CARTERA DE SERVICIOS (10ª edición) SERVICIO DE …sectorzaragozados.salud.aragon.es/uploads/documentos/documentos... · Laboratorio de: MICROBIOLOGIA Fecha Actualización: 12-06-2017

CARTERA DE SERVICIOS Laboratorio de: MICROBIOLOGIA Fecha Actualización: 12-06-2017

PTG-00-06_Z2(E)M_L 15/12/2015 Revisión: A

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CARTERA DE SERVICIOS

(10ª edición)

SERVICIO DE MICROBIOLOGÍA

La cartera de servicios detallada a continuación se presenta en el formato “histórico”, empleado en la primera versión de fecha 10/10/04 y en sus posteriores revisiones. Esta revisión corresponde a la 10ª edición de la Cartera de Servicios.



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ELABORADO REVISADO Y APROBADO Jefe de Servicio

Nombre/Firma Fecha Nombre/Firma Fecha

Manuel Omeñaca Ana Isabel López 12/06/17 María José Revillo 12/06/17

Edición Fecha ALCANCE MODIFICACIONES 01 10 /10/04 Edición inicial 02 17/01/06 Primera Revisión 03 30/04/08 Segunda Revisión (adenovirus en muestras respiratorias) 04 16/04/09

Tercera Revisión Modificar el tiempo de respuesta de

• Cultivo de virus, 14 días • PCR de HSV,CMV;VVZ;VEB;VH6 (≤2 días) • Carga viral de VHB (≤ 7 dias). • PCR enterovirus en LCR (≤2 dias) • Exudado de lesiones superficiales (≤5 días) • Muestras óseas y biopsias invasivas (7-10 días) • Hongos dermatofitos 25 días

Suprimir 3 pruebas reumáticas y PCR de VHC Añadir

• Serología de la enfermedad de Chagas • Investigación de Schistosoma en orina • Examen KOH en muestras hematológicas • Investigación de metapneumovirus en muestras respiratorias • Investigación de Ureaplasma y Micoplasma en muestras urogenitales y

respiratorias

05 17/06/13 Modificar técnica Pneumocystis jirovecii Citomegalovirus Mycobacterium tuberculosis complex Micobacterias no tuberculosas Mycobacterium tuberculosis intra-complex Determinación de la sensibilidad de micobacterias no tuberculosas Determinación de la sensibilidad de M. tuberculosis a antibacterianos de 1ª línea Coxiella burnetti IgG e IgM Enterovirus Papilomavirus detección de alto riesgo Papilomavirus, genotipado 16,18,45 Chlamydia trachomatis Clostridium difficile (toxina) Borrelia burgdorferii (Lyme) Modificar tiempo de respuesta Borrelia burgdorferii (Lyme)



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Brucella Enterovirus Hongos dermatofitos Borrelia burgdorferi (ELISA) Brucella Hepatitis B, antígeno e (HbeAg) Hepatitis B, antígeno superficie (HbsAg) Treponema pallidum Yersinia enterocolitica (03 y 09 separadas) Yersinia pseudotuberculosis Toxoplasma gondii Trichinella spiralis Citomegalovirus Epstein Barr Epstein-Barr EBNA Hepatitis A Hepatitis D Herpes simple tipo 2 Herpes simple tipo 6 Parotiditis Sarampion Varicela Zoster Modificar muestra Mycobacterium tuberculosis complex Añadir Poliomavirus: carga viral de virus BK por PCR-TR Poliomavirus: detección de virus JC por PCR-TR Meningitis por Listeria Meningitis bacteriana del niño: E.coli+S.agalactiae Meningitis bacteriana del adulto: Haemophilus+S.pneumoniae Secuenciación 16S Secuenciación ITS Identificación de bacterias mediante espectrometría de masas Detección metalobetalactamasa Detección de carbapenemasa Tinción Auramina Micobacterias: resistencias a Rifampicina e Isoniacida Papilomavirus, genotipado 16,18,45 Gripe A Gripe A nueva Subtipado gripe: H1, H3, H1 2009 Gripe B Gripe C Parainfluenza 1 Parainfluenza 2 Parainfluenza 3 Parainfluenza 4 Adenovirus Virus respiratorio sincitial A,B Coronavrirus 229E Coronavirus OC43 Virus respiratorio sincitial A Virus respiratorio sincitial B Rinovirus



