Upload
trandan
View
241
Download
4
Embed Size (px)
Citation preview
النخيل في الوطن العربي آفات المؤتمر القومي لمكافحة االمارات العربية المتحدة
2102سبتمبر 23-22
وريةورقة مح
علي سوسة النخيل الحمراء ا الجزيئيةتطبيقات البيوتكنولوجي
(التنوع الوراثي و العالقات الفيلوجينية )
لنخيل الحمراء و حصر للدراسات التي تتناول التنوع الوراثي لسوسة ا
العالقات الفيلوجينية بين بعضها البعض و بين أنواع أخري من
السوس التابعة لجنس الرينكوفورسامقدمته
رباب عبد هللا عبد العزيز المرجاوي. د مصر –جامعة القاهرة -كلية الزراعة -أمراض نبات -بكالوريوس في العلوم الزراعية
مصر –جامعة القاهرة -كلية الزراعة -(فيرولوجيا الحشرات)لحشرات االقتصادية ا -ماجستير في العلوم الزراعية
معهد بحوث الهندسة -حشرات جزيئية و تطور جزيئي: دكتوراة الفلسفة في الهندسة الوراثية والتكنولوجيا الحيوية في مجال البيولوجيا الجزيئية
رمص –جامعة المنوفية –الوراثية و التكنولوجيا الحيوية
العالقات الوراثية بين الطرز األحادية لسوسة النخيل الحمراء
2
المحتويات
3...............................................................................................................نبذة مختصرة
4..........................................................................................................................مقدمة
التنوع الوراثي علي المستوي الميتوكونديري و تاريخ الغزو لعدد من عشائر سوسة النخيل الحمراء من
6......................................................................الشرق األوسط و حوض البحر األبيض المتوسط
Mitochondrial genetic variation and invasion history of the Red Palm
Weevil (RPW) Rhynchophorus ferrugineus (Coleoptera: Curculionidae) in
Middle-East and Mediterranean basin
01.....................................................على المستوى النووي لسوسة النخيل الحمراء التنوع الوراثي
Genetic Variation of Rhynchophorus ferrugineus (Olivier) (Coleoptera:
Curculionidae) Using ITS2-rDNA
01.....................................................................................................عزل الميكروستااليت
Development of microsatellite markers for the red palm weevil
(RPW) Rhynchophorus ferrugineus
00.......................... (رابدال )تقنية التضاعف العشوائي با ستخدم لسوسة النخيل الحمراء التنوع الوراثي
Determination of Rhynchophorus ferrugineus (Olivier) (Coleoptera:
Curculionidae) using RAPD-PCR
04...........................نكوفورسيأربع أنواع أخرى تابعة لجنس الرالمقارنة بين سوسة النخيل الحمراء و
Genetic Comparison among Rhynchophorus ferrugineus and Four Rhynchophorus
Species
01.......................................................................................................االتجاهات المستقبلية
06 .....................................................................................................................المراجع
3
لسوسة النخيل الحمراء و حصر للدراسات التي تتناول التنوع الوراثي
العالقات الفيلوجينية بين بعضها البعض و بين أنواع أخري من
السوس التابعة لجنس الرينكوفورسSurvey of Genetic variation, Phylogenetic analysis of Red Palm
Weevil (RPW) Rhynchophorus ferrugineus (Coleoptera:
Curculionidae) in Middle-East and Mediterranean Basin
and
Phylogenetic Relationships among Rhynchophorus
ferrugineus and Other Four Rhynchophorus Species
رباب عبد هللا عبد العزيز المرجاوي. دمصر –جامعة القاهرة -كلية الزراعة -أمراض نبات -بكالوريوس في العلوم الزراعية
مصر –جامعة القاهرة -كلية الزراعة -(فيرولوجيا الحشرات)الحشرات االقتصادية -علوم الزراعية ماجستير في ال
معهد بحوث الهندسة -حشرات جزيئية و تطور جزيئي: دكتوراة الفلسفة في الهندسة الوراثية والتكنولوجيا الحيوية في مجال البيولوجيا الجزيئية
مصر –معة المنوفية جا –الوراثية و التكنولوجيا الحيوية
نبذة مختصرة
هيمنطقة األصل الجغرافي لها يعتقد أنالغازية و التي من األنواعتعتبر سوسة النخيل الحمراء
تم إدخال سوسة النخيل إلى مناطق الشرق األوسط و حوض البحر األبيض المتوسط . جنوب شرق آسيا
سة العديد من أنواع النخيل في تلك المناطق مسببة أضرارا خالل الثالث عقود األخيرة ، تهاجم السو
نظراً لألهمية االقتصادية لتلك اآلفة فمن األهمية معرفة تاريخ الغزو لها وكذا فهم العالقات . اقتصادية
استراتيجية مقاومة الوراثية بين عشائرها المختلفة من أجل استخدام المعلومات المتحصل عليها عند تصميم
ول التنوع الوراثي و تاريخ الغزو تهدف تلك الورقة المحورية إلي حصر للدراسات التي تتنا. هاضدفعالة
01تم حصر .لسوسة النخيل الحمراء و كذا عالقة سوسة النخيل الحمراء بباقي أنواع جنس الرينكوفورس
لسوسة تم جمعها من بالد وتاريخ الغزو الوراثي لعشائر جغرافية مختلفة من ا أبحاث تناولت التنوع الوراثي
تم أيضاً عمل مقارنة وراثية بين .مختلفة تابعة لمنطقتي الشرق األوسط و حوض البحر األبيض المتوسط
.سوسة النخيل وأربع أنواع أخرى تابعة لنفس الجنس رينكوفورس
الدنا ،يةالجينات الميتوكونديرأجزاء من مثل استخدام مشخصات جزيئية مختلفةتم في تلك الدراسات
. كما تم عزل للميكروستااليت، ( الرابد)و تقنية التضاعف العشوائي الريبوسومي
الكلمات المفتاحية
Key words: Curculionidae, Coleoptera, Cytochrome oxidase c subunit 1 (CO1), Cytochrome b (Cytb), Genetic diversity, ITS2, invasive species, RAPD, molecular markers,
microsatellites,Rhynchophorinae, Phylogeography, Phylogeny, Red palm weevil, R. ferrugineus, R. bilineatus, R. palmarum, R. phoenicis, R. cruentatus.
4
مقدمة
يعتبر اكتشاف التنوع الو راثي لآلفة الحشرية الغازية خطوة أساسية قبل التحقق من األسس
كما تعد معرفة . (3-0)الوراثية ألقلمتها السريعة و بالتالي معرفة أسباب نجاح عملية الغزو
. (7-4)وجود تنوع وراثي من عدمه مطلب هام قبل تطوير استراتيجية مكافحة فعالة لآلفة
تعتبر سوسة النخيل الحمراء
Red Palm Weevil (RPW) Rhychophorus ferrugineus (Olivier, 1790)
(Coleoptera: Curculionidae, Rhynchophorinae))8).
