98
Indian Institute of Pulses Research Kanpur-208 024 Technical Bulletin ICAR Hkkd`vuqi DNA fingerprinting of major pulse crops of India Hkknvl P F O U L E S T E U S T I R T E S S N I E A N R A I C D H N I

DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

  • Upload
    others

  • View
    3

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

Indian Institute of Pulses ResearchKanpur-208 024

Technical Bulletin

ICARHkkd`vuqi

DNA fingerprinting of major pulse crops of India

Hkknvl

PF O U LE ST EU STI RT ES SNI E

AN

RAI CD HNI

Page 2: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

DNA fingerprinting of majorpulse crops of India

P.K. AgrawalP.R. ChoudharySubhojit DattaN.P. SinghMasood Ali

Indian Institute of Pulses ResearchKanpur 208 024

Technical Bulletin

INDIAN INSTITU

TE OF PULSE

S RESEARCH

ICAR

Page 3: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity
Page 4: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

Contents

Page No.

Foreward

Preface

1. Introduction 1

2. Pigeonpea 7

3. Chickpea 23

4. Mungbean 39

5. Lentil 51

6. Fieldpea 65

7. References 79

Annexure I 83

Annexure II 85

Page 5: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity
Page 6: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

List of Figures

S.No. Title Page No.

1. DNA profile of pigeonpea cultivars obtained with RAPD primers 17

2. Dendrogram of pigeonpea varieties constructed using UPGM A based on RAPD primers.

19

3. M ultidimensional 2D plot of pigeonpea genotypes generated from RAPD data.

20

4. RAPD profile of chickpea cultivars amplified with RAPD primer, OPAM -14

36

5. RAPD profile of chickpea cultivars amplified with RAPD primer, OPAC-1

36

6. Dendrogram derived from random amplified polymorphic DNA analysis of chickpea varieties

37

7. RAPD profile of mungbean varieties using RAPD primers 45

8. Dendrogram derived from random amplified polymorphic DNA analysis of mungbean varieties

46

9. Non-Polymorphic banding pattern of lentil genotypes (1-31) using RAPD primer, OPAC-20

62

10. Polymorphic banding pattern of lentil genotypes (1-31) using SSR primers.

62

11. Polymorphic banding pattern of lentil genotypes (1-31) using SSR primers

62

12. Dendrogram developed by use of RAPD markers of lentil varieties

63

13. Dendrogram produced using SSR markers of lentil varieties 64

14. RAPD profile of pea varieties obtained with RAPD primers 75

15. Dendrogram of fieldpea varieties constructed using UPGM A based on RAPD primers.

78

Page 7: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity
Page 8: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

S.No. Title Page No.

1. Brief information about pigeonpea cultivars used 10

2. Analysis of the amplified DNA fragments obtained with 76 RAPD primers in various cultivars of pigeonpea

14

3. Genetic similarity matrix of the pigeonpea cultivars 18

4. List of chickpea cultivars and their parentage used in diversity analysis

26

5a. List of RAPD markers used and the presence of polym orphism for different primers

32

5b. List of RAPD markers used and the presence of polym orphism for different primers

34

6. Description of mungbean varieties used in diversity analysis 42

7. Scoring of polymorphism in 24 mungbean varieties using RAPD primers

46

8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis

54

9. List of RAPD markers used for the diversity analysis 58

10. List of the SSRs used for the diversity analysis of lentil 60

11. List of fieldpea varieties and their pedigree used for molecular diversity analysis

68

12. Analysis of the amplified DNA fragments obtained with RAPD primers in various cultivars of fieldpea

70

13. Efficiency of RAPD primer system in detecting genetic diversity in fieldpea cultivars

73

14. Genetic similarity matrix of 24 elite cultivars of pea 74

15. Analysis of DNA fingerprints using 60 RAPD primers 76

List of Tables

Page 9: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity
Page 10: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

Foreword

India is the largest producer as well as consumer of pulses in the world. It accounts forabout 25 per cent of the global share. However, the growth in pulse production could notkeep pace with the burgeoning population, resulting in the shortage of pulses in the country.In order to meet domestic requirements, we import 1.5-2.0 million tones pulses annually. Tobecome self sufficient in pulses, we need to increase production at annual growth rate of4.02%. This requires a sea change in the strategic research, technology generation anddissemination, and commercialization along with capacity building in frontier areas of researchlike genomics, transgenic development, bioinformatics and molecular breeding.

In India, a large number of pulse crop are being grown since ages. Indian nationalprogram in association with State Agricultural University and international institutions havedeveloped more than 500 varieties of different pulse crops. The national gene bank conservesmore than 34,218 accessions of different pulse crops. As a result of replacement of oldvarieties/land races by modern day varieties, there is loss of diversity globally which is amatter of great concern. In order to contain the loss of genetic diversity and sustain agriculturalgrowth with maximum advantages, several steps are needed to be taken. The enactment of“Protection of Plant Varieties and Farmers Right Acts” (PPV & FR), 2001 and NationalBiodiversity Act 2002 are the important steps in this direction. For the purpose of safeguardingour interests and meeting obligation under TRIPs, India has opted for an effective “Suigeneris” system for plant varieties protection. The country has already shown its preparednessas DUS (Distinctness, Uniformity and Stability) tests are already underway in twelve majorcrops of which six are pulse crops. The varietal characterization can be made more stringentby supplementing DUS results with DNA profile of concerned variety.

In order to characterize varieties/cultivars, data on DNA profiling was generated whichwill be helpful in identification of cultivar/variety, detection of duplicates, varietal registrationand protection of plant breeders and farmers’ right. In this publication, an effort has beenmade to obtain fingerprint data on important varieties of chickpea, pigeonpea, mungbean,lentil and fieldpea. I appreciate the sincere efforts made by Drs. P.K. Agrawal, P.R.Choudhary, S. Datta, N.P. Singh and Masood Ali for generating information on DNAfingerprint of important varieties of major pulse crops in present form. I am confident thatthis publication will be useful for plant breeders in selection of appropriate parents forhybridization, removal of duplicates in gene bank and registration of varieties for protectionpurposes.

(P.L. Gautam)Dy. Director General (CS)

ICAR, Krishi Bhawan, New Delhi

October, 2007

Page 11: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity
Page 12: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

October, 2007

Preface

India produces a wide range of pulses, the major ones being chickpea, pigeonpea,urdbean, Mungbean, field pea and lentil. Although, the varietal improvement program inpulses are continuing through conventional breeding and hybrid technology in few cases,unlike major cereals, these crops have not benefited much through the advances in molecularbreeding. This is mainly due to the lack of comprehensive information about the variability inthe gene pool. The information on genetic characteristics of cultivars and germplasm linesand detection of duplicate accessions is an essential step to exploit genetic resources inbreeding program.

W ith the introduction of Plant Variety Protection Act under GATT, the need of precisegenotype characterization with clear Distinctness (D), Uniformity (U) and Stability (S) hasattained greater importance. Therefore, proper documentation and genetic cataloguing ofgermplasm is becoming necessary in the era of patenting, intellectual property right andpiracy of genetic materials. The developments of PCR (Polymerase Chain Reaction) basedmarkers have opened new avenues for genotype identification. Along with the morphologicaland agronomical data, the DNA fingerprinting will be able to estimate genetic diversity andestablish the identity of genotypes without any ambiguity. IIPR being the premier nationalinstitute on pulses research, the institute has the responsibility to characterize the germplasmsof mandate crops.

W e express our sincere gratitude’s to Dr. Mangala Rai, Secretary, DARE & DG, ICAR,Dr. S.P. Tiwari / Dr. P. L. Gautam, DDG (Crop Sciences), ICAR, for their constant guidanceand encouragement in bringing out this publications. An effort has been made to fingerprintthe released varieties of the major pulse crops which will go a long way to help breeders andbiotechnologists to identify the suitable materials for hybridization and also will offer a platformfor establishing identity of our indigenous pulses germplasm.

Authors

Page 13: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

����������

������������������ ���� ����� ���� ��� ��� ����������������������������� ���

������� ���� ����������������� �� ����������� ���� ��� �������� �������������!����

� ����!�"� ��#$ �%�&���'����(��)��*"������� ������� �+� ��� ����������� ���� �

� �� �����"��"�����'�#� +)������%����'�$�,+)��� ��������'���+)��������'���+)��� ����

'�+)��������� �����'�� +)��-����������� ������������������ ����!�"�������#�+

������# +��������!��"���������.������/�0����.����������1"�������������2 ������

� �������� ��������������!������� ����+����+���+���+�����$+��������!��"�

������������������ ������ ����������������� �����������������������"��������

�3������� ���� �������� � ���� �� ����"� � ���� ���� ������� � ��� ���� �� ��� ������

��!� ����� ���������������*������������� ������������� �������"��������!�������� ��

� ���� �� �������������������� ��������������� � ��������� �� ���� !�����������

"���������"����� ��� ������������������%� ���������!�������"������������������ ��

�����������"� ������������ ���� ���������� ������������� ��� ��������!�"��� �

�"��� � ����� ��������������"��� ������������������ ����!���� ���������� ����� �� �

������ � �"�

. �!��� ������� ��� ��� ����� !�������!��� ���� !���� ����!�"� ��������

�����������"����� ���!������� ����-�������� �������� ����������� ���������/�������

���%� ������������������ ��������������������%���������� �������� ����� ���4������

��!�� ����� �� �� !���"� ��� � �������� � ��� �������� ������ �� �� �������� ���

/� ���� � �"���������������������������������������� ������ ����������"�����

���������������� �� ��� ���������-������������ � �"�� ������ ���� !��� ��� ����!�"

� ����� ��������������� �������������"���������������������� �����������������

����������������0������������ ��������-��� ��� ���� ���� � �"����� ���!��������

����������������������������������!��"� ������������ �!��� ������������ ���� �

��� !�����

���������� ����������������� �����������������5��!���"�����������������"���!�� ���

����!�� �3����� ��� ����,�� ���� ���"� ��� �� �����������"� ��������� �� �� ��!������

���������"�������������!��������-���������������� ��� ��!�������"�����3������� ����"

��������� ��� ������!���� ����� ��� ����!���"�� ���� �������"�� ��� ������������ ��

�� ��������� ��� �����������!���"����������������������� ������� �� ��� ��������

�����3�������!���������!�������������� �����%�������-���6� ��� �� �������7������

����8�����9�����:��;�������������"�����������������������������������������������

� ������������ ��������� ����������������� ��� ���������������"�������%���!�������

�����4����"��������������������������� ������������������ �� ��:���������������

������������!�� ���������� �������������5��������:� !�������������� ����������

�����������

Page 14: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

���������������� ��!���"� ��������� ������������� �������� ������ �� ����� �����"

������� ����<!������!������� ��!�� ���������� �����!��� ������������������ �� �

��������,�����������������,,��� �����!�� ��������!�� ����� (��������0 �����1��"� �

�����!���������!�������"������ ������������������������������������� ������"����� ��

/��������� ��"���� �� ��������� �� ���� $���#�������� ��� ����������� ���������

������� ����-������� ��������������� ����� ���"��������0����� ���!�����������0��

������������ �������=������*>=������������"�������"�������"�� �������������

���������� ������������ ��*?:����������� �������!������&��������������������"

����������9��������

������ ������� ���:������� ��-����9������:������ �� ��� ������������ ��"

9�����'-9���)������ ���� ���� �������������� �������������������� �� ������ ��

��������-9������� �������� ���������������:����,�������� ������������,,$�

������������� ���!�������������>�<7�� ����� ��� �� ������!������� �����������

�������� ��������@���!���=��0�������-���-9�������������������' )'�)���!������ �� �

�������� ������ ��� �����������!��6����������;��"����� ������!�������� ��� ��

/"��� ��������"����������� ��3� ��>�<7�'�,�#)�������7�A�89�:����������������

���������������"����������������� ���"�����8 �� ��� �� �������!��������*>=

'*�����������>��� ��"�����=�����")������(�4�������� ������"���-����*>=����������

������ ����������"������������������ ��*?:�� ������� ��!������������������%���

� ��� ��

1 ���������%������ � �"������! ��� ��0����������������� � ���� � ��������������

��������������*?:(������� ���������%�����!����������!������� ���������!��� ���

��������"����!�� ������������%���3 � �"����"�� � �"�����" � �"������������������������

-��"����� �� ����������� %����� ������������*?:���������������%������!�������"

�������������������������������������-�������%������� �����"�������� ������� ��������

��������"����� �������� ���� ��� ��������� ����� ����� �������"�����-�����������������

�����!�� ����� ����%�(�������������������(�������� ����� ���� � ������"���� ��

�������!�������"�����������"� �����������"������"���"������������%�(�������������� �

�������������� "��������-�������!��������������� ��� �� ��������� �� ���������

������%�(������������ �� ������� ������ ��� ��������� ����!�� ����������������

!��������-�����*?:���%��� ������!������!������� !������ �������� "������%���

�����"�� !����������������������"0��� �2���!��"�

<!������������������������������ ����������������������3����!��"����������� �

���! ��� ��������������1 ���������%������������ ��������� �������"�������!��� �

��� ��������� ��� ����������! ��� ���*�����������"���� �� �������������������

�������� ������������ "������%����������� "�����������������"���� ������������(

�������(��������!�������"��������� "����������������� ��� ��� � ������������������

��������� ��!���� ���������%�����!��!�"������"�� ������������������������������

Page 15: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��� ������ � ����1 ���������%��� �������� �� ��������� � �������� '����� ��� ���"

���� �������������)�������� � ��������!�0���� ����������� 3"�� ��������������'*?:)�

:���"���� �� ��� ���"����� ����� ����� ��!��� ������� � � ��������� ���� ������

������������� ������ ��������������������"�����"0����������������������������������

!��������-��������� ������������������������������%����� �������������"�������

��!� �������������� ��������������������B�������� ���� ���� ���������%��

������*?:���%������� �����������������4�� ��� �� �� �������!���� ��������

-�������"� ����"���%���"���������"��������� ���������� �"� ��������������

����������"����������������������� ��� �������� ������������������� ����� �� ��� �

� ������ ���� ���!������ ���� "�����:�� �����*?:���4������������������� ���

��� ����� �������"����!���� �������� �����������3�����!��������� � �����=�!���������4���

��!��� ���� ��� ����� ��!�� ���� ��� ��� ���� ����"���� � � !������0����*?:� ��4�����

� �"� ������

�� ������������

-������*?:(������������������ ������� �������������"�C����"�'�,#�)�

�������� ��(� ��(��%��*?:� ������� ������ �������� �"������ ���� � ���� ���

���� �� ���������� �� ����� ����*?:����������-�������������������%������

���4���������� ���������"0�������!������������������"�� �������� ��������������

��� ��� � ����������!������0�� ���9�����"��������*?:�������������&�� ��������������

������������� ����������� ����!������������ ��������� ���"�������������������������

!������� ���� ���!���������!�� ���������� ���������� �����-��������������������0�� �

���������!�������"����� ������������������� ������������������ ����0�� �������"���� �

��� ����! ��� ���� ����� ������������3 � �"������������������������ �����

*?:������������������������� ���"������������ �������!������� ���� ������

������������ ������"��-��� ��� ��*?:������������������!��������������������=����

������� !�"��*?:���������������������������"���������D� �������:������� �!�� ��

��� ������%��������������"����������������� �������"����� ��������"����� �����������

������� ������%��������*?:�������������������� ��������������������"�����������������

���%���� ����������� ������������� �����������������������"���������� ����� ��������!������'�)�

����������������������������������� ����������������� �� ������������������ ���� "����

-���� �������� �����������������0��� ���� �����������4������� ��������������������

��� ������ ���� ��!������� ��������� �����!����!�"������������ ���� �����������

���������:� ������������ (�� � ������"���� ����������������� �������2 ��� � �����

�� ��������� ������������������������������������ �����������������!������!�������

��������������������� ��������������"��� ��� � ������"���� ����������� ����� � ��"

���� ���!��������� ��� �������� ������������ ����9��������� ����� �!��� �� �

�� � ��������!���"�

Page 16: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

�������������� �������������

-���*?:� ��������������� ��� ����� ���"���� ����������� �� � � ����� ����� ��

B"����0�� ��������*?:��������������������)��.9�������*?:�������������

����������������

98E��'9����� ���������������� �"� �����)�������� ���������� ���������*?:

� �"� �������������"0���� ����������� ����������� ����'������ ������������� �

����� ������� �������� �����������")��- � �������"������*?:������������ ������

����� ������� ����3���������������"��� ���0������������*?:�� ����������� ���"�

D���� �� ����� � ��� ����������0����"�� �� � ����� ��������"�� �� ������"� ������

*?:�� ������� �������������������������������� ����98E����������������� ����"���

���(��������(�����������������!���� ����� ����������!������������� ����� �������

��� �� ����������*?:�� �����98E���������������� ��������� � � �������� ��

�������������������"�� �� �������������������

�� ������

��!�"����������� ������#�� ��� �� ��! �!��� ��� ����������������� �� ���������

*?:���4������������������ �������������"� �������"��� ���� ��� ����� ����������

���������� �������*?:�� �"�������� �� �����"����� �� ���������� �� ��������������

���������.9�� �����������������������������,#��'F�"�1��������� ���,#�)��������

����������4��������! �!������������0"��������������� �� ������*?:�������������

���� ���� ����������"��������������������� ���3��"������.9������������������

��!�� ����������� ��� ������ � ����������������������������������� ����� �����

���# ����"� "�!������!�"������� �

����������,,���� �� ��������G���������1�.�������������G����������� �����������

� ��������.9�H�����������������"� ��� !�� ���� ���������%� �� ��� ������!������

���������� ���-����� ������� ����! �!������� ������������� �������'�� ��������� ����)

����@.�� ���� �� ��+(#�+��-�������� ���� ��4���������� �������� �� ��� ���-���

� ��������.9(�����������������"����%� ������9��� ��:���������� �"� �����*?:�

9:�*�'� � �������������)��-�����!�� ����� ��9:�*���%������ ���� �����3������ �

����� ����!���� ����� ���� �%� ������� ��*?:���4�������-�����.9���������� �

� ���� ���! �!������������� ���������4������������� ��� ������!��"��������� ���

*?:��������������"����������"���(���� ���(��������������������������� ��� ����

'�"��.9)�������������4����"��������� ����� ����������� �� ������������������� �

��������� ���������!������0�������������!� ��������'G����������� ���,,�)���-���������

��%�������������������� �������!�"� �����������!���"�����!�������"�!���� ���

Page 17: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��������������� �������� !�������� ��� ���� ������� �������������� �� ��������

��!���"������������� ���� ����� ���

9:�*� ����� ��!���� ��!������� !�� ��� � �� ��"������ �����4��� ��%��98E��

-���9:�*������4��������������� ��� ��� ���9:�*����� � �"������������������������ �

�������4������ "���� ����!���� ���������� ����� ���-���9:�*������4�����������

��������������"�� ��������"���� ����!���"����"� ����������� ����������������� �� �������

������������ ��� ��� ����� ���������������� �� �����������������������������������

� ����� ���-�������� � �"������� �� ���� ������!������������������� ��������"��������������"

� ������ ��������������� ����� ��������"������������ !������ ������"��������������

�� !���������%��� � � ��� ��!�� ����� �� ������������ ���� ���� ����� ����� ��� � �

��� !������ ����������������������������

9:�*���%������������� �� � � ������������ ������� ���� ����������������

������������������!�������"������!������������������� �������������%��7��!�����1�����

-�3�������/�� ����9:�*�������� �������������� ���!����� �������� ��������������

��!���"������������������������������������"��������������������-�������%���� !�����

��!��� ���� ��� ���4��!����� �98E����������� ������������ �����%���"�������

��� ��������� ������

$$ ��#$"�!��$�%����� �������

-�������"���� ����� ��������*?:�� ����������������� �� ���� ����� �� ����� �

����"�����1�� ��������� ���� ����� ���� �'�(����)�������"(������������ ������"�

�� �������"����4�������%������4�������I�-������ ���������������� ��� �������� ��

��������������������������������������������������� �����"�� ���������3����� �

�������� � ������������� ��� � ���� �����!�"���( ��%�� �����������:���������!����������

��� 0"� ���������"������"��3����"���������==9����������������� ����� �� ����������

������� 0"� ����������3����� ����#������ ���� �� ��I9���!��� ��==9������� �����

���"������������������ ����������!��� ������������� �������������������� ����'@���

��� ���,,$)��G������"���!��������� ������������ ���������� ���������"��� ��������

� �������������"� � ��������������!��� � ��������������������������������:������

��������������!����� ��������� ��� ���==9���������������������!���� ��� ��������

1�� ����������4�������������������"�������� ������������������������ ���"������

��� "��������������� ����! �������� ����� �������������� ����������� �� ���� ���"

����������!�����==9����!��������� ��� �� !������� ������������� ����������� �

��������� ���"���������� "����������"��������������

8 �� ������ ������� ����������!���� ������ ������������� ������� ��� ��� ��

���� �� ���� ��������� ���������� �������������������"����������������������� �

!��������� ���������������������������������2� ����0�������� ������� ����������������

