20
Novorodenecký genetický test 210x297_brozura_nova.indd 2 210x297_brozura_nova.indd 2 15/02/17 13:28 15/02/17 13:28

Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

  • Upload
    others

  • View
    16

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

Novorodenecký genetický test

210x297_brozura_nova.indd 2210x297_brozura_nova.indd 2 15/02/17 13:2815/02/17 13:28

Page 2: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

Novorodenecký genetický test

210x297_brozura_nova.indd 3210x297_brozura_nova.indd 3 15/02/17 13:2815/02/17 13:28

Page 3: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

Úvod04

Pre koho je test vhodný?08

Požiadavky na vzorku11

Klinické overenie14

Prečo novorodenecký genetický test Nova™?05

Metodológia09

Pracovný postup12

Prípadové štúdie pre klinické účely16

Čo novorodenecký genetický test Nova™zisťuje?06

Obsah testovacej súpravy10

Zdroje informácií o zriedkavých ochoreniach13

Odkazy na klinické štúdie18

210x297_brozura_nova.indd 4210x297_brozura_nova.indd 4 15/02/17 13:2815/02/17 13:28

Page 4: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

Úvod

Spoločnosť BGI s hrdosťou prináša novorodenecký genetický test NOVA™. Ide o komplexný skríningovýtest, vďaka ktorému je možné odhaliť riziko 50 dedičných porúch a poskytnúť personalizované genetické informácie o pravdepodobných reakciách na 20 pediatrických liekov. Pomocou technológie NGS (sekvenovania ďalšej generácie) a genetického bioinformatického softvéru spoločnosti BGI, ktorý je popredným produktom v rámci tohto odvetvia, test NOVA™ ponúka najkomplexnejší a najpresnejší skríningový test na trhu. Jeho pozitívna prediktívna hodnota dosahuje až >99%.

4

210x297_brozura_nova.indd 5210x297_brozura_nova.indd 5 15/02/17 13:2815/02/17 13:28

Page 5: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

Prečo novorodenecký genetický test NovaTM ?

Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení mnohé z nich zdajú byť úplne zdravé a v ich rodinnej anamnéze taká porucha nefi guruje. Tieto chyby sa u detí často odhalia až neskôr, keď sa u nich začnú prejavovať závažné a často nezvratné symptómy. Mnoho krajín realizuje programy fi nancované z verejných zdrojov v snahe odhaliť vrodenéporuchy u novorodencov. Väčšina z týchto krajín sa však v rámci týchto programov zameriava len na 3-16 porúch. To znamená, že každý rok sa u tisícov novorodencov nezisťuje mnoho ďalších potenciálne liečiteľných porúch. Okrem toho niektoré mutácie génov spôsobujú, že dieťa je citlivejšie na určité lieky, ktoré by preto malo brať v menších dávkach, alebo by ich nemalo brať vôbec. Reakcia na tieto lieky sa väčšinou nedá predpokladať a nepredpokladaný negatívny vplyv sa odhalí, až keď ich dieťa užije.

Novorodenecký genetický test Nova™ odhaľuje 50 vrodených porúch s kombinovanou odhadovanou prevalenciou 1/400 narodených. Tieto poruchy boli vybraté na základe zoznamu prevládajúcich porúch a sekundárnych cieľov stanovených špecializovanou skupinou expertov na novorodeneckýskríning Americkej spoločnosti pre medicínsku genetiku ** (ACMG - American College of Medical Genetics). Všetky ochorenia v  rámci panelu novorodeneckého genetického testu Nova™ boli starostlivo zvolené na základe klinických charakteristík ochorenia, vrátane frekvencie výskytu,ťažkostí v  prípade neliečenia, a  liečby ochorenia v akútnej a  chronickej forme. Cieľom novo-rodeneckého genetického testu Nova™ je pomôcť lekárom, aby včas rozpoznali, odporučili k špecialistovi a zahájili liečbu všetkých detí s vysokým rizikom výskytu týchto porúch.

