş akışını oluşturan aşamalar arasında hareket etmeyi kolaylaştırmaktadır.

Otomatik Görüntü Yakalama – Temel İş Akışı

Aşağıdaki görüntü, otomatik görüntü yakalama iş akışını göstermektedir. Her bir simge işlem sırasındaki bir basamağı temsil etmektedir.

Adım 1 Örnek seçimi Adım 4 Örnekyerleştirme (Jel / Blot / Diğer) (Tekli / Çoklu)

Adım 2 Boya seçimi Adım3 Protokol Seçimi (Tekli / Çoklu) OTOMATİK GÖRÜNTÜ YAKALAMA İŞ

AKIŞI ADIMLARI

Otomatik Görüntü Yakalama – Adım 1: Örnek Seçimi

1. Karanlık odanın kapısını açınız ve örneği yerleştiriniz.

2. Başlangıç ekranındaki simgesini seçiniz. Sample Selection – Sample Format (Örnek Seçimi -‐ Örnek Formatı) ekranı gelecektir.

OTOMATİK YAKALAMA ÖRNEK SEÇİMİ – ÖRNEK FORMATI EKRANI

OTOMATİK GÖRÜNTÜ YAKALAMA İŞ AKIŞI


JEL ÖRNEĞİ SEÇİMİ

3. Örnek formatı panelinde (Sample Format) Jel’i (Gel) seçiniz.

4. ‘Sıçrayan’ yeşil oku seçiniz. Sample Selection – Sample Type (Örnek Seçimi – Örnek Çeşidi) ekranı gelecektir.

OTOMATİK YAKALAMA ÖRNEK SEÇİMİ – ÖRNEK ÇEŞİDİ EKRANI

5. Örnek çeşidi panelinde görüntülenecek olan örneğin çeşidine bağlı olarak Protein, DNA ya da RNA’dan herhangi birini seçiniz.

5a. Proteini seçiniz.

(i) ‘Sıçrayan’ yeşil oku seçiniz. Sample Selection – Dye Type (Örnek Seçimi –Boya Çeşidi) ekranı görüntüye gelecektir.

OTOMATİK YAKALAMA ÖRNEK SEÇİMİ –BOYA ÇEŞİDİ EKRANI

(ii) Boya Çeşidi panelinde Fluorescent Dye ya da Visible Stain’i seçiniz.

(iii) ‘Sıçrayan’ yeşil oku seçiniz. Dye Selection ekranı görüntüye gelecektir. Automatic Image Capture -‐ Step 2 Dye Selection’la (Otomatik Görüntü Yakalama – Adım 2 Boya Seçimi) devam ediniz.

5b. DNA ya da RNA’yı seçiniz. (Şekilde DNA gösterilmektedir.)

(i) ‘Sıçrayan’ yeşil oku seçiniz. Sample Selection -‐ Matrix Type (Örnek Seçimi – Kalıp Çeşidi) ekranı görüntüye gelecektir.


OTOMATİK GÖRÜNTÜ YAKALAMA ÖRNEK SEÇİMİ – KALIP ÇEŞİDİ EKRANI

(ii) Kalıp çeşidi panelinde Acrylamide ya da Agarose’u seçiniz.

(iii) ‘Sıçrayan’ yeşil oku seçiniz. Dye Selection (Boya Seçimi) ekranı görüntüye gelecektir. Proceed to Automatic Image Capture -‐ Step 2 Dye Selection’la (Otomatik Görüntü Yakalama – Adım 2 Boya Çeşidi) devam ediniz.

BLOT ÖRNEĞİ SEÇİMİ

3. Sample Format (Örnek Formatı) panelinde Blot’u seçiniz. Sample Selection – Blot Type (Örnek Seçimi – Blot Çeşidi) ekranı görüntüye gelecektir.

OTOMATİK YAKALAMA ÖRNEK SEÇİMİ – BLOT ÇEŞİDİ EKRANI

4. Blot Type panelinde Chemi, Fluorescence ya da Visible’ı seçiniz.

5. Fluorescence ya da Visible’ı seçiniz. ‘Sıçrayan’ yeşil oku seçiniz. Dye Selection (Boya Seçimi) ekranı görüntüye gelecektir. Automatic Image Capture -‐ Step 2 Dye Selection (Otomatik Görüntü Yakalama – Adım 2 Boya Seçimi) ile devam ediniz.

Ya da

5. Chemi’yi seçiniz.

Not: Boya seçimi ekranının görüntülenmesi yapılan tercihlere bağlıdır. Önce Blot daha sonra Chemi seçilirse, değişik seçim ekranları görüntüye gelecektir ve iş akışında değişiklikler olacaktır. Automatic Image Capture -‐ Blot / Chemi Selected (Otomatik Görüntü Yakalama – Blot / Chemi Seçimi)başlığına bakınız.


STAIN FREE (LEKESİZ) ÖRNEK SEÇİMİ

3.Sample Format (Örnek Formatı) panelinden Stain Free (Lekesiz)’yi seçiniz.

OTOMATİK YAKALAMA ÖRNEK SEÇİMİ – STAIN FREE EKRANI

4. ‘Sıçrayan’ yeşil oku seçiniz.

5. Dye Selection (Boya Seçimi) ekranı görüntüye

gelecektir.

Otomatik Görüntü Yakalama – Adım 2 Boya Seçimi

GeneSys programı birçok uygulama için gerekli olan boya bilgilerine ait bir veritabanına sahiptir, floresans, kemilüminesans, kemifloresans ve görünür lekeler gibi. Görüntülenen boya seçimi daha önceki örnek seçimlerinize bağlıdır. Aşağıda bazı örnekler gösterilmiştir.

OTOMATİK YAKALAMA BOYA SEÇİMİ

Not: Örnek simgesi iş akışı çubuğuna eklenmiştir.


BOYA SEÇİMİ – BLOT İÇİN TİPİK / BOYA SEÇİMİ – BLOT İÇİN TİPİK/ FLORESAN BLOT SEÇİMİ GÖRÜNÜR BLOT SEÇİMİ

BOYA SEÇİMİ

• Daha önceki seçimlerinizle alakalı olarak GeneSys yazılımı veritabanında bulunan tüm boyalar yukarıdaki panelde bulunmaktadır. Bütün seçenekleri görmek için aşağı kaydırınız.

• Alt panel veritabanındaki uygun boyaların tam sayısını göstermektedir.

• Yukarıdaki panelde görülen boya seçimini sınırlamak için, Recent selections only (Sadece son zamanlarda seçilenler) kutusunu işaretleyiniz. Yalnızca son zamanlarda kullanılan boyalar ekrana gelecektir.

• Boyayı ismen aramak için Search for dye here... kutusunu kullanınız. Kutuya boyanın ismini giriniz.

• Seçilen boyalar kırmızıya döner ve aynı zamanda Selected Items panelinde görülebilir.

• Örnekte birden fazla boya kullanıldıysa, kullanılan her bir boyayı seçiniz. Çoklu seçmek istediğinizde beş boyaya kadar seçim yapabilirsiniz.

• Seçilen boyaları kaldırmak için Clear All butonuna basınız ve boya seçim işlemine yeniden başlayınız.

6. Boya(ları)nızı listeden seçiniz.

GeneSys PROGRAM OPTIMAL PROTOKOLÜNÜ KABUL EDİNİZ YA DA KENDİ PROTOKOLÜNÜZÜ SEÇİNİZ

• Şimdi Select Light and Filter kutusunu seçmek isterseniz, ‘sıçrayan’ yeşil oku

seçiniz , Protocol Selection ekranı görüntüye gelecektir. Automatic Image Capture -‐ Step 3 Protocol Selection (Otomatik Görüntü Yakalama – Adım 3 Protokol Seçimi) ile devam ediniz.

• Select Light and Filter kutusunu seçmeden devam edecekseniz, ‘sıçrayan’ yeşil

oku seçiniz, Protocol Selection (Protokol Seçimi) aşaması geçecek ve Sample Positioning (Örnek Konumlandırma) ekranı görüntüye gelecektir. Proceed to Automatic Image Capture Step 4 Sample Positioning ( Otomatik Görüntü Yakalama adım 4 Örnek Konumlandırma) ile devam ediniz.

• Select Light and Filter kutusunu seçmeyerek, GeneSys programının kabul ettiği

protokol otomatik olarak seçilmiş olur. Boya ve Protokol simgeleri, örnek konumlandırma ekranında iş akışına eklenmiş olacaktır.


Otomatik Görüntü Yakalama – Adım 3 Protokol Seçimi

GeneSys programı örneğiniz için optimal görüntüleme koşullarını ayarlayacaktır. Bunu yaparken de sisteminizin donanım ayarlarının yanı sıra seçilen boyaların eksitasyon ve emisyon eğrilerine bakarak, protokol olarak kaydetmek üzere bir dizi ayarlama yapmaktadır. Protokol Seçimi ekranı varsayılan ayar olarak mevcut olan en iyi görüntüleme setini ekrana getirmektedir.

TEK BOYA SEÇİLMİŞ BİRDEN FAZLA BOYA SEÇİLMİŞ

Not: Boyalar simgesi iş akışına eklenmiştir.

·∙ Mevcut görüntüleme koşullarını görüntülemek için More Options kutusunu işaretleyiniz.

BİRDEN FAZLA BOYA SEÇİMİ – DAHA FAZLA SEÇENEK İŞARETLENMİŞ

Not: Protokol panelinde yeşil okun görüldüğü yerler, Ethidium Bromide setinde görüldüğü gibi, olası tüm protokollerin görüntülenmesi için yatay kaydırmanın yapılması gerektiğini belirtmektedir.

BİRDEN FAZLA BOYA SEÇİMİ – HEPSİNİ GÖRMEK İÇİN KAYDIRINIZ

7. Bir ya da birden fazla protokol seçiniz.

• Seçilen protokoller kırmızıya döner.

• SYBR Green (SYBR Yeşili), SYBR Gold (SYBR Altın) gibi UV’den kaynaklanabilecek zararın önüne geçmek için mavi ışık kullanılarak görüntülenen güvenli boyaları görüntülemek için NonUV protocols only kutusunu işaretleyiniz.

• Bazı kombinasyonlar hata mesajının ekranda görülmesine sebep olabilir, örneğin:


FARKLI BİR FİLTRE SEÇİNİZ DONANIM BULUNAMADI

Not: Bu mesajları gördüğünüzde daha fazla yardım için Syngene ile iletişime geçiniz.

8. ‘Sıçrayan’ yeşil oku seçiniz. Örnek Konumlandırma ekranı görüntüye gelecektir.

Otomatik Görüntü Yakalama – Adım 4 Örnek Konumlandırma

Bu aşamada kamera canlıdır ve örneğinizin olduğu görüntü sol taraftaki panelde yer almaktadır. Örneğinizin görüntüsünü geliştirmek için kontroller bulunmaktadır. Bu sayede cihaz görüntüyü yakalamadan önce, görüntü kalitesini arttırma olanağına sahip olmaktasınız.

OTOMATİK GÖRÜNTÜ YAKALAMA ÖRNEK KONUMLANDIRMA

Not: Protokoller simgesi iş akışına eklenmiştir.

9. Örneği yerleştiriniz ve aşağıda anlatılan kontrol/fonksiyonları kullanarak önizleme örnek görüntüsünü geliştiriniz.

ÖRNEK GÖRÜNTÜSÜ – ZOOM YAPMA

• Digital Zoom slider ekrandaki görüntüyü yaklaştırmanıza ya da uzaklaştırmanıza olanak sağlamaktadır. Kaydırağı +’ya doğru sürüklemeniz yakınlaşmanıza, tersi yöne kaydırmanız ise uzaklaşmanıza yardımcı olmaktadır. Görüntünün bir bölümüne yakınlaşmanız ya da büyütmeniz, örneği hizalamanıza olanak sağlamaktadır.

IZGARA (GRİD) KULLANARAK ÖRNEĞİ HİZALAMA

• Grid butonu görüntünün üzerine bir ızgara koyarak, örneği daha iyi hizalamanıza yardımcı olmaktadır. Karanlık Odanın sağ tarafında bulunan kapıyı açma düğmesini kullanarak karanlık odanın kapısını yavaşça açınız. Bu örneği


hafifçe oynatarak ızgara korumasıyla hizalamanıza olanak sağlamaktadır. Grid butonuna basarak grid menüsüne ulaşabilirsiniz.

o No Grid seçeneği grid görüntüsünü kaldırmaktadır.

o Show Grid seçeneği varsayılan grid görüntüsünü ekrana getirmektedir ( 2

satır, 2 sütun).

o Gel Grid seçeneği çeşitli grid görüntülerini ekrana getirmektedir (pek çok satır ve pek çok sütun). Görüntüyü farklı parçalara bölmenize olanak sağlayarak, özellikle jel ya da blotta aynı anda birden fazla görüntülemenin olduğu durumlarda kullanışlıdır. Satır ve sütunları ayarlamak için, Gel Grid

seçeneğini seçerek, Edit grid layout simgesini tıklayınız.

o Gridlerin üzerindeki Enable / Disable butonları karanlık odada birden fazla örneğinizin olduğu durumlarda yakalamak istemediğiniz alanları etkisiz hale getirmek için kullanılmaktadır.

GRID MENÜSÜ JEL GRID TANIMLAMA

GRİD SEÇENEKLERİNİ GÖSTER JEL GRİD SEÇENEĞİ

NEUTRAL FIELDING KULLANARAK ÖRNEK GÖRÜNTÜ KALİTESİNİ ARTTIRMAK

·∙ Neutral Fielding seçeneği eşit olmayan aydınlatmada görüntüyü düzeltmenize olanak sağlamaktadır. Bu nispeten büyük bir örnekte bantları belirlerken soruna yol açmaktadır. Neutral field görüntüsü hafif aydınlatmalar için normalleştirilmiştir. Bu normalleştirme daha sonra jel görüntüsüne uygulanır, böylece ışık kaynağı tarafından oluşturulan ışık aydınlatmasına yöneliktir. Neutral Fielding ekranları ve ışık kombinasyonları hakkında detaylı bilgi için Tavsiye Edilen Işık / Boya / Aksesuar ve Diğer Uygulamalar Tablosu’na bakınız.

Neutral Fielding kutusunda, Use Neutral Fielding’i seçiniz.

Ekrana gelen mesajları takip ediniz.


TİPİK NEUTRAL FIELDING MESAJLARI

SEÇİLMİŞ ALANI KULLANARAK ÖRNEK GÖRÜNTÜ KALİTESİNİ ARTTIRMAK

Select AutoExpose Area fonksiyonu ilgilendiğiniz alanı seçerek kamera pozlamasını ayarlamak için kullanılmaktadır. Bu, bantların oldukça soluk olduğu görüntü alanının yükseltilmesi için de kullanılabilir. Yazılım seçilen alan için doğru poz ayarlarını belirlemektedir, bunun sonucunda da seçilen alanın iyi bir görüntüsü alınabilmektedir. Buna rağmen, bu işlemler soluk bantların daha görünür olmasını sağlarken, daha belirgin bantların da fazla pozlanmasına neden olabilir.

Select AutoExpose Area butonunu seçiniz. Bu örneğin görüntüsü üzerinde sarı bir kutunun belirmesine neden olacaktır. Bu sarı kutu sürüklenip, boyu yeniden ayarlanabilir.

OTOPOZ ALANI SEÇİCİ KUTUSU

Pozu ayarlamak için sarı kutunun dışındaki alanı da kullanma seçeneğine sahipsiniz. Bu eğer görüntünün çoğu soluksa ve sadece küçük bir alan düzgün bant içeriyorsa kullanışlıdır. Sarı kutu düzgün bantları içerecek şekilde konumlandırılabilir, daha sonra Use Area Outside ROI kutusu işaretlenebilir. Bu sayede pozlama sarı kutunun dışındaki alanı temel alacaktır.

ÖRNEK GÖRÜNTÜLEMEYİ ARTTIRMAK İÇİN AYDINLATMA & FİLTRE AYARLARI

Aydınlatma & Filtre fonksiyonu çekmecedeki örnekleri hizalamak için ek seçenekler

sunmaktadır. simgesini seçerek içerdeki beyaz ışıkları yakabilir, bu sayede çekmecedeki örneğin daha net görünmesini sağlayabilirsiniz. Beyaz ışıkları söndürmek için

yeniden simgesini seçiniz.


simgesini seçtiğinizde GeneSys yazılımını emisyon filtresini çıkarması için bilgilendirmiş olursunuz, bu sayede filtre artık kameranın önünde olmayacaktır. Şu an örneğin oldukça net görünmesi gerekmektedir. ‘Sıçrayan’ yeşil oka basıldığında yazılım otomatik olarak emisyon filtresini kameranın önüne yerleştirecektir.

LENS KONTROLLERİ

Not: Mevcut olan lens kontrolleri Odak (Focus), İris (Iris-‐aperture) ve Zoom’dur.

Mevcut olan lens kontrolleri Lens Control panelinde görülmektedir.

LENS KONTROL -‐ FOCUS LENS KONTROL -‐ IRIS

LENS CONTROL -‐ ZOOM

Focus seçildiğinde, kameranın odak düzlemi kaydırak yukarı / aşağı

hareket ettirilerek ya da tuşları kullanılarak hareket ettirilebilir. Kontrol değiştikçe, kaydırağın üzerindeki kutuda yer alan sayılar da değişecektir. Bu sayılar kontrol için bir referans teşkil etmektedir.

Iris seçildiğinde, kameranın açıklığı ya da kapak açıklığı kaydırağı yukarı /

aşağı hareket ettirerek ya da tuşlarını seçerek arttırılabilir / azaltılabilir.

/

/


Kontrol değiştikçe, yukarıdaki kutuda f sayıları olarak belirtilen sayılar da değişecektir. Bu sayılar zıttır, daha küçük sayılar daha büyük açıklık değerini gösterirken, daha büyük sayılar daha küçük açıklığı temsil etmektedir. Bu açıklık lensten sensöre geçen ışığın miktarını kontrol etmektedir. Daha geniş açıklıklar (daha küçük f sayıları), daha kısa pozlama süresine neden olurken, daha küçük açıklıklar (daha büyük f sayıları) daha uzun pozlama süresine neden olmaktadır.

Zoom seçildiğinde , kameraya bağlı olan örneğin fiziksel pozisyonu değişmektedir. Bu sayede kullanıcı çözünürlüğü arttırarak örneğin çok daha küçük bir parçasına konsantre

olabilmektedir. Bu kontrol kaydırağı yukarı / aşağı hareket ettirerek zemini alçaltıp /

yükselterek ya da tuşlarını seçerek yapılabilir.

Not: G:BOX F3 geribildirimli bir lense sahip değildir. G:BOX’ın bu modelinde de lens kontrolleri mevcuttur; ancak aynı derecede kontrol edilebilirliğe sahip değildir. Lens kontrol parametrelerinin uyarlanması, aşağıda gösterildiği gibi, UP/DOWN oklarıyla olmaktadır.

G:BOX F3 LENS KONTROLLERİ

10. ‘Sıçrayan’ yeşil oku seçiniz. Otomatik Yakalama ekranı görüntüye gelecektir.

OTOMATİK YAKALAMA EKRANI

Not: Konumlandırma simgesi iş akışına eklenmiştir.

Otomatik Yakalama ekranı, aşağıda belirtildiği gibi, birçok bilginin göründüğü ve kullanıcının seçebileceği eylemlerin olduğu bir ekrandır.

