Upload
others
View
2
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
ISSN 2566-2899
BBiilltteenn UUddrruužžeennjjaa ggeenneettiiččaarraa uu BBoossnnii ii HHeerrcceeggoovviinnii
Br. 9 | Januar, 2020.
Aktuelno
Virusi
Str. 4
Predstavljamo projekt
Nargila: užitak ili prijetnja?
Str. 22
Tema broja
Komet test
Međunarodna radionica „Comet workshop – Basic comet assay techniques“
Str. 7
2020 Bilten, 9
2 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH
Izdavač
Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini (GENuBiH)
Urednik Prof. dr. Sanin Haverić, naučni savjetnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu
Urednički odbor Akademik Rifat Hadžiselimović, naučni savjetnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu
Prof. dr. Stojko Vidović, Medicinski fakultet, Univerzitet u Banjoj Luci
Prof. dr. Kasim Bajrović, naučni savjetnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu
Prof. dr. Naris Pojskić, naučni savjetnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu
Prof. dr. Lejla Pojskić, naučni savjetnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu
Doc. dr. Jasmina Čakar, naučni savjetnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu
Prof. dr. Adaleta Durmić Pašić, viši naučni saradnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu
Doc. dr. Anja Haverić, viši naučni saradnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu
Dr. Naida Lojo Kadrić, viši naučni saradnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu
Dr. Amra Kazić, naučni saradnik, Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju, Univerzitet u Sarajevu
Prof. dr. Semina Hadžiabulić, Agromediteranski fakultet, Univerzitet Džemal Bijedić
Prof. dr. Izet Eminović, Prirodno-matematički fakultet, Univerzitet u Sarajevu
Prof. dr. Slavka Ibrulj, naučni savjetnik Medicinski fakultet, Univerzitet u Sarajevu
Prof. dr. Emina Kiseljaković, Medicinski fakultet, Univerzitet u Sarajevu
Doc. dr. Mirela Mačkić Đurović, Medicinski fakultet, Univerzitet u Sarajevu
Prof. dr. Dunja Rukavina, Veterinarski fakultet, Univerzitet u Sarajevu
Prof. dr. Azra Skender, Biotehnički fakultet, Univerzitet u Bihaću
Mr. Radmila Malešević, Klinički centar, Banja Luka
Naslovna stranica: Softverska analiza u komet testu – Laboratorija za citogenetiku i genotoksikologiju Instituta za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju Univerziteta u Sarajevu
URL: http://www.genubih.ba/Bilten.html
Bilten, 9 2020
Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 3
SADRŽAJ
AKTUELNOSTI ............................................................................................................................. 4
Virusi ........................................................................................................................................... 4
TEMA BROJA ................................................................................................................................ 7
Međunarodna radionica „Comet workshop - Basic comet assay techniques“ ............................ 7
Komet-FISH esej ....................................................................................................................... 11
Biljni komet test ........................................................................................................................ 14
Kritične tačke pri izvođenju alkalnog komet testa na oralnim leukocitima .............................. 19
PREDSTAVLJAMO PROJEKT ................................................................................................... 22
„Nargila: užitak ili prijetnja?“ ................................................................................................... 22
NAJAVE KONFERENCIJA ......................................................................................................... 24
2020 Bilten, 9
4 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH
AKTUELNOSTI
Virusi
Prof. dr. Lejla Pojskić, naučna savjetnica
Kina je u posljednjih desetak godina,
postala vodeća svjetska sila u istraživanju
ljudskih bolesti i novih lijekova. Tako su
kineske vlasti oformile na desetke prestižnih
istraživačkih instituta. Jedan od njih je i
Virusološki institut u Wuhanu koji je i
lokacija jedine zvanične kineske laboratorije
najvišeg biosigurnosnog nivoa (PBL-4).
Neposredno prije puštanja u rad ove
laboratorije, pojedini svjetski autoriteti iz
oblasi biosigurnosti upućivali su na rizike od
biohazarda, zbog neadekvatne kontrole,
vrste eksperimentalnih životinja i socio-
kulturološkog odnosa prema biosigurnosnim
aspektima u laboratoriji koja je tada dobila
atest i akreditaciju za rad sa virusima
visokog rizika za ljudsko zdravlje u skladu sa
međunarodnim standardima.
Postoji velika vjerovatnoća povezanosti
zaraze čiji je pretpostavljeni epicenter
tržnica u Wuhanu koja je udaljena
četrdesetak kilometara od pomenutog
instituta. U tom slučaju kineske vlasti i
nadležna regulatorna tijela koja su izdala
odobrenje za rad laboratorije, a prema
međunarodnim biosigurnosnim
smjernicama i zakonima, dužna su provesti
istragu o sličnosti virusnog soja koji je
izazvao zarazu među ljudima u provinciji
Wuhan sa globalnim rizikom širenja i onog
koji se čuva u laboratorijskim uslovima
Biosigurnosne laboratorije Virusološkog
instituta u Wuhanu, te provesti mjere
sanacije i prevencije svakog biosigurnosnog
rizika i posljedica koje eventualno utvrđeni
biosigurnosni događaj može imati na ljudsko
društvo.
Slika 1: Naučnici sa Virusološkog instituta u Wuhanu obučeni po standardima zaštite za laboratorije najvišeg (četvrtog) biosigurnosnog nivoa u proučavanju najopasnijih patogena kao što su virusi ebole i SARS-a
(preuzeto sa Dailymail.co.uk 23.1.2020.)
Bilten, 9 2020
Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 5
Virusi su zarazne čestice koje nisu
sposobne da aktivno egzistiraju van ćelija
domaćina tj. da se dijele i multipliciraju. Te
čestice sadrže genetički materijal (virusni
genom) koji je obavijen proteinskim
zaštitnim omotačem (kapsidom). Genetički
materijal sadrži informaciju za sintezu
virusnih proteina i to samo kada su unutar
ćelije-domaćina kada koriste njegove
„resurse“ za biološku sintezu.
Virusne čestice zaražavaju vrlo specifičnu
vrstu domaćina i tako razlikujemo
bakterijske, biljne, animalne i humane
viruse. Virusi koji imaju sposobnost
zaražavanja ljudskih ćelija, često uzrokuju
virusne zarazne bolesti kada izazivaju
određene simptome (respiratorne i druge
infekcije). Kada nastupi virusna infekcija,
virus se sistemski širi. U određenoj fazi
virusne infekcije se između ljudskih jedinki
prenose kontaktom tj. preko tjelesnih
tekućina (pljuvačka, krv, urin, itd.). Do većeg
širenja virusnih infekcija dolazi usljed
mutiranja virusa i formiranja novih virusnih
oblika protiv kojih ne postoji prirodni ili
stečeni imunitet kod čovjeka. Najpoznatiji
prirodni rezervoari viroza opasnih za čovjeka
su nedostupni šumski ekosistemi koji se u
incidentalnim događajima kontakta sa
čovjekom „otpuštaju“ i prenose u daljoj
međuljudskoj komunikaciji (najpoznatiji je
primjer virus ebole). Drugi potencijalni rizik
su vještački rezervoari virusa (virusološke
laboratorije) gdje se virusi namjerno
umnožavaju i modificiraju, ali sa motivima
njihovog istraživanja za ljudsko zdravlje i
prevencije širenja infekcija.
