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Online Supporting Information S2. List of the 12,810 functional domain names in the SMART database. 14_3_3 35EXOc 4.1m 53EXOc A1pp A4_EXTRA AAA AAA_PrkA AAI Aamy Aamy_C AARP2CN acidPPc ACR ACTIN ADEAMc Adenylsucc_synt ADF Ad_cyc_g-alpha AFOR_N Agenet Agglutinin Agouti AgrB AgrD Agro_virD5 AGTRAP AHS1 AHS2 AICARFT_IMPCHas AIP3 AKAP_110 ALBUMIN alkPPc Alpha-amyl_C2 Alpha-L-AF_C Alpha-mann_mid Alpha_adaptinC2 Alpha_kinase Alpha_L_fucos Alpha_TIF

AMA-1 Amb_all Amb_V_allergen Amelin Amelogenin Ami_2 Ami_3 AMOP ANATO ANK ANX AP2 AP2Ec APPLE AraC_E_bind ARF ArfGap ARM Asparaginase AT_hook Autotransporter AWS AXH A_amylase_inhib B3_4 B41 B5 B561 BACK Bac_DnaA_C BAG BAH BAR BASIC BATS BBC BBOX BCL BH4 BHL BID_1

BID_2 Biotin_carb_C BIR BMC BON BowB BPI1 BPI2 BRCT BRIGHT Brix BRK BRLZ BROMO BSD BTB btg1 BTK BTP B_lectin C1 C1Q C2 C345C C4 C8 CA CAD CADG CALCITONIN calpain_III Calx_beta CAP10 CARD CARP CASc CASH Cation_ATPase_N CBD_II CBD_IV CBF

Supplementary Material (ESI) for Molecular BioSystemsThis journal is (c) The Royal Society of Chemistry, 2011

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CBS CCP CENPB CFEM CH CHAD CheW CHK CHRD CHROMO ChSh ChtBD1 ChtBD2 ChtBD3 ChW Citrate_ly_lig CLa CLb CLECT CLH CLIP CM_2 CNH cNMP CNX CoA_binding CoA_trans CobW_C Cog4 coiled_coil_region COLFI COLIPASE CPDc Cpn10 CRA CRF CSF2 CSP CT CTLH CTNS CUB CUE CULLIN

Cullin_Nedd8 Cupin_1 Cu_FIST CW CxxC_CXXC_SSSS CY CYCc CYCLIN CysPc D5_N Dabb DAGKa DAGKc DALR_1 DALR_2 DAX DCD DCX dDENN DDT DEATH DED DEFSN DENN DEP DEXDc DEXDc2 DEXDc3 DISIN DM DM10 DM11 DM13 DM14 DM15 DM16 DM3 DM4_12 DM5 DM6 DM7 DM8 DM9 DnaG_DnaB_bind

DnaJ DNaseIc DoH DPBB_1 DSL DSPc DSRM DUSP DWA DWB DYNc DysFC DysFN DZF EAL EB_dh EF1_GNE EFG_C EFG_IV EFh EGF EGF_CA EGF_Lam EGF_like EH eIF1a eIF2B_5 eIF5C eIF6 EKR ELFV_dehydrog Elong-fact-P_C Elp3 END ENDO3c Endonuclease_NS ENTH EPEND EPH_lbd ERCC4 ETF ETS Excalibur EXOIII


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EZ_HEAT FA58C FABD Fapy_DNA_glyco FAS1 FBD FBG FBOX fCBD FCD FCH FDX-ACB FeoA FES Fe_hyd_SSU FF FGF FH FH2 FHA FIMAC FIST Flavin_Reduct Flavokinase Flu_M1_C FMN_bind FN1 FN2 FN3 FolB FOLN FRG FRI FTP FtsA Ftsk_gamma FU Fungal_trans FYRC FYRN FYVE G2F GA GAF

Gal-bind_lectin GAL4 Galanin GAS2 GASTRIN GatB_Yqey GDNF GED GEL Germane GGDEF GGL GHA GHB GIT GIYc GLA GLECT GLUCA Glyco_10 Glyco_18 Glyco_25 Glyco_32 GoLoco GPS Gp_dh_N GRAM GRAN Grip GS GuKc GYF GYR G_alpha G_patch H15 H2A H2B H3 H4 HA2 Haemagg_act HALZ HAMP

HAT HATPase_c HDAC_interact HDc HECTc HELICc HELICc2 HELICc3 HEPN HhH1 HhH2 HintC HintN HIRAN HisKA HLH HMG HMG17 HNHc HNS HOLI HormR HOX HPT Hr1 HRDC HSA HSF HTH_ARAC HTH_ARSR HTH_ASNC HTH_CRP HTH_DEOR HTH_DTXR HTH_GNTR HTH_ICLR HTH_LACI HTH_LUXR HTH_MARR HTH_MERR HTH_XRE HTTM HWE_HK HX


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HYDRO IB IBN_N IBR IDEAL IENR1 IENR2 IFabd IG IGc1 IGc2 IGv IG_FLMN IG_like IL1 IL10 IL2 IL4_13 IL6 IL7 IlGF ILWEQ INB Inhibitor_I29 Int_alpha IPPc IPT IQ IRF IRO ITAM JAB_MPN Jacalin JHBP JmjC JmjN KAZAL Kelch KH KIND KISc Knot1 KOW KR

KRAB KU Ku78 L27 L51_S25_CI-B8 LA Lactamase_B LamB LamG LamGL LamNT LCCL LDLa LEM LeuA_dimer LH2 LIF_OSM LIGANc Lig_chan-Glu_bd LIM LINK LisH LITAF LMWPc LNS2 LON LPD_N LRR LRRcap LRRCT LRRNT LRR_BAC LRR_CC LRR_RI LRR_SD22 LRR_TYP LU LY LysM LytTR LYZ1 LYZ2 MA MA3

MACPF Mad3_BUB1_I MADF MADS Malic_M MAM MANEC MATH MBD MBT MbtH MCM MD MeTrc MGS MgtE_N MHC_II_alpha MHC_II_beta MIF4G MIR MIT ML MltA MoCF_biosynth Molybdop_Fe4S4 MORN MR_MLE Mterf MutH MutL_C MUTSac MUTSd MYSc MyTH4 NADH-G_4Fe-4S_3 NADH_4Fe-4S NAT_PEP NDK NEAT NEBU NEUZ Nfu_N NGF NGN


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NH NIDO NIL NL NMU NOSIC NPCBM NRF NTR NUC NurA OLF OMPdecase OmpH ORANGE OSTEO P-II P4Hc PA14 PA2c PAC PAH PAM PAN_AP ParB PAS PASTA PAW PAX PAZ PB1 PBD PbH1 PBP5_C PBPb PBPe PCRF PD PDGF PDZ Pept_C1 PepX_C PepX_N Pfam:1-cysPrx_C

Pfam:120_Rick_ant Pfam:14-3-3 Pfam:2-Hacid_dh Pfam:2-Hacid_dh_C Pfam:2-oxoacid_dh Pfam:2-ph_phosp Pfam:2CSK_N Pfam:2C_adapt Pfam:2Fe-2S_Ferredox Pfam:2H-phosphodiest Pfam:2HCT Pfam:2OG-FeII_Oxy Pfam:2_5_RNA_ligase Pfam:3-alpha Pfam:3-dmu-9_3-mt Pfam:3-HAO Pfam:3-PAP Pfam:3A Pfam:3Beta_HSD Pfam:3D Pfam:3H Pfam:3HBOH Pfam:3HCDH Pfam:3HCDH_N Pfam:3_5_exonuc Pfam:4F5 Pfam:4HBT Pfam:4_1_CTD Pfam:5-FTHF_cyc-lig Pfam:5-nucleotidase Pfam:53-BP1_Tudor Pfam:5HT_transporter Pfam:5TM-5TMR_LYT Pfam:5_3_exonuc Pfam:5_3_exonuc_N Pfam:5_nucleotid Pfam:5_nucleotid_C Pfam:60KD_IMP Pfam:6PF2K Pfam:6PGD Pfam:7kD_coat Pfam:7kD_DNA_binding Pfam:7TM-7TMR_HD Pfam:7TMR-DISMED2

Pfam:7TMR-DISM_7TM Pfam:7TMR-HDED Pfam:7tm_1 Pfam:7tm_2 Pfam:7tm_3 Pfam:7tm_6 Pfam:7tm_7 Pfam:7TM_GPCR_Sra Pfam:7TM_GPCR_Srab Pfam:7TM_GPCR_Srb Pfam:7TM_GPCR_Srbc Pfam:7TM_GPCR_Srd Pfam:7TM_GPCR_Srh Pfam:7TM_GPCR_Sri Pfam:7TM_GPCR_Srj Pfam:7TM_GPCR_Srsx Pfam:7TM_GPCR_Srt Pfam:7TM_GPCR_Sru Pfam:7TM_GPCR_Srv Pfam:7TM_GPCR_Srw Pfam:7TM_GPCR_Srx Pfam:7TM_GPCR_Srz Pfam:7TM_GPCR_Str Pfam:87kDa_TransP Pfam:A-2_8-polyST Pfam:A1_Propeptide Pfam:A2L_zn_ribbon Pfam:A2M Pfam:A2M_comp Pfam:A2M_N Pfam:A2M_N_2 Pfam:A2M_recep Pfam:A4_EXTRA Pfam:AAA Pfam:AAA-ATPase_like Pfam:AAA_2 Pfam:AAA_3 Pfam:AAA_4 Pfam:AAA_5 Pfam:AAA_PrkA Pfam:AalphaY_MDB Pfam:AAL_decarboxy Pfam:AAR2 Pfam:AARP2CN


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Pfam:AAT Pfam:AATase Pfam:AA_kinase Pfam:AA_permease Pfam:AA_permease_N Pfam:Aa_trans Pfam:ABA_GPCR Pfam:ABA_WDS Pfam:ABC-3 Pfam:ABC1 Pfam:ABC2_membrane Pfam:ABC_ATPase Pfam:ABC_cobalt Pfam:ABC_membrane Pfam:ABC_membrane_2 Pfam:ABC_sub_bind Pfam:ABC_tran Pfam:ABC_transp Pfam:ABC_transp_aux Pfam:Abdominal-A Pfam:AbfB Pfam:ABG_transport Pfam:Abhydrolase_1 Pfam:Abhydrolase_2 Pfam:Abhydrolase_3 Pfam:Abhydrolase_4 Pfam:Abhydro_lipase Pfam:Abi Pfam:Abi_2 Pfam:Abi_HHR Pfam:ABM Pfam:Abp2 Pfam:ACBP Pfam:ACCA Pfam:ACC_central Pfam:AceK Pfam:Acetate_kinase Pfam:AcetDehyd-dimer Pfam:Acetone_carb_G Pfam:AcetylCoA_hydro Pfam:Acetyltransf_1 Pfam:Acetyltransf_2 Pfam:AChE_tetra Pfam:Acid_phosphat_A

