Biyoteknoloji Ders 1

  • Upload
    zuhal

  • View
    244

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    1/163

    BYOTEKNOLOJ

    2008-2009Ayegl TOPAL SARIKAYA

    stanbul niversitesiMolekler Biyoloji ve Genetik Blm

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    2/163

    BYOTEKNOLOJ NEDR?

    Biyolojik ara, sistem ve srelerin retim ve hizmetendstrilerine uygulanmas

    Endstriyel uygulamalarda baarl olabilmek iin Biyokimya,Mikrobiyoloji ve Mhendislik bilimlerinin ortak kullanm ilemikroorganizmalarn, doku ve hcre kltrlerinin

    kapasitelerinin artrlmas eitli yararl maddelerin retilmesi iin biyolojik zellikleri

    kullanan bir teknoloji olmas Biyolojik aralar tarafndan retilen materyallerin daha iyi rn

    ve hizmet vermek zere bilim ve mhendislik ilkelerininuygulanmas

    Biyoteknoloji sadece teknik ve srelerin toplamna verilen biraddr. Biyoteknoloji canl organizmalar ve onlarn yaptalarn tarm,

    gda ve dier endstrilerde kullanan bir tekniktir.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    3/163

    BYOTEKNOLOJNN BALICA

    UYGULAMA ALANLARI Biyosre Teknolojisi

    Alkoll ieceklerin retimi Antibiyotik retimi Memeli hcre kltrleri

    Yeni rnlerin retimi (r: Polisakkaritler) la retimi Organik zc retimi (r:Aseton, butanol) Protein bakmndan zenginletirilmi gdalarn retimi retim kapasitesi art iin fermentasyon tasarm optimizasyonu

    Enzim Teknolojisi zgn kimyasal reaksiyonlar iin kullanmlar Enzim immobilizasyonu (tutuklanmas) Yar sentetik penisilin retiminde Niasta ve sellloz hidrolizinde Biyolojik analizler iin sensrlerin oluturulmasnda

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    4/163

    BYOTEKNOLOJNN BALICA

    UYGULAMA ALANLARIAtk Teknolojisi Atklarn yeniden kullanlabilmesi Atklardan yeni rnlerin retilmesi (r: alkol)

    evre Teknolojisi Kirliliin kontrol Atk toksinlerin uzaklatrlmas Dk dereceli madenlerden ve madencilik endstrisi

    atklarndan metallerin geri kazanlmas

    Yenilenebilen Kaynaklar Teknolojisi Kimyasal ham madde ve etanol, metan ve hidrojen retimiiin lignoselllozik materyalin yenilenebilen enerji kaynaolarak kullanlmas

    Bitki ve hayvan materyalinin tamamnn kullanlmas

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    5/163

    BYOTEKNOLOJNN BALICA

    UYGULAMA ALANLARIZiraat ve Hayvanclk Besin deeri yksek, hastala direnli, strese toleransl

    yksek kalitede ve verimde genetik mhendislii ilegelitirilmi bitkilerin oluturulmas

    Hayvanclkta rn artrmn salamak

    Salk Yeni ilalarn oluturulmas lalarn sadece hastalkl blgeye ulamasnn salanmas Hastalk tanlarnn gelitirilmesi Alarn gelitirilmesi nsan genomunun anlalmas Gen tedavisi

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    6/163

    BYOTEKNOLOJ LE LKL SEKTRLERNSINIFLANDIRILMASI

    Teraptikler Hastalklarn kontrolnde ve tedavisinde kullanlan

    farmastik rnlerin retimi Antibiyotik retimi A retimi Gen tedavisi ile ilgili rnlerin retimi

    Tan kitleri Gda, evre ve ziraatta kullanlan tan ve saptama

    kitlerin retemiGda eitli gda rnleri, koruyucular, iecekler ve eitli

    katk maddelerinin retimi

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    7/163

    evre Artm, Zararl maddelerin yararl hale dnm,

    enerji retimini salayan irketler

    Kimyasal ara rnler Enzimler, DNA, RNA, zgn kimyasallar reten

    irketler

    Tehizat Tm makine donanm, biyoreaktrler, "software" ve

    biyoteknolojiyi destekleyen tm tketim maddelerinireten irketler

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    8/163

    Biyoteknoloji konu olarakmultidisipliner yani bamsz pekok bilim daln birarada barndrr.

    Eer biyoteknoloji almasyapanlar bir liste altnda toplamakgerekirse Biyokimyaclar,Mikrobiyologlar,Genetikiler,Molekler biyologlar, Hcrebiyologlar, Botanikiler, Ziraatmhendisleri, Virologlar, Analitik

    kimyaclar, Biyokimya mhendisleri,Kimya mhendisleri, Kontrolmhendisleri, Elektronikmhendisleri ve Bilgisayarmhendisleri bu liste ierisindesaylabilir.

    Ayrca bu liste oluturulan yeni bir

    tekniin pazarlanmasnda sorumluolan ekonomistler, yneticiler vefinans ii ilgili olan elemanlar veyeni bir rnn patent alnmndansorumlu hukukcular da katlarakgeniletilebilir.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    9/163

    Biyoteknolojinin Tarihsel Evrimi

    lk defa, 1919 ylnda, Karl Ereky tarafndan kullanlanBiyoteknoloji teriminin o zamanki tanm, anlam vekapsam, gnmze kadar gelien modern tekniklerin bualana uygulanmas ile, nemli lde deiikliklere

    uramtr. Karl Ereky, biyoteknolojiyi Biyoteknolojik Sistemler

    Yardmyla Hammaddelerin Yeni rnlereDntrld ilemlerdir eklinde tanmlamtr.

    Bu tanm, o zamanki geleneksel biyoteknolojikuygulamalara ok benzemekte idi. nk, o yllardabiyoteknolojik sistemler herhangi bir deiiklieuratlmadan kullanlmaktayd. Bunun balca nedeni,teknolojinin gelimemi olmasyd.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    10/163

    Son 25-30 yl, biyoteknolojik gelimelerin altna olarak kabul edilmekte, biyoloji, kimya, fizik,biyokimya, mikrobiyoloji ve dier bilimdallarndaki yeni bulularla bu yeni alan

    desteklenmi ve insanolunun hayallerininsnrlad noktaya kadar adm admgereklemitir.

    Ortaya konan her yeni bulu veya teknik, dier

    bir uygulamaya, ileriye dnk olarak, bykkatkda bulunmu, onun temel ve itici gcnoluturmu ve yeni ufuklarn almasna ve yeniproblemlerin ortaya kmasn yol amtr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    11/163

    Dnyada giderek artan sayda lke,biyoteknolojik aratrmalarda ve buna balolarak oluturulan yeni rnlerin kullanmakarlmasnda, bu ynden ncelik kazanarak

    biyoteknoloji pazarna hakim olmada birbirleriyleyar haline girmi bulunmaktadr.

    Bu alanda byk aktivite gsteren birok bykfirma kurulmu ve ok byk yatrm yaplmtr.

    Ksa bir gelecekte biyoteknolojik rnlerin,aynen mikroelektronik malzemeler gibi, gelimilkelerin ticar bir silah haline gelecei okaktr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    12/163

    Biyoteknoloji tarihinde nemli baz

    olaylar M 6000 Mayalar ilk kez Smerler tarafndan bira yapmnda kullanldlar

    M 4000Msrllar maya kullanarak

    ekmek yapmn kefettiler

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    13/163

    zm kltryapm(Grcistan),

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    14/163

    1673 Anton van Leeuwenhoek (1632 -

    1723),Protozoa ve bakterilerinfermentasyonda rol oynayabileceiniaklayan ilk bilim adam

    1856Louis Pasteur Louis Pasteur (1822 -1895)

    mikroorganizmalarn fermentasyondan sorumluolduklarn kesin bir ekilde tanmlad

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    15/163

    1928 Alexander Fleming petri kaplarnda bir para kfle

    evrelenmi blmde tm bakterilerin ldnkefetti. Bylece penisilin dnemi balad. Fakat 15yl sonra tbbi kullanm iin uygun duruma geldi.

    1938 Proteinler ve DNA eitli laboratuvarlarda allmaya

    baland. Molekler biyoloji terimi gndeme girdi.

    1941Bir gen bir enzim hipotezi ortaya atld

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    16/163

    1943 Rockefeller vakf Meksika hkmeti ile ibirlii

    yaparak Meksika Tarm Program balatld. Bu

    yabanc yardmyla yaplan ilk bitki slahalmas olarak biyoteknoloji tarihinde yeriniald.

    1953

    Kortizon byk lekte retilen ilk rn 1953 1976 DNA ile yaplan yaygn almalar

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    17/163

    1977 - Gnmz:

    Genetik Mhendislii almalarnn balamas.

    Genentech Genentech, Inc., tarafndansomatostatin (insan byme hormonu)bakteriye klonland.

    1978

    1978de Herbert Boyer San Francisco Californianiversitesi laboratuvarnda rekombinant insulingenini E. coliierisine aktarmay baard.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    18/163

    1980 PATENT alnmna izin verilmesi ABD yksek Mahkemesinin petrol yiyen bakteri iin patent vermesi Kary Mullis ve arkadalar tarafndan PCR ynteminin kefedilmesi. 1982

    Genetik mhendislii ile gelitirilmi insan insulinin bakteri tarafndanretilmesi

    1985

    Bcek, bakteri ve viruslara direnli bitkilerin toprakta yetitirilmesialmalar

    1986 lk rekombinant a (sarlk, Hepatit B) 1988

    lk genetii deitirilmi hayvan olarak meme kanseri almalarndakullanlan fare iin patent alnmas

    1990 lk baarl gen terapi almasnn yaplmas 1994 lk genetik mhendislii ile gelitirilmi domatesin dnya gda rgt

    tarafndan kabul

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    19/163

    1996 Biyosensrlerin kullanlmas

    1997 Dolynin yaplmas 1998

    Ebriyonik kk hcre retimi 1999

    Deli dana hastal iin hzl ve hassas tan sisteminingelitirilmesi

    2001: 200,000 alan, devlete ait $30 milyar gelir, toplam

    1450 irket 350si kamu irketi

    1992: 80,000 alan, $8.1 milyar devlete ait gelir.Yaklak ayn sayda irket

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    20/163

    Tarihsel evrime gre biyoteknoloji temeldneme ayrlmaktadr. Bunlar da,

    1) Geleneksel Biyoteknoloji: Karl Erekynintanmlad biyoteknoloji kapsamnda, biyolojiksistemler (genellikle bakteri, maya, mantar) hibirmodifikasyona uramadan aynen kullanlmaktayd.

