Upload
zuhal
View
244
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
1/163
BYOTEKNOLOJ
2008-2009Ayegl TOPAL SARIKAYA
stanbul niversitesiMolekler Biyoloji ve Genetik Blm
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
2/163
BYOTEKNOLOJ NEDR?
Biyolojik ara, sistem ve srelerin retim ve hizmetendstrilerine uygulanmas
Endstriyel uygulamalarda baarl olabilmek iin Biyokimya,Mikrobiyoloji ve Mhendislik bilimlerinin ortak kullanm ilemikroorganizmalarn, doku ve hcre kltrlerinin
kapasitelerinin artrlmas eitli yararl maddelerin retilmesi iin biyolojik zellikleri
kullanan bir teknoloji olmas Biyolojik aralar tarafndan retilen materyallerin daha iyi rn
ve hizmet vermek zere bilim ve mhendislik ilkelerininuygulanmas
Biyoteknoloji sadece teknik ve srelerin toplamna verilen biraddr. Biyoteknoloji canl organizmalar ve onlarn yaptalarn tarm,
gda ve dier endstrilerde kullanan bir tekniktir.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
3/163
BYOTEKNOLOJNN BALICA
UYGULAMA ALANLARI Biyosre Teknolojisi
Alkoll ieceklerin retimi Antibiyotik retimi Memeli hcre kltrleri
Yeni rnlerin retimi (r: Polisakkaritler) la retimi Organik zc retimi (r:Aseton, butanol) Protein bakmndan zenginletirilmi gdalarn retimi retim kapasitesi art iin fermentasyon tasarm optimizasyonu
Enzim Teknolojisi zgn kimyasal reaksiyonlar iin kullanmlar Enzim immobilizasyonu (tutuklanmas) Yar sentetik penisilin retiminde Niasta ve sellloz hidrolizinde Biyolojik analizler iin sensrlerin oluturulmasnda
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
4/163
BYOTEKNOLOJNN BALICA
UYGULAMA ALANLARIAtk Teknolojisi Atklarn yeniden kullanlabilmesi Atklardan yeni rnlerin retilmesi (r: alkol)
evre Teknolojisi Kirliliin kontrol Atk toksinlerin uzaklatrlmas Dk dereceli madenlerden ve madencilik endstrisi
atklarndan metallerin geri kazanlmas
Yenilenebilen Kaynaklar Teknolojisi Kimyasal ham madde ve etanol, metan ve hidrojen retimiiin lignoselllozik materyalin yenilenebilen enerji kaynaolarak kullanlmas
Bitki ve hayvan materyalinin tamamnn kullanlmas
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
5/163
BYOTEKNOLOJNN BALICA
UYGULAMA ALANLARIZiraat ve Hayvanclk Besin deeri yksek, hastala direnli, strese toleransl
yksek kalitede ve verimde genetik mhendislii ilegelitirilmi bitkilerin oluturulmas
Hayvanclkta rn artrmn salamak
Salk Yeni ilalarn oluturulmas lalarn sadece hastalkl blgeye ulamasnn salanmas Hastalk tanlarnn gelitirilmesi Alarn gelitirilmesi nsan genomunun anlalmas Gen tedavisi
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
6/163
BYOTEKNOLOJ LE LKL SEKTRLERNSINIFLANDIRILMASI
Teraptikler Hastalklarn kontrolnde ve tedavisinde kullanlan
farmastik rnlerin retimi Antibiyotik retimi A retimi Gen tedavisi ile ilgili rnlerin retimi
Tan kitleri Gda, evre ve ziraatta kullanlan tan ve saptama
kitlerin retemiGda eitli gda rnleri, koruyucular, iecekler ve eitli
katk maddelerinin retimi
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
7/163
evre Artm, Zararl maddelerin yararl hale dnm,
enerji retimini salayan irketler
Kimyasal ara rnler Enzimler, DNA, RNA, zgn kimyasallar reten
irketler
Tehizat Tm makine donanm, biyoreaktrler, "software" ve
biyoteknolojiyi destekleyen tm tketim maddelerinireten irketler
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
8/163
Biyoteknoloji konu olarakmultidisipliner yani bamsz pekok bilim daln birarada barndrr.
Eer biyoteknoloji almasyapanlar bir liste altnda toplamakgerekirse Biyokimyaclar,Mikrobiyologlar,Genetikiler,Molekler biyologlar, Hcrebiyologlar, Botanikiler, Ziraatmhendisleri, Virologlar, Analitik
kimyaclar, Biyokimya mhendisleri,Kimya mhendisleri, Kontrolmhendisleri, Elektronikmhendisleri ve Bilgisayarmhendisleri bu liste ierisindesaylabilir.
Ayrca bu liste oluturulan yeni bir
tekniin pazarlanmasnda sorumluolan ekonomistler, yneticiler vefinans ii ilgili olan elemanlar veyeni bir rnn patent alnmndansorumlu hukukcular da katlarakgeniletilebilir.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
9/163
Biyoteknolojinin Tarihsel Evrimi
lk defa, 1919 ylnda, Karl Ereky tarafndan kullanlanBiyoteknoloji teriminin o zamanki tanm, anlam vekapsam, gnmze kadar gelien modern tekniklerin bualana uygulanmas ile, nemli lde deiikliklere
uramtr. Karl Ereky, biyoteknolojiyi Biyoteknolojik Sistemler
Yardmyla Hammaddelerin Yeni rnlereDntrld ilemlerdir eklinde tanmlamtr.
Bu tanm, o zamanki geleneksel biyoteknolojikuygulamalara ok benzemekte idi. nk, o yllardabiyoteknolojik sistemler herhangi bir deiiklieuratlmadan kullanlmaktayd. Bunun balca nedeni,teknolojinin gelimemi olmasyd.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
10/163
Son 25-30 yl, biyoteknolojik gelimelerin altna olarak kabul edilmekte, biyoloji, kimya, fizik,biyokimya, mikrobiyoloji ve dier bilimdallarndaki yeni bulularla bu yeni alan
desteklenmi ve insanolunun hayallerininsnrlad noktaya kadar adm admgereklemitir.
Ortaya konan her yeni bulu veya teknik, dier
bir uygulamaya, ileriye dnk olarak, bykkatkda bulunmu, onun temel ve itici gcnoluturmu ve yeni ufuklarn almasna ve yeniproblemlerin ortaya kmasn yol amtr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
11/163
Dnyada giderek artan sayda lke,biyoteknolojik aratrmalarda ve buna balolarak oluturulan yeni rnlerin kullanmakarlmasnda, bu ynden ncelik kazanarak
biyoteknoloji pazarna hakim olmada birbirleriyleyar haline girmi bulunmaktadr.
Bu alanda byk aktivite gsteren birok bykfirma kurulmu ve ok byk yatrm yaplmtr.
Ksa bir gelecekte biyoteknolojik rnlerin,aynen mikroelektronik malzemeler gibi, gelimilkelerin ticar bir silah haline gelecei okaktr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
12/163
Biyoteknoloji tarihinde nemli baz
olaylar M 6000 Mayalar ilk kez Smerler tarafndan bira yapmnda kullanldlar
M 4000Msrllar maya kullanarak
ekmek yapmn kefettiler
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
13/163
zm kltryapm(Grcistan),
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
14/163
1673 Anton van Leeuwenhoek (1632 -
1723),Protozoa ve bakterilerinfermentasyonda rol oynayabileceiniaklayan ilk bilim adam
1856Louis Pasteur Louis Pasteur (1822 -1895)
mikroorganizmalarn fermentasyondan sorumluolduklarn kesin bir ekilde tanmlad
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
15/163
1928 Alexander Fleming petri kaplarnda bir para kfle
evrelenmi blmde tm bakterilerin ldnkefetti. Bylece penisilin dnemi balad. Fakat 15yl sonra tbbi kullanm iin uygun duruma geldi.
1938 Proteinler ve DNA eitli laboratuvarlarda allmaya
baland. Molekler biyoloji terimi gndeme girdi.
1941Bir gen bir enzim hipotezi ortaya atld
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
16/163
1943 Rockefeller vakf Meksika hkmeti ile ibirlii
yaparak Meksika Tarm Program balatld. Bu
yabanc yardmyla yaplan ilk bitki slahalmas olarak biyoteknoloji tarihinde yeriniald.
1953
Kortizon byk lekte retilen ilk rn 1953 1976 DNA ile yaplan yaygn almalar
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
17/163
1977 - Gnmz:
Genetik Mhendislii almalarnn balamas.
Genentech Genentech, Inc., tarafndansomatostatin (insan byme hormonu)bakteriye klonland.
1978
1978de Herbert Boyer San Francisco Californianiversitesi laboratuvarnda rekombinant insulingenini E. coliierisine aktarmay baard.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
18/163
1980 PATENT alnmna izin verilmesi ABD yksek Mahkemesinin petrol yiyen bakteri iin patent vermesi Kary Mullis ve arkadalar tarafndan PCR ynteminin kefedilmesi. 1982
Genetik mhendislii ile gelitirilmi insan insulinin bakteri tarafndanretilmesi
1985
Bcek, bakteri ve viruslara direnli bitkilerin toprakta yetitirilmesialmalar
1986 lk rekombinant a (sarlk, Hepatit B) 1988
lk genetii deitirilmi hayvan olarak meme kanseri almalarndakullanlan fare iin patent alnmas
1990 lk baarl gen terapi almasnn yaplmas 1994 lk genetik mhendislii ile gelitirilmi domatesin dnya gda rgt
tarafndan kabul
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
19/163
1996 Biyosensrlerin kullanlmas
1997 Dolynin yaplmas 1998
Ebriyonik kk hcre retimi 1999
Deli dana hastal iin hzl ve hassas tan sisteminingelitirilmesi
2001: 200,000 alan, devlete ait $30 milyar gelir, toplam
1450 irket 350si kamu irketi
1992: 80,000 alan, $8.1 milyar devlete ait gelir.Yaklak ayn sayda irket
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
20/163
Tarihsel evrime gre biyoteknoloji temeldneme ayrlmaktadr. Bunlar da,
1) Geleneksel Biyoteknoloji: Karl Erekynintanmlad biyoteknoloji kapsamnda, biyolojiksistemler (genellikle bakteri, maya, mantar) hibirmodifikasyona uramadan aynen kullanlmaktayd.
