27
ISSN 2566-2899 B B i i l l t t e e n n Udruženja genetičara u Bosni i Hercegovini Br. 9 | Januar, 2020. Aktuelno Virusi Str. 4 Predstavljamo projekt Nargila: užitak ili prijetnja? Str. 22 Tema broja Komet test Međunarodna radionica „Comet workshop – Basic comet assay techniques“ Str. 7

BBiilltteenn - GENuBiHUniverzitet u Sarajevu u ovoj COST akciji i njenom promotivnom videu (). U realizaciji radionice su učestvovali sljedeći međunarodni predavači, eminentni

  • Upload
    others

  • View
    2

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

  • ISSN 2566-2899

    BBiilltteenn UUddrruužžeennjjaa ggeenneettiiččaarraa uu BBoossnnii ii HHeerrcceeggoovviinnii

    Br. 9 | Januar, 2020.

    Aktuelno

    Virusi

    Str. 4

    Predstavljamo projekt

    Nargila: užitak ili prijetnja?

    Str. 22

    Tema broja

    Komet test

    Međunarodna radionica „Comet workshop – Basic comet assay techniques“

    Str. 7

  • 2020 Bilten, 9

    2 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH

    Izdavač

    Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini (GENuBiH)

    Urednik Prof. dr. Sanin Haverić, naučni savjetnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu

    Urednički odbor Akademik Rifat Hadžiselimović, naučni savjetnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu

    Prof. dr. Stojko Vidović, Medicinski fakultet, Univerzitet u Banjoj Luci

    Prof. dr. Kasim Bajrović, naučni savjetnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu

    Prof. dr. Naris Pojskić, naučni savjetnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu

    Prof. dr. Lejla Pojskić, naučni savjetnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu

    Doc. dr. Jasmina Čakar, naučni savjetnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu

    Prof. dr. Adaleta Durmić Pašić, viši naučni saradnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu

    Doc. dr. Anja Haverić, viši naučni saradnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu

    Dr. Naida Lojo Kadrić, viši naučni saradnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu

    Dr. Amra Kazić, naučni saradnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu

    Prof. dr. Semina Hadžiabulić, Agromediteranski fakultet, Univerzitet Džemal Bijedić

    Prof. dr. Izet Eminović, Prirodno-matematički fakultet, Univerzitet u Sarajevu

    Prof. dr. Slavka Ibrulj, naučni savjetnik Medicinski fakultet, Univerzitet u Sarajevu

    Prof. dr. Emina Kiseljaković, Medicinski fakultet, Univerzitet u Sarajevu

    Doc. dr. Mirela Mačkić Đurović, Medicinski fakultet, Univerzitet u Sarajevu

    Prof. dr. Dunja Rukavina, Veterinarski fakultet, Univerzitet u Sarajevu

    Prof. dr. Azra Skender, Biotehnički fakultet, Univerzitet u Bihaću

    Mr. Radmila Malešević, Klinički centar, Banja Luka

    Naslovna stranica: Softverska analiza u komet testu – Laboratorija za citogenetiku i genotoksikologiju Instituta za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju Univerziteta u Sarajevu

    URL: http://www.genubih.ba/Bilten.html

  • Bilten, 9 2020

    Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 3

    SADRŽAJ

    AKTUELNOSTI ............................................................................................................................. 4

    Virusi ........................................................................................................................................... 4

    TEMA BROJA ................................................................................................................................ 7

    Međunarodna radionica „Comet workshop - Basic comet assay techniques“ ............................ 7

    Komet-FISH esej ....................................................................................................................... 11

    Biljni komet test ........................................................................................................................ 14

    Kritične tačke pri izvođenju alkalnog komet testa na oralnim leukocitima .............................. 19

    PREDSTAVLJAMO PROJEKT ................................................................................................... 22

    „Nargila: užitak ili prijetnja?“ ................................................................................................... 22

    NAJAVE KONFERENCIJA ......................................................................................................... 24

  • 2020 Bilten, 9

    4 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH

    AKTUELNOSTI

    Virusi

    Prof. dr. Lejla Pojskić, naučna savjetnica

    Kina je u posljednjih desetak godina,

    postala vodeća svjetska sila u istraživanju

    ljudskih bolesti i novih lijekova. Tako su

    kineske vlasti oformile na desetke prestižnih

    istraživačkih instituta. Jedan od njih je i

    Virusološki institut u Wuhanu koji je i

    lokacija jedine zvanične kineske laboratorije

    najvišeg biosigurnosnog nivoa (PBL-4).

    Neposredno prije puštanja u rad ove

    laboratorije, pojedini svjetski autoriteti iz

    oblasi biosigurnosti upućivali su na rizike od

    biohazarda, zbog neadekvatne kontrole,

    vrste eksperimentalnih životinja i socio-

    kulturološkog odnosa prema biosigurnosnim

    aspektima u laboratoriji koja je tada dobila

    atest i akreditaciju za rad sa virusima

    visokog rizika za ljudsko zdravlje u skladu sa

    međunarodnim standardima.

    Postoji velika vjerovatnoća povezanosti

    zaraze čiji je pretpostavljeni epicenter

    tržnica u Wuhanu koja je udaljena

    četrdesetak kilometara od pomenutog

    instituta. U tom slučaju kineske vlasti i

    nadležna regulatorna tijela koja su izdala

    odobrenje za rad laboratorije, a prema

    međunarodnim biosigurnosnim

    smjernicama i zakonima, dužna su provesti

    istragu o sličnosti virusnog soja koji je

    izazvao zarazu među ljudima u provinciji

    Wuhan sa globalnim rizikom širenja i onog

    koji se čuva u laboratorijskim uslovima

    Biosigurnosne laboratorije Virusološkog

    instituta u Wuhanu, te provesti mjere

    sanacije i prevencije svakog biosigurnosnog

    rizika i posljedica koje eventualno utvrđeni

    biosigurnosni događaj može imati na ljudsko

    društvo.

    Slika 1: Naučnici sa Virusološkog instituta u Wuhanu obučeni po standardima zaštite za laboratorije najvišeg (četvrtog) biosigurnosnog nivoa u proučavanju najopasnijih patogena kao što su virusi ebole i SARS-a

    (preuzeto sa Dailymail.co.uk 23.1.2020.)

  • Bilten, 9 2020

    Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 5

    Virusi su zarazne čestice koje nisu

    sposobne da aktivno egzistiraju van ćelija

    domaćina tj. da se dijele i multipliciraju. Te

    čestice sadrže genetički materijal (virusni

    genom) koji je obavijen proteinskim

    zaštitnim omotačem (kapsidom). Genetički

    materijal sadrži informaciju za sintezu

    virusnih proteina i to samo kada su unutar

    ćelije-domaćina kada koriste njegove

    „resurse“ za biološku sintezu.

