45
Øystein Bech Gadmar Seksjon for diagnostisk fysikk, IVS OUS MR-spektroskopi

MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

  • Upload
    others

  • View
    2

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Øystein Bech Gadmar

Seksjon for diagnostisk fysikk, IVS OUS

MR-spektroskopi

Page 2: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

1)

2)

3)

4) 1–3 kan manipuleres (tider, RF, gradienter)

for posisjonskoding og signalkontrast!

– 4

1)

2)

3) Transvers nettomagnetisering

preseserer og gir signal ved res.frekv.

1)

2) RF ved resonansfrekvensen

flipper spinnene (i fase).

MRI på 1 – 2 – 3

figurer fra simplyphysics.com

1) Magnetfeltet opplinjerer

kjernespinn (1H).

Page 3: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

1)

2)

3) Frekvensretning kodes med gradient

under utlesning av signalet.

1)

2) Fasesteg kodes med ulik gradientstyrke

for hvert av mange opptak i et bilde.

Posisjonskoding på 1 – 2 – 3

1) Snitt kan selekteres med gradient og RF

under eksitasjon.

Page 4: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

1)

2)

3) Avansert vekting:

– Diffusjon; flyt

– Magnetisk (blod; spektra)

– osv. osv. osv.!

1)

2) T2(*)-kontrast:

Tap av fasekoherens. T2* < T2 < T1.

Bildekontrast på 1 – 2 – 3

1) T1-kontrast: Ulike vev mister RF-energien

til omgivelsene med ulik hastighet.

Page 5: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

MR-scannerens anatomi

Jody Culham; Joe Gati

Magnet Gradienter MottakerspoleRF-spole

Elektronikk

Page 6: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

MR er en spektral teknikk

Larmorligningen:

f = B0

for 1H er = 42.58 MHz/T

Feltstyrke (T)

Reso

nan

s fo

r 1 H

(MH

z)

127.7

63.9

1.5 3.0

NRK P2

90.1

2.1

42.6

1.0

Page 7: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Elektronene skjermer

for magnetfeltet:

Blokal = (1- σ)B0

Dette muliggjør MR-

spektroskopi! B0

σ B0

Variasjoner i B0: Skjerming

Page 8: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Skjerming og elektroner

• TMS 1H har kjemisk skift ≡ 0 ppm (std. i NMR)(lite polare bindinger → stor skjerming)

• H2O1H har 4.7 ppm (måles i MRS)

(elektronegativt O drar e- fra 1H → lite skjerming)

TMS

H2O

Si

H C

Page 9: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

(N)MR-spektrum

• Dette måles best i et NMR-spektrometer

• MR-skanneren kan det også: MRS!

• Vi ser p+-spinn i molekylene, påvirket av e–

• Spekteret forteller om omgivelsene til ulike p+(1H)

Page 10: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

MRS – en annen modalitet?

MRI MRS

Skannerens rolle Radiometer Spektrometer

Kontrast T1/T2/diff etc Areal/amplityde

Partikkel p+ p+ ← e–

Vekselvirkning WFS (p+ ← e–) J (p+ ← e– ← p+)

Frekvens Koding 1 retn Spektrum

Fase Koding 1–2 retn Koding 0–3 retn

Seleksjon Snitt/slab 3D-voksel

(PRESS/STEAM)

Page 11: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Kreatin

• Cr/P-Cr er i ATP-metabolismen

• Ofte er Crtot konstant

• (Livsmarkør)

• MS-plakk: Cho/Crtot ↑

• (Kan bli borte i tumor)

• Borte i abscess

• (3.03 ppm)

• Skille Cr og P-Cr:31P-MRS

Timo Schirmer, GE

Page 12: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Cholin

• I lipidmetabolismen: P-Cho, GlycOH-P-Cho...

• I Acetyl-Cho (nevrotransmitter)

• Tumor: Ofte ↑

• Kreftterapi: ↓

• Epilepsi: ?

• Betennelse

• (3.23 ppm)

Timo Schirmer, GE

Acetyl-Cho

P-idyl Cho

Page 13: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

N-acetyl-aspartat (NAA)

• Finnes i nevroner; nevronalmarkør(?)

• Infarkt/inflammasjon: ↓ (temp.)

• Alzheimer: ↓

• MS: ↓

• Tumor: Ofte ↓

• (2.03 ppm)

• Cho/NAA!

