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METODOLOGIA DE COLETA DE PUBLICAÇÕES CIENTÍFICAS PELA FIOCRUZ
Para recuperação das publicações científicas da Fiocruz, o Observatório em
Ciência, Tecnologia e Inovação em Saúde desenvolveu uma metodologia própria e
específica para esta análise. Esta foi dividida em quatro etapas, conforme abaixo:
1) Seleção das bases de dados e elaboração da estratégia de
busca
Para recuperação das publicações científicas foram utilizadas três bases de
dados disponíveis no Portal Capes: Web of Science (Clarivate Analytics), Scopus
(Elsevier) e SciELO. A estratégia usada em cada uma das bases foi a seguinte:
Web of Science (WoS): a busca foi feita em campo específico para
recuperação de publicações através da instituição de afiliação do autor “OG=
Organização Consolidada”, disponível na seção de busca avançada. Neste campo
buscou-se pelos termos “Center for Technological Development in Health (CDTS) OR
Fundação Oswaldo Cruz”. Além dessa lista consolidada pela WoS, utilizou-se uma
lista de referência já previamente compilada pelo Observatório. Estas foram inseridas
no campo “OO=Organização”. No anexo 1 são detalhados todos os termos.
Scopus: a busca foi feita no campo de afiliação dos autores (AFFIL). Neste
utilizou-se a lista de referência já previamente compilada pelo Observatório (a mesma
utilizada na WoS) e a lista consolidada de organizações disponível na WoS.
SciELO: a busca foi feita no campo “OG=Organização”, utilizando-se a lista
consolidada de organizações disponível na WoS e a lista de referência compilada
pelo Observatório.
É importante salientar que a lista de palavras-chaves relativas à instituição foi
redundante no intuito de aumentar a sensibilidade da estratégia de busca.
2
2) Download dos registros, importação para o software e
validação da estratégia de busca
Uma primeira coleta foi realizada no ano passado, referente ao período de
2012 a maio de 2018. Esta coleta foi mantida e apenas uma nova busca para
recuperar as publicações científicas do ano de 2010, 2011 e 2018 completo foi feita.
As publicações recuperadas em cada uma das três bases, das duas coletas,
foram inseridas no software Vantage Point® utilizando filtros específicos, e reunidas
por meio da função “data fusion”. Após junção das três bases de todo o período 2010-
2018, o universo de análise continha 26.465 publicações.
3) Eliminação de duplicatas e harmonização dos registros
Para organização do banco de dados, foi necessário remover as publicações
em duplicidade. Inicialmente, as duplicatas foram removidas utilizando-se como
critério os campos DOI, título, revista e ano. Registros com esses quatro campos
idênticos foram removidos e apenas um registro foi mantido.
Observou-se que havia diferenças na padronização dos campos indexados
nas três bases, isso porque campos como instituições e agência de fomento são ato-
preenchíveis e não possuem um padrão formal, sendo assim uma harmonização
manual para padronização destes campos foi feita. Foram harmonizados os seguintes
campos:
- Títulos das publicações (padronização do idioma e forma de escrita);
- País de filiação dos autores (traduzido para o idioma português);
- Agências de Fomento (padronização)
3
- Key words dos autores (agrupamento das palavras iguais)
- Instituição (padronização dos diferentes nomes atribuídos a uma mesma
instituição).
O campo instituição foi o mais complexo, uma vez que as formas de
denominar uma mesma instituição pode variar. Além dos algoritmos que o software
utiliza para grupamento, foi feita uma harmonização manual das instituições contidas
no banco de dados, para que fosse possível a identificação das colaborações e
parcerias da Fiocruz. Inicialmente foram identificadas 62.323 instituições e ao final da
harmonização, foram incluídas 11.413 na análise.
