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Gestion des exploitations Gestion des exploitations agricoles : partie agricoles : partie

génétiquegénétique« Genetic parameter estimates of meat quality « Genetic parameter estimates of meat quality traits in Duroc pigs selected for average daily traits in Duroc pigs selected for average daily

gain, longissimus muscle area, backfat gain, longissimus muscle area, backfat thickness, and intramuscular fat content »thickness, and intramuscular fat content »

K. Suzuki, M. Irie, H. Kadowaki, T. Shibata, M. Kumagai, A. K. Suzuki, M. Irie, H. Kadowaki, T. Shibata, M. Kumagai, A. NishidaNishida

LAHAYE StéphaniePARMENTIER DamienTESSIER Aymeric

(Groupe n°1)

Année académique 2005-2006

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Objectif de l’étudeObjectif de l’étude

1) 1) Estimer les paramètres génétiques les paramètres génétiques

2) 2) FixerFixer, par la sélection, les tendances , par la sélection, les tendances génétiques des paramètres corrélés génétiques des paramètres corrélés

en vue de produire une lignée de porcs Duroc en vue de produire une lignée de porcs Duroc utilisable pour augmenter la production de utilisable pour augmenter la production de viande et sa qualité.viande et sa qualité.

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AbréviationsAbréviationsGQM: gain quotidien moyenGQM: gain quotidien moyen

LMA: surface de la section du muscle longissimusLMA: surface de la section du muscle longissimus

BF: épaisseur du lard dorsal BF: épaisseur du lard dorsal

IMF: graisse intramusculaireIMF: graisse intramusculaire

TEND: tendreté TEND: tendreté

PCS et L: couleur et clarté PCS et L: couleur et clarté

DL: perte d'eau à l'égouttage DL: perte d'eau à l'égouttage

CL: perte d'eau à la cuisson CLCL: perte d'eau à la cuisson CL

pHpH

IMP: impédance électrique IMP: impédance électrique

COLL: contenu en collagène du muscle longissimusCOLL: contenu en collagène du muscle longissimus

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Déroulement de l’étudeDéroulement de l’étude- Critères de sélection: GQM, LMA, BF et IMF- Critères de sélection: GQM, LMA, BF et IMF

- Tests sur 7 générations avec, à chaque - Tests sur 7 générations avec, à chaque génération, 150 (100 femelles et 50 mâles) génération, 150 (100 femelles et 50 mâles) porcelets utilisés pour les performances-porcelets utilisés pour les performances-tests. Ces 150 sont sélectionnés sur base de tests. Ces 150 sont sélectionnés sur base de leur poids corporel (30kg) à 8 semaines.leur poids corporel (30kg) à 8 semaines.

- Full sib-test à partir de 80 - Full sib-test à partir de 80

autres porcelets (principalement autres porcelets (principalement

des mâles) pour fixer les gènes des mâles) pour fixer les gènes

pendant la sélectionpendant la sélection

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MesuresMesures Entre 30 et 105kg: mesure quotidienne du Entre 30 et 105kg: mesure quotidienne du

GQM sur les 150 porcelets.GQM sur les 150 porcelets. A 105kg: mesure de l'épaisseur BF et LMA.A 105kg: mesure de l'épaisseur BF et LMA. Pas de lignée de contrôle (raisons pratiques)Pas de lignée de contrôle (raisons pratiques) Sélection en 1ère et 2ème génération à partir Sélection en 1ère et 2ème génération à partir

de l'index de sélection basé sur les gains de l'index de sélection basé sur les gains relatifs désirés => performance-tests --> relatifs désirés => performance-tests --> données --> paramètres génotypiques et données --> paramètres génotypiques et phénotypiques --> critères de sélection.phénotypiques --> critères de sélection.

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MesuresMesures Objectifs:Objectifs:

GQM: 865gGQM: 865g +135g+135gLMA: 36,1 cm²LMA: 36,1 cm² +3,9cm²+3,9cm²IMF: 4,3%IMF: 4,3% +0,7%+0,7%BF: 2,34cmBF: 2,34cm -0,54cm-0,54cm

L'objectif est donc d'augmenter le GQM, la L'objectif est donc d'augmenter le GQM, la section du muscle et le contenu section du muscle et le contenu musculaire en graisse tout en diminuant musculaire en graisse tout en diminuant le lard dorsal.le lard dorsal.

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MesuresMesures

I= 0,038 DG + 1,38 EM - 15,10 BF + 12,63 IMF - 56,68

(= index de sélection (= index de sélection

= modélisation de la pression de sélection)= modélisation de la pression de sélection)

Augmenter IMF est impossible si l'épaisseur du Augmenter IMF est impossible si l'épaisseur du lard dorsal diminue TROP => nouvel objectif: ne lard dorsal diminue TROP => nouvel objectif: ne diminuer le BF que de 0,34cm (au lieu de 0,54). diminuer le BF que de 0,34cm (au lieu de 0,54). L'épaisseur sera donc de 2cm et il sera alors L'épaisseur sera donc de 2cm et il sera alors possible d'augmenter IMF.possible d'augmenter IMF.

NB: il existe une formule qui permet d'obtenir l'estimation NB: il existe une formule qui permet d'obtenir l'estimation économique des gains.économique des gains.

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MesuresMesures

Y = Y = μ + E + G + eμ + E + G + e = moyenne + effets fixes (environnement) = moyenne + effets fixes (environnement)

+ effets + effets aléatoires (génétiques) + aléatoires (génétiques) + effets résiduelseffets résiduels

= μ= μi i + (G+ (Gijij + S + Sikik) + (c) + (cilil + a + aimim) + ) + eeijklmijklm

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RésultatsRésultats

Les objectifs de gains (GQM, LMA et BF) n'ont Les objectifs de gains (GQM, LMA et BF) n'ont pas été atteints sauf pour l'IMF dont la réponse a pas été atteints sauf pour l'IMF dont la réponse a même été plus importante (1,2% au lieu de même été plus importante (1,2% au lieu de 0,7%).0,7%).