Pfam:Acid_phosphat_B Pfam:Aconitase Pfam:Aconitase_2_N Pfam:Aconitase_B_N Pfam:Aconitase_C Pfam:ACOX Pfam:ACP Pfam:Acp26Ab Pfam:ACP53EA Pfam:ACPS Pfam:ACP_syn_III Pfam:ACP_syn_III_C Pfam:ACR_tran Pfam:ACT Pfam:Act-Frag_cataly Pfam:ActA Pfam:ACTH_domain Pfam:Actin Pfam:Activator-TraM Pfam:Activator_LAG-3 Pfam:Activin_recp Pfam:Acyl-ACP_TE Pfam:Acyl-CoA_dh_1 Pfam:Acyl-CoA_dh_2 Pfam:Acyl-CoA_dh_M Pfam:Acyl-CoA_dh_N Pfam:Acyl-thio_N Pfam:AcylCoA_dehyd_C Pfam:AcylCoA_DH_N Pfam:Acylphosphatase Pfam:Acyltransferase Pfam:Acyl_CoA_thio Pfam:Acyl_transf_1 Pfam:Acyl_transf_2 Pfam:Acyl_transf_3 Pfam:AD Pfam:Ada3 Pfam:ADAM_CR Pfam:ADAM_spacer1 Pfam:Adaptin_binding Pfam:Adaptin_N Pfam:Adap_comp_sub Pfam:Ada_Zn_binding Pfam:ADC

Pfam:Adenine_glyco Pfam:Adenosine_kin Pfam:Adeno_100 Pfam:Adeno_52K Pfam:Adeno_E1A Pfam:Adeno_E1B_19K Pfam:Adeno_E1B_55K Pfam:Adeno_E1B_55K_N Pfam:Adeno_E3 Pfam:Adeno_E3A Pfam:Adeno_E3B Pfam:Adeno_E3_14_5 Pfam:Adeno_E3_15_3 Pfam:Adeno_E3_CR1 Pfam:Adeno_E3_CR2 Pfam:Adeno_E4 Pfam:Adeno_E4_34 Pfam:Adeno_E4_ORF3 Pfam:Adeno_GP19K Pfam:Adeno_hexon Pfam:Adeno_hexon_C Pfam:Adeno_IVa2 Pfam:Adeno_knob Pfam:Adeno_Penton_B Pfam:Adeno_PIX Pfam:Adeno_PV Pfam:Adeno_PVIII Pfam:Adeno_PX Pfam:Adeno_shaft Pfam:Adeno_terminal Pfam:Adeno_VII Pfam:Adenylate_cycl Pfam:Adenylsucc_synt Pfam:Adenyl_transf Pfam:Adhes-Ig_like Pfam:Adhesin_Dr Pfam:Adhesin_P1 Pfam:ADH_N Pfam:adh_short Pfam:ADH_zinc_N Pfam:ADIP Pfam:Adipokin_hormo Pfam:ADK Pfam:ADK_lid


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Pfam:AdoHcyase Pfam:AdoHcyase_NAD Pfam:AdoMetDC_leader Pfam:AdoMet_dc Pfam:AdoMet_MTase Pfam:AdoMet_Synthase Pfam:ADP_PFK_GK Pfam:ADP_ribosyl_GH Pfam:ADSL_C Pfam:Ad_cyc_g-alpha Pfam:Aegerolysin Pfam:Aerolysin Pfam:AF-4 Pfam:AfaD Pfam:AFG1_ATPase Pfam:AflR Pfam:AFOR_C Pfam:AFOR_N Pfam:AFP Pfam:AfsA Pfam:AFT Pfam:Aft1_HRA Pfam:Aft1_HRR Pfam:Aft1_OSA Pfam:AftA_C Pfam:AftA_N Pfam:Ag332 Pfam:Agenet Pfam:Agglutinin Pfam:Agouti Pfam:Ago_hook Pfam:AgrB Pfam:AgrD Pfam:Agro_virD5 Pfam:AGT Pfam:AGTRAP Pfam:Aha1_N Pfam:AhpC-TSA Pfam:AHS1 Pfam:AHS2 Pfam:AHSA1 Pfam:AHSP Pfam:AICARFT_IMPCHas Pfam:AIG1

Pfam:AIG2 Pfam:Ail_Lom Pfam:AIP3 Pfam:AIPR Pfam:AIRC Pfam:AIRS Pfam:AIRS_C Pfam:AKAP7_NLS Pfam:AKAP7_RIRII_bdg Pfam:AKAP95 Pfam:AKAP_110 Pfam:AKNA Pfam:ALAD Pfam:AlaDh_PNT_C Pfam:AlaDh_PNT_N Pfam:Ala_racemase_C Pfam:Ala_racemase_N Pfam:Alb1 Pfam:Alba Pfam:Albumin_I Pfam:AlcB Pfam:AlcCBM31 Pfam:Aldedh Pfam:Aldolase Pfam:Aldolase_II Pfam:Aldose_epim Pfam:Aldo_ket_red Pfam:Ald_Xan_dh_C Pfam:Ald_Xan_dh_C2 Pfam:ALF Pfam:Alg14 Pfam:ALG3 Pfam:Alg6_Alg8 Pfam:AlgF Pfam:Alginate_lyase Pfam:Alginate_lyase2 Pfam:AlkA_N Pfam:Alk_phosphatase Pfam:Allantoicase Pfam:Allatostatin Pfam:Allene_ox_cyc Pfam:Allexi_40kDa Pfam:Alliinase_C Pfam:ALMT

Pfam:ALO Pfam:Alpha-2-MRAP_C Pfam:Alpha-2-MRAP_N Pfam:Alpha-amylase Pfam:Alpha-amylase_C Pfam:Alpha-amylase_N Pfam:Alpha-amyl_C Pfam:Alpha-amyl_C2 Pfam:Alpha-L-AF_C Pfam:Alpha-mann_mid Pfam:AlphaC_N Pfam:Alpha_adaptinC2 Pfam:Alpha_adaptin_C Pfam:Alpha_E1_glycop Pfam:Alpha_E2_glycop Pfam:Alpha_E3_glycop Pfam:Alpha_GJ Pfam:Alpha_kinase Pfam:Alpha_L_fucos Pfam:Alpha_TIF Pfam:Alph_Pro_TM Pfam:ALS_ss_C Pfam:Alum_res Pfam:Alveol-reg_P311 Pfam:AMA-1 Pfam:Amastin Pfam:Amb_V_allergen Pfam:Amdo_NSP Pfam:Amelin Pfam:Amelogenin Pfam:amfpi-1 Pfam:AMH_N Pfam:Amidase Pfam:Amidase02_C Pfam:Amidase_2 Pfam:Amidase_3 Pfam:Amidase_5 Pfam:Amidinotransf Pfam:Amidohydro_1 Pfam:Amidohydro_2 Pfam:Amidohydro_3 Pfam:Amidoligase_2 Pfam:Amido_AtzD_TrzD Pfam:AMIN


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Pfam:Aminoglyc_resit Pfam:Aminotran_1_2 Pfam:Aminotran_3 Pfam:Aminotran_4 Pfam:Aminotran_5 Pfam:Amino_oxidase Pfam:AmiS_UreI Pfam:AMMECR1 Pfam:Ammonium_transp Pfam:AMNp_N Pfam:AMO Pfam:AmoA Pfam:AmoC Pfam:AMOP Pfam:AMP-binding Pfam:AMPKBI Pfam:AMP_N Pfam:ANATO Pfam:Androgen_recep Pfam:Anemone_cytotox Pfam:AnfG_VnfG Pfam:AnfO_nitrog Pfam:ANF_receptor Pfam:Angiomotin_C Pfam:Ank Pfam:ANKH Pfam:Annexin Pfam:Anoctamin Pfam:Anophelin Pfam:ANP Pfam:Anp1 Pfam:ANT Pfam:AntA Pfam:ANTAR Pfam:ANTH Pfam:Anthrax-tox_M Pfam:Anthrax_toxA Pfam:Anth_Ig Pfam:Anth_synt_I_N Pfam:Anti-adapt_IraP Pfam:Antibiotic_NAT Pfam:Anticodon_1 Pfam:Antifungal_pept Pfam:Antifungal_prot

Pfam:Antigen_Bd37 Pfam:Antig_Caf1 Pfam:Antimicrobial10 Pfam:Antimicrobial11 Pfam:Antimicrobial12 Pfam:Antimicrobial13 Pfam:Antimicrobial14 Pfam:Antimicrobial15 Pfam:Antimicrobial17 Pfam:Antimicrobial18 Pfam:Antimicrobial19 Pfam:Antimicrobial20 Pfam:Antimicrobial_1 Pfam:Antimicrobial_2 Pfam:Antimicrobial_3 Pfam:Antimicrobial_4 Pfam:Antimicrobial_5 Pfam:Antimicrobial_6 Pfam:Antimicrobial_7 Pfam:Antimicrobial_8 Pfam:Antimicrobial_9 Pfam:Antirestrict Pfam:Antistasin Pfam:Antiterm Pfam:Ant_C Pfam:An_peroxidase Pfam:AOX Pfam:AP2 Pfam:ApbA Pfam:ApbA_C Pfam:ApbE Pfam:APC10 Pfam:Apc13p Pfam:Apc15p Pfam:APC2 Pfam:APC8 Pfam:APC_15aa Pfam:APC_basic Pfam:APC_CDC26 Pfam:APC_crr Pfam:APG12 Pfam:APG17 Pfam:APG5 Pfam:APG6

Pfam:APG9 Pfam:APH Pfam:Aph-1 Pfam:aPHC Pfam:APH_6_hur Pfam:API5 Pfam:Apidaecin Pfam:Apis_Csd Pfam:Apo-CII Pfam:Apo-CIII Pfam:Apo-VLDL-II Pfam:ApoA-II Pfam:ApoB100_C Pfam:APOBEC_C Pfam:APOBEC_N Pfam:ApoC-I Pfam:Apocytochr_F_C Pfam:ApoL Pfam:Apolipoprotein Pfam:ApoLp-III Pfam:ApoM Pfam:ApoO Pfam:APP_amyloid Pfam:APS-reductase_C Pfam:APS_kinase Pfam:APT Pfam:Apt1 Pfam:Apyrase Pfam:AP_endonuc_2 Pfam:AP_endonuc_2_N Pfam:ARA70 Pfam:ArabFuran-catal Pfam:Arabinose_Isome Pfam:Arabinose_Iso_C Pfam:Arabinose_trans Pfam:AraC_binding Pfam:AraC_E_bind Pfam:AraC_N Pfam:Arb1 Pfam:Arb2 Pfam:Arc Pfam:Archease Pfam:Arch_ATPase Pfam:Arch_flagellin


