22
Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija molekularnih spektroskopskih informacij s fluorescenčnim mikroskopom Janez Štrancar Laboratorij za biofiziko, IJS / CO NAMASTE Zakaj je ta slika netipčna za navadno mikroskopijo, zakaj za fluorescenčno mikroskopijo?

Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

  • Upload
    others

  • View
    8

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) -

lokalizacija molekularnih spektroskopskih informacij

s fluorescenčnim mikroskopom

Janez Štrancar

Laboratorij za biofiziko, IJS / CO NAMASTE

Zakaj je ta slika

netipčna za

navadno

mikroskopijo,

zakaj za

fluorescenčno

mikroskopijo?

Page 2: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Od mikroskopije do fluorescenčne mikroskopije

• Kontrast!

microscopy

fluorescence microscopy

Page 3: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Pojav fluorescence

3

Eksitacija in relaksacija

elektronskih stanj

Absorbcijski in emisijski spekter

Page 4: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Konfokalna fluorescenčna mikroskopija

• Optično rezinjenje!

– Eksitiramo eno optično

ravnino in

– Zajemamo svetlobe iz

ene optične ravnine!

fluorescence microscopy

fluorescent confocal microscopy

Page 5: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

microscopy confocal microscopy

fluorescence microscopy microspectroscopy

Fluorescenčna mikrospektroskopija

lokalizacija prifiziol. pogojih

3D

kontroliranoozadje

spektralnoobčutljivadetekcija

Page 6: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Fluorescence microspectroscopy (FMS)

Page 7: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Iztok Urbančič FMS 7

EM

Liquid crystal

tunable filter

fluorescenca

konfokalna

mikroskopija

spektroskopija

Shema FMS

Page 8: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Elementi FMS

• primeren za opazovanje bioloških vzorcev v tekočini

• objektivi 10x, 40x, 100x (oljni in vodni imerzijski)

• motorizirana mizica (ravnina XY)

• motoriziran revolver objektivov (Z)

Obrnjeni mikroskop

Nikon TE2000-E

Iztok Urbančič FMS 8

Page 9: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Obrnjeni mikroskop

Nikon TE2000-E

Elementi FMS

• nazivna moč 300 W

• 4,5 W izsevane svetlobe, 500 mW v vidnem delu

• zvezen spekter od UV do NIR

• nadomešča nabor več laserjev

Obločna svetilka (Xe)

Lambda LS

Iztok Urbančič FMS 9

Page 10: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Obrnjeni mikroskop

Nikon TE2000-E

Obločna svetilka (Xe)

Lambda LS

Elementi FMS

Fluorescenčna enota

BD Carv II

nabor

• širokoprepustnih vzbujevalnih in izsevnih filtrov

• in dvobarvnih zrcal

Iztok Urbančič FMS 10

Page 11: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Obrnjeni mikroskop

Nikon TE2000-E

Obločna svetilka (Xe)

Lambda LS

Fluorescenčna enota

BD Carv II

Elementi FMS

Konfokalna enota

BD Carv II

Iztok Urbančič FMS 11

V primerjavi z laserskim skeniranjem:

• manj „bledenja fluorescence“

• neodvisnost pri izbiri fluorescenčnih barvil

Page 12: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Elementi FMS

TK nastavljivi filter

VariSpec

• spektralno območje 400–720 nm

• spektralna širina prepustnosti 10 nm

• korak 1 nm

• odzivni čas 50 ms

Iztok Urbančič FMS 12

Obrnjeni mikroskop

Nikon TE2000-E

Obločna svetilka (Xe)

Lambda LS

Fluorescenčna enota

BD Carv II

Konfokalna enota

BD Carv II

Page 13: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

TK nastavljivi filter

VariSpec

Obrnjeni mikroskop

Nikon TE2000-E

Obločna svetilka (Xe)

Lambda LS

Fluorescenčna enota

BD Carv II

Konfokalna enota

BD Carv II

Elementi FMS

EMCCD kamera

QImaging Rolera Mgi+• ločljivost 512x512, velikost elementov 16 µm

• kvantni izkoristek > 90%

• hitrost snemanja 30 s–1

• temni tok < 0.2 e– (pix s)–1 @–25°C

• elektronsko pomnoževanje signala (do 1000x)

Iztok Urbančič FMS 13

Page 14: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Elementi FMS

Iztok Urbančič FMS 14

TK nastavljivi filter

VariSpec

Obrnjeni mikroskop

Nikon TE2000-E

Obločna svetilka (Xe)