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Enterovirus Sarampion Rubeola Parvovirus B19 Herpes simplex, Varicela zoster (PCR-TR) Epstein-Barr carga viral (PCR-TR) Suprimir Citomegalovirus, antigenemia Coxiella burnetti (Fiebre Q) por Fijación de Complemento (F de C) Mycoplasma pneumoniae por F de C Pruebas reumaticas: Anti Dnasa B Adenovirus por F de C Citomegalovirus por F de C Influenza A por F de C Influenza B por F de C Leptospira por aglutinación Parainfluenza 1 por F de C Parainfluenza 2 por F de C Parainfluenza 3 por F de C Parotiditis por F de C Respiratorio sincitial (VRS) por F de C Sarampión por F de C Papillomavirus detección y cualificación de bajo riesgo HTLV 2 Astrovirus Mycobacterium avium/intracellulare complex Mycobacterium kansasii Determinación de la sensibilidad de M. tuberculosis a antibacterianos de 1ª línea en medios sólidos Hepatitis A cuantificada post-vacunación automatizada Herpes simple tipo 1 IgG automatizado

06 27/10/14 Se incluye el nº de edición de la cartera de servicios en el título. Se indican mediante un asterisco (*) las determinaciones incluidas en el alcance de la acreditación. Se indica en el apartado de consideraciones, y se añade enlace al alcance de acreditación. Se sustituye “etest”por “tiras” en la tabla 2.4 “Pruebas de sensibilidad antibiótica”.

07 28/01/15 Se corrigen algunas de las determinaciones marcadas como acreditadas con asterisco. Se modifica el enlace al alcance de acreditación. Se actualizan diferentes tiempos de respuesta de acuerdo a la rutina actual del laboratorio. Se incluye la columna “técnica” en las tablas del apartado 1.2 Detección de antígenos. Suprimir Haemophilus influenzae b (Ag en LCR) Neisseria meningitidis (Ag en LCR) Clostridium difficile (toxina) en heces Helicobacter pylori Ag en heces Virus neurotropos (Herpes simplex, Varicela, CMV, Herpes 6,Epstein-Barr) (PCR convencional) Pneumocystis jirovecii (nested PCR) Mycoplasma pneumoniae (IgM técnica rápida)



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08

15/12/15 Se cambia el código de formato PTP-02-01 de nivel II al formato PTG-00-06 de nivel III

09 06/07/16 Se incluye la tinción de Kinyoun y su tiempo de respuesta en el punto 1.1 Exámenes directos/tinciones.

10 12/06/17 Se indican mediante un asterisco (*) las determinaciones incluidas en el alcance de la acreditación tras la última auditoria. Añadir Identificación de otras micobacterias distintas de M. tuberculosis (espectrometría de masas)* Detección de Astrovirus, Norovirus por ICT en heces Detección de Parechovirus por PCR Detección de Neisseria gonhorroeae por PCR tiempo real Detección de Bordetella pertussis y Bordetella parapertussis por PCR tiempo real Detección de Pneumocystis jiroveccii por PCR tiempo real Detección de S aureus meticilin sensible y meticilin resistente por PCR a tiempo real en hemocultivos positivos Detección de Plasmodium spp por PCR tiempo real Suprimir Determinación de la sensibilidad a antivíricos en VIH Determinación de la CMB por microdilución en caldo Identificación de otras micobacterias distintas de M. tuberculosis (convencional) Determinación de la sensibilidad de micobacterias no tuberculosas por difusión, E-test y microdilución en caldo Aglutinación de Bordetella, Escherichia coli 0157, Legionella, Listeria a partir de aislado. Detección por PCR de: Coronavirus 229E, Coronavirus OC43, Poliomavirus: virus JC, Gripe C, Parainfluenza 1,2,3,4, Adenovirus, Rinovirus, Sarampión, Rubéola, Parvovirus B19, Herpes 7, Herpes 8, Borrelia burgdorferi, Leishmania Determinación de la sensibilidad a antifúngicos por difusión en agar (hongos levaduriformes), y por etest (hongos filamentosos y levaduriformes)

COPIA nº 1 asignada al Servicio de Microbiología Este documento es propiedad del Servicio de Microbiología del Hospital Universitario Miguel

Servet. La información en él contenida no podrá reproducirse total ni parcialmente sin autorización escrita del Responsable. Las copias no registradas no se mantienen actualizadas a sus destinatarios.



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Esta cartera de servicios tiene la finalidad de proporcionar al solicitante información

de los servicios ofrecidos en el Servicio de Microbiología del Hospital Universitario

Miguel Servet. Con el fin de ayudar en la interpretación de su contenido se aportan

algunas definiciones, junto con consideraciones internas.

Nos comprometemos a mantener permanentemente actualizado este documento a

partir de las necesidades y sugerencias manifestadas por nuestros clientes, así

como a partir de la evolución de la ciencia y de la tecnología. Por ello,

establecemos cauces de comunicación eficaz con los clientes que permitan

recoger y trasladar sus recomendaciones a nuestros servicios.

Definiciones:

Servicio : “Resultado que ofrece el Laboratorio a requerimiento de sus diversos

clientes”.