    Virusne čestice zaražavaju vrlo specifičnu

    vrstu domaćina i tako razlikujemo

    bakterijske, biljne, animalne i humane

    viruse. Virusi koji imaju sposobnost

    zaražavanja ljudskih ćelija, često uzrokuju

    virusne zarazne bolesti kada izazivaju

    određene simptome (respiratorne i druge

    infekcije). Kada nastupi virusna infekcija,

    virus se sistemski širi. U određenoj fazi

    virusne infekcije se između ljudskih jedinki

    prenose kontaktom tj. preko tjelesnih

    tekućina (pljuvačka, krv, urin, itd.). Do većeg

    širenja virusnih infekcija dolazi usljed

    mutiranja virusa i formiranja novih virusnih

    oblika protiv kojih ne postoji prirodni ili

    stečeni imunitet kod čovjeka. Najpoznatiji

    prirodni rezervoari viroza opasnih za čovjeka

    su nedostupni šumski ekosistemi koji se u

    incidentalnim događajima kontakta sa

    čovjekom „otpuštaju“ i prenose u daljoj

    međuljudskoj komunikaciji (najpoznatiji je

    primjer virus ebole). Drugi potencijalni rizik

    su vještački rezervoari virusa (virusološke

    laboratorije) gdje se virusi namjerno

    umnožavaju i modificiraju, ali sa motivima

    njihovog istraživanja za ljudsko zdravlje i

    prevencije širenja infekcija.

    Većina virusnih zaraznih bolesti koje su

    opasne po ljudsko zdravlje, tj. one koje se

    lako šire među ljudima i izazivaju teške

    zdravstvene posljedice su sanirane u javno-

    zdravstvenim programima vakcinacije, kada

    se ljudi imuniziraju i time stiču sposobnost

    prepoznavanja virusa i njihove uspješne

    eliminacije – otpornost na virusne infekcije.

    Do otkrića vakcina se dolazi u mukotrpnim

    laboratorijskim istraživanjima biologije

    samog virusa kada se pokušava izolirati

    specifična molekula tj. biološka meta

    buduće antiviralne terapije. Nakon toga se

    proizvode vakcine, tj. antigeni čija se

    učinkovitost u odbrani od virusnih infekcija

    testira u eksperimentalnim uslovima i na

    eksperimentalnim modelima ćelija, tkiva i

    organizama (eksperimentalnih životinja).

    U svijetu postoji pedesetak laboratorija

    koji se bave izolacijom, uzgojem i

    proučavanjem za ljude visokorizičnih virusa

    (EBOLA- virus, SARS-virus, virusi

    pandemijske gripe, itd.), a sve s ciljem

    istraživanja adekvatnih lijekova za

    prevenciju i liječenje bolesti koje oni

    uzrokuju. Ove laboratorije su izgrađene i

    djeluju po strogo propisanim

    međunarodnim standardima i kontrolom, te

    prolaze detaljnu provjeru pouzdanosti kadra

    i opreme, te drugih uslova rada prije

    stavljanja u pogon. Takve laboratorije ili

    laboratorije četvrtog tj. najvišeg

    biosigurnosnog nivoa (PBL-4) su zatvoreni i

    izolovani sistemi u kojoj postoji visoka

    kontrola rizika od curenja infektivnog

    materijala. Sav otpad mora biti maksimalno

    neutraliziran, a osoblje izolovano od

  • 2020 Bilten, 9

    6 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH

    mogućnosti infekcije i daljeg širenja zaraze.

    Eksperimentalne životinje su također pod

    visokom kontrolom da ne bi došlo do

    interakcije sa osobljem i mogućim

    prenosom infekcije.

    U slučaju izbijanja pandemije virusnih

    bolesti kod čovjeka, neophodna je

    orkestrirana međunarodna akcija pod

    koordinacijom Svjetske zdravstvene

    organizacije (WHO) praćenja i kontrole

    širenja virusnih infekcija. Pored

    epidemiološke sanacije rizika, u ostale mjere

    spadaju usaglašene smjernice za

    dijagnostiku tj. otkrivanje uzročnika i

    potvrdu porijekla virusne infekcije, te

    razmatranje treapijskih opcija i potencijalnih

    vakcinacijskih strategija.

  • Bilten, 9 2020

    Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 7

    TEMA BROJA

    Međunarodna radionica „Comet workshop - Basic comet assay techniques“

    Mr. Tamara Ćetković, viša stručna saradnica

    Dr. Anja Haverić, viša naučna saradnica

    Udruženje genetičara u BiH je u saradnji

    sa Institutom za genetičko inženjerstvo i

    biotehnologiju i „hCOMET - The comet assay

    as a human biomonitoring tool (CA15132)“

    COST akcijom organizovalo međunarodnu

    radionicu pod nazivom „Comet workshop –

    Basic comet assay techniques“, koja je

    održana 5. - 6. oktobra 2019. godine.

    Suorganizator radionice, evropska mreža

    naučnika „hCOMET - The comet assay as a

    human biomonitoring tool (CA15132)“ je

    obezbijedila novčana sredstva za troškove

    puta i smještaja inozemnih predavača koji

    su došli iz Norveške, Portugala, Španije,

    Francuske, Hrvatske i Turske te stipendije za

    12 međunarodnih od ukupno 30 učesnika.

    Radionica je okupila brojne učesnike iz

    Hrvatske, Srbije, Turske, Italije i Češke.

    Organizator i predavač na radionici iz BiH

    bila je dr. Anja Haverić, viša naučna

    saradnica Instituta za genetičko inženjerstvo

    i biotehnologiju UNSA, koja predstavlja

    Univerzitet u Sarajevu u ovoj COST akciji i

    njenom promotivnom videu

    (www.hcomet.eu).

    U realizaciji radionice su učestvovali

    sljedeći međunarodni predavači, eminentni

    naučnici u pripadajućoj oblasti: prof. dr.

    Andrew Collins – voditelj hCOMET COST

    akcije (Oslo, Norveška), prof. dr. Joao Paulo

    Teixeira (Porto, Portugal), prof. dr. Amaya

    Azqueta Oscoz (Pamplona, Španija), prof. dr.

    Bertrand Pourrut (Tuluz, Francuska), prof.

    dr. Mirta Milić (Zagreb, Hrvatska), prof. dr. i

    Nermin Gozukirmizi (Istanbul, Turska).

    Uvodnu riječ o Udruženju genetičara u

    BiH i Institutu za genetičko inženjerstvo i

    biotehnologiju UNSA, kao domaćinima ove

    radionice, dao je direktor Instituta, prof. dr.

    Naris Pojskić. Voditelj hCOMET COST akcije

    prof. dr. Andrew Collins održao je

    predavanje o glavnim ciljevima akcije,

    samim počecima primjene alkalnog comet

    eseja i osnovama primjene ovog testa.

    S obzirom da se comet test rutinski ne

    primjenjuje u Bosni i Hercegovini, cilj ove

    edukacije je njeno uvođenje u širu

    nastavno-naučnu i istraživačku praksu u

    Bosni i Hercegovini. Program dvodnevne

    radionice bio je fokusiran na standardizirane

    protokole za comet test u eukariotskim

    ćelijama, s ciljem da se mladi i iskusni

    naučnici oslanjaju na njih u svojim budućim

    istraživanjima.

