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Imagerie par Résonance Magnétique Fonctionnelle
Technique, méthodes, outils
Jean-Luc Anton, Bruno Nazarian, Muriel RothCNRS – Centre IRMF de Marseille
Imageries fonctionnelles
Imagerie fonctionnelle …Imagerie fonctionnelle …
• Localisation des zones cérébrales mises en jeu par des taches simples
• Cartographie des fonctions mentales
• Neurosciences fonctionnelles
• Neurosciences comportementales
• Sciences cognitives
Un peu de théorie …Un peu de théorie …
• Neurones
• Axones – Dendrites
• Synapses
• Neurones : Courants électriques : PA
• Synapses : Neurotransmetteurs
Première approche : localiser l’activité électriquePremière approche : localiser l’activité électrique
• Electro-encéphalographie (EEG)
Mesure du Potentiel électrique.
Ordre de grandeur : quelques microvolts
Capteurs : électrodes
• Magnéto- encéphalographie (MEG)
Deuxième approche : localiser l’activité magnétiqueDeuxième approche : localiser l’activité magnétique
Mesure du champ magnétique.
Ordre de grandeur : 10-13 tesla
Capteurs : SQUID couplés à des bobines
Appareillage très coûteux
Approches électromagnétiquesApproches électromagnétiques
Inconvénients :
• Aspect spatial (localisation des sources, solution unique ?)
• Coût pour la MEG
• Environnement technologique pour la MEG
Avantages :
• Résolution temporelle
• Non invasives
• Faible coût pour l'EEG
Troisième approche : le vecteur vasculaireTroisième approche : le vecteur vasculaire
Imagerie métabolique et hémodynamiqueImagerie métabolique et hémodynamique
Conséquences locales des activités électriques :
• Neurotransmetteurs : coûteux en énergie
• Augmentation de l’apport de glucose
• Modulation du débit sanguin
La Tomographie par Émission de Positon (TEP)La Tomographie par Émission de Positon (TEP)
Système tomographique :
• Source radioactive• Récepteurs en rotation• Reconstructions informatiques
• Isotopes spécifiques (traceurs)
La Tomographie par Émission de Positon (TEP)La Tomographie par Émission de Positon (TEP)
Inconvénients :
• Rayonnement radioactif
• Multiples injections (délai)
• Faible signal
• Résolution temporelle (mn)
Avantages :
• Résolution spatiale
• Nature tridimensionnelle
Imagerie par Résonance Magnétique Fonctionnelle
L’Imagerie par Résonance Magnétique NucléaireL’Imagerie par Résonance Magnétique Nucléaire
Une technique d'imagerie radiologique
• Non invasive
• Fondamentalement 3D
• Bonne résolution spatiale (mm)
• Signal intrinsèque de l'organisme
• Simultanéité anatomie/imagerie fonctionnelle
Le chant des protonsBloch et Purcell1946
Onde RF
Principe de l’IRM …Principe de l’IRM …
Principe de l’IRM …Principe de l’IRM …
La relaxation est un phénomène complexe
• Plusieurs relaxations
• T1, T2, T2*
• Produits de contraste
• T1 : images anatomiques
• Mesure de la relaxation à l'origine de l'aspect tridimensionnel des acquisitions IRM
L’Imagerie par Résonance Magnétique NucléaireL’Imagerie par Résonance Magnétique Nucléaire
Une technique d'imagerie fondamentalement 3D
Tranche de "voxels"(Pixels 3D)
Volume numérique(VN)Grille de "pixels"
L’IRM… FonctionnelleL’IRM… Fonctionnelle
Activité cérébrale (localisée)
• Augmentation de la Hb-O2
• Diminution de la déoxy-Hb (paramagnétique)
• Les protons restent plus longtemps en phase
• Augmentation du signal IRM(effet T2)
Agent de contraste intrinsèqueAgent de contraste intrinsèque
Exemples d'images (2D)Exemples d'images (2D)
Séquence pondérée en T1 :
Image anatomique
Séquence pondérée en T2 :
Image fonctionnelle
Protocoles et Traitements
Principes biophysiques de l'IRMfPrincipes biophysiques de l'IRMf
signal
temps4 - 6 sec.
• Mesure indirecte de l'activité cérébrale(effets métaboliques de l'activité électrique des neurones activés)
• Phénomène mesuré dans les vaisseaux sanguins (capillaires, veinules, …) qui drainent le territoire cérébral activé
• Localisation spatiale relativement précise (mm3) mais à considérer avec prudence
• Décours temporel du signal IRMf lissé et délayé par la fonction hémodynamique
Paradigme expérimentalParadigme expérimental
Comparaison de 2 conditions comportementale
• Tâche 1 et Tâche 2
• Régions cérébrales activées de façon différentielle
• Exploitation des variations locales d'inhomogénéités de champ magnétique entre une phase de "contrôle" (OFF) et une phase de "tâche" (ON).
• Traitement statistique
Protocole "bloqué" (block design)Protocole "bloqué" (block design)
Paradigme de type ON/OFF en créneaux.
