Jurnal Reading
Kolonisasi Streptococcus pneumoniae pada Faring Anak-Anak dan
Remaja di Area Geografis dengan Perlindungan Vaksin Pneumokokus
yang Relatif Terbatas
Disusun oleh:Pritha Fajar AbriantiG99141017Meutia
HalidaG99141018Debora Marga PangestikaG99141019Annisa
PertiwiG99141020Coraega Gena ErnestineG99141021
Pemimbing:dr. Putu Wijya, K, Sp.THT-KL
KEPANITERAAN KLINIK ILMU KESEHATAN THT-KLFAKULTAS KEDOKTERAN
UNIVERSITAS SEBELAS MARETSURAKARTA2015
Kolonisasi Streptococcus pneumoniae pada Faring Anak-Anak dan
Remaja di Area Geografis dengan Perlindungan Vaksin Pneumokokus
yang Relatif Terbatas
Kolonisasi Streptococcus pneumoniae pada faring merupakan awal
transmisi pneumokokus pada manusia, dan awal terjadinya
Pneumococcal Disease (PD). Pemberian pneumococcal conjugate
vaccines (PCVs) untuk bayi secara signifikan dapat menurunkan
kejadian PD pada anak-anak yang divaksinasi, keluarga, dan
masyarakat dengan mengurangi kolonisasi serotipe pneumokokus pada
faring anak-anak, baik yang divaksinasi dan tidak divaksinasi dalam
area geografis yang sama. Akibatnya, mengukur karier dapat
memberikan data tentang perlindungan PCV langsung dan tidak
langsung terhadap serotipe yang spesifik pada subyek. Namun,
perkiraan kemanjuran PCVs terhadap S. pneumoniae belum
terstandarisasi, sehingga menjadi sulit untuk membedakan perbedaan
efikasi terapi dalam metode penelitian yang berbeda. Status karier
setelah pemberian PCV secara signifikan dapat bervariasi tergantung
pada PCV, waktu sejak pemberian vaksin, tingkat infeksi, prevalensi
karier pada populasi umum, dan karakteristik sistem kekebalan tubuh
dari subyek yang divaksinasi.Telah dilaporkan bahwa PCVs paling
efektif adalah vaksin yang mengandung antigen yang sangat
imunogenik dalam jumlah besar, tetapi kemungkinan efek dari semua
PCVs bervariasi tergantung pada wilayah geografis karena diketahui
bahwa jumlah karier secara signifikan lebih tinggi di negara
berkembang daripada di negara maju. Selain itu, prevalensi karier
pasca vaksinasi dapat dipengaruhi oleh karakteristik sistem
kekebalan tubuh dari subyek yang divaksinasi dan tidak divaksinasi.
Pertahanan karier tidak hanya tergantung pada pengembangan antibodi
kapsuler karena dapat pula dipengaruhi oleh mekanisme lain seperti
sel T. Akhirnya, tingkat imunisasi bayi dan durasi imunitas induksi
PCV juga mungkin penting dan, meskipun bukti empiris dari studi
epidemiologi tampaknya menunjukkan bahwa vaksinasi moderat mungkin
cukup untuk mengendalikan tipe vaksin bahkan dalam tingkat
transmisi tinggi, namun tak satu pun dari aspek ini telah
ditetapkan. Bagaimanapun, kedua variabel tersebut penting dalam
menentukan khasiat PCVs jangka panjang dan strategi vaksinasi
terbaik. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengevaluasi
hubungan antara kolonisasi dan status vaksinasi pneumokokus dari
anak-anak dan remaja yang tinggal di Milan, kota besar di Italia
utara di mana heptavalent PCV (PCV7) secara resmi dimasukkan dalam
jadwal imunisasi dan diberikan secara gratis pada tahun 2008, dan
di mana cakupan vaksinasi pneumokokus tetap tidak lebih dari 50%
selama 4 tahun.
BAHAN DAN METODEKoleksi Swab Swab dikumpulkan pada minggu kedua
dan ketiga Desember 2013 dari anak-anak dan remaja yang dipilih
secara acak pada 4 sekolah dasar, 4 sekolah menengah dan 2 sekolah
tinggi. Partisipasi secara sukarela, dengan menggunakan blangko
yang berisi karakteristik penelitian dan meminta informed consent
tertulis dari kedua orang tua dan persetujuan ditandatangani oleh
subyek penelitian, yang dibagikan selama pelajaran. Untuk
memaksimalkan partisipasi, semua guru meyakinkan subyek dengan
memberikan penjelasan rinci dari S. pneumoniae dan penyakit yang
berhubungan, seminggu sebelum dilakukan swabbing tersebut.