Determinación : “Prueba o conjunto de pruebas de tipo físico, químico o biológico

que conducen a un resultado“. La determinación puede constituir un servicio por sí

misma. Una determinación puede estar constituida por una o varias pruebas.

Técnica : “Forma genérica de realizar una determinación y obtener el resultado de

la misma entre posibles alternativas y que refiere a equipamiento, método o

materiales utilizados”.

Método : “Modo de hacer un ensayo sistemáticamente y con un orden”



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Consideraciones

1. Se pretende aportar las posibilidades del Servicio de Microbiología respecto

a la realización de servicios y determinaciones.

2. Se pretende, igualmente, trasladar los plazos de tiempo necesarios para la

realización de cada servicio o determinación.

3. “Tiempo máximo de determinación” es el plazo en que el solicitante tendrá

el informe con el resultado final de cada servicio. En el caso de varios

servicios solicitados, este tiempo puede estar condicionado por la

combinación de los mismos o por el resultado parcial obtenido de algunos

de los servicios solicitados.

4. El valor de este plazo se ha establecido atendiendo a la mayoría de las

muestras analizadas, pudiendo darse desviaciones en muestras concretas.

5. Los tiempos reflejados en el documento hacen referencia al momento de la

expedición del informe por parte del Servicio de Microbiología. Para algunos

destinatarios este plazo puede verse incrementado en función de la

organización de la distribución.

6. En la valoración de los plazos se consideran días hábiles.

7. Se indica, mediante asterisco, las determinaciones incluidas en el alcance

de acreditación (disponible en el apartado de Entidades Acreditadas de:

https://www.enac.es/).



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ÍNDICE 1. SERVICIO DE TÉCNICAS DIAGNÓSTICAS

1.1 EXÁMENES DIRECTOS

1.2 DETECCIÓN DE ANTÍGENOS MICROBIANOS

1.3 MICROBIOLOGÍA MOLECULAR

1.4 CULTIVOS

1.5 DETECCIÓN DE ANTICUERPOS

2. SERVICIO DE LABORATORIO DE REFERENCIA

2.1 IDENTIFICACION ANTIGENICA

2.2 IDENTIFICACION BIOQUIMICA

2.3 OTRAS DETERMINACIONES

2.4 SENSIBILIDAD ANTIBIOTICA

3. SERVICIO DE INTERCONSULTAS

4. SERVICIO DE APOYO AL CONTROL DE LA INFECCIÓN NOSOCOMIAL

5. SERVICIO DE APOYO AL CONTROL DE LA INFECCIÓN DE LA COMUNIDAD

6. OTROS SERVICIOS

7. OTRAS ACTIVIDADES



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1. SERVICIO DE TÉCNICAS DIAGNÓSTICAS

1.1 Exámenes directos

EXÁMENES EN FRESCO

Exámenes en Fresco: Bacterias

Determinación Muestra Tiempo de respuesta (días) Área funcional

Chancro sifilítico Genitales <1 Exudados

Exámenes en Fresco: Hongos


Examen con KOH Pelo, piel, uña ≤5 Hongos

Examen KOH Muestras hematológicas

<1 Hongos

Exámenes en Fresco: Parásitos


Examen en fresco

Parásitos o fragmentos

Ectoparásitos

Larvas (miasis)

Heces,

Vómicas,

Estructuras parasitarias,

Otras muestras

≤1

Parásitos

Schistosoma Orina, Biopsia ≤2 Orina

Trichomonas Ex. vaginal ≤1 Exudados

Test de Graham (Oxiuros) Papel de celo ≤2 Parásitos



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Tinciones


Tinción Gram* Todas ≤1 Todas

Tinción Tinta china LCR ≤1 Hemocultivos

Tinción Kinyoun* Todas ≤1 Micobacterias

Tinción Ziehl-Neelsen* Todas ≤1 Micobacterias

Tinción Auramina* Todas ≤2 Micobacterias

Tinción de Gram acreditada para muestras de sección Exudados, hemocultivos, muestras respiratorias con cultivo cultivo cuantificado y orinas.

Tinciones parasitarias


Tinción ácido resistente Cryptosporidium, Cyclospora, Isospora

Heces, respiratorias, biliares.

