Introducción a la terminología Snomed CT como elemento facilitador de la interoperabilidad semántica entre plataformas mediante la normalización de datos.
- 1. Unidad de Investigacin en Telemedicina y e-Salud (UITES)
Introduccin a Snomed CTAproximacin a la terminologa mdicaJess
Cceres TelloMadrid, 22/06/2011
2. ndice 05.06 Componentes: Formas cannicas01 Introduccin01
Definicin02 Snomed en Espaa03 Componentes de Snomed. Visin
general02 Contenido de Snomed01 Documentacin02 Ficheros de datos:
Basic tables03 Ficheros de datos: Language subset table03 Tablas en
Snomed CT01 Tabla de conceptos02 Tabla de descripciones03 Tabla de
relaciones04 Aplicaciones y Servicios01 Servicios de Terminologa
basados en Snomed CT02 Aplicaciones con Snomed CT03 Ejemplo de
aplicaciones05 Componentes de Snomed CT01 Conceptos02
Descripciones03 Relaciones Introduccin a Snomed CT04 Subconjuntos05
Conjuntos de referencia cruzada06 Otros componentes06 La gramtica
de Snomed CT07 Snomed browsers01 Navegadores offline02 Navegadores
online03 Navegadores en dispositivos mviles08 Trabajos actuales 2
3. 01.00 IntroduccinLa interoperabilidad I Introduccin a Snomed CT
3 4. 01.00 IntroduccinInteroperabilidad IIDemasiadosmodelos,
sistemas,estructuras, etc Introduccin a Snomed CT 4 5. 00.
DefinicinLa interoperabilidad semnticaposibilita la normalizacin de
losdatos intercambiados y sucontexto para que puedan
sercomprensibles e interpretados de Introduccin a Snomed CTigual
manera por todos losparticipantes en el proceso 5 6. 01.00
IntroduccinInteroperabilidad: Uso de Estndares Introduccin a Snomed
CT 6 7. 01.01 Introduccin Definicin SNOMED RTCTV3Snomed Reference
Terminology Clicinical Terms Version 3College of American
Pathologists (CAP)National Health Service (NHS)mbito: Ciencias
bsicas, bioqumica y especialidades mdicasmbito: Atencin primaria
(Cdigos Read)Sistematic NOmenclature of MEDicine Clinical Terms
Terminologa clnica de referencia completa cuyo contenido
yexpresividad facilitan el diseo de documentacin clnica y elproceso
de informacin en el mbito de la salud. Introduccin a Snomed CT
Permite que mdicos, investigadores y pacientes compartandatos
comparables. Es esencial para la recoleccin, recuperacin, agregacin
yreutilizacin de datos mdicos as como favorecer el intercambio 7de
informacin. 8. 01.02 IntroduccinSnomed en Espaa Snomed est
mantenido y distribuido por el International HealthTerminology
Standards Development Organisation (IHTSDO) Incorporacin de Espaa
al IHTSDO en 2009 Edicin en espaol en desarrollo Edicin nacional
distribuida por el Ministerio de Sanidad (ed.argentina)Introduccin
a Snomed CT Se requiere certificado digital Peticin previa Correo
de aceptacin Descarga sin coste La actualizacin de Snomed es de 2
veces al ao (enero y julio)8 9. 01.03 Estructura de
DatosComponentes de Snomed CT. Visin generalSon grupos menores
deconceptos, descripciones o Mecanismo de relaciones de Snomed
CTMecanismo de HistorialSubconjuntos Posibilitan la actualizacin
Extensiones de las publicaciones de Snomed, guardanTablas
informacin sobre cambios en los datos PrincipalesArchivos de
ndices, palabras equivalentes, trminos duplicados, Conceptos Tablas
de formas cannicas Introduccin a Snomed CT Descripciones Relaciones
Mecanismo deHerramientas deRelacionan conceptosReferencias Snomed
con otrasdesarrollador y Cruzadas clasificaciones o
esquemasotrosCIE-9 o CIE-10 9 10. 02.01 Contenido SNOMED
CTDocumentacin Gua de Usuario: Describe el contenido, la estructura
y la terminologa de Snomed CT. Visin general y ejemplos de uso
