17
1 ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI NOSOKOMIAL PADA LINGKUNGAN RUMAH SAKIT MARGONO SOEKARJO PURWOKERTO SKRIPSI Skripsi diajukan untuk memenuhi salah satu syarat memperoleh gelar Sarjana Farmasi (S. Farm) Diajukan oleh MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF 1208010123 Kepada Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto Purwokerto 2017

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI ...repository.ump.ac.id/4616/1/COVER_MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF_FARMASI'17.pdf · isolasi dan identifikasi bakteri penyebab infeksi

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI ...repository.ump.ac.id/4616/1/COVER_MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF_FARMASI'17.pdf · isolasi dan identifikasi bakteri penyebab infeksi

1

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI

NOSOKOMIAL PADA LINGKUNGAN RUMAH SAKIT MARGONO

SOEKARJO PURWOKERTO

SKRIPSI

Skripsi diajukan untuk memenuhi salah satu syarat memperoleh gelar Sarjana

Farmasi (S. Farm)

Diajukan oleh

MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF

1208010123

Kepada

Fakultas Farmasi

Universitas Muhammadiyah Purwokerto

Purwokerto

2017

Page 2: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI ...repository.ump.ac.id/4616/1/COVER_MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF_FARMASI'17.pdf · isolasi dan identifikasi bakteri penyebab infeksi

2

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI

NOSOKOMIAL PADA LINGKUNGAN RUMAH SAKIT MARGONO

SOEKARJO PURWOKERTO

SKRIPSI

Diajukan oleh

MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF

1208010123

Kepada

Fakultas Farmasi

Universitas Muhammadiyah Purwokerto

Purwokerto

2017

Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017

Page 3: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI ...repository.ump.ac.id/4616/1/COVER_MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF_FARMASI'17.pdf · isolasi dan identifikasi bakteri penyebab infeksi

3

Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017

Page 4: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI ...repository.ump.ac.id/4616/1/COVER_MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF_FARMASI'17.pdf · isolasi dan identifikasi bakteri penyebab infeksi

4

Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017

Page 5: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI ...repository.ump.ac.id/4616/1/COVER_MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF_FARMASI'17.pdf · isolasi dan identifikasi bakteri penyebab infeksi

5

HALAMAN PERNYATAAN

Yang bertanda tangan dibawah ini, saya :

Nama : Mohammad Zulfikar Rashif

NIM : 1208010123

Program Studi : Farmasi

Fakultas/Universitas : Farmasi/Universitas Muhammadiyah Purwokerto

Menyatakan dengan sebenar-benarnya bahwa skripsi ini adalah hasil dari proses penelitian

saya yang telah dilakukan sesuai prosedur penelitian yang benar dengan arahan dari dosen

pembimbing dan bukan hasil penjiplakan dari hasil karya orang lain atau terdapt karya yang

pernah diajukan untuk memperoleh gelar kesarjanaan di suatu perguruan tinggi dan

sepanjang pengetahuan penulis juga tidak terdapat karya atau pendapat yang pernah ditulis

atau diterbitkan orang lain kecuali yang secara tertulis diacu dalam naskah ini dan disebutkan

dalam daftar pustaka.

Demikian Pernyataan ini dan apabila kelak dikemudian hari terbukti ada unsur

penjiplakan, maka saya bersedia mempertanggung jawabkan sesuai dengan ketentuan yang

berlaku.

Purwokerto, Agustus 2017

Yang menyatakan

Mohammad Zulfikar Rashif

Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017

Page 6: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI ...repository.ump.ac.id/4616/1/COVER_MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF_FARMASI'17.pdf · isolasi dan identifikasi bakteri penyebab infeksi