Većina virusnih zaraznih bolesti koje su
opasne po ljudsko zdravlje, tj. one koje se
lako šire među ljudima i izazivaju teške
zdravstvene posljedice su sanirane u javno-
zdravstvenim programima vakcinacije, kada
se ljudi imuniziraju i time stiču sposobnost
prepoznavanja virusa i njihove uspješne
eliminacije – otpornost na virusne infekcije.
Do otkrića vakcina se dolazi u mukotrpnim
laboratorijskim istraživanjima biologije
samog virusa kada se pokušava izolirati
specifična molekula tj. biološka meta
buduće antiviralne terapije. Nakon toga se
proizvode vakcine, tj. antigeni čija se
učinkovitost u odbrani od virusnih infekcija
testira u eksperimentalnim uslovima i na
eksperimentalnim modelima ćelija, tkiva i
organizama (eksperimentalnih životinja).
U svijetu postoji pedesetak laboratorija
koji se bave izolacijom, uzgojem i
proučavanjem za ljude visokorizičnih virusa
(EBOLA- virus, SARS-virus, virusi
pandemijske gripe, itd.), a sve s ciljem
istraživanja adekvatnih lijekova za
prevenciju i liječenje bolesti koje oni
uzrokuju. Ove laboratorije su izgrađene i
djeluju po strogo propisanim
međunarodnim standardima i kontrolom, te
prolaze detaljnu provjeru pouzdanosti kadra
i opreme, te drugih uslova rada prije
stavljanja u pogon. Takve laboratorije ili
laboratorije četvrtog tj. najvišeg
biosigurnosnog nivoa (PBL-4) su zatvoreni i
izolovani sistemi u kojoj postoji visoka
kontrola rizika od curenja infektivnog
materijala. Sav otpad mora biti maksimalno
neutraliziran, a osoblje izolovano od
2020 Bilten, 9
6 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH
mogućnosti infekcije i daljeg širenja zaraze.
Eksperimentalne životinje su također pod
visokom kontrolom da ne bi došlo do
interakcije sa osobljem i mogućim
prenosom infekcije.
U slučaju izbijanja pandemije virusnih
bolesti kod čovjeka, neophodna je
orkestrirana međunarodna akcija pod
koordinacijom Svjetske zdravstvene
organizacije (WHO) praćenja i kontrole
širenja virusnih infekcija. Pored
epidemiološke sanacije rizika, u ostale mjere
spadaju usaglašene smjernice za
dijagnostiku tj. otkrivanje uzročnika i
potvrdu porijekla virusne infekcije, te
razmatranje treapijskih opcija i potencijalnih
vakcinacijskih strategija.
Bilten, 9 2020
Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 7
TEMA BROJA
Međunarodna radionica „Comet workshop - Basic comet assay techniques“
Mr. Tamara Ćetković, viša stručna saradnica
Dr. Anja Haverić, viša naučna saradnica
Udruženje genetičara u BiH je u saradnji
sa Institutom za genetičko inženjerstvo i
biotehnologiju i „hCOMET - The comet assay
as a human biomonitoring tool (CA15132)“
COST akcijom organizovalo međunarodnu
radionicu pod nazivom „Comet workshop –
Basic comet assay techniques“, koja je
održana 5. - 6. oktobra 2019. godine.
Suorganizator radionice, evropska mreža
naučnika „hCOMET - The comet assay as a
human biomonitoring tool (CA15132)“ je
obezbijedila novčana sredstva za troškove
puta i smještaja inozemnih predavača koji
su došli iz Norveške, Portugala, Španije,
Francuske, Hrvatske i Turske te stipendije za
12 međunarodnih od ukupno 30 učesnika.
Radionica je okupila brojne učesnike iz
Hrvatske, Srbije, Turske, Italije i Češke.
Organizator i predavač na radionici iz BiH
bila je dr. Anja Haverić, viša naučna
saradnica Instituta za genetičko inženjerstvo
i biotehnologiju UNSA, koja predstavlja
Univerzitet u Sarajevu u ovoj COST akciji i
njenom promotivnom videu
(www.hcomet.eu).
U realizaciji radionice su učestvovali
sljedeći međunarodni predavači, eminentni
naučnici u pripadajućoj oblasti: prof. dr.
Andrew Collins – voditelj hCOMET COST
akcije (Oslo, Norveška), prof. dr. Joao Paulo
Teixeira (Porto, Portugal), prof. dr. Amaya
Azqueta Oscoz (Pamplona, Španija), prof. dr.
Bertrand Pourrut (Tuluz, Francuska), prof.
dr. Mirta Milić (Zagreb, Hrvatska), prof. dr. i
Nermin Gozukirmizi (Istanbul, Turska).
Uvodnu riječ o Udruženju genetičara u
BiH i Institutu za genetičko inženjerstvo i
biotehnologiju UNSA, kao domaćinima ove
radionice, dao je direktor Instituta, prof. dr.
Naris Pojskić. Voditelj hCOMET COST akcije
prof. dr. Andrew Collins održao je
predavanje o glavnim ciljevima akcije,
samim počecima primjene alkalnog comet
eseja i osnovama primjene ovog testa.
S obzirom da se comet test rutinski ne
primjenjuje u Bosni i Hercegovini, cilj ove
edukacije je njeno uvođenje u širu
nastavno-naučnu i istraživačku praksu u
Bosni i Hercegovini. Program dvodnevne
radionice bio je fokusiran na standardizirane
protokole za comet test u eukariotskim
ćelijama, s ciljem da se mladi i iskusni
naučnici oslanjaju na njih u svojim budućim
istraživanjima.
Budući da je comet test metoda za
detekciju oštećenja DNK u pojedinačnim
eukariotskim ćelijama, koja se koristi već 30
godina, tokom prvog dijela praktičnog rada
http://www.hcomet.eu/
2020 Bilten, 9
8 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH
sa učesnicima predavači su dijelili svoja
iskustva, prolazeći s njima osnovne korake
postavke eksperimenta za comet test.