Signal attendu dans les régions activés par la tâche 1 en comparaison avec la tâche 2
Acquisition
TempsProtocole
30 s - 1 min
Tâche 1 Tâche 1Tâche 2 Tâche 2
• Au cours de chaque période (bloc), le sujet reproduit de nombreuses fois la même tâche -> Problèmes liés à la fatigue et l'habituation
• Les données sont traitées par blocs -> Pas d'information temporelle
Protocole "évènementiel" (event related fMRI)Protocole "évènementiel" (event related fMRI)
Signal attendu dans les régions activés par la tâche 1 en comparaison avec la tâche 2
Séquence d'acquisition IRM ultra-rapide (EPI)• A chaque essai, le sujet réalise une fois la tâche• Possibilité de mélanger différents types d'essais • Possibilité de trier les essais à postériori lors du traitement statistique
(séparer les ≠ conditions, correspondance avec le comportement, …)• Activité cérébrale plus focalisée et plus spécifique• Analyse de la forme temporelle de l'activation (régime transitoire)• Relation avec les protocoles EEG, MEG
Acquisition
ProtocoleDélai (10 - 20 s)
Temps
Tâche 1 Tâche 1
Tâche 2 (="repos")
Traitement des imagesTraitement des images
1 – Pré-traitements
• Correction du bougé : recalage des images fonctionnelles
• Correction de la ligne de base : prise en compte des artéfacts liés à la respiration, au rythme cardiaque
Traitement des imagesTraitement des images
2 – Traitement statistique
• Établir une corrélation stimulus/réponseMéthode de corrélationSPM (régression multivariée)
• Seuillage des zones activées
Modèle linéaire généralisé : SPM99Modèle linéaire généralisé : SPM99
Acquisition (images fonctionnelles)
t
Tâche A Tâche ATâche B Tâche B
Signal IRMf dans un voxel :
Y(t)
Régresseurs modélisant les réponses aux tâches A et B :
RegA (t)
RegB (t)
Modèle linéaire généralisé : SPM99Modèle linéaire généralisé : SPM99
Estimation du modèle : coefficients β Y(t) = βA.RegA(t) + βB RegB(t) + Err(t)
βA.RegA(t)
βB RegB(t)
Err(t)
Y(t)
Les composantes du signal hémodynamiqueLes composantes du signal hémodynamique
1 – Activation « stimulus/réponse »
• Prise en compte dans le modèle linéaire
• Délayée dans le temps
2 - Facteurs physiologiques
• Battement cardiaque – Non régulier
• Respiration
• Stress, …
Enregistrer les données physiologiquesEnregistrer les données physiologiques
Battement cardiaque – Pléthysmographie
Capteur de respiration
Stress, émotion : Réponse électro-dermale
A intégrer dans la mise en place du modèle d’analyse
Traiter les données physiologiquesTraiter les données physiologiques
Seuillage de cartes statistiquesSeuillage de cartes statistiques
… et superposition avec l'anatomie individuelle
* Problèmes de Radio-Fréquence : pénétration
(Présence d’un casque EEG)
Traitement de l’image anatomiqueTraitement de l’image anatomique
Traitement de l’image anatomiqueTraitement de l’image anatomique
Correction du biais : à droite l’image corrigée : la substance blanche est plus uniforme
Traitement de l’image anatomiqueTraitement de l’image anatomique
Visualisation 3D : Substance grise, isolement et segmentation de la substance grise et visualisation 3D de la substance blanche
Visualisations tridimensionnellesVisualisations tridimensionnelles
• Fusion entre rendu volumiques des images anatomiques et les visualisations statistiques issues des images fonctionnelles
Visualisations tridimensionnellesVisualisations tridimensionnelles
« Gonflement ». Visualisation des gyri (gris clair) et du fond des sulci (gris foncé)
(Travaux du SHFJ à Orsay et du L6 à Marseille)
Visualisations tridimensionnellesVisualisations tridimensionnelles
Les « connexions » entre différentes parties du cortex se réalisent grâce aux fibres présentes dans la substance blanche
Fibres de projection
Imagerie IRM de diffusion (IRMd)Imagerie IRM de diffusion (IRMd)
Fibres commissurales (connexions interhémisphériques)
• Principe :• Encodage spatial de la diffusion des molécules dans le tissu
cérébral
• Utilisation d’une séquence RMN spécifique
– Hypothèse :• Dans la matière blanche, les molécules d’eau diffusent
préférentiellement le long des fibres
• Acquérir des images des directions prédéfinies
Imagerie IRM de diffusion (IRMd)Imagerie IRM de diffusion (IRMd)
* « Tracking » des fibres
Imagerie IRM de diffusion (IRMd)Imagerie IRM de diffusion (IRMd)
* Reconstruction des faisceaux
Imagerie IRM de diffusion (IRMd)Imagerie IRM de diffusion (IRMd)
Applications, études et projets
Le centre IRMf de la Timone, à MarseilleLe centre IRMf de la Timone, à Marseille
miroirsprojecteurécran
champ magnétique
clavier ergonomique
cable blindé
cage de Faraday
