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BIOQUÍMICA BLOQUE I BIOMOLÉCULAS 1. Concepto y contenido de la Bioquímica. Organización estructural de las células. 2. El agua: su papel biológico. 3. Glúcidos. 4. Lípidos 5. Aminoácidos y péptidos 6. Proteínas 7. Biomembranas 8. Ácidos nucleicos BLOQUE II - FLUJO DE LA INFORMACIÓN GENÉTICA BLOQUE III - BIOENERGÉTICA Y METABOLISMO

Compendio Lehninger Bioquimica

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BIOQUÍMICA

BLOQUE I – BIOMOLÉCULAS

1. Concepto y contenido de la Bioquímica. Organización estructural de las células.

2. El agua: su papel biológico.

3. Glúcidos.

4. Lípidos

5. Aminoácidos y péptidos

6. Proteínas

7. Biomembranas

8. Ácidos nucleicos

BLOQUE II - FLUJO DE LA INFORMACIÓN GENÉTICA

BLOQUE III - BIOENERGÉTICA Y METABOLISMO

Page 2: Compendio Lehninger Bioquimica

Bibliografía:

Cox, M.M. y Nelson, D.L (2009). (5ª edición). Lehninger. Principios de Bioquímica. Ed.: Omega.

Stryer, L., Berg, J.M., Tymoczko, J.L. (2008). (6ª edición). Bioquímica. Ed.: Reverté.

Feduchi, E., Blasco, I., Romero, C. y Yañez, E. (2011) Bioquímica Ed. Médica Panamericana.

Mckee, T., Mckee, J.R. (2003). Bioquímica. Ed.: McGraw-Hill Interamericana.

Page 3: Compendio Lehninger Bioquimica

BIOQUIMICA

Tema 1.

CONCEPTO Y CONTENIDO DE LA BIOQUÍMICA.• Áreas de estudio• Las raíces de la Bioquímica

ORGANIZACIÓN ESTRUCTURAL DE LAS CÉLULAS.•Células: procariótica y eucariótica (tipos y características)•Composición química de los seres vivos: elementos, moléculas y macromoléculas

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Objetivos de la Bioquímica

•¿Cuáles son las estructuras químicas de los componentes de la materia viva?•¿De qué forma interactúan estos componentes para dar origen a estructuras supramoleculares organizadas, células, tejidos, órganos y organismos?• ¿Cómo extrae energía de su entorno la materia viva?• ¿De qué manera almacena y transmite un organismo la información que necesita para crecer y reproducirse?•¿Cómo se controlan las reacciones químicas en el interior de las células vivas?

• BIOQUÍMICA ESTRUCTURAL

• METABOLISMO

• GENÉTICA MOLECULAR

Áreas de la Bioquímica

¿Qué es la Bioquímica?

La Ciencia que estudia la vida desde el punto de vista molecular

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Filogenia de los tres dominios de la vida

UnicelularesPluricelulares

Unicelulares

Unicelulares

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Características estructurales comunes de las células bacterianas (procariotas)

2 m

Page 8: Compendio Lehninger Bioquimica

Estructura de la célula eucariota

Célula animal típica

Célula vegetal típica

10-100 m

5-30 m

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Núcleo

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Mitocondria

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Cloroplasto

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Las células se agrupan en tejidos, los tejidos forman órganos y los órganos forman aparatos o sistemas, que forman en conjunto al organismo.

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Virus

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Figure 2-6 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)

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Los más abundantes en todos los organismos

Mucho menos abundantes,pero se encuentran en todoslos organismos

Metales presentes en pequeñas cantidades en todos los organismos, pero son esenciales para la vida

Se encuentran o son necesarios en algunos organismos en cantidades mínimas

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lípidos

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BIOQUIMICA

Tema 2.

EL AGUA: SU PAPEL BIOLÓGICO.

• Estructura y propiedades• El agua como disolvente de moléculas hidrófilas, hidrófobas y anfipáticas

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OH

H

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Hielo Agua líquidaAgrupaciones parpadeantes

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El agua como disolvente de moléculas:

HIDRÓFILAS (se disuelven en H2O)-con grupos capaces de formar enlaces de H-compuestos iónicos

HIDRÓFOBAS (no se disuelven en H2O)

ANFIPÁTICAS (parte de la molécula hidrófila yparte de la molécula hidrófoba)

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Moléculas polares

ProteínaAzúcares

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Moléculas iónicas

Hidratación de los iones en disolución

NaCl

Page 25: Compendio Lehninger Bioquimica

Moléculas hidrófobas

Estructura de clatrato que rodea a una molécula hidrófoba

Agrupación de moléculas hidrofóbicas en solución acuosa

Page 26: Compendio Lehninger Bioquimica

Moléculas anfipáticas

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Interacciones de las moléculas anfipáticas con el agua

monocapa micela

bicapa

liposoma

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BLOQUE I – BIOMOLÉCULAS

1. Concepto y contenido de la Bioquímica. Organización estructural de las células.

2. El agua: su papel biológico.

3. Glúcidos.

4. Lípidos

5. Aminoácidos y péptidos

6. Proteínas

7. Biomembranas y transporte

8. Ácidos nucleicos

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BIOQUIMICA

Tema 3.

GLÚCIDOS

•monosacáridos: aldosas y cetosasderivados de los azúcares

•oligosacáridos: disacáridos•polisacáridos de reserva y estructurales•glucoconjugados

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Funciones de los Carbohidratos

-Almacenamiento y generación de energía: almidón, glucógeno ATP

-Cofactores enzimáticos derivados de azúcares fosforilados: NAD, FAD

-Componentes de los ácidos nucleicos: DNA, RNA

-Elementos estructurales y de protección .paredes celulares de vegetales, bacterias y hongos.exoesqueleto de artrópodos.glucosaminoglucanos del tejido conjuntivo

-Glucoconjugados: participan en el reconocimiento y la adhesión intercelular. Actúan como señales de localización intracelular o de destino metabólico.