6

ABSTRAK

Infeksi nosokomial merupakan infeksi yang didapat selama pasien dirawat di rumah

sakit 3 x 24 jam atau infeksi yang terjadi pada lokasi yang sama tetapi disebabkan oleh

mikroorganisme yang berbeda dari mikroorganisme pada saat masuk rumah sakit atau

mikroorganisme penyebab sama tetapi lokasi berbeda. Penelitian ini bertujuan untuk

mengisolasi dan mengidentifikasi famili bakteri penyebab infeksi nosokomial yang

kemungkinan terdapat di lingkungan RS Margono.Metode penelitian dengan Uji identifikasi

bakteri meliputi pengamatan karakteristik mikroskopik dan uji biokimia. Pada penelitian ini

menggunakan 3 uji biokimia yang terdiri dari uji katalase, uji oksidase dan uji fermentasi

karbohidrat. Dari 5 ruang yang diambil acak sampel pada lantai, dinding dan air maka didapat

hasil mengidentifikasi bakteri di lingkungan RS Margono Soekarjo Purwokerto didapat famili

bakteri yaitu sampel dinding 1 , lantai 1-3 merupakan Bacillaceae; dinding 2 , air 1-3 itu

Pseudomonas ; dinding 3-5 , lantai 4 dan 5 itu Staphylococcaceae serta pada air 4 dan 5 itu

Lactobacillaceae.Hasil penelitian identifikasi bakteri di lingkungan rumah sakit Margono

berhasil beberapa bakteri yang diantaranya dikelompokkan menjadi famili bakteri. Famili

bakteri yang didapat dari hasil identifikasi dengan uji biokimia telah dilakukan yang

kemungkinan penyebab infeksi nosokomial yaitu Bacillaceae, Staphylococcaceae dan

Pseudomonas.

Kata Kunci: infeksi nosokomial, RS Margono Soekarjo Purwokerto, identifikasi, bakteri

Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017

Page 7: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI ...repository.ump.ac.id/4616/1/COVER_MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF_FARMASI'17.pdf · isolasi dan identifikasi bakteri penyebab infeksi

7

ABSTRACT

Nosocomial infection is an infection acquired during hospitalized patients 3 x 24

hours or infection occurring at the same site but caused by different microorganisms from

microorganisms at the time of admission or similar cause microorganisms but different sites.

This study aims to isolate and identify the bacterial families that cause nosocomial infections

that may exist in the environment Margono Hospital. Methods of research with bacterial

identification tests include observations of microscopic characteristics and biochemical tests.

In this study used 3 biochemical tests consisting of catalase test, oxidase test and

carbohydrate fermentation test. From 5 random samples taken on the floor, wall and water,

the result of identifying bacteria in Margono Soekarjo Purwokerto Hospital was obtained by

bacterial family, 1st wall, 1-3rd floor samples were Bacillaceae; wall 2, water 1-3 is

Pseudomonas; walls 3-5, The 4th and 5th floors were Staphylococcaceae as well as on water

4 and 5 were Lactobacillaceae. The result research that the presence of bacteria found in the

hospital environment Margono successes get some bacteria that among them grouped into

bacterial families. Bacterial families obtained from the results of identification with

biochemical tests have been conducted which are likely causes of nosocomial infections such

as Bacillaceae, Staphylococcaceae and Pseudomonas.

Keywords: nosocomial infection, Margono Soekarjo Purwokerto Hospital, Identification,

bacterial

Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017

Page 8: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI ...repository.ump.ac.id/4616/1/COVER_MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF_FARMASI'17.pdf · isolasi dan identifikasi bakteri penyebab infeksi

8

HALAMAN PERSEMBAHAN

Puji syukur kehadirat Allah SWT yang telah memberikan kekuatan, kemudahan serta

keridhoannya dalam menyelesaikan skripsi ini. Skripsi ini saya persembahkan untuk

1. Bapak Sugiarto dan Ibunda Rosi Heniwati yang selalu memberikan dukungan

dalam menyelesaika studi

2. Kakak tercinta Meili Eka Listiani yang senantiasa memberikanku semangat,

motivasi, do’a dan nasehat sehingga skripsi ini dapat diselesaikan dengan hasil

yang memuaskan

3. Untuk sahabat-sahabat Tamtama 2012 dan teman-teman Allosteric yang selalu

mendukung saya dalam menyelesaikan skripsi ini

Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017

Page 9: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI ...repository.ump.ac.id/4616/1/COVER_MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF_FARMASI'17.pdf · isolasi dan identifikasi bakteri penyebab infeksi

9

Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017

Page 10: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI ...repository.ump.ac.id/4616/1/COVER_MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF_FARMASI'17.pdf · isolasi dan identifikasi bakteri penyebab infeksi

10

KATA PENGANTAR

Assalamu’alaikum warohmatullohi wabarokatuh

Alhamdulillah puji syukur kehadirat Allah SWT dan Nabi Muhammad SAW,

yang telah melimpahkan rahmat dan hidayah-Nya serta pencerahan yang dibawakan

oleh Rasullullah SAW sehingga penulis mampu menyelesaika skripsi ini yang

berjudul. Skripsi ini disusun untuk memenuhi persyaratan untuk mencapai derajat

Sarjana Farmasi di Fakultas Farmasi Univeristas Muhammdiyah Purwokerto.