/


GEÇERLİ PROTOKOL KUTUSU

Geçerli Protokol kutusu kullanılan ışık ve filtre kombinasyonlarının bir özetidir ve pozlama bilgisini ekrana getirmektedir. Manuel pozlama seçilmişse pozlama zamanı, otomatik pozlama seçilmişse Otomatik Pozlama ekrana gelecektir.

GEÇERLİ PROTOKOL KUTUSU

GÖRÜNTÜ DOYGUNLUĞUNUN KONTROLÜ

Show Saturation butonunu seçiniz. Bu fonksiyon sayesimde görüntüde fazla pozlanan alanların olup olmadığını kontrol etmek için kullanılmaktadır. Fazla pozlanan beyaz bantlar görüntü üzerinde kırmızıyla vurgulanacaktır, fazla pozlanan siyah bantlar ise görüntü üzerinde maviyle vurgulanacaktır. Bu fonksiyon Select AutoExpose Area fonksiyonu kullanıldığında kullanışlıdır. Doymuş bantların ölçülebilir olmadığını unutmayınız.

Histogram butonunu seçiniz. Bu butonun seçilmesiyle kamera sensörü tarafından kaydedilen gri ölçek dağılımının histogram ya da grafik sunumu ekrana gelecektir.

HISTOGRAM GÖRÜNÜMÜ

Histogram simgesi , fonksiyonun seçildiğini belirtmek için kırmızıya dönecektir. Simgenin tekrar seçilmesi, fonksiyonu iptal edecektir.

Histogram her değişik yoğunluk değerinde görüntüdeki piksel sayısının gösterildiği bir grafiktir. 16-‐bitlik bir görüntü için oları 65535 adet değişik yoğunluk vardır, bu nedenle histogram bu grayscale değerleri arasında piksellerin dağılımını göstermek için 256 sayıyı grafiksel olarak gösterecektir. Grafik sol tarafta yığılmışsa, çok fazla grayscalein yakalanmadığını ve histogram grafiğindeki kırmızı çizgilerin bantları görmek için ayarlanması gerektiğini belirtmektedir. Grafik en sağa ulaşırsa bu görüntünün doymuş olabileceğini göstermektedir.


GÖRÜNTÜ KAYDIRAĞI KONTROLLERİ

Aşağıdaki kontroller yakalanan görüntünün ayarlanmasını sağlamaktadır.


Dijital Zoom kaydırağı ekrandaki görüntüye yaklaşıp uzaklaşmanızı sağlamaktadır. Kaydırağı +’ya doğru sürüklediğinizde yakınlaşır, -‐‘ye doğru sürüklediğinizde ise uzaklaşırsınız.

Gama kaydırağıgörüntünün tonunu değiştirmektedir. Daha önce bahsedilen histogram referans olarak alındığında, Gama fonksiyonu kaydedilen orta kademeli tonların parlaklığını çizelgenin karanlık ucuna ya da beyaz ucuna doğru çekerek değiştirmektedir. Bunu yaparken en uç değerleri değiştirmemektedir. Bu kaydedilen görüntüye ortalama bir koyuluk ya da açıklık vermektedir.

Kontrast görüntüdeki parlak vurguların ne kadar olduğunu ölçmektedir. Parlaklık ise bir görüntüdeki parlak gölgelerin ne kadar olduğunu ölçmektedir. Ekrandaki görüntüdeki en açık objelerin parlaklığını kontrol etmek için Kontrol kaydırağını kullanınız. Ekrandaki görüntüdeki koyu objelerin parlaklığını kontrol etmek için Parlaklık kaydırağını kullanınız.

Yaptığınız değişiklikleri geri almak için Reset simgesini kullanınız.

Görüntüyü ters çevirmek için görüntü çevirme düğmesini kullanınız. Bu düğmeyi seçtiğinizde beyaz siyah olarak, siyah da beyaz olarak görülecektir. Bu kaydıraklar kullanılılarak değişiklik yapıldığında yardımcı olabilir. Bu düğmeyi yeniden seçtiğinizde görüntü normale dönecektir.

YAKALANAN GÖRÜNTÜ BİLGİSİ

Görüntü Bilgisi simgesini seçiniz. Yakalanan görüntünün de olduğu bir ekran görüntüye gelecektir. Görüntüdeki bilgiler, aşağıdaki gibidir:

• Dye (Boya) • Image capture date / time (Görüntü yakalama tarihi / zamanı) • Filter (Filtre)

Gama kaydırağı

Kontrast & Parlaklık kaydırağı

Dijital Zoom kaydırağı

Reset düğmesi

Görüntü çevirme düğmesi


• Light (Işık) • Exposure time (Poz süresi) • Iris f number (İris f sayısı) • Image size (görüntü boyutu) • Range

IMAGE INFORMATION POP-‐UP PENCERESİ

Görüntü Bilgisi simgesi kırmızıya dönecektir. İkinci kez görüntü bilgisi simgesinin seçilmesi açılan pencereyi kapatacaktır.

Protokolü Kaydet simgesini seçerek görüntülenen ayarları yapılandırma (ya da protokol) veya tekrar eden iş akışı olarak kaydedebilirsiniz. YAPILANDIRMA – KAYDETME, AÇMA ve DÜZENLEME başlığına bakınız.

Otomatik Görüntü Yakalama – Görüntüyü Yakalama

11. Girilen ayarlarla bir görüntü yakalamak için, Yakala simgesine tıklayınız.

12. Cihaz görüntü yakalarken, aşağıdaki mesaj ekrana gelecektir.

AUTO EXPOSING MESAJI

Ekranın altında Pozlama zamanı simgesi bulunmaktadır. Simgenin etrafında renkli bir çubuk pozun ilerleme durumunu göstermektedir. Birden fazla pozlamanın olduğu durumlarda simgede birden fazla renk görülmektedir.

İşlem devam ederken, ki bu birkaç dakika sürebilir, Automatic Capture ekranından ayrılıp daha önce çekilmiş görüntülere bakabilir, onları düzenleyebilirsiniz. Bu esnada Exposure

Timing simgesi ekranın alt kısmında olmaya devam edecektir. Herhangi bir anda bu simgeyi tıklayarak, otomatik yakalama ekranına dönmek mümkündür. Görüntü yakalandıktan sonra, sol taraftaki panelde ve aynı zamanda Image Pool (Görüntü Havuzu) panelinde küçük resim halinde görülecektir. Daha fazla görüntü yakalandıkça, bu görüntüler de görüntü havuzunda görüntülenecektir. Görüntü havuzundaki görüntüler kaydedilmemiştir ve kırmızıyla çerçevelenmiştir.


GÖRÜNTÜ HAVUZUNDA KAYDEDİLMEMİŞ GÖRÜNTÜ

13. Yakalanan görüntüyü kaydetmek için, Image Pool’daki görüntüyü seçiniz ve ardından Kaydet

simgesine basınız.

Kaydedildikten sonra, görüntü havuzundaki görüntüler yeşille çerçevelenecektir ve dosya isimleri görüntünün altında görülebilecektir.

GÖRÜNTÜ HAVUZUNDA KAYDEDİLMİŞ GÖRÜNTÜ

Daha fazla görüntü yakalanmaya devam edilirse, görüntü havuzunda dikey olarak istiflenmiş ek görüntüler görülür.

Görüntüler, Kapat butonuna basıldığında görüntü havuzundan çıkarılmaktadır. Eğer bir görüntü henüz kaydedilmemişse kaydet uyarısı ekrana gelecektir.

KAYDET UYARISI

14. Hiçbiri kaydedilmeden birden çok görüntü yakalanırsa, tek bir işlemle birden fazla görüntü seçilip, kaydedilebilir. Görüntü havuzundan Multi Select Mode kutusunu seçip, görüntüleri seçiniz.

15. Seçilen görüntüleri kaydetmek için, Kaydet simgesini seçiniz.


Otomatik Görüntü Yakalama – Yakalamadan Sonraki Görüntü Eylemleri

Görüntü Eylemleri simgeleri seçilerek, yakalanan görüntüler üzerinde daha fazla işlem yapılabilir. Bu simgelerin fonksiyonları, bu kullanım kılavuzunun diğer kısımlarında anlatılmıştır.

Otomatik Görüntü Yakalama – Blot / Chemi

Otomatik Görüntü Yakalama – Adım 1 Örnek Seçimi’nde aşağıdaki seçimlerden herhangi birini yaptıysanız, aşağıdaki talimatlara uyunuz.

Sample Format panelinde Blot’ı seçiniz

Blot Type panelinde Chemi’yi seçiniz.

Not: 1. Adımda Blot ardından Chemi’yi seçmek iş akışında aşağıda detaylı bir şekilde anlatılan değişikliklerin olmasına neden olacaktır. 2. ve 3. adımların (Boya Seçimi ve Protokol Seçimi) yerine aşağıdaki talimatlara uyunuz. Daha sonra 4. Adım olan örnek konumlandırmaya yeniden dönmeniz gerektiğini unutmayınız.

ÖRNEK SEÇİMİ -‐ BLOT -‐ CHEMI – YAKALAMA METODU EKRANI

6. Capture Method (Yakalama Metodu) panelinde Auto (Single) or Series’i seçiniz.

6a. Auto (Single) ı seçiniz.

(i) ‘Sıçrayan’ yeşil oku seçiniz. Dye Selection (Boya Seçimi) ekranı görüntüye gelecektir.

IMAGE ACTION SİMGELERİ

Kaydet simgesi

Çıktı Al simgesi

Düzenle simgesi

Protokolü Kaydet simgesi

Analiz simgesi

Görüntüleri İncele simgesi


BLOT -‐ CHEMI -‐ AUTO (SINGLE) – BOYA SEÇİM EKRANI

Not: Örnekler simgesi iş akışına eklenmiştir.

Blot -‐ Chemi -‐ Auto (Single) – Boya Seçimi ekranı aşağıda anlatılacağı gibi, bir dizi seçenek içermektedir.

ÜST PANEL

Varsayılan olarak üst panel veritabandaki bütün kemiluminesans substratlarını göstermektedir. Bütün seçenekleri görmek için aşağı kaydırınız. Seçilen substrat kırmızıya dönmektedir.

ORTA PANEL

Seçilen substratlar Selected Items panelinde görülmektedir. Seçilen substratları kaldırmak için Clear All butonunu seçiniz ve substrat seçimine yeniden başlayınız.

Örneğinizde kolorimetrik marker kullandıysanız, Visible marker kutusunu işaretleyiniz. GeneSys programı otomatik olarak biri örneğiniz için, diğeri marker için (beyaz ışık ile) olmak üzere iki ayrı görüntü alacaktır. Daha sonra bu iki görüntüyü birbiriyle birleştirecektir.

ALT PANEL

Alt panel, veritabanında bulunan kemilüminesans substratlarının toplamını göstermektedir.

Üst panelde görüntülenen kemilüminesans sustratları sınırlamak için, Recent selections only kutusunu işaretleyiniz. Yalnızca son zamanlarda kullanılan kemilüminesans substratlar görüntülenecektir.

Substratları ismen aramak için Search for dye here... kutusunu seçiniz. Substratın ismini kutuya giriniz.

(ii) Direkt olarak ya da arayarak, substratınızı seçiniz.

(iii) Kolorimetrik belirteç kullandıysanız Visible Marker kutusunu işaretleyiniz.


BLOT -‐ CHEMI -‐ AUTO (SINGLE) – BOYA SEÇİM EKRANI – BOYA SEÇİLDİ

(iv) ‘Sıçrayan’ yeşil oku seçiniz. Örnek Konumlandırma ekranı görüntüye gelecektir. See Automatic Image Capture -‐ Step 4 Sample Positioning ( Otomatik Görüntü Yakalama – Adım 4 Örnek Konumlandırma) başlığına bakınız.

6b. Series’i seçiniz.

(i) ‘Sıçrayan’ yeşil oku seçiniz. Chemi Series Capture ekranı görüntüye gelecektir.

CHEMI SERIES CAPTURE EKRANI

Not: Örnekler simgesi iş akışına eklenmiştir. Standart görünüm Home ekranından buraya geldiyseniz, Örnekler simgesi iş akışına eklenmemiştir.

Chemi Series Capture ekranı aşağıda anlatılacağı gibi bir dizi seçenek içermektedir:

SOL ÜST PANEL

Sol üst panel reaktör / substrat seçiminiz için ve kolorimetrik marker kullanıp kullanmadığınızı belirten bir seçenek içermektedir.

Reagent butonunu seçerek, dökülen listeden substratınızı seçiniz.


REAKTÖR/SUBSTRAT LİSTESİ

Örnekte kolorimetrik bir marker kullandıysanız Visible marker kutusunu işaretleyiniz. GeneSys programı otomatik olarak biri örneğiniz için diğeri marker (beyaz ışıkla) için olmak üzere iki görüntü alacaktır, daha sonra bu iki görüntüyü birleştirecektir.

SOL ALT PANEL

Sol alt panel kaç tane görüntü yakalamk istediğinizi seçmeniz, kullanmak istediğiniz binning seviyesini ve bütün görüntüleri çoklu görüntü yakalama işlemine eklemek isteyip istemediğinizi seçmeniz için birçok seçenek içermektedir.

Görüntü sayısı selektöründeki artı ve eksi tuşlarını kullanarak, örneğinizden kaç tane görüntü almak istediğinizi ayarlayabilirsiniz. Sayıyı arttırmak için artıyı, azaltmak için eksiyi kullanınız.

Binning fonksiyonu görüntü yakalama sürelerini geliştirmek için bir yoldur. Görüntü sensöründeki bitişik pikselleri kare gruplar halinde, 2x2, 3x3, 4x4 gibi, birleştirerek, sayıca küçültülen pikseller etkin bir şekilde genişletilir. Veri okuma işlemlerinin azalmasına bağlı olarak daha hızlı görüntü yakalamaya olanak sunar.

Binning butonunu seçiniz ve ardında açılan listeden kullanmak istediğiniz binning oranını seçiniz.

BINNING ORANI AÇILIR LİSTE


Sol alt panel aynı zamanda Reset (Sıfırla) ve Proceed (Devam et) butonlarını da içermektedir.

(ii) Substratınızı seçiniz.

(iii) Kolorimetrik bir marker kullandıysanız Visible Marker kutusunu işaretleyiniz.

(iv) Görüntü sayısı kutusunda, yakalamak istediğiniz görüntü sayısını seçiniz.

(v) Binning kutusunda ihtiyacınız olan binning seçeneğini seçiniz.

(vi) Birden fazla görüntü alarak, onları tek bir görüntüde birleştirmek istediğinizde Add contents of previous image (Bir önceki görüntünün içeriğini ekle) kutusunu işaretleyiniz.

(vii) Sağ taraftaki panelde mevcut olan seçenekleri görmek için Next simgesini

seçiniz. Bu işlemi yaptığınızda Next butonu bu şekilde görülecektir. Aynı

zamanda Reset tuşu da bu şekilden dönüşecektir.

SAĞ TARAFTAKİ PANEL

Sağ taraftaki panel, görüntü yakalamanız için pozlama zamanını ayarlamaya yarayan basit kontrolleri içermektedir. Birden fazla görüntü alacaksanız, Use the same exposure for all images kutusunu işaretlemeniz durumunda serideki her görüntü için ayarladığınız poz zamanı kullanılacaktır. Bu seçenek yalnızca sol paneldeki Proceed butonunu seçmeniz durumunda ekrana gelecektir.

Exposure kontrolleri artı/eksi butonlarıyla sırasıyla şu zaman dilimlerini ayarlamanızı sağlar; saat (h), dakika (m), saniye (s) ve milisaniye (ms) .

POZ KONTROLLERİ – TEK GÖRÜNTÜ YA DA HER GÖRÜNTÜ İÇİN AYNI SEÇİLMİŞ

(viii) Bir serideki bütün görüntülerin aynı poz zamanına sahip olmasını istediğinizde, Use the same exposure for all images kutusunu işaretleyiniz.

(ix) Her bir görüntü için farklı poz zamanı ayarlamak istediğinizde, Use the same exposure for all images kutusunu işaretlemeden bırakınız.

(x) Exposure artı/eksi tuşlarını kullanarak serideki her görüntü için farklı poz süresi girebilirsiniz. Görüntü numarası seçmek için Exposure’ın altındaki okları kullanınız ve her bir görüntü için poz süresini ayarlayınız.

, bu şekle


EXPOSURE KONTROLLERİ – FARKLI SÜRELERE SAHP BİRÇOK GÖRÜNTÜ

(xi) Sağ taraftaki panelde yapılan herhangi bir ayarlamayı iptal etmek için, Reset

tuşunu seçiniz. Bu işlemi yaptığınızda Reset butonu bu şekilde görülecektir.

Aynı zamanda Next butonu bu şekilden dönüşecektir ve sağ taraftaki panelde yer alan seçenekler görünmez hale gelecektir. Bu sayede siz sol paneldeki seçeneklerde değişiklik yapabilir hale geleceksiniz.

(xii) Her iki panelde de değişiklik yapmayı bitirdiğinizde, ‘sıçrayan’ yeşil oku seçiniz. Örnek Konumlandırma ekranı görüntüye gelecektir. Otomatik Görüntü Yakalama – Adım 4 Örnek Konumlandırma başlığına bakınız.

Manuel Görüntü Yakalama Modu

Bu mod, G:BOX cihazını kullanırken kullanıcının her fonksiyonun kontrolünü elinde bulundurmasını sağlamaktadır. Manuel görüntü yakalama alışılmadık görüntüleme uygulamaları için ya da kullanıcının kullanmak istediği parametreleri bildiği durumlarda kullanışlıdır.

Manuel görüntü yakalama modunda, aşağıdaki seçenekler olasıdır:

• Single Image – örneğinizin tek bir görüntüsünü almak için kullanılır.

• Series Images – örneğinizin farklı görüntülerini seri olarak almak için kullanılır. Bunu yaparken her bir yakalama içn aynı ya da farklı poz/filtre/ışık ayarı kullanılmaktadır. Farklı poz ayarları kullanarak seri halinde görüntü yakalayabilir, sonuçları karşılaştırabilir, yakalanan en iyi görüntüyü kaydedebilir ve istemediğiniz görüntüleri silebilirsiniz.

• Additive Series – örneğinizin farklı görüntülerini seri halinde almak için kullanılır. Bunu yaparken her bir yakalama için aynı ya da farklı poz/filtre/ışık ayarı kullandığınızda bunların hepsi tek bir görüntüde bir araya getirilir.

• Multiplex – Örneğinizin seri görüntüsünü almak için kullanılır. Bunlar, her bir yakalama için değişik poz/filtre/ışık ayarı kullanılarak yakalanır ve daha sonra ayrı olarak ve tek bir görüntü olarak ekrana getirilir. Örnek üzerinde birden fazla florofor kullanıldığında kullanılır.

bu şekle


Manuel Görüntü Yakalama – Başlangıç

1. Karanlık odanın kapısını açınız ve karanlık odaya ya siyah yansıtmaz cam ya da transilüminatör yerleştiriniz.

2. Daha önce anlatıldığı şekilde, kuralları takip ederek örneği konumlandırınız.

3. Başlangıç ekranındaki Manuel Yakalama simgesini seçiniz. Temel manuel yakalama ekranı görüntüye gelecektir.

MANUEL YAKALAMA – TEMEL EKRAN -‐ VARSAYILAN

Not: Manuel yakalama ekranı varsayılan olarak Single Image (Tek Görüntü) modunda başlamaktadır.

Lens Kontrolleri, aşağıda da gösterildiği gibi, ekran üzerindeki herhangi bir noktaya sürüklenip bırakılabilir.