Page 18: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��� !����� !����� �������-����������3����"���� ��� ����"������������ �� ��� � �������������� ���3������� ���(��"�����!������� ����� ��������������� ��������������������-���������� � ��"�� !������� ��� �� ��������"� ����������� ���������������� ������������������ ��������������������������������������������� �������� ��������*?:�� �����������%��"� �� ������������������ ��� !������������*?:�� ������� ��%���������������������� ������� ��������"����� ��� ������������

:� ��� ��� !�� ���� ���������%���� �.9�������9:�*���%��� ��!�� ��� ��� ����� �������� ���� �������� ��� ��� � � ����� ��"��� � ��� ��� �� �� �� ��� �����4������� �� ��� ��� ����9:�*����� ����� ���� �� ���� "��� �����4����������� �� ������������������*������4���� ����� ������� ��������"���������"������!���"�����"������������������� "������������� ������������3�� ����������"��������������

1��"�*?:���%���� ��������������������������"���!������������� ������ �*?:������������ �� !�� ��� �������� �� ���������� 8���� ������� ���� =-1='=�4������-������1�� �=������)���%�����"���� �� ������� ������ ������� ��� ������! �!������� ������������� !������������������ ������������������� �� ��� �������������������� �������������������������!����������������������(�3������� ��� �!���� ���:8E��':������8������E������ �"� �����)�������������� ��� ���������%��������������� �����"������%��� �������"� ���������� �"� ���������������"����������������� �"� ����������3����"���������� ���"���� ����%�����=������"����� ����� ���==9���%�������������3�� ����� ���!���"�����"���� �������� ��� ���������-�������������!�������������������������� �� ���3�������� ��!���"��� ����������������������������3�� �������������� ����� ��� �������������������������

-��� �����!����������"�*?:���%��� �����%��� �� �� ���� ������ "����� �����!����1�� �����������%��'.-)�����'@::)����'::@@)�$��'::-)���'�� )��'@:-:)�$�'.:.)����������������������!����������� "������*?:�������������� ��������� �� �������� !���� ��� ����!�� ���������� �� ������� "������-���� ��� ��� �� ��� ������� � 4��������� �� �����������!���"���������0�� �� ��������� ��������������������� ����� �������3 � ������������1�� �����������!��������������� ������� �� ��=-1=���%����!�������� �"� ��������������� ���"�����������!����-��������������� �� ����� ���������������������������������!������������ ������������� �����������!������������ ���� "�����4��! ����"���!������������ ��%�� ���������������!����'������������)�� � "��������-���������� ������������"�� �� ��� �� ��� ����"�����������=������"���� ���������%�����!����� ��������!����� ������������������"���������"���������������� ����-����������������� ���������%�������������� �����!����������!�������"������ ��������"�� ��������������� ������������������ �������!������� �������4�� ���"���� "������ ���������� �����������"��������������������<��� ������ ��������������� ��� ��������%�������������� ��������3����������� �� ���� ��� �������������������� �������� ���'@:-:)�$����� ���� ��!������3(�����������������������= ���������"����������������������������� ������%����������"�������������������������������� �� ��� ����"��3(���������� �� � ����������������������� ������

Page 19: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

Page 20: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

Page 21: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

&�'������

���� �������� ��� �������2 �������� �� ����� ������������ ��������� ����������

��� ���� ��� ��������� ����������� ���� �������������������%�����������������,�

������ ��� ��5����������� ���� ��������� ����������� ����� � ��������� ��������� �

������������������ �� ���� ��� ���� �� '8:<������)��:� ��� ���!���"� �������� �

���� ������ ����"� ������ ��� � %��� ���%�� ���%� � ��� '��� )��-���� ���� � ���� �

���� �������������� ��������������"�������� ��������������������#��� ���� +��-��

��������%���� ��������������������!�������������������������������!��������� ������

��������%�� ����/�������������������3����� �����-�������������������"�� � ��"������

��� ����������������� ���������� �� !���������� ������ ����

D����� �� �����������!���"���������3�� ��� �������������� �����������������

� ����� !������G����"��� �����.9���������%������ � �������������9:�*���==9

����=-1=�������"������������ ��� �������� ��������"��������������� ����������

��� ���������!������ �����!����������������!��������9:�*�� ��������������������

����������� ������ � �"������������������ ������%�������������������� ���� ��

��������� ������������������!���"�������������������= ���� ��"���������������!������

����� ��������0��������������!���"�������� ������"�������*?:���%�����G����������

������������!���"��������� ������� ��� ���������!��&��!���������������������!�� ���

�������������� �������������� ��������������������-�������� "����� ���������������"

�� �������� �������������( ��������� ���� �������� ����-�������� "������������"

��������� ��������������"������������!�� ������ �������1 �� ���������������� "������

��������� ����!������������������ ������!�� ����� ���������������� �J���!�����������

� �� � ������������������"���������� ���������9:�*���������������� ���!���"

����"���������!����� ���������������������������-���� �����������"���������������"� �

���9:�*���%���"���� �����������������!�������"��� ���������� ����������� �����

����� ��3�����4���������� �������"����� �������� "�����������������9:�*������

������ �������� ��������� ���������������������� ��

�!����"�����!

:� ��� ���$����������!���������!�������������������� ������ �������������������

� �� � ������!���� ��������"�� ������ ���������0 ���������������������������

� ����������!���"���������:����������!���������!������������������������������������

���"���!���������!�� ����� ��?�� �������������� ������������������&���!������

� ��������������'-������)��:��� �������������������� �������� ��� ��� ����� �����������

�"�������� ���������������������������� ���������9��������F������������

Page 22: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

(��!��)� ��&���� ����"���������������������!�*��������

�+�

��+�

� ������� ��� ��������

� �������

��������������

������������,,�

������������- ���

���������,�

��� �������� ��� ����������

�������

���������������

��� ����� �

���� �� � ��

������������ �

!����"#�

� �����$��#�%�����

�� &�'��� &�(��)�!�$��� ��������� ���� �� � ��

�&*�

!+��,���-�#�%����.��

/�� &�'��/� ,&�(��)�&��

���.�

)�!�$����

��������� ���� �� � ��

�&*�

!+��,����#�%����.�

��� �*���� '�������� ����

������01���2�#�

3���2��*$� ��

,����.�

4����� ����� #�

��� ����� #������

����

���� �� � ��

�&*�

%%���,����#�%����.�

5�� �*��6�(�� !�$���7�%4�����/� ��������#�

��� ����� ��

8�����������#�

���������#�$��$�

8�������

���� �� � ��

�&*�����

������������ �

%%���,����#�%����.�

��� %������ '�������� ����

�����9�2��2��

,����.�

������������� ���� �� � ��

�&*�

%%���,����#�%����.�

��� %������ !�$���7�%4�'�

���/�

4����� ����� #�

���������

���� �� � ��

�&*�

%%���,����#�%����.�

��� %���/(�� !�$���)�%4�'�

6�5��������

,%4�%��"����.�

4����� ����� � ���� �� � ��

�&*�

%%���,����#�%����.�

6�� %���/(�� !�$���)�%4�'�

6�5��������

,%4�%��"����.�

4����� ����� � ���� �� � ��

�&*���

������������ �

%%���,����#�%����.�

��� %4�'�

���/�

��� ���������

%4�%��"�

��������������

�����������������

� ����� �

���� �� � ��

�&*#����������

��� �������!�

%4�%��"�,����#�

%����.�

���� %4�'�

��/6�

��� ���������

%4�%��"�

��������������

������������#�

���8������ 2�� 8#�

����� � ���� ��

��������

���� �� � ��

�&*�

%4�%��"�,����#�

%����.�

Page 23: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

���� %4�����/� ��� ���������

������������

&�$����$ ���

��������#�

��� ����� #�

8�����������#�

���2������

���� �� � ��

������������ �

%4�%��"�,����#�

%����.�

�/�� %4�'�

����6�

4(���)�%4�'��� %�� ����� #�

���������

���� �� � ��

������������ �

�����&*�

%4�%��"�,����#�

%����.�

���� �2���6� ��������)�

/��/�

%�� ����� ���

�� ��

���� �� � ��

�&*�����

�� �������1���$ �

%��%�,:��*�$�#�

%����.�

�5�� �2���66�� ��� ���������

%4�'�6/��

%�� ����� #�

���8��� 2�� 8#�

�������������

���� �� � ��

������������ �

%��%�,:��*�$�#�

%����.�

���� 4;�5� &2 �� ����4���� �����������������

12�$8�

&���� �8�

���� �� � ���&*�

":���,"�:�#�%����.�

���� 4;��� &2 �� ��������� %�� ����� #�����

���������

"����� � ������

1����

":���,"�:�#�%����.�

���� !&���

�5/�

,%4���//��)�

!*:(�.�)�!*:(��

��������#������

�����$� �����

���� �� � ��

������������ ������&*�

���#�!�����2�#�

,&���#�%����.�

�6�� ����� ��� ���������

!�$���

%�� ����� �����

�� ����� $�$�1� �

���� �� � ��

�&*�

4�����"#��

3���2�#�,����#�%����.��

��� !�$��� ��� ���������

������������

&� �$���#�!�$���

%�� ����� #�

������ ����� #�

8����������#�

���������

���� �� � ��

�&*�

���#��2��#��

,!�$��#�%����.�

���� "(�� ��� ���������

������������

'2�0����

4����� #��� #� ����

$��$�8��������� $�

���������

�2��� �1�� ��

��� ������&*�

4�����"#�3���2�#��

,����#�%����.�

���� *�(��� !�$���7�:��,<�.�

�5�

4����� ����� �� ���� �� � ��

�&*�����

�� �������1���$ �

���#��2��#��

,!�$��#�%����.�

�/�� :*�(�� ��� ���������

������������

=��>�1��#�,����.�

%�� ����� #�

������ ����� #�

$��$�8�������

���� �� � ��

�&*#� �������

����� �

:*���"#�=��>�1��#��

,�����%����.�

���� 3�'��/� ��� ���������

!�$���

%�� ����� #�

������ ����� �

���� �� � ��

������������ #��&*�������!�

%%��#�3���2�#��

,����#�%����.�

Page 24: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

K:���!��� �� ����������� ��&���!������L

/B>L�/������B�����>��!���"J� ���9L� ������� ������� ���������9������J� �.9�=:-L

������ ����. ���9��������������� ����=���(:���- ����J��:9�L��������:��������

9�������������J�-?:>L�-�����?����:���������>��!���"J�:9=L�:���������9������

=�� �J�.=:>:A-L�.������=��%���:0���>��!���"� ��:������������-���� � �"J�9:>L

9�2�����:���������>��!���"J�?*>:A-L�?������*�!��>��!���"� ��:�����������

-���� � �"J�@/�>:A-L�@ !����/�����������>��!���"� ��:������������-���� � �"

K:���!��� �� ���������� �������L

>���M�>��������J�1���M�1���"��������J�:���M�:�����������J�1�=�M�1�������J

-�?�M�-�����?���

:���!��� �� ������� �������KKL

=1*�M�=����"�1 �����*������J��=/�M���" ��� ��=���/����

�������!���

�� ��.������

@�� ����*?:�� ����������� �������������������3������ �����%���������������

'��� 3�����"���������)�����%���� �� ���� ��� ���" ����������������� ��� �� ��*?:

����� ��������� ������ �������� � �� ��@���������A�E�������'�,,�)��� ��������

������������� ���� ���!�"����������������������������������N�����1�� �����������

�B�$�#J������1�?�.�J�����1�D*-:���B�#��J�����1�-�����B�#��J��+��7��'1G������)J

��$+�=*=O������������������P.�� � ����������-��������! ����� �������1�:�� ����

���������������� �� ������ ��������%��� � � �� ������������������.� � �� �����"

��������� ������F����� ������������=�������������%��� ����������! ����� �

���������� (� �"����� � ����������������%�����H���.�� ������������ ������������� �

��*?:��*?:������������� ���"���������� ���������� �����������+����� �����

���� �!������-D�������'����1�-���������1�D*-:���B�#��)��*��� �!���*?:�� ��� �����

�3������������� �L�.�� � �L��� (��"����� � ��'��L�$L�)�����9?:������� !����"

9?����������'Q�$�R�&��� ������������ ��� �%� ������&��� ��9?:��)��� ���.��

�����9?:��������*?:�����������3��������������.�� � �L��� (��"����� � �

'�$L�)�� �������������� ���*?:������(������������������������� ��'����+)��������� �!��

���-D����������������*?:���������%���� ����4����"�����4����"��"���#+���� ������

Page 25: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

���� �� �����������������������'λ)�*?:�������������%��' �����&R�)��*���� �� ����

*?:�� ��� ������� ���������-D������� ���� ������ �� ����� 3�����"��������&�R���

��������.9�����"����

�� ��"�!�����������

�.9����������� ������������ ���������������(������.9��������������1C�9������

*?:�D�������������"����'� �����-.����)��:� ��� ������9:�*�������'��������

������ ��������<�S��<�:T��<�:U��<�B�����<��� ��<�� ��-���� � ������:�������

.:��>=:)���������������� �����������"������������� ���*?:�� ����������������

�"����������'-������)��� �"���������������� ��'�.9)���3��� �����R��� ������������

����� ����*?:�������������>� ������*?:�� �"������'/����� ��@������/����� ��

�����)���� �R1� �������������������R�� �����S��.9�����"�������'����1�F.�������1

-��(.��������1�1�.��)����������R�� ��� �����?-���'�����1������ ���:-����.-����@-�

�����--��� ��8�������E����=���������>=:)���.9��"����� ���� ����������� �� ��L

����������������������,$P.�� � ������ �� �����"�$$��"����� ��,$�.�� �������� ��.�� ��

�����������.�� �������������������"�����������3���� �������.�� ������������ !�����

���"����������� ���������!�

�.9�� ������������������ �������� �� ����� �������+���� �������� �������

��������� ������������S�-/D�������'�B�#��)��-�������������� ���������!������0������

�� ������������>7������� �����<5@����9����-1��������*?:�E����������'8������

E����=���������>=:)�������������� ���������������%��

��!�����������

*?:������������� ���V�5�� ����������������V�5�� ������������� ����������

��� "���� ������ ���-���������"��������3�������������0��� ����������������������"

������ ������ "�����<��"��������� ��������������� ���� ���������� �� ��������

�������"�����������!�������������C�����5���������"�� ����������/����� �����������

>�@1:�'��������������� ������ �����������������!�����)�������������������

���"�����"�������� �����?-=W=(���'9 �����,,�)��=��� �� �������������!������

�"�� ��������"��������G���/ �� �����'W�������?��� ���,,�)��<���� �������������

�������������"��(����������������������� �������������������� ��������&�����

���3��1���������� �����*��� �����"��������� ��� �� ������������� ������������

����� ��������"�>�@1:����� �����-����3��������� 0"� ��"�� ������������%�

'B�)����������������"�B��M��(����'������������������4����"� ��������������J�?�����,#�)��/"

���������!������ ��B���B�!�'������������������� 0"� ��")����������������"�B�!�M

B�&��'��M������� ����%��� �� �������"������ �������� ���,,�)��-����!�������� 0"� ��"

� �� �"� �������%���'B�!)����������!������'B�!)��M�B�&���'���M�� �� ��� �"� ����

Page 26: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

������ ������

����

����� �

���� ���

�����

������/

����������

������/

����������

����������������� ������� ������

������������� ���������� ����������

� ��������

��� ������� �� � � ��

��� ������� �� � �� ��

�� ������ ��� � �� ������������

�� ������ ��� � �� ��� �������������� ��

��� ������� � �� �� ��

��� ������� ��� � � ��

��� ������� �� �� � ������������

�� ������ �� �� �� ��

��� ������ �� � �� ��

���� ������� �� �� �� ��

���� ������� �� �� �� ��

���� ������� �� �� �� ��

��� ������� ��� ��� � �������������

��� �������� ��� �� ��� ���������� �������� ������� ��

���� �������� ��� �� ��� ��

���� �������� ��� ��� �� ��

���� ������ � �� �� � ��

� �� �������� �� � �� ������������

���� �������� ��� � ��� ������ ������� �� � ��� ��

���� ������� ��� ��� �� ��

���� �������� ��� �� � ��

��� �������� �� �� � ���������

��� ������ � ��� ��� �� �������������������

���� �������� ��� ��� �� �����������������������������

��� �������� �� � �� ��

��� ������� �� �� �� ������������

� � ������� � �� �� ��

��� �������� ��� �� �� ���������������������

�� ������ � ��� � � ��

�� �������� ��� �� �� ��

�� �������� ��� �� � ������������

� �������� � � �� � ����������

� �������� ��� �� �� ��

�� ������� �� � �� ��

�� �������� �� � �� ������������

(��!�� 0� ��!������������"�!������ �����"�����������������12� �����"���

��*������ �!�*���� �����������

'. ����������������)

Page 27: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

������ ������

����

����� �

���� ���

�����

�������

����������

������

������

�����

����������������� ������������� ���

���� ������ ����� ����� ������ ���� � �

�������

��� ������� �� �� �� � �����������,���������

�� ������,� �� �� �� ��

�,� �������� �� �� �� ��

�� ������� ��� ��� �� � �,��������,���������

�� ������ ��� ,� �� ��

�� ������� �� ��� �� � ������������������

�� ������ ��� � �� ��

� ������� � �� �� ��

�� ������ � �� �� ��

�� ������ ��� � �� ��

�� �����,� ��� ��� �� ��

� ������� ��� ��� �� � �����������������,��

,� ������ ��� ��� �� � ����������

��� ������� ��� �� �� � �������������������

��� ������� ��� �� � ��

��� ������ ,� � �� ��

��� ������� � �� �� ��

�� ������� �� �� �� ��

��� ������� ��� ,� �� � ������������������

��� ������ � �� �� ��

��� �����,� � � � ��

�� ������� �� �� �� ��

�,� ������� � �� �� ��

��� �������� ,� � �� � ������������

��� ������� ,� ,� �� � ,���������

��� ������ ��� ��� �� � ��������������������������������

��� ������� ��� �� �� � ���������������������������������

�� ������� ��� � �� � �����������

��� ������� ��� ,� �� � ������������������������

��� ������ ��� ��� �� � ������������

��� �����,� �� ��� �� � �����������

�� ������� �,� ��� �� � ����������������������������������

�,� ������� ��� ,� �� ��

��� ������� ��� ��� �� ��

��� ������� ��� �� �� ��

��� ������ ��� ��� �� � �����������

��� ������� ��� ��� �� ��

�� ������� � �� �� ��

��� ������� �� �� �� ��

��� �����,� �� �� �� � ���������,��

Page 28: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

��%��� �� ��)��1�%������3�'1�)�������� ��������������1��M�D�'B�!)��'D����������!�

�������3��� ��������������"��X������X����������� �� ��� �"� �������%�� �� ��)�

$�������������

�����!�"�����"

� <�� �� ������������������������.9����������� �������������� ������������

�������� ������������� ����������� ���������������� ���!������������ �� �� �����

����� ���00"��������=� ��������9:�*����������� ����������� �� ���,���������

�������� ���� ��$�������'�"�<����$)� ��������'<�:T��#)�� �� ���������#�

'� �$+)������������ ���� ����� �"� �����

� -�����!��� ��� �"� ������������� ����+�'�"�<�:T�������������������������

� ���� ����� � � ����)� ����+�'�"�<�S��,��<�:U��#��,��<�B������������<��

� ���$��������������� ������������*?:�������������� ���� ���������$������� �

�����,���������������!��")��1�3����������� ���������������� ��������� ������

�"������<�:T��#��1 � !���<�:T��,�� ���������������� �� �����"�<������

<�:T���������,�������������:��������� ������������������������������"� ��

������<�B��������<�B����� ��

� <������!��������$�������������������� ����������� ������� �� ����������

'$ �$+)���������������"�� ����������������� ������ ����������!�����!����� �

���$��

� 8��"���!��9:�*�� ������ �������"� ��9:�*������������� ���������� "��

����������*?:����������� ������������������"�� ��� �����9:�*������������

��������� �������� "�������������� !��������8������'�������)�

������������������"��'������.