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Pfam:Arch_fla_DE Pfam:Arc_PepC Pfam:Arc_PepC_II Pfam:Arc_trans_TRASH Pfam:ARD Pfam:ArdA Pfam:AreA_N Pfam:Arena_glycoprot Pfam:Arena_nucleocap Pfam:Arena_RNA_pol Pfam:Arf Pfam:Arfaptin Pfam:ArfGap Pfam:Arginase Pfam:Arginosuc_synth Pfam:ArgJ Pfam:ArgK Pfam:Argos Pfam:Arg_repressor Pfam:Arg_repressor_C Pfam:Arg_tRNA_synt_N Pfam:ARID Pfam:Arif-1 Pfam:ARL2_Bind_BART Pfam:Arm Pfam:Armet Pfam:AroM Pfam:Aromatic_hydrox Pfam:ARPC4 Pfam:Arrestin_C Pfam:Arrestin_N Pfam:ARS2 Pfam:ArsA_ATPase Pfam:ArsB Pfam:ArsC Pfam:ArsD Pfam:ArsR Pfam:ART Pfam:Arteri_env Pfam:Arteri_Gl Pfam:Arteri_GP4 Pfam:Arteri_nucleo Pfam:Arv1 Pfam:Arylesterase

Pfam:Arylsulfotrans Pfam:ASC Pfam:ASCH Pfam:ASD1 Pfam:ASD2 Pfam:ASF1_hist_chap Pfam:ASFV_360 Pfam:ASFV_J13L Pfam:ASFV_L11L Pfam:ASFV_p27 Pfam:AsiA Pfam:ASL_C Pfam:AsmA Pfam:AsnA Pfam:AsnC_trans_reg Pfam:Asn_synthase Pfam:Asp Pfam:Asp-Al_Ex Pfam:Asp-B-Hydro_N Pfam:Asparaginase Pfam:Asparaginase_2 Pfam:Asparaginase_II Pfam:Asp_Arg_Hydrox Pfam:Asp_decarbox Pfam:Asp_Glu_race Pfam:Asp_protease Pfam:Asr Pfam:ASRT Pfam:AstA Pfam:Astacin Pfam:AstB Pfam:AstE_AspA Pfam:Astro_capsid Pfam:Astro_capsid_p Pfam:ATE_C Pfam:ATE_N Pfam:ATG11 Pfam:ATG13 Pfam:ATG16 Pfam:ATG22 Pfam:ATG27 Pfam:Atg31 Pfam:ATG_C Pfam:ATHILA

Pfam:ATLF Pfam:ATP-cone Pfam:ATP-grasp Pfam:ATP-grasp_2 Pfam:ATP-grasp_3 Pfam:ATP-gua_Ptrans Pfam:ATP-gua_PtransN Pfam:ATP-sulfurylase Pfam:ATP-synt Pfam:ATP-synt_10 Pfam:ATP-synt_8 Pfam:ATP-synt_A Pfam:ATP-synt_ab Pfam:ATP-synt_ab_C Pfam:ATP-synt_ab_N Pfam:ATP-synt_B Pfam:ATP-synt_C Pfam:ATP-synt_D Pfam:ATP-synt_DE Pfam:ATP-synt_DE_N Pfam:ATP-synt_E Pfam:ATP-synt_Eps Pfam:ATP-synt_E_2 Pfam:ATP-synt_F Pfam:ATP-synt_F6 Pfam:ATP-synt_G Pfam:ATP-synt_J Pfam:ATP-synt_S1 Pfam:ATP11 Pfam:ATP12 Pfam:ATP1G1_PLM_MAT8 Pfam:ATPase-cat_bd Pfam:ATPase_gene1 Pfam:ATP_bind_1 Pfam:ATP_bind_2 Pfam:ATP_bind_3 Pfam:ATP_bind_4 Pfam:ATP_Ca_trans_C Pfam:ATP_sub_h Pfam:ATP_synt_H Pfam:ATP_synt_I Pfam:ATP_transf Pfam:Atracotoxin Pfam:Atrophin-1


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Pfam:ATS3 Pfam:Attachment_P66 Pfam:Attacin_C Pfam:Attacin_N Pfam:Attractin Pfam:Atu4866 Pfam:Atx10homo_assoc Pfam:ATXN-1_C Pfam:ATX_III Pfam:AT_hook Pfam:AurF Pfam:Aurora-A_bind Pfam:Autoind_bind Pfam:Autoind_synth Pfam:Autophagy_act_C Pfam:Autophagy_Cterm Pfam:Autophagy_N Pfam:Autotransporter Pfam:Auto_anti-p27 Pfam:Auxin_BP Pfam:Auxin_inducible Pfam:Auxin_repressed Pfam:Auxin_resp Pfam:AUX_IAA Pfam:Avian_gp85 Pfam:Avidin Pfam:AviRa Pfam:Avirulence Pfam:Avl9 Pfam:AvrB_AvrC Pfam:AvrD Pfam:AvrE Pfam:AvrL567-A Pfam:AvrPphF-ORF-2 Pfam:AvrPto Pfam:AvrPtoB-E3_ubiq Pfam:AvrRpt-cleavage Pfam:Av_adeno_fibre Pfam:AWPM-19 Pfam:AXE1 Pfam:AXH Pfam:Axin_b-cat_bind Pfam:Ax_dynein_light Pfam:AzlC

Pfam:AzlD Pfam:A_amylase_inhib Pfam:A_deamin Pfam:A_deaminase Pfam:A_deaminase_N Pfam:A_thal_3526 Pfam:B Pfam:B-block_TFIIIC Pfam:B1 Pfam:B12-binding Pfam:B12-binding_2 Pfam:B12D Pfam:B2 Pfam:B2-adapt-app_C Pfam:B3 Pfam:B3_4 Pfam:B5 Pfam:B56 Pfam:B9 Pfam:BA14K Pfam:BAALC_N Pfam:BAAT_C Pfam:BacA Pfam:Bacillus_HBL Pfam:Bacillus_PapR Pfam:BACK Pfam:bact-PGI_C Pfam:BacteriocIIc_cy Pfam:Bacteriocin_II Pfam:Bacteriocin_IIc Pfam:Bacteriocin_IId Pfam:Bacteriocin_IIi Pfam:Bact_transglu_N Pfam:Baculo_11_kDa Pfam:Baculo_19 Pfam:Baculo_44 Pfam:Baculo_8kDa Pfam:Baculo_DNA_bind Pfam:Baculo_E25 Pfam:Baculo_E56 Pfam:Baculo_E66 Pfam:Baculo_FP Pfam:Baculo_gp41 Pfam:Baculo_gp64

Pfam:Baculo_helicase Pfam:Baculo_IE-1 Pfam:Baculo_LEF-10 Pfam:Baculo_LEF-11 Pfam:Baculo_LEF-2 Pfam:Baculo_LEF-3 Pfam:Baculo_LEF5 Pfam:Baculo_LEF5_C Pfam:Baculo_ME53 Pfam:Baculo_ODV-E27 Pfam:Baculo_p24 Pfam:Baculo_p26 Pfam:Baculo_p33 Pfam:Baculo_p47 Pfam:Baculo_p48 Pfam:Baculo_p74 Pfam:Baculo_p74_N Pfam:Baculo_PEP_C Pfam:Baculo_PEP_N Pfam:Baculo_PP31 Pfam:Baculo_RING Pfam:Baculo_VP1054 Pfam:Baculo_VP39 Pfam:Baculo_VP91_N Pfam:Baculo_Y142 Pfam:Bac_chlorC Pfam:Bac_DnaA Pfam:Bac_DnaA_C Pfam:Bac_DNA_binding Pfam:Bac_export_1 Pfam:Bac_export_2 Pfam:Bac_export_3 Pfam:Bac_GDH Pfam:Bac_globin Pfam:Bac_luciferase Pfam:Bac_rhamnosid Pfam:Bac_rhamnosid_N Pfam:Bac_rhodopsin Pfam:Bac_small_YrzI Pfam:Bac_surface_Ag Pfam:Bac_thur_toxin Pfam:Bac_transf Pfam:Bac_Ubq_Cox Pfam:BAF


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Pfam:BcrAD_BadFG Pfam:BCS1_N Pfam:BcsB Pfam:BCSC_C Pfam:BDHCT Pfam:BDM Pfam:BDS_I_II Pfam:BDV_G Pfam:BDV_P10 Pfam:BDV_P24 Pfam:BDV_P40 Pfam:Beach Pfam:BEN Pfam:BenE Pfam:Benyvirus_14KDa Pfam:Benyvirus_P25 Pfam:BESS Pfam:Bestrophin Pfam:Beta-APP Pfam:Beta-Casp Pfam:Beta-lactamase Pfam:Beta-TrCP_D Pfam:Beta-trefoil Pfam:BetaGal_dom2 Pfam:Beta_elim_lyase Pfam:Beta_propel Pfam:BetR Pfam:Bet_v_1 Pfam:BEX Pfam:Bgal_small_N Pfam:BH4 Pfam:BHD_1 Pfam:BHD_2 Pfam:BHD_3 Pfam:BicD Pfam:BID Pfam:Big_1 Pfam:Big_2 Pfam:Big_3 Pfam:Big_4 Pfam:Bile_Hydr_Trans Pfam:Biliv-reduc_cat Pfam:Bim_N Pfam:Bin3

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12

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13

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Pfam:CesT Pfam:CfAFP Pfam:CFC Pfam:CFEM Pfam:CFIA_Pcf11 Pfam:CG-1 Pfam:Cg6151-P Pfam:CGGC Pfam:CGI-121 Pfam:Cgr1 Pfam:CgtA Pfam:CH Pfam:ChaB Pfam:ChaC Pfam:CHAD Pfam:Chagasin_I42 Pfam:Chalcone Pfam:Chal_sti_synt_C Pfam:Chal_sti_synt_N Pfam:Channel_Tsx Pfam:CHAP Pfam:chaperone_DMP Pfam:Chaperone_III Pfam:ChAPs Pfam:CHASE Pfam:CHASE2 Pfam:CHASE3 Pfam:CHASE4 Pfam:CHB_HEX Pfam:CHB_HEX_C Pfam:CHCH Pfam:CHD5 Pfam:CHDCT2 Pfam:CHDNT Pfam:CheB_methylest Pfam:CheC Pfam:CheD Pfam:CheF-arch Pfam:CheR Pfam:CheR_N Pfam:CheW Pfam:CheY-binding Pfam:CheZ Pfam:CHGN