MANUEL YAKALAMA – TEMEL EKRAN – LENS KONTROLLERİ

4. Mevcut olan görüntü yakalama seçeneklerini görmek için butonunu seçiniz. Sağ taraftaki panelde görüntü yakalama (Image Capture) seçenekleri görüntüye gelecektir.


MANUEL YAKALAMA EKRANI – GÖRÜNTÜ YAKALAMA SEÇENEKLERİ

5. Sağ taraftaki paneldeki seçeneklerden yapmak istediğiniz görüntü yakalama çeşidini seçiniz.

GÖRÜNTÜ YAKALAMA SEÇENEKLERİ

• Tek bir görüntü yakalamak için Single Image butonuna basınız. Manuel Görüntü Yakalama – Tek Görüntü başlığına bakınız.

• Her biri için değişik ayar olacak şekilde seri halinde görüntü yakalamak için, Series butonuna basınız. Manuel Görüntü Yakalama – Seriler başlığına bakınız.

• Her biri için aynı ya da farklı ayar olacak şekilde bir dizi görüntü yakalayıp, bunları tek bir görüntüde birleştirmek için Additive Series butonuna basınız. Manuel Görüntü Yakalama-‐ Eklemeli Seriler başlığına bakınız.

• Her biri için değişik ayar olcak şekilde, daha sonra her biri ayrı görüntülenecek görüntü yakalamak için Multiplex butonuna basınız. Manuel Görüntü Yakalama – Multipleks başlığına bakınız.

Manuel Görüntü Yakalama – Tekli Görüntü

Not: Tekli görüntü, Image Capture seçeneklerine giriş yapmaya gerek kalmadan direkt olarak Manuel Görüntü Yakalama ekranından yakalanabilir.

6. Tekli görüntü ayarlarını Manuel Görüntü Yakalama ekranından direkt olarak da yapabileceğiniz gibi, Image Capture seçeneklerinden Single Image butonunu seçerek de yapabilirsiniz.


MANUEL YAKALAMA –TEKLİ GÖRÜNTÜ SEÇİLMİŞ

7.Sağ taraftaki panelde yer alan Lighting and Filters (Aydınlatma ve Filtreler) fonksiyonuyla ışık ve filtre ayarlarınızı yapınız.

IŞIK ve FİLTRE FONKSİYONLARI

(i) Lighting butonunu seçiniz ve açılan menüden tercih ettiğiniz ışığı seçiniz.

AÇILIR IŞIK MENÜSÜ

(ii) Filters butonunu seçiniz ve açılan menüden tercih ettiğiniz filtreyi seçiniz.


AÇILIR FİLTRE MENÜSÜ

Not: On initially calling up the Manual Capture screen the Neutral Fielding function in the right

hand pane will have been displaying the following; . Aydınlatma ve Filtre

seçimlerinizi yaptığınızda, Neurtal Fielding fonksiyonu aşağıdaki gibi değişecektir; 8. Örneği konumlandırınız ve örnek görüntünün önizlemesini mümkün olduğunca geliştirmek için,

kontrolleri/fonksiyonları aşağıda anlatıldığı gibi kullanınız.

ÖRNEK ÖNİZLEME GÖRÜNTÜLEMEYİ GELİŞTİRMEK İÇİN AYDINLATMA

Aydınlatma fonksiyonu, örneğin daha iyi hizalanması için karanlık odanın içine aydınlatma

sağlamaktadır. simgesini seçtiğinizde iç aydınlatma açılarak, karanlık odadaki örnek

için daha iyi bir görünürlük sağlanır. simgesini yeniden seçtiğinizde beyaz ışıklar kapatılır.

ÖRNEK GÖRÜNTÜLEME ZOOM

• Digital Zoom kaydırağı ekrandaki görüntüye yaklaşıp uzaklaşmanıza olanak sağlamaktadır. Kaydırağı +’ya doğru sürüklediğinizde yaklaşmış, -‐‘ye doğru sürüklediğinizde uzaklaşmış olursunuz. Yaklaşma ya da görüntünün bir alanını büyütme size örneği daha düzgün bir biçimde hizalama olanağı vermektedir.

GRID (IZGARA) KULLANARAK ÖRNEK HİZALAMA

• Grid butonu örneğin üzerine grid koyarak, örneğinizi daha iyi hizalamanıza yardımcı olmaktadır. Karanlık Odanın sağ tarafında bulunan kapıyı açma düğmesini kullanarak karanlık odanın kapısını yavaşça açınız. Bu örneği hafifçe oynatarak ızgara korumasıyla hizalamanıza olanak sağlamaktadır. Grid butonuna basarak grid menüsüne ulaşabilirsiniz.

o No Grid seçeneği grid görünümünü kaldırmaktadır.

o Show Grid seçeneği, varsayılan grid görünümünü ekrana getirmektedir ( 2 satır x 2 Sütun)


o Gel Grid seçeneği çeşitli grid görüntülerini ekrana getirmektedir (pek çok satır ve pek çok sütun). Görüntüyü farklı parçalara bölmenize olanak sağlayarak, özellikle jel ya da blotta aynı anda birden fazla görüntülemenin olduğu durumlarda kullanışlıdır. Satır ve sütunları ayarlamak için, Gel Grid

seçeneğini seçerek, Edit grid layout simgesini tıklayınız.

o Gridlerin üzerindeki Enable / Disable butonları karanlık odada birden fazla örneğinizin olduğu durumlarda yakalamak istemediğiniz alanları etkisiz hale getirmek için kullanılmaktadır.

GRID MENÜSÜ JEL GRID TANIMLAMA

GRİD SEÇENEKLERİNİ GÖSTER JEL GRİD SEÇENEKLERİ

NEUTRAL FIELDING KULLANARAK ÖRNEK GÖRÜNTÜ KALİTESİNİ ARTTIRMAK

·∙ The Neutral Fielding seçeneği size eşit olmayan aydınlatmayı düzeltme olanağı sağlamaktadır. Bu nispeten büyük bir örnekte bantları belirlerken soruna yol açmaktadır. Neutral field görüntüsü hafif aydınlatma için normalleştirilmiştir. This normalisation is then applied to the gel image, such that uneven light illumination generated by the light source is addressed. Neutral Fielding ekranları ve aydınlatma kombinasyonları için Tavsiye Edilen Işık / Boya / Aksesuar ve Diğer Uygulamalar Tablosuna bakınız.

Neutral Fielding kutusunda, Use Neutral Fielding’i işaretleyiniz.

Ekrana gelen mesajları takip ediniz.


TİPİK NEUTRAL FIELDING MESAJLARI

SEÇİLMİŞ BİR ALANI KULLANARAK ÖRNEK GÖRÜNTÜ KALİTESİNİ ARTTIRMAK

Select AutoExpose Area fonksiyonu kamerayı ayarlamk için ilgilendiğiniz alanı seçmenize olanak sağlamaktadır. Bu bantların oldukça soluk olduğu görüntü alanının yükseltilmesi için de kullanılabilir. Yazılım seçilen alan için doğru poz ayarlarını belirlemektedir, bunun sonucunda da seçilen alanın iyi bir görüntüsü alınabilmektedir. Buna rağmen, bu işlemler soluk bantların daha görünür olmasını sağlarken, daha belirgin bantların da fazla pozlanmasına neden olabilir.

butonunu seçiniz. Bu örneğin görüntüsü üzerinde sarı bir kutunun belirmesine neden olacaktır. Bu sarı kutu sürüklenip, boyu yeniden ayarlanabilir.

AUTOEXPOSE KUTUSU

Pozu ayarlamak için sarı kutunun dışındaki alanı da kullanma seçeneğine sahipsiniz. Bu eğer görüntünün çoğu soluksa ve sadece küçük bir alan düzgün bant içeriyorsa kullanışlıdır. Sarı kutu düzgün bantları içerecek şekilde konumlandırılabilir, daha sonra Use Area Outside ROI kutusu işaretlenebilir. Bu sayede pozlama sarı kutunun dışındaki alanı temel alacaktır.

LENS KONTROLLERİ

Not: Mevcut olan lens kontrolleri Odak (Focus), İris (Iris, aperture) ve Zoom’dur.

Mevcut olan kontroller Lens Control panelinde görülmektedir.


LENS KONTROLÜ -‐ ODAK LENS KONTROLÜ -‐ IRIS

LENS KONTROLÜ -‐ ZOOM

Odak seçildiğinde, kameranın odak düzlemi kaydırak yukarı / aşağı

hareket ettirilerek ya da tuşları kullanılarak hareket ettirilebilir. Kontrol değiştikçe, kaydırağın üzerindeki kutuda yer alan sayılar da değişecektir. Bu sayılar kontrol için bir referans teşkil etmektedir.

Iris seçildiğinde, kameranın açıklığı ya da kapak açıklığı kaydırağı yukarı /

aşağı hareket ettirerek ya da tuşlarını seçerek arttırılabilir / azaltılabilir. Kontrol değiştikçe, yukarıdaki kutuda f sayıları olarak belirtilen sayılar da değişecektir. Bu sayılar zıttır, daha küçük sayılar daha büyük açıklık değerini gösterirken, daha büyük sayılar daha küçük açıklığı temsil etmektedir. Bu açıklık lensten sensöre geçen ışığın miktarını kontrol etmektedir. Daha geniş açıklıklar (daha küçük f sayıları), daha kısa pozlama süresine neden olurken, daha küçük açıklıklar (daha büyük f sayıları) daha uzun pozlama süresine neden olmaktadır.

/

/


Zoom seçildiğinde , kameraya bağlı olan örneğin fiziksel pozisyonu değişmektedir. Bu sayede kullanıcı çözünürlüğü arttırarak örneğin çok daha küçük bir parçasına konsantre

olabilmektedir. Bu kontrol kaydırağı yukarı / aşağı hareket ettirerek zemini alçaltıp /

yükselterek ya da tuşlarını seçerek yapılabilir.

Not: G:BOX F3 geribildirimli lense sahip değildir. G:BOX’ın bu modelinde de lens kontrolleri mevcuttur; ancak aynı derecede kontrol edilebilirliğe sahip değildir. Lens kontrol parametrelerinin uyarlanması, aşağıda gösterildiği gibi, UP/DOWN oklarıyla olmaktadır.

G:BOX F3 LENS KONTROLLERİ

9. Örneğinizi görüntülemek için kullanmak istediğiniz kamera çözünürlüğünü seçiniz.

Binning fonksiyonu görüntü yakalama sürelerini geliştirmek için bir yoldur. Görüntü sensöründeki bitişik pikselleri kare gruplar halinde, 2x2, 3x3, 4x4 gibi, birleştirerek, sayıca küçültülen pikseller etkin bir şekilde genişletilir. Veri okuma işlemlerinin azalmasına bağlı olarak daha hızlı görüntü yakalamaya olanak sunar.

Binning butonunu seçiniz ve açılan listeden kullanmak istediğiniz binning oranını belirleyiniz.

BINNING ORANI AÇILIR LİSTESİ

/


10. Şu an örneğinizi görüntülemeye hazırsınız. Bu aşamada iki seçeneğiniz bulunmaktadır; GeneSys programının pozlama süresini otomatik olarak ayarlamasına izin verebilir ya da bu süreyi siz kendiniz ayarlayabilirsiniz.

MANUEL YAKALAMA -‐ OTO-‐POZLAMA İLE TEKLİ GÖRÜNTÜ

11a. Otomatik Yakalama simgesini seçiniz.

Girmiş olduğunuz ayarlara göre GeneSys programı en iyi pozlama süresine karar verecektir. Bu sefer sağ taraftaki panelde Exposure fonksiyonunda görülecektir. Bu fonksiyon görüntününün bozulmadan mevcut olan gri ölçeklerin yakalanması için tasarlanmıştır. Bu fonksiyon verilerin miktarını belirlemede kullanılmaktadır.

Cihaz bir görüntü yakalarken, aşağıdaki mesaj kutusu ekrana gelecektir:

OTO-‐POZLAMA MESAJ KUTUSU

simgesi ekranın altında görüntüye gelecektir. Pozlamanın ilerleme durumunu simgenin etrafındaki renklerle belli etmektedir.

Pozlama devam ederken, bu işlem birkaç dakika sürebilir, manuel yakalama ekranından uzaklaşmak, daha önceden çekilen görüntüleri incelemek ve düzenlemek mümkündür.

Görüntü yakalandığında, sol taraftaki panelde ve aynı zamanda ortadaki görüntü havuzunda küçük resim olarak görülecektir. Görüntü havuzundaki görüntüler kaydedilmemiştir ve kırmızıyla çerçevelenmiştir.

GÖRÜNTÜ HAVUZUNDAKİ KAYDEDİLMEMİŞ GÖRÜNTÜ

11b. Görüntüyü kaydetmek için, görüntü havuzundaki görüntüyü seçiniz ve Kaydet simgesine tıklayınız .

Görüntü kaydedildikten sonra, görüntü havuzundaki görüntüler yeşille çerçevelenecektir ve dosya isimleri görüntünün altında belirecektir.


GÖRÜNTÜ HAVUZUNDAKİ KAYDEDİLMİŞ GÖRÜNTÜ

Daha fazla görüntü yakalandığında, eklenen görüntüler üstüste dizilmiş olarak görüntü havuzunda görülecektir.

Görüntüler seçildikten sonra simgesi seçilerek görüntü havuzundan çıkarılabilmektedir. Görüntü kaydedilmemişse, kaydet uyarısı ekrana gelecektir.

KAYDET UYARISI

(i) Hiçbiri kaydedilmeden birden çok görüntü yakalanırsa, tek bir işlemle birden fazla görüntü seçilip, kaydedilebilir. Görüntü havuzundan Multi Select Mode kutusunu seçip, görüntüleri seçiniz.

(ii) Seçilen görüntüleri kaydetmek için, Kaydet simgesini seçiniz.

MANUEL YAKALAMA – MANUEL POZLAMA İLE TEKLİ GÖRÜNTÜ

11a. Bir pozlama zamanı ayarlayınız:

Exposure kontrolleri sırasıyla şu zaman dilimlerini ayarlamak için kullanılan basit + / -‐ butonlarıdır; saat (h), dakika (m), saniye (s) ve milisaniye (ms)

MANUEL EXPOSURE KONTROLÜ

Exposure + / -‐ tuşlarını kullanarak, görüntü için bir pozlama zamanı giriniz.

11b. Capture simgesini seçiniz.


Cihaz görüntü yakalarken, aşağıdaki mesaj ekrana gelecektir.

AUTO EXPOSING MESAJI

simgesi ekranın altında görüntüye gelecektir. Pozlamanın ilerlemesine göre simgenin etrafındaki renkte değişiklikler görülecektir.

Pozlama devam ederken, bu işlem birkaç dakika sürebilir, Manual Capture ekranından ayrılıp daha önce yakaladığınız görüntüleri inceleyebilir, düzenleyebilirsiniz.

Görüntü yakalandıktan sonra, sol taraftaki panelde ve görüntü havuzu panelinde ortada küçük resim şeklinde görülecektir. Daha fazla görüntü yakalanması durumunda, bu görüntüler de görüntü havuzunda görülebilecektir. Görüntü havuzundaki görüntüler kaydedilmemiştir ve kırmızıyla çerçevelenmiştir.


11c.Yakalanan görüntüyü kaydetmek için, görüntü havuzundaki görüntüyü seçiniz ve Kaydet simgesini seçiniz.

Görüntü kaydedildikten sonra görüntü havuzundaki görüntüler yeşille çerçevelenecektir ve dosya isimleri görüntünün altında belirecektir.


Daha fazla görüntü yakalandığında, eklenen görüntüler üstüste sıralanmış halde görüntü havuzunda görülecektir.


Görüntüler seçildikten sonra simgesi seçilerek görüntü havuzundan çıkarılabilmektedir. Görüntü kaydedilmemişse, kaydet uyarısı ekranda görülecektir.

KAYDET UYARISI



Manuel Görüntü Yakalama – Seriler

6. Image Capture seçeneklerinden Series butonunu seçiniz.

Serinizde istediğiniz görüntü sayısını belirtmeniz gerekmektedir. Sağ taraftaki panelde Number of images (Görüntü Sayısı) selektörü ekrana gelecektir.

GÖRÜNTÜ SAYISI SEÇİMİ

7. Yakalamak istediğiniz görüntünün sayısını + / -‐ tuşlarını kullanarak seçiniz, daha sonra Next okunu seçiniz. Bu örnekte + tuşu kullanılarak 3’e ayarlandığı görülmektedir. Görüntü seriniz için kamera çözünürlüğünü tanımlamanız gerekmektedir. Sağ taraftaki panelde Binning seçeneği görülmektedir.

BINNING SELEKTÖRÜ

8. No Binning (9.13MP) butonunu seçinizve açılan listeden kullanmak istediğiniz binning oranını

seçerek Next okunu tıklayınız. Tam çözünürlüğü seçmek istediğinizde yalnızca Next

okunu seçiniz.



9. Bu aşamada zaman aralığını (serilerdeki yakalama arasındaki süre), her bir görüntü için pozlama süresini ve aydınlatma / filtre ayarlarını belirlemeniz gerekmektedir. Bunların kontrolleri sağ taraftaki panelde yer almaktadır.

SERİ POZ KONTROLLERİ – İLK GÖRÜNTÜ SERİ POZ KONTROLLERİ – BİR ÖNCEKİYLE AYNI İKİNCİ GÖRÜNTÜ


SERİ POZ KONTROLLERİ – BİR ÖNCEKİYLE AYNI ÜÇÜNCÜ GÖRÜNTÜ

Ekran, serideki her görüntü için hemen hemen aynıdır ve varsayılan olarak 1. Görüntüdeki gibi başlamaktadır. Capture Interval kontrolleri sırasıyla şu zaman dilimlerini ayarlamak için kullanılan oldukça basit + / -‐ tuşlarından oluşmaktadır; saat (h), dakika (m), saniye (s) ve milisaniye (ms).

Capture Interval + / -‐ tuşlarını kullanarak seri görüntülerin zaman aralığını giriniz.

Manuel Exposure kontrolleri sırasıyla şu zaman dilimlerini ayarlamk için kullanılan oldukça basit + / -‐ tuşlarından oluşmaktadır; saat (h), dakika (m), saniye (s) ve milisaniye (ms).

Pozlama zamanını manuel olarak ayarlamak için Manual butonunu seçiniz ve ilk görüntü için Exposure + / -‐ tuşlarını kullanarak bir pozlama zamanı giriniz. Alternatif olarak, aydınlatma ve filtreleri seçtikten sonra Auto tuşuna bastığınızda, sistem o görüntü için otomatik olarak en uygun pozlama zamanını belirleyecektir.

Sağ taraftaki Lighting and Filters fonksiyonlarını kullanarak, daha önce de belirtildiği gibi aydınlatma ve filtre seçimlerinizi yapabilirsiniz.

10. İkinci görüntü için ayarlama yapmak için Next okunu seçiniz. İlk görüntü için yapmış

olduğunuz ayarları kalan görüntülere de uygulamak için Last okunu seçiniz. 14. adıma geçiniz.

11. Varsayılan olarak Same as previous kutusu işaretlenmiştir, bu sayede ikinci görüntü birinci görüntüyle aynı ayarlara sahiptir ve ayarlama kutuları elle herhangi bir değişikliğin yapılamayacağını belirtmek için gri renklidir. İkinci ve diğer görüntüler için değişiklik yapmak istediğinizde, Same as previous kutusunun işaretini kaldırmanız gerekmektedir.