    Budući da je comet test metoda za

    detekciju oštećenja DNK u pojedinačnim

    eukariotskim ćelijama, koja se koristi već 30

    godina, tokom prvog dijela praktičnog rada

    http://www.hcomet.eu/

  • 2020 Bilten, 9

    8 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH

    sa učesnicima predavači su dijelili svoja

    iskustva, prolazeći s njima osnovne korake

    postavke eksperimenta za comet test.

    Metoda je zasnovana na lizi ćelija, nakon što

    je suspenzija ćelija fiksirana u agarozi na

    predmetnom staklu, da bi došlo do

    odmotavanja DNK u alkalnim uslovima.

    Elektroforeza na visokoj pH vrijednosti

    rezultira strukturama koje liče na komete,

    koje se posmatraju na fluoroscentnom

    mikroskopu. Intenzitet i dužina repa komete

    u odnosu na glavu odražava broj DNK

    oštećenja. Analiza ima primjenu u ispitivanju

    genotoksičnosti novih hemikalija, praćenju

    kontaminacije okoliša genotoksinima,

    biomonitoringu ljudskih populacija i

    molekulskoj epidemiologiji te

    fundamentalnim istraživanjima oštećenja i

    popravka DNK (Collins, 2004).

    U drugom dijelu radionice učesnici su

    imali mogućnost da vizuelno i primjenom

    softvera za obradu slika (Comet Assay IV,

    Instem, UK) analiziraju dobivene,

    fluorescentno obojene komete, kako bi

    odredili stepen oštećenja DNK.

    Slike 1-4: Otvaranje radionice, predavanja i praktični rad

  • Bilten, 9 2020

    Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 9

    Slike 5-9: Praktični rad i predavanja

    Na samom kraju organizovana je diskusija

    na temu važnih faktora koji mogu da utiču

    na izvođenje i uspješnost comet testa, kao i

    na interpretaciju dobijenih rezultata na kojoj

    su učesnici imali priliku da sumiraju stečeno

    znanje tokom intenzivne radionice.

    Cijeli događaj (Slike 1 - 10) zaokružen je

    uručivanjem certifikata, razmjenom korisnih

    informacija, zahvalama organizatorima i

    predavačima na uspješno održanoj

    međunarodnoj radionici i saradnji, kao i

    učesnicima na njihovom interesovanju.

  • 2020 Bilten, 9

    10 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH

    Slika 10: Predavači i učesnici radionice Ispred Instituta za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju

    Univerziteta u Sarajevu

    Radionica predstavlja značajan doprinos

    uvođenju nove široko primjenjive metode u

    bh. genetiku i srodne aplikativne naučne

    oblasti ali i priliku za uspostavljanje veza sa

    naučnicima iz evropskih centara i

    započinjanje novih kolaborativnih projekata.

    Realizacija radionice „Comet Workshop –

    Basic comet assay techniques“ je

    omogućena sredstvima Ministarstva civilnih

    poslova BiH, a inicijalna sredstva za

    primjenu ove metode na Univerzitetu u

    Sarajevu obezbijedili su Ministarstvo za

    obrazovanje, nauku i mlade Kantona

    Sarajevo i Institut za genetičko inženjerstvo i

    biotehnologiju UNSA.

    Udruženje genetičara u BiH će nastojati

    da i u budućim redovnim aktivnostima

    organizuje stručna usavršavanja iz različitih

    oblasti genetike, u saradnji sa Institutom za

    genetičko inženjerstvo i biotehnologiju

    UNSA.

    Literatura

    Collins, A.R. (2004) The comet assay for DNA damage and repair: principles, applications, and limitations.

    Mol Biotechnol. 26(3): 249-261.

  • Bilten, 9 2020

    Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 11

    Komet-FISH esej

    Mr. Mahira Mehanović

    Irma Durmišević, BSc.

    Komet esej je jedna od najčešće

    korištenih tehnika za mjerenje i detekciju

    nivoa oštećenja DNK u eukariotskim

    ćelijama. Ova tehnika može detektovati

    brojna oštećenja, uključujući jednolančane i

    dvolančane lomove, fotodimere, alkalno-

    labilna mjesta u frekvencijama od nekoliko

    stotina do nekoliko hiljada lomova u

    pojedinačnim ćelijama. Najčešća primjena

    ovog eseja je za in vitro i in vivo procjenu

    genotoksičnosti hemikalija, toksina i fizičkih

    agenasa te izloženosti okoliša

    karcinogenima. Mnoge su pogodnosti

    korištenja komet eseja obzirom da je riječ o

    senzitivnoj i rapidnoj tehnici koja

    omogućava proučavanje ćelija iz različitih

    tkiva dobivenih uzorkovanjem iz velikog

    broju različitih eukariotskih organizama. Ova

    metoda je također primjenjljiva i za

    mjerenje kapaciteta popravljanja DNK u

    živim ćelijama i acelularnim sistemima.

    Pored toga, koristi se i u prenatalnom

    dijagnostičkom ispitivanju sindroma kao što

    su xeroderma pigmentosum (XP) i

    trihotiodistrofija (TTD) (Trzeciak et al.,

    2008).

    Postoje dvije osnovne varijante ovog

    eseja: neutralni i alkalni komet esej. U

    neutralnim uvjetima (pH=7), molekula DNK

    je očuvana kao dvolančana struktura što

    omogućava otkrivanje dvolančanih lomova,

    dok je u alkalnim uvjetima (pH>7)

    omogućena istovremena detekcija i

    jednolančanih i dvolančanih lomova DNK,

    kao i alkalno-labilnih mjesta, što dovodi do

    zaključka da je alkalni komet esej znatno

    osjetljiviji u odnosnu na neutralnu varijantu

    (Peycheva et al., 2009). Kako god,

    kombinacija elektroforeze, fluorescentne

    mikroskopije i interpretacija dobijenih

    kometa, omogućava da i alkalni i neutralni

    komet esej pruže zadovoljavajuće pristupe i

    informacije za procjenu i analizu oštećenja

    DNK in vitro.

    Od kada su Ostling i Johansson razvili ovu

    tehniku 1984. godine postoje različite

    modifikacije komet eseja. Tako se, na

    primjer, veća specifičnost može postići

    korištenjem ove metode u kombinaciji sa

    fluoroscentnom in situ hibridizacijom (FISH)

    koja omogućava detekciju DNK sekvenci od

    interesa primjenom specifično označenih

    proba. Kombinacija ove dvije tehnike

    omogućava detekciju ukupnog kao i

    oštećenja određenog dijela DNK, ali i

    detekciju reparacije u pojedinačnim

    ćelijama. Naime osnova ove tehnike je

    komet esej u kojem se ćelije fiksirane u

    agarozi na mikroskopskom stakalcu liziraju i

    izlažu elektroforezi pri čemu se

    fragmentirana i nefragmentirana DNK

    odvajaju i stvaraju tzv. komete. Nakon toga

  • 2020 Bilten, 9

    12 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH

    moguće je posmatrati sveukupno oštećenje

    DNK na fluorescentnom mikroskopu

    primjenom odgovarajuće boje. No ovaj

    modifikovani test nakon odmotavanja DNK i

    elektroforeze uključuje dodatni korak

    hibridizacije koji omogućava označavanje

    specifične sekvence unutar kometa. Za to se

    koriste različite DNK probe poput genski

    nespecifičnih proba: centromerne,

    telomerne, probe za ribosomalna DNK

    ponavljanja, SINE, LINE te genski specifične

    probe poput oligonukleotida, PCR

    produkata, BAC, YAC i drugih (Shaposhnikov

    et al., 2009). Vizualizacija FISH kometa

    omogućava lokalizaciju specifičnih sekvenci

    unutar područja glave ili repa kometa,

    odnosno oštećenog ili neoštećenog dijela

    (slika 1). Ukoliko se fluoroscentni signali

    uočavaju na području repa komete to

    ukazuje da se oštećenja događaju u blizini

    ispitivanih sekvenci ili gena od interesa.