Aslnda, bu tarihlere ait bilgi ve teknoloji de genetikdzeyde deiiklikler yapabilecek durumda deildi.Yaklak 20 yl kadar devam eden bu dnemdebiyolojik sistemler, ekmek, peynir, alkol, eitli alkollikiler, sirke, yourt gibi maddelerin retilmesinde
fazlaca kullanlmtr. Bu nedenle de bu periyot,Fermantasyon teknolojisi arlkl olup buna ynelikretimi kapsamaktadr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
21/163
2) Ara Dnem: 1940-1975 yllar arasn kapsayanbu dnemde, biyolojik sistemlerin endstride
kullanm alanlar geniletilmi ve baz kktekniklerin ilavesiyle de retim gelitirilmi veartrlmtr. Bu ara periyot ierisinde antibiyotik,enzim, protein, karbonhidrat, organik asitler, alkolvb. maddeler fazlaca retilmitir.
Bu dnemde, geleneksel biyoteknoloji gibibiyoteknolojik sistemler ve zellikle de bunlarngenomlarnda kkl deiiklikler yaplmad iin,bugnk anlamda kullanlan biyoteknolojik
uygulamalar pek kapsamamaktadr. Bunedenlerle de, bu ara periyot ta birincisi gibifermantasyon teknolojisine dayanmaktadr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
22/163
3) Modern Biyoteknoloji: Gelimi ve modern tekniklerin biyolojiksistemlere uyguland bu dnem olduka ileri bir karakter tamaktadr.
Mutasyonlarveya Rekombinant DNA teknolojisi yardmylaoluturulan yeni fenotipik karakter tayan Mutantlarveya Transgenikorganizmalar, endstride ve dier alanlarda (mikrobiyoloji, biyoloji,biyokimya, insan ve hayvan sal, hayvan slah, ziraat, evre vb.) okfazla kullanlmaya balanmtr.
Bu gelimelere paralel olarak, biyoteknolojinin tanmnda dadeiiklikler yaplmtr. 1982 ylnda OECDnin raporunda belirtilentanma gre biyoteknoloji Temel Bilimlerin ve Mhendislik lkelerinin,Ham Maddelerin Biyolojik Aralar Yardm ile rnlereDntrld Srelere Uyguland Bir Teknolojidir eklindedir.
Bu tarif iine her ne kadar ak olarak belirtilmesede, genetikdzeydeki manipulasyonlarn da iinde bulunduu Molekler Genetikve Rekombinant DNA teknolojisi de yer almaktadr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
23/163
Modern Biyoteknoloji
Bu teknikler yardmyla organizmann yaam iin gerekli btnbilgilerin topland ve kodland genom kitaplnn = bankalarnnkurulmas, oluan bankalardan arzu edilen genin izolasyonunun venkleotid dizisinin saptanmas ve bu dizilerde deiiklikleryaplmas veya baka organizmalara aktarlmas, genreglasyonunun saptanmas, hibrit hcreler elde edilmesimmkndr.
Bu teknikler yardmyla biyoteknolojik alar, proteinler,enzimler, antibiyotikler, hormonlar, sitokininler, monoklonalantikorlar, tehis koruma ve tedavi aratrmalarnda kullanlandiagnostik maddelerin ve kimyasallarn retilmesigerekletirilmektedir.
Bu yntemler ile, doal koullar altnda ancak yz binlerce yliinde meydana gelebilecek mutasyonlar, in vitro olarak ksa sredeoluturmak mmkn olmaktadr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
24/163
Neden byle bir teknoloji (Rekombinant DNATeknolojisi) geliimine ihtiya duyulmutur?
1) Genellikle baz belli tipteki hcreleri byk lekte retmekgtr. rnein memeli hcrelerini zellikle insan kaynakl olanlarretmek olduka zordur. remeleri yavatr. Mikroorganizmalarretebilmek iin kullanlan basit yntemler bu tip hcreler iin
kullanlamaz.
2) Doal kaynaklarn kullanm snrldr.
3) Doal kaynaklardan izole edilen bir rnn kontaminasyonriski tamas r: Serumdan izole edilen baz faktrlerin (faktr XII)
hemofili hastalar iin kullanlmas bu faktrn izolasyonu srasndasarlk veya AIDS gibi baz hastalk etkenleri ile kontamine olmasolasln ortaya karr.
4) Maliyet
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
25/163
$Bu teknolojinin domasna bir baka nedendetamamen yeni bir rnn retilme isteidir.
rnein endstride biyokatalizr olarak kullanlanenzimler snrl zelliklere sahiptir.
Bu zellikler zel spesifite, katalitik aktivite vestabilitedir.
Enzimi kodlayan gende yaplan modifikasyonlarlaenzimin yaps ve dier zellikleri avantaj ynndedeitirilerek konak organizmaya sokulur ve yeni birsper enzim elde edilebilir.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
26/163
$Ekonomik adan nemli bitkilerin de genomlarnndeitirilmesi biyoteknolojinin dier bir nemli konusudur.
Tahllara atmosferden azotun fikse edilmesizelliinin kazandrlmas sadece gbrekullanlmamasn salayan maliyet azalmasnn yansra,
gbre kullanm ile kirlenen tarladan yamur sular iledoal su kaynaklarnn kirlenmesi de nlenebilir.
Ancak uzun ylardan beri yaplan bu almalar azotfiksasyonunun reglasyon mekanizmasnda ok saydagenin etkili olmas nedeniyle azot fiksasyonunun tahllartarafndan yaplmas henz baarlamamtr.
Bundan baka tohumlardaki depo proteinlerininmiktarlar artrlabilir veya herbisitlere direnli bitkilergelitirilebilir. Ayrca eitli hastalklara direnli, donmayadayankl, raf mr uzatlm bitkiler de gelitirilebilir.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
27/163
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
28/163
Biyoteknolojinin retim Sreci Ticari deere sahip bir rnn
mikroorganizmalar kullanarakyaplan retimi srasndaendstriyel biyoteknoloji srecigenellikle 3 temel aamayaayrlr.
Upstream processing: Hedefmikroorganizma iin besinkayna olarak kullanlabilecekham maddenin hazrlanmas
Fermentasyon vetransformasyon: Byk birreaktr (100 litreden byk)
iinde antibiyotik, amino asit,enzim gibi arzu edilen rnnoluumu (biyodnm) ilesonulanan hedefmikroorganizmann oalmas
Downstream processing: Arzuedilen rnn hcre ktlesindenveya besi ortamndan ayrlarak
saflatrlmas
Hammadde
Upstreamprocessing
:
Fermentasyon vebiyodnm
Downstream
processing
Saf rn
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
29/163
Mikroorganizmalarla yaplan biyoteknolojiksrelerin ou genel olarak;
Sre Mh.
Substrat + Mikroorganizma RN
eklinde zetlenebilir.
Sre mhendislii retim ilemleri (fermentasyon)ve bu ilemler sonucunda oluan rnn gerikazanlmas ile ilgili yntemlerin saptanmas,gelitirilmesi ve optimize edilmesini ieren
almalar kapsar.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
30/163
rn hcre biyomas, hcrenin bir metaboliti yada balang materyalinin transformasyonusonucu oluan bir madde olabilir. Bazdurumlarda retimde canl organizma yerine
mikroorganizmalarn rettikleri enzimlerkullanlabilir. Bu durumda;SreMhendislii
Substrat + Enzim RN
eklinde bir eitlik sz konusudur.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
31/163
Sre gelitirilmesinden nce arzu edilenrnn saptanmas gerekir.
Genelde yabani sular bu rn azoluturduklarndan rn saptamayntemleri duyarl olmaldr.
Sre gelitirilmesinde eitli yntemlerkullanlabilir. Fakat retimde ama yalnzbir veya birka yntemi kullanmaktr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
32/163
retim iin gerekli olan substrat, toplam imalat fiyatnn yaklak %50 sinikapsadndan mmknse besiyeri ucuz ham madde iermeli fakat retimin
artrlmas iin gerekli olan spesifik katk maddeleri unutulmamaldr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
33/163
Fermentasyon sonucunda oluan rnnyksek verimde geri kazanlmas dier birnemli konudur.
