ISPITNA PITANJA IZ BIOHEMIJE 2012/2013Studijski program:Hemičar

I oblast PROTEINI

1. Aminokiseline: standardne aminokiseline; elektrolitička svojstva; polarnost; reaktivnost bočnih ostataka.

2. Peptidna veza: strukturni aspekt; termodinamička stabilnost i kinetička inertnost u vodi 3. Nivoi strukture proteina4. Primarna struktura proteina i informacije sadržane u njoj; 5. Post-translacione modifikacije proteina (enzimske i ne-enzimske); gliko-proteini6. Sekundarne strukture proteina7. Tercijerna struktura (osnovne karakteristike; supersekundarne strukture, domeni)8. Konfromaciona stabilnost proteina: Anfinsenov ogled; definicija konformacione strabilnosti9. Faktori koji doprinose konformacionoj stabilnosti: medjumolekulske sile i hidrofobni efekat

Konformacioni prelazi: uvijanje-razvijanje proteina (kooperativna priroda uvijanja i razvijanja proteina)

10. Faktori koji utiču na strukturu i biološku aktivnost proteina11. Uporedni prikaz struktura i funkcija nekih proteina: kolagen, α- keratin, β-keratin, mioglobin,

lizozim, dehidrogenaze12. Kvaternerna struktura proteina13. Mioglobin i hemoglobin; Uporedni prikaz strukture i aktivnosti 14. Karakteristike i značaj alosternih svojstava za funkciju proteina15. Značaj prostetičnih grupa za funkciju proteina

II oblast ENZIMI

1. Pojam katalize hemijske reakcije (Arenijusova jednačina, teorija prelaznog stanja)2. Osnovne karakteristike enzima kao katalizatora: primeri enzima3. Michaelis-Mentenova kinetika4. Značenje i eksperimentalno odredjivanje osnovnih kinetičkih parametara enzima5. Aktivnost enzima (pojam, internacionalne jedinice - IU; specifična aktivnost;

odredjivanje aktivnosti enzima)6. Efekat pH i temperature na aktivnost enzima7. Inhibicija enzima (osnovne vrste inhibicije; eksperimentalno karakterisnaje inhibicije)8. Vrste reakcija katalizovanih enzimima9. Mehanizmi dejstva enzima - pregled10. Koenzimi: karakteristični primeri i njihov značaj11. Uporedni prikaz strukture i aktivnosti enzima: lizozim- mehanizam kiselo-bazne katalize12. Serin-proteaze (himotripsin), odnos strukture i aktivnosti; mehanizam kovalentne katalize 13. Mehanizam enzimske katalize himotripsina, tripsina i elastaze: sličnosti i razlike.

Divergentna i konvergentna evolucija serin-proteaza14. Značaj i mehanizam aktivacije biološki aktivnih proteina (enzima)15. Izoenzimi; multienzimski kompleksi. Primeri16. Regulacija aktivnosti enzima (značaj, karakteristike i primeri mehanizama regulacije

aktivnosti)

III oblast METABOLIZAM I MOLEKULSKE OSNOVE FIZIOLOŠKIH PROCESA

1. Osnovne karakteristike živih sistema na Zemlji2. Osnovne strukturne karakteristike prokariotskih ćelija3. Osnovne strukturne karakteristike eukariotskih ćelija (animalnih i biljnih): struktura i

funkcija ćelijskih organela4. Metode za biohemijsko ispitivanje ćelija5. Bioenergetika (termodinamički aspekti metaboličkih procesa u ćeliji); Strategija metabolizma6. Osnovne karakteristike kataboličkih i anaboličkih (biosintetičkih) procesa u ćeliji7. ATP i njegov značaj: kuplovane reakcije u metabolizmu8. NADH i NADPH: struktura i funkcija. Koenzim A (CoA)9. Glikoliza: mesto u metabolizmu; osnovne reakcije; regulacija glikolize10. Uključivanje drugih ugljenih hidrata u glikolizu11. Putevi katabolizma piruvata12. Krebs-ov ciklus: opšte karakterisitke i značaj u metabolizmu (amfibolična priroda)13. Reakcije u Krebsovom ciklusu i regulacija ciklusa 14. Oksidativna fosforilacija15. Pentozo-fosfatni put: pojam i osnovne reakcije16. Glukoneogeneza: značaj i osnovne reakcije17. Metabolizam glikogena18. Metabolizam masnih kiselina: katabolizam i biosinteza 19. Metabolizam aminokiselina: osnovne reakcije u katabolizmu; osnovni putevi biosinteze20. Ciklus uree: pojam, značaj i osnovne reakcije 21. Metabolizam purinskih i primidinskih nukleotida: osnovne reakcije i njihov značaj22. Povezanost i regulacija metaboličkih puteva: pojam; karakteristični primeri23. Molekulska osnova dejstva hormona. Transdukcija signala kroz biološke membrane

IV oblast NUKLEINSKE KISELINE I INFORMACIONI PUTEVI

1. Centralna dogma molekularne biologije (priroda i protok informacija u biološkim sistemima) 2. Osnovne karakteristike molekula DNK: dimenzije molekula; hemijska struktura; stabilnost u

vodenoj sredini; organizacija u ćeliji 3. Osnovne karakteristike humanog genoma; genom i proteom 4. Horizontalne i vertikalne interakcije nukleinskih baza 5. Onovne strukturne karakteristike RNK 6. Konformaciona stabilnost nukleinskih kiselina. Konformacioni prelazi DNK: pojam; osnovne

karakteristike; značaj/primena 7. Interakcije DNK sa ligandima: voda, metalni joni, proteini, mali molekuli 8. Replikacija DNK: značaj; opšta svojstva, mehanizam replikacije9. Transkripcija genetskih informacija. Posttranskripcione modifikacije i-RNK10. Sinteza i značaj aminoacil-tRNK u biosintezi proteina11. Biosinteza proteina. Posttranslacione modifikacije proteina,12. Genetski kod - dešifrovanje, opšte karakteristike13. Regulacija ekspresije gena14. Mutacije DNK. Reparacija DNK

Literatura:Predavanja i Materijal sa predavanjaLubert Stryer: Biohemija Lehninger : Principles of BiochemistryKoolman & Roehm: Color Atlas of BiochemistryV.Niketić: Principi strukture i aktivnosti proteinaPraktikum, zajedno sa svim dodatnim materijalima, za vežbe