Metoda je zasnovana na lizi ćelija, nakon što
je suspenzija ćelija fiksirana u agarozi na
predmetnom staklu, da bi došlo do
odmotavanja DNK u alkalnim uslovima.
Elektroforeza na visokoj pH vrijednosti
rezultira strukturama koje liče na komete,
koje se posmatraju na fluoroscentnom
mikroskopu. Intenzitet i dužina repa komete
u odnosu na glavu odražava broj DNK
oštećenja. Analiza ima primjenu u ispitivanju
genotoksičnosti novih hemikalija, praćenju
kontaminacije okoliša genotoksinima,
biomonitoringu ljudskih populacija i
molekulskoj epidemiologiji te
fundamentalnim istraživanjima oštećenja i
popravka DNK (Collins, 2004).
U drugom dijelu radionice učesnici su
imali mogućnost da vizuelno i primjenom
softvera za obradu slika (Comet Assay IV,
Instem, UK) analiziraju dobivene,
fluorescentno obojene komete, kako bi
odredili stepen oštećenja DNK.
Slike 1-4: Otvaranje radionice, predavanja i praktični rad
Bilten, 9 2020
Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 9
Slike 5-9: Praktični rad i predavanja
Na samom kraju organizovana je diskusija
na temu važnih faktora koji mogu da utiču
na izvođenje i uspješnost comet testa, kao i
na interpretaciju dobijenih rezultata na kojoj
su učesnici imali priliku da sumiraju stečeno
znanje tokom intenzivne radionice.
Cijeli događaj (Slike 1 - 10) zaokružen je
uručivanjem certifikata, razmjenom korisnih
informacija, zahvalama organizatorima i
predavačima na uspješno održanoj
međunarodnoj radionici i saradnji, kao i
učesnicima na njihovom interesovanju.
2020 Bilten, 9
10 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH
Slika 10: Predavači i učesnici radionice Ispred Instituta za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju
Univerziteta u Sarajevu
Radionica predstavlja značajan doprinos
uvođenju nove široko primjenjive metode u
bh. genetiku i srodne aplikativne naučne
oblasti ali i priliku za uspostavljanje veza sa
naučnicima iz evropskih centara i
započinjanje novih kolaborativnih projekata.
Realizacija radionice „Comet Workshop –
Basic comet assay techniques“ je
omogućena sredstvima Ministarstva civilnih
poslova BiH, a inicijalna sredstva za
primjenu ove metode na Univerzitetu u
Sarajevu obezbijedili su Ministarstvo za
obrazovanje, nauku i mlade Kantona
Sarajevo i Institut za genetičko inženjerstvo i
biotehnologiju UNSA.
Udruženje genetičara u BiH će nastojati
da i u budućim redovnim aktivnostima
organizuje stručna usavršavanja iz različitih
oblasti genetike, u saradnji sa Institutom za
genetičko inženjerstvo i biotehnologiju
UNSA.
Literatura
Collins, A.R. (2004) The comet assay for DNA damage and repair: principles, applications, and limitations.
Mol Biotechnol. 26(3): 249-261.
Bilten, 9 2020
Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 11
Komet-FISH esej
Mr. Mahira Mehanović
Irma Durmišević, BSc.
Komet esej je jedna od najčešće
korištenih tehnika za mjerenje i detekciju
nivoa oštećenja DNK u eukariotskim
ćelijama. Ova tehnika može detektovati
brojna oštećenja, uključujući jednolančane i
dvolančane lomove, fotodimere, alkalno-
labilna mjesta u frekvencijama od nekoliko
stotina do nekoliko hiljada lomova u
pojedinačnim ćelijama. Najčešća primjena
ovog eseja je za in vitro i in vivo procjenu
genotoksičnosti hemikalija, toksina i fizičkih
agenasa te izloženosti okoliša
karcinogenima. Mnoge su pogodnosti
korištenja komet eseja obzirom da je riječ o
senzitivnoj i rapidnoj tehnici koja
omogućava proučavanje ćelija iz različitih
tkiva dobivenih uzorkovanjem iz velikog
broju različitih eukariotskih organizama. Ova
metoda je također primjenjljiva i za
mjerenje kapaciteta popravljanja DNK u
živim ćelijama i acelularnim sistemima.
Pored toga, koristi se i u prenatalnom
dijagnostičkom ispitivanju sindroma kao što
su xeroderma pigmentosum (XP) i
trihotiodistrofija (TTD) (Trzeciak et al.,
2008).
Postoje dvije osnovne varijante ovog
eseja: neutralni i alkalni komet esej. U
neutralnim uvjetima (pH=7), molekula DNK
je očuvana kao dvolančana struktura što
omogućava otkrivanje dvolančanih lomova,
dok je u alkalnim uvjetima (pH>7)
omogućena istovremena detekcija i
jednolančanih i dvolančanih lomova DNK,
kao i alkalno-labilnih mjesta, što dovodi do
zaključka da je alkalni komet esej znatno
osjetljiviji u odnosnu na neutralnu varijantu
(Peycheva et al., 2009). Kako god,
kombinacija elektroforeze, fluorescentne
mikroskopije i interpretacija dobijenih
kometa, omogućava da i alkalni i neutralni
komet esej pruže zadovoljavajuće pristupe i
informacije za procjenu i analizu oštećenja
DNK in vitro.
Od kada su Ostling i Johansson razvili ovu
tehniku 1984. godine postoje različite
modifikacije komet eseja. Tako se, na
primjer, veća specifičnost može postići
korištenjem ove metode u kombinaciji sa
fluoroscentnom in situ hibridizacijom (FISH)
koja omogućava detekciju DNK sekvenci od
interesa primjenom specifično označenih
proba. Kombinacija ove dvije tehnike
omogućava detekciju ukupnog kao i
oštećenja određenog dijela DNK, ali i
detekciju reparacije u pojedinačnim
ćelijama. Naime osnova ove tehnike je
komet esej u kojem se ćelije fiksirane u
agarozi na mikroskopskom stakalcu liziraju i
izlažu elektroforezi pri čemu se
fragmentirana i nefragmentirana DNK
odvajaju i stvaraju tzv. komete. Nakon toga
2020 Bilten, 9
12 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH
moguće je posmatrati sveukupno oštećenje
DNK na fluorescentnom mikroskopu
primjenom odgovarajuće boje. No ovaj
modifikovani test nakon odmotavanja DNK i
elektroforeze uključuje dodatni korak
hibridizacije koji omogućava označavanje
specifične sekvence unutar kometa. Za to se
koriste različite DNK probe poput genski
nespecifičnih proba: centromerne,
telomerne, probe za ribosomalna DNK
ponavljanja, SINE, LINE te genski specifične
probe poput oligonukleotida, PCR
produkata, BAC, YAC i drugih (Shaposhnikov
et al., 2009). Vizualizacija FISH kometa
omogućava lokalizaciju specifičnih sekvenci
unutar područja glave ili repa kometa,
odnosno oštećenog ili neoštećenog dijela
(slika 1). Ukoliko se fluoroscentni signali
uočavaju na području repa komete to
ukazuje da se oštećenja događaju u blizini
ispitivanih sekvenci ili gena od interesa.