    Komet-FISH esej također postoji u dvije

    verzije, neutralni i alkalni pri čemu je u

    alkalnom eseju broj signala udvostručen

    obzirom da se FISH probe vežu na oba lanca

    DNK što nije slučaj u neutralnim uvjetima.

    Slika 1. Prikaz FISH kometa (neoštećena, lijevo; oštećena, desno) obojenih SYBR-Green sa dva

    TP53 signala (Glei et al., 2009)

    Osim istraživanja strukturne organizacije

    DNK i hromatina, te lokalizacije oštećenja

    DNK ovom tehnikom moguće je istraživati i

    kinetiku popravke oštećenja praćenjem

    relokalizacije signala specifičnih gena (poput

    TP53, DHFR, MGMT gena) iz repa u područje

    glave komete tokom perioda inkubacije

    (Shaposhnikov et al., 2015). Ova aplikativna

    tehnika omogućava istraživanje indukcije i

    otkljanjanja DNK modifikacija i lezija

    uključujući jednostruke i dvostruke lomove,

    lezije uklonjene ekscizijom baza ili

    nukleotida, ribonukleotide ugrađene u DNK

    te DNK demetilaciju pružajući uvid u

    molekularne mehanizme različitih puteva

    reparacije (Mondal et al., 2017). Tako je ova

    tehnika pronašla primjenu za detekciju

    specifičnih lomova u DNK regijama koje su

    važne za nastanak različitih bolesti.

    Dokazano je da je komet-FISH tehnika

    prikladna za istraživanje odabranih

    genetičkih promjena što povećava

  • Bilten, 9 2020

    Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 13

    mogućnost karakterizacije endogenih

    faktora rizika kao potencijalnih faktora u

    procesu kancerogeneze gornjeg

    aerodigestivnog trakta, a upotreba proba

    specifičnih za različite hromosomske regije

    može pružiti dodatne informacije o vrsti

    aberacije.

    Izloženost ionizirajućem zračenju može

    uzrokovati druge maligne bolesti. Samim

    tim, postoji potreba za pouzdanom

    metodom za brzo i precizno mjerenje

    oštećenja nastalih usljed zračenja. Nedavna

    istraživanja opisala su specifičnu in situ

    hibridizaciju Ret, Abl1 i Trp53 gena u

    ćelijama periferne krvi miševa C57BL/6 i

    CBA/J sojeva, kao pokazatelja oštećenja

    izazvanog zračenjem. Iako su rezultati

    komet eseja dali značajne rezultate zbog

    interindividualne i eksperimentalne

    varijabilnosti, Komet-FISH rezultati za ova

    tri gena na statistički značajan način su

    diskriminirali efekte testiranih doza (Glei et

    al., 2009).

    Na kraju, za komet-FISH tehniku možemo

    reći da je vrlo obećavajući i vrlo koristan alat

    u otkrivanju ukupnog oštećenja i popravke

    DNK određenih genskih regiona u

    pojedinačnim ćelijama. Iako nije moguće sa

    sigurnošću zaključiti da se oštećenja i

    popravci događaju unutar određenog gena,

    ova metoda omogućava procjenu ovih

    događaja u blizini gena od interesa.

    Također, ova metoda može pomoći i u

    boljem razumijevanju mehanizama razvoja

    kancera i hemoprevencije.

    Literatura

    Glei, M., Hovhannisyan, G., Pool-Zobel, B. (2009) Use of Comet-FISH in the study of DNA damage and

    repair: Review. Mutation Research. 681(1): 33-43.

    Mondal, M. i Guo, J. (2017) Comet-FISH for Ultrasensitive Strand-Specific Detection of DNA Damage in

    Single Cells. Methods in Enzymology. 591: 83-95.

    Peycheva, E., Georgieva, M., Miloshev, G. (2009) Comparison BetweenAlkaline and Neutral Variants of

    Yeast Comet Assay. Biotechnology & Biotechnological Equipment. 23(1): 1090-1092.

    Shaposhnikov, S., El Yamani, N., Collins, A. (2015) Fluorescent In Situ Hybridization on Comets: FISH

    Comet. U S. Chellappan, Chromatin Protocols. Humana Press, New York.

    Shaposhnikov, S., Frengen, E., i Collins, A. (2009) Increasing the resolution of the comet assay using

    fluorescent in situ hybridization - a review. Mutagenesis. 24(5): 383-389.

    Trzeciak, A.R., Barnes, J.I., Evans, M.K. (2008) A Modified Alkaline Comet Assay for Measuring DNA

    Repair Capacity in Human Populations. Radiation Research. 169(1): 110-121.

  • 2020 Bilten, 9

    14 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH

    Biljni komet test

    Selma Behmen, BSc.

    Biljna biomasa predstavlja preko 90%

    ukupne mase žive biote. Lanac ishrane u

    biosferi započinje biljkama, međutim,

    genotoksični učinci polutanata na biljne

    sisteme često su zanemareni. Kao sjedilački

    organizmi, biljke su stalno izložene

    utjecajima okoliša. Stoga su biljke široko

    korištene za procjenu toksičnosti hemijskih

    spojeva i za bionadzor kako vodenih tako i

    kopnenih ekosistema. Međutim, iako je u

    posljednjih nekoliko decenija postignut brz

    napredak u određivanju utjecaja faktora na

    indukciju genetičkog oštećenja u ljudskoj

    populaciji, došlo je do relativno ograničenog

    napretka u utvrđivanju utjecaja takvih

    faktora na divlje vrste, a posebno biljke.