    Aslnda, bu tarihlere ait bilgi ve teknoloji de genetikdzeyde deiiklikler yapabilecek durumda deildi.Yaklak 20 yl kadar devam eden bu dnemdebiyolojik sistemler, ekmek, peynir, alkol, eitli alkollikiler, sirke, yourt gibi maddelerin retilmesinde

    fazlaca kullanlmtr. Bu nedenle de bu periyot,Fermantasyon teknolojisi arlkl olup buna ynelikretimi kapsamaktadr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    21/163

    2) Ara Dnem: 1940-1975 yllar arasn kapsayanbu dnemde, biyolojik sistemlerin endstride

    kullanm alanlar geniletilmi ve baz kktekniklerin ilavesiyle de retim gelitirilmi veartrlmtr. Bu ara periyot ierisinde antibiyotik,enzim, protein, karbonhidrat, organik asitler, alkolvb. maddeler fazlaca retilmitir.

    Bu dnemde, geleneksel biyoteknoloji gibibiyoteknolojik sistemler ve zellikle de bunlarngenomlarnda kkl deiiklikler yaplmad iin,bugnk anlamda kullanlan biyoteknolojik

    uygulamalar pek kapsamamaktadr. Bunedenlerle de, bu ara periyot ta birincisi gibifermantasyon teknolojisine dayanmaktadr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    22/163

    3) Modern Biyoteknoloji: Gelimi ve modern tekniklerin biyolojiksistemlere uyguland bu dnem olduka ileri bir karakter tamaktadr.

    Mutasyonlarveya Rekombinant DNA teknolojisi yardmylaoluturulan yeni fenotipik karakter tayan Mutantlarveya Transgenikorganizmalar, endstride ve dier alanlarda (mikrobiyoloji, biyoloji,biyokimya, insan ve hayvan sal, hayvan slah, ziraat, evre vb.) okfazla kullanlmaya balanmtr.

    Bu gelimelere paralel olarak, biyoteknolojinin tanmnda dadeiiklikler yaplmtr. 1982 ylnda OECDnin raporunda belirtilentanma gre biyoteknoloji Temel Bilimlerin ve Mhendislik lkelerinin,Ham Maddelerin Biyolojik Aralar Yardm ile rnlereDntrld Srelere Uyguland Bir Teknolojidir eklindedir.

    Bu tarif iine her ne kadar ak olarak belirtilmesede, genetikdzeydeki manipulasyonlarn da iinde bulunduu Molekler Genetikve Rekombinant DNA teknolojisi de yer almaktadr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    23/163

    Modern Biyoteknoloji

    Bu teknikler yardmyla organizmann yaam iin gerekli btnbilgilerin topland ve kodland genom kitaplnn = bankalarnnkurulmas, oluan bankalardan arzu edilen genin izolasyonunun venkleotid dizisinin saptanmas ve bu dizilerde deiiklikleryaplmas veya baka organizmalara aktarlmas, genreglasyonunun saptanmas, hibrit hcreler elde edilmesimmkndr.

    Bu teknikler yardmyla biyoteknolojik alar, proteinler,enzimler, antibiyotikler, hormonlar, sitokininler, monoklonalantikorlar, tehis koruma ve tedavi aratrmalarnda kullanlandiagnostik maddelerin ve kimyasallarn retilmesigerekletirilmektedir.

    Bu yntemler ile, doal koullar altnda ancak yz binlerce yliinde meydana gelebilecek mutasyonlar, in vitro olarak ksa sredeoluturmak mmkn olmaktadr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    24/163

    Neden byle bir teknoloji (Rekombinant DNATeknolojisi) geliimine ihtiya duyulmutur?

    1) Genellikle baz belli tipteki hcreleri byk lekte retmekgtr. rnein memeli hcrelerini zellikle insan kaynakl olanlarretmek olduka zordur. remeleri yavatr. Mikroorganizmalarretebilmek iin kullanlan basit yntemler bu tip hcreler iin

    kullanlamaz.

    2) Doal kaynaklarn kullanm snrldr.

    3) Doal kaynaklardan izole edilen bir rnn kontaminasyonriski tamas r: Serumdan izole edilen baz faktrlerin (faktr XII)

    hemofili hastalar iin kullanlmas bu faktrn izolasyonu srasndasarlk veya AIDS gibi baz hastalk etkenleri ile kontamine olmasolasln ortaya karr.

    4) Maliyet

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    25/163

    $Bu teknolojinin domasna bir baka nedendetamamen yeni bir rnn retilme isteidir.

    rnein endstride biyokatalizr olarak kullanlanenzimler snrl zelliklere sahiptir.

    Bu zellikler zel spesifite, katalitik aktivite vestabilitedir.

    Enzimi kodlayan gende yaplan modifikasyonlarlaenzimin yaps ve dier zellikleri avantaj ynndedeitirilerek konak organizmaya sokulur ve yeni birsper enzim elde edilebilir.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    26/163

    $Ekonomik adan nemli bitkilerin de genomlarnndeitirilmesi biyoteknolojinin dier bir nemli konusudur.

    Tahllara atmosferden azotun fikse edilmesizelliinin kazandrlmas sadece gbrekullanlmamasn salayan maliyet azalmasnn yansra,

    gbre kullanm ile kirlenen tarladan yamur sular iledoal su kaynaklarnn kirlenmesi de nlenebilir.

    Ancak uzun ylardan beri yaplan bu almalar azotfiksasyonunun reglasyon mekanizmasnda ok saydagenin etkili olmas nedeniyle azot fiksasyonunun tahllartarafndan yaplmas henz baarlamamtr.

    Bundan baka tohumlardaki depo proteinlerininmiktarlar artrlabilir veya herbisitlere direnli bitkilergelitirilebilir. Ayrca eitli hastalklara direnli, donmayadayankl, raf mr uzatlm bitkiler de gelitirilebilir.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    27/163

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    28/163

    Biyoteknolojinin retim Sreci Ticari deere sahip bir rnn

    mikroorganizmalar kullanarakyaplan retimi srasndaendstriyel biyoteknoloji srecigenellikle 3 temel aamayaayrlr.

    Upstream processing: Hedefmikroorganizma iin besinkayna olarak kullanlabilecekham maddenin hazrlanmas

    Fermentasyon vetransformasyon: Byk birreaktr (100 litreden byk)

    iinde antibiyotik, amino asit,enzim gibi arzu edilen rnnoluumu (biyodnm) ilesonulanan hedefmikroorganizmann oalmas

    Downstream processing: Arzuedilen rnn hcre ktlesindenveya besi ortamndan ayrlarak

    saflatrlmas

    Hammadde

    Upstreamprocessing

    :

    Fermentasyon vebiyodnm

    Downstream

    processing

    Saf rn

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    29/163

    Mikroorganizmalarla yaplan biyoteknolojiksrelerin ou genel olarak;

    Sre Mh.

    Substrat + Mikroorganizma RN

    eklinde zetlenebilir.

    Sre mhendislii retim ilemleri (fermentasyon)ve bu ilemler sonucunda oluan rnn gerikazanlmas ile ilgili yntemlerin saptanmas,gelitirilmesi ve optimize edilmesini ieren

    almalar kapsar.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    30/163

    rn hcre biyomas, hcrenin bir metaboliti yada balang materyalinin transformasyonusonucu oluan bir madde olabilir. Bazdurumlarda retimde canl organizma yerine

    mikroorganizmalarn rettikleri enzimlerkullanlabilir. Bu durumda;SreMhendislii

    Substrat + Enzim RN

    eklinde bir eitlik sz konusudur.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    31/163

    Sre gelitirilmesinden nce arzu edilenrnn saptanmas gerekir.

    Genelde yabani sular bu rn azoluturduklarndan rn saptamayntemleri duyarl olmaldr.

    Sre gelitirilmesinde eitli yntemlerkullanlabilir. Fakat retimde ama yalnzbir veya birka yntemi kullanmaktr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    32/163

    retim iin gerekli olan substrat, toplam imalat fiyatnn yaklak %50 sinikapsadndan mmknse besiyeri ucuz ham madde iermeli fakat retimin

    artrlmas iin gerekli olan spesifik katk maddeleri unutulmamaldr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    33/163

    Fermentasyon sonucunda oluan rnnyksek verimde geri kazanlmas dier birnemli konudur.