Komet-FISH esej također postoji u dvije
verzije, neutralni i alkalni pri čemu je u
alkalnom eseju broj signala udvostručen
obzirom da se FISH probe vežu na oba lanca
DNK što nije slučaj u neutralnim uvjetima.
Slika 1. Prikaz FISH kometa (neoštećena, lijevo; oštećena, desno) obojenih SYBR-Green sa dva
TP53 signala (Glei et al., 2009)
Osim istraživanja strukturne organizacije
DNK i hromatina, te lokalizacije oštećenja
DNK ovom tehnikom moguće je istraživati i
kinetiku popravke oštećenja praćenjem
relokalizacije signala specifičnih gena (poput
TP53, DHFR, MGMT gena) iz repa u područje
glave komete tokom perioda inkubacije
(Shaposhnikov et al., 2015). Ova aplikativna
tehnika omogućava istraživanje indukcije i
otkljanjanja DNK modifikacija i lezija
uključujući jednostruke i dvostruke lomove,
lezije uklonjene ekscizijom baza ili
nukleotida, ribonukleotide ugrađene u DNK
te DNK demetilaciju pružajući uvid u
molekularne mehanizme različitih puteva
reparacije (Mondal et al., 2017). Tako je ova
tehnika pronašla primjenu za detekciju
specifičnih lomova u DNK regijama koje su
važne za nastanak različitih bolesti.
Dokazano je da je komet-FISH tehnika
prikladna za istraživanje odabranih
genetičkih promjena što povećava
Bilten, 9 2020
Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 13
mogućnost karakterizacije endogenih
faktora rizika kao potencijalnih faktora u
procesu kancerogeneze gornjeg
aerodigestivnog trakta, a upotreba proba
specifičnih za različite hromosomske regije
može pružiti dodatne informacije o vrsti
aberacije.
Izloženost ionizirajućem zračenju može
uzrokovati druge maligne bolesti. Samim
tim, postoji potreba za pouzdanom
metodom za brzo i precizno mjerenje
oštećenja nastalih usljed zračenja. Nedavna
istraživanja opisala su specifičnu in situ
hibridizaciju Ret, Abl1 i Trp53 gena u
ćelijama periferne krvi miševa C57BL/6 i
CBA/J sojeva, kao pokazatelja oštećenja
izazvanog zračenjem. Iako su rezultati
komet eseja dali značajne rezultate zbog
interindividualne i eksperimentalne
varijabilnosti, Komet-FISH rezultati za ova
tri gena na statistički značajan način su
diskriminirali efekte testiranih doza (Glei et
al., 2009).
Na kraju, za komet-FISH tehniku možemo
reći da je vrlo obećavajući i vrlo koristan alat
u otkrivanju ukupnog oštećenja i popravke
DNK određenih genskih regiona u
pojedinačnim ćelijama. Iako nije moguće sa
sigurnošću zaključiti da se oštećenja i
popravci događaju unutar određenog gena,
ova metoda omogućava procjenu ovih
događaja u blizini gena od interesa.
Također, ova metoda može pomoći i u
boljem razumijevanju mehanizama razvoja
kancera i hemoprevencije.
Literatura
Glei, M., Hovhannisyan, G., Pool-Zobel, B. (2009) Use of Comet-FISH in the study of DNA damage and
repair: Review. Mutation Research. 681(1): 33-43.
Mondal, M. i Guo, J. (2017) Comet-FISH for Ultrasensitive Strand-Specific Detection of DNA Damage in
Single Cells. Methods in Enzymology. 591: 83-95.
Peycheva, E., Georgieva, M., Miloshev, G. (2009) Comparison BetweenAlkaline and Neutral Variants of
Yeast Comet Assay. Biotechnology & Biotechnological Equipment. 23(1): 1090-1092.
Shaposhnikov, S., El Yamani, N., Collins, A. (2015) Fluorescent In Situ Hybridization on Comets: FISH
Comet. U S. Chellappan, Chromatin Protocols. Humana Press, New York.
Shaposhnikov, S., Frengen, E., i Collins, A. (2009) Increasing the resolution of the comet assay using
fluorescent in situ hybridization - a review. Mutagenesis. 24(5): 383-389.
Trzeciak, A.R., Barnes, J.I., Evans, M.K. (2008) A Modified Alkaline Comet Assay for Measuring DNA
Repair Capacity in Human Populations. Radiation Research. 169(1): 110-121.
2020 Bilten, 9
14 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH
Biljni komet test
Selma Behmen, BSc.
Biljna biomasa predstavlja preko 90%
ukupne mase žive biote. Lanac ishrane u
biosferi započinje biljkama, međutim,
genotoksični učinci polutanata na biljne
sisteme često su zanemareni. Kao sjedilački
organizmi, biljke su stalno izložene
utjecajima okoliša. Stoga su biljke široko
korištene za procjenu toksičnosti hemijskih
spojeva i za bionadzor kako vodenih tako i
kopnenih ekosistema. Međutim, iako je u
posljednjih nekoliko decenija postignut brz
napredak u određivanju utjecaja faktora na
indukciju genetičkog oštećenja u ljudskoj
populaciji, došlo je do relativno ograničenog
napretka u utvrđivanju utjecaja takvih
faktora na divlje vrste, a posebno biljke.
Metoda za evaluaciju oštećenja DNK u
biljnim tkivima je biljni komet test (Pourrut
et al., 2015). Komet test ili gel eketroforeza
pojedinačnih ćelija je tehnika procjene
genotoksičnosti in vitro, a prva izvješća o
upotrebi komet testa na biljkama datiraju iz
1990-ih. Naziv komet potječe od
karakterističnog izgleda ćelija sa oštećenim
genetičkim materijalom, koje posmatrane
na preparatu pod mikroskopom, izgledaju
kao komete (Navarrete et al., 1997; Collins,
2004). Primjena komet testa na biljnim
tkivima signifikantno proširuje upotrebu
biljaka u osnovnim i primijenjenim
studijama u okolišnoj mutagenezi i
toksikologiji (Navarrete et al., 1997). Tokom
posljednje decenije, jednoćelijska gel
elektroforeza ili komet test postali su jedna
od najperspektivnijih tehnika koje se koriste
u području genetičke ekotoksikologije
zahvaljujući svojoj jednostavnosti,
osjetljivosti, svestranosti, brzini i
ekonomičnosti. Alkalna verzija testa
uspostavljena je nekoliko godina kasnije od
strane Koppena i Verschaevea upotrebom
korijena jedinki vrste Vicia faba (Pourrut et
al., 2015). Teoretski, test se može primjeniti
na svakoj biljnoj vrsti. Također, zbog lakoće
uzgoja u kontrolisanim uvjetima, koriste se i
jedinke vrsta Allium cepa, Nicotiana
tabacum i Arabidopsis thaliana (Dhawan et
al., 2009).