4) Limpeza final e geração dos indicadores
A harmonização das publicações foi finalizada com a exclusão de publicações
que não possuíam pelo menos um autor afiliado à Fiocruz. Como a estratégia de
busca utilizada teve caráter abrangente, havia a possibilidade de inclusão de
instituições que não faziam parte do universo de análise. Ao final, foram consideradas
18.832 publicações referente ao período de 2010 a 2018, estas são apresentadas no
dashboard.
4
ANEXO 1
Lista de referência compilada pelo Observatório
(“Aggeu Magalhaes” OR “Bio Manguinhos” OR “Biomanguinhos” OR “Bio-
Manguinhos” OR “Biomanguinlios” OR “Carlos Chagas” OR “Centro de Criação de
Animais de Laboratório” OR “Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde” OR
“Ctr Desenvolvimento Tecnol Saude” OR “Escola Nacional de Saude Publica” OR
“Escola Nacl Salude Publ” OR “Escola Nacl Saude Publ” OR “Escola Nacl Saude
Publica” OR “Escola Natl Saude Publ” OR “Evandro Chagas” OR “Evandro Chagoas”
OR “Far Manguinhos” OR “Farmanguinhos” OR “Fernades Figueira” OR “Fernandes
Figueira” OR “FICORUZ” OR “FIO CRUZ” OR “FIO-CRUZ” “Fiocntz” OR FIOCUZ OR
“Fundação Oswaldo Cruz” OR “Fiocruz” OR “Fundacao Fiocruz” OR “FlOCRUZ” OR
“Goncalo Moniz” OR “Gonçalo Moniz” OR “Helio Fraga” OR “Inst Oswald Cruz” OR
“Inst Oswaldo Fdn” OR “Inst Tecnol Imunobiol” OR “Instituto de Comunicação e
Informação Científica e Tecnológica em Saúde” OR “Instituto de Ciência e Tecnologia
em Biomodelos” OR “Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos” OR “Instituto
Nacional de Controle de Qualidade em Saúde” OR “Joaquim Venancio” OR “Leonidas
& Maria Deane” OR “Leonidas & Maria Deane” OR “Leônidas e Maria Deane” OR
“Leonidas Maria Deane” OR “Osaldo Cruz” OR “Osawaldo Cruz” OR “Osqaldo Cruz”
OR “Osvaldo Cruz” OR “Osvaldo Cruz” OR “Oswald Cruz” OR “Oswald Cruz” OR
“Oswald Cruz” OR “OSWALD CRUZ” OR “Oswaldo” OR “Oswaldo Crus” OR
“OSWALDO CRUS” OR “Oswaldo Crusz” OR “Oswaldo Cruz” OR “Oswaldo Curz” OR
“OSWALDO CURZ” OR “Oswalo Cruz” OR “OSWCRU” OR “Owaldo Cruz” OR
“Owaldo Cruz” OR “Programa Comp Cient Qswald Cruz” OR “Rene Rachou” OR
“René Rachou” OR “Sergio Arouca” OR INCQS OR CECAL OR CPqAM OR CPqGM
OR CPqLMD OR CPqRR OR CESTEH OR CPqRR)
ANEXO 2
Lista de Siglas
ABRRI Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran
ACCA Asociación para la Conservación de la Cuenca Amazónica
AECID Agência Espanhola de Cooperação Internacional para o
Desenvolvimento
AFIP Associação Fundo de Incentivo à Pesquisa
AFSSAPS Agence Française de Sécurité Sanitaire des Produits de Santé
AFSSET Agence française de sécurité sanitaire de l'environnement et du travail
AMRF Advanced Medical Research Foundation
BDFFP Biological Dynamics of Forest Fragments Project
BMBF Bundesministerium für Bildung und Forschung
BRC Imperial NIHR Biomedical Research Centre
CABI Centre for Agriculture and Biosciences International England
CAPES Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
CBMSO Centro de Biología Molecular Severo Ochoa Madrid
CBPF Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas
CCBR CCBR Brasil Centro de Pesquisas e Análises Clínicas
CCCI Centre for Chronic Conditions and Injuries
CDC Centers for Disease Control and Prevention
CDI Children's Discovery and Innovation Institute
CDMPR Congresionally Directed Medical Research Programs
CEITEC Central European Institute of Technology
CEPEM Centro de Pesquisa em Medicina Tropical de Rondonia
CESAT Centro de Referência em Saúde do Trabalhador da Bahia
CETEM Centro de Tecnologia Mineral
CETENE Centro de Tecnologias Estratégicas do Nordeste
CETESB Companhia Ambiental do Estado de São Paulo
6