. جنوب شرق آسياهي منطقة منطقة األصل الجغرافي لها يعتقد أنالغازية و التي من األنواع
منذ منتصف مناطق الشرق األوسط و حوض البحر األبيض المتوسط لسوسة النخيل غزوتم
لباقي الدول تباعا و احدة و استمر غزوهفي اإلمارات العربية المت سجلتالثمانينيات حيث
تهاجم السوسة العديد من أنواع النخيل في تلك .(9)ة مستمر ت عملية الغزوحتي اآلن ما زال
السنوية بسوسة لإلصابةالمتوسط لقدر المعد حيث، المناطق مسببة أضرارا اقتصادية
السوسة في ب اإلصابة بتتسب ،(01) 0.9النخيل الحمراء في منطقة الشرق األوسط بحوالي
اإلنتاج في بعض انخفضكما ،(00) من النخيل المصاب في شبه الجزيرة العربية% 91فقد
نظراً لألهمية االقتصادية لتلك اآلفة فمن .(01)هكتار /طن 01-1.7المصابة من المناطق
.(9) لفةاألهمية معرفة تاريخ الغزو لها وكذا فهم العالقات الوراثية بين عشائرها المخت
:(8) التابع لجنس الرينكوفورس أنواع من سوس النخيل 9تم حصر
:أنواع من العالم الجديد 4
R. palmarum (Linnaues), R. cruentatus (Fabricius), R. ritcheri
(Wattanapongsiri) and R. quadrangulus (Queden);
:نوع أفريقي
R. phoenicis (Fabricius)
:ويةأنواع آسي 4
R. ferrugineus (Olivier), R. bilineatus (Montrouzier), R. distinctus
(Wattanapongsiri), and R. lobatus (Ritsema)
5
تهدف تلك الورقة المحورية إلي حصر للدراسات التي تتناول التنوع الوراثي و تاريخ الغزو
.بباقي أنواع جنس الرينكوفورسو كذا عالقة سوسة النخيل الحمراء لسوسة النخيل الحمراء
مثل تم استخدام مشخصات جزيئية مختلفة لدراسة التنوع الوراثي لسوسة النخيل الحمراء
( الرابد)تقنية التضاعف العشوائي و الدنا الريبوسومي ،الجينات الميتوكونديريةأجزاء من
ونديرية بان وراثتها تتميز الجينات الميتوك .(11)كما تم عزل للميكروستااليت ، (03-10)
ة ممكن استخدامها في مبادئات عا لهاطبيعة فردية و ذات ، ذات معدل تطور سريع، أموية
استخدمت بنجاح في دراسات علي أنواع حشرية عديدة لدراسة ، حالة عدم معرفة التتابعات
خدمت است .(33-13)التوزيع الجغرافي و الباركود ، الدراسات الفيلوجينية، التنوع الوراثي
أجزاء مختلقة من الدنا الريبوسومي لدراسة التنوع الوراثي في أنواع مختلفة من الحشرات
(34-37).
The non-functional Internal Transcribed Spacer 2 Ribosomal DNA (ITS2-rDNA)
اعتبرت كوسيلة جزيئية فعالة لدراسة العالقات الوراثية بين العشائر الجغرافية المختلفة
مفيدة حيث تتطلب كمية تعتبر تقنية الرابد .(40-38) حشرات بسبب معدل تطورها العاليلل
سريعة و ال تتطلب امكانيات كثيرة مما يجعلها مناسبة للتعريف ، صغيرة جدا من الدنا
أصبح الميكروستااليت مشخص جزيئ مهم لدراسة .(44-41) الوراثي في الدول النامية
وراثة ال ويتبع ت حيث انه عالي التنوع مقارنة بمشخصات أخريالتنوع الوراثي في الحشرا
.(41) مشتركة السيادةمندلية ال
6
التنوع الوراثي علي المستوي الميتوكونديري و تاريخ الغزو لعدد من عشائر
سوسة النخيل الحمراء من الشرق األوسط و حوض البحر األبيض المتوسطMitochondrial Genetic Variation and invasion History of Red
Palm Weevil (RPW) Rhynchophorus ferrugineus (Coleoptera:
Curculionidae) in Middle-East and Mediterranean Basin
تم دراسة التنوع الوراثي علي المستوي الميتوكونديري و تاريخ الغزو لعدد من عشائر
دولة تم غزوها بالسوسة في منطقتي 04موقع تتبع 11 منجمعت ،سوسة النخيل الحمراء
، (محافظة 07موقع تتبع 16) مصر: الشرق األوسط و حوض البحر األبيض المتوسط
تركيا، قبرص، فرنسا، اليونان، ايطاليا، ، سوريا، عمان، اإلمارات العربية المتحدة، السعودية
( 3& 1، 0شكل) يابان و باكستان، إيران، ال(األرض الرئيسية و جزر الكناري) أسبانيا
(11909).
تيدية وعتمد علي تحديد التتابعات النيوكلية تجزيئي تم في هذه الدراسة استخدام مشخصات
تلك المشخصات . و تتبع الجينوم الميتوكونديري (الدنا)للحامض النووي منقوص األكسجين
0يتوكروم أكسيديز تحت الوحدة الجزيئية عبارة عن أجزاء من الجينين الميتوكونديريين س
سيتوكروم ب يستثني كال من سوريا و اليابان في حالة (.سيت ب)سيتوكروم ب و ( 0كو)
(.سيت ب)
عمليات استبدال نتيجة ل وجود تنوع وراثي أظهرت التتابعات النيوكليوتيدية لكال الجينين
.لمتحصل عليهاأهم النتائج ا (1& 0) جدوليلخص .ة في كال الجينينينيوكليوتيد
التو عالقتها بعدد و طبيعة االدخا طرز األحادية للاالنتشار الجغرافي
-0ط سميت 0طرز أحادية في حالة الكو 8 كشفت المقارنة بين التتابعات المختلفة عن وجود
في حالة .3طب -0طب طرز أحادية في حالة السيت ب سميت 3بينما تم الكشف عن 8 ط
منفصال و ذلك 8في مجموعة واحدة بينما ظل ط 7ط -0ألحادية طتجمعت الطرز ا 0الكو
يعكس العدد القليل للطرز األحادية انخفاض .(4شكل) طرز األحاديةالشبكة الجغرافية للفي
.(46) التنوع الوراثي كما هو متوقع بالنسبة لألنواع الغازية
ي حالة العينات المجموعة من ف إاللم يالحظ تنوع وراثي بين العينات التابعة لنفس الدولة
و ( 1و ط 4ط،3ط،0ط: طرز أحادية هي 4تم اكتشاف )العربية المتحدة اإلماراتدولة
يمكن تفسير .0و ذلك في حالة الكو( 6و ط 1ط، 0ط: طرز أحادية هي 3تم اكتشاف )عمان
7
ن م لآلفة وجود عدة طرز أحادية في عينات نفس الدولة إلي حدوث العديد من االدخاالت
واحد أو أكثر من منطقة واحدة تحوي إدخالمناطق مختلفة تحوي طرز أحادية مختلفة أو
.(11) طرز أحادية مختلفة
في 8ط)علي طرز أحادي وحيد (محافظة 07موقع تتبع 16)المحلية لمصر تقتصر العشائر
احدة مما يفسر بادخال واحد أو أكثر من منطقة و (في حالة السيت ب 0و طبأ 0حالة الكو
محافظات مصر في األحادياالنتشار السريع للطرز فسر .يالطرز األحادتحوي نفس
األخرىأعطي نفس التفسير للبالد .(3شكل) ثانويةالغزوالأحداث سلسلة من إليالمختلفة
.(1& 0و جدول 39190شكل)التي لم يكتشف فيها غير طرز أحادي وحيد
هو األكثر انتشارا في حالة السيت ب 0و طبأ 0في حالة الكو 8طلطرزاألحادي لوحظ أن ا
مما يدل علي قدرته العالية علي الغزو و لذا أطلق دول 8حيث وجد في من الناحية الجغرافية
.(11909) عليه الطرز الغازي
بين الطرز األحادية و بعضها البعض الفيلوجينيةالعالقات
أن العشائر التي تم دراستها (1& 0جدول و 6& 1شكل) الفيلوجينيةعالقات ال أوضحت
في هذه كشف عنه لم يتم ال ا تشعبتا من سلف مشترك)مي لمجموعتين جغرافيتين تتن