Penulis menyadari bahwa selesainya skripsi ini tidak terlepas dari bantuan

berbagai pihak. Oleh karena itu penulis ingin mengucapkan terimakasih kepada :

1. Dr. H. Syamsuhadi Irsyad, S.H., M.H selaku Rektor Universitas

Muhammadiyah Purwokerto yang telah memimpin dengan arif dan bijaksana serta

memberikan fasilitas belajar mengajar di Fakultas Farmasi Universitas

Muhammadiyah Purwokerto sehingga penulis dapat menyelesaikan studi ini

2. Dr. Agus Siswanto, M.Si., Apt.selaku Dekan Fakutas Farmasi Universitas

Muhammadiyah Purwokerto yang telah memimpin keseluruhan proses mengajar

di tempat penulis menuntut ilmu, dengan segala kedisiplinan, kemudahan dan

perhatian sehingga memberikan semngat dan kemudhan penulis dalam

menyelesaikan studi

3. Nunuk Aries Nurulita, M.Si.,Apt selaku pembimbing I dan Elza Sundhani,

M.Sc.,Apt selaku pembimbing II yang telah memberikan inspirasi kepada penulis

dan berkenan membimbing serta mengarahkan penulis dalam menyelesaikan

skripsi ini

4. Githa Fungie Galistiani, M.Sc., Apt. Dan Retno Wahyuningrum, M.Sc., Apt

selaku penguji yang telah mengarahkan penulis demi kesempurnaan skripsi ini

5. Bapak dan Ibu tercinta yang selalu memberikan do’a dan semangat serta

dukungan moral maupun material

6. Semua pihak yang telah membantu penyelesaian skripsi ini, semoga Allah SWT

memberikan imbalan yang sesuai. Aamiin

7. Untuk Laboratorium Terpadu Mikrobiologi yang telah memberikan ijin untuk

penelitian sehingga dapat terselesaikan penyusunan skripsi ini

Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017

Page 11: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI ...repository.ump.ac.id/4616/1/COVER_MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF_FARMASI'17.pdf · isolasi dan identifikasi bakteri penyebab infeksi

11

Penulis menyadari bahwa skripsi ini masih jauh sempurna karena faktor

keterbatasan yang ada dalam diri penulis, oleh sebab itu penulis mengharapkan kritik

dan saran yang membangun dan semoga skripsi ini dapat bermanfaat bagi yang

membacanya.

Purwokerto, Agustus 2017

Mohammad Zulfikar Rashif

Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017

Page 12: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI ...repository.ump.ac.id/4616/1/COVER_MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF_FARMASI'17.pdf · isolasi dan identifikasi bakteri penyebab infeksi

12

Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017

Page 13: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI ...repository.ump.ac.id/4616/1/COVER_MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF_FARMASI'17.pdf · isolasi dan identifikasi bakteri penyebab infeksi

13

`DAFTAR ISI

Halaman .................................................................................................................................. i

Hal Persetujuan ....................................................................................................................... ii

Hal Pengesahan ....................................................................................................................... iii

Pernyataan ............................................................................................................................... iv

Abstrak .................................................................................................................................... v

Abstract ................................................................................................................................... vi

Hal Persembahan .................................................................................................................... vii

Motto ....................................................................................................................................... viii

Kata Pengantar ........................................................................................................................ ix

Riwayat Hidup ........................................................................................................................ x

DAFTAR ISI ........................................................................................................................... xi

DAFTAR TABEL ................................................................................................................... xiii

DAFTAR GAMBAR .............................................................................................................. xiv

DAFTAR LAMPIRAN ........................................................................................................... xv