Izolacija nukleusa
Metodologija komet testa (Slika 1)
počinje izolacijom nukleusa što je ujedno I
najvažniji korak u ovom testu a primjenjuju
se dvije metode: formiranje protoplasta (tj.
biljnih ćelija s uklonjenim ćelijskim zidom) ili
mehanički postupci kao što su izolacija
nukleusa iz biljne ćelijske suspenzije i
izolacija nukleusa iz intaktnog korijena ili
lišća. Metoda formiranja protoplasta nije
pogodna za toksikološke studije, a sam
postupak je dugotrajan i skup (Abas et al.,
2007). Također, ni postupak dobijanja
nukleusa iz biljne ćelijske suspenzije se više
ne praktikuje. Trenutno aktuelni postupak,
Bilten, 9 2020
Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 15
kojeg su Pourrut i saradnici (2015)
modificirali je izolacija nukleusa iz intaktnog
korjena i lišća. Navedeni autori su
identificirali ključne korake metodologije i
predložili optimizirani protokol za povećanje
njegove pouzdanosti. Nukleusi iz korjena ili
lišća mogu se izolirati rezanjem malog
komadića lista (približno 2 cm x 2 cm) ili
dijela korijena novom (čistom I oštrom)
britvicom (žiletom). Ovaj se postupak
provodi na ledu u plastičnoj Petrijevoj
posudi s 320 ml 0,4 M Tris-HCl pufera, pH =
7.5. Komadić lista ili korjena se brzim
pokretima usitnjava na male djeliće uz
pomoć britvice otprilike 30 s. Petri posuda
se drži nagnuta u ledu kako bi se izolirani
nukleusi sakupljali u puferu (Gichner et al.,
2008; Pourrut et al., 2015). Mora se obratiti
pozornost na prisutnost hloroplasta jer su
oni važan izvor slobodnih radikala i
oksidativnih oštećenja stoga se postupak
provodi pod crvenim svijetlom kako bi se
izbjegla oštećenja izazvana svijetlom
(Pourrut et al., 2015).
Slika 1: Metodologija biljnog komet testa
Pravljenje preparata
Mikroskopska stakalca drže se u etanolu
otprilike jednu sedmicu. Stakalca se zatim
potapaju u 1% agarozu normalne tačke
topljenja (NMPA) na 50°C. Stražnji dio
stakalaca obriše se kako bi se uklonio višak
agaroze i postavi se horizontalno na ravnu
površinu za sušenje na sobnoj temperaturi.
Drugi sloj agaroze koji se postavlja na
stakalca je mješavina 1% agaroze s niskom
tačkom topljenja (LMPA) i suspenzije svježe
izoliranih nukleusa. Suspenzija nukleusa
pomiješana s LMPA pri 40°C, u omjeru 1: 1 u
mikroepruveti, 100 l smjese se stavi na
2020 Bilten, 9
16 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH
svaki preparat i pokrije pokrovnicom.
Preparati se postavljaju na hladnu površinu
najmanje 5 minuta nakon čega se
pokrovnice uklanjaju a preparati su spremni
za denaturaciju i elektroforezu (Gichner et
al., 2008). Na jedno stakalce se mogu
napraviti dva gela tzv. two gel format.
Međutim, u svrhu analize većeg broja
uzoraka istovremeno postoje i 12, 48 i 96
gel formati.
Denaturacija i elektroforeza
Postavljanjem preparata na denaturaciju
DNK se odmotava i oslobađa od histona i
drugih nehistonskih proteina. Denaturacija i
elektroforeza DNK se odvijaju pri pH
vrijednosti od 7 do 8. Pri neutralnom pH
olakšano je otkrivanje dvostrukih lomova, a
ukupno oštećenje DNK je manje izraženo
nego u alkalnim uvjetima što je prednost pri
proučavanju ćelija koje imaju visoku razinu
oštećenja (Angelis et al., 1999). Denaturacija
DNK i elektroforeza pri alkalnom pH
(pH=12,1–12,4) olakšavaju otkrivanje
jednolančanih i dvolančanih lomova i
nepotpune ekscizije. Za studije toksičnosti,
provodi se alkalni komet s pri pH>13.
Postupak odmotavanja DNK može se izvesti
potapanjem preparata u otopinu za
elektroforezu u Koplinovoj posudi koja se
stavi na led ili uranjanjem preparata u
otopinu za elektroforezu na 4–8°C u kadici
za elektroforezu (Angelis et al., 1999). Treba
optimizirati trajanje denaturacije DNK za
svaku biljnu vrstu.
Optimizacija komet testa odnosi se na
najprikladnije vrijeme denaturacije i
elektroforeze. Vrijeme elektroforeze ovisi o
temperaturi, naponu na udaljenosti između
anode i katode (V/cm), amperaži i pH
otopine za elektroforezu. Npr, u alkalnom
komet testu kalibriranom za paradajz
(Solanum tuberosum), optimalno vrijeme
denaturacije bilo je 10 min, nakon čega je
slijedila elektroforeza u trajanju od 15 min
na 0,74 V/cm (26 V, 300 mA) i 4-81°C
(Gichner et al., 2008). U drugim biljnim
vrstama s istim naponom elektroforeze
moraju se upotrijebiti različita vremena
denaturacije i elektroforeze, npr. za biljke
duhana 15 min denaturacija i elektroforeza
25 min, 20 za pšenicu (Triticum durum) 5
min denaturacija i 15 min elektroforeza i za
maslačak (Taraxacum officinale) 30 min
denaturacija i 30 min elektroforeza (Gichner
& Muhlfeldova, 2002).
Po završetku elektroforeze preparati se
fiksiraju dva puta po 5 minuta u PBS-u, a
nakon toga u 95% etanolu te se pohranjuju
u kutije za čuvanje stakalaca (Pourrut et al.,
2015).
Bojenje
Različiti fluorohromi se primjenjuju u
komet testu za bojenje DNK, npr. akridin
narančasto, DAPI, EtBr, propidijev jodid. Za
alkalnu verziju biljnog komet testa mogu se
koristiti fluorohromi EtBr, DAPI i YOYO-1 sa
sličnom učinkovitošću pri čemu je YOYO-1
vrlo skup i nestabilan. Najčešće korištena
boja u komet testu je EtBr, a u manjoj mjeri i
DAPI (Gichner et al., 2006), pri čemu se sve
više favorizuje odabir što manje toksičnih
boja.