1010

Corrélations génotypiques(rG) et Corrélations génotypiques(rG) et phénotypiques(rP) retenues:phénotypiques(rP) retenues:

1) GQM et IMF (0,25 et 0,06)1) GQM et IMF (0,25 et 0,06) --> faibles --> faibles

2) LMA et DL (0,64 et 0,07)2) LMA et DL (0,64 et 0,07) --> élevée --> élevée

3) LMA et IMF3) LMA et IMF (-0,26 et -0,24) --> faiblement corrélés (-0,26 et -0,24) --> faiblement corrélés négativementnégativement

4) LMA et IMP4) LMA et IMP (-0,69 et -0,15) (-0,69 et -0,15) --> ++ LMA => contenu en --> ++ LMA => contenu en eau ++ eau ++ et résistance --et résistance --

5) IMF et TEND (-0,09 et -0,20) --> il n'existe pas de relation 5) IMF et TEND (-0,09 et -0,20) --> il n'existe pas de relation

6) IMF et DL – CL (-0,70 et -0,13) - (-0,42 et -0,07) --> si IMF 6) IMF et DL – CL (-0,70 et -0,13) - (-0,42 et -0,07) --> si IMF ++, ++, capacité de rétention d'eau de la viande fraîche capacité de rétention d'eau de la viande fraîche et cuite ++et cuite ++

1111

Corrélations génotypiques(rG) et Corrélations génotypiques(rG) et phénotypiques(rP) retenues:phénotypiques(rP) retenues:

7) IMF et L (0,42 et 0,43)7) IMF et L (0,42 et 0,43) --> modérée --> modérée

8) BF et TEND (-0,59 et -0,39) --> BF -- => TEND -- 8) BF et TEND (-0,59 et -0,39) --> BF -- => TEND --

9) BF et L (0,55 et 0,23)9) BF et L (0,55 et 0,23) --> BF -- => L ++ --> BF -- => L ++

10) TEND et L (-0,59 et -0,24) --> TEND ++ => L ++ 10) TEND et L (-0,59 et -0,24) --> TEND ++ => L ++

11) DL et IMP (-0,60 et -0,44) --> forte corrélation11) DL et IMP (-0,60 et -0,44) --> forte corrélation

12) TEND et COLL (0,26 et 0,00) --> COLL++ => TEND + 12) TEND et COLL (0,26 et 0,00) --> COLL++ => TEND +

13) COLL et CL (-0,64 et 0,06)13) COLL et CL (-0,64 et 0,06)

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Graphe n°1: traits de sélectionGraphe n°1: traits de sélection

GQM et IMF: EBV augmente donc sélection OK GQM et IMF: EBV augmente donc sélection OK

Graphe n°2: traits de qualité de viandeGraphe n°2: traits de qualité de viande

L: EBV augmente donc sélection OK L: EBV augmente donc sélection OK

DL et TEND: diminuent de la 4ème à la 7ème DL et TEND: diminuent de la 4ème à la 7ème génération donc sélection OK et augmentation génération donc sélection OK et augmentation de la capacité de rétention d'eau donc viande de la capacité de rétention d'eau donc viande plus agréable en bouche. plus agréable en bouche.

1313

Application pratiqueApplication pratique Conclusions des auteurs:Conclusions des auteurs:L'augmentation génétique de la IMF n'est pas reliée à L'augmentation génétique de la IMF n'est pas reliée à

la tendreté de la viande mais plutôt à une capacité la tendreté de la viande mais plutôt à une capacité de rétention d'eau augmentée (=> génétiquement de rétention d'eau augmentée (=> génétiquement lié à l'augmentation du contenu en collagène).lié à l'augmentation du contenu en collagène).

=> mesure de la qualité à partir du collagène => mesure de la qualité à partir du collagène et de l'impédance.et de l'impédance.

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Application pratiqueApplication pratique Conclusions pratiques:Parmis toutes les corrélations, seules GQM, IMF et

capacité de rétention d'eau (IMP, DL et CL) nous semblent utilisables en pratique.

Nous utiliserons donc les corrélations LMA-DL, LMA-IMP, IMF-L, BF-L et CL-COLL.

Pour choisir, il faut comparer les héritabilités: IMF (39%), IMP(22%), L (16%), DL (14%), CL (9%).

De plus, on observe au cours des générations une fixation correcte des caractères GQM, LMA, IMF, L, DL.

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Application pratiqueApplication pratique Conclusions pratiques:Conclusions pratiques:En conclusion, à partir de ces données, pour En conclusion, à partir de ces données, pour

augmenter la productivité, nous conseillerions à augmenter la productivité, nous conseillerions à l'éleveur de sélectionner sur base du gain l'éleveur de sélectionner sur base du gain quotidien moyen. quotidien moyen.

En ce qui concerne la qualité de la viande, la En ce qui concerne la qualité de la viande, la sélection est plus difficile au point de vue pratique. sélection est plus difficile au point de vue pratique. Néanmoins, sélectionner en fonction de la perte Néanmoins, sélectionner en fonction de la perte d'eau à l'égouttage et la clarté de la viande d'eau à l'égouttage et la clarté de la viande semblerait pertinent.semblerait pertinent.

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BibliographieBibliographie

Cours de génétique de 1er Doctorat du Cours de génétique de 1er Doctorat du Professeur DetilleuxProfesseur Detilleux