≤2 Parásitos

Tinción Microsporidium Heces ≤2 Parásitos

Gota gruesa Plasmodium Sangre (EDTA) ≤2 Parásitos

Microfilarias Sangre (EDTA), ojo <2 Parásitos

Leihsmania Biopsia de piel, Raspados,Punción medular

≤2 Parásitos

1.2 Detección de antígenos microbianos

Detección de antígenos: Bacterias

Determinación Técnica Muestra Tiempo de respuesta (días) Área funcional

Legionella pneumophila ICT Orina ≤1 Respiratorio

Streptococcus pneumoniae ICT Orina

LCR ≤1

Respiratorio

Hemocultivos

Detección de antígenos: Hongos


Aspergillus fumigatus (antígeno galactomanano)

ELISA Suero ≤5 Serología

Cryptococcus neoformans Aglutinación LCR/suero ≤1 Hemocultivos



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Pneumocystis (carinii) jiroveci IFI Respiratorio ≤2 Respiratorio

Detección de antígenos: Parásitos

Determinación Técnica Muestra Tiempo de respuesta (días ) Área funcional

Entamoeba histolytica ELISA Heces ≤2 Parásitos

Plasmodium spp ICT Sangre con EDTA ≤1 Parásitos

T.cruzi (Chagas) ICT Suero ≤ 7 Serología

Detección de antígenos: Virus

Determinación Técnica Muestra Tiempo de respuesta (días ) Área funcional

Hepatitis B, antígeno e (HbeAg)*

automatizada Suero ≤7 Serología

Hepatitis B, antígeno superficie (HbsAg)*

automatizada Suero ≤2 Serología

Hepatitis D ELISA Suero ≤7 Serología

Adenovirus IFI Respiratoria ≤1 Virus

Influenza (Gripe) tipo A* IFI Respiratoria ≤1 Virus

Influenza (Gripe) tipo B* IFI Respiratoria ≤1 Virus

Metapneumovirus* IFI Respiratoria ≤1 Virus

Parainfluenza 1* IFI Respiratoria ≤1 Virus



Respiratorio sincitial * IFI Respiratoria ≤1 Virus

Adenovirus ICT Heces ≤2 Gastrointestinal

Astrovirus ICT Heces ≤2 Gastrointestinal

Norovirus ICT Heces ≤2 Gastrointestinal

Rotavirus ICT Heces ≤2 Gastrointestinal

VIH (antígeno p24)* automatizada Suero ≤1 Serología



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1.3 Microbiología Molecular

Determinación Técnica Muestra

Tiempo para realización

determinación (días)

Área funcional

VIH, carga viral (cuantificación)* PCR, tiempo real

Plasma, LCR ≤7 Biología Molecular vírica

Citomegalovirus carga viral (cuantificación)*

PCR, tiempo real

Plasma, LCR ≤7 Biología molecular vírica

Hepatitis B virus carga viral (cuantificación)*

PCR-RT Suero, plasma ≤7 Biología Molecular vírica

Hepatitis C virus carga viral (cuantificación)*

PCR-RT Suero ≤7 Biología Molecular vírica

Hepatitis C virus (genotipo) PCR, lipa Suero, amplicón ≤15

Biología Molecular vírica

Epstein-Barr (carga viral) PCR, tiempo real

LCR, plasma, suero

≤14 Biología molecular

Poliomavirus: carga viral virus BK PCR, tiempo real

Plasma, suero ≤21 Biología Molecular

Herpes simplex PCR, tiempo real

Plasma,suero, LCR, humor vítreo, lesiones vesiculares


Varicela Zoster PCR, tiempo real

Plasma,suero, LCR, humor vítreo, lesiones vesiculares


Enterovirus PCR, tiempo real

LCR, plasma, ≤1 Biología Molecular

Parechovirus PCR, tiempo real

LCR ≤1 Biología Molecular

Papilomavirus detección de alto riesgo*

PCR, tiempo real

Muestra endocervical

≤21 Biología Molecular

Papilomavirus, genotipado 16,18* PCR, tiempo real

Muestra endocervical


Gripe A PCR, tiempo real

Muestra respiratoria


Gripe A nueva PCR, tiempo real



Subtipado gripe: H1, H3, H1 2009 PCR, tiempo real



Gripe B PCR, tiempo real



Virus respiratorio sincitial A PCR, tiempo real



Virus respiratorio sincitial B PCR, tiempo real



Plasmodium spp PCR, tiempo real Sangre ≤7

Biología Molecular



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Determinación Técnica Muestra

Tiempo para realización

determinación (días)