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TRIOSAS

Gliceraldehído(aldosa)

Dihidroxiacetona(cetosa)

Tautómeros

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aldosas cetosas

Enantiómeros

Tautómeros

Fórmula en perspectiva

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Enantiómeros

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D-aldosas

Page 35: Compendio Lehninger Bioquimica

Diastereoisómeros: treosa y eritrosa

Page 36: Compendio Lehninger Bioquimica

Epímeros de la glucosa

Page 37: Compendio Lehninger Bioquimica

D-cetosas

Page 38: Compendio Lehninger Bioquimica

Estereoisómeros

ENANTIÓMEROS: imágenes especulares no superponibles

DIASTEROISÓMEROS: no especulares

EPÍMEROS: diferencia en la configuración alrededor de un C quiral.

Page 39: Compendio Lehninger Bioquimica

HemicetalCetona

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ANILLOS DE PIRANO: anillos de 6 átomos

Aldohexosas.

Anómeros

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ANILLOS DE FURANO: anillos de 5 átomos

Cetohexosas

Proyecciones de Haworth

Proyecciones de Fischer

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Anillos de furano (C2-C5) y de pirano (C2-C6)Fructosa

Proyecciones de Haworth

Page 43: Compendio Lehninger Bioquimica

-D-glucopiranosa en las conformaciones de silla y de bote

-D-ribofuranosa en la conformación de sobre

Conformación espacial

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Azúcares como agentes reductores

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Terminología que describe la estructura de las moléculas deazúcar

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DERIVADOS DE LOS MONOSACÁRIDOS

-Desoxiazúcares

-Derivados fosforilados

-Alditoles

-Ácidos aldónicos

-Ácidos urónicos

-Hexosaminas

-Ácido siálico

-Ácido N-acetil-murámico

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Desoxiazúcares

Page 48: Compendio Lehninger Bioquimica

CH2OH

C

C

C

CH2OH

H OH

H OH

H OH

D-ribitol

COOH

C

C

C

C

H OH

HO H

H OH

D-gluconic acid D-glucuronic acid

CH2OH

OHH

CHO

C

C

C

C

H OH

HO H

H OH

COOH

OHH

Alditoles Ácidos aldónicos Ácidos urónicos

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H O

OH

H

OH

H

NH2H

OH

CH2OH

H

-D-glucosamine

H O

OH

H

OH

H

NH

OH

CH2OH

H

-D-N-acetylglucosamine

C CH3

O

H

Hexosaminas

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N-Acetylmuramic acid

Ácido siálico(ácido N-acetilneuramínico)

Ácido N-acetilmurámico

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Derivados fosforilados de los azúcares

Page 52: Compendio Lehninger Bioquimica

Derivados de las hexosas

Ácido aldónicoÁcido urónico

Page 53: Compendio Lehninger Bioquimica

HemicetalCetona Cetal

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Formación del disacárido maltosa

Extremo reductor

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Disacáridos

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Polisacáridos

almidón y glucógeno – combustible biológico soporte extracelular celulosa y quitina -- elementos estructurales

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Gránulos de almidón Gránulos de glucógeno

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H O

OHH

OHH

OH

CH2OH

HO H

H

OHH

OH

CH2OH

H

O

HH H O

OH

OHH

OH

CH2OH

HH H O

H

OHH

OH

CH2OH

H

OH

HH O

OH

OHH

OH

CH2OH

HO

H1

6

5

4

3

1

2

amilosa

H O

OHH

OHH

OH

CH2OH

HO H

H

OHH

OH

CH2OH

H

O

HH H O

OH

OHH

OH

CH2

HH H O

H

OHH

OH

CH2OH

H

OH

HH O

OH

OHH

OH

CH2OH

H

O

H

O

1 4

6

H O

H

OHH

OH

CH2OH

HH H O

H

OHH

OH

CH2OH

HH

O1

OH

34

5

2

amilopectina

1-4)

1-4)

1-6)

almidón

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H O

OHH

OHH

OH

CH2OH

HO H

H

OHH

OH

CH2OH

H

O

HH H O

OH

OHH

OH

CH2

HH H O

H

OHH

OH

CH2OH

H

OH

HH O

OH

OHH

OH

CH2OH

H

O

H

O

1 4

6

H O

H

OHH

OH

CH2OH

HH H O

H

OHH

OH

CH2OH

HH

O1

OH

34

5

2

1-4)

1-6)

glucógeno

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Estructura de la amilosa

Celulosa

10000-15000 unidades

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Quitina

N-acetil-D-glucosamina 1-4)

Page 63: Compendio Lehninger Bioquimica

Peptidoglucano de la pared bacteriana

Page 64: Compendio Lehninger Bioquimica

Unidades repetidas de algunos de los glucosaminoglucanos más comunes de la matriz extracelular

Ácido hialurónico

Sulfatos de queratán

4-Sulfato de condroitina

Page 65: Compendio Lehninger Bioquimica

Glucoconjugados

Page 66: Compendio Lehninger Bioquimica

Estructura del proteoglucano de una proteína integral de membrana

Page 67: Compendio Lehninger Bioquimica

Unión de oligosacáridos a glucoproteínas

Page 68: Compendio Lehninger Bioquimica

Lipopolisacáridos bacterianos

Page 69: Compendio Lehninger Bioquimica

Papel de los oligosacáridos en el reconocimiento y la adhesión a la superficie de la célula