Okrem skríningu ochorení poskytuje novorodenecký genetický test Nova™ aj farmakogenomické informácie o 20 pediatrických liekoch. Všetky tieto lieky schválil Úrad pre kontrolu potravín a liečiv (FDA) ako vhodné pre deti a boli vybraté na základe potenciálnej závažnosti reakcie na liek za predpokladu rôznych mutácií génov. ***

* Christianson A., Howson C., Modell B, organizácia March of Dimes, Global Report On Birth Defects (Globálna spáva o vrodených poruchách), str. 2, nadácia March of Dimes Birth Defects Foundation White Plains, New York 2006

** Watson M. et al, súhrnná správa Newborn Screening: Toward a Uniform Screening Panel and System—Executive Summary, American College of Medical Genetics, špecializovaná skupina Newborn Screening Expert Group,

PEDIATRICS (ISSN č.: tlač, 0031-4005; online, 1098-4275); vydala verejná doména akadémie American Academy of Pediatrics

*** Databáza Pharmocogenomics Knowledge Database (pharmgkb.org) bola použitá pri zisťovaní, ako genetické variácie ovplyvňujú reakcie na lieky.

† eurodis.org, †† raredisease.org.uk, ††† Európska rada

zriedkavých ochorení má

dokázateľne genetický pôvod †

zriedkavých ochorení

postihne deti ††

pacientov so zriedkavými ochoreniami

zomrie pred dovŕšením 5 rokov ††

u 1/17 sa zriedkavé ochorenie prejaví

v priebehu života †††

80 % 75 % 30 %

5

210x297_brozura_nova.indd 6210x297_brozura_nova.indd 6 15/02/17 13:2815/02/17 13:28

Page 6: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

Čo test zisťuje?

50 vrodených porúch (pozrite si tabuľku nižšie)Vrodené poruchy metabolizmu (40)/Vrodené poškodenie sluchu (1)/Imunodefi ciencia (6)/ Iné monogénne ochorenia (3)

Farmakogenomika 20 pediatrických liekov Neurologické lieky (5)/Protizápalové lieky (10)/Liek proti reumatickým ochoreniam (1)/ Gastroenterologický liek (1)/Liek na srdce (1)/Onkologické lieky (2)

Novorodenecký genetický test Nova™ zisťuje prítomnosť mutácií, ktoré súvisia so špecifi ckými genetickými ochoreniami uvedenými v zozname. Úlohou novorodeneckého genetického testu Nova™ je zistiť, u ktorých novorodencov

je vyššia pravdepodobnosť výskytu jedného z uvedených genetických ochorení. Ak výsledky testu potvrdia prítomnosť jednej z mutácií, konečnú diagnózu ochorenia by mal stanoviť výlučne kvalifi kovaný lekár. Odporúča sa ďalšie

testovanie na potvrdenie diagnózy.

Kategória ochorenia Názov ochorenia

Fenylketonúria

Arginínsukcinická acidémia ASL AR

Defi cit enzymu N-acetylglutamát syntetázy NAGS

MCEE

MCCC1

AR

AR

AR

Nedostatok enzýmu argináza ARG1

MMAA

AR

AR

Defi cit citrinu SLC25A13

PCCA

GCDH

AR

AR

AR

Hyperfenylalaninémia z nedostatku tetrahydrobiopterínu (BH4) FAH AR

Choroba javorového sirupu (MSUD)

Poruchy metabolizmu aminokyselín

Poruchy organických kyselín

Poruchy oxidácie mastných kyselín

BCKDHA AR

BCKDHB AR

DBT AR

DLD AR

Citrullinémia I ASS1

MUT

AR

AR

Defi cit ornitíntranskarbamylázy OTC

MMADHC

MCCC2

XL

AR

AR

Defi cit karbamoylfosfátsyntetázy I CPS1

MMAB

AR

AR

Homocystinúria z defi citu cystation beta-syntázy CBS

PCCB

ACAT1

HLCS

AR

AR

AR

Tyrozinémia I. typu PTS

IVD

BTD

AR

AR

AR

AR

AR

Typ dedičnosti *Gén

PAH AR

č.