    Eer rn hcre biyoktlesi ( "biomass" ) iseoluan hcreler srekli toplanr ve fermentasyondevam eder.

    rn hcre iinde kalabilecei gibi salglamayeteneinde olan hcreler tarafndan da reme

    ortamna salnabilir. Hcrenin paralanmas, ekstraksiyon vesaflatrma ilemleri sonucunda minimum kaypile rnn geri kazanlmas salanr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    34/163

    Biyoteknolojik srelerin en son aamaselde edilen rnn kalite kontrolyapldktan sonra paketlenmesi vetketiciye bozulmadan sunulmasdr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    35/163

    Biyoteknolojide

    Biyolojik Sistemler

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    36/163

    Biyolojik Sistemler

    Bakteri Mantar Bcek

    Bitki Memeli hcre hatlar Bcek, bitki ve memeli

    viruslar

    ok hcreli organizmalar (bitki, balk, fare veevcil hayvanlar

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    37/163

    Prokaryotlar$ Bakterilerve Cyanobacteria (mavi-yeil bakteriler)

    Bakteriler, toprak, hava, su, hayvan ve bitki yzeylerinde bulunurlar.Bazlar hastalk etkeni olmakla beraber ou zararsz ve organik atklarngeri dnm srasndaki yararl etkileri ve birok faydal rn retmelerinedeniyle biyoteknolojide olduka nemli bir yere sahiptirler.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    38/163

    1884 Christian Gram tarafndan bulunan Gramboyama yntemi ile bakteriler kabaca iki bykgruba ayrabiliriz. Bakteriler iki farkl hcre duvar

    yapsna sahiptir ve buna gre farkl ekildeboyanma zellii gsterirler.

    Gram (+) Gram (-)

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    39/163

    Bakteri morfolojileri

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    40/163

    Ayn genusa ait baz trler endstriyel adan faydalzelliklere sahipken bazlar insanlar iin zararldr.rnein Bacillus trleri toprakta yaarlar ve aerop veyafakltatif anaerop metabolizmaya sahiptirler.

    B. subtilis endstride kullanlan amilaz enzimininkaynadr.

    B. thruringiensis ise birok bitki zararls bceinpatojenidir. Ve bu nedenle bceklere direnli bitkilerinoluturulmasnda genetik mhendisliinin nemli alma

    konularndan birini oluturur. B.athracis ise insanlara patojen etkiye sahiptir ve arbon

    hastalnn nedenidir.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    41/163

    Escherichia coli

    Genetii, moleklerbiyolojisi, biyokimyas,fizyolojisi ve genel biyolojisison 50 ylda yaplanalmalardan toplananbilgilerle son derece iyibilinen bir organizmadr.

    Gram (-), patojen olmayan,omak eklinde, hareketlibir organizmadr.

    Doal olarak insanbarsanda bulunur, normalolarak toprak veya sudabulunmaz.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    42/163

    ok basit besi ortamlarnda

    kolaylkla blnerek

    oalabilir

    Generasyon sresi 37Cda

    logaritmik fazda yaklak22 dakikadr.

    Aerobik ve anaerobik

    olarak reyebilir

    (rekombinant heterolog-

    protein retiminde aerobik

    reme)

    Oksijen, retimde en

    nemli snrlayc faktrdr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    43/163

    Prokaryotik Biyolojik Sistemler

    E.colidndaki dier prokaryotlar Acremonium chrysogenum

    Bacillus brevis

    Basillus subtilis, Basillus thuringiensis

    Corynebacterium glutamicum Erwinia herbicola

    Peudomonas spp

    Rhizobium spp

    Streptomyces spp

    Trichoderma resei

    Xanthomonas campestris

    Zymomonas mobilis

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    44/163

    Bu organizmalar iki grub altnda toplanabilir zel bir fonksiyona sahip bir gen iin konak olma

    r: termofillerden izole edilen ve PCR teknolojisindekullanlan sya direnli DNA polimeraz enziminin E.colideklonlanmas ve retimin gereklemesi

    Belirli ileri ok daha etkin yapabilmek iin genetik mhendisliiile gelitirilme

    r: Endstriyel adan nemli amino asitlerin ok fazlaretilmesi iin Corynebacterium glutamicumun eitlitrlerinin gelitirilmesi

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    45/163

    Cyanobacteria (mavi-yeil bakteriler)

    r: Anabaena cylindris, Nostokmuskorum, Spirulina platensis

    Mavi-yeil bakterilerprokaryotlar snfna dahil olupfotosentez zelliine sahiptir.

    lk kez varlklar fosillerde

    saptanmtr. Dnyaoluumunda belki de ilk canlorganizmalardr.

    Tatl ve tuzlu sularnyzeylerinde bulunurlar.Karada ise n ve neminolduu amur ve kaya, tahta

    veya baz canl organizmalarnyzeylerinde bulunabilirler. Koyu yeilimsi-mavi

    pigmentlerinden dolay buisimle adlandrlrlar.

    Anabaena flamentleri

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    46/163

    Cyanobakterilerin yaps Hcre duvar yap ve

    fonksiyon bakmndanGram(-) bakterilerebenzer.

    Fotosentetiktirler. Klorofilve karotenoid pigmentlerlamella ad verilen hcre

    yzeyi membrannda,fikosiyanin ve fikoeritringibi pigmentlerdefikobilisomlarda bulunur.

    Fikobilisomlar tlakoidmemmran yzeyindebulunurlar

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    47/163

    Fikosiyanin Yeil absoblar (615-620A).

    Allofikosiyanin Turuncu absorblar (650-670A)

    Fikoeritrin Yeil absorblar (495-570

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    48/163

    Cyanobakterilerin yaps

    AZOT FKSASYONU: Sadecebirka organizma atmosferik azotuamonyaa redklemek yoluylaa.a. ve proteinleri retmek zereorganik asitlere dntrlebilir.

    Azot fikse edebilen bakteriler gibi

    mavi-yeil bakterilerde byle biryetenee sahiptir. Hcreler nitrogenaz enzimi ile bu

    reaksiyonu gerekletirirler. Buenzim oksijen ile inaktive olur. Bunedenle azot fikse eden hcreleriniindeki koullar anaerobikolmaldr.

    Anabaena gibi baz mavi-yeilbakterler azot fiksasyonundansorumlu heterosit ad verilen zelkaln duvarl hcrelere sahiptirler.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    49/163

    Heterositler hcre duvarlarnda bulunan zel bir por

    aracl ile vejatatif hcrelere balanrlar. Bu porlar kmikroskobu ile grlebilirler. Anabaena flamentleri eker ve oksijen reten

    fotosentetik hcrelerden olumutur.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    50/163

    Birok flamentli mavi-yeil bakteri akinet veya

    spor diyebileceimizolumsuz koullardadevamllktan sorumluolan hcrelerolutururlar. Bu hcrelerheterosit hcreye yaknolan vejatatif hcreler

    tarafndan oluturulur.Hcre boyutunda artolur ve bykmiktarlarda besindepolanr. Gas vakuollerikaybolur. Bununsonucunda akinetler

    suyun dibinde yllarcacanllklarnkoruyabilirler. Koullaruygun olduunda tekrarhzla blnerekoalrlar.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    51/163

    Mavi-yeil bakterilerin biyoteknolojik nemi

    M-Y bakteriler fotosentez yetenekleri, yksekprotein ierikleri ve basit besiyerlerinde hzloalmalar nedeniyle besin kayna olarakkullanm alanna sahiptir.Tek hcre proteini(THP) elde edilmesinde en ok denenengnmzde insan ve hayvanlarnbeslenmesinde geni uygulama alan olan mavi-yeil bakteriler, dier mikroorganizmalardan

    farkl olarak yeterli miktarda karbondioksit, belirliderecede aydnlatma, geni retim ortam gibizel koullara gereksinim gsterirler.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    52/163

    Spirulana

    Sprilulina platensis: Afrika vegney Amerikada ki sgllerde doal olarak bulunur.Binlerce yldan beri yredekiinsanlar tarafndan toplanan bu

    algler kurutulduktan sonrabesin kayna olarakounlukla sos eklinde veyaorba iinde kullanlmaktadr.

    Nostocise Peru ve Gneydou Asya da besin maddesi

    olarak kullanlan bir dier M-Ybakteridir.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    53/163

    GBRE OLARAK: Mavi-yeil bakterilerinazot fiksasyon zellii saptandktan sonrakurutulmu Tolypthrix tenuis pirin tarlasnaserpildiinde azot fiksasyonunda veverimde art gzlenmitir. M-Y bakterilerinHindistan da pirin tarlalarnda gbreolarak kullanmyla topranhavalandrlmas sonucunda su geii vetopran scaklnn daha homojen olmassalanmaktadr. Azot fiksasyonu iin M-Ybakterilerin Rhizobiumlarn yerini

    almasnn baz avantajlar vardr. Mavi-Yeil bakteriler havadaki azotu amonyumaredklerken fotosentez metabolik yolunukullanrlar. Yani bir bitki ile simbiyotik biryaam ve enerji kayna olarak herhangibir organik molekl ilavesi gerekmez.Tarmda azot fikse eden M-Y bakterilerorganik gbre olarak kullanlabilir. in,

    Hindistan, Filipinler gibi pirin tketimi fazlaolan blgelerde byk oranlarda rerler.Pirincin byme sezonunun banda eersuya M-Y bakterilerin balang kltrleriekilirse pirin veriminde %15-20 oranndaart olduu bildirilmektedir.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    54/163

    Mavi-yeil bakterilerin biyoteknolojik nemi

    Aratrmalar Mavi-Yeil bakterilerin gne enerjisi dnm sisteminde yer almasiin devam etmektedir. Anabaena cylindrica heterocystleri vejatatif hcrelerdefotosentez yoluyla oluturduklar oksijeni dar verirler. Azot yokluunda iseheterositlerde nitrogenaz enzimi katalizrlnde elektronlarH+ iyonuna transferedilerek Hidrojen gaz aa karrlar. Oksijen ve Hidrojen her ikisi deendstride ihtiya duyulan gazlardr.

    BYOLOJK OLARAK AKTF MOLEKLLERN RETM: Mavi-Yeil bakteriler antibiyotiklerin ve dier biyolojik olarak aktif molekllerin ticari

    boyutlardaki retimi iin byk bir potansiyel olutururlar. nk Mavi-Yeil bakterilerheterotroftur. Bu zellikleri de onlarn fermentasyon koullarnda retilmelerine olanaksalar. Henz aratrma aamasnda olan Anacystis nidulans ile yaplan rekombinantDNA teknolojisi almalaryla nadir bileiklerin retiminde kullanmlaramalanmaktadr.