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Pfam:ChiC Pfam:CHIPS Pfam:ChitinaseA_N Pfam:Chitin_bind_1 Pfam:Chitin_bind_3 Pfam:Chitin_bind_4 Pfam:Chitin_synth_1 Pfam:Chitin_synth_1N Pfam:Chitin_synth_2 Pfam:Chitosanase Pfam:CHL4 Pfam:ChlamPMP_M Pfam:Chlamy_scaf Pfam:Chlam_OMP Pfam:Chlam_OMP3 Pfam:Chlam_OMP6 Pfam:Chlam_PMP Pfam:Chlam_vir Pfam:Chloroa_b-bind Pfam:Chlorophyllase Pfam:Chlorosome_CsmC Pfam:Chlorovi_GP_rpt Pfam:Chlor_dismutase Pfam:CHMI Pfam:CholecysA-Rec_N Pfam:Choline_kinase Pfam:Choline_kin_N Pfam:Choline_sulf_C Pfam:Choline_transpo Pfam:Chol_subst-bind Pfam:Chon_Sulph_att Pfam:CHORD Pfam:Chordopox_A13L Pfam:Chordopox_A15 Pfam:Chordopox_A20R Pfam:Chordopox_A30L Pfam:Chordopox_A33R Pfam:Chordopox_A35R Pfam:Chordopox_E11 Pfam:Chordopox_G2 Pfam:Chordopox_G3 Pfam:Chordopox_L2 Pfam:Chordopox_RPO7 Pfam:Chorion_1

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Pfam:Coiled-coil_56 Pfam:Coleoptericin Pfam:COLFI Pfam:Colicin Pfam:ColicinD Pfam:Colicin_C Pfam:Colicin_D Pfam:Colicin_Ia Pfam:Colicin_im Pfam:Colicin_Pyocin Pfam:Colicin_V Pfam:Colipase Pfam:Colipase_C Pfam:Collagen Pfam:Collagen_bind Pfam:Collar Pfam:Col_cuticle_N Pfam:ComA Pfam:ComC Pfam:ComFB Pfam:ComJ Pfam:ComK Pfam:Como_LCP Pfam:Como_SCP Pfam:COMP Pfam:COMPASS-Shg1 Pfam:Competence Pfam:Competence_A Pfam:CompInhib_SCIN Pfam:Complex1_24kDa Pfam:Complex1_30kDa Pfam:Complex1_49kDa Pfam:Complex1_51K Pfam:Complex1_LYR Pfam:ComReg_Spx Pfam:ComX Pfam:ComZ Pfam:Con-6 Pfam:Condensation Pfam:Condensin2nSMC Pfam:Connexin Pfam:Connexin43 Pfam:Connexin50 Pfam:Connexin_CCC

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17

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Pfam:Crystallin Pfam:CS Pfam:CsbD Pfam:CSD Pfam:Cse1 Pfam:CSF-1 Pfam:CsgE Pfam:CsgG Pfam:CsiD Pfam:Csm1 Pfam:CsoS2_M Pfam:CsoSCA Pfam:CsrA Pfam:CST-I Pfam:CstA Pfam:CT20 Pfam:CtaG_Cox11 Pfam:Ctf8 Pfam:CTF_NFI Pfam:CTI Pfam:CtIP_N Pfam:CTK3 Pfam:CTK3_C Pfam:CtnDOT_TraJ Pfam:CTNNB1_binding Pfam:CTP-dep_RFKase Pfam:CTP_synth_N Pfam:CTP_transf_1 Pfam:CTP_transf_2 Pfam:CTP_transf_3 Pfam:Ctr Pfam:CtsR Pfam:CTV_P13 Pfam:CTV_P23 Pfam:CTV_P33 Pfam:CTV_P6 Pfam:CTX_RstB Pfam:Cu-binding_MopE Pfam:Cu-oxidase Pfam:Cu-oxidase_2 Pfam:Cu-oxidase_3 Pfam:Cu-oxidase_4 Pfam:Cu2_monooxygen Pfam:Cu2_monoox_C


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Pfam:CUB Pfam:CUB_2 Pfam:Cucumo_2B Pfam:Cucumo_coat Pfam:CUE Pfam:Cul7 Pfam:Cullin Pfam:Cullin_Nedd8 Pfam:Cupin_1 Pfam:Cupin_2 Pfam:Cupin_3 Pfam:Cupin_4 Pfam:Cupin_5 Pfam:Curlin_rpt Pfam:Curto_V2 Pfam:Curto_V3 Pfam:CusF_Ec Pfam:CUT Pfam:Cut12 Pfam:Cut8 Pfam:CutA1 Pfam:CutC Pfam:Cuticle_1 Pfam:Cuticle_2 Pfam:Cuticle_3 Pfam:Cutinase Pfam:Cu_amine_oxid Pfam:Cu_amine_oxidN1 Pfam:Cu_amine_oxidN2 Pfam:Cu_amine_oxidN3 Pfam:Cu_bind_like Pfam:CVNH Pfam:Cw-hydrolase Pfam:CWC25 Pfam:cwf18 Pfam:cwf21 Pfam:CwfJ_C_1 Pfam:CwfJ_C_2 Pfam:Cwf_Cwc_15 Pfam:CW_binding_1 Pfam:CW_binding_2 Pfam:CX Pfam:CXC Pfam:CXCR4_N

Pfam:CXCXC Pfam:CxxC_CxxC_SSSS Pfam:Cyanate_lyase Pfam:CybS Pfam:Cyc-maltodext_C Pfam:Cyc-maltodext_N Pfam:Cyclase Pfam:Cyclase_polyket Pfam:Cyclin Pfam:Cyclin_C Pfam:Cyclin_N Pfam:Cyclotide Pfam:Cyd_oper_YbgE Pfam:Cypo_polyhedrin Pfam:CysG_dimeriser Pfam:Cystatin Pfam:Cys_knot Pfam:Cys_Met_Meta_PP Pfam:Cys_rich_FGFR Pfam:Cyt-b5 Pfam:CytadhesinP1 Pfam:Cytadhesin_P30 Pfam:CytB6-F_Fe-S Pfam:CYTH Pfam:Cytidylate_kin Pfam:CytochromB561_N Pfam:Cytochrome-c551 Pfam:Cytochrome_cB Pfam:Cytochrom_B558a Pfam:Cytochrom_B559 Pfam:Cytochrom_B559a Pfam:Cytochrom_B561 Pfam:Cytochrom_B562 Pfam:Cytochrom_B_C Pfam:Cytochrom_B_N Pfam:Cytochrom_C Pfam:Cytochrom_C1 Pfam:Cytochrom_C552 Pfam:Cytochrom_CIII Pfam:Cytochrom_C_2 Pfam:Cytochrom_C_asm Pfam:Cytochrom_D1 Pfam:Cytochrom_NNT Pfam:CytoC_RC

Pfam:Cytokin-bind Pfam:Cytokin_check_N Pfam:Cytomega_gL Pfam:Cytomega_TRL10 Pfam:Cytomega_UL20A Pfam:Cytomega_UL84 Pfam:Cytomega_US3 Pfam:Cytotoxic Pfam:Cyto_heme_lyase Pfam:Cyto_ox_2 Pfam:Cyt_c_ox_IV Pfam:C_GCAxxG_C_C Pfam:C_tripleX Pfam:D-aminoacyl_C Pfam:D123 Pfam:D5_N Pfam:Dabb Pfam:DAD Pfam:DAG1 Pfam:DAGAT Pfam:DAGK_acc Pfam:DAGK_cat Pfam:DAGK_prokar Pfam:DAHP_synth_1 Pfam:DAHP_synth_2 Pfam:Dak1 Pfam:Dak2 Pfam:Dala_Dala_lig_C Pfam:Dala_Dala_lig_N Pfam:DALR_1 Pfam:DALR_2 Pfam:Dam Pfam:DAN Pfam:DAO Pfam:DAP10 Pfam:DAP3 Pfam:DapB_C Pfam:DapB_N Pfam:DapD_N Pfam:DAP_B Pfam:DAP_C Pfam:DAP_epimerase Pfam:DARPP-32 Pfam:DASH_Ask1


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49

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50

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53

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56

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57

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Pfam:IspA Pfam:IspD Pfam:Ist1 Pfam:IstB Pfam:IstB_N Pfam:Isy1 Pfam:ITAM Pfam:ITAM_Cys-rich Pfam:ITI_HC_C Pfam:IucA_IucC Pfam:IU_nuc_hydro Pfam:Ivy Pfam:I_LWEQ Pfam:Jacalin Pfam:JHBP Pfam:JmjC Pfam:JmjN Pfam:Jnk-SapK_ap_N Pfam:Josephin Pfam:JTB Pfam:Jun Pfam:K-box Pfam:K-cyclin_vir_C Pfam:K1 Pfam:K167R Pfam:KA1 Pfam:KaiA Pfam:KaiB Pfam:KaiC Pfam:KAP Pfam:KapB Pfam:KAP_NTPase Pfam:KAR9 Pfam:KASH Pfam:KAT11 Pfam:Kazal_1 Pfam:Kazal_2 Pfam:KBP_C Pfam:KCl_Cotrans_1 Pfam:KcnmB2_inactiv Pfam:KCNQC3-Ank-G_bd Pfam:KCNQ_channel Pfam:KdgM Pfam:KdgT

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58

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59

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Pfam:Lipoprotein_Ltp Pfam:Lipoprotein_X Pfam:Lipoprot_C Pfam:Lipoxygenase Pfam:Lip_A_acyltrans Pfam:Lip_prot_lig_C Pfam:Lir1 Pfam:LisH Pfam:LktC Pfam:LLGL Pfam:LMBR1 Pfam:LMP Pfam:LMWPc Pfam:LMWSLP_N Pfam:LNS2 Pfam:LOH1CR12 Pfam:LolA Pfam:LolB Pfam:LON Pfam:Lon_C Pfam:LPAM_1 Pfam:LPP Pfam:Lpp-LpqN Pfam:LPP20 Pfam:LppC Pfam:LpxB Pfam:LpxC Pfam:LpxD Pfam:LpxK Pfam:LrgA Pfam:LrgB Pfam:LRRCT Pfam:LRRNT Pfam:LRRNT_2 Pfam:LRR_1 Pfam:LRR_2 Pfam:LRR_3 Pfam:LRR_adjacent Pfam:LRS4 Pfam:LRV Pfam:LRV_FeS Pfam:LSM Pfam:LsmAD Pfam:Lsm_interact