1

4

8

22 Defi cit 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenázy mastných kyselín s dlhým reťazcom

6

20 Glutárová acidémia typu II

10

24 Defi cit trifunkčného proteínu

2

5

9

23 Defi cit acyl-CoA dehydrogenázy mastných kyselín so stredne dlhým reťazcom

7

21 Systémový primárny defi cit karnitínu

11

12

15 Izovalerová acidémia

17 Glutárová acidémia typu I

18 Defi cit β-ketotiolázy

14 Propiónová acidémia

13 Methylmalonová acidémia

16 Defi cit karbamoylfosfátsyntetázy I

19 Mnohopočetný defi cit karboxylázy

3

SLC22A5 AR

ETFA AR

ACADM AR

ETFDH AR

HADHA AR

ETFB AR

HADHA AR

HADHB AR

6

Novorodenecký genetický test

210x297_brozura_nova.indd 7210x297_brozura_nova.indd 7 15/02/17 13:2815/02/17 13:28

Page 7: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

* AD: Autozómovo dominantný, AR: Autozómovo recesívny, XR: Gonozómovo recesívny. XL: viazaný na X chromozóm

NOVA™ is a trademark of BGI. All rights reserved.

Kategória ochorenia Názov ochorenia Typ dedičnosti *Génč.

Defi cit acyl-CoA dehydrogenázy mastných kyselín s veľmi dlhým reťazcom

Fabryho choroba

Defi cit β-ketotiolázy

Cystická fi bróza

ACADVL

GLA

AR

AR

Wilsonova choroba

Mukopolysacharidóza typu I.

ACADS

IL2RG

CD247

LIG4

PRF1

CFTR

IDUA

GALT

PTPRC

DCLRE1C

ZAP70

STXBP2

TSC2

SMPD1

SLC26A4

AR

XR

AR

AR

AR

AR

AR

AR

AR

AR

AR

AR

AD

AR

AR

Defi cit karnitin-palmitoyl transferázy typu 1A

Glykogenóza typu Ib

Nijmegenov rozpadový syndróm

Tuberózna skleróza

CPT1A

SLC37A4

AR

AR

Vrodená intolerancia fruktózy

Krabbeho choroba

Galaktosémia

Niemann-Pickova choroba

Nesyndromická strata sluchu a hluchota

Ťažká kombinovaná imunodefi ciencia

ALDOB

IL7R

RAG2

PNP

STX11

TSC1

GALC

GJB2

GALK1

CD3E

ADA

ATM

RMRP

NPC2

MT-RNR1

AR

AR

AR

AR

AR

AD

AR

AD/AR

AR

AR

AR

AR

AR

AR

Mitochondriálna dedičnosť

Poruchy oxidácie mastných kyselín

Poruchy uhľohydrátov

Poruchy uskladnenia lyzozomálnych enzýmov

Porucha sluchu

Rôznegenetické ochorenia

Primárne poruchy imunity

Porucha metabolizmu medi

Defi cit karnitin-palmitoyl transferázy typu II.

Glykogenóza typu Ia

Ataxia telangiectasia

Ťažká myoklonická epilepsia v detstve

CPT2

G6PC

AR

AR

Defi cit glukózo-6-fosfátdehydrogenázy

Mukopolysacharidóza typu II.

G6PD

JAK3

RAG1

NHEJ1

UNC13D

SCN1A

DLD

GALE

CD3D

AK2

BTK

NBN

NPC1

GJB3

XL

AR

AR

AR

AR

AD

XR

AR

AR

AR

XR

AR

AR

AD/AR

Defi cit acyl-CoA dehydrogenázy mastných kyselín s krátkym reťazcom

Glykogenóza typu II (Pompeho choroba)

Syndróm hypoplázie chrupky a vlasov

Familiárna hemofagocytová lymfohistiocytóza

ACADS

GAA

AR

AR

25

33

43

48

29

37

27

35

45

50

31

39

32

40

41

42

26

34

44

49

30

38

28

36

46

47

7

210x297_brozura_nova.indd 8210x297_brozura_nova.indd 8 15/02/17 13:2815/02/17 13:28

Page 8: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

Pre koho je test vhodný? *

Test Nova™ je vhodný konkrétne pre:

- Rodičov, ktorí majú záujem o komplexný skríning svojho dieťaťa.

- Rodičov, ktorí sa chcú dozvedieť viac o genetických predpokladoch ovplyvňujúcich reakcie ich dieťaťa na niektoré lieky.

- Novorodencov, ktorí neprešli bežným skríningom.

- Novorodencov, ktorých rodičia majú vrodené poruchy v rodinnej anamnéze, alebo sa radia k osobám, u ktorých sa pred-pokladá vyššie riziko vzniku genetických ochorení.