Eer rn hcre biyoktlesi ( "biomass" ) iseoluan hcreler srekli toplanr ve fermentasyondevam eder.
rn hcre iinde kalabilecei gibi salglamayeteneinde olan hcreler tarafndan da reme
ortamna salnabilir. Hcrenin paralanmas, ekstraksiyon vesaflatrma ilemleri sonucunda minimum kaypile rnn geri kazanlmas salanr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
34/163
Biyoteknolojik srelerin en son aamaselde edilen rnn kalite kontrolyapldktan sonra paketlenmesi vetketiciye bozulmadan sunulmasdr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
35/163
Biyoteknolojide
Biyolojik Sistemler
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
36/163
Biyolojik Sistemler
Bakteri Mantar Bcek
Bitki Memeli hcre hatlar Bcek, bitki ve memeli
viruslar
ok hcreli organizmalar (bitki, balk, fare veevcil hayvanlar
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
37/163
Prokaryotlar$ Bakterilerve Cyanobacteria (mavi-yeil bakteriler)
Bakteriler, toprak, hava, su, hayvan ve bitki yzeylerinde bulunurlar.Bazlar hastalk etkeni olmakla beraber ou zararsz ve organik atklarngeri dnm srasndaki yararl etkileri ve birok faydal rn retmelerinedeniyle biyoteknolojide olduka nemli bir yere sahiptirler.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
38/163
1884 Christian Gram tarafndan bulunan Gramboyama yntemi ile bakteriler kabaca iki bykgruba ayrabiliriz. Bakteriler iki farkl hcre duvar
yapsna sahiptir ve buna gre farkl ekildeboyanma zellii gsterirler.
Gram (+) Gram (-)
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
39/163
Bakteri morfolojileri
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
40/163
Ayn genusa ait baz trler endstriyel adan faydalzelliklere sahipken bazlar insanlar iin zararldr.rnein Bacillus trleri toprakta yaarlar ve aerop veyafakltatif anaerop metabolizmaya sahiptirler.
B. subtilis endstride kullanlan amilaz enzimininkaynadr.
B. thruringiensis ise birok bitki zararls bceinpatojenidir. Ve bu nedenle bceklere direnli bitkilerinoluturulmasnda genetik mhendisliinin nemli alma
konularndan birini oluturur. B.athracis ise insanlara patojen etkiye sahiptir ve arbon
hastalnn nedenidir.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
41/163
Escherichia coli
Genetii, moleklerbiyolojisi, biyokimyas,fizyolojisi ve genel biyolojisison 50 ylda yaplanalmalardan toplananbilgilerle son derece iyibilinen bir organizmadr.
Gram (-), patojen olmayan,omak eklinde, hareketlibir organizmadr.
Doal olarak insanbarsanda bulunur, normalolarak toprak veya sudabulunmaz.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
42/163
ok basit besi ortamlarnda
kolaylkla blnerek
oalabilir
Generasyon sresi 37Cda
logaritmik fazda yaklak22 dakikadr.
Aerobik ve anaerobik
olarak reyebilir
(rekombinant heterolog-
protein retiminde aerobik
reme)
Oksijen, retimde en
nemli snrlayc faktrdr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
43/163
Prokaryotik Biyolojik Sistemler
E.colidndaki dier prokaryotlar Acremonium chrysogenum
Bacillus brevis
Basillus subtilis, Basillus thuringiensis
Corynebacterium glutamicum Erwinia herbicola
Peudomonas spp
Rhizobium spp
Streptomyces spp
Trichoderma resei
Xanthomonas campestris
Zymomonas mobilis
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
44/163
Bu organizmalar iki grub altnda toplanabilir zel bir fonksiyona sahip bir gen iin konak olma
r: termofillerden izole edilen ve PCR teknolojisindekullanlan sya direnli DNA polimeraz enziminin E.colideklonlanmas ve retimin gereklemesi
Belirli ileri ok daha etkin yapabilmek iin genetik mhendisliiile gelitirilme
r: Endstriyel adan nemli amino asitlerin ok fazlaretilmesi iin Corynebacterium glutamicumun eitlitrlerinin gelitirilmesi
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
45/163
Cyanobacteria (mavi-yeil bakteriler)
r: Anabaena cylindris, Nostokmuskorum, Spirulina platensis
Mavi-yeil bakterilerprokaryotlar snfna dahil olupfotosentez zelliine sahiptir.
lk kez varlklar fosillerde
saptanmtr. Dnyaoluumunda belki de ilk canlorganizmalardr.
Tatl ve tuzlu sularnyzeylerinde bulunurlar.Karada ise n ve neminolduu amur ve kaya, tahta
veya baz canl organizmalarnyzeylerinde bulunabilirler. Koyu yeilimsi-mavi
pigmentlerinden dolay buisimle adlandrlrlar.
Anabaena flamentleri
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
46/163
Cyanobakterilerin yaps Hcre duvar yap ve
fonksiyon bakmndanGram(-) bakterilerebenzer.
Fotosentetiktirler. Klorofilve karotenoid pigmentlerlamella ad verilen hcre
yzeyi membrannda,fikosiyanin ve fikoeritringibi pigmentlerdefikobilisomlarda bulunur.
Fikobilisomlar tlakoidmemmran yzeyindebulunurlar
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
47/163
Fikosiyanin Yeil absoblar (615-620A).
Allofikosiyanin Turuncu absorblar (650-670A)
Fikoeritrin Yeil absorblar (495-570
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
48/163
Cyanobakterilerin yaps
AZOT FKSASYONU: Sadecebirka organizma atmosferik azotuamonyaa redklemek yoluylaa.a. ve proteinleri retmek zereorganik asitlere dntrlebilir.
Azot fikse edebilen bakteriler gibi
mavi-yeil bakterilerde byle biryetenee sahiptir. Hcreler nitrogenaz enzimi ile bu
reaksiyonu gerekletirirler. Buenzim oksijen ile inaktive olur. Bunedenle azot fikse eden hcreleriniindeki koullar anaerobikolmaldr.
Anabaena gibi baz mavi-yeilbakterler azot fiksasyonundansorumlu heterosit ad verilen zelkaln duvarl hcrelere sahiptirler.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
49/163
Heterositler hcre duvarlarnda bulunan zel bir por
aracl ile vejatatif hcrelere balanrlar. Bu porlar kmikroskobu ile grlebilirler. Anabaena flamentleri eker ve oksijen reten
fotosentetik hcrelerden olumutur.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
50/163
Birok flamentli mavi-yeil bakteri akinet veya
spor diyebileceimizolumsuz koullardadevamllktan sorumluolan hcrelerolutururlar. Bu hcrelerheterosit hcreye yaknolan vejatatif hcreler
tarafndan oluturulur.Hcre boyutunda artolur ve bykmiktarlarda besindepolanr. Gas vakuollerikaybolur. Bununsonucunda akinetler
suyun dibinde yllarcacanllklarnkoruyabilirler. Koullaruygun olduunda tekrarhzla blnerekoalrlar.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
51/163
Mavi-yeil bakterilerin biyoteknolojik nemi
M-Y bakteriler fotosentez yetenekleri, yksekprotein ierikleri ve basit besiyerlerinde hzloalmalar nedeniyle besin kayna olarakkullanm alanna sahiptir.Tek hcre proteini(THP) elde edilmesinde en ok denenengnmzde insan ve hayvanlarnbeslenmesinde geni uygulama alan olan mavi-yeil bakteriler, dier mikroorganizmalardan
farkl olarak yeterli miktarda karbondioksit, belirliderecede aydnlatma, geni retim ortam gibizel koullara gereksinim gsterirler.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
52/163
Spirulana
Sprilulina platensis: Afrika vegney Amerikada ki sgllerde doal olarak bulunur.Binlerce yldan beri yredekiinsanlar tarafndan toplanan bu
algler kurutulduktan sonrabesin kayna olarakounlukla sos eklinde veyaorba iinde kullanlmaktadr.
Nostocise Peru ve Gneydou Asya da besin maddesi
olarak kullanlan bir dier M-Ybakteridir.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
53/163
GBRE OLARAK: Mavi-yeil bakterilerinazot fiksasyon zellii saptandktan sonrakurutulmu Tolypthrix tenuis pirin tarlasnaserpildiinde azot fiksasyonunda veverimde art gzlenmitir. M-Y bakterilerinHindistan da pirin tarlalarnda gbreolarak kullanmyla topranhavalandrlmas sonucunda su geii vetopran scaklnn daha homojen olmassalanmaktadr. Azot fiksasyonu iin M-Ybakterilerin Rhizobiumlarn yerini
almasnn baz avantajlar vardr. Mavi-Yeil bakteriler havadaki azotu amonyumaredklerken fotosentez metabolik yolunukullanrlar. Yani bir bitki ile simbiyotik biryaam ve enerji kayna olarak herhangibir organik molekl ilavesi gerekmez.Tarmda azot fikse eden M-Y bakterilerorganik gbre olarak kullanlabilir. in,
Hindistan, Filipinler gibi pirin tketimi fazlaolan blgelerde byk oranlarda rerler.Pirincin byme sezonunun banda eersuya M-Y bakterilerin balang kltrleriekilirse pirin veriminde %15-20 oranndaart olduu bildirilmektedir.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
54/163
Mavi-yeil bakterilerin biyoteknolojik nemi
Aratrmalar Mavi-Yeil bakterilerin gne enerjisi dnm sisteminde yer almasiin devam etmektedir. Anabaena cylindrica heterocystleri vejatatif hcrelerdefotosentez yoluyla oluturduklar oksijeni dar verirler. Azot yokluunda iseheterositlerde nitrogenaz enzimi katalizrlnde elektronlarH+ iyonuna transferedilerek Hidrojen gaz aa karrlar. Oksijen ve Hidrojen her ikisi deendstride ihtiya duyulan gazlardr.
BYOLOJK OLARAK AKTF MOLEKLLERN RETM: Mavi-Yeil bakteriler antibiyotiklerin ve dier biyolojik olarak aktif molekllerin ticari
boyutlardaki retimi iin byk bir potansiyel olutururlar. nk Mavi-Yeil bakterilerheterotroftur. Bu zellikleri de onlarn fermentasyon koullarnda retilmelerine olanaksalar. Henz aratrma aamasnda olan Anacystis nidulans ile yaplan rekombinantDNA teknolojisi almalaryla nadir bileiklerin retiminde kullanmlaramalanmaktadr.