    Metoda za evaluaciju oštećenja DNK u

    biljnim tkivima je biljni komet test (Pourrut

    et al., 2015). Komet test ili gel eketroforeza

    pojedinačnih ćelija je tehnika procjene

    genotoksičnosti in vitro, a prva izvješća o

    upotrebi komet testa na biljkama datiraju iz

    1990-ih. Naziv komet potječe od

    karakterističnog izgleda ćelija sa oštećenim

    genetičkim materijalom, koje posmatrane

    na preparatu pod mikroskopom, izgledaju

    kao komete (Navarrete et al., 1997; Collins,

    2004). Primjena komet testa na biljnim

    tkivima signifikantno proširuje upotrebu

    biljaka u osnovnim i primijenjenim

    studijama u okolišnoj mutagenezi i

    toksikologiji (Navarrete et al., 1997). Tokom

    posljednje decenije, jednoćelijska gel

    elektroforeza ili komet test postali su jedna

    od najperspektivnijih tehnika koje se koriste

    u području genetičke ekotoksikologije

    zahvaljujući svojoj jednostavnosti,

    osjetljivosti, svestranosti, brzini i

    ekonomičnosti. Alkalna verzija testa

    uspostavljena je nekoliko godina kasnije od

    strane Koppena i Verschaevea upotrebom

    korijena jedinki vrste Vicia faba (Pourrut et

    al., 2015). Teoretski, test se može primjeniti

    na svakoj biljnoj vrsti. Također, zbog lakoće

    uzgoja u kontrolisanim uvjetima, koriste se i

    jedinke vrsta Allium cepa, Nicotiana

    tabacum i Arabidopsis thaliana (Dhawan et

    al., 2009).

    Izolacija nukleusa

    Metodologija komet testa (Slika 1)

    počinje izolacijom nukleusa što je ujedno I

    najvažniji korak u ovom testu a primjenjuju

    se dvije metode: formiranje protoplasta (tj.

    biljnih ćelija s uklonjenim ćelijskim zidom) ili

    mehanički postupci kao što su izolacija

    nukleusa iz biljne ćelijske suspenzije i

    izolacija nukleusa iz intaktnog korijena ili

    lišća. Metoda formiranja protoplasta nije

    pogodna za toksikološke studije, a sam

    postupak je dugotrajan i skup (Abas et al.,

    2007). Također, ni postupak dobijanja

    nukleusa iz biljne ćelijske suspenzije se više

    ne praktikuje. Trenutno aktuelni postupak,

  • Bilten, 9 2020

    Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 15

    kojeg su Pourrut i saradnici (2015)

    modificirali je izolacija nukleusa iz intaktnog

    korjena i lišća. Navedeni autori su

    identificirali ključne korake metodologije i

    predložili optimizirani protokol za povećanje

    njegove pouzdanosti. Nukleusi iz korjena ili

    lišća mogu se izolirati rezanjem malog

    komadića lista (približno 2 cm x 2 cm) ili

    dijela korijena novom (čistom I oštrom)

    britvicom (žiletom). Ovaj se postupak

    provodi na ledu u plastičnoj Petrijevoj

    posudi s 320 ml 0,4 M Tris-HCl pufera, pH =

    7.5. Komadić lista ili korjena se brzim

    pokretima usitnjava na male djeliće uz

    pomoć britvice otprilike 30 s. Petri posuda

    se drži nagnuta u ledu kako bi se izolirani

    nukleusi sakupljali u puferu (Gichner et al.,

    2008; Pourrut et al., 2015). Mora se obratiti

    pozornost na prisutnost hloroplasta jer su

    oni važan izvor slobodnih radikala i

    oksidativnih oštećenja stoga se postupak

    provodi pod crvenim svijetlom kako bi se

    izbjegla oštećenja izazvana svijetlom

    (Pourrut et al., 2015).

    Slika 1: Metodologija biljnog komet testa

    Pravljenje preparata

    Mikroskopska stakalca drže se u etanolu

    otprilike jednu sedmicu. Stakalca se zatim

    potapaju u 1% agarozu normalne tačke

    topljenja (NMPA) na 50°C. Stražnji dio

    stakalaca obriše se kako bi se uklonio višak

    agaroze i postavi se horizontalno na ravnu

    površinu za sušenje na sobnoj temperaturi.

    Drugi sloj agaroze koji se postavlja na

    stakalca je mješavina 1% agaroze s niskom

    tačkom topljenja (LMPA) i suspenzije svježe

    izoliranih nukleusa. Suspenzija nukleusa

    pomiješana s LMPA pri 40°C, u omjeru 1: 1 u

    mikroepruveti, 100 l smjese se stavi na

  • 2020 Bilten, 9

    16 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH

    svaki preparat i pokrije pokrovnicom.

    Preparati se postavljaju na hladnu površinu

    najmanje 5 minuta nakon čega se

    pokrovnice uklanjaju a preparati su spremni

    za denaturaciju i elektroforezu (Gichner et

    al., 2008). Na jedno stakalce se mogu

    napraviti dva gela tzv. two gel format.

    Međutim, u svrhu analize većeg broja

    uzoraka istovremeno postoje i 12, 48 i 96

    gel formati.

    Denaturacija i elektroforeza

    Postavljanjem preparata na denaturaciju

    DNK se odmotava i oslobađa od histona i

    drugih nehistonskih proteina. Denaturacija i

    elektroforeza DNK se odvijaju pri pH

    vrijednosti od 7 do 8. Pri neutralnom pH

    olakšano je otkrivanje dvostrukih lomova, a

    ukupno oštećenje DNK je manje izraženo

    nego u alkalnim uvjetima što je prednost pri

    proučavanju ćelija koje imaju visoku razinu

    oštećenja (Angelis et al., 1999). Denaturacija

    DNK i elektroforeza pri alkalnom pH

    (pH=12,1–12,4) olakšavaju otkrivanje

    jednolančanih i dvolančanih lomova i

    nepotpune ekscizije. Za studije toksičnosti,

    provodi se alkalni komet s pri pH>13.

    Postupak odmotavanja DNK može se izvesti

    potapanjem preparata u otopinu za

    elektroforezu u Koplinovoj posudi koja se

    stavi na led ili uranjanjem preparata u

    otopinu za elektroforezu na 4–8°C u kadici

    za elektroforezu (Angelis et al., 1999). Treba

    optimizirati trajanje denaturacije DNK za

    svaku biljnu vrstu.

    Optimizacija komet testa odnosi se na

    najprikladnije vrijeme denaturacije i

    elektroforeze. Vrijeme elektroforeze ovisi o

    temperaturi, naponu na udaljenosti između

    anode i katode (V/cm), amperaži i pH

    otopine za elektroforezu. Npr, u alkalnom

    komet testu kalibriranom za paradajz

    (Solanum tuberosum), optimalno vrijeme

    denaturacije bilo je 10 min, nakon čega je

    slijedila elektroforeza u trajanju od 15 min

    na 0,74 V/cm (26 V, 300 mA) i 4-81°C

    (Gichner et al., 2008). U drugim biljnim

    vrstama s istim naponom elektroforeze

    moraju se upotrijebiti različita vremena

    denaturacije i elektroforeze, npr. za biljke

    duhana 15 min denaturacija i elektroforeza

    25 min, 20 za pšenicu (Triticum durum) 5

    min denaturacija i 15 min elektroforeza i za

    maslačak (Taraxacum officinale) 30 min

    denaturacija i 30 min elektroforeza (Gichner

    & Muhlfeldova, 2002).

    Po završetku elektroforeze preparati se

    fiksiraju dva puta po 5 minuta u PBS-u, a

    nakon toga u 95% etanolu te se pohranjuju

    u kutije za čuvanje stakalaca (Pourrut et al.,

    2015).