    Sonu olarak : Fermentr koullarnda reyebilirler, uzun sreli fizyolojik stabiliteye, basit besingereksinimine, kpk oluturmama zelliine sahiptirler. Dier alglerden farkl olarakazot fiksasyonu yapabilme farkllna sahiptirler. Optimum scaklk 35oC dir.Karanlkta veya gn nda heterotrofik olarak rerler.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    55/163

    Biyoteknolojide

    Biyolojik SistemlerMayalar

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    56/163

    Maya

    Mayalar; tek hcreli karyotik

    Tomurcuklanarakveya blnerekeeysiz

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    57/163

    farkl eem tipine sahip hcreleriyle eeyli olarakoalabilirler

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    58/163

    Mayalarn tanmlanmas maya biyoteknolojisi iinolduka nemlidir.

    rnein endstriyel srelerde yabani ve kltreedilmi mayalar arasndaki fark gsterebilmekesastr.

    Bira retiminde rnde istenmeyen aroma oluumunaneden olan yabani rkn karmas veya ekmek mayasretiminde eker transport yetenei daha fazla olanCandida utilis mayasnn karmas ekmek mayasretiminde kullanlan Saccharomyces cerevisiaemayasnn remesini engelleyecektir

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    59/163

    Maya genuslarnn ayrmnda fizyolojik

    testlerle birlikte morfolojik testler dekullanlr. Gnmzde 700 civarnda maya tr

    tanmlanmtr. Fakat bu say maya eitliliindesadece ok kk bir blm temsiletmektedir.

    Tanmlanmam maya genus ve trsays ok daha fazladr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    60/163

    Maya biyologlar iin maya eitliliini

    tanmlamak kadar dier nemli bir noktazellikle biyoteknolojik neme sahip trleribelirleyip saklamak ve koruyabilmektir.

    Molekler biyoloji tekniklerinin yaklamyla

    trler daha hzl ve kolay bir ekildekarakterize edilebilmektedir.

    Gnmzde 6 mayann genom projesitamamlanm ve ilevsel genomik almalarile genlerin ilevlerinin belirlenmesine devamedilmektedir.

    Maya hcreleri klorofil

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    61/163

    Maya hcreleri klorofiliermez ve zorunluolarakkemoorganotrofiktirler

    . remek iin organikkarbona gerekduyarlar.

    Karbon metabolizmalar

    ok eitlidir. rneinbasit ekerleri,polioller, organik ve yaasitleri alifatik alkoller,hidrokarbonlar veeitli heterosiklik ve

    polimerik bileiklerikarbon kayna olarakkullanabilirler.

    Bu zellikleri nedeniylefarkl habitatlar iinzellemi trlerkolaylkla saptanabilir.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    62/163

    Mayalar toprak, hava vesudan izole edilebilirler. Bazmayalar ekstrem ortamlardarnein ozmofilik mayalareker bakmndan zengin

    ortamlarda yaayabilirler. Butr mayalar genellikle gdabozucu olarak bilinir. Bunundnda frsat patojenolarak baz maya trleridernein Candida albicans pek

    ok infeksiyondansorumludur.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    63/163

    Mayalar insanlar iin; ekonomik, sosyal ve

    salk asndan olduka nemli en eskievcilletirilmi organizmalardr. Alkoll ieeklerin retiminde, ekmek

    yapmnda hamurun kabarmas iin binlerce ylncesinden beri kullanlmaktadrlar. Gerektebira yapm belkide dnyann ilkbiyoteknolojisini temsil etmektedir.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    64/163

    Gnmzde mayalar geleneksel gdafermentasyonunun dnda ok eitli alanlarda

    da kullanlmaktadr. zellikle genetik mhendisliiyle gelitirilmimayalar hastalklarn nlenmesinde vetedavisinde kullanlan pek ok farmastik

    ajann retilmesinde yaygn bir ekildekullanlmaktadr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    65/163

    Biyoteknolojik neme Sahip Baz Mayalar

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    66/163

    Biyoteknolojik neme Sahip Baz Mayalar Axula adeninivorans

    Candida trleri

    Nitrat ve aminleri asimile eder, 45 Czerinde reyebilir, pek ok hidrolaz

    salglayabilir.

    C.albicans hidrokarbonlardanaminopenisillanik asit ve B6 vitaminretimi, C.boidiniiNAD, FAD metilketonlar ve sitrik asit retimi, C.famatariboflavin, C.maltosa biyoktle proteini iinya asiti ve alkan kullanm, C.tropicalistriptofan, C.pelliculosa sellozikmateryalden biyoktle proteini, C.utilis,

    pek ok rn eldesi, ksilozda reyebilme,klonlama teknolojisinde kullanm,C.shehatae ksiloz fermentasyonu

    Biyoteknolojik neme Sahip Baz Mayalar

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    67/163

    Biyoteknolojik neme Sahip Baz Mayalar

    Hansenula polymorpha

    Kluyveromyces marxianus ve

    K.lactis

    Pachysolen tannophilus

    Heterolog gen anlatm iinkullanlabilen metilotrofik maya

    Laktoz ve polyfruktosanfermente eder. Doal kakao

    fermentayonu. Pek ok enzimiin kaynak olabilir, klonlamateknolojisinde kullanlabilir.

    Bitki lignosellozik

    hidrolizatlarndan kaynaklpentoz ekerlerininfermentasyonu

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    68/163

    Biyoteknolojik neme Sahip Baz Mayalar Phaffia rhodozyma ve Pichia

    trleri

    Rhodosporidium toruloides

    Gda boyas olan astaksantin

    pigment retimi.P.guilliermondiiriboflavinsentezi ve hidrokarbonlardanbiomas protein eldesi.P.methanolica etanol

    biosensr olarak kullanlanalkol oksidazretimi.P.pastorismetanolden biomas proteineldesi, heterolog gen anlatm

    ve insan teraptik proteinleriniretebilen metilotrofik maya

    Fenilketanri tedavisindekullanlan PAL enzim kayna

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    69/163

    Biyoteknolojik neme Sahip Baz Mayalar

    Saccharomyces trleri

    Saccharomycopsis

    trleri

    Schizosaccharomycepombe

    S.cerevisiae klasik gdafermentasyonu. Bira, arap, ekmek,rom, cin yapm. Yakt, alkol, gliserol,invertaz ve hayvan besinikayna.Rekombinant DNA

    teknolojisiyle saysz protein retimi.

    S.fibuligera amilolitik maya.

    Geleneksel Afrika alkoll bira yapm.araplarn deasidifikasyonu. Ykseketanol ozmotik tolerans.. Biyoktleprotein eldesi, heterolog gen anlatm

    ve mutagenez testlerinde kullanm.

    Schwanniomyces trleri S.castelliive S.occidentalis

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    70/163

    y

    Trichosporon cutaneum

    Yarrowia lipolytica

    Zygosaccharomyces rouxii

    amilolitik mayalar. Niastannve inlinin etanole evrimi veheterolog gen anlatmndakullanlabilirler.

    Fenol varlna ilikinbisensor olarak kullanlr.

    Lipid ve hidrokarbonlardanbiomas protein eldesi. Sitrikasit ve hcred enzim

    retimi. Japon soya sosu karakteristik

    aromasn vermede kullanlanhalofilik ve ozmotolerant

    maya tr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    71/163

    Endstriyel mayalarn ou zelliklefermente ieeklerin retimindekullanlanlar genetik bakmndankarmaktrlar ve stabil bir haploidi

    gstermezler.

    rnein bira yapmnda kullanlanSacchoromyces trleri poliploid veya

    anpliod (diploid-heptaploid) rklardr. Bunedenle gelitirilmelerinde eeyli remezelliklerinden yararlanlamaz.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    72/163

    Bunun yerine klasik bira tadn veren

    organoleptik zellikleri iyi olankarakteristik fermentasyon yapanrklardan doal seimle en iyi olaneilir.

    Bunun dnda endstriyel mayalarngelitirilmesinde phesiz genetik

    mhendisliinin nemi oldukafazladr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    73/163

    Rekombinant DNA teknolojisi ilegelitirilen rekombinant mayalartarafndan retilen biyolojik olarak

    aktif rekombinanat proteinlerinveriminin arttrlmasnda iki nemliyaklam vardr:

    molekler genetik tekniklerin kullanm fermentasyon teknolojisi.

    Gda Tzne Uygun Genetik Olarak

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    74/163

    Gda Tzne Uygun, Genetik OlarakDeitirilmi Mayalar

    Maya Ekmek Mayas

    Bira Mayas

    Tanmlama Glukoz basksndan

    kanmak vehamurlamay nlemek

    iin maltoz kullanmgenleri deitirilmi.

    Maltodekstrinleri ksmiolarak paralayan STA2genini ieren plazmiditar.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    75/163

    Alkoll ieeklerin retiminde mayalar

    Alkoll ieeklerin retimi tarih olarak okeskidir. Gnmzde maya fermentasyonu pekok lkenin ekonomisi iin olduka nemlidir.

    Bira retimi bilinen en eski biyoteknolojiksretir. Bira dnda arap distillenmiiecekler cider, sake ve eitli likrler

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    76/163

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    77/163

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    78/163

    Baz alkoll eceklerin retim zeti

    Bira Viski arap Likr ve dier ikiler

    Hammadde Arpa,yardmcmaddeler

    Arpa,buday vb.

    zm Arpa, msr, melas,zm vb.

    n

    uygulama

    Maltoluturma,

    ezme

    Maltoluturma,

    ezme

    Paralama,yumuatma

    Substrata bal olarakdeiir

    Fermentas

    yon

    S.cerevisiae,

    S.carlsbergen

    sis

    S.cerevisiae S.cerevisiae S.cerevisiae,

    K.marxianus

    Damtma Hayr Evet Hayr Evet

    Olgunlama Haftalarca Yllarca Yllarca Deiken

    Son alkol

    oran (%

    v/v)

    3-6 40-45 8-12 35-45

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    79/163

    Biyoalkol retimi

    Etanoln yenilenebilir kaynaklardan mayalar kullanarakretilmesi tm dnyann ilgisini eken konulardanbiridir.

    lk retim 1930larda balamtr fakat petrolfiyatlar drlnce teknoloji braklmtr.