Sonu olarak : Fermentr koullarnda reyebilirler, uzun sreli fizyolojik stabiliteye, basit besingereksinimine, kpk oluturmama zelliine sahiptirler. Dier alglerden farkl olarakazot fiksasyonu yapabilme farkllna sahiptirler. Optimum scaklk 35oC dir.Karanlkta veya gn nda heterotrofik olarak rerler.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
55/163
Biyoteknolojide
Biyolojik SistemlerMayalar
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
56/163
Maya
Mayalar; tek hcreli karyotik
Tomurcuklanarakveya blnerekeeysiz
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
57/163
farkl eem tipine sahip hcreleriyle eeyli olarakoalabilirler
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
58/163
Mayalarn tanmlanmas maya biyoteknolojisi iinolduka nemlidir.
rnein endstriyel srelerde yabani ve kltreedilmi mayalar arasndaki fark gsterebilmekesastr.
Bira retiminde rnde istenmeyen aroma oluumunaneden olan yabani rkn karmas veya ekmek mayasretiminde eker transport yetenei daha fazla olanCandida utilis mayasnn karmas ekmek mayasretiminde kullanlan Saccharomyces cerevisiaemayasnn remesini engelleyecektir
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
59/163
Maya genuslarnn ayrmnda fizyolojik
testlerle birlikte morfolojik testler dekullanlr. Gnmzde 700 civarnda maya tr
tanmlanmtr. Fakat bu say maya eitliliindesadece ok kk bir blm temsiletmektedir.
Tanmlanmam maya genus ve trsays ok daha fazladr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
60/163
Maya biyologlar iin maya eitliliini
tanmlamak kadar dier nemli bir noktazellikle biyoteknolojik neme sahip trleribelirleyip saklamak ve koruyabilmektir.
Molekler biyoloji tekniklerinin yaklamyla
trler daha hzl ve kolay bir ekildekarakterize edilebilmektedir.
Gnmzde 6 mayann genom projesitamamlanm ve ilevsel genomik almalarile genlerin ilevlerinin belirlenmesine devamedilmektedir.
Maya hcreleri klorofil
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
61/163
Maya hcreleri klorofiliermez ve zorunluolarakkemoorganotrofiktirler
. remek iin organikkarbona gerekduyarlar.
Karbon metabolizmalar
ok eitlidir. rneinbasit ekerleri,polioller, organik ve yaasitleri alifatik alkoller,hidrokarbonlar veeitli heterosiklik ve
polimerik bileiklerikarbon kayna olarakkullanabilirler.
Bu zellikleri nedeniylefarkl habitatlar iinzellemi trlerkolaylkla saptanabilir.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
62/163
Mayalar toprak, hava vesudan izole edilebilirler. Bazmayalar ekstrem ortamlardarnein ozmofilik mayalareker bakmndan zengin
ortamlarda yaayabilirler. Butr mayalar genellikle gdabozucu olarak bilinir. Bunundnda frsat patojenolarak baz maya trleridernein Candida albicans pek
ok infeksiyondansorumludur.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
63/163
Mayalar insanlar iin; ekonomik, sosyal ve
salk asndan olduka nemli en eskievcilletirilmi organizmalardr. Alkoll ieeklerin retiminde, ekmek
yapmnda hamurun kabarmas iin binlerce ylncesinden beri kullanlmaktadrlar. Gerektebira yapm belkide dnyann ilkbiyoteknolojisini temsil etmektedir.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
64/163
Gnmzde mayalar geleneksel gdafermentasyonunun dnda ok eitli alanlarda
da kullanlmaktadr. zellikle genetik mhendisliiyle gelitirilmimayalar hastalklarn nlenmesinde vetedavisinde kullanlan pek ok farmastik
ajann retilmesinde yaygn bir ekildekullanlmaktadr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
65/163
Biyoteknolojik neme Sahip Baz Mayalar
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
66/163
Biyoteknolojik neme Sahip Baz Mayalar Axula adeninivorans
Candida trleri
Nitrat ve aminleri asimile eder, 45 Czerinde reyebilir, pek ok hidrolaz
salglayabilir.
C.albicans hidrokarbonlardanaminopenisillanik asit ve B6 vitaminretimi, C.boidiniiNAD, FAD metilketonlar ve sitrik asit retimi, C.famatariboflavin, C.maltosa biyoktle proteini iinya asiti ve alkan kullanm, C.tropicalistriptofan, C.pelliculosa sellozikmateryalden biyoktle proteini, C.utilis,
pek ok rn eldesi, ksilozda reyebilme,klonlama teknolojisinde kullanm,C.shehatae ksiloz fermentasyonu
Biyoteknolojik neme Sahip Baz Mayalar
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
67/163
Biyoteknolojik neme Sahip Baz Mayalar
Hansenula polymorpha
Kluyveromyces marxianus ve
K.lactis
Pachysolen tannophilus
Heterolog gen anlatm iinkullanlabilen metilotrofik maya
Laktoz ve polyfruktosanfermente eder. Doal kakao
fermentayonu. Pek ok enzimiin kaynak olabilir, klonlamateknolojisinde kullanlabilir.
Bitki lignosellozik
hidrolizatlarndan kaynaklpentoz ekerlerininfermentasyonu
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
68/163
Biyoteknolojik neme Sahip Baz Mayalar Phaffia rhodozyma ve Pichia
trleri
Rhodosporidium toruloides
Gda boyas olan astaksantin
pigment retimi.P.guilliermondiiriboflavinsentezi ve hidrokarbonlardanbiomas protein eldesi.P.methanolica etanol
biosensr olarak kullanlanalkol oksidazretimi.P.pastorismetanolden biomas proteineldesi, heterolog gen anlatm
ve insan teraptik proteinleriniretebilen metilotrofik maya
Fenilketanri tedavisindekullanlan PAL enzim kayna
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
69/163
Biyoteknolojik neme Sahip Baz Mayalar
Saccharomyces trleri
Saccharomycopsis
trleri
Schizosaccharomycepombe
S.cerevisiae klasik gdafermentasyonu. Bira, arap, ekmek,rom, cin yapm. Yakt, alkol, gliserol,invertaz ve hayvan besinikayna.Rekombinant DNA
teknolojisiyle saysz protein retimi.
S.fibuligera amilolitik maya.
Geleneksel Afrika alkoll bira yapm.araplarn deasidifikasyonu. Ykseketanol ozmotik tolerans.. Biyoktleprotein eldesi, heterolog gen anlatm
ve mutagenez testlerinde kullanm.
Schwanniomyces trleri S.castelliive S.occidentalis
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
70/163
y
Trichosporon cutaneum
Yarrowia lipolytica
Zygosaccharomyces rouxii
amilolitik mayalar. Niastannve inlinin etanole evrimi veheterolog gen anlatmndakullanlabilirler.
Fenol varlna ilikinbisensor olarak kullanlr.
Lipid ve hidrokarbonlardanbiomas protein eldesi. Sitrikasit ve hcred enzim
retimi. Japon soya sosu karakteristik
aromasn vermede kullanlanhalofilik ve ozmotolerant
maya tr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
71/163
Endstriyel mayalarn ou zelliklefermente ieeklerin retimindekullanlanlar genetik bakmndankarmaktrlar ve stabil bir haploidi
gstermezler.
rnein bira yapmnda kullanlanSacchoromyces trleri poliploid veya
anpliod (diploid-heptaploid) rklardr. Bunedenle gelitirilmelerinde eeyli remezelliklerinden yararlanlamaz.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
72/163
Bunun yerine klasik bira tadn veren
organoleptik zellikleri iyi olankarakteristik fermentasyon yapanrklardan doal seimle en iyi olaneilir.
Bunun dnda endstriyel mayalarngelitirilmesinde phesiz genetik
mhendisliinin nemi oldukafazladr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
73/163
Rekombinant DNA teknolojisi ilegelitirilen rekombinant mayalartarafndan retilen biyolojik olarak
aktif rekombinanat proteinlerinveriminin arttrlmasnda iki nemliyaklam vardr:
molekler genetik tekniklerin kullanm fermentasyon teknolojisi.
Gda Tzne Uygun Genetik Olarak
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
74/163
Gda Tzne Uygun, Genetik OlarakDeitirilmi Mayalar
Maya Ekmek Mayas
Bira Mayas
Tanmlama Glukoz basksndan
kanmak vehamurlamay nlemek
iin maltoz kullanmgenleri deitirilmi.
Maltodekstrinleri ksmiolarak paralayan STA2genini ieren plazmiditar.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
75/163
Alkoll ieeklerin retiminde mayalar
Alkoll ieeklerin retimi tarih olarak okeskidir. Gnmzde maya fermentasyonu pekok lkenin ekonomisi iin olduka nemlidir.
Bira retimi bilinen en eski biyoteknolojiksretir. Bira dnda arap distillenmiiecekler cider, sake ve eitli likrler
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
76/163
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
77/163
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
78/163
Baz alkoll eceklerin retim zeti
Bira Viski arap Likr ve dier ikiler
Hammadde Arpa,yardmcmaddeler
Arpa,buday vb.
zm Arpa, msr, melas,zm vb.
n
uygulama
Maltoluturma,
ezme
Maltoluturma,
ezme
Paralama,yumuatma
Substrata bal olarakdeiir
Fermentas
yon
S.cerevisiae,
S.carlsbergen
sis
S.cerevisiae S.cerevisiae S.cerevisiae,
K.marxianus
Damtma Hayr Evet Hayr Evet
Olgunlama Haftalarca Yllarca Yllarca Deiken
Son alkol
oran (%
v/v)
3-6 40-45 8-12 35-45
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
79/163
Biyoalkol retimi
Etanoln yenilenebilir kaynaklardan mayalar kullanarakretilmesi tm dnyann ilgisini eken konulardanbiridir.
lk retim 1930larda balamtr fakat petrolfiyatlar drlnce teknoloji braklmtr.