    Bojenje

    Različiti fluorohromi se primjenjuju u

    komet testu za bojenje DNK, npr. akridin

    narančasto, DAPI, EtBr, propidijev jodid. Za

    alkalnu verziju biljnog komet testa mogu se

    koristiti fluorohromi EtBr, DAPI i YOYO-1 sa

    sličnom učinkovitošću pri čemu je YOYO-1

    vrlo skup i nestabilan. Najčešće korištena

    boja u komet testu je EtBr, a u manjoj mjeri i

    DAPI (Gichner et al., 2006), pri čemu se sve

    više favorizuje odabir što manje toksičnih

    boja.

  • Bilten, 9 2020

    Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 17

    Analiza preparata

    Preparati se mogu analizirati softverski ili

    vizualno. Glavni parametri stepena

    oštećenja DNK pri softverskoj analizi su %

    repne DNK (% ukupne fluorescencije u repu)

    ili repni trenutak (TM) (dužina repa se množi

    s intenzitetom fluorescencije u repu

    podijeljenom sa 100, izraženo u mm)

    (Kumaravel & Jha, 2006). Ukoliko se koristi

    metoda vizualnog bodovanja komete su

    svrstane u jednu od pet klasa prema

    intenzitetu repa i označavaju se kao 0, 1, 2,

    3 ili 4 (od neoštećene klase 0, do

    maksimalno oštećene 4). Analizira se 150

    kometa po uzorku, odnosno 50 po gelu

    (Pourrut et al., 2015).

    Razlika između animalnog i biljnog komet

    testa

    Glavna razlika između biljnog i animalnog

    komet testa ogleda se u činjenici da biljne

    ćelije posjeduju celulozni ćelijski zid dok

    animalne ćelije imaju samo ćelijsku

    membranu. Nukleusi iz ljudskih i životinjskih

    ćelija mogu se izolirati liziranjem s visokim

    koncentracijama soli i deterdžentima što u

    biljnom komet testu predstavlja nepotrebno

    tošenje vremena te se pripremljeni

    preparati odmah postavljaju u otopinu za

    denaturaciju, odnosno odmotavanje DNK

    (Moller, 2005; Pourrut et al., 2015).

    Podaci govore da ova jednostavna

    tehnika može biti moćan alat za nadopunu

    konvencionalnih metoda in situ praćenja

    zagađenja okoliša. Štaviše, nova polja

    istraživanja koja koriste analizu biljnih

    kometa otvorena su, ne samo u studijama

    okoliša, već i u fiziologiji biljaka, jer ova

    tehnika može pomoći u rasvjetljavanju

    metaboličkih puteva uključenih u razvoj

    biljaka, ćelijski ciklus / programiranu ćelijsku

    smrt ili čak rezistentnost na biljne bolesti.

    Također je i dalje važno polje istraživanja

    dešifriranja genetičkih mehanizama

    povezanih sa oštećenjem / popravkom DNK,

    u kojem će analiza kometa nesumnjivo imati

    presudnu ulogu.

    Literatura

    Abas, Y., Touil, N., Kirsch-Volders, M., Angenon, G., Jacobs, M., Famelaer, I. D.H. (2007) Evaluation of UV

    damage at DNA level in Nicotiana plumbaginifolia protoplasts using single-cell gel electrophoresis. Plant

    Cell Tiss. Organ Cult. 91: 145.

    Angelis, K. J., Dusinska, M., Collins, A. (1999) Single-cell gel electrophoresis: Detection of DNA damage at

    different levels of sensitivity. Electrophoresis. 20(10): 2133-2138.

    Collins, A. (2004) The comet assay for DNA damage and repair: principles, applications, and limitations.

    Molecular Biotechnology. 26(3): 249-261.

    Dhawan, A., Bajpayee, M., Parmar, D. (2009) Comet assay: a reliable tool for the assessment of DNA

    damage in different models. Cell. Biol. Toxicol. 25(1): 5-32.

  • 2020 Bilten, 9

    18 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH

    Gichner, T., Muhlfeldova, Z. (2002) Induced DNA-damage measured by the Comet assay in 10 weed

    species. Biologia Plantarum. 45(4): 509-516.

    Gichner, T., Mukherjee, A., Veleminsky, J. (2006) DNA staining with the fluorochromes EtBr, DAPI and

    YOYO-1 in the Comet assay with tobacco plants after treatment with ethyl methanesulfonate,

    hyperthermia and DNase-I. Mutation Research. 605(1-2): 17-21.

    Gichner, T., Znidar, I., Szakova, J. (2008) Evaluation of DNA damage and mutagenicity induced by lead in

    tobacco plants. Mutation Research. 652(2): 186-190.

    Kumaravel, T. S., Jha, A. N. (2006) Reliable Comet assay measurements for detecting DNA damage

    induced by ionising radiation and chemicals. Mutation Research. 605(1-2): 7-16.

    Moller, P. (2005) Genotoxicity of environmental agents assessed by the alkaline Comet assay, Basic Clin.

    Pharmacol. Toxicol. 96(suppl. 1): 1-42.

    Navarrete, M.H., Carrera, P., Miguel, M., Torre, C. (1997) A fast Comet assay variant for solid tissue cells.

    The assessment of DNA damage in higher plants, Mutation. Research. 389(2-3): 271-277.

    Pourrut, B., Pinelli, E., Celiz Mendiola, V., Silvestre, J., Douay, F. (2015) Recommendations for increasing

    alkaline comet assay reliability in plants. Mutagenesis. 30(1): 37-43.

  • Bilten, 9 2020

    Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 19

    Kritične tačke pri izvođenju alkalnog komet testa na oralnim leukocitima

    Alen Džaferspahić, student

    Alkalni komet test

    U zadnje dvije decenije, nove

    metodologije pomoću kojih je moguća

    procjena DNK oštećenja su rapidno razvijane

    ili su vršene modifikacije već postojećih.

    Takav slučaj je i sa metodom koja je poznata

    pod nazivom komet test. Ostling i Johanson

    su još 1984. godine razvili komet test koji se

    još naziva ćelijska gel elektroforeza (single-

    cell gel electrophoresis – SCGE). Ova

    metodologija se modificirala tokom godina

    te je tako Singh sa saradnicima 1988. godine

    izveo elektroforezu pod alkalnim uslovima

    (pH>13), a Olive i saradnici 1990. pod

    neutralnim uslovima. Alkalni komet test se

    pokazao kao senzitivnija metoda te je

    postao popularan još 90-tih godina, ali i

    danas predstavlja jednu od najčešće

    korištenih metoda u evaluaciji DNK

    oštećenja (Piperakis, 2009). Ovu činjenicu

    potvrđuje podatak pretrage PubMed baze

    podataka prema kojoj je u 2008. bilo

    obavljeno 4154 unosa pod pretragom pojma

    “comet assay”. Pod tim istim pojmom u

    decembru 2019. broj unosa iznosi 11784.

    Komet test predstavlja jednostavnu i brzu

    tehniku za određivanje DNK oštećenja.

    Njegov naziv potiče od izgleda ćelija

    dobijenih ovom metodom koje bojenjem i

    posmatranjem pod fluorescentim

    mikroskopom sliče stvarnim kometama.