12. Serinizdeki tüm görüntüler için ayarları giriniz.

13. Next okunu seçiniz.

14. Neutral Fielding seçeneği mevcutsa, aydınlatma / filtre seçimlerinize bağlı olarak, Neutral Fielding’i kullanıp kullanmamak sizin seçiminize bağlıdır.


Neutral Fielding seçeneği size eşit olmayan aydınlatmayı düzeltme olanağı sağlamaktadır. Bu nispeten büyük bir örnekte bantları belirlerken soruna yol açmaktadır. Neutral field görüntüsü hafif aydınlatma için normalleştirilmiştir. Neutral Fielding ekranları ve aydınlatma kombinasyonları için Tavsiye Edilen Işık / Boya / Aksesuar ve Diğer Uygulamalar Tablosu’na bakınız.

MANUEL SERİLER – NEUTRAL FIELDING

Neutral Fielding uygulaması için, Use Neutral Fielding kutusunu işaretledikten sonra, Next

simgesini seçiniz ve ekrana gelen mesajları takip ediniz.

15. Yapmış olduğunuz poz/ zamanlama/ ışık / filtre seçimleri, geçerli protokol ayarı olarak kabul edilecek ve sağ taraftaki panelde görüntülenecektir.

SERİ PROTOKOLLERİ

16. Örneği konumlandırınız ve önizleme görüntüsünü daha önce detaylı anlatılan Işık / Dijital Zoom / Grid / Otopoz Alanını Seçme / Lens kontrollerini kullanarak mümkün olduğunca geliştiriniz.

17. simgesini seçiniz.

simgesi ekranın altı kısmında görüntüye gelecektir.

İşlem devam ettiği sürece gelişmeleri göstermek için simgenin etrafında renk değişimleri görülecektir.

Pozlama devam ederken, bu işlem birkaç dakika sürebilir, Manual Capture ekranından çıkarak daha önce yakalanan görüntüleri incelemek ve düzenlemek mümkündür.


Seri yakalamalar devam ettikçe geçerli protokol ekranı değişecektir. Bir protokolü kullanarak yakalama yapıldığında, protokol kutusu sarıyla vurgulanacaktır. İşlem bittiğinde protokol kutusunun içinde yeşil bir belirteç görülecektir ve sarı renk ortadan kaybolacaktır. Yeni bir yakalama başladığında, sarı vurgu yeniden görülecektir.

SERİ POZLAMA – İLK GÖRÜNTÜ YAKALANIYOR SERİ POZLAMA – 3 YAKALAMA DA TAMAMLANMIŞ

İlk görüntü yakalandıktan sonra, sol taraftaki Image panelinde ana görüntü olarak, Image panelinde küçük resim olarak ve görüntü havuzunda da küçük resim olarak görülecektir. Devam eden yakalamalarda, o görüntüler Image panelinde küçük resimler olarak olarak görünecektir ve üstüste sıralanacaklardır. Her görüntü yakalandığında Image panelindeki ana görüntü değişecektir. Aynı zamanda görüntü havuzundaki küçük resim de değişecektir.


18. Yakalanan görüntüler sol taraftaki panelden küçük resimlerin arasından istenilen görüntü seçilerek tek tek incelenebilir.

Image (Görüntü) panelindeki küçük resimler ana görüntüyü kısmen gizlemektedir. Ana görüntüyü incelemek için, ilk görüntünün sağ üst tarafında yer alan küçültme tuşunu kullanınız. Bu küçük resimleri saklayacaktır. Küçültme simgesini yeniden seçtiğinizde küçük resimleri tekrar görebilirsiniz.

En iyi görüntü(ler) kaydedilebilri ve istenmeyen görüntüler silinebilir.

19. Bir görüntüyü kaydetmek için, Image panelinden ya da görüntü havuzundan görüntüyü

seçiniz ve Kaydet simgesini tıklayınız.

Kaydedildikten sonra, görüntü havuzundaki görüntüler yeşille çerçevelenecektir ve dosya isimleri görüntünün altında belirecektir.




KAYDET UYARISI



Kaydetme hakkında daha detaylı bilgi için, Ortak Ekran İşlevleri ve Gereçleri başlığına bakınız.

Manuel Görüntü Yakalama – Eklemeli Seriler

6. Image Capture seçeneklerinden Additive Series butonunu seçiniz.

Serinizde istediğiniz görüntü sayısını belirlemeniz gerekmektedir. Sağ taraftaki panelde görüntü sayısı selektörü görülmektedir.

GÖRÜNTÜ SAYISININ SEÇİLMESİ

7. + / -‐ tuşlarını kullanarak yakalamak istediğiniz görüntü sayısını belirleyiniz. Daha sonra, Next okunu seçiniz. Bu örnekte + tuşu kullanılarak 3’e ayarlandığı görülmektedir. Görüntü seriniz için kamera çözünürlüğünü tanımlamanız gerekmektedir. Sağ taraftaki panelde Binning seçeneği görülmektedir.


BINNING SELEKTÖRÜ



okunu seçiniz.


9. İlk görüntü için pozlama zamanını, yakalama zamanını ve aydınlatma ve filtre seçeneklerini ayarlamanız gerekmektedir. Bu işlemler manuel Görüntü Yakalama – Seriler başlığında anlatıldığı gibidir.

10. Serideki her görüntü için ekrana gelen görüntü hemen hemen aynıdır. Varsayılan ayar olarak birinci görüntüden başlamaktadır.

11. Capture Interval kontrolleri sırasıyla şu zaman dilimlerini ayarlamak için kullanılan oldukça basit + / -‐ tuşlarından oluşmaktadır; saat (h), dakika (m), saniye (s) ve milisaniye (ms).

12. Capture Interval + / -‐ tuşlarını kullanarak görüntü serileri zaman aralığını giriniz.

13. Manuel Exposure kontrolleri sırasıyla şu zaman dilimlerini ayarlamk için kullanılan oldukça basit + / -‐ tuşlarından oluşmaktadır; saat (h), dakika (m), saniye (s) ve milisaniye (ms).

14. Pozlama zamanını manuel olarak ayarlamak için Manual butonunu seçiniz ve ilk görüntü için Exposure + / -‐ tuşlarını kullanarak bir pozlama zamanı giriniz. Alternatif olarak, aydınlatma ve filtreleri seçtikten sonra Auto tuşuna bastığınızda, sistem o görüntü için otomatik olarak en uygun pozlama zamanını belirleyecektir.

15. Sağ taraftaki Lighting and Filters fonksiyonlarını kullanarak, daha önce de belirtildiği gibi aydınlatma ve filtre seçimlerinizi yapabilirsiniz.

16. İkinci görüntü için ayarlama yapmak için Next okunu seçiniz. İlk görüntü için yapmış

olduğunuz ayarları kalan görüntülere de uygulamak için Last okunu seçiniz.


17. Varsayılan olarak Same as previous kutusu işaretlenmiştir, bu sayaede ikinci görüntü birinci görüntüyle aynı ayarlara sahiptir ve ayarlama kutuları elle herhangi bir değişikliğin yapılamayacağını belirtmek için gri renklidir. İkinci ve diğer görüntüler için değişiklik yapmak istediğinizde, Same as previous kutusunun işaretini kaldırmanız gerekmektedir.

18. Serinizdeki bütün görüntüler için ayarları giriniz.


20. Neutral Fielding seçeneği mevcutsa, aydınlatma / filtre seçimlerinize bağlı olarak, Neutral Fielding’i kullanıp kullanmamak sizin seçiminize bağlıdır. Neutral Fielding seçeneği size eşit olmayan aydınlatmayı düzeltme olanağı sağlamaktadır. Bu nispeten büyük bir örnekte bantları belirlerken soruna yol açmaktadır. Neutral field görüntüsü hafif aydınlatma için normalleştirilmiştir. Neutral Fielding ekranları ve aydınlatma kombinasyonları için Tavsiye Edilen Işık / Boya / Aksesuar ve Diğer Uygulamalar Tablosu’na bakınız.

MANUEL SERİLERDE NEUTRAL FIELDING

Neutral Fielding uygulaması için, Use Neutral Fielding kutusunu işaretledikten sonra, Next

simgesini seçiniz ve ekrana gelen mesajları takip ediniz. 21. Yapmış olduğunuz poz/ zamanlama/ ışık / filtre seçimleri, geçerli protokol ayarı olarak kabul edilecek ve sağ taraftaki panelde görüntülenecektir.

EKLEMELİ SERİLER – PROTOKOLLER


23. butonunu seçiniz.

simgesi ekranın altı kısmında görüntüye gelecektir.




EKLEMELİ SERİLER PROTOKOLLERİ -‐ YAKALAMALAR YAPILMIŞ

Seri yakalamalar devam ettiği sürece, Current Protocol ekranı da değişecektir. Protokol kullanılarak bir görüntü yakalandığında, protokol sarıyla vurgulanacaktır. İşlem bittiğinde protokol kutusunun içinde yeşil bir belirteç görülecektir ve sarı renk ortadan kaybolacaktır. Yeni bir yakalama başladığında, sarı vurgu yeniden görülecektir.

EKLEMELİ SERİLER POZLAMA – YAKALAMAYA HAZIR

EKLEMELİ SERİLER POZLAMA– 3 YAKALAMA DA TAMAMLANDI

İlk görüntü yakalandıktan sonra, sol taraftaki Image panelinde ana görüntü olarak, Image panelinde küçük resim olarak ve görüntü havuzunda da küçük resim olarak görülecektir. Devam eden yakalamalarda, o görüntüler Image panelinde küçük resimler olarak olarak görünecektir ve üstüste sıralanacaklardır. Her görüntü yakalandığında Image panelindeki ana görüntü değişecektir. Aynı zamanda görüntü havuzundaki küçük resim de değişecektir. İşlem tamamlandığında, yakalanan görüntü, diğer görüntülerle birlikte, ana görüntü olarak Image panelinde görülecektir, aynı zamanda görüntü havuzunda küçük resim halinde de görülecektir. Görüntü havıuzundaki görüntüler henüz kaydedilmemiştir ve kırmızıyla çerçevelenmiştir.



24.Yakalanan görüntüyü kaydetmek için, görüntü havuzundaki görüntüyü seçiniz ve ardından Kaydet simgesini seçiniz. Kaydedildikten sonra, görüntü havuzundaki görüntüler yeşille çerçevelenir ve dosya isimleri görüntünün altında belirir.


Görüntüler seçildikten sonra Kapat simgesi seçilerek görüntü havuzundan çıkarılabilmektedir. Görüntü kaydedilmemişse, kaydet uyarısı ekranda görülecektir.

KAYDET UYARISI




Manuel Görüntü Yakalama – Multipleks

6. Image Capture seçeneklerinden Multiplex butonunu seçiniz.


Serinizde istediğiniz görüntü sayısını belirtmeniz gerekmektedir. Sağ taraftaki panelde görüntü sayısı selektörü görülmektedir.

GÖRÜNTÜ SAYISI SELEKTÖRÜ

7. + / -‐ tuşlarını kullanarak yakalamak istediğiniz görüntü sayısını belirleyiniz. Daha sonra, Next okunu seçiniz. Bu örnekte + tuşu kullanılarak 3’e ayarlandığı görülmektedir. Görüntü seriniz için kamera çözünürlüğünü tanımlamanız gerekmektedir. Sağ taraftaki panelde Binning seçeneği görülmektedir.

BINNING SELEKTÖRÜ



okunu seçiniz.


9. İlk görüntü için pozlama zamanını ve aydınlatma ve filtre seçeneklerini ayarlayınız. Görüntü serideki tüm görüntüler için hemen hemen aynıdır ve varsayılan ayar olarak ilk görüntüden başlamaktadır.

Capture Interval kontrolleri sırasıyla şu zaman dilimlerini ayarlamak için kullanılan oldukça basit + / -‐ tuşlarından oluşmaktadır; saat (h), dakika (m), saniye (s) ve milisaniye (ms). Capture Interval + / -‐ tuşlarını kullanarak görüntü serileri zaman aralığını giriniz.


Manuel Exposure kontrolleri sırasıyla şu zaman dilimlerini ayarlamk için kullanılan oldukça basit + / -‐ tuşlarından oluşmaktadır; saat (h), dakika (m), saniye (s) ve milisaniye (ms).

Pozlama zamanını manuel olarak ayarlamak için Manual butonunu seçiniz ve ilk görüntü için Exposure + / -‐ tuşlarını kullanarak bir pozlama zamanı giriniz. Alternatif olarak, aydınlatma ve filtreleri seçtikten sonra Auto tuşuna bastığınızda, sistem o görüntü için otomatik olarak en uygun pozlama zamanını belirleyecektir.

Sağ taraftaki Lighting and Filters fonksiyonlarını kullanarak, daha önce de belirtildiği gibi aydınlatma ve filtre seçimlerinizi yapabilirsiniz.

10. İkinci görüntü için ayarlama yapmak için Next okunu seçiniz. İlk görüntü için

yaptığınız ayarları serinizdeki diğer görüntülere de uyarlamak için Last okunu seçiniz.

11. Serinizdeki bütün görüntüler için ayarları giriniz.


13. Neutral Fielding seçeneği mevcutsa, aydınlatma / filtre seçimlerinize bağlı olarak, Neutral Fielding’i kullanıp kullanmamak sizin seçiminize bağlıdır. Neutral Fielding seçeneği size eşit olmayan aydınlatmayı düzeltme olanağı sağlamaktadır. Bu nispeten büyük bir örnekte bantları belirlerken soruna yol açmaktadır. Neutral field görüntüsü hafif aydınlatma için normalleştirilmiştir. Neutral Fielding ekranları ve aydınlatma kombinasyonları için Tavsiye Edilen Işık / Boya / Aksesuar ve Diğer Uygulamalar Tablosu’na bakınız.

MANUEL SERİLER NEUTRAL FIELDING

Neutral Fielding uygulaması için, Use Neutral Fielding kutusunu işaretledikten sonra, Next simgesini seçiniz ve ekrana gelen mesajları takip ediniz.

14. Yapmış olduğunuz poz/ zamanlama/ ışık / filtre seçimleri, geçerli protokol ayarı olarak kabul edilecek ve sağ taraftaki panelde görüntülenecektir.

MULTIPLEKS PROTOKOLLERİ



16. butonunu seçiniz.

Pozlama zamanı simgesi ekranın altı kısmında görüntüye gelecektir.



Seri yakalamalar devam ettiği sürece, Current Protocol ekranı da değişecektir. Protokol kullanılarak bir görüntü yakalandığında, protokol sarıyla vurgulanacaktır. İşlem bittiğinde protokol kutusunun içinde yeşil bir belirteç görülecektir ve sarı renk ortadan kaybolacaktır. Yeni bir yakalama başladığında, sarı vurgu yeniden görülecektir.

İlk görüntü yakalandığında, sol taraftaki Image panelinde ana görüntü olarak, Image panelinde üstüste dizilmiş iki görüntü olarak ve Image Pool panelinde küçük resim olarak görülecektir.

Görüntü yakalama devam ettiği müddetçe, Image panelindeki ana görüntü ve sküçük resimler değişecektir. Yeni görüntü küçük resim sırasının arkasına eklenecektir. Küçük resim dizileri kombine görüntüler ve bu görüntüleri oluşturan ayrı görüntüleri temsil eder. Varsayılan ayar olarak ana görüntü küçük resim dizisinden seçilmektedir, seçilen görüntü sarıyla vurgulanmaktadır.

İşlem tamamlandığında, yakalanan görüntü, diğer görüntülerle birlikte, ana görüntü olarak Image panelinde görülecektir, aynı zamanda görüntü havuzunda küçük resim halinde de görülecektir. Image panelindeki küçük resim dizisi, hem kombine görüntüyü hem de tekli görüntüyü içereceği için, görüntü sayısı selektöründe belirtilenden daha fazla görüntü içerecektir.

MULTIPLEKS POZLAMA – YAKALAMAYA HAZIR MULTIPLEKS POZLAMA – 3 YAKALAMA DA TAMAMLANDI

Sol taraftaki panelde görülen ana görüntü, küçük resim dizisinde seçilen görüntüdür ve küçük resmin etrafında sarı bir vurguyla belirtilmiştir. Varsayılan ayar olarak bu kombine görüntüdür.

(i) küçük resim dizisindeki tekli bir görüntüyü ana görüntü yapmak için, küçük resmin çekilen tarafını seçiniz. Sarı vurgu, varsayılan olarak belirlenen görüntüden seçtiğiniz görüntüye geçecektir.


KÜÇÜLTME BUTONU

(ii) Tamamlanmış ana görüntüyü incelemek için, küçük resim dizisinin üzerindeki küçültme butonunu seçiniz.

(iii) Diziyi bir kez daha incelemek için, yeniden küçültme butonunu seçiniz.

Kombine görüntünün görüntüsünü geliştirmek için tekli görüntülerin görünümü değiştirilebilir. Daha iyi bir renk kontrastı oluşturmak için renkli bantların renklerini değiştirmek gibi.

(iv) Değiştirmek istediğiniz küçük resmin yanıda bulunan sağ oku seçiniz ve açılan menüden yeni bir renk seçiniz. Herhangi bir renkten vazgeçmek ve orijinal ayarlara dönmek içn açılan menüden Default seçeneğini seçiniz.

YAKALANAN GÖRÜNTÜ RENK DEĞİŞİMİ

Görüntü yakalandığında, görüntü havuzundaki görüntüler kaydedilmemiştri ve kırmızıyla çerçevelenmiştir.

Küçültme Butonu



17. Yakalanan bir görüntüyü kaydetmek için, görüntü havuzundaki görüntüyü seçiniz ve Kaydet

simgesine tıklayınız.

Görüntü havuzundaki görüntüler kaydedildikten sonra yeşille çerçevelenecektir ve dosya isimleri görüntünün altında görülecektir.



KAYDET UYARISI


(ii) Seçilen görüntüleri kaydetmek için, simgesini seçiniz.



Manuel Görüntü Yakalama -‐ Yakalamadan Sonraki Görüntü Eylemleri

Görüntü Eylemleri simgeleri seçilerek, yakalanan görüntüler üzerinde daha fazla işlem yapılabilir. Bu simgelerin fonksiyonları, bu kullanım kılavuzunun diğer kısımlarında anlatılmıştır.

GÖRÜNTÜ EYLEMLERİ SİMGELERİ

Kaydet simgesi

Çıktı Al simgesi

Düzenle simgesi

Protokolü kaydet simgesi

Analiz simgesi



YAPILANDIRMA – KAYDETME, AÇMA ve DÜZENLEME

Giriş

GeneSys yazılımı tekrar edilen iş akışlarını, iş akışını yapılandırma (ya da Protokl) olarak kaydederek kolaylaştırmaktadır. Yapılandırmalar / Protokoller:

• Kolayca yapılabilir

• Oldukça fazla seçeneğe sahiptir

• Kolayca yeniden kullanılabilir

• Kolayca düzenlenebilir

Bir Yapılandırma Oluşturma ve Kaydetme

Standart Görünüm Başlangıç ekranından

Standart Görünüm Başlangıç ekranından jel için bir yapılandırma oluşturmak için:

1. Sırasıyla şu şekilde çalışnız; Jel simgesini seçiniz, örnek çeşidinizi seçiniz, boyanızı seçiniz, örneğinizi konumlandırınız ve bir görüntü yakalayınız.

2. Görüntü yakalandığında, kaydedilmiş protokoller mesajı ekrana gelecektir.

KAYDEDİLMİŞ PROTOKOLLER MESAJI

(i) Yes butonunu seçiniz.

