22
ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali Trasferimento del nucleo GFP

ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

ANIMALI TRANSGENICI : come si producono???

Vettori retroviraliMicroiniezione del DNA

Cellule staminali embrionaliGene targeting/ gene trap

KO condizionaliTrasferimento del nucleo

GFP

Page 2: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

PREMIO NOBEL per la MEDICINA 2007Motivazione: for their work on "principles for introducing specific gene

modifications in mice by the use of embryonic stem cells and gene targeting.”

GENE TARGETING

Mario R. Capecchi

Martin J. Evans Oliver Smithies

Page 3: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

GENE TARGETING

Mutagenesi MIRATA mediante ricombinazione omologa in cellule ES

Permette la creazione di una mutazione in un gene PREDETERMINATO

Questa mutagenesi può avere come risultato:

1)INATTIVAZIONE dell’espressione di un gene (KNOCK-OUT)2)DIMINUZIONE dell’espressione di un gene (KNOCK-DOWN)3)INSERZIONE di un gene difettivo/selvatico (correzione) (KNOCK-IN)

IL GENE TARGETING SFRUTTA LA RICOMBINAZIONE OMOLOGA

Page 4: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

IL GENE TARGETING SFRUTTA LA RICOMBINAZIONE OMOLOGA

Nelle cellule di Mammifero la RICOMBINAZIONE OMOLOGA è un evento MOLTO RARO (a differenza del Lievito)

La frequenza di questo evento aumenta se il grado di OMOLOGIA di sequenzatra il DNA introdotto (esogeno) e il GENE BERSAGLIO (endogeno) è molto elevata

Per questo il clone di DNA esogeno è una sequenza ISOGENICA(derivante dallo stesso ceppo murino)

Page 5: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

vettori utilizzati per vettori utilizzati per GENE TARGETINGGENE TARGETING

1) VETTORI DI INSERZIONE (per produzione di TOPI KNOCK-OUT)

2) VETTORI DI SOSTITUZIONE (per produzione di TOPI KNOCK-IN)

Gene di interesse

M: marker esternoalla regione omologa

Gene di interesse

M: marker internoalla regione omologa

Singolo evento di ricombinazioneDistruzione del locus genico: KO

Doppia ricombinazioneSostituzione di parti del locus genico1)Per correggere un gene2)Per produrne forma inattiva

Page 6: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

ANIMALI TRANSGENICI : come si producono???

Vettori retroviraliMicroiniezione del DNA

Cellule staminali embrionaliGene targeting/ gene trap

KO condizionaliTrasferimento del nucleo

GFP

Page 7: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

KO costitutiviIl limite principale dei

topi transgenici KOper un gene e’ la possibile mortalita’ degli omozigoti

durante lo sviluppo.Soluzione : l’induzione della

mutazione tempo e tessuto specifica

Page 8: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

KO condizionaliIl sistema cre-lox

Sistema che è alla base: meccanismo di ricombinazione del fago P1 con i siti Lox e la ricombinasi

Cre. Si possono ottenere dei mutanti che perdono la regione voluta solo

attivando la ricombinasi Cre.Si devono costruire dei vettori con la regione genetica da eliminare con siti

Lox all’esterno

Con questa strategia si possono ottenere topi transgenici per geni che sono letali in fasi diverse e soprattutto con l’espressione della ricombinasi

Cre tessuto specifica, si può far avvenire il knock-out del gene solo in particolari tessuti dove si esprime o dove si induce Cre.

Page 9: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

SISTEMA CRE-LOXSistema di RICOMBINAZIONE del fago P1

CRE: ricombinasi specifica (permette la ricombinazione tra siti Lox) cyclization recombination

LoxP: locus di crossover (2 seq palindrome di 13bp + regione centrale di 8nt)locus of X-over P1

LoxP “attira” la ricombinasi CRE la quale ricombina le seq di DNA adiacenti

Cre

Page 10: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

tandem palindrome

scambio su cromat. fratelli

DELEZIONE INVERSIONE

INTEGRAZIONE

b

Ma puo’revertire!

Non utilizzatoper topi

transgenici

a b c

a c

a b c

a d c

b cba

a b c

a c

b

a c

ab c

-DELEZIONE se sono in tandem-INVERSIONE se sono palindrome-INTEGRAZIONE se c’è un elemento in un plasmide, e l’altro nelle seq di integrazione

Page 11: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali
Page 12: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

G418

Page 13: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

UTILIZZO SISTEMA CRE-LOX

siti LoxP derivano da fago P1 (non esistono nel genoma animale/vegetale)quindi non possibilità di ricombinazione in altri siti del genoma

Page 14: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

Il SISTEMA Cre-LoxP permette il controllo dell’espressione genicanello SPAZIO e nel TEMPO

Utilizzo di un PROMOTORETESSUTO SPECIFICO Utilizzo di un PROMOTORE

-dipendente dallo STADIO di SVILUPPO-INDUCIBILE

Page 15: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

DELEZIONE di un GENE TESSUTO SPECIFICA (spazio)

Promotoreattivo in cellule

nervose

Page 16: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

ESPRESSIONE di un GENE TESSUTO SPECIFICA (spazio)

Page 17: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

DELEZIONE/KO programmabile ESPRESSIONE/K-IN programmabile

Espressione di Creregolata nel TEMPO/SPAZIO

Espressione di Creregolata nel TEMPO/SPAZIO

Page 18: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

ESPRESSIONE/DELEZIONE di un GENE INDUCIBILE (tempo/spazio)

Sono state prodotte proteine di fusione tra Cre e ER(T) (recettore estrogeni) La ricombinasi è confinata nel citoplasma finche’ non viene somministrato l’ormone sintetico (TAMoxifene) che riconosce il recettore e fa traslocare la proteina di fusione con la ricombinasi nel nucleo dove induce la delezione del frammento incluso tra i due siti LoxP

spazio

tempo

Page 19: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali
Page 20: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

SISTEMA TET-ON/TET-OFF

Sistema che deriva da Operone Tet E.Coli(se c’è tetraciclina, si attivano geni per la resistenza alla Tc)

Sistema a 3 elementi:

TeT-Repressor: repressoredella trascrizioneTc/Dox: tetraciclinaTRE: tetracycline response element

Page 21: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

La Tc SPEGNEil GENE

La Tc ACCENDEil GENE

tTA è sempre un attivatore trascrizionale+/- doxy regola sua capacità di legame al DNA

Page 22: ANIMALI TRANSGENICI : come si producono??? Vettori retrovirali Microiniezione del DNA Cellule staminali embrionali Gene targeting/ gene trap KO condizionali

TRASFERIMENTO DEL NUCLEO clonazione

Pecora Dolly: prima dimostrazione della TOTIPOTENZAdel nucleo di una cellula di individuo adulto differenziata

Il trasferimento nucleare è una tecnica che permette di sostituire il genoma di una cellula con quello derivante da un'altra.

Viene utilizzata per generare animali clonati partendo da cellule di un individuo adulto.

1) Si allontana il NUCLEO di un ovulo2) Si coltivano le cellule epiteliali adulte (G0)3) Si fondono nucleo G0 + ovulo enucleato4) Uovo rinucleato in crescita in coltura/ovidotto5) Embrione si impianta nella madre adottiva

1

2

3

4

Wilmut e collaboratori 1997 Sheep cloned by nuclear transfer from a cultured cell line.