Materi - Survival Analisis

8/16/2019 Materi - Survival Analisis

http://slidepdf.com/reader/full/materi-survival-analisis 1/61





DefnisiDefnisi

Analisis survival adalah suatu metode

yang berhubungan dengan waktu, mulai

dari time origin atau start pointtime origin atau start point sampai

dengan terjadinya suatu kejadianterjadinya suatu kejadian

khusus atau endkhusus atau end point point .

Dengan kata lain, analisis survivalDengan kata lain, analisis survivalmemerlukan data yang merupakanmemerlukan data yang merupakanwaktuwaktu survival dari suatu individusurvival dari suatu individu



4

Survival Analysis: Terms

Time-to-event: The time from entry into a

study until a subject has a particular outcome

Censoring: ubjects are said to be censoredif they are lostlost to follow up or drop outdrop out of

the study, or if the study ends before theyif the study ends before they

die or have an outcome of interest.die or have an outcome of interest. They

are counted as alive or disease-free for thetime they were enrolled in the study!



"

Survival Analysis?

Merupakan suatu metodeMerupakan suatu metode

statistik untuk menganalisastatistik untuk menganalisa

data longitudinaldata longitudinal padapada

terjadinya suatu kejadianterjadinya suatu kejadian((event)event)

Metode ini dapatMetode ini dapatmengakomodir data darimengakomodir data dari RCTRCT maupunmaupun kohort studikohort studi



Randomized Clinical Trial

(RCT)

Target

population

Intervention

Control

Disease

Disease-free

Disease

Disease-free

TIME

#andom

assignment$isease-free,

at-risk cohort



Target

population

Treatment

Control

Cured

Not cured

Cured

Not cured

TIME

#andom

assignment%atient

population


(RCT)



Target

population

Treatment

Control

Dead

Alive

Dead

Alive

TIME

#andom

assignment%atient

population


(RCT)



Cohort study

(prospective/retrospective)

Target

population

Exposed

Unexposed

Disease

Disease-free

Disease

Disease-free

TIME

$isease-free

cohort



Tiga unsur dalam penentuanwatu survival

!alam menentuan watu survival" terdapattiga elemen yang harus diperhatian yaitu

a# Time origin or starting point (titik awal)Time origin or starting point (titik awal)

adalah waktu dimulainya suatu penelitian.$# Ending event of interest (kejadian akhir)Ending event of interest (kejadian akhir)

adalah kejadian yang menjadi inti dari penelitian

c# Measurement scale for the passage ofMeasurement scale for the passage oftimetime (skala ukuran untuk berlalunya waktu).



Darimana dataDarimana data

diperoleh?diperoleh?!alam $idang esehatan data inidiperoleh dari suatu pengamatanterhadap seelompo atau

$e$erapa elompo individu dandalam hal ini adalah pasien" yangdiamati dan dicatat watu ter%adinya

egagalan dari setiap individu(Collet" &'')#



!arimana data

diperoleh?egagalan yang dimasudanantara lain adalah

& kematiankematian arena penyaittertentu"

& keadaan sakit yang terulangkeadaan sakit yang terulangem$ali setelah pengo$atan

& atau munculnya penyakit barumunculnya penyakit baru#



Apabila kegagalan yang diamati adalahApabila kegagalan yang diamati adalahterjadinya kematian pada pasien maka waktuterjadinya kematian pada pasien maka waktu

survival yang dicatat antara lain sebagaisurvival yang dicatat antara lain sebagaiberikut :berikut :

a. Selisih waktu mulai dilakukannyaa. Selisih waktu mulai dilakukannyapengamatan sampai terjadinya kematian danpengamatan sampai terjadinya kematian dan

data tersebut termasuk data tidak terpotongdata tersebut termasuk data tidak terpotong(uncensored data(uncensored data).).

b. Jika waktu kematiannya tidak diketahuib. Jika waktu kematiannya tidak diketahui

maka memakai selisih waktu mulaimaka memakai selisih waktu mulaidilakukannya pengamatan sampai waktudilakukannya pengamatan sampai waktuterakhir penelitian dan data tersebutterakhir penelitian dan data tersebuttermasuk data terpotongtermasuk data terpotong (censored data).(censored data).



*enentuan +atu Survival Co, dan -aes (&'.)

Tiga hal yang harus diperhatikan dalam

menentukan waktu survival secara tepat, yaitusebagai berikut :

a! 'aktu awal tidak ambigu yang berarti tidakada dua pengertian atau lebih!

b! $efinisi terjadinya kegagalan secara

keseluruhan harus jelas!c! kala waktu sebagai satuan pengukuran

harus jelas



apan penggunaan SA ?