Yapılandırmayı Kaydet (Save Configuration) mesajı ekrana gelecektir.

YAPILANDIRMAYI KAYDET MESAJI

(ii) Mesajdaki uyarı takip ederek ve ekrandaki var olan yapılandırmayı (yeni

yapılandırmanızı kaydederken bunun üzerine yazılacaktır) seçiniz ya da yeni yapılandırmanız için


Enter configuration name here… kutusuna bir isim girerek, mesajdaki uyarıyı takip ediniz. Ör, Stain

free gel

Varsayılan ayar olarak, yeni oluşturduğunuz bir yapılandırmayı kaydettiğinizde, yazılım bu yapılandırmaya yalnızca sizin giriş yapmanıza izin verecektir. Mesajın sol alt köşesndeki iki kutu kullanılarak bu ayar değiştirilebilir.

• Yapılandırmaya eklemelerin yapılmasını engellemek için Lock kutusunu işaretleyiniz.

• Yapılandırmayı diğer kullanıcıların da kullanabilmeleri için Make public kutusunu işaretleyiniz.

(iii) Yapılandırma dosyasında zeminin konumunu kaydetmek için Save Lift Position kutusunu işaretleyiniz. Bu Genesys’in kullandığınız G:BOX ayarını düzgün bir biçimde kopyalamasına olanak vermektedir. Bu kutu varsayılan ayarı olarak seçilmiştir.

(iv) Yapılandırmayı kaydetmek için OK tuşunu seçiniz.

Yeni kaydedilmiş olan yapılandırma Stain free gel başlangıç ekranında görülmektedir, Standart Görünüm başlangıç ekranında şöyle olacaktır:

YENİ YAPILANDIRMA – LİSTENİN EN ÜSTÜNE EKLENMİŞ

Standart Görünüm başlangıç ekranında Blot için bir yapılandırma oluşturmak istediğinizde:

1. Sırasıyla şu şekilde çalışnız; Blots simgesini seçiniz, örnek çeşidinizi / görüntüleme çeşidinizi seçiniz, boyanızı seçiniz, örneğinizi konumlandırınız ve bir görüntü yakalaynız.

2. Görüntü yakalandıktan sonra, kaydedilmiş prtokoller mesajı ekrana gelecektir.



(i)Yes butonunu seçiniz. Yapılandırmayı Kaydet (Save Configuration) mesajı ekrana gelecektir.


(ii) Mesajdaki uyarı takip ederek ve ekrandaki var olan yapılandırmayı ( yeni yapılandırmanızı kaydederken bunun üzerine yazılacaktır) seçiniz ya da yeni yapılandırmanız için Enter configuration name here… kutusuna bir isim girerek, mesajdaki uyarıyı takip ediniz. Ör, VisibleBlotAutomatic



• Yapılandırmayı diğer kullanıcıların da kullanabilmesi için Make public kutusunu işaretleyiniz.


(iv) Yapılandırmayı kaydetmek için OK tuşunu seçiniz.

Yeni kaydedilmiş olan yapılandırma VisibleBlotAutomatic başlangıç ekranında görülecektir, Standart Görünüm başlangıç ekranında şöyle olacaktır:



Otomatik Görüntü Yakalama Modunda

Otomatik Görüntü Yakalama modunda bir yapılandırma oluşturmak için:

3. Görüntüleyeceğiniz test örneğinin çeşidine göre şu şekilde çalışınız; Adım 1 – Örnek seçimi, Adım 2 – Boya seçimi, Adım 3 – Protokol seçimi, Adım 4 Örnek konumlandırma ve görüntü yakalama

4. Görüntü yakalandıktan sonra, kaydedilmiş protokoller (Saved Protocols) mesajı ekrana gelecektir.


(i) Yes butonunu seçiniz.

Yapılandırmayı Kaydet mesajı ekranda görülecektir.


(ii) Mesajdaki uyarı takip ederek ve ekrandaki var olan yapılandırmayı ( yeni yapılandırmanızı kaydederken bunun üzerine yazılacaktır) seçiniz ya da yeni yapılandırmanız için Enter configuration name here… kutusuna bir isim girerek, mesajdaki uyarıyı takip ediniz. Ör, Gel Automatic 6-‐TET






(iv) Yapılandırmayı kaydetmek için OK butonunu seçiniz.

Yeni kaydedilmiş yapılandırma olan Gel Automatic 6-‐TET başlangıç ekranında görülecektir, Klasik Görünüm başlangıç ekranında şöyle olacaktır:


Manuel Görüntü Yakalama Modunda

Manuel Görüntü Yakalama modunda bir yapılandırma oluşturmak için:

1. Manuel Görüntü Yakalama işlemlerinde anlatıldığı gibi çalışınız ve bir görüntü yakalayınız.

2. Görüntü Eylemleri ‘nden Protokolü Kaydet simgesini seçiniz.

) i ( Protoklü Kaydet Simgesini seçiniz.

Yapılandırmayı Kaydet mesajı ekrana gelecektir.

Kaydet simgesi

Çıktı Al simgesi

Düzenle simgesi


Analiz simgesi




(ii) Mesajdaki uyarı takip ederek ve ekrandaki var olan yapılandırmayı ( yeni yapılandırmanızı kaydederken bunun üzerine yazılacaktır) seçiniz ya da yeni yapılandırmanız için Enter configuration name here… kutusuna bir isim girerek, mesajdaki uyarıyı takip ediniz. Ör, Manual Capture 1.





(iv) Yapılandırmayı kaydetmek için OK butonunu seçiniz.

Yeni kaydedilmiş yapılandırma olan Manual Capture 1 başlangıç ekranında görülecektir, Klasik Görünüm başlangıç ekranında şöyle görülecektir:


Yapılandırmaları Kullanma

Daha önceden oluşturulmuş ve kaydedilmiş Yapılandırmalar / Protokoller başlangıç ekranlarında görülebilir.


STANDART GÖRÜNÜM HOME EKRANI KLASİK GÖRÜNÜM HOME EKRANI

Bir Yazılımı Açma

Başlangıç ekranından var olan bir Yapılandırma / Protokol seçmek ve açmak için:

1. Başlangıç ekranında kullanmak istediğiniz yapılandırmayı seçiniz.

Standart Görünüm başlangıç ekranında kayıtlı yapılandırmaları düzenleyebilir ve bu yapılandırmaları arayabilirsiniz:

Düzenleme (Sort By) seçenekleri şunlardır: Son Kullanılan (Last Used), Başlık (Title), Yazar (Author), Çeşit / Boya (Type/Dye).

Arama (Search) Search title here... alanına yazı girilerek olmaktadır. Aranılan yazının silinmesini sağlamak için Clear butonu da mevcuttur.

Yazılım yapılandırma dosyasındaki verilere göre G:BOX’ınızı yapılandıracaktır ve sizi görüntü yakalama işlemindeki bir sonraki adıma götürecektir:

Yapılandırma Otomatik Görüntü Yakalama modundaysa, sistem, aşağıda görüldüğü gibi, Örnek Konumlandırma ekranını görüntüleyecektir.

OTOMATİK YAKALAMA ÖRNEK KONUMLANDIRMA

Yapılandırma Manuel Görüntü Yakalama modundaysa, sistem tanımlanan protokole uygun Manuel Yakalama ekranını görüntüye getirecektir, aşağıda gösterilmektedir:


TİPİK MANUEL YAKALAMA ÖRNEK KONUMLANDIRMA

2. Örneği konumlandırınız ve daha önce anlatıldığı gibi uygun Otomatik ya da Manuel Görüntü Yakalama işlemlerini tamamlayınız.

Bir Yapılandırmayı Silme

Başlangıç ekranından bir yapılandırmayı silmek için:

1. Silmek istediğiniz yapılandırmadaki Delete Configuration (Yapılandırmayı Sil) simgesini seçiniz.

YAPILANDIRMAYI SİL MESAJI

2. Yapılandırmayı Sil mesajında Yes butonunu seçiniz.

3. Seçilen yapılandırma artık silinmiştir ve Home ekranında görünmeyecektir.

Kaydedilmiş Bir Yapılandırmayı Düzenleme

Daha önce oluşturulmuş ve kaydedilmiş Yapılandırmalar / Protokoller Home ekranında görülebilir.

STANDART GÖRÜNÜM BAŞLANGIÇ EKRANI KLASİK GÖRÜNÜM BAŞLANGIÇ EKRANI

Kaydedilmiş bir yapılandırmayı düzenlemek için, daha önce anlatıldığı gibi yapılandırmayı açınız. Otomatik Görüntü Yakalama Örnek Konumlandırma ekranı ya da Manuel Yakalama ekranındaki normal kontrolleri / eylemleri kullanarak ayarları değiştiriniz.


• Otomatik Yakalama Örnek Konumlandırma ekranı için Otomatik Görüntü Yakalama Modu başlığına bakınız.

• Manuel Yakalama ekranı için Manuel Görüntü Yakalama Modu başlığına bakınız.

Var olan bir yapılandırmada değişiklik yaparsanız ve bunu yeni bir yapılandırma olarak kaydetmek isterseniz, Bir Yapılandırmayı Oluşturma ve Kaydetme başlığına bakınız.

GÖRÜNTÜ FONKSİYONLARI

Görüntüleri Yükleme Ekranı

Daha önce kaydedilmiş olan görüntüler Home ekranından yerleştirilebilir.


Standart Görünüm başlangıç ekranından Görüntüleri Yükleme simgesini ya da Klasik Görünüm

başlangıç ekranından Görüntüleri Yükleme simgesini seçiniz. Görüntüleri Yükleme ekranı görüntüye gelecektir.

GÖRÜNTÜLERİ YÜKLEME EKRANI

• Varsayılan ayar olarak yazılım kaydetme yerine gidecektir ve buradaki bütün kaydedilmiş görüntüleri küçük resimler şeklinde ekrana getirecektir. Yazılım aynı zamanda geçerli sürücüleri bularak sol taraftaki standart Windows formatında ekrana getirir. Farklı yerlere kaydedilen görüntüler sol taraftaki panelde görülen ağaç şeklindeki yapı kullanılarak görüntülenebilir.

• Varsayılan kaydetme yerinde kurtarılan görüntüler orta panelde görüntülenmektedir. Aynı zamanda panelin üst kısmında sürücü / klasör yolu görülmektedir.


• Görüntüleri Yükleme ekranındaki orta panelde görüntülenen görüntüler iki parametre aracılığıyla düzenlenebilir; Sort by Name (İsme göre sırala) ve Sort by Date (Tarihe göre sırala). İki simgeden herhangi birini seçiniz.

SIRALAMA SİMGELERİ

• İsme göre sıralama, klasördeki dosyaları A’dan başlayarak alfabetik olarak sıralar.

• Tarihe göre sıralama, klasördeki dosyaları en son tarih en üstte olacak şekilde sıralar.

• Çoklu görüntüler, aşağıda gösterildiği gibi, küçük resmin sağ üst köşesindeki kısa çizgiler sayesinde ayırt edilebilir.

ÇOKLU GÖRÜNTÜ KÜÇÜK RESMİ

·∙ Seri görüntüleri, aşağıda gösterildiği gibi, küçük resmin sağ üst köşesinde üstüste dizilmiş görüntüler sayesinde ayırt edilebilir.

SERİ GÖRÜNTÜ KÜÇÜK RESMİ

• Ekrana gelenden daha fazla görüntü varsa, bir kaydırma çubuğu ekrana gelecektir. Bu çubuk, ekrana gelmeyen diğer görüntüleri görmenize yardımcı olmaktadır.

• Orta panelden herhangi bir görüntü/ görüntüler seçildiğinde, bu seçilen görüntüler seçilmiş görüntüler (Selected Images) panelinde görülecektir. Aynı zamanda orta panelde seçilen görüntüler, aşağıda gösterildiği gibi, yeşile dönecektir.


SEÇİLMİŞ GÖRÜNTÜLER

·∙ Seçimi iptal etmek için, orta panelde görüntüyü seçiniz ya da seçilen görüntüler panelinde köşede

yer alan kırmızı Dismiss simgesini seçiniz.

Görüntü Yükleme Ekranındaki Görüntü Eylemleri

Görüntüleri yükleme ekranını kullanarak görüntülerinizi yerleştirdiğinizde, yapıabileceğiniz iki eylem vardır; Görüntüleri İnceleme (View Images) ve Düzenleme (Edit). Her iki görüntü eylemi simgesi Görüntü Yükleme ekranının alt kısmında görüntülenmektedir.

Düzenleme simgesi Görüntüleri İnceleme simgesi

• Bu simgeler ilk başta gri renklidir (kullanıma hazır değildir), herhangi bir görüntünün seçilmesi durumunda aktif hale gelecektir.

• Görüntüleri inceleme simgesini seçtiğinizde, görüntü yükleme ekranında yüklediğiniz görüntüler görüntüleri inceleme ekranında görülecektir.

• Düzenleme simgesini seçtiğinizde, görüntüleri yükleme ekranında yüklediğiniz ve seçilmiş görüntüler ekranında gördüğünüz görüntüler görüntü düzenleme ekranında açılacaktır.

• Bu ekranları kullanarak yapabileceklerinizi öğrenmek için, bu kullanım kılavuzundaki Görüntüleri İnceleme Ekranı ve Görüntü Düzenleme Ekranı başlıklarına bakınız.

Görüntüleri İnceleme Ekranı

Görüntüleri inceleme ekranı yakalanan görüntüleri incelemek ve karşılaştırmak için kullanılmaktadır. Görüntüler kaydedilmiş ya da kaydedilmemiş olabilir. Bu ekrana aşağıda anlatıldığı gibi giriş yapılabilmektedir:



• Görüntüleri inceleme fonksiyonu geçerli GeneSys oturumunda yakalama olması ve görüntülerin kaydedilmiş, kaydedilmemiş ya da daha önce kaydedilen ve görüntüleri yükleme fonksiyonu kullanılarak seçilmiş olması durumunda kullanılabilirdir.

• Standart görünüm başlangıç ekranından görüntüleri incele simgesini seçiniz.

• Klasik görünüm başlangıç ekranından görüntüleri incele simgesini seçiniz.

• Bu ekrana başka bir ekrandayken görüntü eylemleri simgelerinden görüntü incele simgesini

seçerek de ulaşabilirsiniz. Not: Seçilen fonksiyonlar kırmızıya dönecektir. İşlem devam ettiği müddetçe ve fonksiyon butonları yeniden seçilinceye kadar kırmızı olarak kalacaktır.

Görüntüleri İnceleme Ekranı – Tekil Görüntüler

İncelemek için seçilen tekli görüntüler sol panelde Single Images (Tekil Görüntüler) olarak etiketlenen bölümde görülntülenecektir.

GÖRÜNTÜLERİ İNCELE EKRANI – YALNIZCA TEK GÖRÜNTÜLER GÖRÜLMEKTEDİR

GÖRÜNTÜLERİ İNELE EKRANI – TEKLİ VE ÇOKLU GÖRÜNTÜLER GÖRÜLMEKTEDİR.

Kaydet simgesi

Çıktı Al simgesi

Düzenle simgesi


Analiz simgesi



Görüntüleri İnceleme Ekranı – Çoklu Görüntüler

İncelemek için seçilen çoklu görüntüler sol panelde dosyaya verilen isimle, örneğin yukarıdaki örnekte kullanıldığı gibi composite dylight 680 and 800.sgd, etiketlenmiş olarak görüntülenecektir. Görüntü ve eğer kaydedilmişse görüntüyü oluşturan diğer görüntüler ekrana gelecektir.

Görüntüleri İnceleme Ekranı – Görüntü Ekranı Seçenekleri

Görüntüleri inceleme ekranında ya da ekranda görülen diğer görüntüler aşağıdaki seçenekler kullanılarak değiştirilebilir.

• Yakınlaştır • Düzeni Değiştir • Görüntüleri Yönet • Sakla / Göster

YAKINLAŞTIR

Görüntüleri İnceleme ekranında görüntüler küçük resimler halinde görüntülenmektedir. Görüntülerin boyutları yakınlaştırma kaydırağı (Zoom Slider) aracılığıyla değiştirilebilir.

YAKINLAŞTIRMA KAYDIRAĞI

DÜZENİ DEĞİŞTİR

Change Layout kontrollerini kullanarak yapabileceğiniz iki işlem vardır.

DÜZENİ DEĞİŞTİR KONTROLLERİ

Görüntüleri İnceleme ekranı varsayılan ayar olarak File Display ( Dosya Görüntüleme)

simgesi seçilmiş ve Compare (Karşılaştır) simgesi gri renkli (kullanıma hazır değil) olacak şekilde başlamaktadır. Görüntüleri İnceleme ekranında ana paneldeki dosyalar seçildiğinde karşılaştır butonu aktif hale gelecektir.

Dört görüntüye kadar seçilip karşılaştırma yapılabilmektedir. Karşılaştır butonunun seçilmesiyle görüntüleri inceleme ekranının görüntüleri karşılaştır versiyonu görüntüye gelecektir.


GÖRÜNTÜLERİ İNCELEME –GÖRÜNTÜLERİ KARŞILATIRMA EKRANI

Sol taraftaki panel, her bir görüntü için aşağıdaki kontrolleri içermektedir:

·∙ Gama kaydırağı görüntünün tonunu değiştirmektedir. Daha önce bahsedilen histogram referans olarak alındığında, Gama fonksiyonu kaydedilen orta kademeli tonların parlaklığını çizelgenin karanlık ucuna ya da beyaz ucuna doğru çekerek değiştirmektedir. Bunu yaparken en uç değerleri değiştirmemektedir. Bu kaydedilen görüntüye ortalama bir koyuluk ya da açıklık vermektedir.

GAMA KAYDIRAĞI

• Kaydırma çubukları görüntünün her alanını görmenize olanak sağlamaktadır. Bir görüntü üzerinde yakınlaştırma fonkdiyonu kullanıldığında yatay bir kaydıma çubuğu ekrana gelecektir.

Sağ taraftaki panelde şu kontroller bulunmaktadır:

• Düzeni değiştirme kontrolleri

• Bağlama (Link) kontrolleri

İKİ GÖRÜNTÜ – BAĞLANMIŞ İKİ GÖRÜNTÜ – BAĞLANMAMIŞ ÜÇ GÖRÜNTÜ -‐ BAĞLANMAMIŞ

Karşılaştırılacak görüntülerin bağlanmamış olması varsayılan ayardır. Link kutularındaki sayılar sol paneldeki görüntü konumlarına karşılık gelmektedir.

Görüntüler bağlanmamış olduğunda, eklemeler kaydırma çubukları ya da Yakınlaştır ve Sırala (Zoom and Range) kontrolleri kullanılarak yalnızca seçilen


görüntüye uygulanmaktadır. Seçilen görüntüler seçilen görüntü numarası kırmızıyla çerçevelenerek Link kutularında belirtilmektedir.

Görüntüler Link simgesi seçilerek bağlanabilir. Görüntüler bağlandıklarında, eklemeler kaydırma çubukları ya da Zoom and Range kontrolleriyle bağlı olan tüm görüntülere uygulanmaktadır.

Sol taraftaki panelden bir görüntü ya da numaralandırılmış Link kutusu seçildiğinde görüntüler bağlantılarını kaybedecektir.

Bağlanmamış görüntüler yakınlaştırılabilir ve fare imleci seçilen görüntünün üzerine getirilerek hareket ettirilebilir.