Test Nova™ nie je vhodný pre:

- Konečné diagnostikovanie porúch.

- Novorodencov s numerickými alebo štrukturálnymi zmenami chromozómu, variáciami počtu kópií a/alebo mozaicizmom zárodočných buniek.

- Novorodencov, ktorí dostali krvné trans-fúzie, mali transplantované orgány alebo podstúpili liečbu kmeňovými bunkami.

* Vo formulári na získanie súhlasu rodiča/zákonného zástupcu nájdu poskytovatelia zdravotnej starostlivosti

kompletný zoznam obmedzení súvisiacich s testovaním, na základe ktorého by mali určiť, či tento test

je alebo nie je vhodný pre pacienta.

8

210x297_brozura_nova.indd 9210x297_brozura_nova.indd 9 15/02/17 13:2815/02/17 13:28

Page 9: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

Metodológia

Jedinečné cielené sekvenovanie

Knižnica so stopovým množstvom DNA: môže obsahovať >100 ng DNA zo 4 vzoriek krvi a vytvoriť knižnicu len z 50 ng DNA (1ug = 1000 ng je minimálna požiadavka pri štandardnej knižnici)

DNA sa zachytáva zachytávacím čipom vyrobeným spoločnosťou BGI. Jeho účinnosť zachytávania je porovnateľná so zachytávacími čipmi ostatných popredných spoločností na trhu.

Pomocou komplexnej databázy 12 000 mutácií všetkých génov uvedených na zozname sa automaticky vygeneruje správa.

1

3

5

2

4

6

Cieľová genómová DNA

Región A

Región B

Región B

Sondy

Magnetické častice

Hybridizácia

Amplifi kácia a obohatenie QC

Adaptér sekvenovanianovej generácie

Zachytávanie a premývanie

Sekvenovanie

9

210x297_brozura_nova.indd 10210x297_brozura_nova.indd 10 15/02/17 13:2815/02/17 13:28

Page 10: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

Obsah testovacej súpravy

1

4

2

5

3

6

7

Objednávka, Informovaný súhlas,Žiadanka, Vyhlásenie

Rukavice

Odberová kartana vzorku krvi

Obal na vzorkus označením Biohazard

Príručka používaniatestovacej súpravy NOVA™

Ihla na vpich do päty

Spiatočná obálka

10

210x297_brozura_nova.indd 11210x297_brozura_nova.indd 11 15/02/17 13:2815/02/17 13:28

Page 11: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

Požiadavky na vzorku

Pre donosených a predčasne narodených novorodencov.

Prebodnutie kože nesmie byť hlbšie ako 2,0 mm.

Celý krúžokje rovnomernevyplnený

Vrstvenie

Nedostatočné, viacnásobná aplikácia

Krúžokso sérom

Pre novorodencov s opakovaným prepichom päty.

Odporúča sa automatické zariadenie na vpichovanie nie hlbšie ako 1,0 mm.

Nedotýkajte sa miest vyhradených na aplikáciu vzoriek krvi. Predídete tak kontaminácii výsledkov.

- Tri alebo štyri hodiny sušte na vzduchu, na čistom, rovnom povrchu a chráňte pred teplom či svetlom.

- Počas sušenia nevrstvite vzorku a zabráňte kontaktu krvi na fi ltračnom papieri s inými povrchmi.

- Keď vzorka vyschne, zložte záložku naspäť.

- Je potrebné poskytnúť správne nanesenú vzorku krvi, aby sa predišlo zdržiavaniu a/alebo potrebe odoberania novej vzorky.

- 4 vzorky krvi dieťaťa, ktoré sa bezpečne odoberú z jedného prebodnutia päty- je možné použiť aj pupočníkovú krv, krv z päty a periférnu krv (pri deťoch do 5 rokov)- každá testovacia súprava obsahuje detailný popis postupu odoberania vzorky

Vpich do päty je bezpečný, jednoduchý a bežne využívaný v rámci klinických postupov.