المجموعة اآلسيوية و تضم .المجموعة اآلسيوية و المجموعة متعددة القارات: هما (الدراسة
( بفي حالة السيت 3طب& 1و طب 0في حالة الكو 7ط -0ط) عديد من الطرز األحادية
إيران، اليابان، عمان ، باكستان ، سوريا )بالد تتبع قارة آسيا 6وتشمل عينات من
هو المجموعة متعددة القارات تضم طرز أحادي وحيد بينما( واإلمارات العربية المتحدة
السعودية )، آسيا (مصر)أفريقيا : قارات هم 3بالد تتبع 8و تشمل عينات من الطرز الغازي
.(11909) (6&1شكل) (قبرص، فرنسا، اليونان، إيطاليا وأسبانيا)وبا وأور( وتركيا
ب السلف المشترك ذو عالقة أخوية معالطرز الغازي (0: )يتضح من الشكل الفيلوجيني أن
ا تفرع حيث أنهما( لم يتم الكشف عنه في هذه الدراسة) للطرز األحادية للمجموعة اآلسيوية
7الطرز األحادي ط (1)، (لكشف عنه في هذه الدراسةلم يتم ا)من أصل مشترك واحد ا
حيث أنه يرتبط مع منفصل عن باقي طرز المجموعة اآلسيوية (0في حالة الكو)ي اليابان
(3)، بعالقة أخوية 6ط& 1ط،1ط،4ط،3ط،0ج للطرز األحادية ط السلف المشترك
.(11) (1شكل)
8
الياباني وتحت 7ت مجموعة تضم طحت: أي أن المجموعة اآلسيوية تنقسم لتحت مجموعتين
تحت ( 0: )تنقسم األخيرة بدورها لتحت مجموعتين ثانويتين ،مجموعة تضم باقي الطرز
(في حالة سيت ب 3طب )،1ط& 4ط،3ط،0ط مجموعة ثانوية تضم الطرز األحادية
في حالة 1طب ) ،6ط& اإليراني 1ط تحت مجموعة ثانوية تضم الطرز األحادية( 1)
.(11909) (691ل شك) (سيت ب
7بينت القيم العليا و الدنيا للمسافات الوراثية بين الطرز األحادية المختلفة أن الطرز ط
كما أن . هو األقرب وراثيا 0الياباني هو األبعد وراثيا عن الطرز الغازي بينما الطرز ط
وراثيا عن الموجود في أكثر من دولة هو األبعد 0داخل المجموعة اآلسيوية يعتبر الطرزط
األكثر قربا لبعضهم وراثيا داخل 1ط& 4ط،3و ط( 3طب ) 0ط. الياباني 7الطرز ط
.(11909) المجموعة اآلسيوية
انفصل عن الطرز الغازياتضح من زمن تشعب التتابعات النيوكليوتيدية بين الطرز أن
راني و مليون سنة عن الطرز االي 0.4الي 1.16طرز المجموعة اآلسيوية من حوالي
أو 0في حالة الكو 0ط)كما انفصل عن الطرز الثاني من حيث االنتشار ، الياباني علي التتابع
أما في داخل المجموعة اآلسيوية فقد .مليون سنة 0.19من حوالي ( في حالة السيت ب 3طب
مليون سنة عن الطرز 0.9 إلي 1.83 باقي الطرز من حوالي انفصل الطرز الياباني عن
علي 6و ط( في حالة السيت ب 3أو طب 0في حالة الكو 0ط)من حيث االنتشار الثاني
.(11909) مليون سنة 0من حوالي اإليرانيكما انفصل عن الطرز ، التتابع
الحالي وراثيال عنوتالتفسير التطوري و الديموجرافي لتوزيع ال
أن (1&0جدول)حيادية تبارات تاجيما للخو ا تدفق المورثات ،التمايز الوراثية قيمأوضحت
تشعبت وراثيا تحت تأثير الجرف الوراثي عشائر سوسة النخيل الحمراء التي تم دراستها
.(11909) خالل العديد من األحداث التأسيسية
تناقضات
:نتجت عن هذه الدراسة تناقضات أربعةهناك
كتشف بها الطرز لم يظهر في السعودية أي من الطرز المكتشفة في الدول المجاورة بل ا( 0)
.الغازي
.واقعة علي حوض البحر األبيض المتوسط أنهالم يظهر في سوريا الطرز الغازي رغم ( 1)
9
( األصل الجغرافي المحتمل)بالرغم من أنه ال يوجد حدود فاصلة بين باكستان و الهند ( 3)
.ي واحدطرز أحاد العينات المجموعة من باكستان لم تظهر تنوع وراثي حيث اكتشف أن إال
بالرغم من أنه كان يعتقد أن مصدر سوسة النخيل في مصر هو دولة االمارات اال أنه لم ( 4)
. يكتشف في مصر أي من الطرز األحادية المكتشفة في االمارات
لخالصةا
بين الطرز األحادي تشعب التتابعات النيوكليوتيدية المسافات الوراثية و زمن من يقترح
، التابعة للمجموعة اآلسيوية وعة متعددة القارات و باقي الطرز األحاديةالتابع للمجم الغازي
طرق مختلفة أثناء غزوها من منطقة األصل إلي الدول 3أن سوسة النخيل الحمراء سلكت
طريقان ، المكتشف في اليابان 7طريق للشرق حيث الطرز األحادي ط : تي تم غزوهاال
و الغازي لمتوسط حيث تم اكتشاف الطرز األحاديللغرب أحدهما لمنطقة البحر األبيض ا
طرز أحادي في حالة سيت 1) طرز أحادية 6اآلخر لمنطقة الشرق األوسط حيث تم اكتشاف
و اآلخر اإليراني 1أو طب 1بدوره الطريق األخير تفرع لطريقين أحدهما حيث ط، (ب
.طوري منفصلوراثية لكل منهم تاريخ ت بأنسالطرق ال تلكترتبط .لباقي الطرز
بين الطرز األحادية تشعب التتابعات النيوكليوتيدية و زمن المسافات الوراثية أوضحت
و من الفترة الزمنية التي تم بها الغزو أن الطرز تطورت في منطقة األصل قبل المختلفة
لوراثي من الطرز ا من حيث قربها يمكن ترتيب الطرز األحادية .غزوها للبالد المختلفة
: كاآلتي تشعب التتابعات النيوكليوتيدية بحسب المسافات الوراثية و زمن ادي الغازياألح
ترتيب الطرز األحادية كما يمكن. 7ط.....(6ط&4ط،1ط).....0ط.....(1ط&3ط).....8ط
.....0ط....7ط: من حيث قربها الوراثي من الطرز الياباني كاآلتي اآلسيويةالمجموعة داخل
.6ط.....1ط(.....1ط&4ط، 3ط)
10
على المستوى النووي سوسة النخيل الحمراءل التنوع الوراثي
Genetic Variation of Rhynchophorus ferrugineus (Olivier)
(Coleoptera: Curculionidae) Using ITS2-rDNA
تم في هذه الدراسة استخدام مشخصات جزيئية تعتمد علي تحديد التتابعات النيوكليوتيدية
تلك المشخصات الجزيئية . نوويو تتبع الجينوم ال( الدنا)امض النووي منقوص األكسجين للح
.الريببوسومي الغير وظيفي لحامض النووي منقوص األكسجيناعبارة عن أجزاء من
(09). ITS2-rDNA
يرجع ذلك لعملية تطور . (09)النووية عن وجود تنوع وراثي شخصاتالم ماإستخدلم يكشف
تم مالحظة و تقرير ذلك في دراسات سابقة للحامض النووي منقوص ، قويةتوافقية
.(47948) الريبوسومي( الدنا)األكسجين
عزل بادئات الميكروستااليت من سوسة النخيل الحمراء
Development of microsatellite markers for the red palm weevil
(RPW) Rhynchophorus ferrugineus
هناك . (11)ميكروستااليت من الحامض النووي لسوسة النخيل الحمراء 01تم عزل
. تجارب للكشف عن التنوع الوراثي باستخدام تلك البادئات
11
تقنية التضاعف العشوائي با ستخدم لسوسة النخيل الحمراء التنوع الوراثي
(رابدال )
Determination of Rhynchophorus ferrugineus (Olivier)
(Coleoptera: Curculionidae) using RAPD-PCR
في الكشف عن التنوع الوراثي بين أفراد سوسة ( الرابد)تقنية التضاعف العشوائي نجحت -
