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5' 3'
Gene 1 Gene 2
遺伝子の始まりと終わり
ATG
mRNA中のAUGを開始tRNAがみつけて結合する。
TAA, TAG, TGA
mRNA中のUAAあるいはUAGあるいはUGAのところでリボゾーム遊離因子が結合。翻訳の終了
Open reading flame(ORF)
DNA上
意味
1 ggccgacagt gcctgatttg agatggggtc ccaggtctcg gtggaatcgg gagctctgca61 cgtggtgatt gtgggtgggg gctttggcgg gatcgcagca gccagccagc tgcaggccct121 gaacgtcccc ttcatgctgg tggacatgaa ggactccttc caccacaatg tggctgctct181 ccgagcctcc gtggagacag ggttcgccaa aaagacattc atttcttact cggtgacttt241 caaggacaac ttccggcagg ggctagtagt ggggatagac ctgaagaacc agatggtgct301 gctgcagggt ggcgaggccc tgcccttctc tcatcttatc ctggccacgg gcagcactgg361 gcccttcccg ggcaagttta atgaggtttc cagccagcag gccgctatcc aggcctatga421 ggacatggtg aggcaggtcc agcgctcacg gttcatcgtg gtggtgggag gaggctcggc481 tggagtggag atggcagcag agattaaaac agaatatcct gagaaagagg tcactctcat541 tcactcccaa gtggccctgg ctgacaagga gctcctgccc tccgtccggc aggaagtgaa601 ggagatcctc ctccggaagg gcgtgcagct gctgctgagt gagcgggtga gcaatctgga661 ggagctgcct ctcaatgagt atcgagagta catcaaagtg cagacggaca aaggcacaga721 ggtggccacc aacctggtga ttctctgcac cggcatcaag atcaacagct ccgcctaccg781 caaagcattt gagagcagac tagccagcag tggtgctctg agagtgaacg agcacctcca841 ggtggagggc cacagcaacg tctacgccat tggtgactgt gccgacgtga ggacgcccaa901 gatggcctat cttgccggcc tccacgccaa catcgccgtg gccaacatcg tcaactctgt961 gaagcagcgg cctctccagg cctacaagcc gggtgcactg acgttcctcc tgtccatggg
1021 gagaaatgac ggtgtgggcc aaatcagtgg cttctatgtg ggccggctca tggttcggct1081 gaccaagagc cgggacctgt tcgtctctac gagctggaaa accatgaggc agtctccacc1141 ttgatggaga ggccaggcgg gagaactacc gcagcaggtg ggcgtacgga ctgcttggcg1201 catggcaccc gcctggcaag tgctagaact aatgctattc ttctggaata agatgccaat1261 gatgtggtgg ctagaaatgc aacttgtata aaacaaaaat gggagagaga gaggtattaa1321 acaaataccc cccttagagg ataaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaa
ATG(開始コドン)
TGA (終止コドン)
5’- atttactcca gccatgctaa gaaagctacc-3’
3’- taaatgaggt cggtacgatt ctttcgatgg-5’
RNA ポリメラーゼによる転写まず、二重らせんをほどいてから、
下の方の 3’ > 5’の鎖を読んで、mRNAをつくる。
できたmRNAは上の方の鎖と同じ配列になる。
5’-auuuacucca gccaugcuaa gaaagcuacc-3’
* DNA情報としてデーターベースに記録するのは上の方
プロモーター
転写開始点
5’----TTGACA---------TATAAT---
-35 -1016-19 bp 5-9 bp
5’---- CAAT------TATAAT-----------
CAAT Box25 bp
真核
原核
RNA polymerase
Genomic DNA
mRNA
TATA Box
遺伝子上の配列転写産物のmRNAには見つからない