Pendaftar harus menyelesaikan kuesioner singkat yang berisi data
demografis dan rincian klinis. Status vaksinasi pneumokokus dinilai
dengan konsultasi dari lembaga vaksinasi resmi yang dikeluarkan
oleh Layanan Vaksinasi Daerah.Jadwal imunisasi pneumokokus yang
direkomendasikan oleh Departemen Kesehatan Italia meliputi 3 dosis
PCV di tahun pertama kehidupan, 2 dosis pada tahun kedua, dan dosis
tunggal setelah tahun kedua. Anak-anak dianggap sepenuhnya
tervaksinasi jika salah satu dari rekomendasi ini telah diikuti
pada waktu pendaftaran, dan dianggap tidak sepenuhnya divaksinasi
jika mereka sudah mulai tetapi tidak menyelesaikan jadwal vaksin.
Kelompok terakhir hanya 1% dari subyek yang terdaftar dan tidak
dibandingkan dengan kelompok sepenuhnya divaksinasi atau anak-anak
yang tidak divaksinasi. Subyek dengan ISPA aktif pada saat
sampling, infeksi pernafasan dengan pengobatan antibiotik dalam 2
minggu sebelumnya, dan orang-orang dengan penyakit yang kronis akan
dikeluarkan dari penelitian.Pengambilan swab dilakukan di ruang
medis masing-masing sekolah pada akhir pelajaran pada 2 hari
berturut-turut oleh beberapa tenaga terlatih dan diawasi oleh
dokter anak. Sampel orofaringeal diperoleh dengan menggunakan kit
ESwab berisi tabung polypropylene screw-cap tube yang penuh dengan
1 mL media Amies cair (Brescia, Copan, Italia). Sampling dilakukan
dengan menekan lidah ke bawah dengan spatula dan swabbing kedua
lengkung tonsil dan nasofaring posterior, tanpa menyentuh sisi
mulut. Semua hasil swab segera diangkut ke laboratorium pusat dan
diproses dalam waktu dua jam.
Identifikasi S. pneumoniaDNA genomik bakteri diekstraksi dari
sampel menggunakan NucliSENS easyMAG sistem ekstraksi otomatis
(BioMerieux, Bagno Ripoli, Florence, Italy), sebuah sampel 250 L
dan generik protokol dimasukan, lalu diuji untuk gen
autolysin-A-encoding (lytA) dan gen wzg (cpsA) terhadap
S.pneumoniae melalui real-time polymerase chain reaction (PCR)
seperti yang akan dijelaskan selanjutnya. Setiap sampel diuji dalam
tiga buah percobaan, dan dikatakan positif jika setidaknya terdapat
2 dari 3 uji tersebut menunjukan keberadaan kedua gen tersebut.
Level deteksi dari uji ini dapat mendeteksi 16 genom. Untuk
meningkatkan sensitivitas pada uji ini tidak berasal dari internal
melainkan dengan mengendalikan eksternal kontrol. Spesimen negatif
dari real-time PCR diuji pula untuk keberadaan dari gen Rnase
P-encoding untuk mengeksklusi inhibisi PCR dan kegagalan ekstraksi
DNA. Semua kasus yang positif dilakukan serotipe menggunakan primen
dan prob yang didesain pada basis dari sekuens GenBank , serotipe
1, 3, 4, 5, 6A, 6B, 7F, 9V, 14, 18C, 19A, 19F dan 23F (sebagai
contoh, vaksin 13-valent pneumococcal conjugate, PCV13), dan
disintesis dengan TIB Molbiol (Genoa, Italia) seperti yang akan
dijelaskan selanjutnya. Dilakukan analisa pre evaluasi menggunakan
perangkat komputer dan dianalisis menggunakan perangkat lunak
Primer-BLAST dan BLAST untuk membandingkan sekuens dengan seluruh
daftar sekuens bakteria dan homosapiens.
Analisis StatsitikMenurut pendapat bahwa sekitar 40% dari
anak-anak menerima vaksinasi pneumokokus dan proporsi dari pembawa
pada kelompok non-vaksinasi sekitar 45%, diperhitungkan bahwa besar
sampel yaitu 800 anak yang telah vaksinasi dan 1200 yang
non-vaksinasi dapat mencapai 80% kekuatan (dengan = 0.05) untuk
mendeteksi odd ratio (OR) yaitu 0.8 (P1 < P2) atau 1.3 ( P1 >
P2). Kelompok tersebut dibandingkan menggunakan 2 atau uji Fisher.
Multivariat OR dan 95% CI diperhitungkan untuk menggambarkan
hubungan dari vaksinasi pneumokokus dan pembawa pneumokokus
menggunakan model regresi logistik multiple pada anak kurang dari
15 tahun dijadikan sebagai kovariat pertama, sehingga usia, jenis
kelamin, etnis, jumlah saudara kandung dan kebiasaan merokok dari
orang tua. Sebagai tambahan, model regresi logistik multiple
dipergunakan untuk memeriksa pada 2 kelompok usia (