النخيل الحمراء سواء من منطقة واحدة أو بين عدة مناطق و كذا الكشف عن التنوع الوراثي
ح في الكشف عن عالقات القرابة أو االختالفات وكذا نج. بين األشكال المورفولوجية المختلفة
.الوراثية بين أشكال الصدر األولي المختلفة
تفاعل البلمرة المتسلسل ببادئات عشوائية لمضاعفة أماكن عشوائية من الجينوم تم استخدام -
.(03904906907908)بحسب وجود تتابعات البادئات المستخدمة
وائي في بحثين لدراسة تنوع الشكل المورفولوجي لمنطقة تم استخدام تقنية التضاعف العش-
جود النقط السوداء عليه و ترتيبها ان وجدت ر األول من حيث اللون أو غياب و والصد
عينات من مصر 3ل أشكال مورفولوجية 3العالقة بين تناول أحد البحثين . (04907)
الشكل األول خالي من النقاط : وليتختلف تبعا لغياب أو وجود النقاط السوداء علي الصدر األ
تتجمع النقاط كشبكة في ، بينما وجدت النقاط السوداء في الشكالن الثاني و الثالث، السوداء
الشكل الثاني بينما تترتب في صفين متوازيين في الشكل الثالث حيث تنقسم النقطة الوسطي
من الشكلين اآلخرين بينما وجد أن الشكل األول أقل قرابة وراثية . للصف الثاني لنصفين
.(04)الشكلين الثاني و الثالث أكثر تقاربا لبعضهم البعض
عينة من السعودية تختلف 08 من أشكال مورفولوجية 3تمت المقارنة بين في البحث الثاني
الشكل األول الصدر : (07) غياب أو وجود النقاط السوداء علي الصدر األوليللون و تبعا
. الشكل الثاني بني بال نقاط و الشكل الثالث بني بنقاط،، نقاطاألولي أسود بال
%31بلغت نسبة التقارب بينهم 1و 0 رئيسيتين في مجموعتين تجمعت العينات
(:4و 3) تنقسم بدورها لتحت مجموعتين 0المجموعة األولي
.ثالثال وني تحوي عينات من الشكل الثا( 4)، من الشكل الثالث تحوي عينات( 3)
(:6و 1)تنقسم بدورها لتحت مجموعتين 1 المجموعة الثانية
12
نسبة ((8و 7))عينات الشكلين الثاني و الثالث في تحت مجموعتين ثانويتين تحوي( 1)
ات من عين تحوي ((8))بينما عينة من الشكل الثالث تحوي ((7)): 99% التقارب بينهم
.الشكل الثاني
نسبة تقارب ب ((01و 9)) في تحت مجموعتين ثانويتين األول عينات الشكل تحوي ( 6)
.(07) (7شكل)% 11
عينات من أبحاث لدراسة التقارب الوراثي بين 3تم استخدام تقنية التضاعف العشوائي في
أو بين عينات مجموعة من أكثر من (03906)سوسة النخيل الحمراء مجموعة من بلد واحد
، أفراد من سوسة النخيل الحمراء من مصر 3بين العالقة ولتناول البحث األ. (08)بلد
تشابه وراثي بين عينة من سوسة النخيل الحمراء % 71وجد . (03) السعودية و اندونسيا
بينما لم يالحظ أي تشابه 1.7و اندونسيا حيث بلغت المسافة الوراثية بينهما السعوديةمن
بادئ 11و ذلك باستخدام ، و اندونسيا السعودية أي من عينات وراثي بين عينات من مصر و
.(03)عشوائي
عينات من سوسة النخيل الحمراء من أماكن مختلفة لنفس 7العالقة بين تناول البحث الثاني
في هذا البحث تم الكشف عن وجود ، (06) (8شكل) العربية المتحدة اإلماراتالبلد و هي
تراوحت المسافة الوراثية بين ، %10.4ت نسبة التنوع كان .تنوع وراثي بين العينات المختلفة
و لوحظ عدم وجود عالقة بين المسافات ( تشابه% 94-38) 1.607 -1.118العينات من
كما استنتج ان العينات تنتمي لنفس الجنس لكن ليس نفس ، الجغرافية و المسافات الوراثية
.(06)النوع
عينة من 60وع وراثي داخلي و خارجي بين تم الكشف عن وجود تنفي الدراسة الثالثة
، عمان، اإلمارات، السعودية، (محافظة 01)مصر : دولة 03سوسة النخيل الحمراء من
أنتج تفاعل .(08)قبرص و فرنسا ، اليونان، ايطاليا، أسبانيا، اليابان، ايران، باكستان، تركيا
و كانت نسبة التنوع دوجةقاعدة مز 0411إلى 111البلمرة المتسلسل بندات تتراوح من
تم . كانت متنوعة( ناتج 776) مرة المتسلسل حيث ان كل نواتج تفاعل تضاعف البل% 011
تعكس تلك النسبة .(49)الكشف عن تلك النسبة في دراسات علي أنواع حشرية أخري
من ، مشخص استثنائي 07تم الكشف عن وجود .(49)غياب التشابه بين العينات المدروسة
.(44911)لممكن استخدامهم علي المستوي التطبيقي للتفرقة بين العشائر الجغرافية المختلفة ا
(. تشابه% 71-11) 1.8-1.3ن الوراثية بين العشائر متراوح متوسط المسافات
13
أوضحت المقارنة وجود عالقة . 0-1.410تراوحت المسافات الوراثية بين األفراد من
.الوراثية و الجغرافية طردية بين المسافات
تحت 01)مجموعات كبيرة 3األفراد المختبرة إلى التقنية الدراسة الفيلوجينية لنواتج قسمت
: كاآلتي (9شكل) (مجموعة
.(9شكل) (01تحت مجموعة )أفراد من سوسة النخيل الحمراء من اليابان ( 0)
(السعودية و عمان، إلماراتا)المنطقة العربية أفراد من سوسة النخيل الحمراء من ( 1)
.(9شكل) (01: تحت مجموعة) و باكستان إيرانو ( 00: تحت مجموعة)
و الدول (09193949199: تحت مجموعة 6) النخيل الحمراء من مصر من سوسةأفراد ( 3)
.(9شكل) (69798: تحت مجموعة)البحر األبيض المتوسط ةاألوروبية التابعة لمنطق
ستنتج أن مصدر سوسة النخيل الحمراء التي تم دراستها يرجع الي مما سبق يمكن أن ن -
منطقتين جغرافيتين مختلفتين أحدهما هي مصدر سوسة النخيل الحمراء من مصر و الدول
األوروبية التابعة لمنطقة البحر األبيض المتوسط و اآلخري هي مصدر سوسة النخيل
(.ة و عمانالسعودي، االمارات)الحمراء من المنطقة العربية
حيث وجد ، بالبعد الجغرافي في تجمعها ال ترتبط كل األفراد في تحت المجموعات المصرية-
أن بعض األفراد التي تتبع محافظات بعيدة جغرافيا تتجمع معا في تحت مجموعة واجدة كما
:يلي
.(9شكل)( 1تحت مجموعة )بني سويف و أسوان ، أفراد من محافظات الشرقية( 0)
.(9شكل)( 3تحت مجموعة )القليوبية و الوادي الجديد ، د من محافظات الشرقيةأفرا( 1)
.(9شكل)( 4تحت مجموعة )أفراد من اإلسكندرية و الفيوم ( 3)
العينات المصرية (10)يتوقع ان العشائر المشتقة من أصول مختلفة تكون أكثر تنوعا -
ل مختلفة أو ادخال وحيد مجموعات ممكن تكون من دو 6أظهرت تنوعا حيث تجمعت في
.يحوي العديد من األشكال الوراثية
14
المقارنة بين سوسة النخيل الحمراء و أنواع أخرى تابعة لجنس الرنكوفورسGenetic Comparison among Rhynchophorus ferrugineus and other
Rhynchophorus Species
:ية التضاعف العشوائي بينفي البحث األول تمت المقارنة باستخدام تقن
R. ferrugineus (Egypt, KSA & Indonesia), R. cruentatus (Florida-
USA) and R. palmarum (Costa Rica).