Bilten, 9 2020
Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 17
Analiza preparata
Preparati se mogu analizirati softverski ili
vizualno. Glavni parametri stepena
oštećenja DNK pri softverskoj analizi su %
repne DNK (% ukupne fluorescencije u repu)
ili repni trenutak (TM) (dužina repa se množi
s intenzitetom fluorescencije u repu
podijeljenom sa 100, izraženo u mm)
(Kumaravel & Jha, 2006). Ukoliko se koristi
metoda vizualnog bodovanja komete su
svrstane u jednu od pet klasa prema
intenzitetu repa i označavaju se kao 0, 1, 2,
3 ili 4 (od neoštećene klase 0, do
maksimalno oštećene 4). Analizira se 150
kometa po uzorku, odnosno 50 po gelu
(Pourrut et al., 2015).
Razlika između animalnog i biljnog komet
testa
Glavna razlika između biljnog i animalnog
komet testa ogleda se u činjenici da biljne
ćelije posjeduju celulozni ćelijski zid dok
animalne ćelije imaju samo ćelijsku
membranu. Nukleusi iz ljudskih i životinjskih
ćelija mogu se izolirati liziranjem s visokim
koncentracijama soli i deterdžentima što u
biljnom komet testu predstavlja nepotrebno
tošenje vremena te se pripremljeni
preparati odmah postavljaju u otopinu za
denaturaciju, odnosno odmotavanje DNK
(Moller, 2005; Pourrut et al., 2015).
Podaci govore da ova jednostavna
tehnika može biti moćan alat za nadopunu
konvencionalnih metoda in situ praćenja
zagađenja okoliša. Štaviše, nova polja
istraživanja koja koriste analizu biljnih
kometa otvorena su, ne samo u studijama
okoliša, već i u fiziologiji biljaka, jer ova
tehnika može pomoći u rasvjetljavanju
metaboličkih puteva uključenih u razvoj
biljaka, ćelijski ciklus / programiranu ćelijsku
smrt ili čak rezistentnost na biljne bolesti.
Također je i dalje važno polje istraživanja
dešifriranja genetičkih mehanizama
povezanih sa oštećenjem / popravkom DNK,
u kojem će analiza kometa nesumnjivo imati
presudnu ulogu.
Literatura
Abas, Y., Touil, N., Kirsch-Volders, M., Angenon, G., Jacobs, M., Famelaer, I. D.H. (2007) Evaluation of UV
damage at DNA level in Nicotiana plumbaginifolia protoplasts using single-cell gel electrophoresis. Plant
Cell Tiss. Organ Cult. 91: 145.
Angelis, K. J., Dusinska, M., Collins, A. (1999) Single-cell gel electrophoresis: Detection of DNA damage at
different levels of sensitivity. Electrophoresis. 20(10): 2133-2138.
Collins, A. (2004) The comet assay for DNA damage and repair: principles, applications, and limitations.
Molecular Biotechnology. 26(3): 249-261.
Dhawan, A., Bajpayee, M., Parmar, D. (2009) Comet assay: a reliable tool for the assessment of DNA
damage in different models. Cell. Biol. Toxicol. 25(1): 5-32.
2020 Bilten, 9
18 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH
Gichner, T., Muhlfeldova, Z. (2002) Induced DNA-damage measured by the Comet assay in 10 weed
species. Biologia Plantarum. 45(4): 509-516.
Gichner, T., Mukherjee, A., Veleminsky, J. (2006) DNA staining with the fluorochromes EtBr, DAPI and
YOYO-1 in the Comet assay with tobacco plants after treatment with ethyl methanesulfonate,
hyperthermia and DNase-I. Mutation Research. 605(1-2): 17-21.
Gichner, T., Znidar, I., Szakova, J. (2008) Evaluation of DNA damage and mutagenicity induced by lead in
tobacco plants. Mutation Research. 652(2): 186-190.
Kumaravel, T. S., Jha, A. N. (2006) Reliable Comet assay measurements for detecting DNA damage
induced by ionising radiation and chemicals. Mutation Research. 605(1-2): 7-16.
Moller, P. (2005) Genotoxicity of environmental agents assessed by the alkaline Comet assay, Basic Clin.
Pharmacol. Toxicol. 96(suppl. 1): 1-42.
Navarrete, M.H., Carrera, P., Miguel, M., Torre, C. (1997) A fast Comet assay variant for solid tissue cells.
The assessment of DNA damage in higher plants, Mutation. Research. 389(2-3): 271-277.
Pourrut, B., Pinelli, E., Celiz Mendiola, V., Silvestre, J., Douay, F. (2015) Recommendations for increasing
alkaline comet assay reliability in plants. Mutagenesis. 30(1): 37-43.
Bilten, 9 2020
Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 19
Kritične tačke pri izvođenju alkalnog komet testa na oralnim leukocitima
Alen Džaferspahić, student
Alkalni komet test
U zadnje dvije decenije, nove
metodologije pomoću kojih je moguća
procjena DNK oštećenja su rapidno razvijane
ili su vršene modifikacije već postojećih.
Takav slučaj je i sa metodom koja je poznata
pod nazivom komet test. Ostling i Johanson
su još 1984. godine razvili komet test koji se
još naziva ćelijska gel elektroforeza (single-
cell gel electrophoresis – SCGE). Ova
metodologija se modificirala tokom godina
te je tako Singh sa saradnicima 1988. godine
izveo elektroforezu pod alkalnim uslovima
(pH>13), a Olive i saradnici 1990. pod
neutralnim uslovima. Alkalni komet test se
pokazao kao senzitivnija metoda te je
postao popularan još 90-tih godina, ali i
danas predstavlja jednu od najčešće
korištenih metoda u evaluaciji DNK
oštećenja (Piperakis, 2009). Ovu činjenicu
potvrđuje podatak pretrage PubMed baze
podataka prema kojoj je u 2008. bilo
obavljeno 4154 unosa pod pretragom pojma
“comet assay”. Pod tim istim pojmom u
decembru 2019. broj unosa iznosi 11784.
Komet test predstavlja jednostavnu i brzu
tehniku za određivanje DNK oštećenja.
Njegov naziv potiče od izgleda ćelija
dobijenih ovom metodom koje bojenjem i
posmatranjem pod fluorescentim
mikroskopom sliče stvarnim kometama.