� B�� 0"� ��"���������������� �����,������������� ����� ��������"����� "���

���9:�*��������� ������!��������-���B�!�����'B�!)�������� ���� ������$#

�����������������!��"��������������%������3�'1�)�!��������� ������� ����������

3�������!���������������������

� -��������� ��������������������� ������ "�����! �!���� ��!�� ����� ��������

������� �� � �������������������"�� �����������������!������ ��������"

'������ ���#��)'�-����� )��B�������������"�'��#��)����������������������:����

�����.�E�#$�� ��7�"������������ ���������"�������� �� �����������.<�����

.<�J��*:����������:����J���:� (��������:� (�������.�E�#$�� ����������,,���E���

�������"�'�����)������ ������������������������������������.�E�#$�� ����

Page 29: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

����)#�4��4�4�����*?:�� ����� ������ ���������!��� �����������9:�*�������<�:T����'�)��<����,

'�)��<�:U��#�'�)�����<�B�� �'�)��=����������� �����!�������� ��� ���� ���������1M=�����

*?:���%����������*?:�����������

����������������������������������������������� ������������������������������������� �����������������

���

���������������������������������������������� ���������������������������������� ����� �����������������

���

��������������������������������������������� ������������������������������������� ����������������

���

��������������������������������������������� ����������������������������������� ��������� �������

���

Page 30: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

� ���������������-������������ � ���!������-���� ����� ������������ ��� �

��!���"������.�E�##� �����>�:=������?*:(��������� �� ���� ��� ���������!���"

�����.�E�#���,�������������� ����� "����

� 1���!�����'�����)�����"���� �������������������"������ ������������!�����

� ���2 ��������'��������)��.�������� ������ ��� ����(�������'���������)��=��(

���������� ������ ����!������ "���������� ����� "����'�*:�������:�������.�E

#$�� ����������,,�)������������������ ���������=��(���������������� ������

��$����(� ����'����������������!)�������� ��� �������� "������������������ ������ �

� ����� "�����B ��!���� �����!���'?*:(������-�)��� ����� ������������!���"

����� ����� ������������������"�������'8�����)�

� / ��������"������������� ��!��������������� ������ �� ����������������

���� ����� ������ ���!��� ��� �������� ���(������� ���� ���(� ���������� ��

���� �������� ���� ����"������� ����!������� ������ ����� ���!��� ��

� ���������(������� �����*��� �'8���� )�����>�@1:����� ������������������

��������������

��������������������������������

� 9:�*�����"������������������������ ������� ��� ������������ ������������

!�"������������ ������������� ������ ���� ���� �������"��������������������

��������� ��������������!�&��������������<�� �������9:�*�������� �������

� ���������� �������������� ���������� "������������'-������)�

(��!�� 5� 3����� �"!�����"���.� ��� ���� ��������� �!�*�����(�������� ����

���� ������ ��!��������� �"���� �� ���� ��� ���������� $���!� ���� ��� ���

���������� #)�06�� �� ��� �*��� �� ���� ���!�� )�

�� �� �� �� �� �� � � �� ��� ��� ��� ��� ��� ��� ��� �� �� ��� ��� ��� ��� ��� ���� �

�� � ���� � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � �

�� � ��� � ���� � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � �

�� � ���� � �� � ���� � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � �

�� � ��� � ��� � ��� � ���� � � � � � � � � � � � � � � � � � � � �

�� � ��� � ��� � �� � ��� � ���� � � � � � � � � � � � � � � � � � � �

�� � ���� � �� � ��� � ��� � �� � ���� � � � � � � � � � � � � � � � � � �

� � ��� � ��� � ��� � ��� � ��� � ��� � ���� � � � � � � � � � � � � � � � � �

� � ��� � ��� � ��� � �� � ��� � �� � �� � ���� � � � � � � � � � � � � � � � �

�� � ���� � ��� � �� � ��� � ��� � ��� � ��� � ��� � ���� � � � � � � � � � � � � � � �

��� � ��� � ��� � ���� � �� � ��� � ��� � �� � ��� � �� � ���� � � � � � � � � � � � � � �

��� � �� � ���� � ��� � ��� � �� � ��� � ��� � ��� � ��� � ���� ���� � � � � � � � � � � � � �

��� � ��� � ���� � ���� � ��� � ��� � ��� � ��� � ��� � �� � ���� ��� � ���� � � � � � � � � � � � �

��� � ��� � ��� � ��� � ��� � ��� � ��� � ��� � ��� � ��� � ����� ��� � ��� ���� � � � � � � � � � � �

��� � ��� � ��� � �� � �� � �� � ��� � ��� � ��� � ��� � ���� ��� � ����� ��� � ���� � � � � � � � � � �

��� � ��� � ��� � ���� � �� � ��� � ��� � �� � ��� � ���� � ��� ��� � ��� �� � ��� � ���� � � � � � � � � �

��� � �� � ��� � ��� � ��� � ��� � ��� � �� � ��� � �� � ��� ��� � ���� ��� � ��� � ��� � ���� � � � � � � � �

�� � ���� � ��� � ��� � ��� � ��� � ��� � ��� � �� � ��� � ���� ��� � ���� ��� � ��� � ��� � ��� � ���� � � � � � � �

�� � ���� � ���� � ��� � ��� � ��� � ��� � ���� � ��� � ���� � ���� ��� � ���� ��� � ��� � ��� � � � �� � ���� � � � � � �

��� � ��� � �� � �� � ��� � ��� � ��� � ��� � � � ��� � ���� �� � ����� ��� � ��� � ��� � ��� � �� � �� � ���� � � � � �

��� � �� � �� � ��� � ��� � ��� � ��� � ��� � ��� � ��� � ��� ��� � ���� ��� � ��� � ��� � ���� � ��� � ���� � �� � ���� � � � �

��� � ��� � ���� � ���� � ��� � ���� � ��� � ��� � ��� � ��� � ���� ��� � ���� �� � ��� � ���� � ��� � ��� � ���� � ���� � ���� � ���� � � �

��� � ���� � ��� � ��� � ���� � �� � ��� � ��� � ��� � ��� � ���� ��� � ���� ��� � ��� � ��� � ��� � �� � ��� � �� � ��� � ���� � ����� � �

��� � ���� � ��� � ���� � ��� � ���� � ��� � ���� � ���� � ��� � ���� ���� � ����� ���� � ��� � ���� � ���� � ��� � ���� � ���� � ���� � ���� � ��� � ���� �

��� � ��� � ��� � �� � ��� � ��� � ��� � ��� � ��� � ��� � ���� �� � ����� ��� � ��� � �� � �� � ��� � �� � �� � �� � ���� � ��� � ���� � ����

Page 31: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

����0� *��� ���� ������ �����!�������� �������������>�@1:������� �����9:�*�������

-�����2 ���������������(������������������� �������������?��������������� �����������

���� �� �!��������������J�!��������������� ��� ���������������3����������������'�

��������������������������� ������������+)��-�����2 ������������(��������������(� ���

������������ �����������

�������������!�"�����"

� ���������������"��� �$+�������������� ���� ����� �"� �������������!����� �

���$�����������������9�����%������ ����'�,,�)� ���������, ��������������

���������� �"� �����9:�*������� ����������!����1 � !��� ��������������

�������"� ��������"���������� %���!������ ������ ���,�����������������

������� �� !����� � �������� � ��#��� �������� �� �������� ����� �� �� ��������

������� �������"�� ����������������������� ���������������� "����

� 9:�*����������� ���� ���������� ���������� �����%���"��������������"���

���������!���"�������� ������-�������� �����������!���"����������9:�*������

����� ���� ����������'������ ���#��)����� ������ ���� ������ �� ��:8E�������

'�� ��� ��� �D� �9���������1���)����������!��������� ���!��� ������#�(����

���������� �"� ������ ��� ��#+�����������!������������������9:�*���������������

��%���"����

����������

���� ���� ���� ���� ����

�� �����

�� ���

�� ���

��������

��� ���

� � �

�������

�� ���

�� ���

��������

���

���

�������

� �

�!���

� ��

����"���

��� �

� !��

�� ���

� !���

�� ����

#� �

$�"

���

�����

������

�������

������

���

���

���

��

"��

��

��

�"

��

��

��

��

"�

��

��

��

��

��

��

��

��

Page 32: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

� -���B�!�!���������� ���� ����������'�����)��������������%������3�'1�)����

������� ������������������ !����������������"� ��9:�*��������%���"������

����������� 0"� ��"�������� ������-������������������� 0"� ��"�'B�!)����

� ���� ������������������ ���������������� ���� ��� �����'�����J����4��������)����

�����������'�� $�J�B���A�B��������)�������� ����� 0"�����!���"��G����9:�*����

����������%���"��������B�!�!���������� ���� �������� ����������� ���������

�������������� $������������ ������� ��'*�������� �����$)�

���!�������!�������

D������ ���������� 0"��������"�������������� �� ��������!�������"�������� ����

����!���'E���0���%"�����B������,#�)��-�����2 �������%� ������������4��������������

���������� �"� �������� �������� ���"�����������!����D�����9:�*�'9�����%����

� ���,,�)�����:8E��'������������ ������)���������� �������������!�������"��� ��

���� ���������!���

����5� 1���������� �����*��� � ������ �������� "������������� ��9:�*������/ �� ��

������������������������ ���"���������� "�������� �������� ����� �����=����������� ����

��� "������������!��������������-����������� ���!�� ���� ��������!���

����� ���� ���, ���� ���

��

���,�

����

������

�����

�����

��

,

��

��

��

��

��

��

��

�,

��

��

��

��

����������

�����������

Page 33: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

� -������������"���������� ��� �����9:�*����������!�� ������ ������,�������

������ ��������#������� ���� ����� �"� �����'� �$+)��-����!������������"

����3� ������������������!��������������������������!���"���������"�9:�*

�� ���������� ���������!���������������� ������ �� ���� %��� ���������� ����

��!���"�����"����

� -����!����������� ����������!�� ����'���$�)���������!������������ �"� �����

'� �$)����������������������"� ��9:�*������������������� �"� �������� ��

����!����B�������������"�'��#��)����������������������:����������.�E�#$��

���������.�E�#$�� ���� ��� ����������� ����:�����'/����3��.�E�#$�� )��E���

��������������� �������������������� �������������������� ��� ���������

'E��%� �)�-�����������(��������������������.9�=:-�������.�E�#$�� ����������

�������-����������������������������.��##� �'������������ ����������� �

�����)��8���� ��� ���� ��� ���������������������������������� ��� ���

��� �� ������ '8��0����)�?*:(�� �� ���� ����������� !���� ������� ���������

����������"����.�E�#���,���������(�������������������"����.�E�#$�� �

� -��� ���� ���� ��� � ������� �� � ���2 � ������� ���� ��� �������� �� ��

���� �����������������"����� ����� ���������������� �����������"� �

9:�*� ������������������������ ������ ����� �������������� ���!�����

� ���������(������� �����*��� �����>�@1:����� ������!�������������������

����� �������� "��������������������9:�*���������������� �����������������

��9:�*������������� ���������!���"�

� .��������� ������ ����!������ "����!�0��>�:=�������*:�������:�������.�E�#$�� �

�����,,���/���������.��##� ��-�����!�������&��������� ������������� �������

�������"� ���������������������-�����!������&�����������!������ ����������

��!���������!�� ����� ���������� ��� ������������ ��� ��������������� ��(

�������������� ������ ��� �� ����������������������������������������.9�=:-�

8 �������.�� ���������.9�=:-����� ������������ �������� ����$��#��� �������

>�:=��������������������� ��� ����� "����������������������������!�� ����� �

��������������������.9�=:-�

� <�� ��������������� ��������(� �����'�)����:� (��������:� (����������� ���� �

/����3��.�E�,���#�����������.�E�##� ,������������ ��� �������������������� �

�.9�=:-��������!����������������"��������������� �� ������� ���� ������ ����

��! �!����������������������������� ���.9�=:-������������ � �� ��������������"

� �����

� :����������!������� ��������(� �����'��)��!�0��.<(���.<(������/1=9�#� ���

������� ���������������� (�������������� ���������� ��� �������� ���������� ��(

��������� ���������.<������.<��� ����������!�������������!�� ����� �

� �������������� ��� ����������1 � !���/1=9�#� ������� ���� ���"���!����� ���

Page 34: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

���������� ��� ������������ �����������������-�����!�������� ����������(

��������&����������"��� �������

� :����F�E�$ �����*:(���� ������������(� �����'���)��-���������!�������&�����

��� ��� ������� ������������� ������� ������������0 ��� ���������:���������

��� "����� ��������������� ����������"������������ ���!�� ���� �� ������

/�����/ �����!������� �����(� �����'�!)�������.�E�#���,����������,���!������

��!�� ����� �����"����0�� ���/ �����!�������� ������������������ �������

��������(��������� �� ����������"����-�����!���������� �� ���������������

�����"�� �������������

� .����� ��� � ������ ��1:E���� ��:�$����1:E�� � �����*:�,�(��-�������� "���

��� ��� �� ������� ������"�� ����������������� ������� ������������0 ��� �

�������:������� ����� "���� ������������� ��������������� �����(����������"��

��������1:E����1:E�� ������*:�,�(��� ������ ���� �� �������� ��� �(

��������� ��������'/���)��������������������� �����������������������������

� ��� �(��������� ��������

� -� �!�������!�0�?*:�������-(��� ����� ������������������"�������������!�� ���

� ����!���� ����� ����� �� � ���� �������/ �� �� ������� � ����� ���� ���� ��

���������� �������������3����!��"�� ���������� �������� �������!�������

������ �� �������!������������"������ ������

�����������������������

� -������� �� ���������������������9:�*��������%���"�������������� ����1 � !��

$�����4���� ������� �������!��������������"����9:�*�����"����'-������)�������

� ����� � ��"���������������"���������� �!���������������� �������� ��� ������

� �!������ �.:�=� �=.:9���%��� �!������� ����� "�����

Page 35: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

Page 36: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

Page 37: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

&�'������

.���%��������������������E)� ������ ��� ���������������������� ����� ��������

�"��������'7�����1�������,��)������������ ����� ���������� ��������� ������

���������������������������� ��� ��������"�������������� ���� �����1�2 �� ���� �

������%����� ����� ������������� �����������-�����2 �����%����� ������������

1���"����������9�2�������>�� ��������1��������@�2���:����� �������� ���

F����%���.���%���� �������� ������� ����� �������������'��������� ��������)����

� �������$���+� ���� ��������������%�� ������ ��"�

�:��������� �����������!���"������� ������������������������1 ���������%��

�������� � �� �� � ������ ��� �����������%���� ������!���"�����"������������"

�������������� �������!� ������������ "���3���!� ����������� ���-��"�������

�!��������������������������"���� ������������"�����.9���������%�����%��9:�*����

==9���!�������!�"�� ������ �� ���������!���"�����"����

=����� �������� �� �����'E���0���%"�����:�����,��)������� 0"�������"������!�

���������� ��������������������� ��������� ������������������-� �����������!�����

�����������(���������� �"� ���������������"��������������������9�����"��V9��� �

:��������� � �"� �����*?:� '9:�*)� ����"���� ��!�� ����� �������� � ���"� ������

���� ��������� �����������������������������':������,,,)���������� ������9:�*

��%���� �������������� ��� �������� ����"� ����������� ��������������������<��

*?:���%������������==9������ ���������������98E��� �=-1=����!������������

�������!�������"��������������������<������� ��������������� ����������������������

������ ��� ����������������������������� ���"���� ������"��������� ��������

���� �����������������������������%�" "�������"��������� �������"��������

��!��!����*�������"���������'�������������

=�!��"(��!��������� ������ ������ ��$��������� �� �����������������������"0��

�����.9�������� ���������%����1 ������ ���������� ���������������������"0�����

� �� ������������������������������������������������������� ��������������� � �����

�����"����������%����9:�*�����"���������������������!��� $�� �"� �������������

7�������"���������������������������:����� ���������� �����C�������������"�����3

�� ����������������� ������� ��!�������"�������������������������� �� ��� ��

����������� ��������� ������-�������"�������������� �������"� ��������� ��������

���������.���������"����� �����!��������%����������������!� � ������"����"������

����� ����������������� �������������� ������������� ��������� ����� ������������ ��

':�������,,,)�

Page 38: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

=�������� ��'����)�����"0������������!���"�������������������E��������9��� �

����������� �"� �����*?:���%��� �����������������!���"����� �.���%������� "����

8 "� ������������ �����������������!������� �"� �������� ��������� "����

1 �� ������������!�������������� �"� ��������������� ��"��$���+� ������ ����

����� �"� ������D������� ����������������"������� ��C�����5��� ��������������

� ����,�� ���,,�������������� ���������!�������"��� ��������� "���������� ��9:�*

��%����-���"���������%������� "����� ����� ���2 ������������������ ����

-���� ��9:�*�� �"� �������� �������%������� "��������������������������� �

� �"� ���������������� ��������"0��� �������������������� �������������� ���!��

���9:�*�����"�������� "���� ��� �"� ������������ ����� !���������������� �

����������� ��������������%��������������������"���������� ������$��� �"� ����

9:�*������� �����"������������!���"�����#�!������� ������%����

������!

=�3"(�����!������� ������%���������������������'-�����$)������ ����������������

�������'������3� ������ �� � ����������� �������������!��")��-� �������!�����!�

������ !����� �����������������-���� �� � �������������������� ����� ��������

� ��������� �� ������ ����� ���"�����-���� �� � ���������������������������"���

� ����������������0������� � ������������� ������������������W �������!������

� �������� ������������ ����*?:��3��� ��

(��!��6��7������ �'�����!�*�������� �������������������� ���*���������!���

��+�

��+�

���������� ������ �� ����������������

��� �� ����

,� ��!(/�.�

�"���!�#���5(/5�� $�%&�'� �(��� ��()�#� ��'&(���*�#� �5+,� ��

���%�#�'(���&�-��55(���%(-�#� �.���()�� �.�

#���$���1�&+/���

��� �0���� ���5���123 ���� 4(��� ()%� ���*�#� �'(��� ()%� 1�.5)� ���%�#�

��+,�� ���%�#� '(���&�-� �55(��� %(-�#�

�.���()���.�#���$���1�&+/�����

/�� ! 6��,7.�

,85��(.�

7�5�#��9�5���#������� 8�'&(����(%&)+���()��#�5/&���1.�%� ���%���

'�%&�'� �(��#� '(���&�-� �(!� %(-�#�

���&��()���.�5&��#��.���()���.�0�$�

��� :��/�5� 8���*�&.)�;�.'�9<�/�5� 3��*�#����%��1�.5)�()%�'�%&�'�1.�%#���+�

���%�,�� ���%�#� '(���&�-� ��5� %(-�#�

���&��()���.�5&���

5�� 0���� !��5��1� ��/�� $�%&�'� �(��#� ��'&(���*�#� '(���&�-� �/�%(-�#���5+,�����%���

Page 39: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

��� ������� ����������� ���� ������������������������� ������������ �

������� !�" ���������

�� #$$%� �� �� !� �&��� !�'� ��������(��� ��� �" ��� ������� ���������'� ��������������������)�*� �����������))��

�)���

+�� %�,���

-�.� ����+ � � /��

� !���0�������� � 1������ �� �������������(������ �2�)*��

���������������� �'� �������������������)�

*� ���

�� ������ �������3 ���+'�'$� ��������(��� ��� � �������� ! ��" ������������������� ��� �'������

��� 4�1����+� 1������)5�� ��� ���������������� �+�" ��� �������

��������� ''������

�� 0��������� � �)(� ��� �(��)��5�)��

����� ����

���������������� ������ ���� �� )*��.�

2�)*�� �����������2) ���!��" ��� �������

��� ������������������)�� ��������

!�� ��������

-%�����/�

���� ��&����� ��� ��������(�� � ����� ������� ���6� 2�)*��

������� ��" ������������������� '��������

�����������)�*� ���

��� 4�� �'��-7/�

-$.����6��/�

#$$%�����3�#��++�!�� � ���� ���� �� � ���� ��������(�� *.���� ����

2) �� ������� ! ���" ��� ������� ������)�� �'� '�������

��� 7���'�

-8���/��

9��.�����7��+�� 1������ �� � ���� ��������(��� ��� �

�������� ����" ��� ������� ��������� �'�

��� ������ �) ������ �)� *� ��� �))�� �)�� ����

�������

'�� 7:9� �+� �� �(��)��5�)������� ����� �+��

1������ �� � ���� ��������(��� ������ ����2�)*�� ���� ��� �� +���" ��� �������

��������� �'� ���������

��� ��.)��;� )*�� �� �(��)��5�)�� )(� �

����� �����

1������ �� �� ������ ���� �� )*��.� 2�)*��

���� ������� ��� ��<��� '�" ��� �������

��������� �'� '�������

�� �����!���� =!�+����''�� ��������(��� !!�!�" ��� ������� ���������

�'� '��������

+�� 4��!��-7/� 8��� ����4>���+!�� � ����� ���� ��������(�� ���� �� �� ������ ����

�� �)�� *.���� ���� 2) ��� !��" ��� �������

��������� ��� '�������

�� �$��!���� �� �(��)��5�)�� )(� �

����� ����

��������(��� ������� �� �� ������ ����

�� )*��.� 2�)*�� ���� ������� 2) ���

�" ������������������� '��������

Page 40: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��� �/�����(��� �9�5���#� �-�.)��� 8�'&(���*�#� �'(��� ���%�%#� ���!� +,��

���%�#�'(���&�-�!5(��%(-�#� ���&��()�� �.�

5&���()%��.���()���.��.%�1.�����

���� �7�!�(�/�� ���(��#�3�-'�#�

0/&'(�

8�'&(���*�#� �'(��� ���%�%#� �/��+,��

���%�#�'(���&�-���(��5�%(-��

���� �()�������� ���/�#��5�� 8�'&(���*�#� �'(��� ���%�%#� �5�/+,��

���%�#�%��(�&.)���(��5�%(-��

�/�� ?�(��� ��*.'�.�&���;�.'�

+�)��&*���.*=��

8��%� (��� �'(��� 5&�/� *.(���� ���%� *.(��

,��*=���%.#� ���/+,�� ���%�#� 5&���

���&��()���

���� 6&�/(��

,�/���������.�

7��5�#�! "��!��� $�%&�'� �(��� ()%� ��'&� ���*�#� �/��+,��

���%�#�%��(�&.)�����%(-��

�5�� 6&�(��� ! ������#�! �/��#�

! (�!�#� �&�(��(� ��

8�'&(���*�#� 1.�%� ���%�%#� /5+,�� ���%�#�

��(��5�%(-��

���� 8�7!��!5��� ! ���#�! 6��� $�%&�'����%��&>�#����&��()�� �.�5&��#���(���%(-��

���� 7�5� 0()%(��.*(��#�3�(/�1.�%� $�%&�'� �(��#� ��'&(���*�#� ���%�� (���

��%%&�/� 1�.5)#� �.�)%#� �'..�/� ()%� 1.�%#�

�5���+,�����%�#�%��(�&.)���5(�5�%(-���

���� 8(%(1(/(��� �&'(�#�"��5� ����)� ���%�%#� %��(�&.)� ��5(�5� %(-�#��.���()���.�5&����

�!�� ! 6(/��,7.�

7�()�&�

�����1�?�����1�����/� 8�'&(���*�#� %5(�;� ��()�#� �&+/�� +���)� ()%�

)(��.5� ��(@��#� 1�.5)� ()%� �'(��� ���%�#�

���5+,�����%�#�%��(�&.)��5(���%(-���

/�� 0������ �/��#���/� 8�'&(����(%&)+#� %(�=� +���)� ��(@��#� �&+/��

1�.5)� .@(�� �/(��%� �'(��� ���%�#� ����

+,�� ���%�#� �.���()�� �.� 5&��#� '(���&�-�

�/5(��5�%(-��

/��� <8��� � 8�'&(����(%&)+#��'(������%�%#������+,��

���%��

/��� 0��/��� 0��//�#����!�� $�%&�'� �(��#� ��'&� ����(%&)+#� '�%&�'�

���%�#����/�+,�����%�#��.���()���.�5&����

//�� ���(��!� �������#� �/5��� ?(�=� +���)� ��(@��#� �&+/�� 1�.5)� ���%#�

%��(�&.)���(��5�%(-���

/��� 0���5�� ?�����#��5(/,���#�"55�

#�����

8�'&(����(%&)+#�'�%&�'��(��#��&+/��1�.5)�

1.�%� ���%�#� ����+,�� ���%�#� �.���()�� �.�

5&����

Page 41: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

���� �������� ������ �������������

������

������������ ��� ������ ���� ����������

���� � � �� ������� ������ �� !�"�##�

������������� ��#$���#�������

!� � %�&�'''� %�&�((�)�*��##��� ������������ ��� ������ �������� �( +�"�##�

������� ������ � �(#� ������ �� � ���������

����� ��������������� ����������

!, � �+!$� -.�$'�)���+!(� ������� ��������������������������������

��� �� ��� /���� � �� ���� ���� ��������

�! '�"�##� ������� ������ � ��#��,#� ������

����� � �� ����������� ������� �������

����������������������� �����������

!' � 0&�!+,� 0&�+#!�)�.�,��� ���������� ������ ���� ���� � � �� ������

�� '�"�##��������

!, � %�&�+�

�1��� ��

2���� ����%���#� ���������� ������ �������� �( $�"�##�

������������� ��!#��!$������

(# � 0&��(�!� ��� ����&��!#� ���������� ������ ���������+�"�##��������

������ ��!$��($������

(� � &�.��#��

�&�3���&�������

&�.�+)�-��4�+�� ������������ ������������������������

� �� ���/� ���� � ������� +# +�"�##� �������

������ ���$��+#������������� ��������

(+ � 5����

�5�������������

$+��)�&&�0�3������ 6����� ��� � ���� �� �� ����� �� ��� ���

����� ������ � �� ���� � ������� �$ (�"�##�

������������� ��,#��,$�������

(! � 0&�!,�� -���!,!$�)�.����+$��� ������� ����� ���������� ������ ���� �����

� �� ���/� ���� �� +� ��"�##� �������

������� ��#��+#� ������ ����������

������ ��������

(( � 0&6�,+�

�.�������

.����+$��)�*�##�7��)�

.����+$���

���������� ����� ������� ����� �������

������ ���$��+#������������ ��������

($ � %����� ������ �����������

�����������

���������� ++ ��"�##� ������� ������ �

�!$��($������

(� � .�����&�$�

�4��������

0��#�)��!�� 8���� � �� ���������� ������ � �� ��� ��

������ +,�"�##� ������� ������� ��#���$�

�������

(, � %�&�9((� :&��+�)�;(,�� ������� ���� � �� ����� ����� �������

������ � �� ��� �� ��������$�"�##� �������

������ ���#��+#�������

Page 42: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

���� �2�(���� 8���*�&.)�;�.'�

�)&%�)�&;&�%�'(���&(�#�

8�'&���*�#� ������� �&+'�)�(�&.)� .)�

��&'(�-� 1�()*/��#� ������� ;�.5��#� ���%��

+�(-&�/� -���.5� ()%� �'(��#� �/��+,��

���%�#�%��(�&.)��/5(���%(-�#����&��()���.�

5&���

�<�� 0��A���,7.� ��/���#���<���� 3��*�#� �'(��� ���%�%#� ����+,�� ���%�#�

%��(�&.)���(�5�%(-��

5�� 0��A�/�,7.� $��()��.;�=5/�� 8�'&(���*�#�5/&���1.�%����%�%#����5+,��

���%�#�%��(�&.)��/(���%(-�#� �.���()�� �.�5&����

5��� <(%/�-� �<��#����� B(��� ��()��#� ��'&(���*�#� ���%�� (��� �&+/��

1�.5)�()%�1.�%#�%��(�&.)��5(�55�%(-���

5��� 6(&1/(>�� 8���*�&.)�;�.'���! 6�

<����

B(��#� ��'&(���*�#� ���%�� (��� �'(��#� �&+/��

1�.5)� ()%� 1.�%#� ���/+,�� ���%�#�

%��(�&.)���(�/�%(-��

5/�� <�?�A5�� 8B��#�<8��� 8�'&(����(%&)+#�%����+���)#�%����1�.5)�

()%� �'(��� ���%�#� ����+,�� ���%�#�

%��(�&.)���(�55�%(-��

5��� ?�(��� �/�����5�#�2(��&)+/����#�

! /��

8�'&(����(%&)+#� 1.�%� ���%�%#� ��+,��

���%�#����&��()���.�5&����

55�� � ���5�

,��@�(����('��.�

! =�������#��))�+&�&(��� $�%&�'� �(��� ()%� ��'&(���*�#� +���)#�

�'..�/#� �.�)%�%� ()%� �'(��� ���%�%#�

��5+,�����%�#�%��(�&.)���(�/�%(-���

5��� �>�.%/&�� B�/�#�7/�5� 8�'&(����(%&)+� ()%� �(��#� 1�.5)� 1.�%�

���%�%#� /��+,�� ���%�#� %��(�&.)� ��5(

���%(-�#����&��()���.�5&����

5��� =55�,7.� �1���#�<(1(��� $�%&�'� �(��� ()%� 1��/-#� ���%�� (��� �'(���

()%� *��('-� 5/&��#� �<�5+,�� ���%�#�

%��(�&.)��55(���%(-���

5��� 0��/��� ����/��#�����5�� 8�'&(����(%&)+#� �'(��� ���%�%#� ��+,��

���%�#�'.%��(���-����&��()�� �.�5&��#�1�&+/��

()%�%�-��..���.���

5<�� 8���<��� 8���*�&.)�;�.'��� ��/5�� $�%&�'� �(��#� ��'&(���*�#� �'(��� 1�.5)�

���%�%#����<+,�����%�#� �.���()�� �.�'&�%�

�(�&)&�-#�%��(�&.)��5(���%(-���

��� �0��A5� 0���5��#�3�-'� 8�'&(���*�#� �'(��� 1�.5)� ���%�%#�

����+,�� ���%�#� %��(�&.)� ��(��5� %(-�#�

�.���()���.�#���$���1�&+/���

Page 43: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

���� �2��A��<�

,8('�(�.�

�))�+&�&(��#���5(/5� 3��*�#� �(��#� ���%�� (��� 1�.5)� ()%� 1.�%#�

����+,�����%�#�%��(�&.)���5(�5�%(-��

���� =55�,7.� ! �/��#�! @���5���

0����(0��

$�%&�'� �(��#�1��/-#�'�%&�'�1.�%����%�#�

�+,�����%�#�%��(�&.)��55(���%(-��

�/�� ?��/� �/�����5�#�2(��&)+/����

0.�%�#�?�����

$�%&�'� �(��#� 1�.5)� ()%� 1.�%� ���%�%#�

�/�<+,�����%�#�%��(�&.)��/5�%(-���

���� �=���<� ��//�#�=����� B(��#����*��5&�/�%(�=�+���)�)(��.5���(>��#�

�'(��� 1�.5)&�/� -���.5� ���%�#� ��+,��

���%�#�%��(�&.)���(���%(-���

�5�� � �(�5�

,��@�(����('��.�

! =�������#��))�+&�&(��� $�%&�'� �(��� ()%� ��'&(���*�#� %(�=�1�.5)�

5&�/�1.�%����%#��<��+,�����%�#�%��(�&.)�

�/(��5�%(-���

���� �?8������ ,�5(/,���#��<��.�#�

�<����

?(�=�+���)���(>���()%��&+/��1�.5)����%�#�

���5+,�����%�#�%��(�&.)���(���%(-���

���� 7�7�A��,7.� ! 6(��#�8����(�.����#�,! ��/��(�� �#�

����(�0(�0(���(0�(

���7(��7(0�7.��

$�%&�'��(��#���'&(����(%&)+#�1��/-#�1.�%����%�%#� /�+,�� ���%�#� %��(�&.)� <(��5�

%(-���

��� ?7�(�� 8���*�&.)�;�.'�+��'��(�'�� 8�'&(����(%&)+#�1.�%����%�%�����#��(��-�

;�.5��&)+#� /5+,�� ���%�#� %��(�&.)� ��5(

�/�%(-�#�5&������&��()���

�������!���

3�����!���������������

�.9����������� ��������� �����������%�����(������������������1C�9��������-.(

������� �"�����9���� ��� ��� ���'���%�)�� ����������������� ����� ����*?:��������

�������� ������*?:�� �"������'/����� ��@����)������%1������ ���:-����.-����@-�

�����--��'/����� ��@����)������%1��������������-����.9�������� ������� ������1

-��(B.�&����1�F.�&������&������������B�#� �'/����� ��@����)��."����� ���� �������

�������������� ��������,$�.�� � ������ �� �����"�$���"����� ��,$�.�� �������� ��.��

�������������.�� ��������������������3���� �������.�� �������

�*���������!���

:��������� ��� ��������� �� �!����"����� �� ����� �����+���� �������� �

9:�*������+���� �������� �==9�����!������0�������>7���������� ��

Page 44: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

(��!�� 8�� 7��� ��� ���"��'���� ����� ���� ���� �������� ��� ��!�"�����"� ���

�����������"���

����� ��������� ��!������� +����

������

������� ���� 9�����

������� ������ 9�����

"�����������" �

A�� �A�� � ���� B�� �� 2��

A�� (�� ���� ���� �� 2��

A�� (�� �B�� ��B�� /� 2��

A�� (�� BBB���B� � �� ��

A�� �(<� ���� �B� � 2�� 2��

A�� (�� �� �� ����� �� 2��

A�� (��� B���B ��� �� ��

A�� (��� �� ���B�B�� �� ��

A�� (�/� �� ��BB�� 2�� 2��

A�� (/� � B�� � � 5� ��

A�� (��� BB��������� �� 2��

A�� (�� � �����B��� �� 2��

A�0 (�� BB �� B � 2�� 2��

A�0 (�� � ��B�� ��� �� ��

A�0 (/� �� BB�� B� �� ��

A�0 (�� ����� ����� �� ��

A�0 (�� B�B� B�� � 5� ��

A�0 (�� ��B BB B� /� ��

A�0 (�� �� �B ����� /� ��

A�0 (��� BBBB� � /� ��

A�0 (��� B � ��� 5� ��

Page 45: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

A�0 (�/� B�� � ��� �� ��

A�0 (��� ��B �� ��� �� 2��

A�0 (�5� ��� B �� 5� ��

A�0 (��� B��B� B �� 5� ��

A�0 (��� �BB��B � �� 2��

A�0 (��� �B��������� �� ��

A�0 (�<� � ��� � ��� �� 2��

A�03(�� � B B��B� /� ��

A�03(�� � � B�B��� /� ��

A�03(/� B��� B ��B� �� ��

A�03(�� ��� ���� �� 2��

A�03(5� ���� � B� � <� ��

A�03(�� �� ���B �� �� ��

A�03(�� �B B�B�� �� ��

A�03(�� ������ �B � <� ��

A�03(<� � BBB � �� ��

A�03(�� ��� �� B� /� ��

A�03(��� �B B� B�B� �� ��

A�03(��� BBB� � � � /� 2��

A�03(�5� BB �� ��B�� /� ��

A�03(��� B � �� B� 5� ��

A�03(��� �������� � 5� ��

� B.�(�� � ����

Page 46: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

(��!�� 8�� 7��� ��� ���"��'���� ����� ���� ���� �������� ��� � ��!�"�����"� ���

�����������"���

'. ����������������)

�+��+� �#$�:#� ��+����

������� ���

%�����

��+����

������� ���

%�����

&�������+����

%�����

�� A��B(�� �� �� <�

�� A��B(/� �� �� ��

/� A��B(�� /� �� ��

�� A��B(5� /� �� 5�

5� A��B�� �� �� ��

�� A��B(�� � �� ��

�� A��B(<� /� �� 5�

�� A��B�� �� � ��

<� A��B(��� �� � ��

�� A��B��� �� � ��

��� A��B(�/� �/� � �/�

��� A��B(��� �� �� ��

�/� A��B(��� �� � ��

��� A��B(��� � �� ��

�5� A��B(�<� � �� ��

��� A��B(�� � �� ��

��� A��$(�� /� �� 5�

��� A��$(�� <� � <�

�<� A��$(/� /� � /�

�� A��$(�� �� �� 5�

��� A��$(5� �� �� 5�

��� A��$(�� �� �� ��

�/� A��$(�� /� /� ��

��� A��$(�� � �� ��

�5� A��$(<� �� �� ��

��� A��$(�� /� �� ��

Page 47: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

��� A��$(��� <� � <�

��� A��$(��� � �� ��

�<� A��$(�/� 5� 5� ��

/� A��$(��� 5� �� ��

/�� A��$(��� �� /� <�

/�� A��$(��� � /� /�

//� A��$(�<� �/� � �/�

/�� A��$(�� �� /� ��

/5� A�� (�� 5� � 5�

/�� A�� (�� �� /� <�

/�� A�� (/� �� �� /�

/�� A�� (�� �� /� ��

/<� A�� (5� �� �� 5�

�� A�� (�� � /� /�

��� A�� (�� �� � ��

��� A�� <� /� �� ��

�/� A�� (�� � �� ��

��� A�� (��� A� �� ��

�5� A�� (��� �� �� /�

��� A�� (�/� /� � /�

��� A�� (��� �� �� 5�

��� A�� (�5� �� �� ��

�<� A�� (��� 5� � 5�

5� A�� (�� /� �� ��

&� B.�(�� ��<� ��� ����

&&� B.�(��C� ����� ���5� �

&&&� $�()� /�5�� ��/�� ��<��

&>� $�()�C� ����� ���5� �

Page 48: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

����8��E����1L��������*?:��������������(�#�����������%��������!���'������1�A�1)��������������

9:�*���%���<�:.(�

����6��E����1L��������*?:��������������(�#�����������%��������!���'������1�A�1)��������������

9:�*���%���<�:1(�$

��� ���������������� ���������������� ����������������������������������� �� ������������ �������� ���� ������������������������������ ������� ��� ��

��� ����������������������������������� ����������� ��� ���������������������������������� ������ ��������� ������������������ ����������� �

������

�������

��

�����

����

�����

Page 49: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

$������!����!���

-����������������� ��������������*?:���������������9:�*����������"����

������������������ ��������� �������#�����%��������!����:��������������������

�� ���� ������������'�)� ���������'�)� ��� � � � ��������� ������������"����3� �

�����������9:�*����� "�����"�������:�����*���* ��� ������:�����������"���������

������������"����3�������� ���������������������������� ������ ���������������

�!������ '>�@1:)��?-=W=H���!��� ������� �������������� � �����������"�������

����������� ���������������

$��������������

� :� ��� �����9:�*����������������� ����*?:������������� ���������%���

����!����<�� ��������������+�'��)������ ���!����"�� �"� �������9���#�+�'$�)

��������!��������� ���� �"� ����������

���2���*��� �������!���� ����� ������������� �"� �����*?:�����"���� ���#�����%����!������

Page 50: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

� :� ��� ���$���������������������"����9:�*���%����<�� ����������,�'���$+)

����� �"� ��������������#�'����+)������ �(� �"� ������:������ ��$�,$���%��

���� ���!�����������

� -����������� ����������������"������� ��C�����5��� ���������������� �������

��,��

� :�����������"���!��� ���,+���������� ������������� ������!�����������/@1

$� ���%�����������������������������������4������������ ���� ���������!���

� -�������!���/@���� �����FG9���#����!�"��� ���"������������������ �����/@

��� ������ ��"�����������FG9���#���������"����B������*��������F������"�������

� �������������� �� �� ����������9:�*������������==9���%���'8�����)�

� -�������� ���������� ����������������"������� ��C������� ���������'����� ���,�)

���� �!�"������

Page 51: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

Page 52: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

Page 53: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

&�'������

1��������N������������� 'E)�G���0�%����M��3�M���O���� ��� �� ���� �� ��� ��

�������� ��������� ��:������������������������ ��������������� �� � $������ ��������

� �������� ������������ �� ��������� ����!�"� �� ��%�&���'8:<������)���������������

� ���� ���:������ ���������� ����������������������"�� ���������"������� ������"

������ ���������� �1������������������!"� � ��������� ��� ���������� ��� ����������

� ���4����"���� �����"����� ����!�"�������������� ���������������*��������2

��� ��� ����� �!��� ���������������������������� ������"�������������0���"���������

�������������B������������������� ����� ���� !��������������"� ������������������

��������������� ���������%����������!���� �������� ������������� ����������

-������������!���"�������������������!��� ������������������������������

�� ���������� �� ��"������������ ������������ �������!��������� �� � ������

���������������������������������!���"� ����������������������!�������� ���E�%�������

��� ��'����)�������������!���"��� ��� ���������������!���� ��������������9:�*

��%����=�����'��� )�������==9���%�� �����������������!���"� ������������� "����

- ���!��������������� �����������!���"��������� �������� ����������!����/������ �

'����)������:8E����%���"���������������������� ������� ��������������������!��

�����3�������� ����������� ������������� ��� �� ���������������������������-����

���������� ��!���������� �������������� �������������������@��������!���"��� ��

������������������������������������9:�*������4����"�=���������� ��'�,,#)��-���

���"�� !������!�������������� � ����������� �� ��:����������:������������� ����

���������������2��������������������������� ������������������������� �������������

����� ���"���������������

9����!�����������"� ��������������������������!�������� �"� ���������$����������

��� "����������������"�=�������� ��'���$)��E ��������� ���#(���������������������

�����������!�������� � ��������� �������������������������������������������

� �"� ������������-����������� �������� ������������������ ����� ���� ��������

���� �������������!���������!���"��/������ ��'����)������������!�����������"� ��:8E�

��������!���� � ���������!������� ������ ���������� �"� �������B����������� �

� �"� ���������� �����������Y ���������Y��� ������������� ������������ ��� ����

�������������������Y��������

-������������� �����������!���"��� ����$�������������!��� �������������!�

������ ������������������ ������ ��������

Page 54: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

������!