. (03) و لقد وجد تنوع وراثي بينهم
:تمت المقارنة بين : البحث الثاني في
R. ferrugineus and R. vulneratus
و و لكنه تنوع لوني فولنوريتس هو نفسه سوسة النخيل الحمراءالتأكيد علي أن النوع تم
أجزاء من الجين الميتوكونديري سيتوكروم ذلك باستخدام تقنية التضاعف العشوائي و
.(01) (0كو) 0أكسيديز تحت الوحدة
سميت هنا ) بين الطرز األحادية لسوسة النخيل الحمراء تم المقارنة الوراثية في البحث الثالث
استخدام أجزاء من الجين ب اع أخري تابعة لنفس الجنسأنو 4و (للتفرقة* 8ط-*0ط
:(10) (0كو) 0الميتوكونديري سيتوكروم أكسيديز تحت الوحدة
R. palmarum (Linnaues), R. cruentatus (Fabricius), R. phoenicis
(Fabricius) and R. bilineatus (Montrouzier).
%31.1تنوع وراثي ناتج من عملية استبداالت نيوكليوتيدية بنسبة دوجو عن ت النتائجكشف
بين سوسة النخيل الحمراء ) 1.118تراوحت المسافات الوراثية بين األنواع و بعضها بين .
.(10) (بين سوسة النخيل الحمراء و النوع بلمارم) 1.180و ( و النوع بيلينياتس
نية بين األنواع المختلفة يلوراثية و العالقات الفيلوجا أوضح عد د المواقع المتغيرة، المسافات
و ان النوع بلمارم هو األبعد أن نوع سوسة النخيل الحمراء أكثر قربا من النوع بلنياتس،
و المسمي الطرز الغازي لسوسة النخيل الحمراء هو *8أيضا كان الطرز األحادي ط .وراثيا
.هو األكثر بعدا *0ألنواع بينما الطرز األحادي طاألكثر قربا من الناحية الوراثية لباقي ا
يمكن ترتيب الطرز األحادية لسوسة النخيل الحمراء بحسب قربها الوراثي من األنواع
:المختلفة كاآلتي
15
*(.....8ط*.....6ط*.....4ط*.....3ط*.....1ط*.....0ط)سوسة النخيل الحمراء
.(10)رم بلما.....كورينتيتس.....فوينيسيس.....بلنياتس
إلى نكوفورسيالرتعتبر تلك المقارنة كخطوة أولى لمراجعات الحالة التقسيمية لجنس
.(01 شكل) (10) المستوى الوراثي
16
االتجاهات المستقبلية
-جان فرانسوا سيلفان مدير أحد الوحدات البحثية بمعهد البحوث للتنمية. في حوار مع د
ايميل أغسطس ) والذي لديه خبرة عن التنوع الوراثي لألنواع الحشرية الغازية فرنسا
1101):
األبحاث المتعلقة بوراثة سوسة سيلفان علي سؤالي عما هو متوقع بالنسبة لمستقبل . رد د
:النخيل كاآلتي
نطقة معرفة نتائج استخدام الميكروستااليت و هل يمكنه التفرقة بين عشائر مينتظر الباحثين
عينات من سوسة النخيل حصول علي لل سيلفان بشغف. يتطلع د. البحر المتوسط أم ال
الحمراء من منطقة الهند و جنوب شرق آسيا كمناطق أصل محتملة لمعرفة مصدر سوسة
النخيل التي غزت مصر و منطقة حوض البحر األبيض المتوسط أو الطرز األحادي
سيلفان أيضا في معرفة حجم الفقد في . يأمل د .تتو معرفة من أي عائل نخيلي أ،الغازي
حيث ، التنوع الوراثي الناتج عن عملية االنتقال من منطقة األصل لألماكن الجديدة
لكنه يري ، ر فان هذا سيؤثر علي مستقبل بقاء السوسةكان هذا الفقد كبي اذانه في حالة يعتقد ا
. ان كثيرين غير متفقين معه في هذا الرأي
لمحاولة عزل و استخدام ( ايطاليا)حاليا هناك دراسات في أوروبا انه إليسيلفان . دأشار
.أيضا هناك أبحاث تجري في كاليفورنيا و لكنه ال يعلم تفاصيلها، الميكروستااليت
األساسية العاملين في مكافحة السوسة بأهمية األبحاث إقناعسيلفان انه من الصعب . يري د
أهمية دراسات التنوع الوراثي سيلفان. د وضح. عمليات المكافحة ينالوراثة لتحسومنها
هكالفطر فانفي حالة الرغبة مثال في استخدام ممرض حشري بأنهعلي المستوي التطبيقي
.تنوع وراثي والعكس صحيح هناك لم يكن إنم ساللة واحدة للفطر للمكافحة سيتم استخدا
17
المراجع
(1) Sakai, A.K., Allendorf, F.W., Holt, J.S., Lodge, D.M., Molofsky, J., With,
K.A., Baughman, S., Cabin, R.J., Cohen, J.E., Ellstrand, N.C., McCauley, D.E.,
O’Neil, P., Parker, I.M., Thompson, J.N. and Weller, S.J. (2001). The population
biology of invasive species. Annual Review of Ecology and Systematic, 32: 305-
332.
(2) Keane, R.M. and Crawley, M.J. (2002). Exotic plant invasions and the enemy
release hypothesis. Trends in Ecology & Evolution, 17: 164–169.
(3) Wolfe, L.M., )2002(. Why alien invaders succeed: support for the
escapefrom-enemy hypothesis. American Nat., 160: 705–711
(4) Grapputo, A., Boman, S., Lindstrom, L., Lyytinen, A. and Mappes, J. (2005).
The voyage of an invasive species across continents: genetic diversity of North
American and European Colorado potato beetle populations. Molecular Ecology,
14: 4207-4219.
(5) Monnerat, R., E. Martins, P. Queiroz, S. Ordúz, G. Jaramillo, G. Benintende,
J. Cozzi, M.D. Real, A. Martinez-Ramirez, C. Rausell, J. Cerón, J.E. Ibarra, M.C.
Delrincon-Castro, A.M. Espinoza, L. Meza-Basso, L. Cabrera, J. Sánchez, M.
Soberon and A. Bravo, )2006(. Genetic variability of Spodoptera frugiperda Smith
(Lepidoptera: Noctuidae) populations from Latin America is associated with
variations in susceptibility to Bacillus thuringiensis Cry toxins. Appl. Environ.
Microbiol., 72: 7029–7035.
(6) Marimuthu, M., Perumal, Y., Salim, A.P. and Sharma, G. (2009). Genetic
similarity of eggplant shoot and fruit borer, Leucinodes orbonalis, populations.
DNA Cell Biology, 28(12): 599-603.
(7) Sharma, A.K., Mendkia, M.J., Tikara, S.N., Chandela, K., Sukumarana, D.,
Parashara, B.D., Veera, V., Agarwalb, O.P. and Prakasha, S. (2009). Genetic
variability in geographical populations of Culex quinquefasciatus Say (Diptera:
Culicidae) from India based on random amplified polymorphic DNA analysis.
Acta Tropica, 112(1): 71-76.
(8) Wattanapongsiri, A. (1966). A Revision of the genera Rhynchophorus and
Dynamis (Coleoptera: Curculionidae). Department of Agriculture Science
Bulletin, 1: 1-328.