Posmatranjem repova ćelija, odnosno
kometa, moguće ih je klasificirati te na
osnovu njihove dužine i intenziteta zaključiti
o DNK oštećenju u posmatranom uzorku
(Slika 1). Ono što ih svrstava u idealne
biomarkere jeste raznolikost polja u kojima
se može primjenjivati krenuvši od humanih
studija, ekološkog monitoringa,
genotoksikoloških testiranja, procjene
uspješnosti DNK sistema popravke i mnogih
drugih. Također uzorci koji mogu biti
korišteni u ovom testu su mnogobrojni. Tu
spadaju krvni ili tkivni uzorci, sperma, razni
tipovi epitelnih ćelija kao i oralni leukociti
(Rojas et al., 2014; Cortes-Gutierrez et al.,
2014; Brunborg et al., 2015). Kao i u većini
testova varijabilnost dobijenih rezultata
predstavlja ozbiljan problem, što je slučaj i
sa komet testom (Langie et al., 2015).
Komet esej i oralni leukociti
Konkretan primjer mogućeg dobijanja
varijabilnih, nekvalitetnih i nereproducibilnih
rezultata je uočljiv primjenom komet testa
na oralnim leukocitima. Projekat Instituta za
genetičko inženjerstvo i biotehnologiju,
0 1 2
2020 Bilten, 9
20 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH
proveden u Laboratoriji za citogenetiku i
genotoksikologiju, je imao za cilj
optimiziranje protokola izolacije i izvođenja
alkalnog komet test na uzorcima oralnih
leukocita u svrhu prevazilaženja navedenih
poteškoća.
Slika 1: Komete porijeklom iz oralnih leukocita bojene DAPI bojom nakon izvođenja alkalnog
komet testa pokazuju različit nivo DNK oštećenja (0-4)
Prednosti oralnih leukocita su
neizvazivno i jednostavno uzorkovanje te
vrlo informativni rezultati što je posljedica
njihove stalne eksponiranosti polutantima i
toksinima. Međutim pri izvođenju alkalnog
komet testa na uzorcima oralnih leukocita
postoji velika varijacija u broju dobijenih
“kometa” u konačnoj analizi preparata.
Kritične tačke protokola koje mogu
doprinijeti varijaciji u broju ishodišnih ćelija
su eksperimentalno testirane te
optimizirane u svrhu dobijanja optimalnog
broja ćelija potrebnih za uspješnu analizu
uzorka. Prije svega, testiran je utjecaj
korištenja kupovne i laboratorijski
pripremljene fiziološke otopine koja se
koristi kao medij za izolaciju. Komparacijom
rezultata dobijenih korištenjem obje
otopine primjećuje se signifikantan utjecaj
korištene otopine te za dobijanje optimalnih
rezultata savjetuje se korištenje
komercijalno dostupne, kupovne fiziološke
otopine. Sljedeća kritična tačka, koja je
imala i literaturno zasnovanu sumnju, jeste
utjecaj temperature na elektroforezu i
rezultate (Speit et al., 1999). Poređenjem
dobijenih rezultata korištenjem različitih
temperatura u laboratoriji je zaključeno da
optimalna temperatura za izvođenje
alkalnog komet testa treba biti u rasponu od
20-25C, što u ljetnim periodima može
predstavljati problem i ugroziti kvalitet
preparata dobijenih alkalnim komet testom.
Također pri izvođenju ovog testa pažnja
treba biti usmjerena na povremenu provjeru
pH vrijednosti pufera i otopina koje se
koriste prema protokolu kako bi se održali
alkalni uslovi. Uslovi brzine i temperature
centrifugiranja mogu biti jedan od faktora
koji utječu na varijaciju u broju ćelija.
Testiranja vezana za podešavanja centrifuge
su pokazala najbolji prinos pri korištenju
temperature od 4C, te obrtaja u vrijednosti
od 600 rcf (g). Jedan od važnih koraka
predstavlja raslojavanje uzorka odnosno
vizualizacija i prikupljanje oralnih leukocita
iz odgovarajućeg sloja (Slika 2).
Bilten, 9 2020
Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 21
Slika 2: Odvajanje oralnih leukocita
Pored problema sa kojima se može
susresti prilikom izvođenja alkalnog komet
testa te oralnim leukocitima kao
materijelom za istraživanje, komet test
generalno svakodnevno doživaljava svoju
evoluciju kako kroz unaprijeđenje
instrumenata potrebnih za rad tako i
informatičkim dostignućima kroz razne
softvere koji ovu metodu čine
informativnijom i prezicnijom.
Literatura
Brunborg, G., Collins, A., Graupner, A., Gutzkow, K., Olsen, A. (2015) Reference cells and ploidy in the
comet assay. Front Genet. 27(6): 61. doi: 10.3389/fgene.2015.00061
Cortés-Gutiérrez, E., López-Fernández, C., Fernández, J., Dávila-Rodríguez, M., Johnston, S., Gosálvez, J.
(2014) Interpreting sperm DNA damage in a diverse range of mammalian sperm by means of the two-
tailed comet assay. Front Genet. 27(5): 404. doi: 10.3389/fgene.2014.00404
Langie, S., Azqueta, A., Collins, A. (2015) The comet assay: past, present, and future. Front Genet. 6: 266.
doi: 10.3389/fgene.2015.00266.
Piperakis, S. (2009) Comet assay: a brief history. Cell Biol Toxicol. 25(1): 1-3.
Rojas, E., Lorenzo, Y., Haug, K., Nicolaissen, B., Valverde, M. (2014) Epithelial cells as alternative human
biomatrices for comet assay. Front Genet. 28(5): 386. doi: 10.3389/fgene.2014.00386
Speit, G., Trenz, K., Schütz, P., Rothfuss, A., Merk, O. (1999) The influence of temperature during alkaline
treatment and electrophoresis on results obtained with the comet assay. Toxicol Lett. 110(1-2): 73-78.
2020 Bilten, 9
22 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH
PREDSTAVLJAMO PROJEKT
„Nargila: užitak ili prijetnja?“
Mr. Maida Hadžić, viša stručna saradnica
Udruženje genetičara u Bosni i
Hercegovini realizira projekat pod nazivom
„Nargila: užitak ili prijetnja?“ koji je
finansijski podržan od strane Ministarstva za
obrazovanje, nauku i mlade Kantona
Sarajevo u 2019. godini. Cilj projekta je
podizanje svijesti mladih o efektima
konzumiranja nargile na genetički materijal
uz ohrabrivanje mladih da donose ispravne
odluke i izbore jer su u značajnoj mjeri i
sami odgovorni za svoje genetičko naslijeđe
i buduće potomstvo.
Poznato je da konzumacija duhana
povećava nivo genetičkih oštećenja u ćeliji
te uzrokuje više tipova karcinoma.