Área funcional

Pneumocystis jirovecii PCR, tiempo real



Bordetella pertussis PCR, tiempo real

Muestra respiratoria ≤7

Biología Molecular

Bordetella parapertussis PCR, tiempo real



Meningitis bacteriana del niño: E.coli+S.agalactiae

PCR, tiempo real


Meningitis bacteriana del adulto: H.influenzae+S.pneumoniae

PCR, tiempo real LCR ≤2

Biología Molecular

Listeria monocytogenes PCR, tiempo real


Chlamydia trachomatis PCR, tiempo real

Ex. Uretral, cervical, ocular


Neisseria gonhorroeae PCR, tiempo real

Ex. Uretral, cervical, ocular


Detección de S aureus meticilin sensible y meticilin resistente

PCR, tiempo real

Hemocultivos ≤1 Hemocultivos

Detección de carbapenemasas PCR, tiempo real

Aislado ≤7 Biología molecular

Secuenciación 16S PCR+secuenciacion

Aislado ≤30 Tipado molecular bacteriano

Secuenciación ITS PCR+secuenciación

Aislado ≤30 Tipado molecular bacteriano

Mycobacterium tuberculosis complex*

Amplificación Hibridación

Todas menos sangre

≤7 Micobacterias


Hibridación reversa

Aislado ≤7 Micobacterias

Mycobacterium tuberculosis intra-complejo*



Micobacterias no tuberculosas* Hibridación reversa


Micobacterias: resistencias a Rifampicina e Isoniacida


Todas menos sangre

≤7 Micobacterias



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1.4 Cultivo

Cultivo muestras de Aparato Genital y Urinario

Determinación Muestra Tiempo de respuesta (días ) Área funcional

Muestras genitales* Exudados: vaginal, endocervical, uretral, de pene, de glande…

≤5 Exudados

Muestras genitales * Aspirado endometrial ≤7 Exudados

Muestras genitales de gestantes *

(Cribado Streptococcus agalactiae)

Exudado vaginal, anal ≤4 Exudados

Orina (Urocultivo)*

Micción media, orina de uréter, aspiración suprapúbica, punción sonda vesical, punción renal, nefrostomía.

≤4 Urocultivos

Semicuantitativos: Estudio de prostatitis

Semen, líquido prostático, orina

≤4 Urocultivos

Cultivo: Heces


Coprocultivo (Salmonella, Shigella, Yersinia, Campylobacter, Aeromonas)*

Heces, hisopo rectal ≤4 Gastrointestinal



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Cultivo muestras Epidemiología


Controles de esterilidad Ambientales Material clínico

≤5 Epidemiología

Control de portadores (SARM*, Bacilos Gram (-) multiresistentes, Salmonella, enterococos vancomicina resistentes...)

Exudado nasal, inguinal... Heces...

≤4 Epidemiología

Unidades formadoras de colonia

Agua de dialisis ≤5 Epidemiología

Control bacteriológico Hemoderivados ≤7negativo

≤15 contaminado o positivo

Epidemiología

Cultivo muestras Exudados


Biopsias* Renal, cutánea…

Pulmonar 7-14

Exudados*

Hemocultivos

Respiratorio

Exudado de lesiones profundas y abscesos con búsqueda de anaerobios*

Heridas profundas, absceso pulmonar, cerebral, mamario, mediastínico, hepático, renal...

7-14 Exudados

Hisopos periféricos de recién nacido,

Exudado conjuntival, ótico, nasal, faríngeo y umbilical

≤3 Exudados

Exudado de lesiones superficiales sin búsqueda de anaerobios*

Heridas y lesiones superficiales

≤5 Exudados

Muestras óseas*

Esternal, vertebral, tibial, cubital, femoral, radial...Injertos e implantes óseos

7-14 Exudados

Punción/aspiración con aguja fina (PAAF)*

Renal, Hepática,

Pulmonar y Ganglionar

7-14 Exudados* Respiratorio



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Cultivo: Hemocultivos y catéteres


Catéteres y otros dispositivos

(Semicuantitativos: Maki)

Alimentación parenteral, conexiones de catéter diálisis peritoneal

≤5 Hemocultivos

Hemocultivo convencional* Sangre ≤7 Hemocultivos

Hemocultivo de infección específica: endocarditis, brucelosis, micosis*

Sangre 15-21 Hemocultivos

LCR LCR ≤4 Hemocultivos

Líquidos orgánicos estériles

Sinovial*, ascítico*, biliar*, mediastínico, pericárdico, peritoneal, CAPD...

≤7 Hemocultivos, Exudados*

Cultivo Muestras Respiratorio


Muestras respiratorias (cultivo convencional)

Esputo, esputo inducido, aspirado bronquial, aspirado traqueal,

≤5 Respiratorio

Muestras respiratorias estériles

Líquido pleural, PAAF pulmonar, biopsia

≤7 Respiratorio

Muestras respiratorias (cuantificado)*

Aspirados bronquiales lavado broncoalveolar cepillo telescopado esputo mucoviscidosis EPOC bronquiectasias

≤7 Respiratorio

Muestras respiratorias vías altas u otorrinolaringológicas

Exudado nasal, faríngeo, ótico

Punción/aspiración de senos

≤3 Respiratorio

Muestras oculares Exudado conjuntival ≤3 Respiratorio

Muestras oculares Raspado corneal, humor vítreo, humor acuoso

≤7 Respiratorio

Cultivo Bacterias especiales


Actinomyces Pleural, conjuntival, abscesos ≤14 Respiratorio, Exudados



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Bordetella

Ex. nasofaríngeo (pernasal) (toma en el laboratorio)

Aspirado nasofaríngeo

≤7 Respiratorio

E. coli O:157 H:7 Heces ≤4 Gastrointestinal Helicobacter Mucosa gástrica ≤10 Gastrointestinal

Legionella Muestras respiratorias ≤10 Respiratorio

Micobacterias*

Biopsias, huesos, LCR, sangre, líquidos orgánicos, piel, orina, esputo, jugo gástrico..