(9) El-Mergawy A.A.M. R. and Al Ajlan M. A. (2011). Red palm weevil,
Rhynchophorus ferrugineus (Olivier): Economic importance, biology,
biogeography and integrated pest management. Journal of Agricultural Science
and Technology. A1(1): 1-23. (Accepted 13/09/2010).
(10) Zaid A. 1999. Date palm cultivation. Food and Agriculture Organization of
the United Nation. pp 242 – 246ز
(11) Moore M. )2000(. Control of red palm weevil, Rhynchophorus ferrugineus:
Requirements for the development of amycoinsecticide. First workshop on control
of date palm red weevil, King Faisal University, Al-Hassa, Saudi Arabia. pp 1 –
25.
(12) Gush H. )1997(. Date with disaster. The Gulf Today. p 16.
18
(13) Abulyazid, I., Kamel, I.K.E., Sharawi, F.A. and El-Bermawi, S. (2002).
Comparison between different populations of red palm weevil, Rhynchophorus
species using RAPD-PCR. Journal of Egyptian Germany Society Zoology, 38E: 1-
15.
(14) Salama, H.S. and Saker, M.M. (2002). DNA fingerprints of three different
forms of the red palm weevil collected from Egyptian date palm orchards. Archive
of Phytopathology Pflanz, 35: 299-306.
(15) Hallett, R.H., Crespip, B.J. and Borden, J.H. (2004). Synonymy of
Rhynchophorus ferrugineus (Olivier) 1790 and R. vulneratus (Panzer) 1798
(Coleoptera, Curculionidae, Rhynchophorinae). Journal of Naural History, 38:
2863-2882.
(16) Gadelhak, G.G. and Enan, M.R. (2005). Genetic diversity among populations
of red palm weevil, Rhynchophorus ferrugineus Olivier (Coleoptera:
Curculionidae), determined by random amplified polymorphic DNA-polymerase
chain reaction (RAPD-PCR). Journal of Agriculture and Biology, 7(3): 395-399.
(17) Al-Ayied, H.Y., Alswailem, A.M., Shair, O. and Al Jabr, A.M. (2006).
Evaluation of phylogenetic relationship between three phenotypically
different forms of red date palm weevil Rhynchophorus ferrugineus using PCR-
based RAPD technique. Archives of Phytopathology and PlantProtection, 39(4):
303-309.
(18) El-Mergawy A.A.M. R., Al Ajlan M. A., Abdalla N., Nasr I. M. and Silvain
J.-F. )1101) Determination of different geographical populations of
Rhynchophorus ferrugineus (Olivier) (Coleoptera: Curculionidae) using random
amplified polymorphic DNA-PCR (RAPD-PCR). International Journal of
Agriculture and Biology 13(2): 227-232.
http://www.fspublishers.org/ijab/past-issues/IJABVOL_13_NO_2/13.pdf
(09) El-Mergawy A.A.M. R., Al Ajlan M. A., Abdalla N., Vassiliou V.,
Kontodimas C. D., Silvain J.-F. and Nasr I. M. (2011). Preliminary Study on a
geographical variation of cytochrome b gene and ITS2-rDNA among
populations of Rhynchophorus ferrugineus. Journal of Agricultural Science and
Technology. B1(2): 189-197. (Accepted 02/09/2010).
(21) El-Mergawy A.A.M. R., Faure, N. Nasr I. M., Faghih A. A., Rochat D. and
Silvain J.- F. (2011). Mitochondrial genetic variation and invasion history of the
red palm weevil Rhynchophorus ferrugineus (Coleoptera: Curculionidae) in
Middle-East and Mediterranean basin. International Journal of Agriculture and
Biology. 13: 631–637. (Accepted 17/12/2010).
(20) El-Mergawy A.A.M. R., Al Ajlan, M. Abdalla N., A., Nasr I. M. and Silvain
J.-F. (2011). Genetic comparision among Rhynchophorus ferrugineus and
four Rhynchophorus species. Journal of Agricultural Science and Technology.
B1(4): 610-615. (Accepted 08/10/2010).
(22) Capdevielle-Dulac, C., El-Mergawy A.A.M. R., Faghih A. A., Rochat D. and
Silvain J.-F. (2012). Development of microsatellite markers for the red palm
weevil (RPW) Rhynchophorus ferrugineus (Coleoptera: Curculionidae).
Molecular Ecology Resources. 12: 185-189. (Accepted August, 2011).
19
(23) Avise, J.C., J. Arnold, R.M. Ball, E. Bermingham, T. Lamb, J.E. Neigel,
Reeb C.A. and Saunders, N.C. )1987(. Intraspecific phylogeography: the
mitochondrial DNA bridge between population genetics and systematic. Annu.
Rev. Ecol. Syst., 18: 489–522.
(24) Irwin, D.M. Kocher, T.D. and Wilson, A.C. (1991). Evolution of the
cytochrome b gene in mammals, Journal of Molecular Evolution, 32: 128-144.
(21) Roehrdanz, R.L. (1993). An improved primer for PCR amplification of
mitochondrial DNA in a variety of insect species, Insect Molecular Biology, 2: 89-
91.
(26) Meyer, A. (1994). Shortcomings of the cytochrome b gene as a molecular
marker, Trends in Ecology and Evolution, 9: 278-280.
(27) Kambhampati, S. and Smith, P.T. (1995). PCR primers for the amplification
of four insect mitochondrial gene fragments, Insect Molecular Biology 4: 233-236.
(28) Lunt, D.H. Zhang, D.X. Szymura, J.M. and Hewitt, G.M. (1996). The insect
cytochrome oxidase I gene: evolutionary patterns and conserved primers for
phylogenetic studies, Insect Molecular Biology, 5: 153-165.
(19) Lanave, C. Licciulli, F. De Robertis, M. Marolla, A. and Attimonelli, M.
(2002). Update of AMmtDB: a database of multi-aligned Metazoa mitochondrial
DNA sequences, Nucleic Acids Research, 30: 174-175.
(31) Hebert, P.D.N., Cywinska, A. Ball S.L. and deWaard, J.R. (2003). Biological
identifications through DNA barcodes. Royal Soc., 270: 313–321.
(30) Zhang, Z., Schwartz, S., Wagner, L. and Miller, W. (2000). A greedy
algorithm for aligning DNA sequences. Journal of Computational Biology, 7(1-2):
203-14.
(31) Behura, S.K., (2006). Molecular marker systems in insects: current trends and
future avenues. Mol. Ecol., 15: 3087–3113.
(33) Singh, T.R., (2008). Mitochondrial gene rearrangements: new paradigm in
the evolutionary biology and systematic. Bioinformation, 3: 95–97.
(34) Campbell, B.C., Steffen-Campbell, J.D. and Warren, J.H. (1993). Phylogeny
of the Nasonia species complex (Hymenoptera: Pteromalidae) inferred from an
internal transcribed spacer (ITS2) and 28S rDNA sequences. Insect Molecular
Biology, 2: 225-237.
(31) Paskewitz, S.M., Wesson, D.M. and Collins, F.H. (1993). The internal
transcribed spacers of ribosomal DNA in five members of the Anopheles gambiae
species complex. Insect Molecular Biology, 2: 247-257.
(36) Fenton, B., Birch, A.N.E., Malloch, G., Woodford, J.A.T., and Gonzalez, C.
(1994). Molecular analysis of ribosomal DNA from the aphid Amphorophora
idaei and an associated fungal organism. Insect Molecular Biology, 3: 183-190.
(37) Schmitz, J. and Moritz, R.F.A. (1998). Molecular phylogeny of vespidae
(Hymenoptera) and the evolution of sociality in wasps. Molecular Phylogenetics
and Evolution, 9(2): 183-191.
(38) Baldwin, B.G. (1992). New chromosome counts in Madiinae (Asteraceae)
and their systematic significance. Madroño, 39(4): 307–308.
(39) Chen, T-C., Yoon, J.H., St. Croix, K.J. and Takle, E.S. (2001). Suppressing
impacts of the Amazonian deforestation by global circulation change.