Penggunaan analisis survival padaPenggunaan analisis survival pada

keadaan dimana aktor !keadaan dimana aktor !kapankapanterjadinya suatu kejadianter jadinya suatu kejadian""

lebih penting daripada !apakah suatulebih penting daripada !apakah suatukejadian terjadi atau tidak"#kejadian terjadi atau tidak"#

Atau dengan kata lain kita memakai Atau dengan kata lain kita memakaianalisis survival ila kita peduli dengananalisis survival ila kita peduli dengan! ! "aktu terjadinya suatu"aktu terjadinya suatukejadiankejadian#$#$



,ample: *atient data

()

(

*

+

4

"

)

(. (" *... *.." )/*..0

!arotidectomy patient medical records

% a t i e n t

ead 1$

" 2ost to follow up a u d i t





,ample: Survival !ata

(0

(

*

+

4

"

)

. " (. ("

!arotidectomy patient survival data

% a t i e n t

"

$ead 1$

3ears post operation




(

(

*

+

4

"

)

. " (. ("


% a t i e n t

"

$ead 1$





*.

(

*

+

4

"

)

. " (. ("


% a t i e n t

"

$ead 1$


censored

censored

issing data




*(

(

*

+

4

"

)

. " (. ("


% a t i e n t

"

$ead 1$


censored

censored

issing data

censored

censored

censored




**

(

*

+

4

"

)

. " (. ("


% a t i e n t

"

$ead 1$


censored

censored

censored

issing data

censored

$ata sensor digunakan untuk

urvival Analysis




*+

(

*

+

4

"

)

. " (. ("


% a t i e n t

"

$ead 1$


censored

censored

censored

issing data

censored

issing data dapat mempengaruhi hasil analisa,

diperlukan manajemen penelitian yang ketat!



*4



*"

RCT: +omen0s 1ealth 2nitiative( JAMA" 344&)

On hormones

On placeboCumulative

incidence



*)

+12 and low56at diet7

Control

o!-fat diet

!rentice #. $. et al. JA%A &''&*+:&*,-&.





*0

8engapa menggunaan

SA?(! engapa tidak membandingkan meantime-to-event antara grup denganmenggunakan t-test atau linear

regression5 engabaikan 671#879

engabaikan 'AT;

6<A$8A7

*! engapa tidak membandingkanproporsi antara kejadian-kejadian

dalam grup dengan menggunakanrisk/odds ratios atau logisticregression5





Terminologi *enting !alam

SA(! applan eier

*! urvival #ate

+! edian urvival

4! Asumsi %roportional =a>ard (Samadengan Asumsi ormalitas dalam/ji !arametrik)

"! =a>ard #asio ?=#@)! 6vent

! ensor





9enis penyensoran

Ada T89A jenis penyensoran yaitu

(!ensor kanan (right censoring),

2.Sensor kiri (left censoring),3.Sensor selang (interval censoring)



9ensi penyensoran




terjadi jika individu yang diamatimasih tetap hidup pada saat

waktu yang telah ditentukan





9enis penyensoran




terjadi jika semua informasi yang

ingin diketahui dari seorang

individu telah dapat diperoleh

pada awal studi



+)

9enis penyensoran

Ada T89A jenis penyensoran yaitu(! ensor kanan (right censoring),

2.Sensor kiri (left censoring),

Time to relapse

Time to event is less than observed t +

3.Sensor selang (interval censoring)

urgery

.

#ecurrence

+ month eBamt



9enis penyensoran



2.Sensor kiri (left censoring),3.Sensor selang (interval

censoring)

jika informasi yang dibutuhkantelah dapat diketahui pada kejadian

peristiwa didalam selang

pengamatan







4.

2ntroduction to aplan5

8eier7on-parametric estimate of the survival

function:

imply, the empirical probability of

surviving past certain times in thesample ?taking into account censoring@!



4(

2ntroduction to aplan5

8eier 7on-parametric estimate of the survival

function!

Commonly used to describe survivorship

of study population/s! Commonly used to compare two study

populations!

8ntuitive graphical presentation!



Beginning of study End of study Time in months

Subject B

Subject A

Subject C

Subject D

Subject E

Survival !ata (right5censored)

1. subject E dies at 4

monthsX



1!

Time in months

Corresponding aplan58eier Curve

"#obabi$ity ofsu#%i%ing to 4

months is 1! &

'('

)#action

su#%i%ing thisdeath & 4('

Subject E dies at 4

months




Subject B

Subject A

Subject C

Subject D

Subject E

Survival !ata

*. subject A

d#o+s out afte#

, months


monthsX

-. subject C dies

at monthsX



1!

Time in months


subject C dies at

months

)#action

su#%i%ing this

death & *(-




Subject B

Subject A

Subject C

Subject D

Subject E

Survival !ata

*. subject A

d#o+s out afte#

, months

4. Subjects B

and D su#%i%e

fo# the /ho$eyea#0$ong

study +e#iod


monthsX

-. subject C dies

at monthsX



4

1!

Time in months


#ule from probability theory:

!(A01)2!(A)3!(1) if A and 1 independent

4n survival analysis: intervals are defined by failures (& intervals leading to failures here).