    1970deki petrol krizi ile birlikte yeniden gndemegelmitir.

    Brazilya eker kamn ve melas substrat olarakkullanarak rettii petrol yakt amalkullanmaktadr. Brazilyada otomobillerin ou alkol

    veya alkol+benzin karm (gasohol) ile almaktadr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    80/163

    Genetik mhendislii ile gelitirilmi mayalarnlignosellozik (odunsu) atklar substrat olarak

    kullanarak etanol retmeleri ynnde younalmalar yaplmaktadr.

    Etanol dnda mayalarn rettii dier

    biyoalkoller gliserol ( alkoll iecekler iin aroma katc,nitrogliserin trevli patlatclar yapmnda),

    ksilitol (eker yerine diyabetik rnlerin yapmnda), sorbitol, arabinitol (dk eker ierikli gdalarn

    yapmnda; ilalarn kaplanmasnda yenilebilir kaplamamaddesi olarak)

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    81/163

    Lignosellozik Materyallerden Etanol retimi

    Lignosellozik

    Materyaln Hidroliz

    Hidroliz

    Heksozca Zengin

    Fermentasyon

    Damtma Etanol

    Pentozca Zengin

    Fermentasyon

    Lignin

    Yakt Amal Etanol reten Mayalarda stenen

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    82/163

    Yakt Amal Etanol reten Mayalarda stenenzellikler

    Genel zellikFermentasyon

    reme

    rneklerHzl fermentasyon, yksek oranda etanolretimi. Yksek etanol tolerans.Fermentasyon iin optimum yksek scaklkve dk pH. Substratlarn etkin kullanm.Kk lekte fermentasyon metabolitleri.(Gliserol, esterler vb.)

    Hzl maya retimi. Yksek oranda canll

    srdrme. eitli etkenlere kar tolerans.(Yksek eker ve toksik kimyasallar)Genetik kararllk. Bakterikontaminasyonuna diren. Fermentasyon

    srasnda en az s retimi.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    83/163

    Maya biyoktlesi trevli rnler

    Ekmek mayas olarak S.cerevisiae yldamilyonlarca ton retimektedir.

    Bunun dnda;

    hayvan yemlerine katk olarak tek hcre proteinieklinde, biyosorbent olarak ar metal temizliinde, gda renklendirilmesinde pigmentli mayalar, insan ve hayvanlar iin probiyotik olarak (byme

    faktr/biyofarmastik amal) maya biyoktlesikullanlmaktadr.

    Maya Biyoktlesinin Endstriyel Kullanmlar

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    84/163

    M ay a rn Tip i Ku llan m rn ek le r i

    T m Hcre rnler i

    Sktr lm Ekme k M aya s /Aktif Kuru M aya

    M aya Krem i

    TekHcre Proteini

    Byme Faktr

    Reaktant mayalar

    Biosorben t mayalar

    M ineral mayalar

    Kozmetik maya lar

    Boyar madde mayalar

    Biyolojik kon trol mayalar

    Kirlilik kontrol mayalar

    Ekmek,bira ,arap ve da mtma

    Ekmek ve da mtma

    Hayvan bes in i

    nsan ve hayvan p robiyotii

    Organik kimyada kullanlanbiyokatalistler

    Ar metal artm

    Besinsel iz element kayna

    Deri solunum faktr

    Gda bo yalar

    Ziraatt e antifun gal ajan

    BOD indirgeyicileri

    ztlen mi Hcr ernleri

    M aya ztleri

    M aya RNA trevler i

    Hcre maya duva r

    M ay a-B vita min i ko mpleks leri

    M aya enzimleri

    Reko mb inan t maya lar

    Besin ku llan m vemikrobiyo lo jik besiye ri

    Aroma kuvvetlendiricileri vefarmastik kullanm

    Yiyecek ve farmas tikkullanm

    Kaps ller ve bes ins el des tektabletleri

    Yiyecek lerde inver taz velaktaz kullanm

    Terap tik protein ler

    S.cerevisae Dndaki Maya Biyoktlesinin

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    85/163

    y yBiyoteknolojik Kullanm

    MayaKluyveromyces marxianus veK.lactis

    C.utilis

    Phaffia rhodozymaSaccharomyces boulardii

    Pichia pastoris ve H. Polymoroha

    Yarrowia lipolytica ve C.paraffinica

    Rhodotorula glutinis,Lipomyces

    lipofer,Cryptococcus curvatus

    ve Candida trleri

    Biyomas KullanmHayvan besini. Laktaz kayna

    Tek Hcre Proteini

    Karoten pigmentiBioteraptik ajan

    THP ve metanolden rekproteinler

    Alkanlardan Tek Hcre Proteinieldesi

    Ucuz karbon kaynaklarndan TekHcre Ya Eldesi

    Tm Hcre Maya Kitlesinin Yeni Kulanm

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    86/163

    Tm Hcre Maya Kitlesinin Yeni KulanmAlanlar

    Uygulama

    iftlik Hayvanlar remeFaktr

    Yorum

    Gevigetirenlerde hayvanbymesini ve st verimini

    arttrmak iin ikembeblgesini stabilize edenS.cerevisiae kullanlr.Mayalar ikembedeoksijensiz ortam salayarak

    oksidadif hasar engeller.kembedeki yararlbakterilerin remesini, malikasit gibi maddeleri retereksalarlar.

    Biyoteraptik ajan S.cerevisia anti akne ajan vet i

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    87/163

    Kimyasal Reaktant

    Besin pigmenti

    menstrasyon ncesi argideriminde, S.boilardiibazince barsak hastalklarna

    kar koruyucu ajan olarak veanti Candida ajan olarak dakullanlr.

    Organik kimyaclar

    S.cerevisiaeyibaz kimyasalmaddelerin modifiyeedilmesinde kullanrlar. Bureaksiyonlarn bazlarendstride rutin kullanm alan

    bulmutur.Phaffia rhodozyma baz deniz

    mahsllerinde renklendiriciolarak kullanlan pigmentler

    retir.

    Biyokontrol ajanS.cerevisiae tahlrnlerinde fitoalleksin

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    88/163

    Biyokontrol ajan

    Biyoremediyasyon ajanlar

    Biyosensr

    Biyoelektriksel yakt hcresi

    rnlerinde fitoalleksinelisitr olarak kullanlr.Birka maya tr fungalmeyve hastalklarnn

    biyokontrolnde kullanlr.

    Baz mayalar endstriyelatklardan Ag, U, Co, Cu,Cdgibi ar metalleri temizler.

    Organik atklardan karbon venitrojenleri uzaklatrr.Herbisit gibi zararl toksiklerietkisizletirir.

    S.cerevisiae ortam kirliliitest etmede biyosensrolarak kullanlabilir.

    Elektron reten maya destekli

    yakt hcreleri ve maya

    Maya Kkenli Enzimlerin Kullanm

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    89/163

    y

    Substrat Enzim

    Niasta w-Amilaz,glukoamilaz

    Sukroz nvertaz

    nlin nlinaz

    Uygulamalar

    Niasta atklarnndnmyle bioetanol vebiomas retimi. Dkkarbohidratl bira yapm.

    Maya invertaznn tekstilendstrisinde sukrozhidrolizinde kullanm.ikolatayapmnda inert eker eldesi

    Kluyveromyces trleri, etanol veyksek fruktozlu uruplarn eldesinde,polifruktan ve levanlarn hidrolizinde

    etkili inlinaz enzim kaynadr.

    Laktoz Laktaz Kluyveromyces trleri stteki laktozunparalanmasnda ve gnlk atklardan

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    90/163

    Yalar Lipaz

    Selloz

    Yar selloz Sellaz vb.

    paralanmasnda ve gnlk atklardanetanol ve biyomas protein eldesindekullanlan laktaz kaynadr.Laktazyiyecek ilemede de kullnalr.Kluyveromycesteki ilgili genlerS.cerevisiaede klonlanmtr.

    Hazm kolaylatrc,tat modifiye edicieldesinde ve yalarnesterifikasyonunda trigliseritlerdenserbest ya asidi ve gliserolsalanmasnda lipazlarn kullanm.

    Sellobiozun fermentesinde bazmantarlar, ksilanlarn paralanmasndabaz mayalar kullanlr. Kimi genlerS.cerevisiaede klonlanmtr veyenilenebilir bioktledenbioetanol

    retiminde kullanlmaktadr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    91/163

    Mayalarn Biyomedikal Alanlarda Kullanm

    onkoloji, farmakoloji,

    toksikjoloji, viroloji insan genetik hastalklariin model organizma olmalar ok nemlidir.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    92/163

    2001 Nobel Tp ve Fizyoloji dl

    Maya hcre blnmesinin kontrolu ve kanser Leland H. Hartwell

    R. Timothy Hunt

    Paul M. Nurse

    Mayalara Klonlanm Baz Teraptik Proteinrnekleri

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    93/163

    rnekleriDNA Kayna

    Prokaryotik

    Viral

    Protozoal

    Hayvan

    nsan

    Gen rn rnekleriTetanoz toksin fragment C;

    Herpes,Hepatit,Onkogenik vb. bazvirslerden yzey antijeni ve enzim kodlayangenler.Malarya antijeni

    Slkten hirudin,engerektenekhistatin,tavan E-globin,sr ve fareinterlkini vb.nslin,paratiroid hormon, somatostatin, bymehormonu, ilevsel antijenler ve IgE faktr,inslin benzeri byme faktr, tmr nekroz vesinir byme faktrleri, interferonlar, hemoglobin,faktr 8 ve11, albumin, fibrinojen, Superoksitdismutaz,w-amilaz, gastrik lipaz vb..