Negativos ≤80 Positivos ≤10-30

Micobacterias

Nocardia Muestras respiratorias, abscesos

≤14 Respiratorio, Exudados

Ureaplasma, Micoplasma Muestras urogenitales, Aspirado bronquial

≤3 Respiratorio, Exudados, Urocultivos

Vibrio cholerae Heces ≤4 Gastrointestinal

Cultivo Hongos


Hongos: levaduras Muestras respiratorias, genitales y otras

≤ 7 Exudados, Hemocultivos, Hongos, Respiratorio

Hongos: Miceliales Muestras respiratorias y otras

≤21

Hongos

Hongos dermatofitos* Pelo, piel, faneras... ≤32 Hongos

Blastomyces dermatitidis, Cladophialophora bantiana, Coccidioides immitis, Histoplasma capsulatum, Paracoccidioides brasiliensis Otros

Muestras respiratorias Biopsias LCR Heces...

≤42 Hongos en relación con Centro Nacional de Microbiología

Cultivo Parásitos


Parásitos (larvas de nematodos)

Heces ≤6 Parásitos

Parásitos (Amebas de vida libre)

Muestras oculares ≤7 Parásitos

Parásitos (Trichomonas) Muestras urogenitales ≤7 Exudados



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Cultivo Virus


Adenovirus Muestras respiratorias, conjuntivales

≤15 Virus

Citomegalovirus Sangre completa orina, respiratorias...

≤21 Virus

Enterovirus (Echovirus, Coxsackie virus, Enterovirus, Poliovirus)

Faríngea, heces, liq. pericárdico, LCR

≤15 Virus

Herpes simplex 1 y 2

Frotis lesiones, líquido vesicular, muestras respiratorias. biopsia cerebral...

≤15 Virus

Parainfluenza virus 1, 2 y 3 Asp. nasofaríngeo faríngeo

≤15 Virus

Parotiditis virus Saliva, faríngeo ≤15 Virus

Respiratorio sincitial virus Asp. nasofaríngeo, faríngeo

≤15 Virus

Rinovirus Asp. nasofaríngeo, faríngeo

≤15 Virus

Sarampión virus Faríngeo, orina ≤15 Virus

Varicela-zoster virus Líquido vesicular LCR. ≤21 Virus

Virus de la gripe (Influenza virus A y B)*

Asp. Nasofaríngeo

F. faríngeo ≤15 Virus

1.5 Detección de anticuerpos

Detección de anticuerpos Bacterias

Determinación Técnica Tipo de muestra

Tiempo de respuesta (días ) Área funcional

Bartonella henselae IFI Suero ≤ 7 Serología

Bartonella quintana IFI Suero ≤ 7 Serología

Borrelia burgdorferii (Lyme)

ELISA Suero/LCR ≤ 7 Serologia

Borrelia burgdorferii (Lyme)

Western-Blot Suero/LCR ≤ 7 Serologia

Brucella Aglutinación, Coombs, Rosa de Bengala.

Suero/LCR ≤ 3

Serología



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Chlamydia pneumoniae ELISA Suero ≤ 7 Serología Chlamydia psittaci ELISA Suero ≤ 7 Serología

Coxiella burnetti (Fiebre Q fase I y fase II)

IFI Suero ≤ 7 Serología

Coxiella burnetti IgG e IgM

ELISA Suero ≤ 7 Serología

Legionella pneumophila (serogrupos 1 a 8) IFI Suero ≤ 7 Serología

Rickettsia conorii(IgG) IFI(IgG) Suero ≤ 4 Serología

Treponema pallidum (no treponémicos)

RPR, VDRL SueroLCR ≤ 3 Serología

Treponema pallidum (treponémicos)*

Ac totales (automatizada)

Suero/LCR

Suero ≤ 3 Serología

Treponema pallidum (treponémicos)

FTA IgG Suero/LCR


Treponema pallidum (treponémicos)

ELISA IgM Suero ≤ 7 Serología

Yersinia enterocolitica (03 y 09 separadas)