Explica el contenido y los principios utilizados para modelar la
terminologa Dirigido a personal de rea mdicas, directores,
comerciales, gerentes de productos de software y lderes de
proyectos de adquisicin, implementacin y uso Gua Tcnica de
Implementacin: Gua para la implementacin tcnica de aplicaciones
habilitadas para Snomed CT Dirigido a desarrolladores de software,
especialistas en informticaIntroduccin a Snomed CT mdica,
compradores e integradores de sistemas Gua de Referencia Tcnica:
Describe la estructura de archivos de Snomed CT segn IHTSDO
Dirigido a cualquier particular u organizacin que desee desarrollar
o utilizar Snomed CT10 11. 02.02 Contenido SNOMED CTFicheros de
datos: Basic tables____. sct1_Concepts_Core_INT_20100131.txt
390.023 Conceptos Cada fila representa a un concepto mdico Cada
concepto tiene un identificador nico y una descripcin completas que
especifica la naturaleza del concepto
sct1_Descriptions_es_INT_20100430.txt: 1.053.939 Descripciones Cada
fila asocia a un trmino con un concepto mdico, este trmino puede
utilizarse para representar al conceptoIntroduccin a Snomed CT Cada
descripcin tiene su identificador nico y adems, el texto de un
trmino y el identificador del concepto que puede representar Debe
utilizarse conjuntamente con la tabla de subconjunto de idioma.
sct1_Relationships_Core_INT_20100131.txt: 1.420.532 Relaciones Cada
fila representa una relacin entre dos conceptos11 El tipo de
relacin se identifica por la referencia a otro concepto 12. 02.03
Contenido SNOMED CTFicheros de datos: Language subset table
Conjunto de conceptos, descripciones o relacionesapropiadas para un
idioma, dialecto, pas, especialidad,organizacin, usuario o contexto
en particular Lista de identificadores de Snomed (SCTID) miembro
del subconjunto Tipos de subconjuntos: Idiomas: ISO 639 Conceptos
de un dominio (especialidad mdica, organizacin, etc.) Descriptores
de un dominio, trminos duplicados, conceptos de uncontexto, ..
der1_Subsets_es_INT_20100430.txt Cada fila de la tabla describe una
publicacin de un subconjunto Introduccin a Snomed CT Incluye los
subconjuntos de Snomed CT que se agrupan en la tablade miembros
der1_SubsetMembers_es_INT_20100430.txt: Cada fila representa un
miembro de un subconjunto El miembro puede ser un concepto o una
descripcin. Se pueden agrupar uno o ms subconjuntos.12 13. 03.01
Tablas en SNOMED CTTabla de ConceptosconceptID conceptStatus
fullySpecifiedName CTV3ID snomedID isPrimitiveEntire tuberculum
sellae (body139784008 0XS10s T-D1463 1structure)10041900010 DUOVAC
-M (product)XU07K C-D2631 1 conceptID: Identificador nico del
concepto conceptStatus: Estado del concepto:0: Activo1: Retirado2:
Duplicado3: Desactualizado4: Ambiguo5: Errneo6: Limitado10:
Trasladado a otra parte (extensin o al ncleo) Introduccin a Snomed
CT11: Traslado pendiente fullyspecifiedName: frase nica que
describe al concepto. Relacionado conTerm en la tabla de
descripciones CTV3ID: Cdigo asignado en Clinical Terms Version 3
(Cdigos Read) snomedID: identificador Snomed RT isPrimitive: Indica
si un concepto es primitivo (son relaciones is a) ocompletamente
definido 13 14. 03.02 Tablas en SNOMED CTTablas de
Descripcionesdescriptio descriptionStaInitialCapi Description
LanguageCo ConceptIDTerm nID tustalStatus Type de mordedura de
animal en la1361819017 028381500303esespalda (trastorno)129754601
mordedura de animal en el 02838160020 1 es6traxdescriptionID:
Identificador nico de la descripcindescriptionStatus: Estado del
concepto: 0: Activo 1: No Activo 2: Duplicado 3: Desactualizado 4:
Ambiguo 5: Errneo 6: Limitado 10: Trasladado a otra parte (extensin
o al ncleo) 11: Traslado pendienteIntroduccin a Snomed CTconceptId:
Identificador nico del conceptoTerm: Indica el texto que describe
el conceptoInitialCapitalStatus: (0: Falso; 1:
Verdadero)descriptionType: Indica el tipo de descripcin definida:
0: No especificado 1: Preferido 2: Sinnimo 3:
FullSpecifiedNameLanguagecode: indica el lenguaje y/o dialecto del
trmino (ISO 639)14 15. 03.03 Tablas en SNOMED CTTablas de
RelacionesrelationShi conceptIDconceptIDrelationShipType
characteristicType Refinability relationShipGrouppID
123565950025101763002116680003 370126003 0
003572296020101764008116680003 370126003 0 00 relationShipID:
Identificador nico de la relacin conceptID1: Indentificador del
primer concepto (rol hijo) relationShiptype: Identificador nico del
concepto querepresenta el tipo de relacin entre los conceptos
relacionados characteristicType: seala si una relacin especifica
unacaracterstica definitoria del concepto origen o una
posiblecaracterstica calificativa de ese concepto: 0: Relacin
Definitoria: ES UN/UNA [IS_A] Introduccin a Snomed CT 1: Relacin
Calificadora: ES UNA CALIFICACIN POSIBLE 2: Relacin Histrica: IGUAL
QUE 3: Relacin Adicional: ES UNA CARACTERSTICA DEL CONCEPTO CTV3ID:
Cdigo asignado en Clinical Terms Version 3 (CdigosRead) snomedID:
identificador Snomed RT isPrimitive: Indica si un concepto es
primitivo (son relaciones isa) o completamente definido 15 16.
04.01 Servicios de Terminologa basados en Snomed CTEsquema general
Edicin AInternacional de Snomed CTInstalacin Bsqueda de Frases p
Actualizacin Navegacin por la jerarqua l Aplicacin de Subconjuntos
iSubconjuntosDistribucinde la Instalacin Referencias Cruzadas
cExtensin Palabras clavesObtencin de conceptos Actualizacin a
Obtencin referencias cruz. c Introduccin a Snomed CTCrear/Editar
SubconjuntosObtencin de historial i Crear/Editar una Extensin
Servicios de Terminologan 16Ampliados 17. 04.02 Aplicaciones con
Snomed CTEnfoques: Integrado y basado en componentesEnfoque basado
en componentes Desarrollo rpido de la funcionalidadrelacionada con
Snomed Identificacin de forma separada los Enfoque de
integracinmdulos reutilizables y losreemplazables Independencia de
desarrollos Permite la comparticin de un nico realizados por
tercerosservidor de terminologa Acceso personalizado a Snomed CT
Reduccin del mantenimiento y eladatado a las necesidades de los
coste asociado de cada usuarios instalacin Alineacin garantizada de
las Introduccin a Snomed CT publicaciones de Snomed CT Coherencia
entre interfaz de usuario y las diferentes aplicaciones en lo
relativo a su acceso a Snomed CT 17 18. 04.03 Ejemplos de
aplicacionesPropuesta de aplicaciones con Snomed CT Sistema de
registros mdicos preparado para SNOMED CT,: Ingreso de datos mdicos
Soporte para la toma de decisiones Vnculos con bases de
conocimientos Interfaces de mensajes de rdenes-informes mdicos
Soporte para comunicar o compartir registros, etc. Almacn de datos
(warehouse). Sistema de diagnstico departamental Sistema de soporte
para la toma de decisiones Sistema para la creacin de consultas
Introduccin a Snomed CT Un sistema de codificacin que vincula
conceptos codificadoscon SNOMED CT a agrupaciones o
clasificacionesadministrativas, DRG o CIE10. Sistema de soporte
para el diseo o implementacin demensajes 18 19. 05.01 Componentes:
ConceptosDefinicin Esunsignificado clnicoidentificado por un
identificadornumrico (ConceptID) Se representan con un
nombrecompleto nico legible al serhumano (Descripcin completa) Su