-���������������������� ��������"�����������$�������������!��� ����������

� �����"�� ����������������� ��� ��������'-������)��=����� �������!������������ ������

� ��������������� �� �����9��F�������������� ��������� � ������ ���� ����-��

��("��������������� !�������������������� ����������!��������!�����

(��!�� 2�� �������������"��������*������������ ���*������ ���!���

�+�

��+�

;�������� ���� ��� <������

#�������

'�������

��������� �

��������(������

��� 0?A<���� �6<? �=&)�� (� �(�5� 0.�%�8��%�%�

��� 7��5�� ��5/�@�/B��� �<��� �(�5� 8/&)&)+� +���)� �'..�/�

�++��/(���()%�1.�%����%#�

����(%&)+���

/�� �$����� B-�����#�?�?��� �<<�� ��5(��� <��&��()���.�A$6�

��� ���(���5� B(&5()����#�$=����#�

3�$�����#�$=/��

�<�/� �5(�� 3��*�#� ?����'&)(��#� �$�

()%�A$6�,<.�

5�� $?$����� $��()��.;�������

7��5��

�<<�� �(�� B.���()�� �.� $A$6#�

'�%&�'��&D�����%��

��� ����(�6&�/(��� 8���*�&.)� �.'���2$�<�� �� �(�5� <��&��()���.��A$6��

��� $�=����<� ?.).��� �<<5� �5(��� B.���()���.��.5%��-�

'&�%�5��

��� ���(�<��� ���(���#��(��5� �<<5� �5(�� B.���()���.��.5%��-�

$&�%�5�

<�� $�=���/� ?.).��� (� (� (�

��� $=������ ?.).��� (� (� (�

���� 2$����� ���5#�?�$��<(/�� �<<�� ��(�� <��&��()���.�A$6�

���� !���$���(/� ���(�6&�/(��#�!�$�<<(

��5�

(� (� (�

�/�� �()��$�)+���� $��()��.;�$=���� �<��� �(�� 8/&)&)+�+���)����%�

���� �()��$�)+�/�� =$��<�(��#�=��� �<�5� �5(�5� 8��%� %���� +���)#� ���*��

�$,$<.#�A$6�,<.�

�5�� �()+(���� 7��5��#����(��5� ��� ��� $.%��(���-� ���&��()�� �.�

A$6#� =8���*���

���� �?$������ 8���*�&.)�;�.'�=$�5<5� �<��� �(�5� 8/&)&)+�+���)����%����*�#�

1��/-#� 8�&�(1��� ;.��

���&)+���(�.)�����

���� ��(�(��� 8���*�&.)�;�.'�8/&��.)+�

�.*(��

�<</� �(�� 8�&�(1��� ;.�� �(��-� ()%�

�(����&��(�&.)���

���� B������� $��()��.;�8(�� �<��� ��(�5� 8'(����/&)&)+�+���)�

���%#����*�#�%����'&)(����

�<�� ��/(�� 7��5���#�=���(�� �<</� �5(�� $A$6�,$<.�

Page 55: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

�������!���

=����� �� �����!���"� '��(��� �����)�������������� �������� ����� � �%������

����������� =��������� � ��� ��� �� ����� � ���� �� � ������ ��"� ��� �����*?:

� ������� ���:�������"����������������������!������������ ����������������������

� ��� ��� �� ����� ����*?:���������� ���������� �� ��@� ������ ��'�,,�)��-����������

����������� ����������3��� �������� '� �������� 1�.B .<<?���$1�?�.�������1

D*-:��B��#�����1�-����B�#�����+��7�����$+=*=)���������2������ ���� ��������� ���

��Z.� �����������-������� ��.B .<<?B

$�'�B$�#)�����������������������������

������������������������= !����== $� �� ������������=������������� ���������

��������� ������������! ������� � ��� ������������ �������������*?:�����%����

��� ����*?:��������������"��������������������������������� ������������-��

��������������������������������������������������-��D

��������'���1�-��(B.�����

��1�D*-:)��:�������������������3�������������4����! ����� ������ �&���� � �&

�� ��"����� � ��'��L�$L�)���3���� �� �����"��4����! ����� ���� � � �&�� ��"��� � ��'�$L�)�

-����������� ��������3������������������������ ����������������������������������

����� ��������-����*?:����������������������+�� ���D��� ��� �������������

��������� ���������������-���*?:������������������+����� ��� ������������

��������� �������������������������������-��D

��������

8 �4��������� �� ������� �����*?:��%� ���� ������ �� �������������*?:�������� �� ������� ��������������*?:�����7�� ���� ����������S�-/D���������

��#+� ��� ��� ����� -�������� ��� � � ������� �"� ��*?:� ��� ���� ������� 'B ���

=���������.:�>=:)�������������"����*?:����������%������������B ������ ��#�*?:

������������"��

��� ��!���

=�3"���������� ������ �<�*��<�S�����<��������� ����� ��������������

� ��<�� ��-���� � ������>=:�������!�"���� ��.9����������� �����������������$

�������������!�����.9�� ���� ��������������0���������!�"����� ������ ��� �������

�����������*?:��:����������0�� ���������� ������������ �������R��! ��������

��� � �$��/�� �!$8���@���(<<� �<<5� (� (�

���� � 8$=���/�� 6������#�$=��5�� �<<�� ��� .�����&)+,�8�''����

���� � �B�<$����� <?$�5�#�B�$(�� �<<�� �(�5� 8'(��� +���)� ���%#�

���&��()�� �.� '&�%�5� ()%�

�.���()���.�$A$6��

�/�� � $=��5�� 2.��5��#��-%�

�5�

�<��� �(�5� 3��*�#�?����'&)(��#� =8�

E�A$6�,$<.�

���� � �7$���/� �!$�5/�#�$�(�� �<<�� �5(�� $A$6,$<.�

Page 56: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

� �����������R�� ����S��-�4������������R�� ����1��?-����3�� ��1������������� ��-�4

� �"��������������� ���������*?:��-������� ����3��������������������������

�� ��������� ��! �����"���� ������ �������� ������� ���/������������.9����� �

��! �!������� ��������������!�������������3������������������ �������������������

�?-��������������-�4�� �"�����������������������������4� ���� �������� �������

�������*?:�� ������!����������!����G����������������������������.9������� �

:3"���� � � �����.9� ���� ����-��� ������ �"������� �������� ������ �� ��� ���-.

-�������"����'1C�9������&/� ��)��-����.9�� ������������������������� �������

,$Z.�� �$������� �� �����"�$$��"���� ��,$Z.�� �������� �Z.�� ��������������Z.�� �������

:��������3���� ������������!�������Z.�� �������

���������!��!�����������

-�������������� ������������� �� ���������7�������+�:�� �����������S�-/D

������� � �� ����-���*?:�����������!������0����"�����������������+���������� ����

� ��� �������� ������������>7��������������:�����������*���� ������� ������� �

�"�����:������*?:�������'1/��8������)���������������� ���������������%���

�������������� ������������� ���������������� �����

$������������!�����������

*����0��������� ����� ��9:�*���������������"0���������?-=W=��.�7�����

���������� ��������%�����*��������� ���������'�������)� ���'�������)��-��������

����������!�"����������� �� ��������� ��� �����8 �������������.9����� ��

������������ ����������� ��� ������� ��� ��"��� ������������������� ��������

-�������������������� �� ��������������� �������������������������������� �

���������������-�������������������"���������� ���������� �"� ��������������

����������������C�����5��� ���������'�,#�)��-���>�@1:���� ������������ �������

������ �������������3� ���������"�� ����������G��/ �� ������ �������������

��� ��� ��������"���� ������"����� ������������� ��������������� ��>�@1:

���������� �����

$�������������

��� ��!���

� :� ��� ����3"�9:�*�������� ��<�D9<?������������� �������������!���"

�������$����������!��������<�� ����3"���������������"������ �������������

�� ��������9:�*��������-��"(��3������������������� ��� ���$,��������-���

����!����������� ��������������������������������'-������)�

Page 57: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

������������� ���� ��������������������������� � ��������������� ������������� ��� � ����� ������������������

��������� ���� ���� ����������������� ���������� � ��������������������������� ���� � ����� ������������������

��������� ���� ���� ����������������� ���������� � ��������������� ������������� ��� � ����� ������������������

� <�� ����"(��3�����������"(������������ ����� ������#�+�� �"� ������

-��� ��������� ��� �"� ���������������������������$�',�+)��:� ��������� �����

�������<�*(��� ��������3����������� ��������'��)��������+�� �"� �����

������ �����<�S� (�� � ������ ����������� ������ �� ������ ' )����� +

� �"� �������-�����0�� ��� ������������ ������%�� ������%���8������� �����

���������� ��� ������������������������<�*��������<�*����

������1� 9:�*� � ����� �� �$� ��������� !������� ������ ����� '�)� <�*� ��

'�)�<�*����'�)�<�*�E����L�1�L�1�%��*?:����%���������E����1���������������L�1�%��*?:��E����

�(�$�L�*�������!������� ������������L/*W9����LF#���� L�1$��$L����������L1>1����L�����7������

�L1E��,��#L�����,,����,L1E�#$ ����L1E��#�����L?1�����L��1���(� ��� L����1�������$L����1��� �

��L@�����#����L��*1������L��������#L-:�����,L:�������L@1� ����L=1E� $����L-:91���� L1E��

�$L:F1�##� �

Page 58: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

(��!��1��$����������!�"�����"� ��06�"��������*������������ �����"���

����=��*��� �������!���� ����� ������������� �"� �����*?:�����"���� ���$�����������!�����

����������

����

���

�� �

��%�

������

������

���������

�����

� ��!

"#�

$��%&

����

�'���

�("�&�%

� )�"#�*

�+�!�,

-��&

�+�.��

��(��

����&&

$��%��

�+���

�("�,,!�

��(����

����

�� ��&

�+�%

"�*�&��

������ ������

������ �

������

�����������

������

�����������

������

>� �

�����������

������

<�S(�� �� �� �� #���+�

<�S( � ��� ��� �� ,���+�

<�S($� � � � � �� ���+�

<�S(�� � �� �� ��+�

<�S�(�� #� #� �� ���+�

<�S(,� ,� #� �� ##+�

<�S(��� ,� #� �� ##+�

Page 59: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

<�S(� � �� �� �� ���+�

<�S(��� �� �� �� ���+�

<�S(�,� � � � � �� ���+�

<�S(��� �� �� �� ##�+�

<�*(�� �� $� �� ���+�

<�*(�� ��� ��� �� ���+�

<�*(�� ��� ��� �� ���+�

<�*(#� �� �� �� ���+�

<�*(��� ��� ��� �� ,��+�

<�*(� � �� �� �� # �+�

<�*(�#� #� �� �� #��+�

<�*(��� �$� �$� �� ���+�

<��(�� �� � �� ��+�

<��( � $� � �� ��+�

<��($� #� #� �� ���+�

<��(�� �� �� �� ���+�

<��(,� �� �� �� ��+�

<��(��� $� � �� ��+�

<��(��� �� �� �� ��+�

<��(� � �� �� �� ���+�

<��(�$� �� �� �� ���+�

<��(��� �� $� �� #�+�

<��(��� � �� �� ��+�

<��(��� �� � �� ��+�

<��(�#� �� �� �� ���+�

<�8(�� �� �� �� ���+�

Page 60: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

� :����� ���������� ��>�@1:�����"�����!������������������!���"��� �����

���"� � �� !������� ����������������� ������ � ����$�� � ���#�� ���� ��"

� ������������������������������-���9:�*��������������������������8���#�

���� ����� ��������������.�������� �������� ����3����!������������!������������

'�:� ��D)��������������� ������� ��� ��!��������/���� ��!�������:F1�##� �

1E#$ �������,,�����������1���� %���������������� ��� ��

� =����������:�� ������� ��������!�������� ������������� ���������� ����� ���

������=��� ������ �/� � ����� �� ���� !�������� ��� � ��/:9.����� ���!���"

��������� ��..=B:>��B�����������������.���� �� ������ ������!�������F(#��

��������� ��.=:>:A-��F���������������$���������� �����������1>1��

��������� ��1����������������*�� ������ ��!�����������7��������������� �

�:9���?���*���������� � �������!������������� ���������� ����� �������������

�������D�� ������ ��� �!������� ���� �����9��F��������� ���� ����������

.��������� ������ ��� ��!����������������� �������������� ���:>��E��������

���� ��/:9.����� ���� ��@:>��@�2���

� <��/ ��������"���� ������������ ������ ���������!���-:�������������������

�������/�������#�+��-������������������"�������� ��������'�#+)��� �������

� �����!���������������7����������1E���,���������������*���� ������+�������

�������"������ ����!����� ���#�$�+�����������������.��F(#���������1�$����

�� ����� �� � ���� !����� �� $#�#+� �� �� ������� ��!���"� �� ��+�� ���.����� ��

-9:1(������1E���������,+���������������"������$�,+�� ����!�����

E��������:���'�,#�)����������������������!���"�������"� ����������� ���������

�������������� �����=�!����� %�����!����� ��� ����������������� ��9:�*�'G������

��� ���,,�)������4���������"���������!���"� ��� ������!����9:�*���%�����!������

����������������"� ��������� �������� �"� ���������������'F������� ��,,�)����������

'=���������� ��,,#��E�%������������)���������� �����'1��� ������� ���,,#)�

8 ����"����������������!���"����� ������!������� ���������� "�������������

��� �����!���������������� ���-������� ����� �������� �����������"��������� �

9:�*������"�������!�"���� ��� ���%���������!���� ��� ���������!���-���>�@1:���

������ ������������ ��������� ������� �������������� "�������� ��������������

��������������"������� �����"���� ���������!���� ���������������� �����"�� �����"���� �

9:�*�� �"� ���������� ��!�� ����� ���� �� ���� ����� ��� ��� ������ ������� ��

�� �������������������"���� �2���!������ ��3������������� �������� ����$�� �� ��"

� ����������������!��� �����������������"������������ �����������!������������%���

������������!���"��� ������������!������!���������� ����"�������-������"�����������

����"����������������������� ���������!�������!�"���!��������� �� �����!��

������� �� ��������E�%����������� ��'����)��� ����������!��� ���������� �

���������������"������� ������/�������!�� ���!����������������������!������

Page 61: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��������� ���:9��������?���*������������ ������������������������������ �����:� ��

����������7�������������!��"�����!���"������������������/���>=:�,��������� ���

������� ���'���������,,�)������������������� �����"���� ���'������������,#�)��. ���� ���"

���� ���� ���"���������������� ���%������������������ ���� ��� �������������� ��

���������������� �������� ���� ������� ����"���������������!�������� �� ��!�������

=������"� � �!������� �������� � ���������� ���� �� ���� � �������� ��� ���� ��

����������� ���������D!��� ����������� ��� �� � ������������ � �������������������

������ ���� ����������"��������� ��������� ������/������� ��'�,,#)�������,�����

� �������������� ��� ������������-�����3������������ ������������� �� ���� �����

�� ���������!���"��-����� ���!�� ����!���������� "������!���"��� ����������!��

��"�������� ���� ������ ����%�������� ������� ������8 �������������3�� ��� �� �

���������!���"������� �������������������������3 ���� ����� ���� ��������3�� ����8

��� !����� ���3���������!���������!�� ����� ����������!������������ ��� ����

� ����������� ��� ������������ ������������ ����� ��� ���!���"�����"�������������

����� �� ��� � ������� ��� ����� ��!���"� ��� ��� �������� ������� �� � (� �� � ���

������ ��

Page 62: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity
Page 63: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity
Page 64: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

Page 65: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

&�'������

E�������������� ���� ����� ����� ��������� ���������<�� ���� ������� ��� ��

����� ������������������� ����"�������� ��������$��������� �������$�� ��� ���� �����������

��������� ����������$����������� ������������ �����-��� ������ ���������� ����

� ���������-�%�"��="������%������=���������/�������������������%������������ �����

������ ��� ���� ������������������ �� �����"�-�%�"���������������������� ���� ��"���

�������� ��1�����>�����/��������G���/������

��� ��� ���� !�����"������ ������ ����� �������������������!����������

��������������������������� ���������������"�����������%� �������������� ��������&���

�!�����������������������������������!������������!�����!� ��������������&��

���!�� ������������������"������!� ������������ "���3���!� ����������� ���

-�����!���"�����"���� �������� "���������*?:���!������������������� ���� ���*?:

��%��� ��%��98E����9:�*���==9���=-=���=-1=�������:8E������4������������ ����

��� ����������!�"�������� ��� ��������������3������� ����!���"��� ��������� "����

���������������"������!�������9:�*�����==9���%����������� �������������������

�� ��� ����������"�

/ ��9:�*�����==9���%�����!������������� ������!���"�����"�������������

�� �������������� ����� ����9:�*���%������������ ���������������������3��������

&���� �3�� ���������� ����!���� ������ ���� �������� ����!����9:�*� ����"���� � � ��

���� ������������������������ �����������!��� �������������3�������������:�������

�����(��������� ������'8 ����� ����,,�)��:��� �������3�������� �"� �����������

��3���������������"�!����� ���� ���:���"���� ��� �������!������� ��� ���� ��0"������

9:�*������!�����������������#+�����,,+� �����!���� ��������������� �������(

� ����� ��������������=������"��9:�*������ ���!������ ���������"����������������� ��&

����!��� ��� ������ ���&������������� !�������� ����!��������� ����� ����� ����

����!����������������� ����������������!�������"�������������������':�������� �

�,,�)�

=�������� ��'�,,�)������:8E������9:�*���%�������4���� ��!�������������"

�����!���"�������"� ���"� ���$�������������� ���������������3�� ����� ��� ������!���

����������������������!����-��������� ��:8E������"��������� ������ �������� ���

��!� ���9:�*�����"���� ������������������-���� ���� ���� !������������ ������ ��

��������������"� ���"� ��&�������� ��������*?:�� �"� ������������� ���������"

����"���� ��!������������� �� ������������ '7?-9)����� �������� ���������������

*?:� ��4�������� ���(������� ��4������ ������ '�==9)�� ���� ���������� ������� �����

� �"� ������':8E�)� �������������������� ������������������!���'&����� ������)

�������� ���"������� ����������2�������� ���������������� � ����������� �� � �����

Page 66: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

����� � ����� ������� ���"������!���� ������������!�������������������������� � �� ��

1������������� �� �������:��������������� ���������������������"��������

�����"� ���"� ������������"�����"0�������!���� ���������-=���� ���� ������������-��

�������������� ������������98E���������

=�!���� ������ �� ������� ��!���"� ��!�� ����� �� ���0��� � � ������� ��� �������

:�����������-�%�"�����D�� �����/� �"��������� �� � ��������� ��������������� � �����

�������� ���� �"����0�� ��� �" �������� �� ���������� �3 � ������� ����� � ������� ���

�! ��� ��"�������� ������ �� �����������������'�������� �)�����������'&�� � ����� �)�

������'&����� ������)���������%����'������������ �)������� �������������!�� �������

������8�����.�������-��������� ���� ������������������� ��������������3��������� �

����� ������������!����������� ������������ �����������

.���������"��������������� ���������������������� �������������������="�������

�������������������!�� �������.:9*:�����������"���������� ������������������ ��

��� ������������ ��������� ��� ����"���������'����������D�� ���)��B ��!��� �� �

$����� "����� ��"� ��������'�EE�����)�������%����"���������� ������ ��������� "����

-����������3������������������"������ � ������� ���������"��������������� �������

!������������������ ���������� ���� ���������!���

������!