CFDA Council of Fashion Designers of America
CGF Canadian Geological Foundation
CIBERBBN CIBER de Bioingeniería
CIBERDEM Centro de Investigación Biomédica en Diabetes y Enfermedades
Metabólicas Asociadas
CIBEREHD Centro de Investigacion en Red en enfermedades hepáticas y
digestivas
CIBERER Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Raras
Madrid
CIBERES Centro de Investigación Biomedica en Red
CIBERESP Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y
Salud Pública
CIBERNED Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades
Neurodegenerativas
CIBEROBN Centro de Investigación Biomédica en Red de la Fisiopatología de
la Obesidad y la Nutrición
CIBERSAM Centro de Investigación Biomédica en Red Salud Mental
CIBIO Centro de Investigacao em Biodiversidade e Recursos Genéticos
CIEE Centro Integrado Empresa Escola
CIHR Canadian Institutes of Health Research
CIRAD French Agricultural Research Centre for International Development
CIRC Centre International de Recherche sur le Cancer
CMRI Children's Medical Research Institute
CNAG Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica
CNEN Comissão Nacional de Energia Nuclear Comissão Nacional de Energia
Nuclear
CNPEM Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais Campinas
CNPq Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
7
COFORD National Council for Forest Research and Development
CONAE Comisión Nacional de Actividades Espaciales
CRCL Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon
CRG Centre for Genomic Regulation Barcelona
CSIC Conselho Superior de Investigações Científicas
CSIR Council of Scientific and Industrial Research
CSS Mendel Institute
CSTI Council for Science
CWRU Case Western Reserve University
DCEG Division of Cancer Epidemiology and Genetics
DFAT Department of Foreign Affairs and Trade
DFID Department for International Development
DOST Department of Science and Technology
DSIT Department of Science
EDCTP European & Developing Countries Clinical Trials Partnership
EGU European Geosciences Union
EPSRC Engineering and Physical Sciences Research Council
ERDF European Regional Development Fund
ERS European Respiratory Society
FACEPE Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de
Pernambuco
FAPAC Fundação de Amparo a pesquisa no estado do Acre
FAPDF Fundação de Apoio à Pesquisa do Distrito Federal
FAPEAL Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas
FAPEAM Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas
FAPEG Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás
FAPEMA Fundação de Amparo à Pesquisa e ao Desenvolvimento Científico e
Tecnológico do Maranhão
8
FAPEMAT Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Mato Grosso
FAPEMIG Fundação de Amparo à Pesquisa de Minas Gerais
FAPEPE Fundação de Apoio ao Ensino, Pesquisa e Extensão de Itajubá
FAPEPI Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Piauí
FAPERGS Fundação de Amparo à Pesquisa do Rio Grande do Sul
FAPERJ Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro
FAPERN Fundação de Amparo à Pesquisa do Rio Grande do Norte
FAPERO Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Rondônia
FAPERP Fundação de Apoio à Pesquisa e Extensão de São Jose do Rio
Preto
FAPES Fundação Estadual de Amparo à Pesquisa do Estado do Espírito
Santo
FAPESB Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia
FAPESC Fundação de Amparo à Pesquisa e Inovação do Estado de Santa
Catarina
FAPESP Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
FAPESPA Fundação Amazônia Paraense de Amparo à Pesquisa
FAPESPA Fundação Amazônia de Amparo a Estudos e Pesquisas
FAPESQ Fundação de Apoio à Pesquisa do Estado da Paraíba