definicin formal se basa en lasrelaciones con otros conceptos
Representan diferentes niveles dedetalle clnico La granularidad
favorece laposibilidad de codificacin deIntroduccin a Snomed
CTdatos mdicos con el nivelapropiado de detalle. Ejemplo: 55679008
Neumona peribronquial (trastorno)19 20. 05.01 Componentes:
ConceptosJerarquas en los conceptos de Snomed CT Hallazgo clnico
Fuerza fsica Procedimiento Evento Entidad observable Ambiente o
localiz. geogrfica Estructura corporal Contexto social Organismo
Situacin con contex. Explcito Sustancia Estadificaciones y escalas
Prod. Farmacutico/biolgico Conceptos de enlace Introduccin a Snomed
CT Espcimen Calificadores Conceptos especiales Elementos de
registro Objeto fsico20 21. 05.02 Componentes:
DescripcinIntroduccin Trminos o nombre asignados a un concepto de
Snomed CT. Un identificador de descripcin identifica una descripcin
Cada concepto tiene una descripcin completa Cada descripcin se
refiere a un solo objeto Fully Specified Name de la tabla conceptos
no es igual a ladescripcin o trmino preferido en la tabla de
descripciones: FullySpecifiedName: explica el significado del
concepto con mayordetalle Prefered Term: busca evitar la ambigedad
o disminuirla. Ejemplo: ConceptID 22298006Introduccin a Snomed CT
Descripcin completa (Fully Specified Name): Infarto de miocardio
(trastorno)DescriptionID 898593010 Trmino preferido: Infarto de
miocardio DescriptionID 898589016 Sinnimo: Infarto cardaco
DescriptionID 898591012 Sinnimo: Ataque al corazn DescriptionID
898592017 Sinnimo: Infarto de corazn DescriptionID 3744101821 22.
05.03 Componentes: RelacionesIntroduccin Una relacin representa una
asociacin entre dos conceptos RelationShipID identifica una sola
relacin, es nico. Una relacin contiene tres conceptos, dos
asociados por untercero que indica el tipo de relacin por el cual
estnasociados Ejemplo: artritis(1er. concepto) IS_A (ES_UN/UNA)
(tipo de relacin) trastorno articular (2 concepto) 171238007
(fullyspecifiedName: Arthritis screening (procedure)) IS_A
(characteristicType: 0) 13750006 (fullyspecifiedName: Joint-ill
(disorder)) RelationGroupvinculacaractersticas
definitoriasinterrelacionadas Introduccin a Snomed CT Una relacin
puede representarse en una estructura jerrquicallamada Jerarqua de
Roles 363699004: Direct device (attribute)Procedure categorized by
device involved (procedure) 363710007: Indirect device (attribute)
22 23. 05.03 Componentes: RelacionesVisualizacin grfica de las
tablasTabla Conceptos SCT IDSNOMED IDConcept Name 71620000
DD-13100Fracture of Femur116676008 G-C504Associated Morphology
(attribute) 72704001 M-12000 Fracture (morphology)Tabla
RelacionesIntroduccin a Snomed CT Concept IDRelationship ID Concept
ID 71620000116676008 7270400123 24. 05.04 Componentes:
SubconjuntosIntroduccinRepresentan grupos de componentes que
comparten caractersticas especficas de accesibilidad: Dominio
Especialidad Contexto particularTipos: Idiomas y dialectos
Frecuencia de uso de descripciones o conceptos Adaptabilidad de
conceptos especficos para ser usados en un contextoparticular
Estructura y orden de las jerarquas de conceptos para navegacin por
parte delusuario.Los subconjuntos se publican en formato
relacional, como una fila en la Tabla de Subconjuntos
(der1_Subsets_es_INT_20100430) Introduccin a Snomed CT subsetOrigin
SubsetVerssubsetTylanguagLanguag realM contextsubsetID subsetName
alIDion peeCodeeCodeidID1130033 18 283815003 Spanish Language
Edition0 1es 0Cada uno de los miembros de los subconjuntos se
representa como una filaen laTabla deMiembros deunSubconjunto.