Aglutinación Suero ≤ 3 Serología

Yersinia pseudotuberculosis Aglutinación Suero ≤ 3 Serología

Detección de anticuerpos Parásitos



Entamoeba histolytica IFI Suero ≤ 7 Serología

Hidatidosis Echinococcus granulosus

Hemaglutinación Suero ≤ 7 Serología

Leishmania infantum IFI Suero ≤ 7 Serología Taenia solium (cisticercosis)

ELISA Suero/LCR ≤ 10 Serología

Toxoplasma gondii* IgG total automatizada

Suero/LCR ≤ 3 Serología

Toxoplasma gondii IgG IFI Suero/LCR ≤ 7 Serología Toxoplasma gondii* IgM Automatizada Suero ≤ 3 Serología

Toxoplasma gondii Avidez Automatizada


Toxoplasma gondii IgA ELISA Suero ≤ 7 Serología

Trichinella spiralis ELISA(IgG) Suero ≤ 10 Serología

T.cruzi (Chagas) ICT Suero ≤ 7 Serología



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T.cruzi (Chagas) ELISA(IgG) Suero ≤ 7 Serología



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Detección de anticuerpos Virus



Citomegalovirus* IgG Automatizada Suero ≤ 3 Serología

Citomegalovirus* IgM Automatizada Suero ≤ 3 Serología

Epstein Barr* IgM Automatizado Suero ≤ 3 Serología

Epstein barr* IgG Automatizada Suero ≤ 3 Serología

Epstein-Barr EBNA ELISA Suero ≤ 7 Serología

Hepatitis A* IgM Automatizada Suero ≤ 3 Serología

Hepatitis A* IgG Automatizada Suero ≤ 3 Serología

Hepatitis B Diagnóstico* Automatizada Suero ≤ 3 Serología

Hepatitis B Preoperat. Precat. Embarazo etc*

Automatizada Suero ≤ 3 Serología

Hepatitis B* Cuantificación post-vacuna automatizada


Hepatitis C* IgG automatizada Suero ≤ 3 Serología

Hepatitis C Dot Blot (IgG Ac frente a proteínas)


Hepatitis D IgG o IgM ELISA Suero ≤ 10 Serología

Herpes simple total* IgG Automatizado Suero ≤ 3 Serología

Herpes simple total* IgM Automatizado Suero ≤ 3 Serología

Herpes simple tipo 2 IgG (ELISA) Suero ≤ 7 Serología

Herpes simple tipo 6 IgG (ELISA) Suero ≤ 7 Serología

Herpes simple tipo 6 IgM (ELISA) Suero ≤ 7 Serología

HTLV,1-2 IgG ELISA Suero ≤7 Serología

Parotiditis IgG (ELISA) Suero ≤ 7 Serología

Parotiditis IgM ELISA Suero ≤ 7 Serología

Parvovirus IgG IFI Suero ≤ 7 Serología

Parvovirus IgM IFI Suero ≤ 7 Serología

Rubéola* IgG automatizada Suero ≤ 3 Serología

Rubéola* IgM automatizada Suero ≤ 3 Serología

Sarampión IgG (ELISA) Suero ≤ 7 Serología

Sarampión IgM ELISA Suero ≤ 7 Serología

Varicela Zoster IgG (ELISA) Suero ≤ 7 Serología

Varicela Zoster IgM (ELISA) Suero ≤ 7 Serología

VIH 1,2,O* Automatizado Suero ≤ 3 Serología

VIH( Ac frente a proteínas VIH-1+2)

Western Blot (IgG) Suero ≤ 7 Serología

VIH Antígeno* Semiautomatizada Suero ≤ 3 Serología

VIH ( Ac frente a proteínas VIH-2)

Western Blot (IgG) Suero ≤ 7 Serología



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Automatizada Quimioluminiscencia y derivados (electroquimioluminiscencia)

IFI: Inmunofluorescencia Indirecta (manual)

ELISA: Enzimoinmunoensayo (manual) o semiautomatizada

WB (Western Blot): Ac frente a las proteínas específicas (semiautomatico)

RPR VDRL: Ac no específicos de Treponema (manual)

FTA IgG Inmunofluorescencia Indirecta con Ag treponémico (manual)

Técnica rápida: Aglutinación en pocillo preparado comercial (manual)



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2 SERVICIO DE LABORATORIO DE REFERENCIA TÉCNICAS DI AGNÓSTICAS 2.1 Pruebas de identificación antigénica


Tiempo de respuesta (días a partir de fecha de

aislamiento)

Área funcional

Neisseria meningitidis Aglutinación Aislado ≤1 Respiratorio

Salmonella* Aglutinación Aislado ≤1 Gastrointestinal Shigella* Aglutinación Aislado ≤1 Gastrointestinal

Yersinia enterocolitica Aglutinación Aislado ≤1 Gastrointestinal

Streptococcus agalactiae

Aglutinación Aislado ≤1 Exudados

Estreptococo beta-hemolítico (C, D, E, F,G)