Posljednjih godina je jedan od
najpopularnijih konzumacija duhana,
pušenje nargile ili tzv. šiša. Nargila je u
širokoj upotrebi na Bliskom istoku u
posljednjim desetljećima, ali se njena
upotreba postupno povećavala, posebno
kod mladih ljudi koji žive u zemljama
zapadne kulture, u Americi i Evropi.
Procenat konzumenata nargile je sve veći i u
enormnom je porastu. Procjenjuje se da 100
miliona ljudi širom svijeta konzumira nargilu
svakodnevno. Nedavne naučne studije
pokazuju da je, za razliku od konzumiranja
cigareta, nargila socijalno prihvatljivija i zbog
toga postoji manje kampanja za podizanje
svijesti javnosti o postojanju ovisnosti i
štetnosti po zdravlje. Procjene Svjetske
zdravstvene organizacije (WHO) su da je
prosječna sesija konzumiranja nargile u
trajanju od 20-80 minuta, ekvivalentna
pušenju 100 i više cigareta. Izloženost
pušenju nargile je povezana sa smanjenom
tjelesnom težinom, varijacijama srčane
frekvencije, hiperglikemijom, hiper–
trigliceridemijom i povećanim rizikom od
genetičkih oštećenja koja vode ka razvoju
karcinoma. Dimnik nargile može doseći
temperaturu i do 450°C i sadrži
genotoksične, naročito klastogene
komponente kao što su katran i policiklični
aromatski ugljikovodici koji doprinose
razvoju karcinoma. Ove činjenice
naglašavaju potrebu kontinuiranog
educiranja prvenstveno mladih osoba koje
su aktivni ili pasivni konzumenti nargile. U
Bosni i Hercegovini svakodnevno raste broj
konzumenata nargile što je zabrinjavajuća
činjenica, jer su veoma popularna javna
mjesta za izlaske i okupljanja studenata i
srednjoškolaca koja to promovišu.
U okviru projekta, predviđeno je
upoznavanje učesnika (srednjoškolaca i
studenata) sa konkretnim utjecajem
konzumacije nargile na genetički materijal u
ćelijama konzumenata. Na ovaj način
Bilten, 9 2020
Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 23
Udruženje genetičara u BiH će prezentirati
važnost adekvatne brige o preveniranju
genetičkih promjena izbjegavanjem
konzumiranja poznatih genotoksičnih
agenasa, u prvom redu duhana i duhanskih
derivata.
Planirana edukacija učesnika u projektu
provoditi će se u formi predavanja iz
pripadajućih oblasti genetike te u formi
praktičnog rada u laboratoriji. Ciljana
populacija mladih ljudi (studenata i
srednjoškolaca) koja pokaže
zainteresovanost za samotestiranje će imati
pristup laboratorijskom radu. Učesnici u
projektu će pripremati preparate ćelija
epitela bukalne sluznice (Slika 1), koje
predstavljaju prvu barijeru duhanskom
dimu, i u njima mikroskopski posmatrati
markere genotoksičnog i citotoksičnog
djelovanja duhana kod konzumenata
nargile. Komparirati će se frekvencija
markera genotoksičnosti kod konzumenata
nargile (aktivnih i pasivnih) i nepušača. Ovaj
segment predstavlja inovativan, naučno
utemeljen pristup prezentiranja poznatih
činjenica o utjecaju duhana na genetički
materijal, koji je rezultat opsežnih analiza
velikog broja uzoraka u internacionalnim
kolaborativnim studijama.
Slika 1: Ćelije epitela bukalne sluznice obojene akridin narančastom, 1000x uvećanje
(a - normalna diferencirana epitelna ćelija, b - diferencirana epitelna ćelija s mikronukleusom, c - karioreksija)
Značaj jednog ovakvog projekta i
educiranja mladih kao ciljne grupe leži u
činjenici da genetička oštećenja nastala kod
mlađih osoba imaju tendenciju akumulacije
te mogu rezultirati razvojem ozbiljnih
patoloških procesa kao što je karcinom.
Također, genetička oštećenja nastala u
spolnim ćelijama mogu imati značajan
utjecaj na smanjen fertilitet ili biti
prenesena na potomstvo.
a b c
2020 Bilten, 9
24 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH
NAJAVE KONFERENCIJA
Pripremila: mr. Maida Hadžić, Viša stručna saradnica
Joint 3rd Donau Symposium and 4th AIT Austrian Biomarker Symposium
Translational Biomarker Development and Clinical Application
March 19-20, 2020
Vienna, Austria
https://www.applied-diagnostics.eu/
Open Conference - Budapest 2020
Human Biomonitoring and the Comet Assay
27th of March, 2020
Budapest, Hungary
http://www.hcomet.eu/open-conference-budapest-2020
https://pharmaceuticalchemistry.annualcongress.com/
https://www.applied-diagnostics.eu/http://www.hcomet.eu/open-conference-budapest-2020https://pharmaceuticalchemistry.annualcongress.com/
Bilten, 9 2020
Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 25
Inter-Organ Communication in Physiology and Disease
March 15-18, 2020
EMBL Heidelberg, Germany
https://www.applied-diagnostics.eu/
The European Human Genetics Conference 2020
June 6-9, 2020
Berlin, Germany
https://www.eshg.org/94.0.html
https://foodchemistry.healthconferences.org/
16th World Congress on Structural Biology
April 16-17, 2020
Amsterdam, Netherlands
https://structuralbiologycongress.conferenceseries.com/
https://www.applied-diagnostics.eu/https://www.eshg.org/94.0.htmlhttps://foodchemistry.healthconferences.org/https://structuralbiologycongress.conferenceseries.com/
2020 Bilten, 9
26 Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH
15th European Conference On Fungal Genetics
February, 15-17
Rome, Italy
https://fems-microbiology.org/opportunities/15th-european-conference-on-fungal-genetics-ecfg15/
Behavioural Science-2020
May 05-06, 2020
Rome, Italy
https://behaviouralscience.healthconferences.org/
13th International Conference on Genomics and Molecular Biology
May 25-26, 2020
Rome, Italy
https://genomics.insightconferences.com/
https://fems-microbiology.org/opportunities/15th-european-conference-on-fungal-genetics-ecfg15https://behaviouralscience.healthconferences.org/https://genomics.insightconferences.com/
Bilten, 9 2020
Udruženje genetičara u Bosni i Hercegovini – GENuBiH 27
2nd World Congress on Plant Science and Molecular Biology
June 17-19,
London UK
http://massivegroup.org/plant-science-conference/
https://www.scientificfederation.com/genetics-2020/
http://massivegroup.org/plant-science-conference/https://www.scientificfederation.com/genetics-2020/