-��"( ������ "��� �������������������������!���� �����������������%���� �*?:

������������������!���"�����"���� '-�����#)��-� ��� ����� "���� ��������� � ��3 ��

��� "�������1�� �������� 0����� 0�'�EE�$���)�� ��:����������������������"�����

����������"��� ���������� ������������������������������� ������� ��������

�,,���-������ ���� "����������� �������������%��� ������������������!���"��� ��

�������������!���

(��!��=��3������������!���!���������������� ������������������*���������!����

�+�

��+�

��������� ������ �� ����������������

�� ?�=��5�,��&-(.� �=����#�=����� 8�'&(����(%&)+#� %(�=� +���)� ;.�&(+�#� �������

;�.5��#� �(;;�.)� *.�-��%.)#� �/5(��� %(-��%��(�&.)#� 1.�%� ���%�%� ,���<� +,�� ���%�.#�

���&��()���.������

�� 7��5�,$(�&=(.� =.*(������*�&.)� 8�'&(���*�#� �&+/�� +���)� ;.�&(+�#� ������� ;�.5��#�

�(;;�.)�*.�-��%.)#�1.�%����%�%#�,/�+,�����%�.�

/� =����(��,8(�)(.� =�<(���#��?=8�(�� 8�'&(���*�#� �&+/�� +���)� ;.�&(+�#� ������� ;�.5��#�

�(;;�.)�*.�-��%.)#�'(������&)��/5(���%(-�#�1.�%�

���%�%�,���+,�����%�.#��.���()���.������

Page 67: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

(� "5�'+��� .����+�)����(� ���������� ���/� ���� � ��������� ������� ��������

������ ������� ���������������������

$� 6."��+��������� :"��9��)�"&���,�� ���������� ���/� ���� � ��������� ������� ��������

������ ������� �������������������� �������� ��

������������ � ��!#��!$������������ ������� �! (�

�"�##��������

�� 8�!�� ������ ���1� ���� ���������� ����� ���� � ��������� ������� ��������

������ ������� ���������������

,� ""��(,� .��+'(��,�)��.+�� ���������� ����� ���� � ��������� ������� ��������

������ ������� �� ������ �������� ����� � �� ����

� ������

'� "�(�(,��.����

4�����B��

�"�!',$�)�.(��)�

.14"���

���������� ����� ���� � ��������� ������� ��������

������ � ������ �� ������ �������� ������� �!(������������� �������

,� "�(#,�� ."�+!(��,�)�."��!,� ���������� ����� ���� � ��������� ������� ��������

������ ������� ���������������! ���"�##���������

������ �������

�#� "�,��+� ������ ����������� ���������� ����� ���� � ��������� ������� ��������

������ � ������ �� ������ �������� �����

����������������� �������

��� ."�(#�� ������ ������.�(,$� ���������� ����� ���� � ��������� ������� ��������

������ � ������ �� ������ �������� ���� ������ ��

��������� �

�+� ."��!,� "�,��+�)�8�'� ������������ ��� ����� ���� � ��������� �������

�������� ������ � ������ ��������� �������� �!$�

�(#� ������ ������ ������� �� ,�"�##� ��������

������ ������������� �������� ���������������

�!� ."�(� C."�9�,$�)��."��'(�

)�.�+''��

���������� ���/� ���� � ��������� ������� ��������

������ � ������ �� ������ �������� �� ,� �"�##�

�������������� �������� �����"����������������

� ��!$��(#������

�(� ."�$� "(��!�)�"&��,�� ���������� ���/� ���� � ��������� ������� ��������

������������� ���������������������

�$� ."�+!(� ������ ������.�+!#� ���������� ����� ���� � ��������� ������� ��������

������ ������� ���������������������� ����� �

������� ������

��� "�(�#!� .���#�)�"!,,�� ���������� ����� ���� � ��������� ������� ��������

������ ������� ���������������������

�,� -."�$+$� ."��!,�)�.���#� ������������ ��� ���/� ���� � ��������� �������

�������������� ������� ���������������

Page 68: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

��� 8�/.�����(/� A� 8�'&(���*�#� %(�=� +���)� ;.�&(+�#� ������� ;�.5��#�

�(;;�.)�*.�-��%.)#��'(������%�%�

�<� �=����(�� $��()��.;�0�(�5� 8�'&(���*�#� %(�=� +���)� ;.�&(+�#� ������� ;�.5��#�

�(;;�.)�*.�-��%.)#�'�%&�'�1.�%����%�%�

�� $(�.)� 3#.�&*�*.���*�&.)�

;�.'�?8��

8�'&(���*�#� �&+/�� +���)� ;.�&(+�#� ������� ;�.5��#�

-���.5�*.�-��%.)#�'�%&�'�1.�%����%�%�

��� ?�=�5�� �=��/<�#����*.D� 8�'&(���*�#� %(�=� +���)� ;.�&(+�#� ������� ;�.5��#�

-���.5�*.�-��%.)#�1.�%����%�%�

��� ���*.D� 3#.�&*�*.���*�&.)�

;�.'���+�)�&)(�

8�'&(���*�#� �&+/�� +���)� ;.�&(+�#� ������� ;�.5��#�

-���.5�*.�-��%.)#�1.�%����%�%�

�/� 0����,��/(.� 8���*�&.)�;�.'�?.�/(��

�.*(��

8�'&(���*�#� %(�=� +���)� ;.�&(+�#� 5/&��� ;�.5��#�

�(;;�.)�*.�-��%.)#��'(������%�%�

��� !�=����,2..�&.� 7�A�5�#��=��/<� 8�'&(���*�#� %(�=� +���)� ;.�&(+�#� ������� ;�.5��#�

�(;;�.)� *.�-��%.)#� �.���()�� �.� ����� ()%� 5&��#�

'(������&)���5(���%(-�#�1.�%����%�%�,����+,��

���%�.�

�5� <()@()� $��()��.;�0�(��� 8�'&(���*�#� %(�=� +���)� ;.�&(+�#� 5/&��� ;�.5��#�

�(;;�.)�*.�-��%.)#��'(������%�%�,����+,�����%�.�

��� F0=�5��

,8�1�(�(.�

?=8���#�B�(/�� 8�'&(���*�#� %(�=� +���)� ;.�&(+�#� ������� ;�.5��#�

�(;;�.)� *.�-��%.)#� 1.�%� ���%�%#� �.���()�� �.� ����#�

'(������&)���(��5�%(-��

��� 6=��� 8���*�&.)�;�.'��.*(�� 8�'&(����(%&)+#� %(�=� +���)� ;.�&(+�#� �������

;�.5��#��(;;�.)�*.�-��%.)#����%�*.(��1�(*=#��'(���

���%�%�,��<+,������%�.#��.���()���.�5&���()%������

��� ?=��� 8���*�&.)�;�.'��.*(��

,��'.�(.�

8�'&(���*�#� %(�=� +���)� ;.�&(+�#� ������� ;�.5��#�

�(;;�.)�*.�-��%.)#�'�%&�'�1.�%����%�

�<� 6=��/� A� 8�'&(���*�#� %(�=� +���)� ;.�&(+�#� ������� ;�.5��#�

�(;;�.)�*.�-��%.)#��'(������%�%�

/� 6=��� =.*(������*�&.)��

;�.'��&�/.�(+(�/�

8�'&(���*�#� %(�=� +���)� ;.�&(+�#� ������� ;�.5��#�

�(;;�.)� *.�-��%.)#� �'(��� ���%�%#� 1�(*=� ���%�%#�

�.���()���.������()%�5&���

/�� 2?=��� ���*.D�#�=�<(��� 8�'&(���*�#� %(�=� +���)� ;.�&(+�#� ������� ;�.5��#�

�(;;�.)� *.�-��%.)#� 1.�%� ���%�%#� ���&��()�� �.� �����

()%�5&���

Page 69: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

�������!���

���'���������*���������!���

-�����!���"�����"������ ��������������� "��������� ���������$ �9:�*������

����� �==9�������'-������,����)��-���9:�*������������ ������ �����<�D9<?

-D.B?<E<@�D=��>=:��-���==9��������������������"������!��������� ��������%���

��� �����������!�������������������� "���������������[�����4������ ��� �����%�����

�����! ��� ��"����� ������

3�����!�������������������� ��

*?:��� ��� ������� ���������� ���������������� ����� ������������/�������

�.9����������� ��������� �����������%�����(������������������1C�9��������-.(���

��� �"�����9���� ��� ��� ���'���%�)�� ���������������� ����� ����*?:������������

���� ������*?:�� �"������'/����� ��@����)������%1������ ���:-����.-����@-�����

�--��'/����� ��@����)���������%1��������������-����.9�������� ������� ������1

-��(B.�&����1�F.�&������&������������B�#� �'/����� ��@����)��."����� ���� ��������

�������������� ��������,$�.�� � ������ �� �����"�$���"����� ��,$�.�� �������� ��.��

�������������.�� ��������������������3���� �������.�� �������

3�����!��������������������$$

�.9����������� ��������� �����������%�� ���(����� ��������������1C�9������

�-.(������� �"�����9���� ��� ��� ���'���%�)�� ��������������� ����� ����*?:

���������������� �����*?:�� �"������'/����� ��@����)������%1������ ���:-����.-��

�@-�������--��'/����� ��@����)������%1������ ��� ���������!�����������-����.9

������� ������� ������1�-��(B.�&����1�F.�&������&������������B�#� �'/����� ��@����)�

."����� ���� ���������������������� ��������,$�.�� � ������ �� �����"�$���"����� �

,$�.�� ���������$�.�� ���������������.�� ��������������������3���� �������.�� �������

�*���������!���

:��������� ��� ��������� �� �!����"� ���� �� ����� �����+���� ��� ���� �

9:�*������+���� �������� �==9�����!������0�������>7���������� ��

$������!����!���

-����������������� ��������������*?:���������������9:�*������==9�����

����"���� ������������������� ��������� ������ ��E�������� "�����:����������������

������ ���� � �����������'�)� ���������'�)� ��� � � � ��������� ������������"

���3� �� �����������9:�*������==9����� "�����"�������:�����*���* �� � �����

:�����������"���������� ������������"����3�������� ��������������������������

Page 70: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

� ������ �����������������!������'>�@1:)��?-=W=H���!��� ������� ��������

������ �����������"������������������� ���������������

(��!��?� �� �7������ ���"��'��������������*���������!���

����� ������ �� �������� �

������

�������������)�����

���������������)�����

!��� �����!��

<�:.�H$� :.@@@:..-@� $� ?��

<�:.(�� ..:@::.@@:� �� ?��

<�:.(�� @-@@..@:-@� � ?��

<�:.(#� ---@@@-@..� �� ��

<�:.�(,� :@:@.@-:..� ?:� ?:�

<�:.(��� :@.:@.@:@@� �� ?��

<�:.(��� ..-@@@-.:@� �� ��

<�:.(��� @@.@:@-@-@� $� ��

<�:.(� � @:...@:--@� ?:� ?:�

<�:.( � .:.-@@...:� �� ��

<�:.(�#� --@@@@@:@:� �� ?��

<�:.(��� :.@@::@-@@� �� ?��

@�"*� � � �

<�/.(�� ..--.@@.-.� ?:� ?:�

<�/.(�� :.:@-:@.@@� $� ��

<�/.( � @@.--@:..-� $� ��

<�/.(�� @::@@.@:@:� $� ��

<�/.(�� -@[email protected]@:.� �� ��

<�/.(#� @@-.--...-� � ��

<�/.(��� ::.@-.@:@@� � ��

<�/.(��� ----@.....� � ��

<�/.(��� ..-..:..:@� �� ��

Page 71: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

<�/.(� � ..-@@.:.:@� $� ��

<�/.(�$� @@-..@:.@:� $� ?��

<�/.(��� ..:@:.-..:� �� ��

<�/.(��� .-@@[email protected].:� �� ��

<�/.(��� ..@--:@-..� �� ?��

<�/.(�#� @-@::@@:@@� $� ��

<�/.(�,� :.::@.@.@:� �� ?��

@�"+� � � �

<�/D(�� .:.-..-@@-� � ��

<�/D(�� :[email protected]@-:@� � ��

<�/D( � -@@:.-.@@-� �� ��

<�/D($� ...::@.@::� �� ?��

<�/D(�� @@::[email protected]:.� ,� ��

<�/D(�� .:@.@@@-.:� �� ��

<�/D(�� [email protected]:-@� $� ��

<�/D(#� @@@::@.@-.� ,� ��

<�/D(,� [email protected]..� $� ��

<�/D(��� ::@.@@...-� � ��

<�/D(��� @[email protected]@-� $� ��

<�/D(�$� .---@.@.:.� � ?��

<�/D(��� --.@@.@:-@� � ��

<�/D(��� .-..:.@:.-� �� ��

<�/D(��� @@@::::@..� �� ��

� - ��� ��$� �

Page 72: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

(��!�)A��7������ ����$$ ������� ���� �����*���������!������� !���!

����� !������#�

"���

,�� �#�� #������-������ ��������������$�����

���������������

��%��� $+�$(G� +�C��������� ,#��,$� .�

��%�+� $+�$(G� +C��������� '#���##� .�

��%�(� $(G� �������� '#��$#� .�

��%�$� $(G� +C��������� !#�,$� .�

��%��� $(G� +C��������� ,#��$#� .�

��%�,� $(G� +C��������� ,#�,#� .�

��%�,� $(G� +C��������� ,#� �.�

��%��#� $(G� �������� ,#���#� .�

��%���� $(G� +C��������� !#�$#� .�

��%��+� $(G� +C��������� '#���#� .�

��%��!� $(G� +C��������� ,$�'#� .�

��%��(� $(G� +C��������� ,#��##� .�

��%��,� $(G� �������� �#�,$� �.�

��%��'� $(G� +C��������� $#� �.�

��%��,� $(G� +C��������� �#��($� .�

��%�+�� $(G� +C��������� !#��$#� .�

��%�++� $(G� +C��������� �#��##� .�

��%�+!� $(G� �������� (#�'$� .�

��%�+(� $(G� +C��������� �#� �.�

��%�+,� $(G� +C��������� $$� �.�

��%�+'� $(G� �������� '#���#� .�

��%�+,� $(G� +C��������� �#��,#� .�

��%�!#� $(G� +C��������� �#��+$� .�

��%�!+� $(G� +C��������� (#��#� .�

Page 73: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

88<(/�� 5D*� �C�(+(�.��� �#�� ��

88<(/5� 5D*� �C�(+(�.��� �#��� ��

88<(/�� 5D*� �C�(+(�.��� <#�5� ��

88<(/<� 5�D*� �C�(+(�.��� ��#�� ��

88<(�� 5�D*� �C�(+(�.��� 5#�5� ��

88<(��� 5�D*� �C�(+(�.��� �#�� ��

88<(��� 5�D*� �C�(+(�.��� /#�� ��

88<(�<� 5�D*� �C�(+(�.��� �#�� ��

88<(5/� 5�D*� �C�(+(�.��� �#�5� ��

88<(5�� 5�D*� $��(�/.�� �#�� ��

88<(55� 5�D*� �C�(+(�.��� �#�� ��

88<(5�� 5�D*� �C�(+(�.��� �#�5� ��

88<(5�� 5�D*� �C�(+(�.��� //#�/� ��

88<(5�� 5�D*� �C�(+(�.��� �5� 2��

88<(�� 5�D*� �C�(+(�.��� �5#�� ��

88<(��� 5�D*� �C�(+(�.��� �#��� ��

88<(�5� 5�D*� �C�(+(�.��� /#�5� ��

88<(��� 5�D*� �C�(+(�.��� 55#��5� ��

88<(�5� 5�D*� �C�(+(�.��� /#�� ��

�$�������������

� :� ���$ �9:�*�������������$��9:�*����������������������������������� ��

������������� ���%�������� �������"��:� ��������������������������������+

'�,&$�)� ������� ��� � �"� ����� ������ '8��� ��)������ ��� ����+� '��&$�)� ��!�

� � � �����������'8���,)��:� ��� ����$����������� ���!���������9:�*������

'-������,)�

� :������$ �==9��'==9������=-1=�)���������������3��������� �,+�'�&$ )����

� �(� �"� �������������������� ���==9��' �&$ )���!��� �"� �������'8���������

��)��-����3�������������� ��������

Page 74: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

����

�� �������������������������������������� ����� � ��� ������������������������������� � ��� ��������������� ���������������� ���

�����

�������� ������������ ���� ������������������ � ������� ��� ���������� ������� � � ������������ ������ ����� ����� ���

�� ���

������������������������ ������������������ � ������� �� �������� ��������� � ������� ��� �������� ���������� ���

����))��� �"� ������������������ �� ����������� "����'�( �)�������==9������==9( ���������L

�����������

����)A��� �"� ������������������ �� ����������� "����'�( �)�������==9������==9(����������L

�����������

����?���? �(� �"� ������������������ �� ����������� "����'�( �)�������9:�*������<�:.(���

������L������������

Page 75: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

� .���������"����������� ����������==9�����9:�*������������"��-������� ���

���!��� � ��9:�*����� �� ��� �������� ����� � ��� ���������� ������� ������

���%� �����-������� ���������� ��==9������ ������������ ���� �����������

�� !������ ������� "����

� -������ "����!�0���EB�#$(#������E(� ,���!�� ��������������E(,(������� �� �����

9:�*�����"����������������� "�������4������� ���� �� ����� ��������������

���==9�����"����������� "����E(,(��������E�� ,����4������ ����-���������������

���==9�������%��� ���� ����� ������!���"�����"����

� -����������������� ����� ����� "����������������==9���%��������!�����

-���������-����������������������������"����������������!������� ����"�� �� � �����

���� ��������������

� ?������ �����9:�*�� �� �����==9������������ ������!�����9��2������������

��/����������������������������� ������������"������������

� -����������� ����������������"������� ��C������5�� ����������������� ����$,�

��#��������9:�*����������� �==9������������ ���,$��B������ ��9:�*�����==9

��%������4������������ ������!���"�����"������ �����������������������!���

����)0��*��� ������!�� �����"����� ��9:�*���%��

Page 76: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

����)5��*�� ����� ������������==9���%��

� 1��"��3 �����������%��1�� �������� 0�� �� �� ����������������'8������A�� )�

���������������3������� ����!���"��� ������������!������� ����4����� ������

�� ����� �� ����� ��'�)��� ������������%� �������������!�� ����� ��!������

%�������

Page 77: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

Page 78: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

Page 79: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

&�'������

����''�� ����� ��E�)���� ��� ������ ����� ���� ����������������� ���� � ��"

� ����!�"� ������ "� ��� ������� �������� �� ����!��������������!������������������

������������������� ���� ����%����� ����� �������� ������ ���������������� ������

����������������� �������3����������������.����������9������'F����A�*�3�������)�

��������� ������� !����������������������(� ����������� ���������������!��������

����'����"�����)������ ��'�� �������)����� �'������)������� �������� ������������������"

���%���� � �"���� ��������������� ����������������� �������������� ���� ������

����� ����!�"� ��,���%�&��'����(��)�

*������� �� �����������!���"������������ ��������%�"� �� ����� !������8

������ �� �����������!���"����������������� ��!�����������"��!�� ���"���� ����%�

�"��������������������"�������������'����� �� � ��������� ��������� �� ������)�

1 ���������%���������� ������������������������ ����!� ������������� ����� ��

�� �����������������3����� �� ��������������� !��������������� ��� �"� ���������

����������� !�� �����%���"������=�!����� ������������4�����������������

!������ ���������� �� ���� ��!���"� ������������� ��������� ����� �� ������� �����

� �"� ������'98E���=��� %���� ����,#,)����� ������������� �"� �����*?:�'9:�*�

G����������� ����,,�)�����������4������������'==9���C�� ����� ����,,�)������������������

������� �"� ������':8E���7 ����� ����,,�)������ �������"�==:���'��4��������������

���������� ��� �"� �������G�������������,,�)���9:���'����� ���� � �����������

� �"� �����)� �9D1:���'� ����� � ����� ������������������� �"� �������F������

��� ����,,,)��:� �������������4�����9:�*����� � ��"��������� ������%��'F������ ��

�,,�)������� �����������������������*��� ��������!������� !�� �����%���"�����

9:�*�����������������������������"�� ����������!���"�����"����������"���� ���� �

����������������������

-���� ������ ��� � �������� !����������� ��������������!���"��� ��������� ��

������������!������������������������ !����������3��� �������� ����9:�*���%�

����"����!������� ���� "����1 � !��� ��� ���������"� �� ���9:�*���%�� �"�����

������"����!�������������� �2������

������!

:� ��� ���$��������������!������� ����������!������ ����������������������

��������� �� � ������!���� ���� �� ���������0 �������������������� �������� �

� �������� �"� ������������� '-�������)�� �:��� �������!�������� �������� ��� �

� ����� �������������"����� ����������������������������� ���������9��������F�����

������

Page 80: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

(��!�� ))� 7��������!�����*���������������������������������"�!��!����*�����

���!���

�����

����

���� ��������� �������������

��� F8���� � F�19�# �S�F�19�,� -����"�����������������!���

��� �@� � -��� �S�/ ���!����� *����"��������(��������!���

�� 9������ -��� �S�-���� -����"������������!���

$�� ��8�,,(��� �*�*�#�S��������� -����"������������!���

��� �������� -����S�-��� � -����"���

��� C1��� E ����"��� ��/ ��S��

'��##(��S�$��.)�

-����"���

��� C�"���� B8��$�S��@� � *����"���

#�� F�19����� F�19�����S�B8��$� *����"����������������

,�� F�19��$$(�� 9������S�B8��$� *����"���

���� *19��� ��#��S�E����� -����"���

���� :���%��� *19����S�B>���� -����"���

���� 7E���� =����� ��� ��1����� -����"���

� �� 7E� � <���=����S�G��%����*������ *����"��������(��������!����

�������� ���

�$�� /���� =����� �� ��� �����������

� ��/����� ��'=���� ��

G���/������������)�

-���� "���� ����� �� ���� ����(

��������!���

���� C��##�� '-��� �S���##(�)�S�$�.� -����"�����������

���� =���� 8��!�����S�B8��$� *����"����������������

���� =����� 9������S�C��##�� -����"���

�#�� B>���� ':���%����S�.����$)�S�=��$ � -����"����������������

�,�� **9�$$� B8��$�S�F�19����� *����"���������� ����� ��

���� B8��#,�,�'>��)�

D.���,�#��S�B8��$� *����"����������������

���� F�19�$��� 9������S�B8��$� *����"����������������

���� B8��$� -��� �S�D.���,�,�� *����"�����������������

� �� B>*����� '�@� �S�=�$ )�S�8.��� *����"�����������������

�$�� ��8*�,,(� � B8��$�3�E8��#�� *����"�����������������

Page 81: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

�������!���

�� ��.������

@�� ����*?:� � �� ����� ���� !���"����� �� ����� � �� ���%��� ����� �������

'��� 3�����"���������)�����%���� ��" �������������� �� ���� ����������� ��� �� ��*?:

����� ��������� ������ �������� � �� ��@�������������E�������'�,,�)���� ��������

������������� ���� ���!�"����������������������������������N�����1�� �����������

�B�$�#J������1�?���J�����1�D*-:���B�#��J�����1�-�����B�#��J��+��7��'1G������)J

��$+�=*=O������������������ .�� � ���������� �� �����"����.�� ��������������

����� �� ������! ����� �����1���� �������������.�������� ������� ���� ����������

�����F�9�1��-��������! ����� ������������ (� ��� ��������3����������������������

%�����(���.�� ������������ �*?:��������� ���*?:������������� ��������������

������+����� ���������� �!������-D�'����1�-���������1�D*-:���B�#��)���*��� �!��

*?:�� ��� �������3������������� �L���� � �L��� (��"����� � ��'��L�$L�)�����9?:

������ !����"�9?:���������Q�$�R�&��� ����������������� ��� �%� ������&��� �

9?:��)��� ���.�� ������*��� �!���*?:�'���-D������)�����������3�������������

��� � �L��� (��"����� � ��'�$L�)��*?:������(������������������ �!������-D�������

��������*?:���������%���� ����4����"�����4����"��"���#+���� ����������� �� ����

������������������'�λ�)�*?:�����������' �����&R�)��*���� �� �����*?:�� ��� ������ ���������-D������� ���� ������ �� ����� 3�����"������&��R��� ���������.9�����"����

�� ��"�!�����������

�.9����������� ������������ ���������������(������.9��������������G������

/� ����'� ����-��-��� �"���)� �������"����� � �:� ��� ��#��9:�*����������

�����������������������"������������� ���*?:�� ������������������"����������

� �"���������������� ��'�.9)���3��� �����R��� ������������� ����� ����*?:��������

����>� ������*?:�� �"������ '/����� ��@������/����� ��� �����)�������� ��������

�����'<�� ��-���� � ������:��������.:��>=:)������R�� �����S��.9�����"�������'��

�1�F.�������1�-���H�.��������1�1�.��)����������R�� ��� �����?-���'�����1������ �

�:-����.-����@-�������--��� ��8�������E����=���������>=:)���.9��"����� ���� ��

���������������������������,$��.�� � ������ �� �����"�$$��"����� ��,$�.�� �������� ��.

