Linux day2010

whoami: Dott. Giuseppe Agrillo

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DSA-LabMNCP/sHPC Beowulf Cluster for e-Scince Virtual Labs 2

http://lmncp.uniparthenope.it/






HPC Beowulf GNU/Linux Cluster;

BlueJeans: DSA-LabMNCP e-sHPC Beowulf Cluster

Applicazioni:

DSA-LabMNCP/e-Science Virtual Lab;

‣ Nonsoloscienza;

Sviluppi futuri.



DSA-LabMNCP/sHPC-Bj;

Applicazioni: DSA-LabMNCP/MeteoMar

Nonsoloscienza;

Sviluppi futuri.

DSA-LabMNCP/sHPC Beowulf

Cluster for e-Scince Virtual Labs 6

Collezione di risorse computazionali connesse mediante una network;

lavorano insieme per risolvere un problema;

Beowulf: è una delle possibili “architetture” con cui si costruisce un cluster low-cost* ;

Ambienti per il Calcolo Parallelo e Distribuito.

Continua...


Server di FrontEnd (FE);

Switch;

workingnode (wn);

Distro GNU/Linux

su tutte le macchine.


Head

Body


Il nodo di frontiera I nodi di calcolo

E’ un Server di tutto o quasi...; Autenticazione (NIS/LDAP Server); Esporta il Filesystem (NFS/ASF/GPFS); Job Scheduler (Torque/PBS); DHCP Server (opzionale ma utile); Software (dipende dagli scopi).

Rappresenta l’aspetto client;

L’autenticazione è remota; Importano il Filesystem distribuito; Esecuzione dei job;


Head

Body

• Cluster di classe TeraFlop; • Supporto per la ricerca scientifica; • Scopi multidiscilinari.

http://www.anl.gov/index.html

Economicamente vantaggioso: • Hardware dai costi contenuti;

• Nessun costo aggiuntivo dovuto alle licenze software;

• Ottimo rapporto costo/prestazione.

Aumento delle performance;

Ambiente di calcolo parallelo e distribuito;

Elevata Scalabilità;

Migliore utilizzo delle risorse hardware.


HPC Beowulf/GNU+Linux Cluster;


Applicazioni: DSA-LabMNCP/MeteoMar;

Nonsoloscienza;

Sviluppi futuri.



N.1 FrontEnd N.1 LoginNode/job-

submitting;

5 Switch 3Com 24p/1000 Mb/s;

36 workingnode;

OS: GNU/Linux


2 Servicenodes Features: CPU Intel Dual Core 2,6 GHz; 2 GB RAM; 2 Schede di rete 1000 Mb/s.

36 Workingnode: CPU Intel Dual Core 2,6 GHz 1 GB RAM 1 Scheda di rete 1000 Mb/s Switch : 3Com 24 porte 1000 Mb/s.



HPC Beowulf/GNU+Linux Cluster;


Applicazioni: DSA-LabMNCP/e-Science Virtual Lab.; Nonsoloscienza; Sviluppi futuri;


http://dsa.uniparthenope.it/meteo

WRF (produzione);

CHIMERE (produzione);

ROMS (testing);

WW3 (testing);



e-Science

Computer Science

Environmental Science


http://www.wrf-model.org/

http://www.lmd.polytechnique.fr/chimere/

http://www.myroms.org/

http://polar.ncep.noaa.gov/waves/wavewatch/wavewatch.html




Soluzione numerica di Eq. Differenziali;

U,V,W e t + parametro termodinamico;

Simula l’evoluzione dell’atmosfera;

Risoluzione elevata Condizioni atmosferiche + vicino al reale;

Limiti nella capacità e disponibilità delle risorse computazionali.





Modelli Numerici: • GCM, Global Circulation Model

(termo-dinamica atmosferica su larga scala, cond. iniziali);

• LAM, Limited Area Model (termo-dinamica su regioni limitate, cond. Iniziali e al-contorno, dipendono dai GCM ).




http://www.wrf-model.org Weather Research & Forecasting Model;

Modello numerico di previsione su Mesoscala; Scopi:

• Supporto alla Ricerca scientifica; • Produzione di previsioni meteo;

Partnership: • National Center for Atmospheric Research (NCAR); • National Oceanic and Atmospheric Administration (NOAA) • National Centers for Environmental Prediction (NCEP) • Air Force Weather Agency (AFWA)















• U,V: componenti zonali del vettore vento;

• 𝜭 Parametro

Termodinamico



1 way nesting: dal dominio esterno al dominio

interno

2 way nesting: dal dominio esterno a quello

interno e viceversa!





Ricercatori;

Dottorandi;

Collaboratori;

Laureandi;

Tirocinanti; Studenti.



HPC Ferrari: Fluid aerodynamic simulation



In arrivo… RedJeans HPC/GPU Cluster



Applicazioni: DSA-LabMNCP/Meteo;

Nonsoloscienza.

Sviluppi futuri.



Installazione BJ e GJ con GNU/Linux Ubuntu 10.04 64bit (in corso d’opera);

Cloud Computing testing e deployment del neowoulf:

BlueJeans OpenNebula

GJ Eucalyptus

Deployment «in produzione» di gVirtus (HPC+GPU).



Obiettivo: • Elaborazione, gestione,

analisi e la visualizzazione di dati multi-dimensionali;

Applicazioni multidisciplinari: • Modellistica ambientale;

• Energie Alternative;

• Indagini socio-economiche

Ecosostenibile: • Alimentazione;

• Refrigeramento.


Obiettivo: • Elaborazione, gestione,

analisi e la visualizzazione di dati multi-dimensionali;

Applicazioni multidisciplinari: • Modellistica ambientale;

• Energie Alternative;

• Indagini socio-economiche

Ecosostenibile: • Alimentazione;

• Refrigeramento.

http://dsa.uniparthenope.it/dsa


http://dsa.uniparthenope.it/lmncp

http://dsa.uniparthenope.it/lmncp/wiki

http://osl.uniparthenope.it

http://www.gnu.org

http://www.linux.org

http://www.beowulf.org

http://www.top500.org


http://www.hpcwire.com

http://www.noaa.gov

http://www.ncep.noaa.gov

http://www.wrf-model.org

http://www.e4company.com

http://www.nvidia.come

Cudazone: http://www.nvidia.com/object/cuda_home_new.html





http://dsa.uniparthenope.it/lmncp

http://dsa.uniparthenope.it/lmncp/wiki

http://osl.uniparthenope.it/

http://www.gnu.org/

http://www.linux.org/

http://www.beowulf.org/

http://www.top500.org/

http://www.hpcwire.com/

http://www.noaa.gov/

http://www.ncep.noaa.gov/






http://www.e4company.com/

http://www.e4company.com/

http://www.nvidia.come/

http://www.nvidia.com/object/cuda_home_new.html



# shutdown –h now


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