Bulletin of the American Meteorological Society, 82: 2209–2216.
20
(41) Keller, I. Chintauan-Marquier, I.C. Veltsos, P. Nichols, R.A. (2006).
Ribosomal DNA in the grasshopper Podisma pedestris: Escape from concerted
evolution, Genetics, 174: 863-874.
(40) Sota, T. Vogler, A.P. (2001). Incongruence of mitochondrial and nuclear
gene trees in the carabid beetles Ohomopterus, Systematic Biology, 50:39-59.
(41) Williams, J.G.K., Kubelik, A.R. Livak, K.J. Rafalski, J.A. and Tingey, S.V.
(1990). DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers as useful as genetic
markers. Nucl. Acid Res., 18: 6531–6535.
(43) Hadrys, H., Balick, M. and Schierwater, B. )1992(. Applications of random
amplified polymorphic DNA (RAPD) in molecular ecology. Mol. Ecol., 1: 55–63. (44) Bardakci, F., (2000). Random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers.
Turkish J. Biol., 25: 185–196
(41) Wang, M. L. Barkley, N. A. and Jenkins, T. M. (2009). Microsatellite
Markers in Plants and Insects. Part I: Applications of Biotechnology. Genes,
Genomes and Genomics,3 (1).
http://www.ent.uga.edu/pubs/jenkins_microsatellitei.pdf
(46 ) Puillandre, N., Dupas, S., Dangles, O., Zeddam, J.L., Capdevielle-Dulac, C.,
Barbin, K., Torre –Leguizamon, M. and Silvain, J-F. (2007). Genetic bottleneck in
invasive species: the potato tuber moth adds to the list. Biological Invasions,
10(3): 319-333.
(47) Elder, J.F. and Turner, B.J. (1995). Concerted evolution of repetitive DNA
sequences in eukaryotes. The Quarterly Review of Biology, 70: 297–320.
(48) Graur, D. and LI, W.H. (2000). Fundamentals of Molecular Evolution,
Sinauer Associates, Sunderland, 604 pp.
(49) Sharma, A.K., M.J. Mendki, S.N. Tikar, K. Chandel, D. Sukumaran, B.D.
Parashar, V. Veer and O.P.S. Agarwaland Prakash, 2009. Genetic variability in
geographical populations of Culex quinquefasciatus Say (Diptera: Culicidae) from
India based on random amplified polymorphic DNA analysis. Acta Trop., 112:
71–76.
(11 ) Haymer, D.S. and D.O. McInnis, 1994. Resolution of populations of the
Mediterranean fruit fly at the DNA level using random primers for
the polymerase chain reaction. Genome, 37: 244–248.
(10) Vieira, P., Burgermeister, W., Mota, M., Kai, M. and Silva, G. (2007).
Lack of genetic variation of Bursaphelenchus xylophilus in Portugal revealed by
RAPD-PCR analyses. Journal of Nematology, 39(2): 118–126.
األشكال و الجداول
22
خريطة جغرافية توضح أماكن جمع عينات سوسة النخيل الحمراء و توزيع الطرز األحادية لجين :0شكل
. (11) يوضح كل تظليل طرز أحادي مختلف .المكتشفة0الكو
CO1: ،0كو H1-H8: 8ط-0ط
زيع الطرز األحادية لجين السيت ب خريطة جغرافية توضح أماكن جمع عينات سوسة النخيل الحمراء و تو :2شكل
. (09)يوضح كل تظليل طرز أحادي مختلف . المكتشفة
Cytb: ، سيت ب HB1-HB3: 3طب-0طب
. خريطة جغرافية توضح أماكن جمع عينات سوسة النخيل الحمراءمن محافظات مصر المختلفة :3شكل
: (11909908) الوكالة المركزية للتعبئة و االحصاء: مصدر األسماء
http://www.citypopulation.de/Egypt.html
يوضح حجم كل دائرة عدد . طرز األحادية لسوسة النخيل الحمراءلل (بارسيموني% 91) الشبكة الجغرافية: 4شكل
يمثل كل . الطرز األحادية المندثرة أو التي لم يتم حصرها تمثل. يوضح كل تظليل عينات جغرافية مختلفة. العينات
.(11) جزء من الخط طفرة نيوكليوتيدية
توضح االفتراضات الفيلوحينية بين الطرز األحادية لجين . الشجرة الفيلوجينية للطرز األحادية :2شكل
.(11) (تكرار 0111)يظهر فوق الخطوط قيم التكرارات المدعمة . المكتشفة0الكو
H1-H8: 8ط-0ط
توضح االفتراضات الفيلوحينية بين الطرز األحادية لجين السيت ب . الشجرة الفيلوجينية للطرز األحادية :6شكل
.(09) (تكرار 0111)يظهر فوق الخطوط قيم التكرارات المدعمة . المكتشفة
Cytb: ، سيت ب HB1-HB3: 3طب-0طب
عينة من سوسة النخيل الحمراءتختلف تبعا للون وغياب أو 08رفولوجية ل أشكال مو 3العالقات بين :7شكل
وجود النقاط السوداء علي الصدر األولي من األحساء بالمملكة العربية السعودية باستخدام الرابد
bl =أسود; brs=بني بنقط سوداء عالصدر; brnsبني بدون نقط سوداء علي منطقة الصدر
.(07) تحت مجموعات ثانوية(: 01&79899))، تحت مجموعات(: 6&39491)، مجموعات أساسية
باستخدام هاالعالقات بينو عينات من سوسة النخيل الحمراء من االمارات العربية المتحدة 7 أماكن جمعيظهر :8شكل
.(06)الرابد
.(08) م الرابدباستخدا( 0شكل )دولة 03عينة من سوسة النخيل الحمراء 60يظهر العالقات بين :9شكل
توضح االفتراضات الفيلوحينية بين األنواع المختلفة و الطرز . الشجرة الفيلوجينية ألنواع الرينكوفورس :01شكل
.(10) (تكرار 0111)يظهر فوق الخطوط قيم التكرارات المدعمة . المكتشفة0األحادية لجين الكو
H1*-H4*, H6*, H8*: 8ط،*6ط،*4ط-*0ط*
04لعينات من سوسة النخيل الحمراء من 0ألهم النتائج المتحصل عليها من تحليل تتابعات الكو تلخيص :0جدول
. (09) دولة
تلخيص ألهم النتائج المتحصل عليها من تحليل تتابعات السيت ب لعينات من سوسة النخيل الحمراء من :2جدول
. (11)دولة 01
و أنواع لعينات من سوسة النخيل الحمراء الكوا تحليل تتابعاتتلخيص ألهم النتائج المتحصل عليها من :3جدول
. (10)أخري لجنس الرينكوفورس
0شكل
24
1شكل
3شكل
4شكل
1 شكل
28
6شكل
29
7شكل
30
8شكل
0.129- 0.617
31
9شكل
32
01شكل
0جدول
المختلفةالمقاييس النتائج و تفسيرها
600 bp فاعدة مزدوجة 611 Amplified sites ةتضاعفعدد المواقع الم
546 bp دة مزدوجة فاع 146 Studied sites عدد المواقع المدروسة
Yes نعم Inter-population variation رالتنوع بين العشائ
8 haplotypes (H1 to H8) 8ط - 0ط طرز أحادية 8 سميت Number of haplotypes عدد الطرز األحادية
(3و 0شكل ) (H1, H5 & H8) 8ط& 1ط ،0ط كل منهم في أكثر من بلد واحدة طرز أحادية اكتشف
Haplotype found in different countries
(3و 0شكل ) (H2, H3, H4, H6 & H7) 7ط& 6ط، 4ط،3ط،1ط كل منهم في بلد واحدة طرز أحادية وجد
Haplotypes found in only one country each
ديري للحشراتكما وجد من قبل في الجينوم الميتوكون (897969194) اضافة أو حذف نيوكليوتيدي INDELs ال