Vizuálne naznačenie oblastí pre odber vzorky

Vizuálne naznačenie vzorky na kartičke

Vysušenie vzorky

Vzorky krvi

11

210x297_brozura_nova.indd 12210x297_brozura_nova.indd 12 15/02/17 13:2815/02/17 13:28

Page 12: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

Pracovný postup

1

3

5

7

2

4

6

Pred vykonaním genetického testu poskytniteporadenstvo, vysvetlite všetky aspekty testovania a podpíšte objednávku a informo-vaný súhlas od rodiča/zákonného zástupcu. Objednávku zašlite na [email protected]

Pošlite Informačný list (excel), Vyhlásenie a tieto informácie: typ a počet vzoriek, dopravca a číslo zásielky, emailom na adresy [email protected] a [email protected].

Pošlite Informovaný súhlas, Žiadanku a Vyhláse-nie pre colné účely spolu s Odberovou kartou so suchou vzorkou krvi do laboratória BGI (adresa je na spiatočnej obálke).

V prípade potreby poskytnite potestové poradenstvo či poučenie o liekoch.

Prediskutujte, vyplňte a podpíšte Žiadanku o test, Informačný list (tabuľka excel), Odberovú kartu na vzorky krvi a Vyhlásenie pre colné účely.

Dohodnite sa so spoločnosťou DHL na vyzdvihnutí vzoriek krvi.

Výsledky dostanete do 15-tich dní.

Poskytovateľom testov NOVA™ sa môžete stať rýchlo a jednoducho.

Kontaktujte nás na [email protected] a zistite viac o možnostiach spolupráce.

12

210x297_brozura_nova.indd 13210x297_brozura_nova.indd 13 15/02/17 13:2815/02/17 13:28

Page 13: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

Zdroje informácií o zriedkavých ochoreniach

Zriedkavé ochorenia sú charakteristické širokou škálou symptómov

a príznakov, ktoré sa líšia nie len v rámci ochorenia, ale aj pri jednotlivých

pacientoch, ktorí touto chorobou trpia. Za relatívne rovnakými

symptómami sa môžu skrývať ojedinelé ochorenia a môže dôjsť

k mylným záverom.

Aj závažné zriedkavé ochorenia sa niekedy dajú zistiť a liečiť

už v rannom štádiu (napr. operatívne, prostredníctvom výživy či liekov),

čím sa zmierňuje ich dopad. Predpôrodný skríning a skríning novo-

rodencov (napr. skríning krvných vzoriek novorodencov) tu zohráva

dôležitú úlohu.

Zdroj: Stratégia VB pre zriedkavé ochorenia, s. 14

Zdroj: www.eurordis.org/content/what-rare-disease

Zdroj: www.raredisease.org.uk/about-rare-diseases

Zriedkavé ochorenie defi nuje Európska únia ako také, ktoré

v rámci všeobecnej populácie zasiahne 5 z 10 000 ľudí.

Poznáme asi 6 000 - 8 000 zriedkavých ochorení a každý

týždeň sa v medicínskej literatúre objaví približne päť nových.

13

210x297_brozura_nova.indd 14210x297_brozura_nova.indd 14 15/02/17 13:2815/02/17 13:28

Page 14: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

Klinické overenie

Štúdia založená na 40 nezávisle poskytnutých vzorkách Detská nemocnica pri Fudanskej univerzite

V 29 vzorkách (72,5%) sa objavili mutácie génov zhodné s klinickými fenotypmi. V ostatných vzorkách sa našli len spoločné patogénne mutácie alebo SNP (jednonukleotidový polymorfi zmus).

22 mužov 18 mužov

Neidentifi kované

11

Rôzne genetické poruchy

9

Glutárováacidémia

3

Fenylketonúria

5

Defi cit citrinu

6

Methylmalonováacidémia

6

14

210x297_brozura_nova.indd 15210x297_brozura_nova.indd 15 15/02/17 13:2815/02/17 13:28

Page 15: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

Prijaté vzorky 2, 7 a 11 mali rovnaké výsledky hmotnostnej spektrometrie, ale podľa zistení ich spôsobujú tri rôzne mutácie génov. Postup liečby sa zásadne odlišuje pri každej z týchto mutácií.

ZáverAplikácia cieleného sekvenovania ďalšej generácie u detí so zvýšeným rizikom dedičných meta-bolických porúch môže potenciálne poskytnúť spoľahlivú molekulárnu diagnózu, ktorá je navyše cenovo a časovo prijateľná. Odhalenie mutácií, ktoré spôsobujú ochorenia, môže byť prínosom aj pre klinickú prax a je tiež nevyhnutné pri poradenstve v súvislosti s genetikou.