    Posmatranjem repova ćelija, odnosno

    kometa, moguće ih je klasificirati te na

    osnovu njihove dužine i intenziteta zaključiti

    o DNK oštećenju u posmatranom uzorku

    (Slika 1). Ono što ih svrstava u idealne

    biomarkere jeste raznolikost polja u kojima

    se može primjenjivati krenuvši od humanih

    studija, ekološkog monitoringa,

    genotoksikoloških testiranja, procjene

    uspješnosti DNK sistema popravke i mnogih

    drugih. Također uzorci koji mogu biti

    korišteni u ovom testu su mnogobrojni. Tu

    spadaju krvni ili tkivni uzorci, sperma, razni

    tipovi epitelnih ćelija kao i oralni leukociti

    (Rojas et al., 2014; Cortes-Gutierrez et al.,

    2014; Brunborg et al., 2015). Kao i u većini

    testova varijabilnost dobijenih rezultata

    predstavlja ozbiljan problem, što je slučaj i

    sa komet testom (Langie et al., 2015).

    Komet esej i oralni leukociti

    Konkretan primjer mogućeg dobijanja

    varijabilnih, nekvalitetnih i nereproducibilnih

    rezultata je uočljiv primjenom komet testa

    na oralnim leukocitima. Projekat Instituta za

    genetičko inženjerstvo i biotehnologiju,

    0 1 2

  • 2020 Bilten, 9

    20 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH

    proveden u Laboratoriji za citogenetiku i

    genotoksikologiju, je imao za cilj

    optimiziranje protokola izolacije i izvođenja

    alkalnog komet test na uzorcima oralnih

    leukocita u svrhu prevazilaženja navedenih

    poteškoća.

    Slika 1: Komete porijeklom iz oralnih leukocita bojene DAPI bojom nakon izvođenja alkalnog

    komet testa pokazuju različit nivo DNK oštećenja (0-4)

    Prednosti oralnih leukocita su

    neizvazivno i jednostavno uzorkovanje te

    vrlo informativni rezultati što je posljedica

    njihove stalne eksponiranosti polutantima i

    toksinima. Međutim pri izvođenju alkalnog

    komet testa na uzorcima oralnih leukocita

    postoji velika varijacija u broju dobijenih

    “kometa” u konačnoj analizi preparata.

    Kritične tačke protokola koje mogu

    doprinijeti varijaciji u broju ishodišnih ćelija

    su eksperimentalno testirane te

    optimizirane u svrhu dobijanja optimalnog

    broja ćelija potrebnih za uspješnu analizu

    uzorka. Prije svega, testiran je utjecaj

    korištenja kupovne i laboratorijski

    pripremljene fiziološke otopine koja se

    koristi kao medij za izolaciju. Komparacijom

    rezultata dobijenih korištenjem obje

    otopine primjećuje se signifikantan utjecaj

    korištene otopine te za dobijanje optimalnih

    rezultata savjetuje se korištenje

    komercijalno dostupne, kupovne fiziološke

    otopine. Sljedeća kritična tačka, koja je

    imala i literaturno zasnovanu sumnju, jeste

    utjecaj temperature na elektroforezu i

    rezultate (Speit et al., 1999). Poređenjem

    dobijenih rezultata korištenjem različitih

    temperatura u laboratoriji je zaključeno da

    optimalna temperatura za izvođenje

    alkalnog komet testa treba biti u rasponu od

    20-25C, što u ljetnim periodima može

    predstavljati problem i ugroziti kvalitet

    preparata dobijenih alkalnim komet testom.

    Također pri izvođenju ovog testa pažnja

    treba biti usmjerena na povremenu provjeru

    pH vrijednosti pufera i otopina koje se

    koriste prema protokolu kako bi se održali

    alkalni uslovi. Uslovi brzine i temperature

    centrifugiranja mogu biti jedan od faktora

    koji utječu na varijaciju u broju ćelija.

    Testiranja vezana za podešavanja centrifuge

    su pokazala najbolji prinos pri korištenju

    temperature od 4C, te obrtaja u vrijednosti

    od 600 rcf (g). Jedan od važnih koraka

    predstavlja raslojavanje uzorka odnosno

    vizualizacija i prikupljanje oralnih leukocita

    iz odgovarajućeg sloja (Slika 2).

  • Bilten, 9 2020

    Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 21

    Slika 2: Odvajanje oralnih leukocita

    Pored problema sa kojima se može

    susresti prilikom izvođenja alkalnog komet

    testa te oralnim leukocitima kao

    materijelom za istraživanje, komet test

    generalno svakodnevno doživaljava svoju

    evoluciju kako kroz unaprijeđenje

    instrumenata potrebnih za rad tako i

    informatičkim dostignućima kroz razne

    softvere koji ovu metodu čine

    informativnijom i prezicnijom.

    Literatura

    Brunborg, G., Collins, A., Graupner, A., Gutzkow, K., Olsen, A. (2015) Reference cells and ploidy in the

    comet assay. Front Genet. 27(6): 61. doi: 10.3389/fgene.2015.00061

    Cortés-Gutiérrez, E., López-Fernández, C., Fernández, J., Dávila-Rodríguez, M., Johnston, S., Gosálvez, J.

    (2014) Interpreting sperm DNA damage in a diverse range of mammalian sperm by means of the two-

    tailed comet assay. Front Genet. 27(5): 404. doi: 10.3389/fgene.2014.00404

    Langie, S., Azqueta, A., Collins, A. (2015) The comet assay: past, present, and future. Front Genet. 6: 266.

    doi: 10.3389/fgene.2015.00266.

    Piperakis, S. (2009) Comet assay: a brief history. Cell Biol Toxicol. 25(1): 1-3.

    Rojas, E., Lorenzo, Y., Haug, K., Nicolaissen, B., Valverde, M. (2014) Epithelial cells as alternative human

    biomatrices for comet assay. Front Genet. 28(5): 386. doi: 10.3389/fgene.2014.00386

    Speit, G., Trenz, K., Schütz, P., Rothfuss, A., Merk, O. (1999) The influence of temperature during alkaline

    treatment and electrophoresis on results obtained with the comet assay. Toxicol Lett. 110(1-2): 73-78.

  • 2020 Bilten, 9

    22 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH

    PREDSTAVLJAMO PROJEKT

    „Nargila: užitak ili prijetnja?“

    Mr. Maida Hadžić, viša stručna saradnica

    Udruženje genetičara u Bosni i

    Hercegovini realizira projekat pod nazivom

    „Nargila: užitak ili prijetnja?“ koji je

    finansijski podržan od strane Ministarstva za

    obrazovanje, nauku i mlade Kantona

    Sarajevo u 2019. godini. Cilj projekta je

    podizanje svijesti mladih o efektima

    konzumiranja nargile na genetički materijal

    uz ohrabrivanje mladih da donose ispravne

    odluke i izbore jer su u značajnoj mjeri i

    sami odgovorni za svoje genetičko naslijeđe

    i buduće potomstvo.