1970deki petrol krizi ile birlikte yeniden gndemegelmitir.
Brazilya eker kamn ve melas substrat olarakkullanarak rettii petrol yakt amalkullanmaktadr. Brazilyada otomobillerin ou alkol
veya alkol+benzin karm (gasohol) ile almaktadr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
80/163
Genetik mhendislii ile gelitirilmi mayalarnlignosellozik (odunsu) atklar substrat olarak
kullanarak etanol retmeleri ynnde younalmalar yaplmaktadr.
Etanol dnda mayalarn rettii dier
biyoalkoller gliserol ( alkoll iecekler iin aroma katc,nitrogliserin trevli patlatclar yapmnda),
ksilitol (eker yerine diyabetik rnlerin yapmnda), sorbitol, arabinitol (dk eker ierikli gdalarn
yapmnda; ilalarn kaplanmasnda yenilebilir kaplamamaddesi olarak)
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
81/163
Lignosellozik Materyallerden Etanol retimi
Lignosellozik
Materyaln Hidroliz
Hidroliz
Heksozca Zengin
Fermentasyon
Damtma Etanol
Pentozca Zengin
Fermentasyon
Lignin
Yakt Amal Etanol reten Mayalarda stenen
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
82/163
Yakt Amal Etanol reten Mayalarda stenenzellikler
Genel zellikFermentasyon
reme
rneklerHzl fermentasyon, yksek oranda etanolretimi. Yksek etanol tolerans.Fermentasyon iin optimum yksek scaklkve dk pH. Substratlarn etkin kullanm.Kk lekte fermentasyon metabolitleri.(Gliserol, esterler vb.)
Hzl maya retimi. Yksek oranda canll
srdrme. eitli etkenlere kar tolerans.(Yksek eker ve toksik kimyasallar)Genetik kararllk. Bakterikontaminasyonuna diren. Fermentasyon
srasnda en az s retimi.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
83/163
Maya biyoktlesi trevli rnler
Ekmek mayas olarak S.cerevisiae yldamilyonlarca ton retimektedir.
Bunun dnda;
hayvan yemlerine katk olarak tek hcre proteinieklinde, biyosorbent olarak ar metal temizliinde, gda renklendirilmesinde pigmentli mayalar, insan ve hayvanlar iin probiyotik olarak (byme
faktr/biyofarmastik amal) maya biyoktlesikullanlmaktadr.
Maya Biyoktlesinin Endstriyel Kullanmlar
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
84/163
M ay a rn Tip i Ku llan m rn ek le r i
T m Hcre rnler i
Sktr lm Ekme k M aya s /Aktif Kuru M aya
M aya Krem i
TekHcre Proteini
Byme Faktr
Reaktant mayalar
Biosorben t mayalar
M ineral mayalar
Kozmetik maya lar
Boyar madde mayalar
Biyolojik kon trol mayalar
Kirlilik kontrol mayalar
Ekmek,bira ,arap ve da mtma
Ekmek ve da mtma
Hayvan bes in i
nsan ve hayvan p robiyotii
Organik kimyada kullanlanbiyokatalistler
Ar metal artm
Besinsel iz element kayna
Deri solunum faktr
Gda bo yalar
Ziraatt e antifun gal ajan
BOD indirgeyicileri
ztlen mi Hcr ernleri
M aya ztleri
M aya RNA trevler i
Hcre maya duva r
M ay a-B vita min i ko mpleks leri
M aya enzimleri
Reko mb inan t maya lar
Besin ku llan m vemikrobiyo lo jik besiye ri
Aroma kuvvetlendiricileri vefarmastik kullanm
Yiyecek ve farmas tikkullanm
Kaps ller ve bes ins el des tektabletleri
Yiyecek lerde inver taz velaktaz kullanm
Terap tik protein ler
S.cerevisae Dndaki Maya Biyoktlesinin
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
85/163
y yBiyoteknolojik Kullanm
MayaKluyveromyces marxianus veK.lactis
C.utilis
Phaffia rhodozymaSaccharomyces boulardii
Pichia pastoris ve H. Polymoroha
Yarrowia lipolytica ve C.paraffinica
Rhodotorula glutinis,Lipomyces
lipofer,Cryptococcus curvatus
ve Candida trleri
Biyomas KullanmHayvan besini. Laktaz kayna
Tek Hcre Proteini
Karoten pigmentiBioteraptik ajan
THP ve metanolden rekproteinler
Alkanlardan Tek Hcre Proteinieldesi
Ucuz karbon kaynaklarndan TekHcre Ya Eldesi
Tm Hcre Maya Kitlesinin Yeni Kulanm
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
86/163
Tm Hcre Maya Kitlesinin Yeni KulanmAlanlar
Uygulama
iftlik Hayvanlar remeFaktr
Yorum
Gevigetirenlerde hayvanbymesini ve st verimini
arttrmak iin ikembeblgesini stabilize edenS.cerevisiae kullanlr.Mayalar ikembedeoksijensiz ortam salayarak
oksidadif hasar engeller.kembedeki yararlbakterilerin remesini, malikasit gibi maddeleri retereksalarlar.
Biyoteraptik ajan S.cerevisia anti akne ajan vet i
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
87/163
Kimyasal Reaktant
Besin pigmenti
menstrasyon ncesi argideriminde, S.boilardiibazince barsak hastalklarna
kar koruyucu ajan olarak veanti Candida ajan olarak dakullanlr.
Organik kimyaclar
S.cerevisiaeyibaz kimyasalmaddelerin modifiyeedilmesinde kullanrlar. Bureaksiyonlarn bazlarendstride rutin kullanm alan
bulmutur.Phaffia rhodozyma baz deniz
mahsllerinde renklendiriciolarak kullanlan pigmentler
retir.
Biyokontrol ajanS.cerevisiae tahlrnlerinde fitoalleksin
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
88/163
Biyokontrol ajan
Biyoremediyasyon ajanlar
Biyosensr
Biyoelektriksel yakt hcresi
rnlerinde fitoalleksinelisitr olarak kullanlr.Birka maya tr fungalmeyve hastalklarnn
biyokontrolnde kullanlr.
Baz mayalar endstriyelatklardan Ag, U, Co, Cu,Cdgibi ar metalleri temizler.
Organik atklardan karbon venitrojenleri uzaklatrr.Herbisit gibi zararl toksiklerietkisizletirir.
S.cerevisiae ortam kirliliitest etmede biyosensrolarak kullanlabilir.
Elektron reten maya destekli
yakt hcreleri ve maya
Maya Kkenli Enzimlerin Kullanm
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
89/163
y
Substrat Enzim
Niasta w-Amilaz,glukoamilaz
Sukroz nvertaz
nlin nlinaz
Uygulamalar
Niasta atklarnndnmyle bioetanol vebiomas retimi. Dkkarbohidratl bira yapm.
Maya invertaznn tekstilendstrisinde sukrozhidrolizinde kullanm.ikolatayapmnda inert eker eldesi
Kluyveromyces trleri, etanol veyksek fruktozlu uruplarn eldesinde,polifruktan ve levanlarn hidrolizinde
etkili inlinaz enzim kaynadr.
Laktoz Laktaz Kluyveromyces trleri stteki laktozunparalanmasnda ve gnlk atklardan
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
90/163
Yalar Lipaz
Selloz
Yar selloz Sellaz vb.
paralanmasnda ve gnlk atklardanetanol ve biyomas protein eldesindekullanlan laktaz kaynadr.Laktazyiyecek ilemede de kullnalr.Kluyveromycesteki ilgili genlerS.cerevisiaede klonlanmtr.
Hazm kolaylatrc,tat modifiye edicieldesinde ve yalarnesterifikasyonunda trigliseritlerdenserbest ya asidi ve gliserolsalanmasnda lipazlarn kullanm.
Sellobiozun fermentesinde bazmantarlar, ksilanlarn paralanmasndabaz mayalar kullanlr. Kimi genlerS.cerevisiaede klonlanmtr veyenilenebilir bioktledenbioetanol
retiminde kullanlmaktadr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
91/163
Mayalarn Biyomedikal Alanlarda Kullanm
onkoloji, farmakoloji,
toksikjoloji, viroloji insan genetik hastalklariin model organizma olmalar ok nemlidir.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
92/163
2001 Nobel Tp ve Fizyoloji dl
Maya hcre blnmesinin kontrolu ve kanser Leland H. Hartwell
R. Timothy Hunt
Paul M. Nurse
Mayalara Klonlanm Baz Teraptik Proteinrnekleri
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
93/163
rnekleriDNA Kayna
Prokaryotik
Viral
Protozoal
Hayvan
nsan
Gen rn rnekleriTetanoz toksin fragment C;
Herpes,Hepatit,Onkogenik vb. bazvirslerden yzey antijeni ve enzim kodlayangenler.Malarya antijeni
Slkten hirudin,engerektenekhistatin,tavan E-globin,sr ve fareinterlkini vb.nslin,paratiroid hormon, somatostatin, bymehormonu, ilevsel antijenler ve IgE faktr,inslin benzeri byme faktr, tmr nekroz vesinir byme faktrleri, interferonlar, hemoglobin,faktr 8 ve11, albumin, fibrinojen, Superoksitdismutaz,w-amilaz, gastrik lipaz vb..