BAB I. PENDAHULUAN ...................................................................................................... 1

A. Latar Belakang ...................................................................................................... 1

B. Perumusan Masalah .............................................................................................. 3

C. Tujuan Penelitian .................................................................................................. 3

D. Manfaat Penelitian ................................................................................................. 3

BAB II. TINJAUAN PUSTAKA ........................................................................................... 4

A. Sanitasi Lingkungan .............................................................................................. 4

B. Infeksi Nosokomial ............................................................................................... 4

1. Cara Pengendalian Infeksi Nosokomial .......................................................... 5

2. Pembagian Infeksi Nosokomial ...................................................................... 6

a. Infeksi Saluran kemih ............................................................................... 6

b. Infeksi Luka operasi .................................................................................. 6

Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017

Page 14: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI ...repository.ump.ac.id/4616/1/COVER_MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF_FARMASI'17.pdf · isolasi dan identifikasi bakteri penyebab infeksi

14

3. Bakteri yan dapat menyebabkan infeksi nosocomial dengan beberapa cara: . 6

a. Flora tetap atau sementara pada pasien (endogen) ................................... 7

b. Flora dari pasien atau petugas rumah sakit (exogen) ................................ 7

4. Pengelolaan lingkungan dan ruangan rumah sakit dalam upaya pencegahan

infeksi nosokomial .......................................................................................... 8

C. Bakteri ................................................................................................................... 9

1. Ukuran Bakteri ................................................................................................ 10

2. Bentuk Bakteri ................................................................................................ 10

D. Isolasi Bakteri ....................................................................................................... 11

E. Identifikasi Bakteri ................................................................................................ 11

F. Pewarnaan Bakteri ................................................................................................ 12

BAB III METODE PENELITIAN ......................................................................................... 16

A. Rancangan Penelitian ...................................................................................... 16

B. Batasan Variabel Operasional ......................................................................... 16

C. Jalannya Penelitian .......................................................................................... 16

D. Bahan dan Alat yang digunakan ..................................................................... 16

BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN ................................................................................ 22

BAB V KESIMPULAN DAN SARAN ................................................................................. 33

A. Kesimpulan ............................................................................................... 33

B. Saran ......................................................................................................... 33

DAFTAR PUSTAKA ............................................................................... 34

LAMPIRAN .............................................................................................. 36

Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017

Page 15: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI ...repository.ump.ac.id/4616/1/COVER_MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF_FARMASI'17.pdf · isolasi dan identifikasi bakteri penyebab infeksi

15

DAFTAR TABEL

Tabel 1. Hasil Uji Katalase berdasarkan sampel ...................................................... 25

Tabel 2. Hasil Uji Oksidase berdasarkan sampel ..................................................... 27

Tabel 3. Hasil Uji Fermentasi Karbohidrat ............................................................... 28

Tabel 4. Hasil Pewarnaan Gram ................................................................................ 29

Tabel 4. Hasil Identifikasi Bakteri ............................................................................ 30

Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017

Page 16: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI ...repository.ump.ac.id/4616/1/COVER_MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF_FARMASI'17.pdf · isolasi dan identifikasi bakteri penyebab infeksi

16

DAFTAR GAMBAR

Gambar 1. Hasil Isolasi Bakteri ..................................................................................... 23

Gambar 2. Hasil Uji Katalase ........................................................................................ 24

Gambar 3. Hasil Uji Oksidase ....................................................................................... 26

Gambar 4. Hasil Uji Fermentasi Karbohidrat ................................................................ 28

Gambar 5. Hasil Pewarnaan Gram ................................................................................ 29

Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017

Page 17: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI ...repository.ump.ac.id/4616/1/COVER_MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF_FARMASI'17.pdf · isolasi dan identifikasi bakteri penyebab infeksi

17

DAFTAR LAMPIRAN

Lampiran 1. Hasil Isolasi Bakteri ............................................................................. 36

Lampiran 2. Hasil Uji Fermentasi Karbohidrat ........................................................ 37

Lampiran 3. Hasil Uji Katalase ................................................................................. 39

Lampiran 4. Hasil Uji Oksidase ................................................................................ 39

Lampiran 5. Hasil Pewarnaan Gram ......................................................................... 40

Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017