    Poznato je da konzumacija duhana

    povećava nivo genetičkih oštećenja u ćeliji

    te uzrokuje više tipova karcinoma.

    Posljednjih godina je jedan od

    najpopularnijih konzumacija duhana,

    pušenje nargile ili tzv. šiša. Nargila je u

    širokoj upotrebi na Bliskom istoku u

    posljednjim desetljećima, ali se njena

    upotreba postupno povećavala, posebno

    kod mladih ljudi koji žive u zemljama

    zapadne kulture, u Americi i Evropi.

    Procenat konzumenata nargile je sve veći i u

    enormnom je porastu. Procjenjuje se da 100

    miliona ljudi širom svijeta konzumira nargilu

    svakodnevno. Nedavne naučne studije

    pokazuju da je, za razliku od konzumiranja

    cigareta, nargila socijalno prihvatljivija i zbog

    toga postoji manje kampanja za podizanje

    svijesti javnosti o postojanju ovisnosti i

    štetnosti po zdravlje. Procjene Svjetske

    zdravstvene organizacije (WHO) su da je

    prosječna sesija konzumiranja nargile u

    trajanju od 20-80 minuta, ekvivalentna

    pušenju 100 i više cigareta. Izloženost

    pušenju nargile je povezana sa smanjenom

    tjelesnom težinom, varijacijama srčane

    frekvencije, hiperglikemijom, hiper–

    trigliceridemijom i povećanim rizikom od

    genetičkih oštećenja koja vode ka razvoju

    karcinoma. Dimnik nargile može doseći

    temperaturu i do 450°C i sadrži

    genotoksične, naročito klastogene

    komponente kao što su katran i policiklični

    aromatski ugljikovodici koji doprinose

    razvoju karcinoma. Ove činjenice

    naglašavaju potrebu kontinuiranog

    educiranja prvenstveno mladih osoba koje

    su aktivni ili pasivni konzumenti nargile. U

    Bosni i Hercegovini svakodnevno raste broj

    konzumenata nargile što je zabrinjavajuća

    činjenica, jer su veoma popularna javna

    mjesta za izlaske i okupljanja studenata i

    srednjoškolaca koja to promovišu.

    U okviru projekta, predviđeno je

    upoznavanje učesnika (srednjoškolaca i

    studenata) sa konkretnim utjecajem

    konzumacije nargile na genetički materijal u

    ćelijama konzumenata. Na ovaj način

  • Bilten, 9 2020

    Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 23

    Udruženje genetičara u BiH će prezentirati

    važnost adekvatne brige o preveniranju

    genetičkih promjena izbjegavanjem

    konzumiranja poznatih genotoksičnih

    agenasa, u prvom redu duhana i duhanskih

    derivata.

    Planirana edukacija učesnika u projektu

    provoditi će se u formi predavanja iz

    pripadajućih oblasti genetike te u formi

    praktičnog rada u laboratoriji. Ciljana

    populacija mladih ljudi (studenata i

    srednjoškolaca) koja pokaže

    zainteresovanost za samotestiranje će imati

    pristup laboratorijskom radu. Učesnici u

    projektu će pripremati preparate ćelija

    epitela bukalne sluznice (Slika 1), koje

    predstavljaju prvu barijeru duhanskom

    dimu, i u njima mikroskopski posmatrati

    markere genotoksičnog i citotoksičnog

    djelovanja duhana kod konzumenata

    nargile. Komparirati će se frekvencija

    markera genotoksičnosti kod konzumenata

    nargile (aktivnih i pasivnih) i nepušača. Ovaj

    segment predstavlja inovativan, naučno

    utemeljen pristup prezentiranja poznatih

    činjenica o utjecaju duhana na genetički

    materijal, koji je rezultat opsežnih analiza

    velikog broja uzoraka u internacionalnim

    kolaborativnim studijama.

    Slika 1: Ćelije epitela bukalne sluznice obojene akridin narančastom, 1000x uvećanje

    (a - normalna diferencirana epitelna ćelija, b - diferencirana epitelna ćelija s mikronukleusom, c - karioreksija)

    Značaj jednog ovakvog projekta i

    educiranja mladih kao ciljne grupe leži u

    činjenici da genetička oštećenja nastala kod

    mlađih osoba imaju tendenciju akumulacije

    te mogu rezultirati razvojem ozbiljnih

    patoloških procesa kao što je karcinom.

    Također, genetička oštećenja nastala u

    spolnim ćelijama mogu imati značajan

    utjecaj na smanjen fertilitet ili biti

    prenesena na potomstvo.

    a b c

  • 2020 Bilten, 9

    24 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH

    NAJAVE KONFERENCIJA

    Pripremila: mr. Maida Hadžić, Viša stručna saradnica

    Joint 3rd Donau Symposium and 4th AIT Austrian Biomarker Symposium

    Translational Biomarker Development and Clinical Application

    March 19-20, 2020

    Vienna, Austria

    https://www.applied-diagnostics.eu/

    Open Conference - Budapest 2020

    Human Biomonitoring and the Comet Assay

    27th of March, 2020

    Budapest, Hungary

    http://www.hcomet.eu/open-conference-budapest-2020

    https://pharmaceuticalchemistry.annualcongress.com/

    https://www.applied-diagnostics.eu/http://www.hcomet.eu/open-conference-budapest-2020https://pharmaceuticalchemistry.annualcongress.com/

  • Bilten, 9 2020

    Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 25

    Inter-Organ Communication in Physiology and Disease

    March 15-18, 2020

    EMBL Heidelberg, Germany

    https://www.applied-diagnostics.eu/

    The European Human Genetics Conference 2020

    June 6-9, 2020

    Berlin, Germany

    https://www.eshg.org/94.0.html

    https://foodchemistry.healthconferences.org/

    16th World Congress on Structural Biology

    April 16-17, 2020

    Amsterdam, Netherlands

    https://structuralbiologycongress.conferenceseries.com/

    https://www.applied-diagnostics.eu/https://www.eshg.org/94.0.htmlhttps://foodchemistry.healthconferences.org/https://structuralbiologycongress.conferenceseries.com/

  • 2020 Bilten, 9

    26 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH

    15th European Conference On Fungal Genetics

    February, 15-17

    Rome, Italy

    https://fems-microbiology.org/opportunities/15th-european-conference-on-fungal-genetics-ecfg15/

    Behavioural Science-2020

    May 05-06, 2020

    Rome, Italy

    https://behaviouralscience.healthconferences.org/

    13th International Conference on Genomics and Molecular Biology

    May 25-26, 2020

    Rome, Italy

    https://genomics.insightconferences.com/

    https://fems-microbiology.org/opportunities/15th-european-conference-on-fungal-genetics-ecfg15https://behaviouralscience.healthconferences.org/https://genomics.insightconferences.com/

  • Bilten, 9 2020

    Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 27

    2nd World Congress on Plant Science and Molecular Biology

    June 17-19,

    London UK

    http://massivegroup.org/plant-science-conference/

    https://www.scientificfederation.com/genetics-2020/

    http://massivegroup.org/plant-science-conference/https://www.scientificfederation.com/genetics-2020/