Pfam:LSPR Pfam:LSR Pfam:Lsr2 Pfam:LST1 Pfam:LT-IIB Pfam:LtrA Pfam:LTV Pfam:LTXXQ Pfam:LUC7 Pfam:Luciferase_3H Pfam:Luciferase_cat Pfam:Luciferase_N Pfam:Lum_binding Pfam:Lung_7-TM_R Pfam:Luteo_coat Pfam:Luteo_P1-P2 Pfam:Luteo_PO Pfam:Luteo_Vpg Pfam:LuxC Pfam:LuxE Pfam:LuxQ-periplasm Pfam:LuxS Pfam:LVIVD Pfam:Ly-6_related Pfam:Ly49 Pfam:Lyase_1 Pfam:Lyase_8 Pfam:Lyase_8_C Pfam:Lyase_8_N Pfam:Lyase_catalyt Pfam:Lyase_N Pfam:Lycopene_cycl Pfam:Lys Pfam:Lys-AminoMut_A Pfam:LysE Pfam:Lysine_decarbox Pfam:Lysis_col Pfam:Lysis_S Pfam:LysM Pfam:LysR_substrate Pfam:Lysyl_oxidase Pfam:LYTB Pfam:LytR_cpsA_psr Pfam:LytTR


60

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Pfam:MatP Pfam:Matrilin_ccoil Pfam:Matrix Pfam:MAT_Alpha1 Pfam:MauE Pfam:MazG Pfam:MBA1 Pfam:MBD Pfam:MbeB_N Pfam:MbeD_MobD Pfam:MBF1 Pfam:MBOAT Pfam:MBT Pfam:MbtH Pfam:MC1 Pfam:MCC-bdg_PDZ Pfam:MCD Pfam:MCE Pfam:MCH Pfam:MCLC Pfam:MCM Pfam:Mcm10 Pfam:MCM2_N Pfam:McpA_N Pfam:MCPsignal Pfam:MCPVI Pfam:MCP_N Pfam:McrBC Pfam:MCR_alpha Pfam:MCR_alpha_N Pfam:MCR_beta Pfam:MCR_beta_N Pfam:MCR_C Pfam:MCR_D Pfam:MCR_gamma Pfam:McyA_C Pfam:MdcE Pfam:MdcG Pfam:MDH Pfam:MDM31_MDM32 Pfam:MDMPI_C Pfam:MDMPI_N Pfam:MdoG Pfam:Mdv1


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Pfam:Med9 Pfam:MEF2_binding Pfam:Mei5 Pfam:Meiotic_rec114 Pfam:MEKHLA Pfam:MelC1 Pfam:Meleagrin Pfam:Melibiase Pfam:Melittin Pfam:Membralin Pfam:Membr_traf_MHD Pfam:Memo Pfam:MeMO_Hyd_G Pfam:Mem_trans Pfam:Menin Pfam:MENTAL Pfam:MepB Pfam:Mer2 Pfam:MerB Pfam:MerC Pfam:MerE Pfam:Merozoite_SPAM Pfam:MerR Pfam:MerR-DNA-bind Pfam:MerT Pfam:Mesd Pfam:Mesothelin Pfam:META Pfam:Metalloenzyme Pfam:Metallopep Pfam:Metallophos Pfam:Metallophos_C Pfam:Metallothio Pfam:Metallothionein Pfam:Metallothio_11 Pfam:Metallothio_2 Pfam:Metallothio_5 Pfam:Metallothio_7 Pfam:Metallothio_PEC Pfam:Metallothio_Pro Pfam:Metal_hydrol Pfam:Metaviral_G Pfam:Methuselah_N Pfam:Methylase_S

Pfam:MethylPyrKinase Pfam:MethyltransfD12 Pfam:Methyltransf_10 Pfam:Methyltransf_11 Pfam:Methyltransf_12 Pfam:Methyltransf_13 Pfam:Methyltransf_14 Pfam:Methyltransf_15 Pfam:Methyltransf_16 Pfam:Methyltransf_1N Pfam:Methyltransf_2 Pfam:Methyltransf_3 Pfam:Methyltransf_4 Pfam:Methyltransf_5 Pfam:Methyltransf_6 Pfam:Methyltransf_7 Pfam:Methyltransf_8 Pfam:Methyltransf_9 Pfam:Methyltransf_FA Pfam:Methyltrans_RNA Pfam:Methyltrans_SAM Pfam:MethyTransf_Reg Pfam:Meth_synt_1 Pfam:Meth_synt_2 Pfam:MetJ Pfam:MetRS-N Pfam:MetW Pfam:Met_10 Pfam:Met_asp_mut_E Pfam:Met_synt_B12 Pfam:MFAP1_C Pfam:MFMR Pfam:Mfp-3 Pfam:MFP2b Pfam:MFS_1 Pfam:MFS_Mycoplasma Pfam:MF_alpha Pfam:MF_alpha_N Pfam:Mg-por_mtran_C Pfam:MG1 Pfam:Mg296 Pfam:Mga Pfam:MGAT2 Pfam:MGC-24


62

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63

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Pfam:MRVI1 Pfam:MR_MLE Pfam:MR_MLE_N Pfam:MSA-2c Pfam:MSA_2 Pfam:MSC Pfam:MscL Pfam:MSG Pfam:Msg2_C Pfam:MSP Pfam:MSP1a Pfam:MSP1b Pfam:MSP1_C Pfam:MspA Pfam:Mss4 Pfam:MSSP Pfam:Mst1_SARAH Pfam:MSV199 Pfam:MS_channel Pfam:MT-A70 Pfam:MtaB Pfam:Mtc Pfam:MTD Pfam:mTERF Pfam:MtfA Pfam:MTH865 Pfam:MTHFR Pfam:MTHFR_C Pfam:MtlR Pfam:MtmB Pfam:MtN3_slv Pfam:Mtp Pfam:MTP18 Pfam:Mtr2 Pfam:MtrA Pfam:MtrB Pfam:MtrC Pfam:MtrD Pfam:MtrE Pfam:MtrF Pfam:MtrG Pfam:MtrH Pfam:MTS Pfam:MTS_N

Pfam:MttA_Hcf106 Pfam:MTTB Pfam:Mt_ATP-synt_B Pfam:Mt_ATP-synt_D Pfam:Mu-conotoxin Pfam:Mu-like_Com Pfam:Mu-like_gpT Pfam:Mu-like_Pro Pfam:Mu-transpos_C Pfam:MucBP Pfam:MucB_RseB Pfam:Mucin Pfam:Muc_lac_enz Pfam:MuDR Pfam:MUG2_C Pfam:MukB Pfam:MukE Pfam:MULE Pfam:Multi_Drug_Res Pfam:MurB_C Pfam:Mur_ligase Pfam:Mur_ligase_C Pfam:Mur_ligase_M Pfam:Mus7 Pfam:Musclin Pfam:Muskelin_N Pfam:MutH Pfam:MutL_C Pfam:MutS_I Pfam:MutS_II Pfam:MutS_III Pfam:MutS_IV Pfam:MutS_V Pfam:Mu_DNA_bind Pfam:Mu_I-gamma Pfam:Mu_transposase Pfam:Mvb12 Pfam:MVIN Pfam:MVL Pfam:MVP_shoulder Pfam:MxiH Pfam:MxiM Pfam:Myb_DNA-binding Pfam:Myb_DNA-bind_2


64

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Pfam:NADH5_C Pfam:NADHdeh_related Pfam:NADHdh Pfam:NADHdh-2_N Pfam:NADH_4Fe-4S Pfam:NADH_dehy_S2_C Pfam:NADH_oxidored Pfam:NADH_Oxid_Nqo15 Pfam:NADH_ub_rd_NUML Pfam:NADPH_Ox Pfam:NAD_binding_1 Pfam:NAD_binding_2 Pfam:NAD_binding_3 Pfam:NAD_binding_4 Pfam:NAD_binding_5 Pfam:NAD_binding_6 Pfam:NAD_Gly3P_dh_C Pfam:NAD_Gly3P_dh_N Pfam:NAD_kinase Pfam:NAD_synthase Pfam:NaeI Pfam:NAF Pfam:NAGidase Pfam:NAGLU Pfam:Nairovirus_M Pfam:Nairo_nucleo Pfam:NAM Pfam:NanE Pfam:Nanovirus_C8 Pfam:Nanovirus_coat Pfam:NAP Pfam:NapB Pfam:NapD Pfam:NapE Pfam:NAPRTase Pfam:NARG2_C Pfam:NARP1 Pfam:NAS Pfam:NatB_MDM20 Pfam:Na_Ala_symp Pfam:Na_Ca_ex Pfam:Na_H_antiporter Pfam:Na_H_antiport_1 Pfam:Na_H_Exchanger

Pfam:Na_K-ATPase Pfam:Na_Pi_cotrans Pfam:Na_sulph_symp Pfam:Na_trans_assoc Pfam:NB Pfam:NB-ARC Pfam:Nbl1_Borealin_N Pfam:NblA Pfam:NBP1 Pfam:Nbs1_C Pfam:NC Pfam:NCA2 Pfam:NCD1 Pfam:NCD2 Pfam:NCD3G Pfam:Nckap1 Pfam:Ndc1_Nup Pfam:Ndc80_HEC Pfam:NdhL Pfam:NdhM Pfam:NdhN Pfam:NdhO Pfam:NDK Pfam:Ndr Pfam:NDT80_PhoG Pfam:NDUFA12 Pfam:NDUFB10 Pfam:Ndufs5 Pfam:NDUF_B12 Pfam:NDUF_B4 Pfam:NDUF_B5 Pfam:NDUF_B6 Pfam:NDUF_B7 Pfam:NDUF_B8 Pfam:NDUF_C2 Pfam:NEAT Pfam:NeA_P2 Pfam:Nebulin Pfam:nec1 Pfam:Nefa_Nip30_N Pfam:Neil1-DNA_bind Pfam:Neisseria_PilC Pfam:Neisseria_TspB Pfam:NEMO


65

Pfam:Neocarzinostat Pfam:Neogenin_C Pfam:NEP Pfam:Nepo_coat Pfam:Nepo_coat_C Pfam:Nepo_coat_N Pfam:NERD Pfam:NESP55 Pfam:NeuB Pfam:Neugrin Pfam:Neur Pfam:Neuralized Pfam:Neural_ProG_Cyt Pfam:Neuregulin Pfam:Neurexophilin Pfam:Neurochondrin Pfam:Neurokinin_B Pfam:Neuromodulin Pfam:Neuromodulin_N Pfam:Neuroparsin Pfam:Neuro_bHLH Pfam:Neur_chan_LBD Pfam:Neur_chan_memb Pfam:Nexin_C Pfam:NfeD Pfam:NfI_DNAbd_pre-N Pfam:Nfu_N Pfam:NGF Pfam:NgoMIV_restric Pfam:NGP1NT Pfam:Nha1_C Pfam:NhaB Pfam:NHase_alpha Pfam:NHase_beta Pfam:NHL Pfam:NHR2 Pfam:Nic96 Pfam:Nicastrin Pfam:NICE-3 Pfam:NicO Pfam:NID Pfam:NIDO Pfam:NIF Pfam:Nif11