Lambda LS

Fluorescenčna enota

BD Carv II

Konfokalna enota

BD Carv II

EMCCD kamera

QImaging Rolera Mgi+• IR vlakenski laser 1064 nm

• izhodna moč 5 W

• več kot 1000 sočasnih pasti

• preklapljanje med pastmi 100 kHz

• natančnost lege pasti < 1 nm

Optična pinceta

Aresis Tweez 200si

fluorescenčne nanokroglice (50 nm)

10 µm

Page 15: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Zajem in kodiranje krajevno lociranih spektralnih lastnosti

Page 16: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Kam so šli vsi fotoni?

FMSIztok Urbančič

elementprepustnost

[1]jakost

[W]fotonskitok [s–1]

300 W Xe obločnica 4,5 10+0 1,5 1019

svetlobni vodnik 0,1 4,5 10–1 1,5 1018

vzbujevalni filtri 0,2 9,0 10–2 3,0 1017

konfokalni disk 0,08 7,2 10–3 2,4 1016

objektiv (vstopna odprtina) 0,08 5,7 10–4 1,9 1015

fluorofori (absorpcija, emisija) (5 10–4) 2,9 10–7 9,7 1011

/ 3D slikovni element („voxel“) 6 10–7 1,7 10–14 5,7 104 [(pix s)–1]

objektiv (NA, n) 0,3 5,2 10–15 1,7 104::

izsevni filtri 0,7 3,6 10–15 1,2 104

TK filter 0,02 8,0 10–17 2,4 102

kamera (γ ⇒ ADCe) (0,02) 4,8 101 [ADCe (pix s)–1]

Page 17: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Ciljano porazdeljevanje označevalcev

• Od lastnosti označevalcev je odvisno, kje se le ti porazdeljujejo!

10 µmA B

D E

C

F

Page 18: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Preverjamo stabilnost vezave označevalcev

• Akumulirane titan oksidne nanocevke v MCF7 celicah (rak dojke) po 1 dnevu, sprane s

PBS

• Vezan in prost Alexa označevalec imata vrha emisijskega spektra razmaknjena za 8 nm

emmision-maximum-coding FMS image emmision spectra of the two

states of the same probe

Page 19: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Identificiramo delce manjše od resolucije mikroskopije

• Akumulirani polistirenski nanodelci v MCF7 celicah (rak dojke) po 1 dnevu

• Kolokalizacija z doma-sintetiziranim membranskim označevalcem , ki ima vrh

emisijskega spektra zamaknjen za 40 nm glede na vrh spektra označevalca na

nanodelcih

500 550 600

Inte

nzi

teta

flu

ore

sce

nce

(a.

u.)

Valovna dolžina (nm)

Nanodelci

Membranska proba

slika, ki kodira vrh

emisijskega spektra

slika, ki kodira

intenziteto

Emisijski spekter

obeh označevalcev

membranski

označevalec

Page 20: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Opazujemo časovno odvisne pojave, kot je zlivanje membran

• Zaradi zlivanja membrane liposomov s plazemsko membrano, s okoli

fluorescenčnih označevalcev spreminja koncentracija holesterola, ki vpliva na

strukturiranost membrane, ta pa se odraža na vrhu emisijskega spektra

5 µm

5 min 10 min 15 min

Page 21: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Razglednica za spomin

Detekcija lokalnega

molekularnega okolja

Detekcija nanodelcev preko

spektralnega kontrasta

Barvno kodiranje

spektralnih lastnosti

Koncept FMS

Page 22: Fluorescenčna mikrospektroskopija (FMS) - lokalizacija ...lbf.ijs.si/Downloads/FMS_Strancar_Rogla2011_splet.pdfkonfokalna mikroskopija spektroskopija Shema FMS Elementi FMS •primeren

Projektna skupina

Laboratorij za biofiziko @ F5.IJS, FFA.UNI-LJ, CO NAMASTE

Tilen KokličSlavko Pečar

Zoran Arsov

Iztok Urbančič

Marjeta Šentjurc

Janez Mravljak

Stane Pajk

Ivan Kvasić

Darija Jurašin

Alma Mehle

Ajasja LjubetičMaja Garvas

Daniele Biglino

Jana Mlakar

Janez Štrancar

http://lbf.ijs.si

Jure Zdovc

http://www.conamaste.si