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    94/163

    Maya genomik ve poroteomikalmalarnn tamamlanmasyla pek

    ok insan genetik hastalnntansnn konmas ve tedavisi yaknbir gelecekte gerekleecektir.

    Maya Endstrisinde

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    95/163

    Maya Endstrisindekillerldrc Faktrler

    Endstriyel mayalarn bazlarnda virusa benzeyen ift iplikli RNAlartarafndan sentezlenen toksik bir molekl (proteinaceous), bumolekle sahip olmayan mayalar iin ldrc etki gsterir.

    Bu faktrlerin varl zellikle biraclk endstrisinde ok bykskntlara neden olmutur.

    ldrc maya sular bira oluumunu tamamen durdurmakta vebiraya kt bir tat kazandrmaktadrlar.

    Fermentasyon sektrnde steril olmayan tip ak fermantasyonyapld iin arzu edilmeyen maya trleri sisteme girebilmektefermantasyon verimini ve rn kalitesini bozmaktadr.

    zellikle killer plazmid tayan maya trlerinin sisteme girmesidurumunda killer toksinine hassas balang kltr zarar grmekte,

    nemli lde verim kaybna ve rn kalitesinin dmesine nedenolabilmektedir.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    96/163

    Bu problemin en mantkl zm iseyabanc organizmalarn toksinlerinebaklk kazanm bir maya tr

    oluturmaktr. Arzu edilmeyen maya trleri tarafndan

    olaabilecek bir kontaminasyonu nlemekamacyla molekler biyoloji teknikleri

    kullanlarak killer plazmid ieren bir ekmekmayas kltr gekitirmek mmkndr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    97/163

    Kfler

    Kfler hifli mantarlardr. Birok organizma ve gda maddesi ( ekmek,meyve, sebze.. vb) zerinde oluturduklar pamuk grntsndekidoku nedeniyle mayalardan ok daha nce kefedilmilerdir.

    Kfler, endstride bir ok rnn eldesinde, atklardan deerlirnlerin oluturulmasnda kullanlan farkllama gstermeyen veklorofil iermeyen mikroorganizmalardr. Doada ve toprakta yaygn

    olarak bulunan kflerden endstriyel mikrobiyoloji alannda nemtayanlar mikroskobik olanlardr. Kflerin redikleri ortama proteaz, lipaz, karbonanhidrazlar gibi litik

    enzimleri salglamalar ve kflerin rettikleri eitli metabolitlerinbirok alanda kullanlabilir olmas bu organizmalarn endstridekinemini olduka artrmaktadr.

    Ayrca insan, hayvan ve bitkiler iin patojen olan trleridebulunmaktadr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    98/163

    Kflerin Biyolojisi

    Bir kf, protoplazmaiplikleri veya uzantlarolan hiflerden vesporlardan oluur.

    Hiflerin yapt yumamisel ad verilir. Hifler,blmeli hifler ve blmesizhifler olarak ikiye ayrlr.

    Blmeli hifler blmeler ile

    hcrelere ayrlrlar ve herhcrede bir veya iki hcreekirdei bulunur.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    99/163

    Blmesiz hiflere snositik hifad da verilir. Blme iermezler ve ok ekirdeklidirler. reme hifleri genellikle koloninin yzeyinde

    bulunan ve reyen hcreleri veya sporlar

    tayan hiflerdir. Hifsel reme ortamn besin koullar ile yakndan

    ilgilidir. Beslenme hifleri ise koloniye besin salayan

    hiflerdir. Beslenme hifleri sayesinde hcreninbulunduu noktadan uzakta olan substratlaraulamalar salanr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    100/163

    Kflerin hcre duvar glukan, kitosan ve kitin gibifarkl glukoz polimerlerinden yaplabilir.

    Birka rnekte hcre duvarnn sadece kitindenolutuu bilinmektedir. Ayn zamanda hcreduvar % 80 90 polisakkarit polimerleri deierir. Geri kalan byk bir ksm ise protein velipidlerden oluur.

    Hifler u hcrelerin gelimesi sonucu apikal

    byme ile veya blmeli hiflerde olduu gibiapikal byme ve hifin herhangi bir blmndekihcrelerin blnmesiyle geliir ve uzarlar.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    101/163

    KFLERN YAAM EVRM

    ok hcreli kflerin yaam evrimi eeyli veya eeysiz sporlarlaolabilir. eitli cins ve trlerde farkl detaylara sahip olmakla berabergenel zellikleri bakmndan benzerlik gsterilir.

    Baz eeysiz sporlar, sporangioforad verilen zel bir hif uzantsnnucunda bulunan sporangium denilen kapal bir yap iinde oluurlar.

    Bazlar ise konidioforad verilen zel hiflerden oluarak konidium

    adn alr. Dier eeysiz spor biimi ise klamidospordur.Klamidospor genellikle vegetatif hcreden geliir, kaln duvarldr veuygunsuz koullara dayankldr.

    Eeysiz remede rzgarla dala konidialar, miselyumunoluturduu konidioforlarn ularnda meydana gelir. Konidialarnimlenmesiyle vejatatif reme devam eder.

    Kfl d li

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    102/163

    Kflerde eeyli reme

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    103/163

    Endstriyel nemi Olan Kflerin Snflandrlmas

    Ascomycetes : Mayalarda olduu gibi sporlarnaskus keseleri ierisinde olutururlar. Bununlaberaber filamentli mantarlarda askuslar

    kompleks bir yap olan ascocarp iinde oluurlar.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    104/163

    Basidiomycetes grubu kfleri eeyli sporlarbasidia, basidiocarp iinde gelitirirler. Hcreeperleri glukan ve kitinden oluur. Agaricustrleri insanlar iin endstriyel mantar tketimine

    cevap vermek zere retilir.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    105/163

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    106/163

    Deuteromycotina: Bugruptaki kflerde eeylireme yoktur. Sadecekonidia olarak bilinen

    eeysiz reme yaplarylarerler. Hcre eperleriglukan ve kitinden oluur.Bu gruba giren en nemliendstriyel kflerAspergillus vePenicillumdur.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    107/163

    A. nigersitrik ve glukonik asit retimde kullanlr. A. oryzae pirin ve soya rnlerinin fermentasyonunda (

    besin endstrisinde) , proteolitik ve amilolitik enzimlerinretilmesinde kullanlr.

    Baz trleri ise bitkilere rnein pamua patojen etkiyesahiptir. Fndk veya fstk zerinde reyen A. flavusinsan ve kmes hayvanlarnda karacier kanseriniindkleyen etkiye sahip B1 mikotoksinini retirler.

    Mitotoksinler genelde kk molekl arlkl, insan ve

    hayvanlara kar toksik olan kflere ait metaboliklerdir.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    108/163

    Endstriyel kflerden en ok zerinde allanPenicillum trleridir.

    Her eit organik materyal zerinde reyebilen sporlarhavada sporofit olarak bulunur.

    P.griseofulvum griseofulvin retiminde kullanlr. Bumadde deri ve trnaktaki mantar tedavisinde kullanlr.

    Griseofulvine duyarl mantarlarda antibiyotik,mikrotubullerdeki tubulinin oluumuyla ilgili proteinebalanarak mitozda kromozomlarn ayrlmasn ve hifselremeyi durdurur.

    Penicillumun dier trlerinin birou besin endstrisindenemlidir. rnein P. camemberti, P.roquefortiisimleriyle anlan peynirlerin yaplmasnda kullanlr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    109/163

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    110/163

    Bu grubun endstriyelkfleri Mucor ve Rhizopustur. Rhizopus migricanssitrik asit retimindekullanlr. Mucorise daha

    nce anlatld gibi peyniryapmnda kullanlan renninretimnde kullanlmaktadr.Mucor pussillus ve Mucormieheiden izole edilen asitproteazlar st proteinikazeindeki peptid banparalayarak kazininkmesine neden olur.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    111/163

    Normal doal koullar altnda mantarlareeysiz olarak oalrlar. Eeyli reme isesadece uygun artlar altnda nadiren

    olabilir. Kflerin endstriyel retimi ise zelolarak tasarm yaplm sadece miseloluumuna izin veren yatay tanklarda

    yaplr.

    Kfl i ttii d t i l l d b l

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    112/163

    Kflerin rettii endstriyel rnlerden bazlar

    Antibiyotikler

    Sitrik asit

    eitli peynirler ; Rokfor, camembert, briepeynirleri gibi

    Sake (Japon ikisi)

    Soya fasulyesi sosu ve dier baz soslar eitli enzimler ; Amilaz, Glukoaminaz, Sellulaz,

    Pektinaz, Proteaz, Mikrobiyal rennet gibi

    Protist

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    113/163

    Protist

    Protistler (protozoa) neminbulunduu yerlerde, tuzlu ve tatlsularda ve toprakta bulunurlar.

    Simbiyotik ve parazit trlerininyan sra serbest yaayan trlerdebulunmaktadr.

    Bazlar ototrofik, dier bazlarsaprofit, bir grup ise heterotrofiktir.

    Besin maddelerinin sindirimisitoplazmadaki besin vakuolleriiinde olmaktadr.

    Gaz deiimi hcre zarndandifzyon yoluyla olmaktadr.

    Hcre metabolizmasnn sonucuoluan atklar hcreden difzyonlaatlr.

    Biyoteknolojik nemleri

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    114/163

    Biyoteknolojik nemleri

    Siliatlarn bir ou saprofittir. Ve organik atklarn geri dnmndeolduka byk neme sahiptir.

    Paramecium ve Chlorella

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    115/163

    Protistlerin baz trleri vitaminzellik B12 ve E vitaminlerini retirve reme ortamna salglarlar.

