INF 4611Scientific Writing and Presenting

Andreas KämperSummer 2011

3. Title and Abstract

Recapitulation

Historical Development

• The first scientific journals appeared in A.D. 16651665

Journal des Sçavans

Philosophical Transactions ofTransactions of 

the Royal SocietySociety

Standard Structure (I)

• Journal space is preciousd i f b i d f d d• Reduction of verbosity and of redundancy

• Organization of manuscripts in a standard form

• The historical development resulted in today’s standard structure:standard structure:

The Introduction, Methods, Results, and Discussion (IMRAD) format

Standard Structure (II)

• Introductionh i hi ll b ? h hi k d ? h• What is this all about? Why was this work done? Why 

do you write this paper?

• Materials and Methods• How was the evidence obtained?How was the evidence obtained?

• Results• What are the facts? What was found?

• Discussion and Conclusion• What do your findings mean?

Homework

• “nodus”• noun; plural: nodi• noun; plural: nodi• a complicated situation or problem• a prominent cross vein near the center of the leading edge• a prominent cross‐vein near the center of the leading edge of a wing in Odonata

• from Latin “nodus” (knot)from Latin  nodus  (knot)

• “compurgator”• compurgator• noun• one who under oath vouches for the character or conduct• one who under oath vouches for the character or conduct of an accused person

• Deutsch: EideshelferDeutsch: Eideshelfer

Outline

• Title

• Abstract

• Grammar and Style Quarter• Plural forms of nouns

TitleTitle

Abstract

Style and Grammar Quarter

Purpose of the Title

• What is the paper about?

• Properties• Interestingg

• Concise

• Informative• Informative

• Many, if not most, readers will read the title only and decide on the paper’s relevance for their research on the title alone

Length and Style of the Title

• The title should be briefi ll l h 00 h• Typically less than 100 characters

• Typically less than 10 to 12 words

• Choose words with great care

• Avoid two part or series titles• Avoid two part or series titles• Example for a bad title:

Heteropoly Compounds. IV. The Basicities of Some Heteropoly Tungstic and Molybdic Acids and the Charge of Their Anions

J. R. Matthews, J. M. Bowen, R. W. Matthews, Successful scientific writing, 2nd Ed., p. 66;example from: E. Matijević, M. Kerker, J. Am. Chem. Soc., 1959, 81(21), 5560–5566.

Hints for Selecting a Title

• Avoid trivial phrases“ ”• “Notes on …”

• “A study of …”

• “Studies on …”

• “Investigations on ”Investigations on …

• “Observations on …”

l h b• Avoid articles at the beginning• “A …”

• “An …”

• “The ”• The …J. R. Matthews, J. M. Bowen, R. W. Matthews, Successful scientific writing, 2nd Ed., p. 66;

R. A. Day, B. Gastel, How to write and publish a scientific paper, 6th Ed., p. 40.

Hints for Selecting a Title

• Do not use uncommon abbreviations

• Do not make claims about your findings, be neutral• Do not write “A and B are correlated”, use “Correlation of A and B” insteadCorrelation of A and B  instead

• Do not try to put “a short abstract” into the title

When to write the Title?

• When starting your research you have a rough “ orking title”“working title”

• During writing the paper, collect a number of alternative titles

• Finally select the most appropriate title for the• Finally, select the most appropriate title for the final manuscript

TitleTitle

Abstract

Style and Grammar Quarter

Purpose of the Abstract

• Provides an abbreviated but accurate representation of the contents of the entirerepresentation of the contents of the entire article• “Summary of the information in a document”

• Informative for people who never read the articleInformative for people who never read the article

• Used by secondary sources (e.g. Chemical Abstracts)

Types of Abstracts

• “Informative” abstractS h bl h h d h i i l d• States the problem, the methods, the principal data and conclusions

• A substitute for the paper, “the paper condensed”

• For primary research papers!p y p p

• “Indicative” or “descriptive” abstractM lik t bl f t t• More like a table of contents

• Cannot serve as a substitute of the paper

• Use for reviews only!