Odkazy na štúdieWu BB, Gao Rui. et. al. Application of targeted next generation sequencing in the molecular diagnosis of abnormal mass spectrometry analysis fi ndings (Uplatnenie cieleného sekvenovania ďalšej generácie v molekulárnej diagnóze nálezov v analýze abnormálnej hmotnostnej spektrometrii). Chin J Evid Based Pediatr. 2015 Feb., 10. zv., č. 1. doi: 10.3969/j.issn.1673-5501.2015.01.007

Elektroforeogram dlhého PCRVšetky mutácie potvrdilo Sangerovo sekvenovanie

15

210x297_brozura_nova.indd 16210x297_brozura_nova.indd 16 15/02/17 13:2815/02/17 13:28

Page 16: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

Prípadové štúdie pre klinické účely

Prípad č. 1 / Galaktosémia

Novorodenci s galaktosémiou majú počas prvých dní a týždňov života zvyčajne ťažkosti s dojčením, vracaním, žltačkou, neduživosťou, či ochoreniami pečene a obličiek, ktoré spôsobuje neschopnosť organizmu premieňať galaktózu, cukor prítomný v mlieku, na glukózu, t.j. cukor, ktorý využíva organizmus.Ak sa ochorenie nelieči okamžite, hrozí smrť ako následok zlyhania pečene, krvácania alebo infekcie. U starších detí sa zvyčajne objavia ťažkosti s učením a vývojom reči. U väčšiny dievčat s galaktosémiou badať oneskorený nástup puberty a v dospelosti trpia neplodnosťou. Existujú tri typy galaktosémie, ktoré spôsobujú rôzne mutácie génov.

Kazuistika:Spoločnosť BGI prijala vzorku od pacienta so závažnými klinickými symptómami.Test NOVA™ odhalil dve mutácie (c.505C>T a c.452G>A) na géne GALE. Pacient zdedil každý z nich od jedného rodiča.U pacienta diagnostikovali prvý prípad galaktosémie v Číne spôsobený génom GALE.

Typ I.GALT

GalaktosémiaGalaktosémia

Typ III.GALE

Typ II.GALKI

16

210x297_brozura_nova.indd 17210x297_brozura_nova.indd 17 15/02/17 13:2815/02/17 13:28

Page 17: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

Autozomálnyrecesívny

Prípad č. 2 / Familiárna chylomikronémia

Familiárna chylomikronémia (hyperlipidémia typu I.) je zriedkavé autozomálne recesívne ochorenie spôsobené najmä zriedkavými variantmi v sekvencii génu lipoproteínovej lipázy (LPL). Porucha sa väčšinou prejaví v detstve a vyznačuje sa ťažkou hypertriglyceridémiou sprevádzanou občasnou bolesťou brucha, opakovanou akútnou pankreatitídou, kožnými eruptívnymi xantómami a lipemicky vyzerajúcou plazmou (pripomínajúcou mlieko).

Metóda: Použili sme panel monogénnych dyslipidémií paralelne s testovaním pomocou sekvenovania ďalšej generácie s cieľom určiť mutácie zapríčiňujúce ochorenie u dvoch novorodencov, u ktorých sa prejavovali symptómy hypertriglyceridémie a lipemickej plazmy.

Kazuistika A:Dieťa bolo hospitalizované tridsať dní po narodení s pretrvávajúcim kašľom. Zistili, že má ružovkastú krv. Taktiež sa zistilo, že odtučnené lipidy v sére vrátane triglyceridov (TG) a cholesterolu (CHOL) neboli v norme, s celkovým pomerom cholesterolu (TC) 1270 mg/dl a tri-glyceridémiou (TG) 757 mg/dl. Následné genetické testy chlapca odhalili zloženú heterozygozitu mutácií p.Arg270His a p.Trp421* na géne LPL, pričom v prípade oboch ide o patogenické mutácie. Zaviedli mu diétu na obmedzenie tukov a cholesterolu. Následkom toho sa prudko znížila úroveň cholesterolu v chlapcovom sére a stav sa do dvoch mesiacov znormalizoval.

