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シカジーニアス ® POT キットシリーズCicaGeneus® POT KIT Series
*1 シカジーニアス DNA抽出試薬は別売です。
*1
菌株の迅速簡易同定、院内感染対策に…
キットをご活用ください
操作手順
集団感染と推定
愛知県衛生研究所(現 藤田保健衛生大学)の鈴木匡弘先生により開発されたPCR-based ORF Typing(POT法)は、マルチプレックスPCRを用いて複数の特定遺伝子を同時に増幅し、増幅されたバンドパターンを解析することで、菌体間の相同性を比較する方法です。
シカジーニアス® 分子疫学解析用 POTキットシリーズ
● 必要な試薬はすべて同梱されたPCRキット● 約4時間以内で分子疫学解析が可能● PFGEまたはMLSTと同等の解析能● 解析結果が数値化(POT値)されるので、容易に菌体間の相同性の比較、管理が可能
特徴
黄色ブドウ球菌用POT
● POT値算出例
①2つのマルチプレックスPCR の電気泳動結果(図1)からバンドパターン(表1)を読み取ります。②この電気泳動のバンドの有無の結果を用いて、POT 値解析用の計算シート に二進法で入力し、3つのカテゴリーの POT 値を算出します。 ⅰ femA が陽性の場合、その検体は黄色ブドウ球菌(S. aureus)であることが確認できます。また、MRSA の場合、POT 1 の値の合計は64 以上になります。 ⅱ 検体間の POT 値を比較することで、菌体間の相同性を客観的に推測出来ます。 ⅲ 集団感染から得られた菌体はPOT 1 ~ 3 の POT 値が全て同一になります。(例:図1の6と7、8と9)
※2 各キットのPOT値解析用の計算シートは、弊社製品ホームページに掲載しております。
Reactionmixture 1
Reactionmixture 2
POT No.femAPOT 1-1POT 1-2POT 1-3POT 2-1POT 2-2POT 2-3POT 2-4POT 2-5POT 2-6POT 2-7POT 2-8femAPOT 1-4POT 1-5POT 1-6POT 1-7POT 3-1POT 3-2POT 3-3POT 3-4POT 3-5POT 3-6POT 3-7
増幅サイズ(bp)601530449355304271228197161131106816014773883202732431971711401159578
POT 係数
6432161286432168421
84216432168421
ターゲット領域S. aureus positive controlmecAmec gene complex class BSCCmec type Ⅱa specificTn554プロファージプロファージプロファージプロファージプロファージプロファージGenomic IslandS. aureus positive controlcassette chromosome recombinase A2遺伝的バックグラウンド遺伝的バックグラウンドmec gene complex class Aプロファージプロファージプロファージプロファージプロファージプロファージプロファージ
POT値算出結果
※2
メチシリン耐性黄色ブドウ球菌(MRSA)は医療関連感染の主な原因菌であり、この蔓延防止には菌体間の相同性などを解析し、適切な拡散予防策を講じる必要があります。本キットでは、菌株の識別、MRSAクローンのCC型、SCCmec型の推定が行えます。
※1 愛知県衛生研究所 (現 藤田保健衛生大学 ) 鈴木匡弘先生のご厚意により、電気泳動パターンの実例データをご提供いただきました。
※1
製品情報
製品番号
08087-96
08179-96
08112-96
08114-96
包 装
120回分
50回分
30回分
30回分
希望価格(円)
85,000
50,000
38,000
38,000
製品名
シカジーニアス® 病原遺伝子検出PCRキット(下痢原性大腸菌用)
シカジーニアス® コアグラーゼ検出セット(黄色ブドウ球菌用)
シカジーニアス® ESBL遺伝子型検出キット
シカジーニアス® カルバペネマーゼ遺伝子型検出キット
保 存
冷凍(-25℃~-20℃)
冷凍(-25℃~-20℃)
冷凍(-25℃~-20℃)
冷凍(-25℃~-20℃)
シカジーニアス® PCRキットシリーズは、マルチプレックスPCRを用いて複数の遺伝子を同時に増幅し、増幅されたバンドパターンで特定遺伝子の存在を推定するPCR検出キットです。必要な試薬、ポジティブコントロールがすべて同梱されており、約3時間以内に解析が可能です。