Pfam:NIF3 Pfam:NiFeSe_Hases Pfam:NifQ Pfam:NifT Pfam:NifU Pfam:NifU_N Pfam:NifW Pfam:NifZ Pfam:NikM Pfam:NikR_C Pfam:NIL Pfam:NinB Pfam:NinE Pfam:NinF Pfam:NinG Pfam:Ninjurin Pfam:NIPSNAP Pfam:NIP_1 Pfam:NIR_SIR Pfam:NIR_SIR_ferr Pfam:NIT Pfam:Nitrate_red_del Pfam:Nitrate_red_gam Pfam:Nitrophorin Pfam:Nitroreductase Pfam:Nitro_FeMo-Co Pfam:Nitr_red_assoc Pfam:Nit_Regul_Hom Pfam:Ni_hydr_CYTB Pfam:NKAIN Pfam:NKWYS Pfam:NLBH Pfam:NLE Pfam:NLPC_P60 Pfam:NlpE Pfam:nlz1 Pfam:NMD3 Pfam:NMDAR2_C Pfam:NMN_transporter Pfam:NmrA Pfam:NMT Pfam:NMT1 Pfam:NMT_C Pfam:NMU

Pfam:Nnf1 Pfam:NNMT_PNMT_TEMT Pfam:NnrS Pfam:NnrU Pfam:NOA36 Pfam:NOB1_Zn_bind Pfam:Noc2 Pfam:NOC3p Pfam:NOD Pfam:NodA Pfam:NODP Pfam:NodS Pfam:Nodulin Pfam:Nodulin-like Pfam:Nodulin_late Pfam:NodZ Pfam:Nod_GRP Pfam:Noelin-1 Pfam:NOG1 Pfam:NOGCT Pfam:Noggin Pfam:Nol1_Nop2_Fmu Pfam:NolV Pfam:NolX Pfam:Nop Pfam:Nop10p Pfam:Nop14 Pfam:Nop16 Pfam:Nop25 Pfam:Nop52 Pfam:Nop53 Pfam:NOP5NT Pfam:NOPS Pfam:NosD Pfam:NOSIC Pfam:NosL Pfam:Not1 Pfam:NOT2_3_5 Pfam:Not3 Pfam:Notch Pfam:NotI Pfam:Novirhabdo_Nv Pfam:NOZZLE Pfam:NO_synthase


66

Pfam:NP1-WLL Pfam:Npa1 Pfam:NPCBM Pfam:NPCBM_assoc Pfam:NPCC Pfam:NPD Pfam:NPDC1 Pfam:NPH3 Pfam:NPHI_C Pfam:NPIP Pfam:NPL4 Pfam:NPP Pfam:NPP1 Pfam:NPR Pfam:NPR1_like_C Pfam:NPR2 Pfam:NPR3 Pfam:NPV_P10 Pfam:NQR2_RnfD_RnfE Pfam:NQRA Pfam:NQRA_SLBB Pfam:Nramp Pfam:Nrap Pfam:Nrf1_activ_bdg Pfam:Nrf1_DNA-bind Pfam:NrfD Pfam:NRIF3 Pfam:NRPS Pfam:NS3_envE Pfam:Nse4 Pfam:Nse5 Pfam:NSF Pfam:Nsp1 Pfam:NSP10 Pfam:NSP11 Pfam:NSP13 Pfam:Nsp1_C Pfam:Nsp3 Pfam:Nsp3_PL2pro Pfam:nsp7 Pfam:nsp8 Pfam:nsp9 Pfam:NSs Pfam:NT5C

Pfam:NtA Pfam:NTase_sub_bind Pfam:NTF2 Pfam:NTNH_C Pfam:NTPase_I-T Pfam:NTPase_P4 Pfam:NTP_transferase Pfam:NTP_transf_2 Pfam:NTR Pfam:NuA4 Pfam:Nuc-transf Pfam:NUC129 Pfam:NUC130_3NT Pfam:NUC153 Pfam:NUC173 Pfam:NUC194 Pfam:NUC201 Pfam:NUC202 Pfam:NUC205 Pfam:Nuclease_act Pfam:Nucleocapsid-N Pfam:Nucleocap_ssRNA Pfam:Nucleolin_N Pfam:Nucleoplasmin Pfam:Nucleoporin2 Pfam:Nucleoporin_C Pfam:Nucleoporin_N Pfam:Nucleopor_Nup85 Pfam:Nucleoside_tran Pfam:Nucleos_tra2_C Pfam:Nucleos_tra2_N Pfam:Nucleotid_trans Pfam:Nucleo_LEF-12 Pfam:Nucleo_P87 Pfam:Nuc_deoxyrib_tr Pfam:Nuc_H_symport Pfam:Nuc_rec_co-act Pfam:Nuc_sug_transp Pfam:NUDE_C Pfam:NUDIX Pfam:NUDIX-like Pfam:Nudix_N Pfam:Nuf2 Pfam:NUFIP1

Pfam:NuiA Pfam:NumbF Pfam:NUMOD1 Pfam:NUMOD3 Pfam:NUMOD4 Pfam:NUP Pfam:Nup153 Pfam:Nup160 Pfam:Nup188 Pfam:NUP50 Pfam:Nup84_Nup100 Pfam:Nup88 Pfam:Nup96 Pfam:Nup_retrotrp_bd Pfam:NurA Pfam:NusA_N Pfam:NusB Pfam:NusG Pfam:Nyv1_N Pfam:N_methyl Pfam:O-FucT Pfam:OAD_beta Pfam:OAD_gamma Pfam:OapA Pfam:OapA_N Pfam:OAR Pfam:OAS1_C Pfam:OATP Pfam:OB_RNB Pfam:Occludin_ELL Pfam:OCD_Mu_crystall Pfam:OCIA Pfam:Ocnus Pfam:ocr Pfam:Octapeptide Pfam:Octopine_DH Pfam:Ocular_alb Pfam:ODC_AZ Pfam:ODV-E18 Pfam:OEP Pfam:Oest_recep Pfam:Ofd1_CTDD Pfam:OGFr_III Pfam:OGFr_N


67

Pfam:OGG_N Pfam:Ogr_Delta Pfam:OHCU_decarbox Pfam:OKR_DC_1 Pfam:OKR_DC_1_C Pfam:OKR_DC_1_N Pfam:Ole-e-6 Pfam:Oleosin Pfam:OLF Pfam:Olfactory_mark Pfam:oligo_HPY Pfam:Omega-toxin Pfam:Omega_Repress Pfam:Omp28 Pfam:OmpA Pfam:OmpA_membrane Pfam:OMPdecase Pfam:OmpH Pfam:Omptin Pfam:OmpW Pfam:OMS28_porin Pfam:OPA3 Pfam:Opacity Pfam:OpcA Pfam:OpcA_G6PD_assem Pfam:OpgC_C Pfam:Opi1 Pfam:Opiods_neuropep Pfam:OprB Pfam:OprD Pfam:OprF Pfam:OPT Pfam:Optomotor-blind Pfam:OpuAC Pfam:Opy2 Pfam:Op_neuropeptide Pfam:Orai-1 Pfam:Orbi_NS1 Pfam:Orbi_NS3 Pfam:Orbi_VP1 Pfam:Orbi_VP2 Pfam:Orbi_VP3 Pfam:Orbi_VP4 Pfam:Orbi_VP5

Pfam:Orbi_VP6 Pfam:Orbi_VP7 Pfam:ORC2 Pfam:ORC3_N Pfam:ORC6 Pfam:Orexin Pfam:Orexin_rec2 Pfam:ORF11CD3 Pfam:ORF6C Pfam:ORF6N Pfam:OrgA_MxiK Pfam:ORMDL Pfam:Ornatin Pfam:Orn_Arg_deC_N Pfam:Orn_DAP_Arg_deC Pfam:Orthopox_35kD Pfam:Orthopox_A36R Pfam:Orthopox_A43R Pfam:Orthopox_A47 Pfam:Orthopox_A49R Pfam:Orthopox_A5L Pfam:Orthopox_B11R Pfam:Orthopox_C10L Pfam:Orthopox_F14 Pfam:Orthopox_F6 Pfam:Orthopox_F7 Pfam:Orthopox_F8 Pfam:Orthopox_N1 Pfam:Orthoreo_P10 Pfam:Orthoreo_P17 Pfam:OS-D Pfam:OSCP Pfam:Oscp1 Pfam:OsmC Pfam:Osmo_CC Pfam:Osmo_MPGsynth Pfam:OspD Pfam:OspE Pfam:OSR1_C Pfam:OST3_OST6 Pfam:Ost4 Pfam:OstA Pfam:OstA_C Pfam:Osteopontin

Pfam:Osteoregulin Pfam:OSTMP1 Pfam:OTCace Pfam:OTCace_N Pfam:Otopetrin Pfam:OTU Pfam:Oxidored-like Pfam:Oxidored_FMN Pfam:Oxidored_molyb Pfam:Oxidored_nitro Pfam:Oxidored_q1 Pfam:Oxidored_q1_C Pfam:Oxidored_q1_N Pfam:Oxidored_q2 Pfam:Oxidored_q3 Pfam:Oxidored_q4 Pfam:Oxidored_q5_N Pfam:Oxidored_q6 Pfam:OxoDH_E1alpha_N Pfam:Oxysterol_BP Pfam:ox_reductase_C Pfam:P-II Pfam:P-mevalo_kinase Pfam:P120R Pfam:p12I Pfam:P16-Arc Pfam:P19Arf_N Pfam:P2 Pfam:P21-Arc Pfam:P22_AR_C Pfam:P22_AR_N Pfam:P22_CoatProtein Pfam:P22_Tail-4 Pfam:p25-alpha Pfam:P2X_receptor Pfam:P2_Phage_GpR Pfam:P30 Pfam:P34-Arc Pfam:P35 Pfam:P3A Pfam:p450 Pfam:p47_phox_C Pfam:P4Ha_N Pfam:P53