    Sahip olduklar pigmentleri iseendstride bir ok kullanm alanmevcuttur. r: Karatenoidleryiyeceklerin renklendirilmesinde

    yumurta sarsnn veya somonbalnn renginin artrlmasndayemlere katk maddesi olarak ilaveedilir.

    Chlorella ve Dunaliella Phytol (Fitol) bir baka potansiyel

    endstriyel rndr.

    Vitamin A, F Karoten vit E ve Ksentezinin ncl maddeleri olarakkullanlabilir.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    116/163

    Protisler amino asit retiminde de nemlibir role sahiptir. Aminoasitler ise besinendstrisinin en nemli katk

    maddelerinden birini oluturur. Ayrca ok nemli karbonhidratkaynadrlar. Besin kayna olarakkullanlmalarnn yan sra mikrobiyal

    transformasyonlar iin rnein etanol vemetan retimi iin kaynak olutururlar.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    117/163

    Alglerin polisakkarit retimi bir bakanemli retim alann oluturur.

    Baz alg- polisakkaritlerinin potansiyel anti-

    kanser aktivitesi olduu da bilinmektedir. Polisakkaritler younlatrc ajanlar olarak

    kullanlr. Polisakkaritin ticari retimindePorphyridium cruentum fazla miktardaekstraselller polisakkarit retme zelliiile kullanlr.

    karyotik Hcre kltrleri

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    118/163

    karyotik Hcre kltrleri

    Bcek,memeli ve bitki hcre kltrleri iin ayrntda farklama temelde ayn yaklamlar ve yntemler kullanlr.

    ncelikle kk bir doku paras organizmadan ayrlr. Hcreleri birarada tutan hcre d matriksin enzimler

    kullanlarak paralanmasyla hcreler serbest durumagetirilir. Bitki hcreleri iin hcre duvarn paralamak iin ek bir

    enzim daha kullanlr. In vitro hcre blnmesini engelleyen hcre d matriksten

    uzaklaan hcreler amino asitler, antibiyotikler, vitaminler,tuzlar, glukoz ve reme faktrleri ieren karmak bir besiyeri zerine yerletirilir.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    119/163

    Bu koullar altnda hcreler kltr kabnnyzeyini tek tabaka eklinde kablayncayakadar blnrler.

    Bu noktada hcre blnmesi hcrernekleri toplanmadan, seyreltilmeden veyeni bir kltr kabnn iinde yeni bir kltr

    kabna aktarlmadka durur.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    120/163

    Genellikle balang (primer) hayvan hcre kltrleri aktarlr ve 50-100 generasyon hcreler blnme yeteneini kaybeymeden velmeden korunabilir.

    Primer hcre kltrnn hcreleri orjinal hcre tipinin bazzelliklerini korur.

    Bu nedenle eitli dokularn biyokimyasal zelliklerini almak

    mmkn olmaktadr. Sklkla primer hcre kltrlerinin pasaj srasnda hcrelerin

    bazlarhcre kltrnde oalmay kolaylatran genetikdeiiklikler geirebilir

    Avantaj ynndeki bu seicilie sahip hcreler in vitro reyerek bellihcre hatlarnn olumasna neden olur. Kurulan hcre hatlar kk

    lekte viruslar korumak ve klonlanm DNA tarafndan retilenproteinin saptanmasnda, byk lekte ise alarn ve klonlanmgenlerin kodlad proteinlerin retiminde kullanlr.

    Memeli Hcre Kltrleri

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    121/163

    Memeli Hcre Kltrleri

    Baz memeli proteinlerinin yabanc birorganizma ierisinde retilmesi mmkndeildir.

    Dier bilimsel ve ekonomik nedenlerle bu

    proteinlerin retiminde Memeli Hcre Kltrlerikullanlmaktadr. r:Monoklonal antikorlar Neden: nk monoklonal antikorlarn

    transkripsiyon ve translasyon dzeylerindekisentez ve reglasyonlar olduka karmaktr. Bu

    tr proteinler gelecekte tedavi ve analitikuygulamalardaki nemlerinden dolay oldukageni almalara konu olacaklardr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    122/163

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    123/163

    GELENEKSEL

    BYOTEKNOLOJ

    arap Yapm

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    124/163

    arap Yapm

    arap zmn d tabakasnda bulunan yabanimayalar kullanlarak yllar ncesinden beriyaplmaktadr.

    Farkl maya rklar arabn o blgeye aitkarakteristik tad ve aromasn vermek zere oorafik alan iin zel olarak seilir.

    Gnmzde ou modern arap reticileri kendizgn maya rklarn zelliklerine gre seiminiyaparak kltrleyip saklarlar.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    125/163

    Toplanan zmler ra haline getirmek zere paralanr. Geleneksel olarak zmler n ilemden geirilmez.

    Sadece Kaliforniada sfr dioksit etkisinde braklarakyabani mayalar ldrlr.

    zmn d tabakasnda bulunan yabani mayalarradaki ekerin fermentasyonunu salar. Saccharomyces cerevisiae var. ellipsoideus. Bu deiimi

    gerekletiren baskn olan mayadr. Fermentasyon gnlerce srer.

    Krmz ve beyaz zmlerden elde edilen ralar krmzve beyaz araplar oluturur.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    126/163

    Krmz araplar zmn d kabuu ilebirlikte fermente edilir.

    ekerler etanol ve karbon dioksite

    dntrlrken etanol kabuktakipigmentleri znr duruma getirir vekrmz arap oluur.

    Beyaz arap iin d kabuk uzaklatrlr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    127/163

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    128/163

    Bira Yapm

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    129/163

    Bira Yapm

    Bira malt haline getirilmi (imlendirilmi) arpadan yaplr Malt yapmak iin arpa taneleri su ierisinde 2-3 gn bekletilir daha

    sonra szlr 13-17 C 10 gn bekletilir. Bu ilem depo niastann maltoza

    dnmesi iin gerekli olan amilazn retilmesiyle imlenmeyibalatr.

    Scakln 40-70 Cye karlmasyla enzimler denature edilir veimlenme durdurulur.

    Tanelerin kavyrulma scaklna gre farkl renk ve tadda malt oluurbunun sonucunda da farkl renk ve tadda bira oluur

    Taneler silindirler arasndan geirilerek paralanr. 62-68 C de su eklenip 2 saat bekletilir. Bu ilem ekerin malttan

    ayrlrak zlmesine yardmc olur Sv byk bir kaba aktarlr (atk taneler hayvan yemi olarak satlr)

    ve biran karakteristik tadn veren erbetci otu (Humulus lupulus)eklenir

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    130/163

    Az miktar eker eklenerek birka saat kaynatlr erbetioyundan ayrldktan sonra fermentasyon iin uygunscakla getirilir

    Fermentasyon tankna Saccharomyces cerevisiae ve S.calsbergensis ilavesiyle fermentasyon balatlr.

    20 C de 5 gn sren fermentasyon sonucunda (etanolve karbon dioksit oluumu) mayalar uzaklatrlr ve

    Marmamite olarak adlandrlan maya zt olarak besinendstrisinde kullanlr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    131/163

    Olgunlamasrecinden (haftalarbazen aylar) sonrabira santrifj edilirekatklardanuzaklatrlr ve uygunieleme

    ilemlerinden sonrasata sunulur

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    132/163

    Arpa taneleri

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    133/163

    Arpa taneleri

    Malt oluumu iin taneleri slatma

    Ezme ilemi

    erbeti otu

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    134/163

    EKMEK YAPIMI

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    135/163

    EKMEK YAPIMI

    Gnmzde ekmek yapmnda eitli tahllardan eldeedilen unlar kullanlmaktadr.

    lem un, su, tuz ve maya karmn kapsar (bazeneker ilavesi de gerekebilir)

    Undaki enzimler (amilazlar) niastay maltoza ve glukozahidroliz ederler. Mayalar ekerleri etanol ve karbon dioksite dntrrler Karbon dioksit ekmein kabarmasn salar Ekmein yapsn undaki proteinlerin zellikleri belirler. Genel olarak gluten olarak adlandrlan proteinlerin

    toplam kaliteli ekmek iin %10-14 biskvi yapm iin%10dan az olmaldr.

    Ekmek Mayas retimi

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    136/163

    Ekmek Mayas retimi

    Yourt Yapm

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    137/163

    Yourt Yapm

    Yourt yapmnda st,yar st tozu veya tamamen st tozukullanlabilir.

    St ncelikle patojen mikroorganizmalar iin kontrol edilir. St 85-95 C de 15-30dk stlr.

    n ilemleri ve stlmas tamamlanan ve 43-45 C yesoutulan ste %2-3 orannda yourt bakterileri eklenir. Ayn sda yourtlama kaplarnda bir sre beklenir. Yourt bakterileri ortaklaa olarak stteki laktozu

    paralarlar ve laktozdan laktik asit oluturarak stn

    ekiliini artrrlar asiditenin artmasyla stteki kalsiyumkazeinat kolloidal durumunu koruyamaz znerek jel

    haline geer ki buna yourtlama denir.

    Yourt Yapm

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    138/163

    Yourt Yapm

    Kullanlan mikroorganizmalar: Fakltatif anaerop Lactobacillus hcreleri Gram(+) omaktrlar.

    Kompleks reme faktrlerine gereksinim duyarlar. Asite kartolerans gsterirler. Fermentasyon sresince den pH'ya karbakteriler remeye devam ederler. Bu zellikleri onlara ortamdaseici olmalarn salar.

    Lactabacillus dnda laktik asit retiminde kullanlan bir dier cinsStreptococcus'tur. Streptococcus Gram(+) ve kok morfolojisinesahiptir.

    Yourt yapmnda her iki tip bakteride kullanlmaktadr. Lactabacillusproteinleri paralayp peptitleri aa karr. Bu sonuStreptococcus thermophilus un remesini indkler. Streptococcusrerken methanoik asit retir. Bu da Lactobacillusun remesiniindklemektedir. Her ikiside ok az oranda alkol retmektedir.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    139/163

    Yourt istenen kvam kazannca soutularak lkortamda alan bakterilerin aktiviteleri nlenir .

