Estrutura de Proteínas

Insulina

Aminoácidos: componentes das proteínas

ala

arg

asn asp cys

gln glu

gly his

ile leu

lysmet

phe

pro ser thrtrp

tyrval

O DNA é uma molécula informacional: cada códon (sequência de três nucleotídeos) codifica um único residuo de aminoácido na proteína.

Como as proteínas são construídas

phe

phe

val valval

val

tyr

tyr

trp

ala

ile ile

ileile

φ

ψ

Os aminoácidos são unidos por ligações peptídicas com a liberação de uma molécula de água e passam a ser denominados resíduos

A cadeia polipeptídica se dobra devido aos graus de liberdade da ligação e dos resíduos originando uma estrutura tridimensional funcional

Estrutura e função de proteínas

Colágeno

Anticorpo IgG1

Hemoglobina

Insulina

Adenilato kinase

As proteínas são moléculas essenciais para a estrutura e função das células, desempenhando ampla variedade de funções biológicas

A função das proteínas é totalmente dependente de sua estrutura tridimensional

Enzimas são proteínas que catalizam reações químicas no metabolismo

Estrutura Primaria

Pontes de Hidrogênio

Estruturas Secundarias

-Helice

Estrutura Beta

Estrutura Beta antiparalela

Estrutura Beta paralela

Estrutura Volta

Proporções Relativas dos diversos AA nas Estruturas 2as.

Estrutura Terciaria

Mioglobina

Grupo Heme

Grupo Prostético

MiniproteínasNome Classificação

PDB ID

Nº de Resíduos

Figura

Stable Mini-Protein A Domain, Z34C

Ponte Dissulfeto 1ZDD 34  

Avian Pancreatic Polypeptide

Íon Complexante 1PPT 36  

TRP-ZipperEmpilhamento

Aromático1LE0 12  

TRP-CageNúcleo

Hidrofóbico1L2Y 20  

Villin HeadpieceNúcleo

Hidrofóbico / D-Aminoácido

1VII 35  

Instantâneos da simulação por dinâmica molecular do folding da miniproteína villin headpiece (Duan e Kollman, 1998)

DomíniosDiferentes “porções” tridimensionaisdentro de uma mesma cadeia polipeptídica

2 domínios cadeia única

Estrutura QuaternáriaArranjos de várias cadeias polipeptídicas com estruturas Terciárias definidas. Presente em proteínas Globulares e FibrosasGlobulares e Fibrosas

Dímero

Tetrâmero globular Hemoglobina

Catálise de Reação Química: Enzima

enzima

substratos produtos

+

Vírus

Enovelamento

( Pentapeptideo )

Resíduos de Aminoácidos modificados

Banco de Dados PDB

• A Resource for Studying Biological Macromolecules

• The PDB archive contains information about experimentally-determined structures of proteins, nucleic acids, and complex assemblies. As a member of the wwPDB, the RCSB PDB curates and annotates PDB data according to agreed upon standards.

• The RCSB PDB also provides a variety of tools and resources. Users can perform simple and advanced searches based on annotations relating to sequence, structure and function. These molecules are visualized, downloaded, and analyzed by users who range from students to specialized scientists.

FIM