Dikey kaydırma çubuğunun altında her görüntü için bir Histogram butonu bulunmaktadır. Bu butonun seçilmesiyle kamera sensörü tarafından kaydedilen gri ölçek dağılımının histogram ya da grafik sunumu ekrana gelecektir.

HİSTOGRAM GÖRÜNÜMÜ

Histogram simgesi, fonksiyonun seçildiğini belirtmek için kırmızıya dönecektir. Simgenin tekrar seçilmesi, fonksiyonu iptal edecektir.


·∙ Görüntü Anahtarı

IMAGE KEY

Anahtar, ekrandaki görüntülerin dosya isimlerini göstermektedir. Link kontrollerinde de olduğu gibi, anahtar sayıları sol taraftaki panelde yer alan görüntü konumlarına karşılık gelmektedir.


·∙ Zoom and Range kontrolleri

Dijital Yakınlaştırma Kayd. ZOOM AND RANGE KONTROLLERİ

Dijital yakınlaştırma kaydırağı ekrandaki görüntüye yakınlaşıp uzaklaşmanıza olanak sağlamaktadır. Kaydırağı +’ya doğru sürüklediğinizde yakınlaşır, -‐‘ye doğru sürüklediğinizde ise uzaklaşırsınız.

Kontrast görüntüdeki parlak vurguların ne kadar olduğunu ölçmektedir. Parlaklık ise bir görüntüdeki parlak gölgelerin ne kadar olduğunu ölçmektedir. Ekrandaki görüntüdeki en açık objelerin parlaklığını kontrol etmek için Kontrol kaydırağını kullanınız. Ekrandaki görüntüdeki koyu objelerin parlaklığını kontrol etmek için Parlaklık kaydırağını kullanınız.

Görüntüleri İnceleme – Görüntüleri Karşılatırma ekranında Dosya Görüntüleme (File

Display) butonunu seçtiğinizde, standart Görüntüleri İnceleme ekranına döneceksiniz.

GÖRÜNTÜLERİ YÖNETME

Görüntüleri Yönetme kontrolleriyle yapabileceğiniz iki işlem vardır:

GÖRÜNTÜLERİ YÖNETME KONTROLLERİ

Close (Kapat) simgesini seçtiğinizde yalnızca seçilen görüntü dosyası / dosyaları kapatılacaktır.

Close All (Hepsini Kapat) butonunu seçtiğinizde bütün görüntü dosyaları kapatılacaktır.

SAKLA / GÖSTER

İnceleme ekranındaki bir görüntünün başlığının yanında bulunan oku

(inaktif) (aktif) seçtiğinizde, o başlıkla ilişkili görüntü(ler) saklanacaktır, örneğin küçük resimler görüntülenmeyecektir; fakat görüntü başlığı hala görüntülenecektir. Bu diğer görüntülerin de ekranda görülmesine olanak sağlamaktadır. Üst oku alt oka dönüşecektir. Saklanmış olan görüntüler alt okun yeniden seçilmesiyle görüntülenebilir.

Kontrast / Parlaklık Kaydırakları


Görüntüleri İnceleme Ekranı – Tekli Görüntüleri Çoklu Görüntülere Dönüştürme

Create Multiplexed Image simgesi kullanılarak birden fazla görüntü bir araya getirilerek yeni bir çoklu görüntü oluşturulabilir. Oluşturulan bu görüntü ekranın sağ alt kısmında bulunan görüntü

eylemlerinde görülebilir. Çoklu görüntü simgesi yalnızca Görüntüleri İnceleme ekranındaki ana panelde dosyalar seçildiğinde aktif hale gelmektedir. Not: Seçilen fonksiyonlar kırmızıya dönmektedir. İşlem devam ettiği müddetçe ve fonksiyon butonları

yeniden seçilinceye kadar kırmızı olarak kalacaktır.

Yeni bir çoklu görüntü oluşturmak için:

1. Tekli görüntüler ekranında, kombin etmek istediğiniz görüntüleri seçiniz. Bu işlem Düzeni Değiştir – Karşılaştır fonksiyonundan da gerçekleştirilebilir. Bu durumda görüntüler seçilmiş olacaktır.

ÇOKLU GÖRÜNTÜ OLUŞTURMA – GÖRÜNTÜLER SEÇİLMİŞ

2. Çoklu Görüntü Oluştur butonunu seçiniz. Çoklu Görüntü Oluştur mesaj kutusu ekrana gelecektir. Burada çoklu görüntünün nasıl görüneceğini görmeniz mümkündür.

Görüntü Çeşidini Ayarlama butonlarını kullanarak yapabileceğiniz iki işlem vardır; Monokrom Görüntü Oluştur (Create Monochrome Image) ve Renkli Görüntü Oluştur (Create Colour Image)

CreateMultiplexed Image icon

Save icon

Print icon

Analyse icon

Edit icon


ÇOKLU GÖRÜNTÜ – GÖRÜNTÜYÜ RENKLENDİRME ÇOKLU GÖRÜNTÜ – MONOKROM GÖRÜNTÜ

3. Çoklu görüntü oluşturmak için OK butonunu, iptal etmek için Cancel butonunu seçiniz. Oluşturulan çoklu görüntü Görüntüleri İnceleme ekranında görüntülenecektir.

ÇOKLU GÖRÜNTÜ OLUŞTURULDU

Yeni oluşturulan çoklu görüntünün sol taraftaki panelde kendine ait bir sırası vardır. Burada çoklu görüntü ve seçilen görüntüler ekrana gelecektir.

Görüntü Düzenleme Ekranı

Görüntü Düzenleme ekranı birçok görüntü seçeneği sunmaktadır. Görüntü Düzenleme ekranına Görüntü Eylemleri simgelerindeki Düzenleme simgesi seçilerek ulaşılabilir.

Görüntü Düzenleme Ekranı – Görüntü Düzenleme Ana Seçenekleri Image

Görüntüleri Düzeneleme ekranı dört ana seçenekten oluşan birçok görüntü düzenleme seçeneği sunmaktadır:

• Genel • Annotate • Enhance • 3D Görüntüsü

Kaydet Simgesi

Çıktı Al Simgesi

Düzenle Simgesi

Protokolü Kaydet Simgesi

Analiz Simgesi Görüntüleri İncele

Simgesi


Görüntü Düzenleme Ekranı varsayılan ayar olarak Genel modda başlamaktadır.

Not: Seçilen fonksiyonlar kırmızıya dönmektedir. İşlem devam ettiği müddetçe ve fonksiyon butonları yeniden seçilinceye kadar kırmızı olarak kalacaktır.

GÖRÜNTÜ DÜZENLEME EKRANI –GENEL MOD

Diğer ana seçenekler sol taraftaki panelden seçilebilir.

GÖRÜNTÜ DÜZENLEME EKRANI – ANA SEÇENEKLER SEÇİM BUTONLARI

Görüntü Düzenleme Ekranı – Genel Seçenek

Genel seçeneği bir dizi temel görüntü aracını içermektedir. Genel ekranının sol alt paneli aşağıdaki kontrolleri / fonksiyonları içermektedir:

• Görüntü Kaynağı • Rotasyon • Görüntüyü Kopyalama • Diğer

Note: Seçilen fonksiyonlar kırmızıya dönmektedir. İşlem devam ettiği müddetçe ve fonksiyon butonları yeniden seçilinceye kadar kırmızı olarak kalacaktır.

Genel butonu

Enhance button

Annotate button

3 3D Görüntü butonu


GENEL KONTROLLER / FONKSİYONLAR

GÖRÜNTÜ KAYNAKLARI

Bir görüntü dosyasında değişiklik yaptığınız zaman, GeneSys yazılımı değişiklik yapılan dosyanın bir kopyasını yapmaktadır. Bu nedenle görüntü dosyasının ilki üzerinde değişiklik yapılmamış orijinal dosya ve ikincisi değişiklik yapılmış olan dosya olmak üzere iki versiyonu vardır. Görüntü Kaynakları fonksiyonu bu iki versiyonu görmenize olanak sağlamaktadır. Değişiklik yapılmamış dosyayı incelemek için Orijinal Görüntüyü İncele

butonunu seçmeniz gerekmektedir. Değişiklik yapılan dosyayı seçmek için İşlenmiş

Görüntüyü İncele butonunu seçiniz. ROTASYON

Ekrandaki görüntüler Rotasyona İzin Ver butonuyla rahatça döndürülebilir. Döndürme işlemi tamamlandıktan sonra aynı butona yeniden basılarak görüntünün

oryantasyonu düzeltilebilir. Bu oryantasyon Rotasyonu Sil butonuyla orijinal pozisyona döndürülebilir.

GÖRÜNTÜ KOPYALAMA

Bir görüntü Kopyala butonu seçilerek Windows Clipboard’a kopyalanabilir. Bu görüntüyü başka bir yere yapıştırmanıza da olanak sağlamaktadır. DİĞER

Diğer seçenekler ise Saturation (Doygunluk) ve Renk’tir.

Saturation fonksiyonu görüntünün fazla pozlanıp pozlanmadığını kontrol etmektedir. Fazla pozlanmış beyaz bantla görüntü üzerinde kırmızıyla vurgulanacaktır, fazla pozlanmış siyah


bantlar ise görüntünün üzerinde maviyle vurgulanacaktır. Bu fonksiyon Otopoz Alanını Seç (Select AutoExpose Area) fonksiyonu kullanıldığında daha kullanışlıdır. Doymuş (bantların

ölçülebilir olmadığını unutmayınız. Bu fonksiyonu kullanmak için butonunu seçiniz.

Renk fonksiyonu renkli bantların renklerini değiştirip adha iyi bir renk kontrastı oluşturarak görüntünün görünümünü arttırmak için kullanılmaktadır. Bu soluk bantların daha görünür olmasını sağlamaktadır.

Varsayılan butonunu seçiniz ve açılan listeden yeni bir renk seçiniz. Rengi iptal etmek ve orijinal ayara dönmek için açılan menüden Default seçeneğini seçiniz.

DİĞER FONKSİYONLAR – VARSAYILAN RENK MENÜSÜ

Varsayılan fonksiyonu farklı boyaları taklit eden renklerin uygulanmasında kullanılabilir.

• SYBR Green DNA jeli taklit etmesi için yeşil rengi seçiniz.

• SYBR Gold DNA jeli taklit etmesi için sarı rengi seçiniz.

• Turuncu – mavi – kırmızı renkleri protein jelinin gümüş görünmesine neden olmaktadır.

Düzenlenen görüntü çoklu bir görüntüyse, renk değişimi bütün tekli görüntülere uygulanırken, bileşik görüntüye uygulanmaz. Renk değişikliğini bileşen görüntüye de uygulamak için Bileşende Kullan kutusuna bakınız.


Görüntü Düzenleme Ekranı -‐ Annote Seçeneği

Annotate seçeneği görüntüye hem metinsel hem de grafiksel dipnotlar eklemektedir. Annotate ekranının sol alt paneli aşağıdaki kontrolleri / fonksiyonları içermektedir:

• Görüntü Kaynağı • Açıklama Araçları • Kopyala ve Yapıştır • Düzenle


ANNOTATE KONTROLLERİ / FONKSİYONLARI

GÖRÜNTÜ KAYNAĞI

Bu fonksiyon Görüntü Düzenleme Ekranı – Genel Seçenekler başlığında anlatıldığı gibidir.

AÇIKLAMA ARAÇLARI

Aşağıda gösterilen dipnot araçları mevcuttur:


Seç aracı Çokgen Aracı

Sürükle aracı Çizgi Aracı

Metin Aracı Ok Aracı

Dolgu/Dolgu Yok Renk Seçme Aracı

Dikdörtgen aracı Hat Seçme Aracı

Elips aracı

Seç aracı görüntüye eklemek istediğiniz yazıyı ya da objeyi seçmenize olanak sağlamaktadır.

Sürükle aracı büyüttüğünüz görüntüyü kaydırmanıza olanak sağlamaktadır. Böylece ortadaki görüntü inceleme panelinde bütün görüntünün olmamasını sağlamış olursunuz. Görüntüyü hareket ettimek için araç simgesini seçiniz.

Metin aracı görüntünüze metin ya da metin kutusu eklemenize olanak sağlamaktadır. Aracı seçiniz ve imleci eklemenin olmasını istediğiniz yere konumlandırınız ve sola tıklayıp yazmaya başlayınız. Seçme aracını kullanarak metin kutusunu tam olarak istediğiniz yere konumlandırabilir ve yatay ya da dikey olarak metin kutusunun boyutlarını yeniden ayarlayabilirsiniz. Yazıyı çift tıkladığınızda, aşağıda gösterildiği gibi, yazıyı ve yazı parametrelerinizi değiştirebilirsiniz.

METİN MESAJ KUTUSU 1 METİN MESAJ KUTUSU 2

Metin mesaj kutusunda Select Font butonunu seçtiğinizde ikinci bir mesaj kutusu açılacaktır.

Değiştirebileceğiniz parametreler:

• Yazının kendisi. Daha önceden metin kutusuna yazılmış olan metin Metin kutusunda görülmektedir. Bu metin kutusu direkt olarak düzenlenebilir.

• Metin yönü (Yatay ya da dikey)

• Yazı büyüklüğü

• Boyut


• Yazı stili (Normal/italik/eğik) ve (Normal/kalın)

Dolgu /Dolgu Yok aracı görüntüye eklediğiniz şekilleri doldurmanıza olanak sağlamakadır. Şekli seçiniz ardından şekli doldurmak için Renk Seç aracıyla dolgu için renk seçiniz.

Dikdörtgen aracı görüntü üzerine dört köşeli şekiller çizmenize olanak sağlamaktadır. Şekli çiziniz, ardından Seç aracını kullanarak şekli sürükleyebilir ve yeniden boyutlandırabilirsiniz. Dikdörtgeni Dolgu / Dolgu Yok aracını ve Renk Seç aracını kullanarak doldurabilirsiniz. Dikdörtgenin dış hatları renklendirilebilir ve çizginin stili Renk Seç ve Çizgi Stilini Seç araçları kullanılarak değiştirilebilir.

Elips aracı görüntü üzerine elipsler eklemenize olanak sağlamaktadır. Şekli çiziniz, ardından Seç aracını kullanarak şekli sürükleyebilir ve yeniden boyutlandırabilirsiniz. Elips Dolgu / Dolgu Yok aracı kullanılarak doldurulabilir. Elipsin dış hatları renklendirilebilir ve hattın stili Renk Seç ve Çizgi Stilini Seç araçları kullanılarak değiştirilebilir.

Çokgen aracı görüntüye hazır şekiller eklemenize olanak sağlamaktadır. Şekli çiziniz, ardından sağa tıklayıp çizimi durdurunuz. Seç aracı seçilerek şekil yeniden oluşturulabilir. Şekiller Dolgu / Dolgu Yok ve Renk Seç araçları kullanılarak doldurulabilir. Şeklin dış hatları renklendirilebilir ve çizginin stili Renk Seç ve Çizgi Stilini Seç araçları kullanılarak değiştirilebilir.

Çizgi aracı bir görüntü üzerine istediğiniz boyut ve açıyla, düz çizgiler çizmenize olanak sağlamaktadır. Çizgiyi çiziniz, ardından Seç aracını kullanarak çizgiyi sürükleyebilir ve yeniden boyutlandırabilirsiniz. Çizgi renklendirilebilir ve çizginin şekli Renk Seç ve Çizgi Stilini Seç araçları kullanılarak değiştirilebilir.

Ok aracı bir görüntü üzerine istediğiniz boyut ve açıyla, bir ucu ok şeklinde olan bir doğru çizmenize olanak sağlamaktadır. Oku çiziniz, ardından Seç aracını kullanarak oku sürükleyebilir ve yeniden boyutlandırabilirsiniz. Ok renklendirilebilir ve okun şekli Renk Seç ve Çizgi Stilini Seç araçları kullanılarak değiştirilebilir.

Renk Seçimi ve Çizgi stilleri aracı yukarıda anlatıldığı gibidir.

KOPYALA ve YAPIŞTIR

Kopyala ve Yapıştır fonksiyonu oluştruduğunuz dipnotları kopyalayıp yapıştırmanıza olanak sağlamaktadır. Aynı görüntü üzerinde yapıştır fonksiyonu da kullanılmışsa, yapıştırılan dipnot direkt olarak dipnot kaynağının üzerine aktarılır. Yapıştırılan dipnot daha sonra ihtiyaç duyulan yere sürüklenebilir ve daha önce de anlatıldığı gibi değiştirilebilir. Kopyalanmış bir dipnot daha önce anlatıldığı gibi değiştirilebileceği farklı bir görüntüye yapıştırılabilir.

Herhangi bir dipnotu kopyalamak için, ilk önce dipnotu seçmeniz gerekmektedir. Seçtikten

sorna Seçilen Dipnotları Kopyala butonunu seçiniz. Kopyalananan dipnotu

yapıştırmak için, yer görüntüsünü seçtikten sonra Dipnotları Kopyala butonunu seçiniz.

DÜZENLEME

Düzenleme fonksiyonu yukarıda da anlatıldığı gibi oluşturulan dipnotları birleştirmek ve silmek için kullanılmaktadır. Birleştirme ve silme fonksiyonları yalnızca seçilen dipnotlara uygulanmaktadır.


Dipnotları birleştirmek için, ilk önce dipnotları seçiniz (birden fazla dipnot seçmek için

klavyenizde Ctrl tuşuna basılı tutunuz.). daha sonra Seçilen Dipnotları Birleştir butonunu seçiniz ve açılan listeden birleştirme yönünü seçiniz.

DİPNOT AYARI AÇILIR MENÜSÜ

Dipnotları silmek için, ilk önce dipnotları seçiniz ve ardından Seçilmiş Dipnotları Sil butonunu seçiniz.

Not: Klavyenizdeki Delete tuşunu da bu işlem için kullanabilirsiniz.


Görüntü Düzenleme Ekranı – Büyütme Seçeneği

Büyütme ekranının sol alt paneli aşağıdaki kontrol / fonksiyonları içermektedir:

• Görüntü Kaynağı • Büyütme Araçları • Çözünürlük


BÜYÜTME SEÇENEKLERİ ARAÇLARI/KONTROLLERİ/FONKSİYONLARI

GÖRÜNTÜ KAYNAĞI

Bu fonksiyon daha önce de Görüntü Düzenleme Ekranı – Genel Seçenekler başlığında anlatıldığı gibidir.

BÜYÜTME ARAÇLARI

Aşağıdaki büyütme araçları mevcuttur:

Keskinleştirme aracı Dikey olarak döndürme aracı

Pürüzsüzleştirme aracı Yatay olarak döndürme aracı

Ters çevirme aracı Kırpılacak alanı tanımla aracı Nokta doğrulama aracı Alanı kırp aracı

Keskinleştime aracı seçilen görüntüye keskin bir filtre uygulamaktadır. Bu işlem bantların kenarlarının daha vurgulu olmasını sağlamaktadır. Bununla birlikte bu durum tanelenmede azalmaya sebep olabilmektedir.


Pürüzsüzleştirme aracı seçilen görüntüye pürüzsüzleştirici bir filtre uygulamaktadır. Bu görüntüde hava kabarcıkları, toz tanecikleri varlığında kullanışlı olmaktadır. Bununla beraber bant keskinliğinde gerilemeye neden olmaktadır.

Ters çevirme aracı görüntüyü ters çevirmektedir, siyah beyaz olarak, beyaz da siyah olarak gözükmektedir. Bu görüntüdeki çok soluk bantları incelemek için kullanışlıdır.