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
94/163
Maya genomik ve poroteomikalmalarnn tamamlanmasyla pek
ok insan genetik hastalnntansnn konmas ve tedavisi yaknbir gelecekte gerekleecektir.
Maya Endstrisinde
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
95/163
Maya Endstrisindekillerldrc Faktrler
Endstriyel mayalarn bazlarnda virusa benzeyen ift iplikli RNAlartarafndan sentezlenen toksik bir molekl (proteinaceous), bumolekle sahip olmayan mayalar iin ldrc etki gsterir.
Bu faktrlerin varl zellikle biraclk endstrisinde ok bykskntlara neden olmutur.
ldrc maya sular bira oluumunu tamamen durdurmakta vebiraya kt bir tat kazandrmaktadrlar.
Fermentasyon sektrnde steril olmayan tip ak fermantasyonyapld iin arzu edilmeyen maya trleri sisteme girebilmektefermantasyon verimini ve rn kalitesini bozmaktadr.
zellikle killer plazmid tayan maya trlerinin sisteme girmesidurumunda killer toksinine hassas balang kltr zarar grmekte,
nemli lde verim kaybna ve rn kalitesinin dmesine nedenolabilmektedir.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
96/163
Bu problemin en mantkl zm iseyabanc organizmalarn toksinlerinebaklk kazanm bir maya tr
oluturmaktr. Arzu edilmeyen maya trleri tarafndan
olaabilecek bir kontaminasyonu nlemekamacyla molekler biyoloji teknikleri
kullanlarak killer plazmid ieren bir ekmekmayas kltr gekitirmek mmkndr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
97/163
Kfler
Kfler hifli mantarlardr. Birok organizma ve gda maddesi ( ekmek,meyve, sebze.. vb) zerinde oluturduklar pamuk grntsndekidoku nedeniyle mayalardan ok daha nce kefedilmilerdir.
Kfler, endstride bir ok rnn eldesinde, atklardan deerlirnlerin oluturulmasnda kullanlan farkllama gstermeyen veklorofil iermeyen mikroorganizmalardr. Doada ve toprakta yaygn
olarak bulunan kflerden endstriyel mikrobiyoloji alannda nemtayanlar mikroskobik olanlardr. Kflerin redikleri ortama proteaz, lipaz, karbonanhidrazlar gibi litik
enzimleri salglamalar ve kflerin rettikleri eitli metabolitlerinbirok alanda kullanlabilir olmas bu organizmalarn endstridekinemini olduka artrmaktadr.
Ayrca insan, hayvan ve bitkiler iin patojen olan trleridebulunmaktadr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
98/163
Kflerin Biyolojisi
Bir kf, protoplazmaiplikleri veya uzantlarolan hiflerden vesporlardan oluur.
Hiflerin yapt yumamisel ad verilir. Hifler,blmeli hifler ve blmesizhifler olarak ikiye ayrlr.
Blmeli hifler blmeler ile
hcrelere ayrlrlar ve herhcrede bir veya iki hcreekirdei bulunur.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
99/163
Blmesiz hiflere snositik hifad da verilir. Blme iermezler ve ok ekirdeklidirler. reme hifleri genellikle koloninin yzeyinde
bulunan ve reyen hcreleri veya sporlar
tayan hiflerdir. Hifsel reme ortamn besin koullar ile yakndan
ilgilidir. Beslenme hifleri ise koloniye besin salayan
hiflerdir. Beslenme hifleri sayesinde hcreninbulunduu noktadan uzakta olan substratlaraulamalar salanr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
100/163
Kflerin hcre duvar glukan, kitosan ve kitin gibifarkl glukoz polimerlerinden yaplabilir.
Birka rnekte hcre duvarnn sadece kitindenolutuu bilinmektedir. Ayn zamanda hcreduvar % 80 90 polisakkarit polimerleri deierir. Geri kalan byk bir ksm ise protein velipidlerden oluur.
Hifler u hcrelerin gelimesi sonucu apikal
byme ile veya blmeli hiflerde olduu gibiapikal byme ve hifin herhangi bir blmndekihcrelerin blnmesiyle geliir ve uzarlar.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
101/163
KFLERN YAAM EVRM
ok hcreli kflerin yaam evrimi eeyli veya eeysiz sporlarlaolabilir. eitli cins ve trlerde farkl detaylara sahip olmakla berabergenel zellikleri bakmndan benzerlik gsterilir.
Baz eeysiz sporlar, sporangioforad verilen zel bir hif uzantsnnucunda bulunan sporangium denilen kapal bir yap iinde oluurlar.
Bazlar ise konidioforad verilen zel hiflerden oluarak konidium
adn alr. Dier eeysiz spor biimi ise klamidospordur.Klamidospor genellikle vegetatif hcreden geliir, kaln duvarldr veuygunsuz koullara dayankldr.
Eeysiz remede rzgarla dala konidialar, miselyumunoluturduu konidioforlarn ularnda meydana gelir. Konidialarnimlenmesiyle vejatatif reme devam eder.
Kfl d li
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
102/163
Kflerde eeyli reme
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
103/163
Endstriyel nemi Olan Kflerin Snflandrlmas
Ascomycetes : Mayalarda olduu gibi sporlarnaskus keseleri ierisinde olutururlar. Bununlaberaber filamentli mantarlarda askuslar
kompleks bir yap olan ascocarp iinde oluurlar.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
104/163
Basidiomycetes grubu kfleri eeyli sporlarbasidia, basidiocarp iinde gelitirirler. Hcreeperleri glukan ve kitinden oluur. Agaricustrleri insanlar iin endstriyel mantar tketimine
cevap vermek zere retilir.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
105/163
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
106/163
Deuteromycotina: Bugruptaki kflerde eeylireme yoktur. Sadecekonidia olarak bilinen
eeysiz reme yaplarylarerler. Hcre eperleriglukan ve kitinden oluur.Bu gruba giren en nemliendstriyel kflerAspergillus vePenicillumdur.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
107/163
A. nigersitrik ve glukonik asit retimde kullanlr. A. oryzae pirin ve soya rnlerinin fermentasyonunda (
besin endstrisinde) , proteolitik ve amilolitik enzimlerinretilmesinde kullanlr.
Baz trleri ise bitkilere rnein pamua patojen etkiyesahiptir. Fndk veya fstk zerinde reyen A. flavusinsan ve kmes hayvanlarnda karacier kanseriniindkleyen etkiye sahip B1 mikotoksinini retirler.
Mitotoksinler genelde kk molekl arlkl, insan ve
hayvanlara kar toksik olan kflere ait metaboliklerdir.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
108/163
Endstriyel kflerden en ok zerinde allanPenicillum trleridir.
Her eit organik materyal zerinde reyebilen sporlarhavada sporofit olarak bulunur.
P.griseofulvum griseofulvin retiminde kullanlr. Bumadde deri ve trnaktaki mantar tedavisinde kullanlr.
Griseofulvine duyarl mantarlarda antibiyotik,mikrotubullerdeki tubulinin oluumuyla ilgili proteinebalanarak mitozda kromozomlarn ayrlmasn ve hifselremeyi durdurur.
Penicillumun dier trlerinin birou besin endstrisindenemlidir. rnein P. camemberti, P.roquefortiisimleriyle anlan peynirlerin yaplmasnda kullanlr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
109/163
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
110/163
Bu grubun endstriyelkfleri Mucor ve Rhizopustur. Rhizopus migricanssitrik asit retimindekullanlr. Mucorise daha
nce anlatld gibi peyniryapmnda kullanlan renninretimnde kullanlmaktadr.Mucor pussillus ve Mucormieheiden izole edilen asitproteazlar st proteinikazeindeki peptid banparalayarak kazininkmesine neden olur.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
111/163
Normal doal koullar altnda mantarlareeysiz olarak oalrlar. Eeyli reme isesadece uygun artlar altnda nadiren
olabilir. Kflerin endstriyel retimi ise zelolarak tasarm yaplm sadece miseloluumuna izin veren yatay tanklarda
yaplr.
Kfl i ttii d t i l l d b l
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
112/163
Kflerin rettii endstriyel rnlerden bazlar
Antibiyotikler
Sitrik asit
eitli peynirler ; Rokfor, camembert, briepeynirleri gibi
Sake (Japon ikisi)
Soya fasulyesi sosu ve dier baz soslar eitli enzimler ; Amilaz, Glukoaminaz, Sellulaz,
Pektinaz, Proteaz, Mikrobiyal rennet gibi
Protist
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
113/163
Protist
Protistler (protozoa) neminbulunduu yerlerde, tuzlu ve tatlsularda ve toprakta bulunurlar.
Simbiyotik ve parazit trlerininyan sra serbest yaayan trlerdebulunmaktadr.
Bazlar ototrofik, dier bazlarsaprofit, bir grup ise heterotrofiktir.
Besin maddelerinin sindirimisitoplazmadaki besin vakuolleriiinde olmaktadr.
Gaz deiimi hcre zarndandifzyon yoluyla olmaktadr.
Hcre metabolizmasnn sonucuoluan atklar hcreden difzyonlaatlr.
Biyoteknolojik nemleri
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
114/163
Biyoteknolojik nemleri
Siliatlarn bir ou saprofittir. Ve organik atklarn geri dnmndeolduka byk neme sahiptir.
Paramecium ve Chlorella
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
115/163
Protistlerin baz trleri vitaminzellik B12 ve E vitaminlerini retirve reme ortamna salglarlar.
Sahip olduklar pigmentleri iseendstride bir ok kullanm alanmevcuttur. r: Karatenoidleryiyeceklerin renklendirilmesinde
yumurta sarsnn veya somonbalnn renginin artrlmasndayemlere katk maddesi olarak ilaveedilir.