Timo Schirmer, GE

Page 14: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Laktat

• Fra anaerob glykolyse

• Ikke normalt målbart

• Ischemi: ↑

• Tumor: Iblant ↑

• Abscess: ↑

• Akutt migrene: ↑

• Mitokondriesykdom: ↑

• (1.30 ppm)

• J-kopling (dublett); TE 144 ms for 180°

Timo Schirmer, GE

Page 15: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

J-kopling

• 1H merker hverandres B-felt: ΔB → Δν (frekvens)

• Effekten av p+ på effekten av e– på effekten av p+ ☻

• Binomialfordelt finsplitt (1:1 – 1:3:3:1 – 1:4:6:4:1 etc)

• Faseutvikling (Δν → Δφ) B0-uavhengig!

• Svak kopling ved Δν >> J (enklere – høyt felt er bra!)

↑↑↑

↓↑↑ ↑↓↑ ↑↑↓

↑↓↓ ↓↑↓ ↓↓↑

↓↓↓

Page 16: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

J-kopling i laktat

• De 3 metylprotonene v 1.3 ppm blir dublett pga CH-p+

• I –CHOH– vises ikke OH-p+ (for rask utskiftning)

• CH-p+ i –CHOH– blir tetraplett (1:3:3:1) pga 3 CH3-p+

• Trodde Jlac-H3 = 7.3 Hz → 270 ms periode (Siemens!)

• Nye målinger: Jlac-H3 = 6.9 Hz → 288 ms (→ 0.16 µT)

CH3 CH

Page 17: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Ekkotider for Lac

• Kort TE gir best SNR, men mye andre metab. (+lipid!)

• TE = 144 ms for -180° Lac; iblant problematisk v 3 T(pga destruktiv faseinterferens fra dårlig PRESS-seleksjon)

• TE = 288 ms tydelig Lac (lang T2) men også støyete

• Anbefalt: 144 ms eller 288 ms for klinikk – test ut!

MRS: Wibeke Nordhøy, OUS 2011, UUS NMR3 (GE Signa HDxt 3T)

30 ms 144 ms 288 ms

Page 18: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

T2 og TE i MRS

• T2-kontrast er ofte uønsket i MRS

• Forholdet mellom topper endres med TE og B0!

• (→ OBS ved sammenligning av skannere/sekvenser!)

• TE↑: Kontrast for langlivede metabolitter

• TE↑: Dårlig SNR; faseartefakt m.m.

• TE↓: Ser flere metabolitter; lite fasegang

• TE↓: Kan være forvirrende; mer fettsignal

Page 19: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Vannsignal

• Vann gir ca. 10000 × Smetabolitter

• Må derfor supprimeres, f.eks. spektral inversjon

• Restsignal kan prosesseres bort

Page 20: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Baselinjekorreksjon

• Imperfekt vannsuppresjon m.m.

• Korrigeres automatisk

• Vi ser dermed ferdig

”punkterte” spektra

som ikke ”rir” flanken

av vanntoppen

LCModel

Page 21: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Blodsignal

• Arterier i eller nær voksel kan forstyrre MRS

• Gir dårlig vannsuppresjon og andre artefakter

• Bruk sat-bånd hvor det trengs!

Page 22: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Fettsignal

• Fett gir lett ~100 × Smetabolitter og mer

• Supprimeres ikke vanligvis for hjerne

• Problem v lipidansamlinger

• Problem nær meninges

• Kan maskere Lac

• Variabel frekvens og J-kopling (fasing)

• (0.9–1.3+ ppm)

• Bruk sat-bånd hvor det trengs!

Page 23: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

PRESS-sekvensen

• Vi har ikke 3D-gradienter for 3D-seleksjon

• Må bruke multi-snittseleksjon (”PRESS-boks”)

• PRESS pulssekvens: 90° – 180° – 180°

• SVS: Single Volume Selection

• CSI: Chem Shift Imaging

• CSI bruker 2D/3D fasekoding

Alternativ: STEAM (3×90°)– ½ SNR, men TEmin ↓– Vanligvis ikke verdt det…

Page 24: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Unøyaktig PRESS-boks

• Ulik eksitasjon kan gi utflytende spektra m.m.

• Løses vanligvis ved en litt stor PRESS-boks og så auto-saturering rundt kanten

• De ytterste vokslene i et 2D-bilde blir dårligere

• Konsekvenser for Lac-måling, særlig v 144 ms

Page 25: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Satureringsbånd

• Alle våre scannere legger auto-sat-bånd inntil(vanligvis usynlig under planlegging)

• Til høyre sees manuelt lagte tilleggsbånd

• Hold voksel ≥ 5 mm fra kalvariet! (Mer v 3 T?)