1 ggccgatata tatcagtgcc tgatttgaga ttgggtccca ggtctcggtg gaatcggga61 cgtggtgatt gtgggtgggg gctttggcgg gatcgcagca gccagccagc tgcaggccct121 gaacgtcccc ttcatgctgg tggacatgaa ggactccttc caccacaatg tggctgctct181 ccgagcctcc gtggagacag ggttcgccaa aaagacattc atttcttact cggtgacttt241 caaggacaac ttccggcagg ggctagtagt ggggatagac ctgaagaacc agatggtgct301 gctgcagggt ggcgaggccc tgcccttctc tcatgttatc ctggccacgg gcagcactgg361 gcccttcccg ggcaagttta atgaggtttc cagccagcag gccgctatcc aggcctatga421 ggacatggtg aggcaggtcc agcgctcacg gttcatcgtg gtggtgggag gaggctcggc481 tggagtggag atggcagcag agattaaaac agaatatcct gagaaagagg tcactctcat541 tcactcccaa gtggccctgg ctgacaagga gctcctgccc tccgtccggc aggaagtgaa601 ggagatcctc ctccggaagg gcgtgcagct gctgctgagt gagcgggtga gcaatctgga661 ggagctgcct ctcaatgagt atcgagagta catcaaagtg cagacggaca aaggcacaga721 ggtggccacc aacctggtga ttctctgcac cggcatcaag atcaacagct ccgcctaccg781 caaagcattt gagagcagac tagccagcag tggtgctctg agagtgaacg agcacctcca841 ggtggagggc cacagcaacg tctacgccat tggtgactgt gccgacgtga ggacgcccaa901 gatggcctat cttgccggcc tccacgccaa catcgccgtg gccaacatcg tcaactctgt961 gaagcagcgg cctctccagg cctacaagcc gggtgcactg acgttcctcc tgtccatggg
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TGA (終止コドン)
ATG(開始コドン)TATA BOX(プロモーターの配列)
遺伝子配列情報の記載例
1 ggccgacagt gcctgatttg agatggggtc ccaggtctcg gtggaatcgg gagctctgca61 cgtggtgatt gtgggtgggg gctttggcgg gatcgcagca gccagccagc tgcaggccct121 gaacgtcccc ttcatgctgg tggacatgaa ggactccttc caccacaatg tggctgctct181 ccgagcctcc gtggagacag ggttcgccaa aaagacattc atttcttact cggtgacttt241 caaggacaac ttccggcagg ggctagtagt ggggatagac ctgaagaacc agatggtgct301 gctgcagggt ggcgaggccc tgcccttctc tcatcttatc ctggccacgg gcagcactgg361 gcccttcccg ggcaagttta atgaggtttc cagccagcag gccgctatcc aggcctatga421 ggacatggtg aggcaggtcc agcgctcacg gttcatcgtg gtggtgggag gaggctcggc481 tggagtggag atggcagcag agattaaaac agaatatcct gagaaagagg tcactctcat541 tcactcccaa gtggccctgg ctgacaagga gctcctgccc tccgtccggc aggaagtgaa601 ggagatcctc ctccggaagg gcgtgcagct gctgctgagt gagcgggtga gcaatctgga661 ggagctgcct ctcaatgagt atcgagagta catcaaagtg cagacggaca aaggcacaga721 ggtggccacc aacctggtga ttctctgcac cggcatcaag atcaacagct ccgcctaccg781 caaagcattt gagagcagac tagccagcag tggtgctctg agagtgaacg agcacctcca841 ggtggagggc cacagcaacg tctacgccat tggtgactgt gccgacgtga ggacgcccaa901 gatggcctat cttgccggcc tccacgccaa catcgccgtg gccaacatcg tcaactctgt961 gaagcagcgg cctctccagg cctacaagcc gggtgcactg acgttcctcc tgtccatggg
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ATG(開始コドン)