Length and Style of an Abstract

• Typical length: 250 wordsOf h d li i b h j l• Often a hard limit set by the journal

• If you can tell your story in 100 words, do not use 200.

Je n'ai fait celle ci plus longue parce que jeJe n ai fait celle‐ci plus longue parce que je n'ai pas eu le loisir de la faire plus courte.

I write the present [letter] only longer, because I have no leisure/time to make it shorter.

Blaise PascalQuotation: B. Pascal, Lettres provinciales, Letter XVI, Dec 4, 1656; French text: http://gallica.bnf.fr/ark:/12148/bpt6k205164n;

figure: http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/7/79/Blaise_pascal.jpg (public domain). 

Structured Abstracts

• Use one paragraph only, unless the journal uses “structured” abstracts“structured” abstracts

Example of a structured abstract: S. Böcker et al., BMC Bioinf., 2009, 10(Suppl. 1), S61.

Hints on the Abstract

• Never put something into the abstract that is not contained in the articlecontained in the article

• The abstract must be self‐contained, often it is published by itself• Do not cite references in the abstractDo not cite references in the abstract

• Do not refer to tables or figures

bb• Do not use uncommon acronyms or abbreviations. Do not use any abbreviation at all, unless you need it 

l h bseveral times in the abstract

When to write the Abstract?

• The abstract should be the last part of the paper o riteyou write

• Complete everything else; rewrite everything else. Then, at the very end: write the abstract

TitleTitleAbstract

S l d G QStyle and Grammar Quarter

Plural Forms of Nouns (I)

• In general (regular plural)dd ‘ ’ h• Add an ‘‐s’ to the noun

table  tables, tree  trees

• If the noun ends in a sibilant sound, i.e., with ‘‐s’, ‘‐ss’ ‘‐sh’ ‘‐ch’ or ‘‐x’ss ,  sh ,   ch , or  x• Add ‘‐es’ to the noun

class  classes, fax  faxes

Sources: J. Crump, English irregular plural nouns, http://www2.gsu.edu/~wwwesl/egw/crump.htm;K. M. Mallory, Irregular nouns list, http://www.english‐zone.com/spelling/plurals.html; and others.

Plural Forms of Nouns (II)

• If the noun ends with ‘‐y’f h ‘ ’ f ll l• If the ‘‐y’ follows a vowel

• Or if the noun is a proper name• Simply add an ‘‐s’

• play  plays• The two Germanys united in 1990.

• Elsese• ‘‐y’ changes to ‘‐ies’

• fly flies body bodiesfly  flies, body  bodies

Irregular Plural Nouns (I)

• Nouns that end with ‘‐f’ or ‘‐fe’l h ‘ f’/‘ f ’ b ‘ ’• For some: replace the ‘‐f’/‘‐fe’ by ‘‐ves’

half  halves, self  selves, wife  wives

Regular: cliff  cliffs, roof  roofs

• Change of vowels (Old English roots)• Change of vowels (Old English roots)foot  feet, (fire)man  (fire)men, louse  lice, 

i h hmouse mice, tooth  teeth, woman  women

• Old English plurals forms retainedchild  children, ox  oxen

Irregular Plural Nouns (II)

• Nouns ending with ‘‐o’f i ’ h f• If it’s a short form

• If it’s the name of peoples

• If the word originates in another language

• If a vowel precedes the ‘‐o’If a vowel precedes the  o• Simply add ‘‐s’

kilo kilos Navajo Navajos machomachos videokilo  kilos, Navajo  Navajos, macho machos, video videos

• Else• Else• Depending on the word, ‘‐oes’ and sometimes ‘‐os’ is correct If in doubt: use ‘‐oes’correct. If in doubt: use  oes

Singular and Plural Identical

• In some words the singular and plural forms are identicalidentical• Chinese  Chinese, Japanese  Japanese, Swiss Swiss 

• cod  cod, fish  fish (or                                        (fishes), salmon  salmon,                                          perch  perch, trout  troutp p

• deer  deer, grouse  grouse, moose moose, sheep sheepsheep  sheep

• offspring  offspring, means means, series series species speciesseries, species  species

Figures top to bottom (all public domain): Atlantic cod, http://en.wikipedia.org/wiki/File:Atlantic_cod.jpg; Coho salmon, …:Oncorhynchus_keta.jpeg; European perch, …:Aborre,_Iduns_kokbok.jpg; brown trout, …:Bachforelle_Zeichnung.jpg.