Page 26: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Satureringsbånd

• Manuelt lagte bånd for å slå ut skalle,

• samt venøs/arteriell flow

• Bør uansett ha avstand til membraner

• Bruk sat-bånd på skalle og arterier hvis nær voksel!

Page 27: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Signal-til-støy (SNR)

• Lengre opptakstid hjelper noe (~NSA1/2)

• Trenger også godt signal (spole)

• Bedre oppløsning er farlig for SNR!!! (~FOV-3/2)

• Oppløsning har mer å si enn opptakstid...

Page 28: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

CSI og SVS

• Singel voksel (SVS) gir mye bedre signal,

• men ingen romoppløsning som i CSI

• Lettere å shimme/plassere SVS (linjebredde++)

Page 29: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

3T MRS vs. 1.5T MRS

CITIUS

EXILIUS

FORTIUS

• Enkel teori sier 2x SNR og bedre spektraloppløsning.

• Men – er det så enkelt? Artefakter...!

(raskere)

(smalere)

(sterkere)

Page 30: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Shimming

• Unøyaktig frekvens påvirker toppbredden mye

• Størst problem i store voksler (f eks CSI)

• Vanskelige lokasjoner (f eks nede i hodet)

• Pass også på shimvolum!

~Voksel best; unngå problemområder?!

• Anbefaler HOS for store/vanskelige voksler!

Page 31: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Shim ved vanskelig MRS

I dette opptaket hadde høyere ordens shim (HOS)

mye å si for signalstyrke og -kvalitet

Uten HOS Med HOS

Page 32: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Enklere opptak

• Periventrikulært f.eks., er enklere å få til

• (trenger sjelden ekstra shim)

Page 33: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Oblike snitt

• Dette er en mulighet på Siemens-maskinen

• Kan være svært hendig ved vanskelig anatomi!

Page 34: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

”PRESS-midler” – BWex

• 90°-puls kan ha større BWex enn 180°

→ kjemisk shift får mindre å si → mer nøyaktig

• Kan styre ”slice direction” ved planlegging

90o (”slice”)

PRESS180o

Page 35: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

”PRESS-midler” – skiftretning

• Fat Shift Direction påvirker retningen av shift!

• (”Frequency/phase encoding direction”…)

• Kan styre 1–3 retninger på ulike skannere

• Metode: Prøving og feiling → erfaring…?!

Page 36: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Et hjertesukk

• Postprosessering har ubrukt potensiale (jMRUI+)

• Sammen med

avanserte opptak

• Bør bli bedre!

(Over- vs. under-

forenkling...)

• Samtidig mer

brukervennlig!!!

Page 37: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

Siemens Sonata MRS

UUS, 2006

Page 38: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

GE3T - tumor

• Merk Cho/NAA ↑

• Mer artefakt i tumor (bl.a. dårlig vannsuppresjon)

• NB: Forskjellig skalering!

Page 39: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

GE3T - tumor

• Sammenligning av voksler

• NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon

Page 40: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

GE3T – metabolittbilder

Page 41: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

CSI av hjerne vs. prostata

Siemens

• Begge steder ser vi Cholin

• I normal prostata ser vi Citrat fra seminalvæsken

• Problem: Fett (dobbel suppr.!), bevegelse!

Page 42: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

ProstataFør behandl.

Etter 6 uker

jMRUI - AMARES

citrat

UUS(T. Storås et al)

Page 43: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

MRS Mamma

• Ikke helt lett ennå (oppløsning; fett m.m.)

• Kan være bra ved store lesjoner

• Cho ↑: Malignitet (invasivt duktalcarcinom)

Hyun-Kyung Chung, GE

Page 44: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

MRS Mamma

• Ingen Cho sees: Benign fibrocystisk endring

• 85–100% spesifikt (med T̅E-teknikk)?

• MRS mamma gjøres ikke ved UUS?!

Hyun-Kyung Chung, GE

Page 45: MR-spektroskopi på UUS · MRI på 1 –2 –3 figurer fra ... • Merk Cho/NAA ... •NAA ↓, Cho ↑ og Lip/Lac ↑ i lesjon. GE3T –metabolittbilder • CSI av hjerne vs. prostata

31P MRS