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日本人基準ゲノム配列(JRGA) 第二版( JG2)利用ガイド

jMorp 日本人多層オミクスリファレンスパネルの 活用について...6 ゲノムのデータの統合 複数検体の デノボアセンブリ 遺伝地図等を用いた

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日本人基準ゲノム配列(JRGA)

第二版(JG2)利用ガイド

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ゲノムバリアント 8.3K

ゲノム配列 JG2

代謝物 25K

タンパク質 500

トップページ

ゲノム配列

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日本人基準ゲノムJG2:日本人男性3人6ゲノムのデータの統合

複数検体のデノボアセンブリ

遺伝地図等を用いた染色体構築

複数アセンブリの統合

多数決によるレアアレル排除

ゲノム配列

PacBio + Bionano + Illumina + Hi-C + Nanopore

JG2上の遺伝子領域定義ファイル(GENCODE34), GRCh37, GRCh38との座標変換用ファイルも提供

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ゲノム配列

表示配列種別拡大/縮小 表示位置(遺伝子名可)

配列+annotationをブラウザで表示JG2.0.0 betaGRCh37GRCh38

ユーザが選択したファイル(vcf, bam)を同軸で表示可能(ToMMoにデータは送られません)

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ゲノム配列

選んだ基準ゲノムの同等領域を同時表示

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