68

Pfam:P53_C Pfam:P53_TAD Pfam:P53_tetramer Pfam:P63C Pfam:P68HR Pfam:PA Pfam:PA-IIL Pfam:PA-IL Pfam:PA14 Pfam:PA14_2 Pfam:PA26 Pfam:PA28_alpha Pfam:PA28_beta Pfam:PaaA_PaaC Pfam:PaaB Pfam:PAAD_DAPIN Pfam:PAAR_motif Pfam:PaaX Pfam:PaaX_C Pfam:PABP Pfam:PAC2 Pfam:Pacifastin_I Pfam:Pacs-1 Pfam:PACT_coil_coil Pfam:PAD Pfam:PadR Pfam:PADR1 Pfam:PAD_M Pfam:PAD_N Pfam:PAD_porph Pfam:PAE Pfam:PAF-AH_p_II Pfam:Paf1 Pfam:Paf67 Pfam:PagL Pfam:PagP Pfam:PAH Pfam:Paired_CXXCH_1 Pfam:PAL Pfam:Pal1 Pfam:PalH Pfam:Palm_thioest Pfam:PALP Pfam:Pam16

Pfam:Pam17 Pfam:PAM2 Pfam:Pantoate_ligase Pfam:Pantoate_transf Pfam:PAN_1 Pfam:PAN_2 Pfam:PAN_3 Pfam:PaO Pfam:PAP1 Pfam:PAP2 Pfam:PAPA-1 Pfam:PapB Pfam:PapG_C Pfam:PapG_N Pfam:Papilloma_E5 Pfam:Papilloma_E5A Pfam:Papo_T_antigen Pfam:PAPS_reduct Pfam:PAP_assoc Pfam:PAP_central Pfam:Pap_E4 Pfam:PAP_fibrillin Pfam:PAP_PilO Pfam:PAP_RNA-bind Pfam:PAR1 Pfam:ParA Pfam:Paralemmin Pfam:Paramecium_SA Pfam:Paramyxo_C Pfam:Paramyxo_ncap Pfam:Paramyxo_NS_C Pfam:Paramyxo_P Pfam:Paramyx_P_V Pfam:Paramyx_RNA_pol Pfam:Parathyroid Pfam:ParB Pfam:ParBc Pfam:ParBc_2 Pfam:ParcG Pfam:ParD Pfam:Pardaxin Pfam:Parecho_VpG Pfam:PaREP1 Pfam:PaRep2a

Pfam:PaRep2b Pfam:ParG Pfam:PARG_cat Pfam:PARP Pfam:PARP_reg Pfam:PARP_regulatory Pfam:Parvo_coat Pfam:Parvo_coat_N Pfam:Parvo_NS1 Pfam:PAS Pfam:PASTA Pfam:PAS_2 Pfam:PAS_3 Pfam:PAS_4 Pfam:PAS_5 Pfam:PAS_6 Pfam:Pas_Saposin Pfam:PAT1 Pfam:Patatin Pfam:Patched Pfam:Pathogen_betaC1 Pfam:PAX Pfam:Pax2_C Pfam:Pax7 Pfam:Paxillin Pfam:PAXNEB Pfam:PAZ Pfam:PAZ_siRNAbind Pfam:PA_decarbox Pfam:PB1 Pfam:PB1-F2 Pfam:PBAN Pfam:PBC Pfam:PBCV_basic_adap Pfam:PBD Pfam:PBP Pfam:PBP5_C Pfam:PBP_dimer Pfam:PBP_GOBP Pfam:PBP_sp32 Pfam:PBS_linker_poly Pfam:PC4 Pfam:PCAF_N Pfam:Pcc1


69

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Pfam:Pec_lyase_C Pfam:Pec_lyase_N Pfam:Pedibin Pfam:PEGA Pfam:PEGSRP Pfam:Pellino Pfam:PemK Pfam:PEMT Pfam:PEN-2 Pfam:Penaeidin Pfam:Pencillinase_R Pfam:Penicil_amidase Pfam:Pentapeptide Pfam:Pentapeptide_2 Pfam:Pentaxin Pfam:PEP-utilisers_N Pfam:PEP-utilizers Pfam:PEP-utilizers_C Pfam:Pep3_Vps18 Pfam:PEPcase Pfam:PEPCK Pfam:PEPCK_ATP Pfam:Pepsin-I3 Pfam:PepSY Pfam:PepSY_TM Pfam:Peptidase_A17 Pfam:Peptidase_A21 Pfam:Peptidase_A22B Pfam:Peptidase_A24 Pfam:Peptidase_A25 Pfam:Peptidase_A2B Pfam:Peptidase_A2E Pfam:Peptidase_A3 Pfam:Peptidase_A4 Pfam:Peptidase_A6 Pfam:Peptidase_A8 Pfam:Peptidase_C03 Pfam:Peptidase_C1 Pfam:Peptidase_C10 Pfam:Peptidase_C11 Pfam:Peptidase_C12 Pfam:Peptidase_C13 Pfam:Peptidase_C14 Pfam:Peptidase_C15

Pfam:Peptidase_C16 Pfam:Peptidase_C1_2 Pfam:Peptidase_C2 Pfam:Peptidase_C21 Pfam:Peptidase_C23 Pfam:Peptidase_C24 Pfam:Peptidase_C25 Pfam:Peptidase_C25_C Pfam:Peptidase_C26 Pfam:Peptidase_C27 Pfam:Peptidase_C28 Pfam:Peptidase_C3 Pfam:Peptidase_C30 Pfam:Peptidase_C31 Pfam:Peptidase_C32 Pfam:Peptidase_C33 Pfam:Peptidase_C34 Pfam:Peptidase_C36 Pfam:Peptidase_C37 Pfam:Peptidase_C39 Pfam:Peptidase_C3G Pfam:Peptidase_C4 Pfam:Peptidase_C41 Pfam:Peptidase_C42 Pfam:Peptidase_C47 Pfam:Peptidase_C48 Pfam:Peptidase_C5 Pfam:Peptidase_C50 Pfam:Peptidase_C53 Pfam:Peptidase_C54 Pfam:Peptidase_C57 Pfam:Peptidase_C58 Pfam:Peptidase_C6 Pfam:Peptidase_C62 Pfam:Peptidase_C65 Pfam:Peptidase_C69 Pfam:Peptidase_C7 Pfam:Peptidase_C70 Pfam:Peptidase_C71 Pfam:Peptidase_C74 Pfam:Peptidase_C78 Pfam:Peptidase_C8 Pfam:Peptidase_C80 Pfam:Peptidase_C9


70

Pfam:Peptidase_M1 Pfam:Peptidase_M10 Pfam:Peptidase_M10_C Pfam:Peptidase_M11 Pfam:Peptidase_M13 Pfam:Peptidase_M13_N Pfam:Peptidase_M14 Pfam:Peptidase_M15 Pfam:Peptidase_M15_2 Pfam:Peptidase_M15_3 Pfam:Peptidase_M16 Pfam:Peptidase_M16_C Pfam:Peptidase_M17 Pfam:Peptidase_M17_N Pfam:Peptidase_M18 Pfam:Peptidase_M19 Pfam:Peptidase_M2 Pfam:Peptidase_M20 Pfam:Peptidase_M22 Pfam:Peptidase_M23 Pfam:Peptidase_M24 Pfam:Peptidase_M26_C Pfam:Peptidase_M26_N Pfam:Peptidase_M27 Pfam:Peptidase_M28 Pfam:Peptidase_M29 Pfam:Peptidase_M3 Pfam:Peptidase_M30 Pfam:Peptidase_M32 Pfam:Peptidase_M35 Pfam:Peptidase_M36 Pfam:Peptidase_M3_N Pfam:Peptidase_M4 Pfam:Peptidase_M41 Pfam:Peptidase_M42 Pfam:Peptidase_M43 Pfam:Peptidase_M44 Pfam:Peptidase_M48 Pfam:Peptidase_M49 Pfam:Peptidase_M4_C Pfam:Peptidase_M50 Pfam:Peptidase_M54 Pfam:Peptidase_M55 Pfam:Peptidase_M56

Pfam:Peptidase_M57 Pfam:Peptidase_M6 Pfam:Peptidase_M61 Pfam:Peptidase_M64 Pfam:Peptidase_M66 Pfam:Peptidase_M7 Pfam:Peptidase_M73 Pfam:Peptidase_M74 Pfam:Peptidase_M75 Pfam:Peptidase_M76 Pfam:Peptidase_M8 Pfam:Peptidase_M9 Pfam:Peptidase_M9_N Pfam:Peptidase_S10 Pfam:Peptidase_S11 Pfam:Peptidase_S13 Pfam:Peptidase_S15 Pfam:Peptidase_S21 Pfam:Peptidase_S24 Pfam:Peptidase_S26 Pfam:Peptidase_S28 Pfam:Peptidase_S29 Pfam:Peptidase_S3 Pfam:Peptidase_S30 Pfam:Peptidase_S31 Pfam:Peptidase_S32 Pfam:Peptidase_S37 Pfam:Peptidase_S39 Pfam:Peptidase_S41 Pfam:Peptidase_S46 Pfam:Peptidase_S48 Pfam:Peptidase_S49 Pfam:Peptidase_S49_N Pfam:Peptidase_S51 Pfam:Peptidase_S55 Pfam:Peptidase_S58 Pfam:Peptidase_S6 Pfam:Peptidase_S64 Pfam:Peptidase_S66 Pfam:Peptidase_S68 Pfam:Peptidase_S7 Pfam:Peptidase_S8 Pfam:Peptidase_S9 Pfam:Peptidase_S9_N

Pfam:Peptidase_U32 Pfam:Peptidase_U35 Pfam:Peptidase_U4 Pfam:Peptidase_U40 Pfam:Peptidase_U49 Pfam:Peptidase_U57 Pfam:Peptidase_U9 Pfam:Pept_tRNA_hydro Pfam:PepX_C Pfam:PepX_N Pfam:Pep_deformylase Pfam:Pep_M12B_propep Pfam:Per1 Pfam:PerB Pfam:PerC Pfam:Pericardin_rpt Pfam:Perilipin Pfam:Period_C Pfam:Peripla_BP_1 Pfam:Peripla_BP_2 Pfam:Periviscerokin Pfam:peroxidase Pfam:Peroxidase_2 Pfam:Peroxin-13_N Pfam:Peroxin-3 Pfam:Pertactin Pfam:Pertus-S4-tox Pfam:Pertus-S5-tox Pfam:Pertussis_S1 Pfam:Pertussis_S2S3 Pfam:Pes-10 Pfam:Pescadillo_N Pfam:PET Pfam:PET122 Pfam:Pet127 Pfam:Pet191_N Pfam:Pet20 Pfam:PetG Pfam:PetL Pfam:PetM Pfam:PetN Pfam:PEX-1N Pfam:PEX-2N Pfam:PEX11