Chlorella ve Dunaliella Phytol (Fitol) bir baka potansiyel
endstriyel rndr.
Vitamin A, F Karoten vit E ve Ksentezinin ncl maddeleri olarakkullanlabilir.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
116/163
Protisler amino asit retiminde de nemlibir role sahiptir. Aminoasitler ise besinendstrisinin en nemli katk
maddelerinden birini oluturur. Ayrca ok nemli karbonhidratkaynadrlar. Besin kayna olarakkullanlmalarnn yan sra mikrobiyal
transformasyonlar iin rnein etanol vemetan retimi iin kaynak olutururlar.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
117/163
Alglerin polisakkarit retimi bir bakanemli retim alann oluturur.
Baz alg- polisakkaritlerinin potansiyel anti-
kanser aktivitesi olduu da bilinmektedir. Polisakkaritler younlatrc ajanlar olarak
kullanlr. Polisakkaritin ticari retimindePorphyridium cruentum fazla miktardaekstraselller polisakkarit retme zelliiile kullanlr.
karyotik Hcre kltrleri
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
118/163
karyotik Hcre kltrleri
Bcek,memeli ve bitki hcre kltrleri iin ayrntda farklama temelde ayn yaklamlar ve yntemler kullanlr.
ncelikle kk bir doku paras organizmadan ayrlr. Hcreleri birarada tutan hcre d matriksin enzimler
kullanlarak paralanmasyla hcreler serbest durumagetirilir. Bitki hcreleri iin hcre duvarn paralamak iin ek bir
enzim daha kullanlr. In vitro hcre blnmesini engelleyen hcre d matriksten
uzaklaan hcreler amino asitler, antibiyotikler, vitaminler,tuzlar, glukoz ve reme faktrleri ieren karmak bir besiyeri zerine yerletirilir.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
119/163
Bu koullar altnda hcreler kltr kabnnyzeyini tek tabaka eklinde kablayncayakadar blnrler.
Bu noktada hcre blnmesi hcrernekleri toplanmadan, seyreltilmeden veyeni bir kltr kabnn iinde yeni bir kltr
kabna aktarlmadka durur.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
120/163
Genellikle balang (primer) hayvan hcre kltrleri aktarlr ve 50-100 generasyon hcreler blnme yeteneini kaybeymeden velmeden korunabilir.
Primer hcre kltrnn hcreleri orjinal hcre tipinin bazzelliklerini korur.
Bu nedenle eitli dokularn biyokimyasal zelliklerini almak
mmkn olmaktadr. Sklkla primer hcre kltrlerinin pasaj srasnda hcrelerin
bazlarhcre kltrnde oalmay kolaylatran genetikdeiiklikler geirebilir
Avantaj ynndeki bu seicilie sahip hcreler in vitro reyerek bellihcre hatlarnn olumasna neden olur. Kurulan hcre hatlar kk
lekte viruslar korumak ve klonlanm DNA tarafndan retilenproteinin saptanmasnda, byk lekte ise alarn ve klonlanmgenlerin kodlad proteinlerin retiminde kullanlr.
Memeli Hcre Kltrleri
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
121/163
Memeli Hcre Kltrleri
Baz memeli proteinlerinin yabanc birorganizma ierisinde retilmesi mmkndeildir.
Dier bilimsel ve ekonomik nedenlerle bu
proteinlerin retiminde Memeli Hcre Kltrlerikullanlmaktadr. r:Monoklonal antikorlar Neden: nk monoklonal antikorlarn
transkripsiyon ve translasyon dzeylerindekisentez ve reglasyonlar olduka karmaktr. Bu
tr proteinler gelecekte tedavi ve analitikuygulamalardaki nemlerinden dolay oldukageni almalara konu olacaklardr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
122/163
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
123/163
GELENEKSEL
BYOTEKNOLOJ
arap Yapm
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
124/163
arap Yapm
arap zmn d tabakasnda bulunan yabanimayalar kullanlarak yllar ncesinden beriyaplmaktadr.
Farkl maya rklar arabn o blgeye aitkarakteristik tad ve aromasn vermek zere oorafik alan iin zel olarak seilir.
Gnmzde ou modern arap reticileri kendizgn maya rklarn zelliklerine gre seiminiyaparak kltrleyip saklarlar.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
125/163
Toplanan zmler ra haline getirmek zere paralanr. Geleneksel olarak zmler n ilemden geirilmez.
Sadece Kaliforniada sfr dioksit etkisinde braklarakyabani mayalar ldrlr.
zmn d tabakasnda bulunan yabani mayalarradaki ekerin fermentasyonunu salar. Saccharomyces cerevisiae var. ellipsoideus. Bu deiimi
gerekletiren baskn olan mayadr. Fermentasyon gnlerce srer.
Krmz ve beyaz zmlerden elde edilen ralar krmzve beyaz araplar oluturur.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
126/163
Krmz araplar zmn d kabuu ilebirlikte fermente edilir.
ekerler etanol ve karbon dioksite
dntrlrken etanol kabuktakipigmentleri znr duruma getirir vekrmz arap oluur.
Beyaz arap iin d kabuk uzaklatrlr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
127/163
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
128/163
Bira Yapm
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
129/163
Bira Yapm
Bira malt haline getirilmi (imlendirilmi) arpadan yaplr Malt yapmak iin arpa taneleri su ierisinde 2-3 gn bekletilir daha
sonra szlr 13-17 C 10 gn bekletilir. Bu ilem depo niastann maltoza
dnmesi iin gerekli olan amilazn retilmesiyle imlenmeyibalatr.
Scakln 40-70 Cye karlmasyla enzimler denature edilir veimlenme durdurulur.
Tanelerin kavyrulma scaklna gre farkl renk ve tadda malt oluurbunun sonucunda da farkl renk ve tadda bira oluur
Taneler silindirler arasndan geirilerek paralanr. 62-68 C de su eklenip 2 saat bekletilir. Bu ilem ekerin malttan
ayrlrak zlmesine yardmc olur Sv byk bir kaba aktarlr (atk taneler hayvan yemi olarak satlr)
ve biran karakteristik tadn veren erbetci otu (Humulus lupulus)eklenir
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
130/163
Az miktar eker eklenerek birka saat kaynatlr erbetioyundan ayrldktan sonra fermentasyon iin uygunscakla getirilir
Fermentasyon tankna Saccharomyces cerevisiae ve S.calsbergensis ilavesiyle fermentasyon balatlr.
20 C de 5 gn sren fermentasyon sonucunda (etanolve karbon dioksit oluumu) mayalar uzaklatrlr ve
Marmamite olarak adlandrlan maya zt olarak besinendstrisinde kullanlr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
131/163
Olgunlamasrecinden (haftalarbazen aylar) sonrabira santrifj edilirekatklardanuzaklatrlr ve uygunieleme
ilemlerinden sonrasata sunulur
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
132/163
Arpa taneleri
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
133/163
Arpa taneleri
Malt oluumu iin taneleri slatma
Ezme ilemi
erbeti otu
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
134/163
EKMEK YAPIMI
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
135/163
EKMEK YAPIMI
Gnmzde ekmek yapmnda eitli tahllardan eldeedilen unlar kullanlmaktadr.
lem un, su, tuz ve maya karmn kapsar (bazeneker ilavesi de gerekebilir)
Undaki enzimler (amilazlar) niastay maltoza ve glukozahidroliz ederler. Mayalar ekerleri etanol ve karbon dioksite dntrrler Karbon dioksit ekmein kabarmasn salar Ekmein yapsn undaki proteinlerin zellikleri belirler. Genel olarak gluten olarak adlandrlan proteinlerin
toplam kaliteli ekmek iin %10-14 biskvi yapm iin%10dan az olmaldr.
Ekmek Mayas retimi
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
136/163
Ekmek Mayas retimi
Yourt Yapm
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
137/163
Yourt Yapm
Yourt yapmnda st,yar st tozu veya tamamen st tozukullanlabilir.
St ncelikle patojen mikroorganizmalar iin kontrol edilir. St 85-95 C de 15-30dk stlr.
n ilemleri ve stlmas tamamlanan ve 43-45 C yesoutulan ste %2-3 orannda yourt bakterileri eklenir. Ayn sda yourtlama kaplarnda bir sre beklenir. Yourt bakterileri ortaklaa olarak stteki laktozu
paralarlar ve laktozdan laktik asit oluturarak stn
ekiliini artrrlar asiditenin artmasyla stteki kalsiyumkazeinat kolloidal durumunu koruyamaz znerek jel
haline geer ki buna yourtlama denir.
Yourt Yapm
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
138/163
Yourt Yapm
Kullanlan mikroorganizmalar: Fakltatif anaerop Lactobacillus hcreleri Gram(+) omaktrlar.
Kompleks reme faktrlerine gereksinim duyarlar. Asite kartolerans gsterirler. Fermentasyon sresince den pH'ya karbakteriler remeye devam ederler. Bu zellikleri onlara ortamdaseici olmalarn salar.
Lactabacillus dnda laktik asit retiminde kullanlan bir dier cinsStreptococcus'tur. Streptococcus Gram(+) ve kok morfolojisinesahiptir.
Yourt yapmnda her iki tip bakteride kullanlmaktadr. Lactabacillusproteinleri paralayp peptitleri aa karr. Bu sonuStreptococcus thermophilus un remesini indkler. Streptococcusrerken methanoik asit retir. Bu da Lactobacillusun remesiniindklemektedir. Her ikiside ok az oranda alkol retmektedir.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
139/163
Yourt istenen kvam kazannca soutularak lkortamda alan bakterilerin aktiviteleri nlenir .