Plural of Foreign Nouns (I)

• Foreign nouns retain their plural form from the other lang ageother language• Most nouns ending in ‘‐a’ become ‘‐ae’ (Latin)

alga  algae, amoeba  amoebae, antenna antennae (antennas also used), formula  formulae ( )(formulas also used), larva  larvae, nebula nebulae (nebulas also used), vertebra  vertebrae

• Exception (Greece) 

schema schemata stigma stigmataschema  schemata, stigma stigmata

Plural of Foreign Nouns (II)

• Foreign nouns retain their plural form from the other lang ageother language• Nouns ending in ‘‐is’ become ‘‐es’

analysis  analyses, axis  axes, basis  bases, crisis  crises, diagnosis  diagnoses, emphasis g g pemphases, hypothesis  hypotheses, neurosis neuroses, oasis  oases, parenthesis  parentheses, p psynopsis  synopses, thesis  theses

Plural of Foreign Nouns (III)

• Foreign nouns retain their plural form from the other lang ageother language• Nouns ending in ‘‐o’ become ‘‐i’ (Italian)

graffito  graffiti, libretto  libretti, tempo  tempi, virtuoso  virtuosi

• Nouns ending in ‘‐on’ become ‘‐a’ (Greek/Latin)

automaton automata criterion criteriaautomaton  automata, criterion  criteria, phenomenon  phenomena, …

Plural of Foreign Nouns (IV)

• Foreign nouns retain their plural form from the other languagethe other language• Nouns ending in ‘‐um’ become ‘‐a’

addendum  addenda, bacterium  bacteria, curriculum  curricula (curriculums also used), datum  data, erratum  errata, medium media, memorandum memoranda (memorandums also used), ovum  ova, serum  sera (serums also used), stratum  strata, symposium  symposia (symposiums also used), …

Plural of Foreign Nouns (V)

• Foreign nouns retain their plural form from the other lang ageother language• Most nouns ending in ‘‐us’ become ‘‐i’

alumnus  alumni, bacillus  bacilli, cactus  cacti, focus  foci, fungus  fungi, nucleus  nuclei, g goctopus  octopi, radius  radii, stimulus  stimuli, syllabus  syllabi, terminus  termini, …y y

• A few nouns have different plural forms

corpus corpora genus generacorpus  corpora, genus  genera

• Exception: virus  viruses (regular)

Plural of Foreign Nouns (VI)

• Foreign nouns retain their plural form from the other lang ageother language• Nouns ending in ‘‐ex’ become ‘‐ices’

apex  apices (also apexes), index  indices (also indexes), vortex  vortices)

• Nouns ending in ‘‐ix’ also become ‘‐ices’

appendix appendices (in books) but appendixes (inappendix  appendices (in books) but  appendixes (in the abdomen), cervix  cervices, matrix matrices

Words Always in Singular

• These words are never in plural and are always combined ith a verb in singularcombined with a verb in singular• advice

• dust

• furniturefurniture

• information

k l d• knowledge

• news (although there’s an ‘‐s’ at the end!)

• progress

Words Always in Plural

• These words are never/rarely in singular and are al a s/most often combined ith a verb in pluralalways/most often combined with a verb in plural

barracks (barrack is uncommon), binoculars, briefs, clothes, congratulations, dentures, environs, glasses, goggles, goods, headquarters (use with plural verb more common), jeans, outskirts, pants, people, pliers, police, pajamas, scissors, shears, spectacles/specs, surroundings, trunks, thanks, tights, tongs, trousers, underpants