シカジーニアス® PCRキットシリーズ
★本キットは研究用として販売しております。ヒトや動物を対象にした医療や臨床診断の目的には使用しないで下さい。
アシネトバクター属菌用
大腸菌用
POT
POT
POT
緑膿菌は、自然環境中に存在する代表的な常在菌の一種です。医療関連感染においては、主要な抗生物質に対して広く耐性を獲得した多剤耐性緑膿菌(MDRP)が問題となっています。
● 菌株の識別、一部ST型の推定、薬剤耐性遺伝子(VIM,IMP)の保有状況の確認が行えます。● PFGEやMultilocus Sequence Typing(MLST)と同等の識別能を有しております。
特長
緑膿菌用
アシネトバクター属菌は、医療環境を含め、自然環境中に広く存在する日和見感染菌です。近年、各種抗生物質に対して広く耐性を獲得した多剤耐性アシネトバクター属(MDRA)が問題となっています。
● アシネトバクター属菌の菌種の識別、A. baumannii の菌株の識別、 ST型、国際流行クローン(International clone Ⅰ/Ⅱ)の推定が行えます。● Multilocus Sequence Typing(MLST)と同等の識別能を有しております。
大腸菌は、自然環境中に広く存在する日和見感染菌です。医療環境においては、食中毒や院内感染といった集団感染の原因になることが多く、感染管理が重要となります。
● 菌株の識別、一部ST型(特にST131)の推定、ESBL原因遺伝子(CTX-M-1,2,9)の保有状況の確認が行えます。● 特にESBL産生大腸菌において、PFGEに近い識別能を有しております。
特長
特長
関連製品
★各キットは個別のリーフレットご用意しております。製品の詳細に関しましてはそちらをご確認ください。
BGa-16(201707)
製品情報
製品番号
08180-96
08180-97
08187-96
08062-96
08362-97
08178-96
包 装
120回分
30回分
50回分
30回分
30回分
120回分
希望価格(円)
83,000
38,000
64,000
42,000
42,000
22,000
製品名
シカジーニアス® 分子疫学解析POTキット(緑膿菌用)
シカジーニアス® 分子疫学解析POTキット(アシネトバクター属菌用)
シカジーニアス® 分子疫学解析POTキット(大腸菌用)
シカジーニアス® DNA抽出試薬
保 存
冷凍(-25℃~-20℃)
冷凍(-25℃~-20℃)
冷凍(-25℃~-20℃)
冷凍(-25℃~-20℃)
冷凍(-25℃~-20℃)
冷蔵(2℃~8℃)★本キットは研究用として販売しております。ヒトや動物を対象にした医療や臨床診断の目的には使用しないで下さい。
シカジーニアス® 分子疫学解析POTキット(黄色ブドウ球菌用)
★上記の他に必要な機材などがございますので、弊社営業所もしくは販売店へお問合せください。●本キットは愛知県から特許許諾を得て、製造販売しております。他メーカーの商品に関するライセンスについては、各メーカーにご確認ください。
関連試薬
製品番号
72046
72108
72118
72101
46510-79
14575-43
49914-40
01089-23
包 装
10枚
10枚
10枚
10枚
1 L
10 mL
250 gel lanes
100 g
希望価格(円)
2,800
3,500
3,200
3,100
5,000
5,000
13,000
27,000
製品名
クロモアガー MRSAスクリーン培地
クロモアガー MDRPスクリーン培地
クロモアガー MDRAスクリーン培地
クロモアガー ESBL 生培地
10×TBE緩衝液
臭化エチジウム溶液(2 mg/mL、点眼瓶入)
Quick-Load Purple 50 bp DNA Ladder
アガロースKANTO HC(短フラグメント用)
保 存
冷蔵(2℃~8℃)
冷蔵(2℃~8℃)
冷蔵(2℃~8℃)
冷蔵(2℃~8℃)
常温
冷蔵(2℃~10℃)
常温
常温
関連機材シカジーニアス® 分子疫学解析POTキット実施に必要な機器をご用意しております。詳細に関しては、別途パンフレットをご確認ください。
ピペットセット
スターターキットSTANDARD(BRAND)
希望価格 90,000円
電気泳動装置
Mupid®-One(Mupid)希望価格 62,000円
PCR装置
Gene Atlas E02 エコノミー仕様(ASTEC)
希望価格 480,000円
ゲル撮影装置
SCOPE 21(OPTIMA)
希望価格 339,000円
卓上遠心機
Micro-12( ニッコーハンセン)希望価格 73,000円
8連チューブ用ローター希望価格 18,000円
取り扱い機材例