Kazuistika B: U 48-dňového chlapca sa prejavovali symptómy dusenia sa mliekom a polypnea. Hladina triglyceridov (TG) bola na úrovni 557 mg/dl, ale cholesterol (CHOL) mal v norme. Genetické testy pacienta odhalili zloženú heterozygózu dvoch známych patogenických mutácií: p.Leu279Arg a deléciu veľkého frag-mentu na exon8/exon9/exon10. Prostredníctvom obmedzenia tukov a stravy obohatenej o vitamíny sa podarilo dostať hladinu TG pod kontrolu a chlapec sa ďalej vyvíjal normálne.

nezasiahnutý

nosič otec

nezasiahnutý syn nosič syn

nosič matka

nosič dcéra zasiahnutá dcéra

zasiahnutý

nosič

17

210x297_brozura_nova.indd 18210x297_brozura_nova.indd 18 15/02/17 13:2815/02/17 13:28

Page 18: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

Odkazy na klinické štúdie

Wu BB, Gao Rui. et. al. Application of targeted next generation sequencing in the molecular diagnosis of abnormal mass spectrometry analysis fi ndings. Chin J Evid Based Pediatr. 2015 Feb., 10. zv., č. 1. doi: 10.3969/j.issn.1673-5501.2015.01.007 [čínsky]

Thong MK. Birth defects registries in the genomics era: challenges and opportunities for developing countries. Front Pediatr. 2014 Jún 16; 2:60. doi: 10.3389/fped.2014.00060. eCollection 2014.

Rieder MJ, Carleton B. Pharmacogenomics and adverse drug reactions in children. Front Genet. 2014 Apr 16; 5:78. doi: 10.3389/fgene.2014.00078. eCollection 2014.

Brandi ML. Lessons from next-generation sequencing in genetic skeletal disorders. Bonekey Rep. 2014 Máj 14;3:528. doi: 10.1038/bonekey.2014.23. eCollection 2014.

Waisbren SE. et.al. Parents are interested in newborn genomic testing during the early postpartum period. Genet Med. 2014 Dec 4. doi: 10.1038/gim.2014.139.

Christianson A., Howson C., Modell B, March of Dimes, Global Report On Birth Defects, str. 2, March of Dimes Birth Defects Foundation White Plains, New York 2006

Watson M. et al, Newborn Screening: Toward a Uniform Screening Panel and System —Executive Summary, American College of Medical Genetics Newborn Screening Expert Group, PEDIATRICS (Č. ISSN: tlač, 0031-4005; online, 1098-4275); vydala verejná doména akadémie American Academy of Pediatrics

Databáza Pharmocogenomics Knowledge Database (pharmgkb.org) bola použitá pri zisťovaní, ako genetické variácie ovplyvňujú reakcie na lieky.

18

210x297_brozura_nova.indd 19210x297_brozura_nova.indd 19 15/02/17 13:2815/02/17 13:28

Page 19: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

Poruchy metabolizmu aminokyselín

Fenylketonúria

Hyperfenylalaninémia z nedostatku tetrahydrobiopterínu (BH4)

Choroba javorového sirupu (MSUD)

Argininsukcinická acidémia

Citrullinémia I

Nedostatok enzýmu argináza

Defi cit karbamoylfosfátsyntetázy I

Defi cit enzymu N-acetylglutamát syntetázy

Defi cit ornitíntranskarbamylázy

Defi cit citrinu

Homocystinúria z defi citu castation beta-syntázy

Tyrozinémia I. typu

Poruchy organických kyselín

Methylmalonová acidémia

Propiónová acidémia

Izovalerová acidémia

Defi cit karbamoylfosfátsyntetázy I

Glutárová acidémia typu I

Defi cit β-ketotiolázy

Mnohopočetný defi cit karboxylázy

Poruchy oxidácie mastných kyselín

Glutárová acidémia typu II

Systémový primárny defi cit karnitínu

Defi cit 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenázy mastných kyselín s dlhým reťazcom

Defi cit acyl-CoA dehydrogenázy mastných kyselín so stredne dlhým reťazcom

Defi cit trifunkčného proteínu

Defi cit acyl-CoA dehydrogenázy mastných kyselín s veľmi dlhým reťazcom

Defi cit karnitin-palmitoyl transferázy typu II.