!(surviving intervals 5 and &)2!(surviving interval 5)3!(surviving interval &)

"#oduct $imit estimate of su#%i%a$ &

"su#%i%ing inte#%a$ 1(at0#is2 u+ to fai$u#e 13

"su#%i%ing inte#%a$ *(at0#is2 u+ to fai$u#e *3

& 4(' *(-& .'---



40

9enis penyensoran

Ada T89A jenis penyensoran yaitu(! ensor kanan (right censoring),

2. Sensor kiri (left censoring),

3.Sensor selang (interval censoring)Time to relapse

+ t )

ree of disease

+ month eBam

urgery

. t

#ecurrence

) month eBam



3A79 $A%AT $8782A8 $A#8

;#DA A%2A7 686#



SR;2;A< RAT

urvival rate untuk waktu tertentu, dapat

diketahui dengan dengan menarik garis

vertikal dari waktu tertentu pada sumbu

B sampai dengan memotong garissurvival



SR;2;A< RAT

urvival rate untuk waktu tertentu, dapat

diketahui dengan dengan menarik garis

vertikal dari waktu tertentu pada sumbu

B sampai dengan memotong garissurvival

.!.

.!*

.!4

.!)

.!0

(!.

. *. 4. ). 0. (.. (*.

6aplan %eier estimate

6 s t i m a t e d s u r v i v o r f u n c t i o n

onths

urvival rate pada bulan ke 4.

adalah E



8edian Survival

edian survival adalah waktu dimana

".E subyek mengalami event!

edian survival dapat diketahui dengan

menarik garis hori>ontal dari sumbu ypada titik ".E sampai dengan

memotong garis survival

anfaatnya: membandingkansurvival antar kelompok



8edian Survival

edian survival adalah waktu dimana

".E subyek mengalami event!

edian survival dapat diketahui dengan

menarik garis hori>ontal dari sumbu ypada titik ".E sampai dengan

memotong garis survival . ! .

.

. ! *

"

. ! "

.

. ! ,

"

(

! . .

. *. 4. ). 0. (..

analysis time

group F . group F (

aplan-eier survival estimates

%ada kelompok garis biru, median

survival adalah time ke "., sedangkan

kelompok garis coklat, median

survivalnya adalah pada time ke 0



Asumsi *roporsional

1azard %roporsional ha>ard artinya

Gperbandingan kecepatan terjadinya

suatu kejadian antar kelompok setiap

saat adalah sama! urva yang memenuhi asumsi %=

adalah bila garis survival antar

kelompok tidak saling berpotongan! . ! .

.

. ! *

"

. ! "

.

. ! ,

"

( ! .

.

. *. 4. ). 0. (..analysis time

group F . group F (

aplan-eier survival estimates



1azard Ratio

8nsiden rate F ha>ard

=a>ard ratio : membandingkan dua

ha>ard!

Catatan: perbandingan dua insiden

disebut sebagai relatif risk ?##@!



7bat !asien Status !ersontime(tahun)

4nsidens 8otalpersontime

4nsiden#ate

1bat A ( eninggal ) 4/"F0.E )H)H)H)H()F 4.

4/4.F.!(

* eninggal )

+ eninggal )

4 eninggal )

" =idup ()

1bat I ( eninggal 4 4/"F0.E 4H4H4H)HF*"

4/*"F.!()

* eninggal 4

+ eninggal 4

4 eninggal )

" =idup

8nterpretasi:

8nsiden #ate 1bat I lebih besar

dari 1bat A kematian lebih cepat

pada kelompok dengan obat I



4nsidens !erbandingan4nsidens(#esiko #elatif)

4nsidens #ate(9aard)

!erbandingan4nsidens #ate(9aard #atio)

1bat A .!0 .!0/.!0 F ( .!( ?I $ibandingkan A@

.!()/.!(F (!)

?A dibandingkan I@.!(/.!() F .!)*"

1bat I .!0 .!()

8nterpretasi:

=# F (!) setiap saat, kelompok I lebih cepat(!) kali untuk terjadi kematian dibandingkan

kelompok A!

yarat proportional ha>ard ?%=@ harus

dipenuhi



TA=A% 6$;A %#AT8;



Tu%uan pem$ela%aran

(! emahami cara entri data untuk

analisis survival

*! elakukan analisa survival secara:

a! ;nivariat :

b! Iivariat :

c! ultivariat ?tingkat lanjut@

C t i ! t t



Cara ntri !ata untuAnalisis Survival

;ariabel <ontoh variabel 6ode = /nit

Alternatif ( Alternatif *

tatus ematian ( F event ?meninggal@. F sensor

( F event ?meninggal@. F sensor

%erson time 'aktu survival is: bulan is: bulan

Dariabel bebas

variabel numerik

;mur Tahun Tahun

Dariabel bebas

kategorik, dikotomi

%erilaku minumalkohol

( F peminum alkohol* F tidak minum alkohol

( F tidak minumalkohol* F peminum alkohol

Dariabel bebas

kategorik polikotom

Tingkatpendidikan

( F pendidikan tinggi*! %endidikan sedang+ F pendidikan rendah

( F pendidikanrendah*! %endidikan sedang+ F pendidikan tinggi



Documents

Materi - Survival Analisis