Nucleotide substitutions استبداالت نيوكليوتيدية Type of variation نوع التنوع
موااقع بارسيمونية 7منها عموق (4.2%) 23 Variable sites المواقع المتغيرة
ة طفر 24 Total no. Of mutations الطفرات
1 to 17 االختالفات الثابتة بين العشائر عدد
No. fixed differences between populations
متوسط 1.116 Overall haplotype diversity التنوع الكلي للطرز األحادي
Low heterogeneity منخفض 0.01238 Overall nucleotide diversity (Pi) التنوع النيوكليوتيدي الكلي
منخفض 0.00069-0.01193 التنوع النيوكليوتيدي بين العشائر
Nucleotide diversity (Pi) between populations
(69194) حياد اتجاه ا ت كما هو شائع في الجينوم الميتوكونديري للحشرات 60.7 - 61.4 % (AT %) %ا ت
%37.6-38.3 (GC %) %ج س
A to G - ج -اعبارة عن التغيرات المتشابهة Transitional substitutions 22 موقع
T to A and T to G ج -ت& ا -عبارة عن ت التغيرات المختلفة Transversional substitutions موقع واحد -
Overall transition/transversion ratio (R) 26 انحياز للتغيرات المتشابهة كما قي جميع أنواع الجينوم (9) المختلفة /تشابهةنسبة التغيرات الم
Yes نعم Intra-population variation التنوع داخل العشائر
DNA divergence at intra-population level (UAE & Oman) (االمارا ت )ائر العشداخل تشعب الدنا عمان &
اقع االنعزالمو Number of segregating sites (S) 4 & 3 بين عينات اإلمارات و عمان علي التوالي
تنوع الطرز األحادي Haplotype diversity (h) 0.34167 & 0.58571 متوسط
التنوع النيوكليوتيدي Nucleotide diversity (Pi) 0.00221 & 0.001240 منخفض
(H8 & H7) 7ط& 8بين ط 1.133األعلى المسافات الوراثية بين الطرز األحادية
Genetic distances between haplotypes ( H1 & H3; H4; H5) 1ط،4ط،3و كال من ط 0بين ط 1.111األقل
مليون عام 0.4 - 6 1.1. الطرز األحادي الغازي عن باقي الطرز من حوالي زمن التشعب بين الطرز األحادية Divergence time between haplotypes انفصل
Demographic analysis مقاييس ديموجرافية
A recent founder event 1.11148 حدث تأسيسي حديث Tajimas’D test اختبارات تاجيما للحيادية
قيم التمايز الوراثية Fst - genetic differentiation 0.98406 تجزئة وراثية بين العشائر يتبعها ان كل منها ثابتة لطرز معين
Absence of gene flow: Support the bottleneck event فق الموروثات و دعم للجرف الوراثي دغياب ت 0 Nm – gene flow تدفق المورثات
34
2جدول
المقاييس المختلفة النتائج و تفسيرها
550 bp فاعدة مزدوجة 111 Amplified sites ةتضاعفعدد المواقع الم
440 bp فاعدة مزدوجة 441 Studied sites المدروسةعدد المواقع
Yes نعم Inter-population variation التنوع بين العشائر
3 haplotypes (HB1 to HB3) 3بط - 0بط طرز أحادية 3 سميت Number of haplotypes عدد الطرز األحادية
(3و 1شكل ) (HB1 & HB3) 3بط &0بط طرز أحادية اكتشف كل منهم في أكثر من بلد واحدة
Haplotype found in different countries
(3و 1شكل ) HB2, 1بط
كل منهم في بلد واحدة طرز أحادية وجد
Haplotypes found in only one country each
اضافة أو حذف نيوكليوتيدي INDELs ال كما وجد من قبل في الجينوم الميتوكونديري للحشرات (897969194)
Nucleotide substitutions استبداالت نيوكليوتيدية Type of variation نوع التنوع
موااقع بارسيمونية كلهم المواقع المتغيرة Variable sites 16 (%4.2) موقع
ة طفر 16 Total no. Of mutations الطفرات
2 to 15 عدد االختالفات الثابتة بين العشائر
No. fixed differences between populations
متوسط 1.48 Overall haplotype diversity التنوع الكلي للطرز األحادي
منخفض 0.025-0.003 التنوع النيوكليوتيدي بين العشائر
Nucleotide diversity (Pi) between populations
(69194) حياد اتجاه ا ت كما هو شائع في الجينوم الميتوكونديري للحشرات 66 - 66.1 % (AT %) %ا ت
%34-33.5 (GC %) %ج س
A to G, G to A, C to T & T to C - س -ت& ت -س، ا-ج، ج-عبارة عن ا التغيرات المتشابهة Transitional substitutions 04 موقع
T to A and C to A ا -س& ا -عبارة عن ت موقع1 - Transversional substitutions التغيرات المختلفة
Overall transition/transversion ratio (R) 10.779 انحياز للتغيرات المتشابهة كما قي جميع أنواع الجينوم (9) المختلفة /نسبة التغيرات المتشابهة
No ال Intra-population variation التنوع داخل العشائر
(HB1 & HB2 and HB1 & HB3) 3طب& 0و طب 1طب& 0ببين ط 1.139األعلى المسافات الوراثية بين الطرز األحادية
Genetic distances between haplotypes ( HB2 & HB3) 3طب& 1ببين ط 1.111األقل
Demographic analysis مقاييس ديموجرافية
A recent founder event 0.11161 حدث تأسيسي حديث Tajimas’D test اختبارات تاجيما للحيادية
يتبعها ان كل منها ثابتة لطرز معين* تجزئة وراثية بين العشائر 1 Fst - genetic differentiation قيم التمايز الوراثية
Absence of gene flow: Support the bottleneck event فق الموروثات و دعم للجرف الوراثي دغياب ت 0 Nm – gene flow تدفق المورثات
35
3دول ج
المقاييس المختلفة النتائج و تفسيرها
1263 bp 1263 قاعدة مزدوجة Amplified sites ةتضاعفعدد المواقع الم
735 bp 537 فاعدة مزدوجة Studied sites عدد المواقع المدروسة
جينوم الميتوكونديري للحشرات حياد اتجاه ا ت كما هو شائع في ال 66 - 69.8 % (AT %) %ا ت
%34-30.2 (GC %) %ج س
6: H1*-H4* , H6* & H8* 8ط* & *6ط *4ط - 1*ط , طرز أحادية 6 سميت لسوسة النخيل الحمراء عدد الطرز األحادية
Number of haplotypes of RPW
Nucleotide substitutions استبداالت نيوكليوتيدية Type of variation نوع التنوع
86 singleton موااقع بارسيمونية 136منها المواقع المتغيرة Variable sites (%30.2) 222 موقع
AG, GA, TC & CT س ت& ت س , ج ا, اج Transitional substitutions تشابهةالتغيرات الم
س ج& ج س , ج ت, ت ج, س ا, اس, ت ا, ا ت AT, TA, AC, CA, TG, GT, GC & CG
Transversional substitutions التغيرات المختلفة
32.488 انحياز للتغيرات المتشابهة كما قي جميع أنواع الجينومOverall transition/transversion ratio (R) نسبة التغيرات
المختلفة/المتشابهة
R. ferrugineus (H8*)
R. bilineatus R. phoenicis R. Cruentatus R. Palmarum
79 (0.12%) 98 (0.13%) 101 (0.14%) 102 (0.14%) Variable sites المواقع المتغيرة
91 107 112 115 الطفرات
Total no. Of mutations
2.5 3.3 3.4 3.5 زمن التشعب (مليون سنة)
Divergence time
R. bilineatus
0.058
المسافات الوراثيةGenetic distances
R. phoenicis
0.076 0.084
R. Cruentatus
0.079 0.083 0.081
R. Palmarum 0.081 0.095 0.084 0.078