Aglutinación Aislado ≤1 Todas


Inmunocromatografía Aislado ≤1 Micobacterias

2. 2 Pruebas de identificación bioquímica u otros método s

Determinación Cepa tras aislamiento Tiempo de respuesta (días) Área funcional

Identificación bioquímica de bacterias*

Aislado ≤ 2 –3 Todas

Identificación de bacterias mediante espectrometría de masas MALDI-TOF*

Aislado, Hemocultivo positivo

≤ 1 Todas

Identificación de otras micobacterias distintas de M. tuberculosis (espectrometría de masas MALDI-TOF)*


Identificación de hongos filamentosos (convencional)

Aislado ≤15 Todas

Identificación de hongos levaduriformes (convencional)

Aislado ≤ 3 Todas

Identificación de Entamoeba histolytica Parásito ≤ 1

Parásitos

Identificación de virus por inmunofluorescencia directa, a partir de monocapa

Aislado ≤ 1 Virus

Identificación de virus por otras técnicas Aislado ≤ 21 Virus



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2. 3 Otras determinaciones

Determinación Técnica Cepa tras aislamiento

Tiempo de respuesta (días )

Área funcional

Estudios epidemiológicos en Micobacterias

RFLP, Spoligotyping


Identificación de Micobacterias PRA (PCR) Aislado ≤7 Micobacterias

2. 4 Pruebas de sensibilidad antibiótica

Determinación Técnica Cepa tras aislamiento

Tiempo de respuesta (días )

Área funcional

Antibiograma por difusión* Difusión disco placa

Aislado ≤2 Todas

Detección de ß-lactamasa Disco Aislado ≤1 Todas

Determinación de la CMI de antibióticos en caldo, método automatizado comercial*

Microdilución Aislado ≤2 Todas

Determinación de la CMI de antibióticos por difusión con tiras *

Difusión en placa

Aislado ≤2 Todas

Determinación de la sensibilidad de Nocardia por difusión con tiras

Difusión en placa Aislado ≤4 Respiratorio

Determinación de la sensibilidad de M. tuberculosis a antibacterianos de 1ª línea en medios líquidos fluorométricos (automatizada)

Medio líquido automatizado


Determinación de la CMI de antifúngicos por microdilución en caldo (manual o automatizada) (hongos levaduriformes)

Microdilución Aislado ≤3 Todas



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3. SERVICIO DE INTERCONSULTAS

Tipo Tiempo de respuesta (días) Área funcional

Preventivas ≤1 Todas Diagnósticas ≤1 Todas Terapéuticas ≤1 Todas Interpretación y valoración de los informes microbiológicos ≤1 Todas



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4.- SERVICIO DE APOYO AL CONTROL DE LA INFECCION NO SOCOMIAL

1. Colaboración en la implantación de programas de vigilancia y control de la

infección hospitalaria.

2. Colaboración en el diseño, control y evaluación de la profilaxis antimicrobiana.

3. Colaboración en el diseño, control y evaluación de la política de antimicrobianos.

4. Colaboración en la detección e intervención en brotes epidémicos.

5. Detección y colaboración en la prevención de la aparición de microorganismos con

resistencia de especial riesgo clínico.

6. Participación en la Comisión de Infecciones del Hospital.

7. Estudio de la prevalencia de la resistencia a los antimicrobianos en el hospital.



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5.- SERVICIO DE APOYO AL CONTROL DE LA INFECCION DE LA COMUNIDAD

1. Informes de aislamientos con significado epidemiológico.

2. Información de la prevalencia de la patología infecciosa en la comunidad.

3. Colaboración en la prevención de las enfermedades transmisibles en la

comunidad.

4. Colaboración en la elaboración de protocolos.



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6. OTROS SERVICIOS

1. Obtención de muestras especiales

2. Envío de muestras a laboratorios de referencia

3. Informes epidemiológicos

4. Informes estadísticos

5. Informes de gestión

6. Archivo y custodia de muestras biológicas y aislamientos microbianos



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7.- OTRAS ACTIVIDADES

1. Formación postgraduada

- Residentes

- Residentes de otros hospitales

2. Formación personal técnico

3. Programa de Formación Continuada

4. Participación institucional en Comisiones Clínicas hospitalarias

5. Línea de investigación consolidada en Mycobacterias con varios proyectos de

investigación en desarrollo

6. Protocolos microbiológicos:

De diseño propio

Participación en estudios multicéntricos

Protocolos clínicos hospitalarios

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CARTERA DE SERVICIOS (10ª edición) SERVICIO DE …sectorzaragozados.salud.aragon.es/uploads/documentos/documentos... · Laboratorio de: MICROBIOLOGIA Fecha Actualización: 12-06-2017