FAPITEC Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Sergipe
FCT Fundação para a Ciência e a Tecnologia
FENORTE Fundação Estadual Norte Fluminense
FGTB Global Fund Tuberculosis Brasil
FIC Fogarty International Center
FINATEC Fundação de Empreendimentos Científicos e Tecnológicos
FINEP Financiadora de Estudos e Projetos
FIPE Fundação Instituto de Pesquisas Econômicas
FNI Field Neurosciences Institute
9
FNIH Foundation for the National Institutes of Health
FRISBI French Infrastructure for Integrated Structural Biology
FRQS Fonds de Recherche du Québec Santé
FUNDECT Fundação de Apoio ao Desenvolvimento do Ensino
FUNTAC Fundação de Tecnologia do Estado do Acre
FUNTTEL Fundo para o Desenvolvimento Tecnológico das Telecomunicações
GCRC General Clinical Research Center
HCPA Hospital de Clínicas de Porto Alegre
I.E.S. Instituto de Enseñanza Secundaria
i3S Instituto de Investigação e Inovação em Saúde
IATS Instituto de Avaliação de Tecnologia em Saúde
IBAMA Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Naturais
Renováveis
IBGE Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística
IBioBA MPSP
IBMP Instituto de Biologia Molecular do Paraná
IBNnet Instituto Brasileiro de NeuroCiências
ICESP Instituto do Câncer do Estado de São Paulo
ICGEB International Centre for Genetic Engineering
ICMBio Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade
ICMR Indian Council of Medical Research
ICTS Institute of Clinical and Translational Sciences
IDCR International Development Research Centre
IDSOG Infectious Diseases Society for Obstetrics and Gynecology
IEAPM Instituto de Estudos do Mar Almirante Paulo Moreira
IEN Nuclear Engineering Instituteian Nuclear Energy Commission
IEPA Instituto de Pesquisas Científicas e Tecnológicas Do Amapá
IFAC Instituto Federal de Educação
10
IFAL Instituto Federal de Alagoas
IFAM Instituto Federal do Amazonas
IFARHU Instituto para la Formacion de Recursos Humanos
IFBA Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia da Bahia
IFCE Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Ceará
IFEPE Instituto Federal de Educação Pernambuco
IFES Instituto Federal do Espírito Santo
IFGO Instituto Federal de Educação Goiás
IFMA Instituto Federal de Educação Ciência e Tecnologia do Maranhão
IFMG Instituto Federal de Ciência e Tecnologia de Minas Gerais
IFMS Instituto Federal de Mato Grosso do Sul
IFOM International Foundations of Medicine
IFPE Instituto Federal de Educação
IFPI Instituto Federal de Pernambuco
IFPR Instituto Federal do Paraná
IFRO Instituto Federal de Rondônia
IFRS Instituto Federal do Rio Grande do Sul
IICAR CONICET Instituto de Ciências Agrarias de Rosario
IINFACTS Institute of Research and Advanced Training in Health Sciences and
Technologies
IME Instituto Militar de Engenharia Rio de Janeiro
IMIP Instituto de Medicina Integral Professor Fernando Figueira Pernambuco
IMPA Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia
INAGEMP Instituto Nacional de Genética Médica Populacional
INAU National Institute of Science and Technology in Wetlands
INBEQMeDI Instituto Nacional de Biotecnologia Estrutural e Química
Medicinal em Doenças Infecciosas
INC Instituto Nacional de Cardiologia
11
INCA Instituto Nacional de Câncer
INEA Instituto Estadual Do Ambiente
INPE Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais
INPer Istituto Nacional de Perinatología
INPI Instituto Nacional da Propriedade Industrial
INRA Institut National de la Recherche Agronomique
INSERM Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale
INSS Instituto Nacional do Seguro Social
IPN Instituto Politécnico Nacional