Nokta doğrulama Speckle Correct aracı görüntüdeki beyaz noktaları ya da istenmeyen pikselleri kaldırmak için kullanılmaktadır.

Dikey olarak döndürme aracı seçilen görüntüyü dik düzlemde göstermektedir. Bu, örnek karanlık odada yanlış konumlandırığında kullanışlı olmaktadır.

Yatay olarak döndürme aracı görüntüyü yatay düzlemde göstermektedir. Bu, örnek karanlık odada yanlış konumlandırıldığında kullanışlı olmaktadır.

Kırpılacak alanı tanımlama aracı seçtiğiniz görüntüde bir alanı seçerek bu alanın görüntünündiğer kısımlarından izole edilerek daha yakından incelemenizi sağlamaktadır. Simgeyi seçiniz ve incelemek istediğiniz alanı saran bir dikdörtgen çiziniz. Dikdörtgenin dış hatları pembedir ve transparan bir pembe dolguyla çevrilmiştir. Doldurma alanını seçerek dikdörtgeni sürükleyebilir ve yeniden boyutlandırabilirsiniz. Bu ilgilendiğiniz alanı daha rahat kontrol etmenize olanak sağlamaktadır. Bu aracı yeniden seçtiğinizde oluşturduğunuz dikdörtgen iptal edilir; fakat seçme işlemine yeniden başlayabilmeniz için fare imleci seç modundadır. Kırpılacak alanı tanımlama aracı iki kez daha seçildiğinde oluşturulan dikdörtgen ve seçme fonksiyonu iptal edilecektir.

Kırpılacak Alanı Tanımla aracıyla daha yakından incelemek istediğiniz alanı tanımladığınızda, kırpma işlemininin uygulanması için Alanı Kırp aracını seçiniz. Tanımlanan alan görüntüden kesilmiştir ve görüntünün kalan kısmı atılmıştır ve kırpılan ya da kesilen alan ise büyütülmüştür.

ÇÖZÜNÜRLÜK

Çözünürlük aracı, seçilmiş olan görüntünün çözünürlüğünü değiştirmek için kullanılmaktadır. Büyütme Araçları seçeneği seçildiğinde, sistem seçilmiş görüntünün geçerli/varsayılan çözünürlüğünü Çözünürlük kutusunda göstermektedir.

Geçerli görüntünün çözünürlüğünü değiştirmek için, Çözünürlük aracını seçiniz ve açılan listeden yeni bir çözünürlük seçiniz.


ÇÖZÜNÜRLÜK MENÜSÜ

Açılan Çözünürlük menüsünde görüntülenen seçenekler görüntünün yakalandığı çözünürlüğe bağlıdır, örnek aşağıda verilmiştir:

ÇÖZÜNÜRLÜK MENÜSÜ

Not: Çözünürlük seçeneğini kullandığınızda, görüntünün çözünürlüğünde bir değişiklik yapabilir ve o değişikliği geri alabilirsiniz. Bir değişiklik yaptığınızda Undo tuşunu kullanarak orijinal çözünürlüğe geri dönebilirsiniz. Çözünürlük seçeneği gri renklidir ve kullanılamaz durumdadır. Farklı bir çözünürlük denemek istediğinizde görüntüyü Görüntü Yükleme ekranından yeniden yükleyiniz.

Görüntü Düzenleme Ekranı -‐ Genel / Annotate / Büyütme Seçeneklerinin Ortak Kontrolleri

Görüntü Düzenleme Ekranında yer alan Genel, Annotate ve Büyütme seçeneklerinin olduğu görüntü inceleme panelinde görüntü kontrol setleri bulunmaktadır.


Yeni seçim Varsayılan görüntü çözünürlüğü



Yakalanan görüntünün görüntülenmesini sağlamak için mevcut kontroller aşağıda belirtilmiştir.

G


Yakınlaştırma (Zoom) kaydırağı, ekrandaki görüntüye yaklaşmanıza ya da uzaklaşmanıza olanak sağlamaktadır. Kaydırağı +’ya doğru sürüklediğinizde yakınlaşmış, -‐‘ye doğru sürüklediğinizde uzaklaşmış olursunuz.

Gama kaydırağı görüntünün tonunu değiştirmenize yardımcı olmaktadır. Daha önce bahsedilen histogram referans olarak alındığında, Gama fonksiyonu kaydedilen orta kademeli tonların parlaklığını çizelgenin karanlık ucuna ya da beyaz ucuna doğru çekerek değiştirmektedir. Bunu yaparken en uç değerleri değiştirmemektedir. Bu kaydedilen görüntüye ortalama bir koyuluk ya da açıklık vermektedir.

Kontrast Kontrast görüntüdeki parlak vurguların ne kadar olduğunu ölçmektedir. Parlaklık ise bir görüntüdeki parlak gölgelerin ne kadar olduğunu ölçmektedir. Ekrandaki görüntüdeki en açık objelerin parlaklığını kontrol etmek için Kontrol kaydırağını kullanınız. Ekrandaki görüntüdeki koyu objelerin parlaklığını kontrol etmek için Parlaklık kaydırağını kullanınız.

Kaydırakları kullanarak değişiklik yaptığınızda, Auto Levels simgesini seçerek yaptığınız değişiklikleri geri alabilirsiniz.

Ters çevirme butonunu kullanarak, görüntüyü tersine çevirebilirsiniz, örneğin beyaz siyah olarak, siyah da beyaz olarak gözükecektir. Bu kaydıraklarla değişiklik yaptığınızda size yardımcı olabilir. Ters çevirme butonunu ikinci kez seçtiğinizde, görüntü orijinal haline geri dönecektir.

YAKALANAN GÖRÜNTÜ BİLGİSİ

Görüntü Bilgisi simgesini seçiniz. Görüntü bilgisinin olduğu bir pencere ekrana gelecektir. Bu bilgi aşağıdaki gibidir:

• Boya • Görüntü yakalama tarihi / zamanı

Gama kaydırağı

Kontrast / Parlaklık kaydırakları

Ters çevirme düğmesi

Reset (Auto Levels) düğmesi

Zoom (Dijital) kaydırağı


• Filtre • Işık • Pozlama zamanı • İris f sayısı • Görüntü boyutu • Range

GÖRÜNTÜ BİLGİSİ PENCERESİ

Görüntü Bilgisi simgesi kırmızıya dönecektir. Bu simgeyi ikinci kez seçmek, açılan pencereyi kapatacaktır.

GÖRÜNTÜ HİSTOGRAMI

Histogram butonunu seçiniz. Select the Histogram button. Bu butonun seçilmesiyle kamera sensörü tarafından kaydedilen gri ölçek dağılımının histogram ya da grafik sunumu ekrana gelecektir.

HİSTOGRAM GÖRÜNTÜSÜ

Histogram butonu fonksiyonun seçildiğini belirtmek için kırmızıya dönecektir. Butonun yeniden seçilmesi Histogram fonksiyonunun iptal edilmesine neden olacaktır.


Görüntü İnceleme Ekranı – 3D İnceleme Seçeneği

3D İnceleme ekranı, seçilen görüntünün jel kalınlığını açıklayarak ve kamera sensörü tarafından kaydedilen grey scaleslerin dağılımını belirleyen pikler aracılığıyle üç boyutlu formda görülmesini sağlamaktadır.


GÖRÜNTÜ DÜZENLEME EKRANI – 3D İNCELEME SEÇENEĞİ

3D ekranının sol alt panelinde aşağıdaki kontroller / fonksiyonlar bulunmaktadır:

• Görüntü Kaynağı • Diğer • Gama


3D İNCELEME SEÇENEĞİ KONTROLLERİ / FONKSİYONLARI

GÖRÜNTÜ KAYNAĞI

Bu fonksiyon Görüntü Düzenleme Ekranı – Genel Seçenekler başlığında anlatıldığı gibidir. DİĞER

Saturation ve Varsayılan fonksiyonları da Görüntü Düzenleme Ekranı – Genel Seçenekler başlığında anlatıldığı gibidir.


GAMA

Gama kaydırağı görüntünün tonunu değiştirmenize yardımcı olmaktadır. Daha önce bahsedilen histogram referans olarak alındığında, Gama fonksiyonu kaydedilen orta kademeli tonların parlaklığını çizelgenin karanlık ucuna ya da beyaz ucuna doğru çekerek değiştirmektedir. Bunu yaparken en uç değerleri değiştirmemektedir. Bu kaydedilen görüntüye ortalama bir koyuluk ya da açıklık vermektedir.

GÖRÜNTÜ DÜZENLEME FONKSİYONLARI

Görüntü Düzenleme Ekranındaki 3D seçeneğinin inceleme panelinde, ekrandaki görüntünün değiştirilmesini sağlayan şu fonksiyonlar bulunmaktadır:

Yukarı hareket ettir Sağa döndür

Reset düğmesi

Aşağı hareket ettir Saat yönünün tersine döndür

Sola hareket ettir Reset düğmesi

Sağa hareket ettir Saat yönünde döndür

Geriye döndür

Sola söndür

Bir simgeye tek bir defa tıklayarak ya da dokunarak bir eylem seçtiğinizde, görüntü programlanan miktarda ya da adımda hareket edecektir. Görüntü simge aşağıda tutularak durmaksızın istenilen yönde hareket ettirilebilir.

Ayarlama simgelerinden herhangi biri seçildiğinde, görüntü orijinal konumuna geri dönecektir.

İnceleme panelinin sol üst köşesinde bulunan yakınlaşma kontrolü, inceleme paneli içerisinde görüntüyü büyütür / küçültür.

YAKINLAŞTIRMA KAYDIRAĞI

İnceleme panelinin sol alt köşesinde bulunan ölçek kontrolü, gri ölçek bilgisinin yayılımını görüntüleyen dikey ekseni azaltıp / arttırır.


ÖLÇEK KAYDIRAĞI

Görüntü İnceleme Ekranı – Tüm Seçeneklerin Ortak Kontrolleri

EYLEM SİMGELERİ

Görüntü Düzenleme ana seçenekler ekranı, ekranın alt kısmında bulunan Eylemler simgeleriyle aynı işleve sahiptir.

Eylemler simgesinin sol taraftaki grubunda şunlar bulunur:

• Görüntüleri Yükle simgesini seçtiğinizde, Görüntüleri Gözden Geçir ekranına dönerek, görüntüleri aramanız mümkündür.

• Görüntüleri İncele simgesini seçtiğinizde, yeniden Görüntü İnceleme ekranına dönerek, yakaladığınız görüntüleri incelemeniz ve karşılaştırmanız mümkündür.

Eylemler simgesinin sağ taraftaki grubunda şunlar bulunur:

• Son Değişikliğ Geri Al simgesi yalnızca bir görüntü üzerinde işlem yapıldığında aktif hale gelmektedir. Bu simgeyi seçtiğinizde, son eyleminizden önce hangi konumdaysanız oraya götürecektir, örneğin son eklediğiniz dipnot kaldırılacaktır.

Başlangıç simgesi

Görüntüleri Yükle simgesi


Son Değişikliği Geri Al simgesi

Dipnotları Kaydet / Yükle simgesi

Kaydet simgesi

Analiz simgesi

Çıktı al simgesi


• Dipnotları Kaydet / Yükle simgesi görüntü üzerine yapmış olduğunuz dipnotu ayrı bir dipnot dosyasına kaydedecektir. Bu ayrı dipnot dosyası kolayca açılabilir ve birden fazla görüntüye eklenebilir. Karşılaştırma amacıyla aynı dipnota sahip olması gereken benzer görüntüler yakalanırken kullanışlıdır.

BU simgeyi seçtiğinizde Dipnotları Kaydet / Yükle kutucukları ekrana gelecektir. Bu kutucukları dipnotlarınız belirli bir dosyaya kaydetmek için ya da daha önce kaydettiğiniz dipnotlarınıza ulaşmak için kullanabilirsiniz.

DİPNOTLARI KAYDET / YÜKLE KUTUCUKLARI

SAĞ TARAFTAKİ PANEL

Dört Görüntü Düzenleme ana seçenekleri ekranının sağ taraftaki panelleri aynı bilgileri içermektedir.

Sağ taraftaki panel düzenleme için seçilen görüntüler için görüntü havuzlarını içermektedir. Görüntü havuzundaki her görüntü küçük resim olarak görüntülenmektedir. Birden fazla görüntünün küçük resmi görüntülendiğinde, geçerli olan görüntü sarıyla vurgulanacaktır. Ekrandaki görüntüyü değiştirmek için, sağ taraftaki panelde bulunan görüntüyü seçiniz.

Sağ taraftaki panelin alt kısmında, görüntüleri görüntü havuzundan uzaklaştırmak için kullanılan iki buton bulunmaktadır:

REMOVE / REMOVE ALL BUTTONS

Remove butonunu seçtiğinizde seçilen görüntü görüntü havuzundan çıkarılacaktır.

Remove All butonunu seçtiğinizde görüntü havuzundaki bütün görüntüler çıkarılacaktır.

Ortak Ekran Fonksiyonları ve Araçları

Aşağıda bahsedilen Eylemler simgeleri GeneSys yazılımı kullanıldığında mevcuttur:

Başlangıç simgesi seçildiğinde, sizi GeneSys Başlangıç ekranına götürür.

Kaydet simgesi yakalanan / düzenlenen görüntülerin kaydedilmesi için kullanılır.


Çıktı Al simgesi bir görüntünün çıktısını almak için kullanılmaktadır.

Analiz simgesi görüntüyü ilerdeki analizler için GeneSys’e yollamaktadır.

Eylem simgeleri yalnızca aktif olduklarında, renkli olduklarında, seçilebilirler.

Görüntüleri Kaydetme

Görüntü yakalandığında ya da üzerinde değişiklik yapıldığında ve Kaydet simgesi aktif olduğunda, GeneSys yazılımını kullanarak görüntüyü kaydetme olanağınız bulunmaktadır.

Ekranın alt kısmındaki Kaydet simgesini seçiniz. Tipik bir Windows Farklı Kaydet ekranı görüntüye gelecektir.

FARKLI KAYDET EKRANI

• Yazılım varsayılan olarak varsayılan ayarı ya da son kullanılan kaydetme yerini kullancaktır.

• Farklı bir yer seçmek için sol tarafa ya da Save in: alanına bakınız.

• Dosya Adı (file name: ) alanını kullanarak dosyanıza isim verebilirsiniz. GeneSys yazılımı görüntüye imageX olarak isim verecektir. Burada X 1’den başlayan bir sayıdır.

• Format olarak kaydet (Save as type) alanını kullanarak dosya çeşidinizi belirleyebilirsiniz. GeneSys yazılımı SynGene Data format dosyası (*.sgd) olarak kaydedecektir. Diğer dosya çeşitleri:

DOSYA FORMAT ÇEŞİTLERİ

Dosya konumunu, dosya adını ve dosya çeşidini seçtikten sonra, Kaydet (Save) butonuna basınız.

·∙ SynGene Data format dosyasından (*.sgd) başka bir format seçtiğinizde, aşağıdaki mesaj kutusu ekrana gelecektir:


EKRANDAKİ GÖRÜNTÜYÜ KAYDET MESAJ KUTUSU

Mesaja ve kaydedilen görüntüyü nasıl kullanmak istediğinize bağlı olarak seçiminizi yapınız.

Görüntüyü ekranda göründüğü haliyle kaydetmek istiyorsanız Göründüğü gibi (As displayed) butonunu seçiniz. Bu görüntüde parlaklık ve kontrast ayarlamaları tamamlanmıştır.

Görüntüyü orijinal haliyle kaydetmek için Yakalandığı gibi (As captured) butonunu seçiniz. Yakalamadan sonra yapılan parlaklık ve kontrast eklemeleri kaydedilmemiştir.

EKLEMELİ SERİ GÖRÜNTÜLERİNİ KAYDETME

Manuel Yakalama – Eklemeli Seriler fonksiyonunu kullanarak bir dizi görüntü yakaladıysanız Kaydet fonksiyonu değişecektir. Aşağıdaki seçeneklerden birini seçebilirsiniz.

SEÇENEK 1 Eklemeli görüntüyü ve kurucu görüntüleri tek bir dosya şeklinde kaydediniz.

Kaydet simgesini seçiniz, aşağıdaki mesaj kutusu ekrana gelecektir:

EKLEMELİ SERİ YAKALAMASINI KAYDETME MESAJ KUTUSU

Together (Hep beraber) butonunu seçtiğinizde, Farklı Kaydet ekranı görüntülenecektir.

Dosya kayıt yerini, ismini ve çeşidini daha önce anlatıldığı gibi seçiniz ya da sistem varsayılanlarını kabul ediniz.

Sistem serideki bütün görüntüleri, bireysel yakalamların her birini ve eklemeli görüntüyü, tek bir .sgd dosyasında kaydedecektir.

SEÇENEK 2 Oluşturan görüntülerin hepsini gizli dosya olarak kaydediniz.


EKLEMELİ SERİ YAKALAMASINI KAYDETME MESAJ KUTUSU 1


Individually (Tek tek) butonunu seçiniz, aşağıdaki mesaj kutusu ekrana gelecektir:

EKLEMELİ SERİ YAKALAMASINI KAYDETME MESAJ KUTUSU 2

Devam etmek için All (Tümü) butonunu seçiniz. Yakalanan her görüntü için Farklı Kaydet ekranının kopyası ekranda görülecektir.

Her görüntü dosyası için dosya kaydetme yerini, dosya ismini ve çeşidini daha önce anlatıldığı gibi seçiniz. Kaydet butonunu seçiniz.

Her görüntü kaydedildikten sonra, aşağıdaki mesaj kutusu ekrana gelecektir:

EKRANDAKİ GÖRÜNTÜYÜ KAYDET MESAJ KUTUSU




Not: Bu işlem yalnızca yakalanan görüntüleri kaydetmektedir, eklemeli görüntüler ise kaydedilmemektedir.

SEÇENEK 3 Seçilmiş kurucu görüntüleri gizli dosya olarak kaydediniz.

Kaydetmek istediğiniz görüntüyü seçiniz.

Kaydet butonuna basınız, aşağıdaki mesaj kutusu ekrana gelecektir:

EKLEMELİ SERİ YAKALAMALARINI KAYDETME MESAJ KUTUSU 1

Individually (Tek tek) butonunu seçiniz, aşağıdaki mesaj ekrana gelecektir:


EKLEMELİ SERİ YAKALAMALARINI KAYDETME MESAJ KUTUSU 2

Devam etmek için Selected (Seçilmiş) butonunu seçiniz, Farklı Kaydet ekranı görüntüye gelecektir.

Görüntü dosyası için dosya kaydetme yerini, dosya ismini ve çeşidini daha önce anlatıldığı gibi seçiniz. Kaydet butonunu seçiniz.

Görüntü kaydedildikten sonra, aşağıdaki mesaj kutusu ekrana gelecektir:

EKRANDAKİ GÖRÜNTÜYÜ KAYDETME MESAJ KUTUSU




Not: Bu işlem yalnızca seçilen tekli görüntüyü kaydetmektedir, eklemeli görüntüler ise kaydedilmemektedir.

Seçilmiş görüntünüzü kaydettikten sonrai, seriden diğer bir görüntüyü seçme ve kaydetme seçeneğine sahipsiniz. Bu sayede serinizden istediğiniz kadar görüntü seçme ve kaydetme olanağına sahip olmuş olursunuz.

ÇOKLU GÖRÜNTÜLERİ KAYDETME

Çoklu bir görüntü yakaladığınızda ya da oluşturduğunuzda Kaydet fonksiyonu değişmektedir. Aşağıdaki seçeneklerden birini seçebilirsiniz.