Bu ilem ne kadar abuk olursa asitlik gelimesiaz olacaktr.
Soutma sresinde de asiditenin artmas gznne alnarak inkbasyon sresi ksatutulmaldr.
Son yllarda retimi yaplan "Bio yourt" ise dahatatl ve kremsi tatdadr. retiminde bu iki grupbakteriye ilaveten L.acidophilus da oluan asidiktad uzaklatrmak iin kullanlr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
140/163
Probiyotik yourt: Probiyotik kltrlerbarsak yzeyine tutunarak oalr vebarsak florasnn dengelenmesine
yardmc olur. Lactobacillus johnsonliprobiyotik zelliklerinden dolay yourtyapmnda kullanlmaktadr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
141/163
Laktik asit ayrca ilk mikrobiyal rn olarakretilen organik asitlerden biridir.
Eki ve kokusuz bir maddedir. Su, alkol ve eterle kolaylkla karabilir.
Kloroformda znmez. Erime noktas dktr. yi zc zelliklerine sahip zayf bir asittir. Kolaylkla polimerleebilir.
Bu zellikleri nedeniyle geni bir kullanm alanvardr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
142/163
Besin maddelerinin korunmas amacylaasidite salar.
Kalsiyum laktat pasta yapmnda kabartma
tozu olarak, bakr laktat ise elektrokaplama ilerinde geni olarakkullanlmaktadr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
143/163
ki tip laktik asit bakterisi bilinmektedir.Heterofermentatifve Homofermentatif.
Heterofermentatiforganizmalar ok sayda yan
rn oluturduklar iin endstriyel boyutlarda kiretimler iin uygun deildir.
Homofermentatiforganizmalar ise ok azistenmeyen yan rn oluturan buna karlk
laktik asit retimi fazla olan organizmalardr.
Teoride bir glukoz molekl bana iki molekl laktik asitve iki molekl ATP oluur.Gli ld hit 3 f f t d hid d NAD+
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
144/163
Gliseraldehit-3-fosfat dehidrogenazdan NAD+redksiyonu ve laktat dehidrogenazla prvat
redksiyonundan geen NADH oksidasyonu sonuculaktik asit oluur
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
145/163
Endstriyel laktik asit retimi iin en okkullanlan mikroorganizma Lactobacillusdelbrueckii olup zellikle msr glukozu ierenortamlarn fermentasyonunda kullanlr.
L. bulgaris karbon kayna olarak laktozufermente eder ve peynir alt suyunda laktatretiminde kullanlr.
L. petosus pentozlar kullanabilmekte olup sfitatk svsndan laktik asit retiminde elverilidir
Peynir Yapm
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
146/163
y p
Peynir stteki proeinin kelmesiyle yaplan eneski st rnlerinden biridir.
Stn kaynana, olgunlamada ve ileriaamalarda kullanlan yerel yntemlere bal
olarak farkl tat, renk ve yapda yzlerce farklpeynir eidi bulunmaktadr. Pernir yapmnn ilk aamalar yourt yapmna
benzer. Stteki proteinin koaglasyonu (st kesii)
Peynir alt suyunun uzaklatrlmas Olgunlama
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
147/163
St 72 C de 15 saniye stlr Hzla 31 C e soutulur ve peynir tankna geirilir Laktik asit bakterileri (Streptococcus lactis, S. cremoris
ya da zel bir tada zg bir tr) eklenir
Laktozun laktik asite dnm st proteinlerininkoaglasyonu Daha ileri dzeyde st kesiinin oluumu iin kimozin
(%90) ve pepsin (%10) enzimlerinin karm olan renneteklenebilir.
45 dakika sonra st kesii svsndan (peynir alt suyu)uzaklatrlr
eitli olgunlama ilemleri
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
148/163
Evaporasyon: Sttem suyunuzaklatrlmas
Kontrol odas
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
149/163
Peynir tankna bakteri
kltr eklenir, renklenme
gerekleir ve st kesii
oluur
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
150/163
St kesii ve peynir alt suyu szmetablalarna geirilir.
Peynir alt suyu ayrlrkartrma ilemiylest kesiklerinin boyutlarnn ayn olmassalanr Bu aamada tuz eklenir.
Sirke Yapm
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
151/163
p
Meyve sular ve meyve ezmelerindenasetik asit eklinde sirke retimi ok uzunyllardan beri yaplmaktadr.
Romallar devrinde sulandrlm sirkeferahlatc iecek olarak kullanlrd. arap
flarnn aznn ak braklmasyla sirkeoluturulurdu. Daha sonralar teknikleringelitirilmesiyle sirke retimi artrld.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
152/163
ekerli meyvelerden sirke yapmndabirbirinden tamamyla farkl ikifermentasyon ilemi yer alr.
1.Alkol fermentasyonu 2.Asetik asit fermentasyonu
nce meyve ve zm ralarndaki ekeralkole dndrlr. Bunu salayan
mayalardr. Sonra oluan bu alkol sirkebakterileri asetik asite dntrlr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
153/163
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
154/163
Asetik asit fermentasyonu balamadan alkolfermentasyonu bitmi olmaldr.
Sirke bakterileri havann oksijeni yardmylaalkol okside ederek asetik aside evirir.
Kimyasal bakmdan asetik asit fermentasyonubir oksidasyon (dehidrogenasyon) olaydr.
Asetik asit retimi bir ok fermentatif bakteritarafndan yaplmakla beraber ticari olarakretimde zel bir grup bakteri "asetik asitbakterileri" kullanlmaktadr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
155/163
Asetik asit bakterileri iki grup altnda toplanabilir. Glucanobacterler
Asetobakterler Asetik asit bakterileri Gram(-) genelde omakfakat deien morfolojiye sahip asite toleransl,aerop kirpikli bakterilerdir.
A. pasteurianus, A.aceti ve A. peroxidans sirke
yapmnda kullanlan trlerdir. OT:25-30 vepH:5.4-6.3. kemoheterotroflardr. Etanoln dnda gliserol ve laktat da karbon
kayna olarak kullanlabilir.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
156/163
Asetik asit Biyosentezi : lk oksidasyonaamasnda etanol alkol dehidrogenazenzimine zgn NAD ve NADP'nin
redklenmesi ile aset aldehite oksitlenir.kinci oksidasyon ise aset aldehitdehidrogenaz ile asit aldehit hidratn asetikasite oksidasyonudur. Sonuta 1 moletanolden 1 mol asetik asit oluur.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
157/163
Glukanobakterler etanol sadece asetik asite oksitlerken(tamamlanmam oksidasyon) Acetobakterler etanolnce asetik asite daha sonra da oksijen varlnda CO2ve H2O indirgerler.
Sirke retiminde bu durum asit niceliini azaltacandanpratikte nem tar.
Glukanobakterler ayrca glukozu glukonik asiteoksitleyebilirler. Glukonik asitte ila endstrisindekullanlan kalsiyum glukonatn yapmnda kullanlr.Doal sulara sodyum glukonat ilavesi ile de tuzkelmesi nlenmektedir.
Tek Hcre Proteini
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
158/163
Mikroorganizmalar ucuz ve atk materyalzerinde retilir, saflatrlr ve hayvan veyainsanlar iin besin kayna olarakkullanlabilirler.
Eer bu besin protein kayna olarak retilirsetek hcre proteini (THP) olarak adlandrlr.
Pek ok mikroorganizma, algler, mavi-yeil
bakteriler, mantarlarve bakterilertek hcreprotein kayna olarak kullanlabilir.
THP retimi iin KullanlanSubstratlar
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
159/163
Substratlar Peynir endstrisi at olan protein ve laktoz bakmndanzengin olan peynir alt suyu Baz mayalar bu atk zerinde protein ve baz vitaminler
bakmndan zengin ierie sahip olarak reyebilirler vekedi mamas katks olarak kullanlr.
eker ileme endstrisi at olan melas zerindemayalar kolaylkla reyebilir Kat endstrisinin at olan slfit svs eker
bakmndab zayftr ve baz kfler bu atk zerindereyebilir.
Petrol endstrisinin at olan alkanlar mayalar iinsubstrat olabilir Alkanlar zerinde reyen mayalarhayvan yemi olarak kullanlr.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
160/163
nsanlar iin tketime en uygun olan THPsatta bulunan Quorn mikoproteinidir.
Mikoprotein flamentli kf olan Fusariumgraminereumdan elde edilir.
Karbon kayna olarak glukoz urubu azotkayna olarak amonyum kullanlr
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
161/163
Msr veya buday niastas glukozkayna olarak, kolin ise hifin bymesiniindklemek iin kullanlmaktadr. Ayrca
biotin de eklenir. 30 C de pH 6 da srekli kltrde reme
gerekletirilir.
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
162/163
Mikroorganizmalarn hzl remesi yksek RNAieriine neden olur.
Yksek dzeydeki RNA ierii insan ve
hayvanlar tarafndan tketimde uygun deildir. nsanlarda fazla miktardaki nukleik asit rik asitedntrlr.
rik asit bbrekler tarafndan atlamaz ve rik
asit kristalleri eklinde eklemlerde birikir (Guthastal)
8/7/2019 Biyoteknoloji Ders 1
163/163
Normal retim sonunda RNA ierii %10civarndadr ve hala tketim iin fazladr.
Is oku ve ribonukleaz etkisiyle RNA
ierii %2 ye drlr. Miselyum toplanr 18 C de uzun sreler
saklanabilir.
Tad etin tadna benzer ve eitli hazr etrnleri iine eklenir