IPPH Institute of Population and Public Health
ISMMS Icahn School of Medicine at Mount Sinai
ISPUP Instituto de Saúde Pública
ITMAT Institute for Translational Medicine and Therapeutics
IVIC Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas
KFF Kettering Family Foundation
KRIBB Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology
LICR Ludwig Institute of Cancer Research
LNLS Laboratório Nacional de Luz Síncrotron
MASSIVE Multi:modal Australian ScienceS Imaging and Visualisation
Environment
MCT Ministério da Ciência e Tecnologia
MDEIE Ministère du Développement Économique de l'Innovation et de
l'Exportation
MECD Ministerio de Educación
MEST Ministry of Education
MRC Medical Research Council
MVZ Museum of Vertebrate Zoology
NBCR National Biomedical Computation Resource
12
NCMRR National Center for Medical Rehabilitation Research
NHRI National Health Research Institutes
NIAAA National Institute On Alcohol Abuse And Alcoholism
NIDA Architectural League of New York National Institute on Drug Abuse
NIDCR National Institute of Dental and Craniofacial Research
NIIST National Institute for Interdisciplinary Science and Technology
NINS National Institutes of Natural Sciences
NORAD Norwegian Agency for Development Cooperation
NSBRI National Space Biomedical Research Institute
NSERC Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada
NST National Research Council of Science and Technology
NWO Netherlands Organisation for Scientific Research
PDVI Pediatric Dengue Vaccine Initiative
PEPFAR President's Emergency Plan for AIDS Relief
RSF Robert Schalkenbach Foundation
SAMRC South African Medical Research Council
SECTEC Secretaria Estado Ciência
SEDES Secretaria de Estado do Desenvolvimento Econômico e Social
STRIDE Southeastern Transportation Research
UCPel Universidade Católicas Pelotas
UCSAL Universidade Católica do Salvador
UdelaR Universidade da República
UEA Universidade do Estado do Amazonas
UEAP Universidade do Estado do Amapá
UECE State University of Ceará
UEFS Universidade Estadual de Feira de Santana
UEGO Universidade Estadual Goias
UEL Universidade Estadual de Londrina
13
UEL Universidade Estadual de Londrina
UEM Universidade Estadual de Maringá
UEMA Universidade Estadual do Maranhão
UEMASUL Universidade Estadual da Região Tocantina Maranhão
UEMG Universidade Estadual de Minas Gerais
UEMS Universidade Estadual de Mato Grosso do Sul
UEMT Universidade Estado Mato Grosso
UENF Universidade Estadual do Norte Fluminense
UEPA Universidade Estadual do Pará
UEPB Universidade Estadual da Paraíba
UEPE Universidade Estadual de Pernambuco
UEPG Universidade Estadual de Ponta Grossa
UEPI Universidade Estadual do Piauí
UEPR Universidade Estadual do Paraná
UERGS Universidade Estadual do Rio Grande do Sul
UERJ Universidade do Estado do Rio de Janeiro
UESB Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia
UESBA Universidade do Estado da Bahia
UESC Universidade do Estado de Santa Catarina
UESPI Universidade Estadual Piauí
UEVC Universidade Estadual Vitoria da Conquista
UEZO Universidade Estadual Zona Oeste
UFABC Universidade Federal do ABC
UFAL Universidade Federal de Alagoas
UFAM Universidade Federal de Amazonas
UFAP Universidade Federal do Amapá
UFB Universidade Federal de Uberlândia
UFBA Universidade Federal da Bahia
14
UFC Universidade Federal do Ceará
UFCG Universidade Federal de Campina Grande PB
UFCSPA Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre
UFERSA Universidade Federal Rural do Semiárido
UFES Universidade Federal do Espírito Santo
UFF Universidade Federal Fluminense
UFFS Universidade Federal Fronteira Sul
UFGD Universidade Federal da Grande Dourados