TGA (終止コドン)ポリAテール
cDNAの配列情報記載例(ポリAテールあり)
遺伝子調節領域
TATA
プロモーター
転写開始点
mRNA遺伝子調節領域
遺伝子転写調節タンパクが結合
アクチベーターリプレッサーエンハンサー
RNAポリメラーゼが結合Poly-A付加
部位
AUG翻訳開始点
-AAAAA
UAA終止コドン
G-ppp-
リボゾーム結合部位
5‘
5’- atttactcca gccatgctaa gaaagctacc-3’
3’- taaatgaggt cggtacgatt ctttcgatgg-5’
RNA ポリメラーゼによる転写まず、二重らせんをほどいてから、
下の方の 3’ > 5’の鎖を読んで、mRNAをつくる。
できたmRNAは上の方の鎖と同じ配列になる。
5’-auuuacucca gccaugcuaa gaaagcuacc-3’
* DNA情報としてデーターベースに記録するのは上の方
1 ggccgatata tatcagtgcc tgatttgaga ttgggtccca ggtctcggtg gaatcggga61 cgtggtgatt gtgggtgggg gctttggcgg gatcgcagca gccagccagc tgcaggccct121 gaacgtcccc ttcatgctgg tggacatgaa ggactccttc caccacaatg tggctgctct181 ccgagcctcc gtggagacag ggttcgccaa aaagacattc atttcttact cggtgacttt241 caaggacaac ttccggcagg ggctagtagt ggggatagac ctgaagaacc agatggtgct301 gctgcagggt ggcgaggccc tgcccttctc tcatgttatc ctggccacgg gcagcactgg361 gcccttcccg ggcaagttta atgaggtttc cagccagcag gccgctatcc aggcctatga421 ggacatggtg aggcaggtcc agcgctcacg gttcatcgtg gtggtgggag gaggctcggc481 tggagtggag atggcagcag agattaaaac agaatatcct gagaaagagg tcactctcat541 tcactcccaa gtggccctgg ctgacaagga gctcctgccc tccgtccggc aggaagtgaa601 ggagatcctc ctccggaagg gcgtgcagct gctgctgagt gagcgggtga gcaatctgga661 ggagctgcct ctcaatgagt atcgagagta catcaaagtg cagacggaca aaggcacaga721 ggtggccacc aacctggtga ttctctgcac cggcatcaag atcaacagct ccgcctaccg781 caaagcattt gagagcagac tagccagcag tggtgctctg agagtgaacg agcacctcca841 ggtggagggc cacagcaacg tctacgccat tggtgactgt gccgacgtga ggacgcccaa901 gatggcctat cttgccggcc tccacgccaa catcgccgtg gccaacatcg tcaactctgt961 gaagcagcgg cctctccagg cctacaagcc gggtgcactg acgttcctcc tgtccatggg
1021 gagaaatgac ggtgtgggcc aaatcagtgg cttctatgtg ggccggctca tggttcggct1081 gaccaagagc cgggacctgt tcgtctctac gagctggaaa accatgaggc agtctccacc1141 ttgatggaga ggccaggcgg gagaactacc gcagcaggtg ggcgtacgga ctgcttggcg1201 catggcaccc gcctggcaag tgctagaact aatgctattc ttctggaata agatgccaat1261 gatgtggtgg ctagaaatgc aacttgtata aaacaaaaat gggagagaga gaggtattaa1321 acaaataccc
TGA (終止コドン)
ATG(開始コドン)TATA BOX(プロモーターの配列)
M
-AAAAAG-ppp-
M
-AAAAAG-ppp-
M
AUG
リボゾーム小サブユニット
開始 tRNA
リボゾーム大サブユニットが結合して翻訳が進む
5‘キャップの識別
AUGコドンを
探索
5‘-------/AG GU / AGU-------
---////////N/AG /--------3’
C
A
AG
U U UU U U U U
C C CC C C C C
GA
5‘スプライス部位の
配列 3‘スプライス部位の
配列
イントロン
AAAAAA-3’5‘
AAAAAA-3’5‘ 3’-TTTTTT-5’合成プライマーTTTTTTTを対合させる
TTTTTT-5’AAAAAA-3’
逆転写酵素でDNAを合成
細胞から取り出し、精製したmRNA
TTTTTT-5’3‘RNAを分解する
TTTTTT-5’
DNAポリメラーゼで相補鎖を合成