    Bu ilem ne kadar abuk olursa asitlik gelimesiaz olacaktr.

    Soutma sresinde de asiditenin artmas gznne alnarak inkbasyon sresi ksatutulmaldr.

    Son yllarda retimi yaplan "Bio yourt" ise dahatatl ve kremsi tatdadr. retiminde bu iki grupbakteriye ilaveten L.acidophilus da oluan asidiktad uzaklatrmak iin kullanlr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    140/163

    Probiyotik yourt: Probiyotik kltrlerbarsak yzeyine tutunarak oalr vebarsak florasnn dengelenmesine

    yardmc olur. Lactobacillus johnsonliprobiyotik zelliklerinden dolay yourtyapmnda kullanlmaktadr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    141/163

    Laktik asit ayrca ilk mikrobiyal rn olarakretilen organik asitlerden biridir.

    Eki ve kokusuz bir maddedir. Su, alkol ve eterle kolaylkla karabilir.

    Kloroformda znmez. Erime noktas dktr. yi zc zelliklerine sahip zayf bir asittir. Kolaylkla polimerleebilir.

    Bu zellikleri nedeniyle geni bir kullanm alanvardr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    142/163

    Besin maddelerinin korunmas amacylaasidite salar.

    Kalsiyum laktat pasta yapmnda kabartma

    tozu olarak, bakr laktat ise elektrokaplama ilerinde geni olarakkullanlmaktadr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    143/163

    ki tip laktik asit bakterisi bilinmektedir.Heterofermentatifve Homofermentatif.

    Heterofermentatiforganizmalar ok sayda yan

    rn oluturduklar iin endstriyel boyutlarda kiretimler iin uygun deildir.

    Homofermentatiforganizmalar ise ok azistenmeyen yan rn oluturan buna karlk

    laktik asit retimi fazla olan organizmalardr.

    Teoride bir glukoz molekl bana iki molekl laktik asitve iki molekl ATP oluur.Gli ld hit 3 f f t d hid d NAD+

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    144/163

    Gliseraldehit-3-fosfat dehidrogenazdan NAD+redksiyonu ve laktat dehidrogenazla prvat

    redksiyonundan geen NADH oksidasyonu sonuculaktik asit oluur

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    145/163

    Endstriyel laktik asit retimi iin en okkullanlan mikroorganizma Lactobacillusdelbrueckii olup zellikle msr glukozu ierenortamlarn fermentasyonunda kullanlr.

    L. bulgaris karbon kayna olarak laktozufermente eder ve peynir alt suyunda laktatretiminde kullanlr.

    L. petosus pentozlar kullanabilmekte olup sfitatk svsndan laktik asit retiminde elverilidir

    Peynir Yapm

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    146/163

    y p

    Peynir stteki proeinin kelmesiyle yaplan eneski st rnlerinden biridir.

    Stn kaynana, olgunlamada ve ileriaamalarda kullanlan yerel yntemlere bal

    olarak farkl tat, renk ve yapda yzlerce farklpeynir eidi bulunmaktadr. Pernir yapmnn ilk aamalar yourt yapmna

    benzer. Stteki proteinin koaglasyonu (st kesii)

    Peynir alt suyunun uzaklatrlmas Olgunlama

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    147/163

    St 72 C de 15 saniye stlr Hzla 31 C e soutulur ve peynir tankna geirilir Laktik asit bakterileri (Streptococcus lactis, S. cremoris

    ya da zel bir tada zg bir tr) eklenir

    Laktozun laktik asite dnm st proteinlerininkoaglasyonu Daha ileri dzeyde st kesiinin oluumu iin kimozin

    (%90) ve pepsin (%10) enzimlerinin karm olan renneteklenebilir.

    45 dakika sonra st kesii svsndan (peynir alt suyu)uzaklatrlr

    eitli olgunlama ilemleri

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    148/163

    Evaporasyon: Sttem suyunuzaklatrlmas

    Kontrol odas

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    149/163

    Peynir tankna bakteri

    kltr eklenir, renklenme

    gerekleir ve st kesii

    oluur

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    150/163

    St kesii ve peynir alt suyu szmetablalarna geirilir.

    Peynir alt suyu ayrlrkartrma ilemiylest kesiklerinin boyutlarnn ayn olmassalanr Bu aamada tuz eklenir.

    Sirke Yapm

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    151/163

    p

    Meyve sular ve meyve ezmelerindenasetik asit eklinde sirke retimi ok uzunyllardan beri yaplmaktadr.

    Romallar devrinde sulandrlm sirkeferahlatc iecek olarak kullanlrd. arap

    flarnn aznn ak braklmasyla sirkeoluturulurdu. Daha sonralar teknikleringelitirilmesiyle sirke retimi artrld.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    152/163

    ekerli meyvelerden sirke yapmndabirbirinden tamamyla farkl ikifermentasyon ilemi yer alr.

    1.Alkol fermentasyonu 2.Asetik asit fermentasyonu

    nce meyve ve zm ralarndaki ekeralkole dndrlr. Bunu salayan

    mayalardr. Sonra oluan bu alkol sirkebakterileri asetik asite dntrlr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    153/163

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    154/163

    Asetik asit fermentasyonu balamadan alkolfermentasyonu bitmi olmaldr.

    Sirke bakterileri havann oksijeni yardmylaalkol okside ederek asetik aside evirir.

    Kimyasal bakmdan asetik asit fermentasyonubir oksidasyon (dehidrogenasyon) olaydr.

    Asetik asit retimi bir ok fermentatif bakteritarafndan yaplmakla beraber ticari olarakretimde zel bir grup bakteri "asetik asitbakterileri" kullanlmaktadr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    155/163

    Asetik asit bakterileri iki grup altnda toplanabilir. Glucanobacterler

    Asetobakterler Asetik asit bakterileri Gram(-) genelde omakfakat deien morfolojiye sahip asite toleransl,aerop kirpikli bakterilerdir.

    A. pasteurianus, A.aceti ve A. peroxidans sirke

    yapmnda kullanlan trlerdir. OT:25-30 vepH:5.4-6.3. kemoheterotroflardr. Etanoln dnda gliserol ve laktat da karbon

    kayna olarak kullanlabilir.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    156/163

    Asetik asit Biyosentezi : lk oksidasyonaamasnda etanol alkol dehidrogenazenzimine zgn NAD ve NADP'nin

    redklenmesi ile aset aldehite oksitlenir.kinci oksidasyon ise aset aldehitdehidrogenaz ile asit aldehit hidratn asetikasite oksidasyonudur. Sonuta 1 moletanolden 1 mol asetik asit oluur.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    157/163

    Glukanobakterler etanol sadece asetik asite oksitlerken(tamamlanmam oksidasyon) Acetobakterler etanolnce asetik asite daha sonra da oksijen varlnda CO2ve H2O indirgerler.

    Sirke retiminde bu durum asit niceliini azaltacandanpratikte nem tar.

    Glukanobakterler ayrca glukozu glukonik asiteoksitleyebilirler. Glukonik asitte ila endstrisindekullanlan kalsiyum glukonatn yapmnda kullanlr.Doal sulara sodyum glukonat ilavesi ile de tuzkelmesi nlenmektedir.

    Tek Hcre Proteini

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    158/163

    Mikroorganizmalar ucuz ve atk materyalzerinde retilir, saflatrlr ve hayvan veyainsanlar iin besin kayna olarakkullanlabilirler.

    Eer bu besin protein kayna olarak retilirsetek hcre proteini (THP) olarak adlandrlr.

    Pek ok mikroorganizma, algler, mavi-yeil

    bakteriler, mantarlarve bakterilertek hcreprotein kayna olarak kullanlabilir.

    THP retimi iin KullanlanSubstratlar

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    159/163

    Substratlar Peynir endstrisi at olan protein ve laktoz bakmndanzengin olan peynir alt suyu Baz mayalar bu atk zerinde protein ve baz vitaminler

    bakmndan zengin ierie sahip olarak reyebilirler vekedi mamas katks olarak kullanlr.

    eker ileme endstrisi at olan melas zerindemayalar kolaylkla reyebilir Kat endstrisinin at olan slfit svs eker

    bakmndab zayftr ve baz kfler bu atk zerindereyebilir.

    Petrol endstrisinin at olan alkanlar mayalar iinsubstrat olabilir Alkanlar zerinde reyen mayalarhayvan yemi olarak kullanlr.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    160/163

    nsanlar iin tketime en uygun olan THPsatta bulunan Quorn mikoproteinidir.

    Mikoprotein flamentli kf olan Fusariumgraminereumdan elde edilir.

    Karbon kayna olarak glukoz urubu azotkayna olarak amonyum kullanlr

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    161/163

    Msr veya buday niastas glukozkayna olarak, kolin ise hifin bymesiniindklemek iin kullanlmaktadr. Ayrca

    biotin de eklenir. 30 C de pH 6 da srekli kltrde reme

    gerekletirilir.

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    162/163

    Mikroorganizmalarn hzl remesi yksek RNAieriine neden olur.

    Yksek dzeydeki RNA ierii insan ve

    hayvanlar tarafndan tketimde uygun deildir. nsanlarda fazla miktardaki nukleik asit rik asitedntrlr.

    rik asit bbrekler tarafndan atlamaz ve rik

    asit kristalleri eklinde eklemlerde birikir (Guthastal)

  • 8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1

    163/163

    Normal retim sonunda RNA ierii %10civarndadr ve hala tketim iin fazladr.

    Is oku ve ribonukleaz etkisiyle RNA

    ierii %2 ye drlr. Miselyum toplanr 18 C de uzun sreler

    saklanabilir.

    Tad etin tadna benzer ve eitli hazr etrnleri iine eklenir