UFGO Universidade Federal de Goiás
UFJF Universidade Federal de Juiz de Fora
UFLA Universidade Federal Lavras
UFMA Universidade Federal do Maranhão
UFMG Universidade Federal de Minas Gerais
UFMS Universidade Federal do Mato Grosso Do Sul
UFMT Universidade Federal do Mato Grosso
UFOBA Universidade Federal do Oeste Bahia
UFOP Universidade Federal de Ouro Preto
UFOPR Universidade Federal do Oeste do Pará
UFPA Universidade Federal do Pará
UFPB Universidade Federal da Paraíba
UFPel Universidade Federal de Pelotas
UFPI Universidade Federal do Piauí
UFPR Universidade Federal do Paraná
UFRAM Universidade Federal Rural da Amazônia
UFRB Universidade Federal do Recôncavo da Bahia
UFRGS Universidade Federal do Rio Grande do Sul
UFRJ Universidade Federal do Rio de Janeiro
UFRN Universidade Federal do Rio Grande do Norte
15
UFRO Universidade Federal de Rondônia
UFRPE Universidade Federal Rural de Pernambuco
UFRR Universidade Federal de Roraima
UFRRJ Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro
UFERSA Universidade Federal Rural do Semiárido
UFS Universidade Federal de Sergipe
UFSBA Universidade Federal do Sul da Bahia
UFSC Universidade Federal de Santa Catarina
UFSCAR Universidade Federal São Carlos
UFSJ Universidade Federal de São João del Rei
UFSM Universidade Federal de Santa Maria
UFTM Universidade Federal do Triângulo Mineiro
UFTO Universidade Federal de Tocantins
UFTPR Universidade Tecnológica Federal do Paraná
UFU Universidade Federal de Uberlândia
UFV Universidade Federal de Viçosa Minas Gerais
UFVJM Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri
ULBRA Universidade Luterana do Brasil
UMR Unité Mixte de Recherche France
UNB Universidade de Brasília
UNCISAL Universidade Estadual Ciências Saúde Alagoas
UNEAL Universidade Estadual de Alagoas
UNEB Universidade do Estado da Bahia
UNEMAT Universidade do Estado de Mato Groso
UNESA Universidade Estácio de Sá
UNESC Universidade do Extremo Sul Catarinense
UNESP Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho
UNESPAR Universidade do Estado do Paraná
16
UNFPA Fundo de População das Nações Unidas Global
UNIANDRADE Centro Universitário Campos de Andrade
UNIBH Centro Universitário de Belo Horizonte
UNIC Universidade de Cuiabá
UNICAMP Universidade de Campinas
UNICENTRO Universidade Estadual do Centro Oeste
UNIFAL Universidade Federal de Alfenas
UNIFAP Universidade Federal do Amapá
UNIFEB Fundação Educacional de Barretos
UNIFEI Universidade Federal de Itajubá
UNIFENAS Universidad José do Rosário Vellano
UNIFESP Universidade Federal de São Paulo
UNIFOA Centro Universitário de Volta Redonda
UNIFOR Universidade de Fortaleza
UNIFRAN Universidade de Franca
UNILA Universidade Federal da Integração Latino
UNILAB Universidade da Integração Internacional da Lusofonia Afro
UNIMONTES Universidade Estadual de Montes Claros
UNINOVE Universidade Nove de Julho
UNIOESTE Universidade Estadual do Centro
UNIPAC Universidade Presidente Antônio Carlos
UNIPAMPA Universidade Federal do Pampa
UNIR Universidade Federal de Rondônia
UNIRIO Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro
UNISC Universidade de Santa Cruz do Sul
UNISINOS Universidade do Vale Rio Sinos
UNISISNOS Universidade do Vale do Rio dos Sinos
UniSL Centro Universitário São Lucas
17
UNISUL Universidade do Sul de Santa Catarina
UNITAU Universidade de Taubaté
UNIUBE Universidade de Uberaba
Univale Universidade Vale do Rio Doce
UNIVALI Universidade do Vale do Itajaí
UNIVAP Universidade do Vale do Paraíba
UNIVASF Universidade Federal do Vale São Francisco
UPPMD United Parent's Project for Muscular Dystrophies
USPHS United States Public Health Service
WWF World Wild Foundation