Defi cit karnitin-palmitoyl transferázy typu 1A

Defi cit acyl-CoA dehydrogenázy mastných kyselín s krátkym reťazcom

Porucha metabolizmu medi Wilsonova choroba

Poruchy uhľohydrátov

Defi cit glukózo-6-fosfátdehydrogenázy

Vrodená intolerancia fruktózy

Galaktosémia

Poruchy uskladnenialyzozomálnych enzýmov

Fabryho choroba

Glykogenóza typu Ia

Glykogenóza typu Ib

Glykogenóza typu II (Pompeho choroba)

Mukopolysacharidóza typu I.

Mukopolysacharidóza typu II.

Krabbeho choroba

Niemann-Pickova choroba

Porucha sluchu Nesyndromická strata sluchu a hluchota

Primárna porucha imunity

Ťažká kombinovaná imunodefi ciencia

Defi cit β-ketotiolázy

Ataxia telangiectasia

Nijmegenov rozpadový syndróm

Syndróm hypoplázie chrupky a vlasov

Familiárna hemofagocytová lymfohistiocytóza

Rôzne genetické ochorenia

Cystická fi bróza

Ťažká myoklonická epilepsia v detstve

Tuberózna skleróza

Neurologické lieky

Karbamazepín

Fenytoín

Diazepam

Kyselina valproová

Amitriptylín

Protizápalové lieky

Gentamicín

Streptomycín

Amikacín

Kanamycín

Dapson

Chlorochín

Primachinu

Sulfadiazínu

Izoniazid

Abakavir

Liek proti reumatologickým ochoreniam Azatioprín

Gastroenterologický liek Omeprazol

Liek na srdce Warfarín

Onkologické liekyMerkaptopurín

Tioguanín

19

Kategória ochorenia KategóriaNázov ochorenia Liečivo

Novorodenecký genetický test

50 genetických ochorení Farmakogenomika 20-tich liekov

210x297_brozura_nova.indd 20210x297_brozura_nova.indd 20 15/02/17 13:2815/02/17 13:28

Page 20: Novorodenecký genetický testPrečo novorodenecký genetický test NovaTM? Každý rok sa na svete narodí až 7,9 mil. detí s vrodenými chybami *, aj keď sa tesne po narodení

Novorodenecký genetický test

Nova™ je obchodná značka spoločnosti BGI. Všetky práva vyhradené. Informácie sú určené len pre kvalifi kovaných poskytovateľov zdravotnej starostlivosti.Informácie nemajú nahradiť odborné lekárske poradenstvo. Slúžia len na referenčné účely.

Novorodenecký genetický test Nova™ zisťuje prítomnosť mutácií, ktoré súvisia so špecifi ckými genetickými ochoreniami uvedenými v zozname. Úlohou novorodeneckého genetického testu Nova™ je zistiť, u ktorých novorodencov je vyššia pravdepodobnosť výskytu jedného z uvedených genetických ochorení. Ak výsledky testu potvrdia prítomnosť jednej z mutácií, ďalšie testy na defi nitívne potvrdenie diagnostikovania akéhokoľvek ochorenia by mal vykonať výlučne kvalifi kovaný lekár. Akúkoľvek liečbu pacienta vrátane predpisovania liekov by mal odporučiť a poskytnúť výlučne kvalifi kovaný poskytovateľ zdravotnej starostlivosti. Spoločnosť BGI odporúča, aby sa pacientom / zákonným zástupcom poskytovalo nedirektívne poradenstvo a usmernenie v oblasti genetiky pred vykonávaním akéhokoľvek genetického skríningu a tiež následne pri prechádzaní výsledkov s pacientom / zákonným zástupcom. Presnosť genetického skríningu môže ovplyvňovať niekoľko klinických faktorov. Preto by sa výsledky testov vždy mali interpretovať v kontexte ďalších klinických informácií a rodinnej anamnézy pacienta. Pred skríningom je vždy potrebné získať informovaný súhlas od pacienta / zákonného zástupcu.

Distribučný partner pre Slovensko:

Zentya, a.s. Grösslingova 4, 811 09 Bratislava, Slovensko

+421 915 918 257

[email protected]

210x297_brozura_nova.indd 1210x297_brozura_nova.indd 1 15/02/17 13:2815/02/17 13:28