ordinateur
codage optique fibres
optiques
Stimulation sensorielle (visuelle, auditive, ...) et acquisition des réponses du sujet en temps réel
--> Contrôle du déroulement de l'expérience --> Analyse des performances psychophysiques
Exemple
Mise en œuvre technique du protocole dans l'environnement IRM
Description d'une expérience typique en IRMfDescription d'une expérience typique en IRMf
Le banc de stimulationLe banc de stimulation
Système temps réelPC (Windows NT), Labview, Cartes National InstrumentsSynchronisation par les acquisitions IRM
Plaque à filtres
PC de stimulation
Connectique dans la salle
* Visuelle: vidéo projecteur dans une cage de Faradayobjectif longue focale, jeu de miroirs et écranimages fixes ou séquences vidéos
* Acoustique: système piezzo-électrique (et … pneumatique)* Vibrations: turbines à air comprimé / lames piezzo
(fuseaux neuro-musculaires / récepteurs tactiles)
En cours d’installation :* Motrice: génération de mouvements du poignet
Banc deBanc de stimulationstimulation
Recueil des données / réponsesRecueil des données / réponses
- Claviers 5 touches (Main D et G)- Souris trackball avec 2 boutons- Joystick- Angles articulaires et force motrice
- Microphone piezzo-électrique ( )
- Battements cardiaques, respiration- Réponse électro-dermale
En cours de développement :- Mouvements oculaires- EMG, EEG
L'environnement d'expérimentationL'environnement d'expérimentation
Environnement sonore
Bruit permanent
Acquisition anatomique
Séquences fonctionnelles
Environnement spatial
Exiguité
Isolement
Stress
Thématiques NeuroscientifiquesThématiques Neuroscientifiques
- Action et Perception (11 projets)
- Langage, Mémoire, Attention (11 projets)
- Plasticité et Neurologie (7 projets)
Trois axes majeurs
Bibliographie sommaireBibliographie sommaire
Romaiguère P, Anton JL, Roth M, Casini L, Roll JP“Kinaesthesia activates both motor and parietal cortical areas in humans:a parametric fMRI study”Cognitive Brain Research (2002)
Longcamp M, Anton JL, Roth M, Velay JL“The Sensorimotor Component of Letter Representation”Neuroimage (en révision)
Schön D, Anton JL, Roth M, Besson M“An fMRI study of music sight-reading ”Neuroreport (en révision)
Chabanne V, Péruch P, Anton JL, Roth M, Thinus-Blanc C “An fMRI investigation of dissociation between spatial and object recognition and memory”Eighth International Conference on Cognitive Neuroscience, Porquerolles, Septembre 2002
Brett M, Anton JL, Valbregue R, Poline JB“Region of interest analysis using an SPM toolbox”,Human Brain Mapping, Juin 2002 (Abstract)
+ …
- Acquisition IRM
- Conception des protocoles
- Traitements des données
Trois axes majeurs
Recherches méthodologiquesRecherches méthodologiques
Illustration(s) : TonotopieIllustration(s) : Tonotopie
JL Anton, M Roth, B Nazarian, JM Badier, C Liégeois-Chauvel, P Belin
Acquisition IRM éparpillée (sparse imaging)
Sons aigus vs sons graves
Stimulation saccadée …
750 Hz 2000 Hz
Illustration(s) : TonotopieIllustration(s) : Tonotopie
Acquisition IRM éparpillée(sparse imaging)
Son aigu (2000 Hz)
Son grave(750 Hz)
Intersection
L LR R
TonotopieTonotopie : : Topologie fonctionnelle
TonotopieTonotopie : : Topologie fonctionnelle
Perspectives scientifiques
- Relation avec des modèles précis, paramètriques
- Analyse spatiale et temporelle
- Connectivité fonctionnelle
- Fusion IRMf – EEG - MEG
Perspectives scientifiques MEG : Instrumentation
MEG versus IRMf
• Mesure directe
• Résolution temporelle : ms
• Résolution spatiale variable : cm
• Analyse des processus temporels
• Silencieuse
• Mesure indirecte
• Résolution temporelle : s
• Résolution spatiale : mm
• Accès aux structures profondes
Mise en oeuvre expérimentale procheMise en oeuvre expérimentale procheComplémentarité des deux techniquesComplémentarité des deux techniques
Perspectives scientifiques Fusion IRMf & MEG
Perspectives pour la recherche clinique
Implication encore timide de la communauté médicale marseillaise …
L’IRM fonctionnelle, un outil puissant et prometteur pour :
- Cartographie fonctionnelle précise en pré-opératoire
- Nouvelles méthodes diagnostiques précoces de pathologies cérébrales
- Meilleure compréhension des maladies dégénératives (suivi longitudinal)
- Suivi de la récupération fonctionnelle après lésion cérébrale
- Localisation des foyers épileptogènes (couplage avec EEG)(complémentarité avec l’EEG, la MEG et la SEEG)
Centre IRMf (Bâtiment extérieur)CHU La Timone264, Rue Saint Pierre13385 MARSEILLE Cedex 05
Tél: 04-91-38-47-56/9Fax: 04-91-38-47-57E-mail: [email protected]
http://irmfmrs.free.fr
A propos …