SEÇENEK 1 Birleştirilmiş görüntüyü ve tüm kurucu görüntüleri tek bir dosya olarak kaydediniz.

Birleştirilmiş görüntüyü seçiniz.



ÇOKLU YAKALAMAYI KAYDETME MESAJ KUTUSU

Together (Hepsi) butonunu seçiniz, Farklı Kaydet ekranı görüntüye gelecektir.

Dosya kayıt yerini, ismini ve çeşidini daha önce anlatıldığı gibi seçiniz.

SEÇENEK 2 Birleştirilmiş görüntüyü ve tüm kurucu görüntüleri gizli doya olarak kaydediniz.

Birleştirilmiş görüntüyü seçiniz.



Individually (Tek tek) butonunu seçiniz, uygun değildir mesaj kutusu ekrana gelecektir:

NON-‐GLP GÖRÜNTÜ KAYDETME MESAJ KUTUSU

Not: Çoklu görüntü için kurucu olan görüntüleri gizli dosya olarak kaydetmek, non-‐GLP laboratuvar pratiği olarak düşünülmelidir. Bunun anlamı şudur; tek dosya silinebilir ve çoklu görüntünün tam denetim izni kaybedilmiştir.

Devam etmek için Yes butonunu seçiniz, her görüntü (Birleştirilmiş görüntü ve tek tek kurucu görüntüler) için Farklı Kaydet ekranının bir kopyası ekrana gelecektir.

Her görüntü dosyası için dosya kayıt yerini, ismini ve çeşidini daha önce anlatıldığı gibi seçiniz.

SEÇENEK 3 Herhangi bir seçilmiş kombinasyonla görüntüleri seçiniz.

Kaydetmek istediğiniz görüntüleri seçiniz.

Kaydet simgesini seçiniz, her seçilen görüntü için Farklı Kaydet ekranı görüntüye gelecektir.



SEÇENEK 4 Düzenlenmiş çoklu görüntüyü kaydetme

Görüntü düzenleme modundaysanız ve çoklu görüntü üzerinde bir değişiklik yaptıysanız,



Together (Hepsi) butonunu seçiniz, Farklı Kaydet ekrana gelecektir.

Dosya kayıt yerini, ismini ve çeşidini daha önce anlatıldığı gibi seçiniz.

Individually (Tek tek) butonunu seçiniz, aşağıdaki mesaj kutusu görüntüye gelecektir:

DÜZENLENMİŞ ÇOKLU GÖRÜNTÜ KAYDETME MESAJ KUTUSU

Selected (Seçilmiş) butonunu seçiniz, her seçilen görüntü için Farklı Kaydet mesajı ekrana gelecektir.


All (Tümü) butonunu seçiniz, uygun değildir mesaj kutusu ekrana gelecektir:

NON-‐GLP GÖRÜNTÜ KAYDETME MESAJ KUTUSU

Note: Çoklu görüntü için kurucu olan görüntüleri gizli dosya olarak kaydetmek, non-‐GLP laboratuvar pratiği olarak düşünülmelidir. Bunun anlamı şudur; tek dosya silinebilir ve çoklu görüntünün tam denetim izni kaybedilmiştir.

Devam etmek için Yes butonunu seçiniz, her görüntü (Birleştirilmiş görüntü ve tek tek kurucu görüntüler) için Farklı Kaydet ekranının bir kopyası ekrana gelecektir.



Çıktı Alma

Bir görüntü yakalandığında, incelendiğinde ya da değiştirildiğinde, Çıktı Al simgesi aktif olduğunda, GeneSys yazılımını kullanarak görüntünün çıktısını almanız mümkündür.

Not: Çıktı Al kutusu Windows’un hangi versiyonunu kullandığınıza bağlı olarak değişecektir.

TİPİK ÇIKTI AL KUTUSU

Yazıcı kutusundaki İsim: (Name: ) alanından yazıcınızı seçiniz.

Çıktısını almak istediğiniz sayfaların sırasını Çıktı Sırası kutusundan seçiniz.

Özellikler… butonunu kullanarak kullanmak sitediğiniz yazıcı ayarlarını seçiniz.

Kopya kutusundaki Kopya sayısı alanında çıktısını almak istediğiniz kopya sayısını belirtiniz.

Kullanıcı Tercihleri ekranında yapılan seçimlere göre neyin çıktısının alınacağı belirlenecektir:

• Full Report (Tam Rapor) – Bu kutunun seçilmesi cihazın her test için tam rapor hazırlamasına neden olacaktır. Tam raporun içeriği ek onay kutuları kullanılarak kontrol edilebilir. Özelliği eklemek için seçiniz:

• Görüntü

• Dosya Tanımı

• Yakalama Özellikleri

• Basic Report (Temel Rapor) – Bu kutunun seçilmesi cihazın her test için temel rapor hazırlamasına neden olacaktır. Ek özellikler:

• Basic Report Image Only (Temel Rapor – Yalnozca Görüntü) -‐ Bu kutu seçilmişse, çıktısı alınan rapor yalnızca test için yakalanan görüntüden ibaret olacaktır. Eğer seçilmemişse, raporda görüntünün yanısıra bazı temel bilgiler, dosya adı / kullanıcı adı / Tarih / Zaman / Örnek / Filtre gibi, yer alacaktır.

• Preview Before Printing (Çıktısını Almadan Önce Önizleme) – Bu kutu seçilmişse, rapor basılmadan önce ekranda bir önizlemesi görülecektir. Eğer seçilmemişse, rapor herhangi bir önizleme olmadan basılacaktır. Birden fazla görüntünün olduğu durumlarda bu seçenek seçilmişse, her görüntü için bir baskı önizleme aşamasından geçmeniz gerekmektedir.


Çıktı alma fonksiyonu, ekranın altında bulunan Çıktı Al simgesinin seçilmesiyle aktif hale gelecektir.

Neyin çıktısının alınacağı ayrıca aşağıdakilere bağlıdır:

• Görüntüleri İncelem ekranından çıktı alma

• Görüntü Düzenleme ekranından çıktı alma

• Tekli görüntü çıktısı alma

• Eklemeli seri çıktısı alma

• Çoklu yakalama çıktısı alma

TEKLİ GÖRÜNTÜ YAKALAMA

Görüntüleri İnceleme ekranından tekli görüntüler seçilebilir ve tek tek çıktıları alınabilir ya da fazla tekli görüntüler seçilebilir ve toplu olarak çıktıları alınabilir.

Görüntü düzenleme ekranından tekli görüntüler seçilebilir ve tek tek çıktıları alınabilir.

EKLEMELİ SERİ YAKALAMA

SEÇENEK 1

Görüntü İnceleme ekranından kurucu görüntülerin çıktısı alınabilir:

Eklemeli görüntüyü seçiniz.

Çıktı Al simgesini seçiniz. Yakalanan seri çıktısı alma (Printing series capture) mesaj kutusu ekrana gelecektir.

YAKALANAN SERİ ÇIKTISI ALMA MESAJ KUTUSU

All (Tümü) butonunu seçiniz. Kurucu görüntülerin tümünün çıktısı alınacaktır. Eklemeli görüntünün çıktısı alınmayacaktır.

SEÇENEK 2

Görüntüleri İnceleme ekranından eklemeli görüntünün çıktısını alma:

Eklemeli görüntüyü seçiniz.




Görüntüle (Display) butonunu seçiniz. Eklemeli görüntü basılacaktır (Boş sayfa)

SEÇENEK 3

Görüntüleri İncele ekranından tek kurucu görüntünün çıktısını alma:

Görüntüyü seçiniz.

Çıktı al simgesini seçiniz.

Seçilen görüntünün çıktısı alınacaktır.

SEÇENEK 4

Görüntüleri İncele ekranından birden fazla kurucu görüntünün çıktısını alma:

Görüntüleri seçiniz.

Çıktı al simgesini seçiniz.

Seçilen görüntülerin çıktısı alınacaktır.

SEÇENEK 5

Görüntü Düzenleme ekranından bütün kurucu görüntülerin çıktısını alma:

Herhangi bir kurucu görüntünün küçük resmini seçiniz.



All (Tümü) butonunu seçiniz. Kurucu görüntülerin tümü basılacaktır. Eklemeli görüntü ise basılmayacaktır.

SEÇENEK 6

Görüntü Düzenleme ekranından tek bir kurucu görüntü çıktısı almak için:


Kurucu görüntülerin küçük resimlerinden birini seçiniz.

Çıktı Al simgesini seçiniz. Yakalanan seri çıktısı alma (Printing series capture) mesaj kutusu ekrana gelecektir:


Görüntüle (Display) butonunu seçiniz. Seçilen kurucu görüntünün çıktısı alınacaktır.

ÇOKLU YAKALAMALAR

SEÇENEK 1

Görüntüleri İnceleme ekranından çoklu görüntüler ve kurucu görüntülerin çıktısını almak için:

Çoklu görüntüyü seçiniz.

Çıktı Al simgesini seçiniz. Çoklu yakalama çıktısı alma (Printing Multiplex Capture) mesaj kutusu ekrana gelecektir.

ÇOKLU YAKALAMA ÇIKTISI ALMA MESAJ KUTUSU

All (Tümü) butonunu seçiniz. Çoklu görüntü (Boş sayfa) ve kurucu görüntüler basılacaktır.

SEÇENEK 2

Görüntü İnceleme ekranında eklemeli görüntüyü seçiniz:

Çıktı Al simgesini seçiniz. Çoklu yakalama çıktısı alma (Printing Multiplex Capture) mesaj kutusu ekrana gelecektir.



Görüntüle (Display) butonunu seçiniz. Ekranda görülen görüntü basılacaktır.

SEÇENEK 3

Görüntü İnceleme ekranından tek bir kurucu görüntünün çıktısını almak için:

Kurucu görüntüyü seçiniz.

Çıktı Al simgesini seçiniz.

Seçilen görüntü basılacaktır.

SEÇENEK 4

Görüntüleri İnceleme ekranından birden fazla kurucu görüntünün çıktısını almak için:

Kurucu görüntüleri seçiniz.

Çıktı Al simgesini seçiniz.

Seçilen görüntüler basılacaktır.

SEÇENEK 5

Görüntü Düzenleme ekranından çoklu görüntülerin ve kurucu görüntülerin çıktısını almak için:

Küçük resimlerden çoklu görüntüyü seçiniz.

Çıktı Al simgesini seçiniz. Çoklu Çıktı Alma mesaj kutusu ekrana gelecektir.


All (Tümü) butonunu seçiniz. Çoklu görüntü ve kurucu görüntüler basılacaktır.

SEÇENEK 6

Görüntü Düzenleme ekranından çoklu görüntünün çıktısını almak için:

Küçük resimlerden çoklu görüntüyü seçiniz.




Görüntüle (Display) butonunu seçiniz. Seçilen görüntü basılacaktır.

SEÇENEK 7

Görüntü Düzenleme ekranından çoklu görüntünün ve kurucu görüntülerin çıktısını almak için:




All (Tümü) butonunu seçiniz. Çoklu görüntü ve tüm kurucu görüntüler basılacaktır.

SEÇENEK 8

Görüntü Düzenleme ekranından bir kurucu görüntünün çıktısını almak için:


Çıktı Al simgesini seçiniz. Seri Yakalama Çıktı Alma mesaj kutusu ekrana gelecektir.


Görüntüle (Display) butonunu seçiniz. Seçilen görüntü basılacaktır.

TAM RAPOR ÇIKTISI ALMA SEÇENEKLERİ

Kullanıcı Tercihleri ekranında Full Report (Tam Rapor) seçeneği işaretlenmişse, Çıktı Al

simgesini seçtiğinizde raporu inceleyebilir ve ekranın üst kısmında bulunan simgeler sayesinde baskı ayarlarına ulaşabilirsiniz.


Aşağıdaki eylemler mevcuttur:

Yakınlaş Yazıcı Ayarları

Uzaklaş Çıktı Al

Zoom yapma Önceki

Sonraki

ÇIKTI ALMADAN ÇIKIŞ YAPMA

Raporu bastırmak istemediğinizde, ekranın sol üst köşesindeki Rapor (Report) simgesini seçip açılan menüden Kapat’ı (Close)seçtiğinizde Çıktı Al fonksiyonundan çıkış yapabilirsiniz.

ÇIKTI ALMADAN ÇIKIŞ YAPMA


KULLANICI BAKIMI

Bir G:BOX Cihazına Bakmak

G:BOX nadiren yapılan kontrol ve temizlik dışında düzenli bakım ya da kalibrasyona ihtiyaç duymamaktadır.

G:BOX’ı Temizleme

UYARI

Cihazı kapatınız ve ana güç kablosunu prizden çekiniz.

G:BOX’ın dışı yumuşak bir bezle, eğer ihtiyaç duyulursa biraz suyla nemlendirilmiş bir bezle silinebilir. Gerekli görülürse yumuşak deterjanlar da kullanılabilir. Aşındırıcı, solvent bazlı temizleme ürünlerini kullanmayınız. Bütün yüzeyi temizlemeden önce görünmeyen bir yerde ürünü test ediniz.

Karanlık odanın iç yüzeyleri, Siyah Tepsi ya da transilüminatör modülü gibi yüzeyler biyokimyasal ürünler / reaktörlerle kontamine olabilir. Bu durumda yüzeyler yumuşak bir bez ve doğal deterjan ya da %70’lik etanol çözeltisi gibi floresan olmayan bir ajanla temizlenebilir.

Cihaz gövdesine sıvı ürünlerin dökülmesinden kaçınınız. Herhangi bir dökülmeyi derhal temizleyiniz. Cihazın içine herhangi bir sıvının girmesi durumunda, cihazı çalıştırmayı bırakınız ve satıcınızla iletişime geçiniz.

Syngene ile İletişime Geçme

Syngen ile iletişime geçmek istediğinizde, aşağıdaki bilgiler gerekli olacaktır:

• Cihaz seri numarası • Kamera • GeneSys versiyonu • Veritabanı versiyonu

Cihaz seri numarası karanlık odanın arkasındaki bir yapışkan üzerinde bulunmaktadır. Diğer sistem bilgilerine, aşağıda gösterildiği gibi, GeneSys Başlangıç ekranlarından ulaşılabilir:

STANDART GÖRÜNÜM BAŞLANGIÇ EKRANI


Standart Görünüm Başlangıç ekranında, başlık çubuğundan simgesini seçiniz. GeneSys hakkında mesaj kutusu ekrana gelecektir:

GeneSys HAKKINDA MESAJ KUTUSU

Mesaj kutusunu kapatmak için OK butonunu seçiniz.

Klasik Görünüm Başlangıç ekranında, sistem bilgileri sağ taraftaki panelin alt kısmında görülmektedir.

KLASİK GÖRÜNÜM BAŞLANGIÇ EKRANI

G:BOX cihazları hakkında daha detaylı bilgiye Syngene’in web sayfasından, www.syngene.com , ulaşabilirsiniz. Burada Uygulama Notları (Application Notes), Teknik Makaleler ( Technical Articles), Sık Sorulan Sorular (FAQs) ve Hızlı Rehberler ( Quick Guides) başlıklarına ulaşabilirsiniz.

G:BOX için teknik desteğe telefon ya da mail yoluyla ulaşabilirsiniz:

Tel: +44 (0)1223 727123

Email: [email protected]


G:BOX Sorun Giderme SORUN OLASI NEDEN ÇÖZÜM

Kamera bağlı değil ya da cevap vermiyor.

Kameranın USB bağlantısı takılı değildir

Kamera için yazılım sürücüsü kayıptır.

Tüm kabloların bu kılavuzda anlatıldığı gibi takılı olduğundan emin olunuz. Kamera sürücüsünü yükleyiniz.

G:BOX simgesi üzerindeki yenile (Refresh) butonuna basınız.

'Hardware not available' (Donanım mevcut değil) uyarısı ekrana geliyor.

Seçmiş olduğunuz boya için uygun olan filtre ya da ışığa sahip değilsiniz. Hardware (Donanım) ekranındaki donanım listesini (Hardware list) kontrol ediniz.

Sisteminizi yükseltmek için [email protected] ile iletişime geçiniz. Donanım (Hardware) ekranına yüklediğiniz ekstra ışık ve filtreleri programlayınız.

Boya listede görünmüyor. Kullanmakta olduğunuz boya veritabanında listelenmemiştir.

[email protected] ile iletişime geçiniz.

Boya ismi gri renkli görünüyor. Seçmiş olduğunuz boya için uygun donanıma sahip değilsiniz. Hardware (Donanım) ekranındaki donanım listesini (Hardware list) kontrol ediniz.

Sisteminizi yükseltmek için [email protected] ile iletişime geçiniz. Donanım (Hardware) ekranına yüklediğiniz ekstra ışık ve filtreleri programlayınız.

Mavi Işık LED Transilüminatörü çalışmıyor.

Transilüminatör anahtarının ON pozisyonunda olduğundan emin olunuz.

Transilüminatör çalışmadığı takdirde, lütfen [email protected] ile iletişime geçiniz.


ORTADAN KALDIRMA

G:BOX’ı Ortadan Kaldırma

Atık Elektrik ve Elektronik Araç Gereçler (WEEE) Yönergesi

Üzerinde çarpı işareti bulunan tekerlekli çöp simgesi ve dikdörtgen çubuk, ürünün WEEE Yönergesine tabi olduğunu ve sınıflandırılmamış belediye atığı olarak ortadan kaldırılmaması gerektiğini belirtmektedir. Bu simgeyle işaretlenmiş herhangi bir ürün yerel kurallar da göz önünde bulundurularak ayrı olarak toplanmalıdır.

WEEE Yönergesi’nin amacı çevre kalitesini korumak ve geliştirmek, insan sağlığını korumak ve doğal kaynakları ihtiyatlı ve rasyonel bir biçimde kullanmaktır. WEEE spesifik geri dönüşümlü malzeme ya da atık akımına kirleticilerin dağılmasını önlemek için vazgeçilmezdir. Bu, çevreyi koruma adına en etkili yoldur.

G:BOX Cihazları İçin WEEE Talimatları

Atık toplama yeniden kullanımı, geri dönüşüm ve geri kazanım programları yerel otoriteler tarafından belirlenmektedir. Yerel yetkilinizle (örneğin laboratuvar müdürü gibi) ya da uygulanabilir yönetmeliklerle ilgili bir yetkiliyle iletişime geçiniz. G:BOX cihazınız için spesifik bilgiye ulaşmak için, Synoptics Health ile iletişime geçiniz:

İnternet adresi : www.synopticshealth.com

Email: [email protected] Mail ve telefon:

Syngene Europe office Syngene USA office Beacon House 5103 Pegasus Court, Suite L

Nuffield Road Frederick

Cambridge MD 21704

CB4 1TF

United Kingdom

USA

Tel: +44 (0)1223 727123 Tel: 800 686 4407/301 662 2863

Not: Diğer üreticilerin ürünleri G:BOX ürününüzün bir parçasını oluşturabilir. Bu ürünlerin WEEE Direktifleri doğrultusunda toplanması ve işlenmesinden bu üreticiler sorumludur. Ürünlerini ortadan kaldırmadan önce lütfen bu satıcılarla iletişime geçiniz.

Documents

genplaza.com.trgenplaza.com.tr/wp-content/uploads/2016/09/SYNGENE_GBOX... · 2016-09-08 · KULLANICILARIN&DİKKATİNE!! Bukılavuzunhazırlanmasında!tüm!olasılıklar!göz!önünde!bulundurulduğundan,!Synoptics!Limited