(der1_SubsetMembers_es_INT_20100430) subsetID MemberID MemberStatus
LinkedID 24 11300331361819017 3 25. 05.05 Componentes: Conjuntos de
referencia cruzadaIntroduccin Representa a un grupo de vnculos
entre los conceptos deSnomed CT y uno o ms cdigos en una
clasificacin,esquema de codificacin o grupo de trminos
administrativos(ICD9) (der1_CrossMapSets_ICD9_INT_20100731) MAPSE
MAPS MAP MAPSET MAPSETIMAPSETN MAPSETSCHE ETRE SETR MAPSETSCHEMEID
MAPSETSCHEMENAME SEPARAT D AMETTYPEMEVER ALMI ULETORSIONDYPE
International Classification ofDiseases and Related
Health100046ICD-9-CM2 2.16.840.1.113883.6.5.2.1 2010|Problems, 9th
Revision, Clinical Modifications. der1_CrossMaps_ICD9_INT_20100731
MAPCONCEPTI MAPSETID MAPOPTIONMAPPRIORITY MAPTARGETID
MAPRULEMAPADVICE Introduccin a Snomed CT D 100046 126485001 0 0
14380541
der1_CrossMapTargets_ICD9_INT_20100731TARGETIDTARGETSCHEMEIDTARGETCODESTARGETRULE
TARGETADVICE14380542.16.840.1.113883.6.5.2.1708.9 25 26. 05.06
Componentes: Otros componentesIntroduccin Formas Cannicas: Es una
tabla adicional que contiene representaciones alternativas de
caractersticas definitorias asociadas a cada concepto. Su
utilizacin es opcional. Contiene el conjunto mnimo de
caractersticas definitorias de cada concepto
res1_Canonical_Core_INT_20100731
CONCEPTID1RELATIONSHIPTYPECONCEPTID2RELATIONSHIPGROUP109489000
116680003 1094870030 Informacin Histrica:Introduccin a Snomed CT
Los identificadores nicos de los componentes son permanentes y no
se reutilizan ConceptStuatus o DescriptionStatus indican por qu se
ha inactivado el componente (errores, duplicidad,
ambigedad)CONCEPTIDRELEASEVERSION CHANGETYPESTATUSREASON
321393004200207312 0 FULLYSPECIFIEDNAME CHANGE26 27. 06.01 La
gramtica de Snomed CT Introduccin Creada para la representacin de
expresiones de Snomed CT. Utilizada para propsitos de demostracin y
estandarizacin Legibilidad para humanos y procesable por las
mquinas Almacenamiento en objetos de UNE-EN ISO13606 Ejemplos:
31978002 | fracture of tibia 31978002 | fracture of tibia |:
272741003 | laterality |= 7771000| left | 417662000 | past history
of clinical finding| :246090004 | associatedfinding| =(31978002 |
fracture of tibia| : 272741003 | laterality| =7771000 |left| )
:=Introduccin a Snomed CT :{=,=} :=(:=codeSystemName="LOINC"/>
Past Medical History 32 33. Gracias por su atencinJess Cceres
[email protected] de Investigacin en Telemedicina
y e-SaludAvda. Monforte de Lemos, 528029 - Madrid.
Espaawww.isciii.es