� ��������������.�� ��������������������"�����������3���� �������.�� ����������

� !�����

���"���������������������!�

�.9�� ������������� �� ������"��������� �������+���� �������� �������

��������� ������������S�-/D�������'�B�#��)��-�������������� ���������!������0������

�� ������������>7������� �����<5@����9���-1��������*?:�E����������'8������

E����=���������>=:)�������������� ���������������%��

Page 82: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

��������!����

*?:������������� ���V�5�� ����������������V�5�� ������������� ����������(

��� "���� ������ ����-���������"��������3�������������0��� ����������������������"

������ ������ "������<��"��������� ��������������� ���� ���������� �� ��������

�������"���� ����� �C�����5��� ��������� ���������"���/����� ������������>�@1:

'��������������� ������ �����������������!�����)�������������������� �������

���� ��������%����?-=W=(���'9 ������,,�)����-����3��������� 0"� ��"�� ���������

��%��'B�)����������������"�B

��M��(����'������������������4����"� ���������������'?���

�,#�)��/"����������!������ ��B���B

�!�'������������������� 0"� ��")��������������

�"�B�!�M�B

�&��'��M������� ����%��� �� �������"������ �������� ���,,�)���-����!����

��� 0"� ��"�� �� �"� �������%���'B�!)���������!������'B

�!)��M�B

�&���'���M�� �� �

� �"� �������%��� �� ��)���1�%������3�'1�)�������� ��������������1��M�D�'B�!)��'D

���������!���������3��� ��������������"��������������������� �� ��� �"� �������%�

�� ��)���- ������������ ������"� ��*?:������������� ����"�� �����!�����������������

�"���������������������"�9���%���������� ��'�,,$)���!������������"�����3�� ��������

������ ����� ��'S*)������ ����"����� "�������� �����'S

*)��������S

*M��!������������"

����3�������M��!����������� ������������� ������������!��

$�!����������

�����!�"�����"

� <�� ��� ���#�������������������.9����������� �������������� ������������

�������� ������������� ����������� ���������������� ���!������������ �������!���

���� ������� �� ������!�"������ ���00"�������'-�������)��=� ��������9:�*

���������� ����������� �� ����,����������������� ���� ��$�������'�"�<�����)

��#�����'<�/:���)�� �� ��������$ �'�$�#+)������������ ���� ����� �"� �����

(��!�� � )0� ��!�������������"�!������ �����"����������������� �����"���

��*�������!�*���������!����

����� ��������+����

������

��������������

��+����

������� �

������������

������

������� ����

��9���������

�����+���������+�-�+����

����������������������

����������-�� ���+���+����

������

E������ �� ��� ����� ��� ���������

E������ ��� �� ����� ��

E����� ��� �� ����� ����������� ��

E����� �� �� ���� ����������H������

���� H������������

Page 83: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

<������ ��� ��� ���$� ��'����������)�

<������� �,� ��� ����� ��',�������$)�

<������ ��� ��� �#� � ��'����������)�

<����#� ��� �#� #�� ��'���������)�

<����,� ��� ��� #���� ��'��������� J���������)�

<������ ��� ��� #�� ��'����������J�� ���

�����)�

<������ ��� �,� ,�� (�

<������ �,� ��� ����� ��'���������)�

<���� � ��� ��� ,���� ��'���������)�

<����$� ��� � � #�� � (�

<������ �$� ��� ���$� ��'����������J��$�������)�

<������ ��� ��� # � � ��'���������)�

<������ �$� ��� �#��� (�

<����,� ��� �,� ��� ��'�#�������$J���������$)�

<�/:���� ��� ��� ��� (�

<�/:���� ��� ��� # � � ��'����������J� ��������)�

<�/:�� � �,� ��� ����#� (�

<�/:��$� � � ��� ,�� � (�

<�/:���� ��� ��� #����� (�

<�/:���� ��� �$� � � (�

<�/:���� ��� ��� $���� (�

<�/:��#� ��� �,� ��� ��'���������J� �������)�

<�/:��,� ��� � � #���� ��'�,��������)�

<�/:���� �#� ��� #���� (�

<�/:���� �$� ��� #���� (�

<�/:���� �#� �$� ��� (�

<�/:��$� �#� ��� ����� ��'$�������)�

<�/:���� ��� ��� ���$� (�

Page 84: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

<�/:���� ��� ��� ���$� ��'���������)�

<�/:��#� ��� ��� ��� (�

<�/:��,� �,� ��� ���#� (�

<�/:���� �#� ��� ��� ��'#������� )�

<�:U���� ��� ��� #���� ��'������� )�

<�:U�� � �$� � � ��� ��'�,������� J�#������� )�

<�:U��$� ��� ��� ��� (�

<�:U��$� �#� �$� ��� (�

<�:U���� �,� ��� ����� (�

<�:U��,� �#� ��� #���� (�

<�:T���� � � ��� � �,� ��'��������)�

<�:T���� �#� ��� ��� (�

<�:T��,� ��� ��� # � � (�

<�:T�� � �$� �#� ����� (�

<�:T���� �$� ��� #���� ��'��������#)�

<�:T���� ��� �$� #�� ��'�,��������J������

����$)�

<�:T��#� �,� �$� $$�$� (�

<�:T��,� �#� �$� ��� (�

<�:T���� �,� ��� ����� (�

<�B���� ��� ��� ���� (�

<�B���� ��� ��� ���� ��'����������J� $�������)�

<�B�� � ��� ��� # � � ��'$�������#)�

<�B��$� �$� ��� ��� (�

<�B���� ��� � � ��� ��'$��������)�

<�B���� ��� ��� ���� ��'�,�������J��$�������$)�

<�B��#� ��� ��� ���� ��'�#������$)�

<�B��,� �#� �#� ���� ��'$�������,)�

<�B���� �#� �#� ���� (�

- ��� ��,� $ � � $ �

�'?�/��-���9:�*�������<����#���J�<�/:�� ���J�<�:U��������� ��������#����J�<�:T������#������������$���

�����<�B��������� ��������00"������� ������ �������"J���������!��������������������������� ������

������ ��������4�������'�)������������������������� �� �����!���"�� ��� ������ �-���������������!��")�

Page 85: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

� �-�����!��� ��� �"� ������������� ������+�'�"�<�:T����������#&,�������� ���

����� � � ����)� ����+�'�"�<����$�����<�B��������������#���,��������������

��������� ������������*?:�������������� ���� ����� �������������������#������#�

������!��")�

� �1�3����������� ���������������� ��������� ��������"������<���� ���1 � !��

<����$�� ���������������� �� �����"�<�������<�/:��,�����<�B����������������

�������-���������<�/:��������<�B����� ���������������������� ���������������

� �<������!�����,���������������������� �������������������� �� ����������

'$ � +)���������������"�� ������*?:�������� ����������!�����!����� ��,����

8 "�����9:�*�� ������ �������"� ��9:�*������������� �������!���"

�����������*?:����������� ������������������"�� ��� �����9:�*������������

�������������!������������� !��������8������$�

������������������"��'������.�

� B�� 0"� ��"���������������� ������,������������ ����� ��������"����� "���

���9:�*��������� ������!���������-���B�!�����'B

�!)������� ���� ������$,�����

���� ��������!��"���������������%������3�'1�)�!��������� ������� ����$��#�

'-������ )�

3�������!����������������������

� -��������� ��������������������� �������!����! �!���� ��!�� ����� ��������

������� �� � ���������������������������!������ ��������"�'���,,� ���#� )

'-������$)���B�������������"�'��#� )������������������������"���*19������

:���%���7�"������������ ���������"�������� �� �����������9������������8�,,(��

'��#$#)������������F�19��$$(������*99�$$�'��#$$)������������ ��!��������� �

����#�+��������"���!������� ���������������������� ��9����������*19��J���8

,,(�������*19��J�������������C��##�J�F�19���������F�19��$$(�J�F�19����

����*99�$$J�B8��#,�,�����B8��$���<����� ���������������������"�'���,,)����

(��!�� )5� !������ ��� �����"��� �����"� �� �������� ������ �*������ �

��!����� �!�*���

��"��� �

#$�%�

������

�����&���

$�"�>�� �

����������

�������

$�"���"�� �

�����'�

�����

(��� �(����� )*�

��� �$�#� ,���� ��$,�� ���� � $��#��

Page 86: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

(��!��)6��3������"!�����"���.����06��!����!�*����������

B��������*���!������F�8��� ������@� �� ��9�������$����8�,,(�������������������C1

�������C�"�����#��F�19������,��F�19��$$(�������*19

�������:���%�������7E����� ��7E� ���$��/���������C��##�������=���������=�������#��B>������,��*99�$$������B8��#,�,������F�19��$$(�����

B8��$��� ��B>*�������$����8*�,,(� �

�.�

+�

,�

-�

.�

/�

0�

1�

2�

./�

..�

.+�

.,�

.-�

..�

./�

.0�

.1�

.2�

+/�

+.�

++�

+,�

+-�

��������

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

������#�������

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

�������������������

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

$����� ����,#���#$#�������

��

��

��

��

��

��

��

��

��

������,����#,�������������������

��

��

��

��

��

��

��

��

��

�����������,����� ����� $����� �������

��

��

��

��

��

��

��

��

������������ ����##����������#��������������

��

��

��

��

��

��

��

��

#����������� �����#���������� $���� �����#��������

��

��

��

��

��

��

��

,�����������������������������������,�����$���# ��������

��

��

��

��

��

��

��

������������� ���#�����#� �����,����������������������##�������

��

��

��

��

��

��

������$�����$�����,$����#������#����������#����������������#� �������

��

��

��

��

��

��

������$#����$�����������,������,����,#����������������, ����,��������������

��

��

��

��

��

� �����,����##����#������,����#������$�����$����,������$����#������������$�������

��

��

��

��

��

�$���� #����������������$#����, ����������,�����$#�����,����#�����#��������������������

��

��

��

��

������� ����#������$���������#������#,����������������� ����,�����#$���� �����������#��������

��

��

��

��

������##����$�����������������������##����, ����� ����������������������##�������������������������

��

��

��

������,������������������,�����,���� �����������##����������������,,����������,������������,�����$�������

��

��

��

�#���� $�����������#����������# ����������������,�����#�����#�����,����� ������������������#�������������������

��

��

�,����������������� ���������������� ,����,#���#�����#$$�����,����� �����������$����������� �����������,�������������

��

��

������#����������� $����,#����,$����������$����� ,�����������������������������$����$,����������� ����������, �������������

��

������ ������$�����������$�����$�����������������#���#�������������������������#���������� �����,�����,�����������#�����#$�������

��

������$,����� ����,�����������#������ ����,#����,#����#�����#�����������������##����,,�����#�����$����#$�����,�����,���#������ ��������

� �����#����$�����������������������$�����#������$����������,�����# �����$�����������������������������������#�����#�����$�����������#�������

�$�����,���� �����,,����,������ ����#������$���������� �����������,�����������$,���� ����,������������#����������$������������������������$������

Page 87: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

���

��� ���� ��������������������� ������������� ���������� �������������������� ����������������

� � � �

���

����� �������������������������������������� �������������������� ����������� ���������������

� � � �

��������������������������������������������� ������������������� �������������� ������������ ��

���

�����)6��9:�*�� ����� ������!������� �����������������<����#�'�)��<������'�)�����<�/:��,�'�)�

=����������� �����!�������� ��� ���� ����������1M=������*?:���%����������*?:������

�����

Page 88: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

� -����������������9:�*��������%���"������������ �������"����������� ���� "���

�������� ���"�'-�������)��1 � !���� ��������������$�����4���� ������� ��

����!��������������"����9:�*�����"����'-�������)�� �������� �!������ �.:�=

�=.:9���%��� �!������� ����� "�����

��!���������!�"�����"�

� ������������"���$�#+�������������� ���� ����� �"� ��������� ������ �����+

��������"�=��� �������� ��'����)���������������@���������!����"����� "������

9:�*��������1 � !�������������������������"� ��������"���������� %��

!������ ����#�� ���,$�'�������##)������������ �����������!������ �����,,�

��#� �'����������)��������� ��������������� ���� ���������������� �������������

���������������� "����

� -���B�!�!���������� ���� ����������'��$,�)���������� !����������������"� ��9:�*

�������%���"������������������ 0"� ��"���������/����� ����� 0"�����!���"����

� ����������� ���� "��� ����� ����/������������� "���B8��$��/������� � �� ���

� ������������ ��� ����!���"������@� ��9���������8�,,(����=�����B>�����B8�

#,�,��B>*�����������8*�,,(� �'�!������������"����������(��+)�

� 1���!�����'�����)�����"���� �������������������"������ ������������!�����

� ���2 ������������� ����(� ������������������'�:���/������:���/��������!��"�

'8�����)���-������(� ����:����� ������� �������������"�������!�������������(�� ��

�/� ��������� ���� ��� ����� "��� ����!���� �-��� ����� ����:� �� �����2 � �����

��� ������� �������"�������!����������/���!��� �!�������'����7E�������7E� )�

-��������!����@� ��B>��������/����� ��� ����������!����������"�� ����"����(

�������������� ��������������� �� � ������"�!�������� �� ���������������

�� ���������������� �� ���!�����3 ��� �����

������������������������

� -���� ������"� �����������������"������������� ���� ������,��3���(� �'-�������)

������ ��������� ��� �"� ���� "�������9:�*�������� ��� 3�����"� �3���� � ���

��� "������������������"�����������

(��!��)8�� � ��!��������� �����������������2A� �����"���

������������ �������� �����

�����

������������������ ���C�����

���

���������������� �������

��������������� ��C����

����#����#���� �������������� ��,��S������� �

Page 89: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

��

���������������� 0"� ��"�'B�!)���!��������� ��� ����!�"�� ����������� ��������

������� ���� ��� �����'�����J����4��������)������ �����"��������������������

'�� $�J�B���A�B��������)���G����9:�*���������������%���"��������B�!�!����

����� ���� �������� ����������� ������ ������� �������� $������������ ������ �

'*�������� �����$)�

���!�������!��������

� :� ��� �����9:�*���������!�� ������ �������,������������� �������$ ����

� ���� ����� �"� �����'�$�#+)���-������������� ������������������� ��������"

=��� �������� ���'����)����������+�� �"� ��������������� ��������"���������

9:�*�������������@�������������!���

� -����!������������"�����3� ������������������!��������������������������!���"

�� ��������������!������� �������-����!����������� ����������!�� �����"���

���9:�*�������',���)���������!������������ �"� ������'�$�#)������������

���������"� ��9:�*������������������� �"� �������� �������!���

� E�����������"����� ������������������������������/����'�������� ��� �������

��� �������)����������� �����������B8��$������������� ����������-��� �������

�3 ���� ����� ���/������� ��� ���������������!���� ��� �������"����@� ��������

"���9�����������-��� ������ ���� ������� �� ���������.� ������� ���������

�������������� ���� "����*19�������:���%�� '*19���� ��� ��� �� ��������)�

1 � !���F�19��$$(������**9�$$���� ��� ����!�"������������ ���������"�����

B8��$������� �� ����������� ���������!���

� 8 ���������������"���������������"��!�������������2 ����������� ��������"

������������ '�:������/)�� �-���������� ���(������ '�:)� ������������� ��� ���� "��

����!���������B>����'��������� ���3 �������!��:���%���)�������/����'����

���)��-��"�������!��-�� �����������'�����"� ��������")�����������������/ �

B>��������/����� ��� ����������!������"�� ����"�� ���������������� ������

�� ���������������� �� �������������-����������/����� ��������"��������"��

����!�����!��������������%� ���� ��B8��$�����������������! �!���� ��-��� ����

D.���,�,��

� �������!������ ���������������:������������ ���������� "������!������

B8��$���� "��� ��@� ����� �� ��������:������������������������"���� ��B8��$

�����@� ����� ������������-��� �������� �� �� �����-� �����!���7E�������7E�

� ����� ���������'��/)������3 ������%� ��������� �����������������"�� ���

��� �� �� �������:� ��� ��� ����� ���-��� ����� ���� �� ��4����"����������

� �� �����"�D.���,�,������-�����-��� ������ ��"������� ������������������"

�������-����������������� � ������� �� ���"�����������������'8������)��D.

��,�,����������������� ����� ���������������������"����1 �� ����� �������� �

Page 90: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

������������� � ������ ��������������� ���������������������������"�� ���"

������� ������"���'������ ����������)�

� :�������������� ����� �"� ����������������������������+� ����+��<�� �

��,������������ ������$ ��� ����� �"� ������'�$�#+)��<������!������,���������

����������������������

� .���������"���������� ��C�����5���������"�� ���������������>�@1:�� ��������

��� ���� "���!������� ������������������� "���� � ���� � ��������� ������

�������� ��������������

� -������������������� 0"� ��"�'B�!)�!�����������%������3�'1�)������ ����

�����$,������$��#���������!��"���������������������������"� ��9:�*��������%�

�"�����1 � !���� ������"� ������������ �������"���������������������� �����

��� "������������������� ���"���������������"����� "�������9:�*�������

������)8��*��� ���� �����������!��������� �������������>�@1:������� �����9:�*�������

-�����2 ���������������(������������������� ������������

���

���

����

���

Page 91: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

$�!������ ��������

:������1������1�?�����*�E��'�,,�)��. ����� �� ��� �������"��9:�*��=*=(�:@D������ �� � �����

��%���� ��!������������������ ������������������� ���E�����������������������(�����

?5L��##(�, �

:������1������1�?�����*�E��8������:�@���:�� ���F�8���������� ���:�1��'�,,�)���@�����

���� ����������E�������������������������������� �� �������������������"����������

9:�*���%������������� �(������?0L���,�(��,#�

:������8��'�,,,)��9��� ��:���������� �"� �����*?:�����"�����!���������������� �������� ��

�������������������������������� ��(������?=L����(�� �

/��%������C�=������= �����1��'�,# )��9����� ���������������� �"� ������������������� !����L

��� � � ������������������� ������������� ��(������21L� ($ �

/����F�7���E�%���������=������.�������=��'����)��:����������������������� �"� ������':8E�)

����"���� �����������!���"��������������������N��������������'E�)�G���0�%O�����!����)�����

*��+���������6L��(�$�

/�������=���1���2����9�F������F����%���-�@��'�,,#)��*�!���"������������'���������������'E�)

G���0�%)����������� ����� ���������� ���������� ��� ����� !�������������� ��+�� ���)50L

��( ���

.� ��G���=� �����@���B������������.�������9�?��'����)�����"� ����������� ������� ����!���� �� � �����

� ���� ����3��� ��������'����� ������ ��E�����-�����)������� ��9:�*�����"�������(������

65����$(����

*������9�=���E�����1�*���.� ����"��E�/���9��2�%�����F������@�����7�=��'���$)��:��������� ���������

��!���"����������� ������ �,����� ������������� ������ ����������==9�����9:�*���%���

+-��' ���+�� �� ��6L�� �

8 ���9���������D�.�F������-�"� ����G�C��'�,,�)��*�!���"�����"�������������������������� �����E���

�������.9�����������%����. �� �����?2L��$�(����

@�����������������E��������1�*��'�,,�)���� ��� �� �������*?:L�:���������3�����!��������������

��� ���' ���-� �� ���+�� �� �/��������)AL���(���

@�����1���.�"���9 �� ��W�=���=�!�� ���C������<�����C�E�'�,,$)��:��������� �� ��*?:���%���� �

�! ��� ��"���!������� ����������������������� �����������4����������������������� �

(������=?L,,#(�����

B����1�F�������B����B�G��'����)�@��������!���"������ ����� �������� ���������������������

0���������6)L�,$�(�,$��

C�� ���B�C���F��E�����������E��� ����=�D���F�������F���/��%���9�F���1� ��W������@������*���*0����7�C��

����E������D�=��'�,,�)��@�������������� ������������������"������ ��������� %�(� ��

�� ���� ���"��"������!�������� ��21L��� (��$�

Page 92: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

C����"���:��G��� ���C������-��������=�E�'�,#�)��B"��!���������� ����������� ������������*?:�

1� ����5)6L���(� �

F ��������F�����=������E������B"� ��0��-��'�,,$)��@������!���� �� ��"�����������"� "����

������ ��������� �����'��2�� ����2���'E�)�1������)�����������������!�������������� ��(�����

=L��,#�H,, �

F�����:�?���- � %���?���D������W���B ��%���F������F���2�����<�'�,,�)��=����������� ���������

���������.�� ����'�����������)�����!�������"�9:�*�����"�����. �� �����==L��(��$�

F��������9���-��@ ���1���9�������:���=� ���������=���������:��'�,,,)���9:������9D?:�L���� ����

� � � ���������*?:������������������4���������������� ��(������?=L���$(����

F�����-�?������*�3���@���'����)��/�������������������������������:��������)������*�' ����/�����)6L

�(,�

F����:���D�������F���/�� ���1���7 ������/���1 ������1���=������<���F�����:���/ �� �����

:�����������-��0��*������B�����@��'�,,�)��?����� ����������� � ������ ��� ��!���"

�!����� �L� �� �����������������������1� ���+������� �� ��)8L����,��#�

E���0���%"��@������B������B��'�,#�)��=����� ����� ����� ������ �����'��2�� ����2��)������ ��

:"� �������������. �� �����0?�L� � H ���

E�%���������=���.�������=�������/����F�7�'����)��9��� ������������� �"� �����*?:�'9:�*)�����"���

��������������������'�������������'E�)�G���0�%)�����!����(��������)A?L����(� $�

E�����9�C������:����.�=�'�,#�)��1���������'�������������'E�)�3� ����4������� ����'E�)�B����)�

�����#$H�� ����L�9�C��=��������������D�B��9 ����'����)��@������������ ����G�������. �����

= ���A�. �E���E �� ��

1�3��@�:��'�,��)��.���������� ������������������������������($ ����-�����"�� � �"� �����@����

������������"�C�8��=������������C�=��������:��������������E �� ��

1�"���1�=������/������=�F��'����)��-�����"� ���"� ��E����'E������ ���)L������������� ���-=

��4����������"�����' ���0 ������������.� ���050L��$�(��$�

1��� �����B�*���?�T��?���C���%�������-� �����"��@���'�,,#)��@��������!���"����� ���������!�������"

��� ������������� �"� �����*?:��*��(�����+�������80L���H��,�

1 �����1������<��!�����:�1��'�,, )���.9(������������� ���������������%�������������������

' ���*���5�L����(�#��

1�������F������8 ������8�:�'�,#�)��=���������"������� ��*?:�������������� �"������H�����"0��

���������� ���-������.�� �� ���)88L� �( ���

?����1��'�,#�)��D����� �� ���!�������� 0"� ��"��������������������� ���������������� �

����!��������(���������=5�L��# (�,��

����������=�F���C��������F���@ !����C�?���F�������:������=��������.��'����)��:8E����������������

���� �����'��2�� ����2��� 'E�)�1������)�����������������!����(������/��� �������������

.� ������85�L���� H� ��

Page 93: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

���4����9�=�� '����)��:�� 0"�����!���"� �� ����!���� � ������������ �� �� �������������� �

(������)A)�L�����(��,�

��2��������:2� ��(1�� �������1 ������1���F 0������%�7���.������ ��������-����� ��@��������1 �

1��'�,,#)��. �����!������"���� ����������������"��� ������0����������������������"

98E����9:�*���==9������:8E�������������� ��(�������?1L���$#(�����

���� ���*�=���=�������=�������1��%�� ����C�/��'�,,�)���-���.��������. �� ��� ������?���!�

7����� ��:��������@����E���������������� ���@����9�����������*�!�� �����. � �� ��

.�������:�������

� ������G���1 ������1���:�����.���B�����"��1���7 �����C���-����"��=�������9�����%���:��'�,,�)��:

� ����� �� ��98E���9:�*��:8E������==9�'��� �������)���%���� ��������������"����

-� ��+��������0�L�����(� ��

9��%��������G���E�����1�*���@�����7�=�������9��2�%�����F��'�,,$)��*?:�������������������������

��� ����� ����� �������������� �������������!��*?:���4����������������� ��(�����==L

$��($���

9�����%����1�/���@�����7�=���7���1��"��1�9������9��2�%�����F��'�,,�)��@������������������ �

���� �������2�� ����2���'E�)�1����������������������!���������9:�*���%�������������� �

(������?)�L��#, (#,#

9�"�.� ����"�����F �����=���=���!������F���1 �������-������=������9����'����)������������� �����

����������� �� ��� ���������������� ��*?:��������������. �� �����))=�L��$ (����

9 �����8�C��'�,,�)��?-=W=(���?��������-�3 � �"�����1���!�����:���"����="�����7��� �������

:�������/� ���������?���W %�

9 �����������1�� ���1�������������������8������9��'�,,$)���D����� ���������������������� �����"����

����� ���� �������4���������� ���� �������!�������� ������������ ������� ���*��.5��

��������56L��$�(�$��

=��� %��C���8������D��8������1��������-��'�,#,)��1 �������.� ����L�:�E�� � "�1����������

���� ���. ���=�����B�� �E�� � "�������. ���=�����B � ��?���W %�

=��������1���� ����C�/������*�!�"��1�9��'�,,#)��@��������!���"�����������������������!�����

�"�9:�*���%����' ���+�������))1L�$� ($�#�

=������:���9���"��=�F������C�������?��'���$)��D!����� �� ��� ���������� �:�(�.9�����"���� ������

�����'�������������'��)G���0�%)L�@����������� ����������������������� ��� ������ "����

)������*��+��������5�L����(��#

=������=�F���F� 3��1�9������D������-�B�?��'�,,�)��:8E������"���� ����!���"�������"� ���"� ��E���

�������� ����� ������9:�*�����"��������������� ��(������?5L����(��#�

=��� ������*���>�� ��9���8����G������<� ���8��'����)��@��������!���"���������� ��������� ��

��������!����!�������"�9:�*������:8E����' ���+�������)0)L�$�,($ ��

=������=��'��� )��*?:���%��������������������*���������>��!���"� ��1�������������

Page 94: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

=% ������������?���������C��'�,,�)��T������!������4������!���������0�� �� ��9:�*�!���� �

�� �������������''����� �� ��� ��E�)���� "��������������� ��(������?)L���#�(��,��

-�5����/���U������.���G�F�����-���-������:�������7���������:��'����)��@��������!���"��� ��

!������������������������������� ��� ������''�� ����� ��E�)������� ��� ���������%�������

� �� � ������������"�� � ���������������(�������6=L����(����

7�%����=���8 �(E� "���/�7���C��%� ���1�-������?����"��B�C��'�,,�)��>��� ��9:�*�� �������"� �

��!���"���������������������� ����� �����6����� ��16�L����(��,�

7 �������B ����9����/���%���1���9��2�����1���7������E����-���B �����1���8�2����:���� ���C������������C��

F������1������U�������1��'�,,�)��:8E�L������������4���� �*?:��������������1 � ������

/�����05L�$$��($$�$�

G������9���1�E�����F���8��!�����:�C����������=�9���F�����:���-� �����G�-�/������� ������G��'�,,�)�

@������������� �� ��/��(�(��%��� ���� ������������������������"���� ����!�������"

��4�����(������������������� ��� �"� �������'=(=:�)���-� ��(����(������085L��#�(�,$�

G������C�������1�.���������1��'�,,�)��8�����������@�� �����������.9����������"������

1 � ����������/�����)=�L���� (���#�

G���������C�@�F���F�����%��:��9���E�!�%��F�C���9�����%���C�:������-����"��=�7��'�,,�)��*?:�� �"� ������

�����������"�����"�����������������������������%����1 � �����������/�����)=�L��� �(�� ��

G �% ��/���=������%���G��F���F��0%���F��������0"% ��%���E��'����)����� 0"�������9:�*���%���� ���

���������� �� ��������������������������������!����*������ ��(������6)�L����(����

W����D���F��������F��F����=������@�9��������E���%���-�:�'��,,,)��*�!���"��� �������������������� ����

'��0�%�)�������� ��� ����������� ��9:�*�����:8E����%����������0�����5?�L���#(����

W���U���E��E�(T� ����E��B�����/��C����W��1��(W���1��.�����.��W���(8����T��S�� (E�������.��8�����'����)�

9:�*���%��������!���"������ ������!���"����������� �� ��-������������������"���' ��

-� �+�� �/�����0AL� �,( ���

U ��"��*��'�,,,)��1 � ��"�����!���� �"��"����� ����� ������ ��� ���������������������� �����

������?���D����(����/��� �����������.� ���62�L�� (�$��

Page 95: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

���.�����

�� �����!�������*���!��!�*��������'����������!����� ���

�D����

�D����

�D����

�D�����

�D����

����

������

�����

������

�����

�����

�����

�����

��������

��������

��������

��������

��������

�������

��������

��������

�������

�������

��������

�������

�������

�������

�������

��������

������

�������

�������

�������

�������

�������

�������

�������

�������

�������

�������

��������

��������

��������

�������

������

�������

��

/�

:�

:/�

/�

/�

:/.�

:/.�

:�

:�

:�

/�

:/�

:�

��

:/�

/�

:/�

:�

:/�

:/.�

:.�

:�

:�

:�

/�

:/�

:/�

:/�

/�

:/�

.�

:/�

:/.�

:.�

:�

:�

:�

:/�

:/�

.�

$�

/�

/�

:/�

/.�

/�

�:.�

:�

:�

:�

:/�

/�

(�

��

/�

:�

:/�

:/.�

:/�

:/.�

:/.�

:/�

:�

:/�

/�

.�

.�

��

/�

:�

:/�

:/.�

:/�

:/.�

:.�

:/�

:�

:/�

:/�

/.�

:.�

��

/�

/�

:/�

:/.�

/�

:/.�

:.�

:�

:/�

:/�

/�

:/.�

:�

#�

:/�

/�

:/�

:/.�

/�

/.�

:.�

:�

:�

:�

/�

:.�

:�

,�

/�

/�

:/�

:/�

/�

/.�

:.�

:�

:�

:�

/�

:.�

:�

���

/�

/�

:/�

:/�

/�

�:/.�

:�

:�

:�

/�

:.�

:�

���

/�

/�

:/�

.�

/�

.�

:.�

:�

:�

:�

/�

:.�

:/�

���

:/�

/�

:/.�

/.�

/�

/.�

:.�

:�

:�

:�

/�

:.�

:�

� �

:/�

:�

:/.�

:.�

:/�

:/.�

:.�

:�

:�

:�

/�

:.�

:/�

�$�

:/�

/�

:/.�

:/.�

/�

/.�

:.�

:�

:�

:�

/�

:.�

:�

���

:/�

/�

:/.�

:/.�

:/�

:/.�

:.�

:�

:�

:�

/�

:.�

:/�

���

:/�

/�

:/.�

/�

:/�

:/.�

:/.�

:/�

:�

:�

/�

/�

:/�

���

:/�

/�

:/.�

:/.�

/�

(�:/.�

:�

:�

:�

/�

:/�

.�

�#�

:/�

/�

:/�

:/.�

:/�

:/.�

:.�

:�

:�

:/�

/�

:/�

.�

�,�

/�

/�

:/�

:/.�

:/�

:/.�

.�

:�

:�

:/�

:/�

:�

:/�

���

/�

/�

:/�

:/�

:/�

:/.�

:.�

:�

:�

:�

:/�

:�

:/.�

���

/�

/�

:/.�

/�

:/�

:/.�

/.�

:�

:�

:/�

:/�

/�

:/.�

���

:/�

:�

:/.�

:/�

:/�

:/.�

:/.�

:�

:�

:�

/�

.�

:/�

� �

:/�

:�

:/.�

:/�

:/�

:/.�

:/�

:�

:�

:/�

/�

:/�

:/�

�$�

:/�

/�

:/�

:.�

:/�

:/.�

:.�

:�

:/�

:/�

/�

:/�

:/�

���

:�

/�

:/�

:.�

:/�

:/.�

:.�

:�

:�

:/�

/�

:/�

:�

���

/�

/�

:/.�

:/�

:/�

:.�

:.�

:�

:�

:/�

:/�

:/�

:/�

���

/�

/�

:/.�

:/�

/�

/.�

:.�

:�

:�

:/�

/�

:/�

:/�

�#�

/�

/�

:/.�

:/�

/�

(�:.�

:�

:�

:�

/�

:/�

:/�

�,�

/�

/�

:/�

.�

/�

.�

:.�

:�

:�

:�

/�

:�

:/.�

��

/�

/�

:/.�

/�

:/�

:.�

:�

:�

:�

:�

/�

:/.�

:/�

Page 96: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

��������������������������� ��!�"���� ��� �������!��������#���������

��

/�

/�

:/�

/.�

:�

:/.�

:.�

:�

:�

:/�

/�

:/.�

:/�

��

/�

/�

:/�

:.�

:/�

:/.�

:.�

:�

:�

:/�

/�

:.�

:/�

:/�

/�

:/�

.�

:/�

:.�

:.�

:�

:�

:/�

/�

:.�

:�

$�

/�

/�

:/�

:�

:/�

:�

:.�

:�

:�

:�

/�

:/.�

:�

��

/�

/�

:/.�

:.�

:/�

:/�

:�

:�

:�

:/�

:/�

:/.�

:/.�

��

/�

:/�

:/�

:.�

/�

/�

:.�

:�

:/�

:�

:/�

:/�

:/�

��

/�

:/�

:/�

:.�

/�

/.�

:.�

:�

:/�

:�

:/�

:/�

:.�

#�

:/�

:/�

:/�

:.�

:/�

:/.�

:.�

:�

:/�

:/�

/�

:/.�

:/�

,�

:/�

:�

:/�

:�

:/�

:/.�

:.�

:�

:/�

:/�

:/�

:/.�

/�

$��

/�

:/�

:/.�

:.�

:/�

:/.�

:.�

:�

:�

:�

/�

:.�

/�

$��

/�

/�

:/�

:/.�

:/�

:/.�

:.�

:�

:/�

:/�

:/�

:/.�

:�

$��

/�

:/�

:/�

:/.�

/�

:�

:.�

:�

:/�

:/�

:/�

:/�

.�

$ �

/�

:/�

:/�

/.�

:/�

:/.�

:.�

:/�

:�

:�

:/�

:/.�

:�

$$�

/�

:/�

:/.�

/.�

/�

:/.�

:�

:�

:�

:/�

:/�

:/.�

:/�

$��

/�

:/�

:/.�

/.�

/�

:/�

:.�

:/�

:�

:/�

:/�

:.�

:�

$��

:/�

:/�

:/.�

/.�

:/�

/.�

:.�

:�

:�

:/�

/�

:.�

:/�

$��

:/�

:/�

:/.�

/.�

/�

/.�

:�

:�

:�

:/�

/�

:/.�

:/.�

$#�

/�

:�

:/.�

/�

:/�

/.�

:�

:�

:/�

:�

:/�

:/.�

:/.�

$,�

/�

:�

:.�

/.�

:/�

.�

:.�

:�

:�

(�/�

:/.�

:/�

���

/�

:�

:.�

/.�

:/�

:/�

.�

:�

:/�

:/�

/�

:/.�

:/�

���

/�

:�

:�

/.�

:/�

:./�

.�

:/�

:/�

:�

:/�

:.�

:/�

���

/�

:/�

.�

.�

:/�

/�

:.�

:�

:/�

:/�

:/�

:�

:/�

� �

/�

:/�

:�

:.�

/�

:/.�

:.�

:/�

:/�

:�

/�

:�

:/�

�$�

/�

:/�

:�

:.�

:/�

:/.�

:�

:/�

:/�

:/�

/�

:�

/�

���

:/�

:�

:./�

:/.�

:/�

:/�

:.�

:�

:/�

:/�

:/�

:�

/�

���

:/�

:/�

:./�

:/.�

:/�

:.�

:/.�

:/�

:/�

:/�

:/�

:�

:/�

���

:/�

:�

:./�

:/.�

:/�

:/�

.�

:�

:/�

:/�

/�

:�

:/�

�#�

/�

:/�

:./�

/.�

:/�

:/.�

:�

:/�

:/�

:/�

/�

:/�

:/�

�,�

/�

:/�

:./�

:/.�

:/�

:/.�

:.�

:/�

:/�

:/�

/�

:�

/�

���

/�

:/�

:/�

/.�

:/�

:.�

:/.�

:/�

:/�

:/�

/�

:�

:�

���

/�

:/�

/�

:.�

:/�

:/�

/.�

:/�

:/�

:/�

:/�

:/�

(�

���

:/�

:/�

/.�

:/�

:/�

:/.�

/.�

:�

:/�

:/�

:/�

:/�

:/�

� �

:/�

:/�

/.�

:/.�

:/�

:/.�

/.�

/�

:/�

:/�

:/�

:/�

:/�

�$�

:/�

:�

:/.�

:.�

:/�

:/.�

:/.�

:/�

:/�

:/�

:/�

:/�

:/�

���

:/�

:�

:/�

/.�

/�

:.�

:/�

:/�

:/�

:/�

/�

:.�

:/�

���

/�

:�

:/�

/.�

:/�

:.�

/�

:/�

:/�

:/�

/�

/�

:/�

���

/�

:/�

:/�

/�

/�

:.�

/�

:/�

:/�

:/�

:/�

.�

:/�

�#�

/�

:�

:Y/.�

:.�

:/�

:.�

(�:�

:/�

:/�

/�

:/�

:�

Page 97: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

������������ �������������������������������

���.������

�� �����!�������*���!���������������!���!�������!�����$$ �

����L�=�0�� ���������������� 3��

���!������:

��/�����.

�������� ��������������0��������� �����!��������

��

�����������

!�� ��

!�� "�

���"�

!�� #�

!��$#�

������

!�%&�

!�# �

����#�

!�' �

!��#&�

(��%&�

����%�

!�� &�

!���'�

���#��

!�% �

!�## �

���#"�

!�� %�

!�#�&�

���#%�

!�$ �

!���)�

���"��

!�%��

!��))�

���&#�

!���#�

!�� ��

���&"�

!�$#�

!���&�

���&&�

!�� �

!�# �

���&)�

!�')�

!�� $�

���) �

!�' �

!�%'�

���)��

!�'��

!�%&�

���$��

!�'&�

!��� �

��

��

����

��

��

���

��

��

���

��

��

��

���

��

��

��

���

��

��

����

��

��

���

��

��

���

��

��

���

��

���

��

��

��

��

��

����

��

��

���

���

��

���

��

��

���

��

��

��

��

���

��

��

����

��

��

���

��

��

��

��

���

��

��

��

��

��

�����

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

���

��

��

��

��

��

���

��

��

���

��

��

��

���

��

��

��

���

��

����

����

���

���

��

��

���

��

��

��

���

��

��

��

���

��

��

����

����

��

���

��

��

��

��

��

��

���

��

��

��

���

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

���

���

��

��

��

��

��

��

��

���

��

��

��

��

��

��

��

���

���

�����

��

��

��

��

��

���

���

��

��

��

��

���

��

��

��

���

��

��

��

��

��

��

��

���

��

��

���

��

��

��

��

��

���

��

��

��

��

���

����

���

��

��

���

��

��

��

��

���

���

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

���

��

��

��

��

��

��

��

��

���

��

��

���

��

��

��

��

��

���

��

��

��

��

���

��

��

���

��

��

���

��

��

��

��

��

� �

��

��

��

��

��

��

��

���

��

��

���

��

��

��

��

���

���

��

��

��

��

��

���

��

��

��

��

��

���

��

��

���

���

��

��

��

��

��

���

��

���

��

��

��

��

���

��

��

��

���

��

��

��

��

��

��

���

��

��

��

��

��

��

��

��

���

��

��

��

��

���

��

��

��

��

��

���

��

��

���

���

��

��

��

��

��

��

���

��

��

���

��

��

��

��

��

���

��

����

��

���

���

��

��

��

��

��

��

��

���

��

��

��

���

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

���

��

���

��

��

���

��

��

��

����

��

��

��

��

��

��

��

���

��

���

��

��

��

���

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

��

���

� �

��

��

����

���

���

��

���

��

��

��

��

��

��

��

��

��

���

��

��

��

��

��

���

��

��

��

���

��

���

��

��

���

���

��

��

����

��

��

��

���

��

��

��

��

��

��

��

��

���

���

��

��

��

��

���

��

���

��

��

��

���

��

��

��

��

���

���

��

��

��

���

��

��

���

��

��

��

���

��

���

��

��

���

Page 98: DNA fingerprinting of major pulse crops of India · 8. Genotypes of lentil used for the DNA fingerprinting and diversity analysis 54 9. List of RAPD markers used for the diversity

ww

w.a

rmyp

rin

tin

gpre

ss.c

omL

uck

no

w (

0522)

2481164

arm

y p

rin

tin

g p

res

s