71

Pfam:Pex14_N Pfam:Pex16 Pfam:Pex19 Pfam:Pex24p Pfam:Pex26 Pfam:Pex2_Pex12 Pfam:PE_PPE_C Pfam:PFEMP Pfam:Pfg27 Pfam:PFK Pfam:PfkB Pfam:PFL Pfam:PFO_beta_C Pfam:PFU Pfam:PfUIS3 Pfam:Pga1 Pfam:PGA2 Pfam:PGAM Pfam:PGAMP Pfam:PGAP1 Pfam:PGA_cap Pfam:PGI Pfam:PGK Pfam:PglZ Pfam:PGM_PMM_I Pfam:PGM_PMM_II Pfam:PGM_PMM_III Pfam:PGM_PMM_IV Pfam:PgpA Pfam:PGPGW Pfam:PG_binding_1 Pfam:PG_binding_2 Pfam:PG_binding_3 Pfam:PG_binding_4 Pfam:PH Pfam:Ph1570 Pfam:PHA-1 Pfam:PhaC_N Pfam:Phage-A118_gp45 Pfam:Phage-Gp8 Pfam:Phage-MuB_C Pfam:Phage-scaffold Pfam:Phage-tail_1 Pfam:Phage-tail_2

Pfam:PhageMin_Tail Pfam:PhageP22-tail Pfam:Phageshock_PspD Pfam:Phageshock_PspG Pfam:Phage_1_1 Pfam:Phage_30_3 Pfam:Phage_30_8 Pfam:Phage_AlpA Pfam:Phage_antitermQ Pfam:Phage_antiter_Q Pfam:Phage_ASH Pfam:Phage_attach Pfam:Phage_B Pfam:Phage_base_V Pfam:Phage_BR0599 Pfam:Phage_C Pfam:Phage_capsid Pfam:Phage_Capsid_P3 Pfam:Phage_cap_E Pfam:Phage_cap_P2 Pfam:Phage_CII Pfam:Phage_CI_repr Pfam:Phage_coat Pfam:Phage_Coat_A Pfam:Phage_Coat_B Pfam:Phage_Coat_Gp8 Pfam:Phage_connector Pfam:Phage_Cox Pfam:Phage_CP76 Pfam:Phage_CRI Pfam:Phage_DNA_bind Pfam:Phage_DsbA Pfam:Phage_E Pfam:Phage_endo_I Pfam:Phage_F Pfam:Phage_fiber Pfam:Phage_fiber_2 Pfam:Phage_fiber_C Pfam:Phage_FRD3 Pfam:Phage_G Pfam:Phage_glycop_gL Pfam:Phage_Gp111 Pfam:Phage_Gp14 Pfam:Phage_Gp15

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72

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Pfam:PhoU Pfam:PhoU_div Pfam:PHP Pfam:PHR Pfam:PhrC_PhrF Pfam:Phtf-FEM1B_bdg Pfam:Phycobilisome Pfam:Phycoerythr_ab Pfam:PhyH Pfam:Phytase Pfam:Phytochelatin Pfam:Phytochelatin_C Pfam:Phytochrome Pfam:Phytoreo_P8 Pfam:Phytoreo_Pns Pfam:Phytoreo_S7 Pfam:Phyto_Pns9_10 Pfam:PHZA_PHZB Pfam:PhzC-PhzF Pfam:PH_2 Pfam:PI-PLC-X Pfam:PI-PLC-Y Pfam:PI31_Prot_Reg Pfam:PI3Ka Pfam:PI3K_1B_p101 Pfam:PI3K_C2 Pfam:PI3K_p85B Pfam:PI3K_rbd Pfam:PI3_PI4_kinase Pfam:Picorna_P3A Pfam:Pico_P1A Pfam:Pico_P2A Pfam:Pico_P2B Pfam:PID Pfam:PIG-F Pfam:PIG-H Pfam:PIG-L Pfam:PIG-P Pfam:PIG-S Pfam:PIG-U Pfam:PIG-X Pfam:PIGA Pfam:Pigment_DH Pfam:PigN


73

Pfam:PIH1 Pfam:Pik1 Pfam:PilI Pfam:Pilin Pfam:Pilin_PilX Pfam:Pili_assembly_C Pfam:Pili_assembly_N Pfam:PilM Pfam:PilN Pfam:PilO Pfam:PilP Pfam:PilS Pfam:Pilus_CpaD Pfam:Pilus_PilP Pfam:PilZ Pfam:PIN Pfam:Pinin_SDK_memA Pfam:Pinin_SDK_N Pfam:PIN_2 Pfam:PIP49_C Pfam:PIP5K Pfam:PipA Pfam:PIR Pfam:Pirin Pfam:Pirin_C Pfam:PITH Pfam:Piwi Pfam:PixA Pfam:PK Pfam:PKD Pfam:PKD_channel Pfam:PKI Pfam:pKID Pfam:Pkinase Pfam:Pkinase_C Pfam:Pkinase_Tyr Pfam:Pkip-1 Pfam:PKK Pfam:Pkr1 Pfam:PK_C Pfam:PLA1 Pfam:PLA2G12 Pfam:PLA2_B Pfam:PLA2_inh

Pfam:PLAC Pfam:PLAC8 Pfam:Planc_extracel Pfam:Plant_all_beta Pfam:Plant_NMP1 Pfam:Plant_tran Pfam:Plant_vir_prot Pfam:Plant_zn_clust Pfam:Plasmid_killer Pfam:Plasmid_parti Pfam:Plasmid_RAQPRD Pfam:Plasmid_stabil Pfam:Plasmid_stab_B Pfam:Plasmid_Txe Pfam:Plasmodium_HRP Pfam:Plasmodium_Vir Pfam:Plasmod_dom_1 Pfam:Plasmod_MYXSPDY Pfam:Plasmod_Pvs28 Pfam:PLAT Pfam:PLATZ Pfam:PLC-beta_C Pfam:PLDc Pfam:PLD_C Pfam:PLD_envelope Pfam:Plectin Pfam:Plexin_cytopl Pfam:PLRV_ORF5 Pfam:PLU-1 Pfam:Plug Pfam:Plug_translocon Pfam:Plus-3 Pfam:PM0188 Pfam:PmbA_TldD Pfam:PMBR Pfam:PMC2NT Pfam:PMD Pfam:PMEI Pfam:PMG Pfam:PMI_typeI Pfam:PMM Pfam:PMP1_2 Pfam:PMP22_Claudin Pfam:Pmp24

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74

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75

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76

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77

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Pfam:Rcd1 Pfam:RCR Pfam:RcsC Pfam:RCSD Pfam:RDD Pfam:RdgC Pfam:RDM Pfam:RdRP Pfam:RdRP_1 Pfam:RdRP_2 Pfam:RdRP_3 Pfam:RdRP_4 Pfam:RdRP_5 Pfam:RDV-p3 Pfam:Rdx Pfam:RebB Pfam:RecA Pfam:Receptor_2B4 Pfam:Receptor_IA-2 Pfam:Recep_L_domain Pfam:Recombinase Pfam:RecO_C Pfam:RecO_N Pfam:RecQ5 Pfam:RecR Pfam:RecT Pfam:RecU Pfam:RecX Pfam:Red1 Pfam:Redoxin Pfam:RED_C Pfam:RED_N Pfam:Reeler Pfam:REF Pfam:REGB_T4 Pfam:Regulator_TrmB Pfam:Reg_prop Pfam:REJ Pfam:Relaxase Pfam:RelA_SpoT Pfam:RelB Pfam:RELT Pfam:Remorin_C Pfam:Remorin_N

Pfam:Renin_r Pfam:Reoviridae_Vp9 Pfam:Reovirus_cap Pfam:Reovirus_L2 Pfam:Reovirus_M2 Pfam:Reovirus_Mu2 Pfam:Reo_P9 Pfam:Reo_sigma1 Pfam:Reo_sigmaC Pfam:Rep-A_N Pfam:RepA1_leader Pfam:RepA_C Pfam:RepA_N Pfam:RepB Pfam:RepB-RCR_reg Pfam:RepC Pfam:RepL Pfam:Replicase Pfam:Repressor_Mnt Pfam:Reprolysin Pfam:Rep_1 Pfam:Rep_2 Pfam:Rep_3 Pfam:Rep_4 Pfam:Rep_fac-A_3 Pfam:Rep_fac-A_C Pfam:Rep_fac_C Pfam:Rep_N Pfam:Rep_Org_C Pfam:Rep_trans Pfam:Rer1 Pfam:RES Pfam:ResB Pfam:ResIII Pfam:Resistin Pfam:Resolvase Pfam:Response_reg Pfam:RestrictionMunI Pfam:RestrictionSfiI Pfam:Reticulon Pfam:Retinin_C Pfam:Retrotrans_gag Pfam:Retro_M Pfam:Ret_tiss


78

Pfam:REV Pfam:RE_AccI Pfam:RE_Alw26IDE Pfam:RE_AlwI Pfam:RE_ApaLI Pfam:RE_Bpu10I Pfam:RE_Bsp6I Pfam:RE_BstXI Pfam:RE_CfrBI Pfam:RE_Eco29kI Pfam:RE_Eco47II Pfam:RE_HaeII Pfam:RE_HaeIII Pfam:RE_HindIII Pfam:RE_HindVP Pfam:RE_HpaII Pfam:RE_LlaJI Pfam:RE_LlaMI Pfam:RE_MamI Pfam:RE_MjaI Pfam:RE_MjaII Pfam:RE_NgoBV Pfam:RE_NgoFVII Pfam:RE_NgoPII Pfam:RE_R_Pab1 Pfam:RE_SacI Pfam:RE_ScaI Pfam:RE_SinI Pfam:RE_TaqI Pfam:RE_XamI Pfam:RE_XcyI Pfam:RF-1 Pfam:RFamide_26RFa Pfam:RFC-E_C Pfam:RFC1 Pfam:RFPL3_antisense Pfam:Rft-1 Pfam:RFX1_trans_act Pfam:RFX_DNA_binding Pfam:RGM_C Pfam:RGM_N Pfam:RGP Pfam:Rgp1 Pfam:RgpF

Pfam:RGS Pfam:RGS-like Pfam:RhaA Pfam:Rhabdo_glycop Pfam:Rhabdo_M1 Pfam:Rhabdo_M2 Pfam:Rhabdo_matrix Pfam:Rhabdo_ncap Pfam:Rhabdo_ncap_2 Pfam:Rhabdo_NV Pfam:Rhamnogal_lyase Pfam:RhaT Pfam:RHD Pfam:RHD3 Pfam:RhgB_N Pfam:RHH_1 Pfam:RHH_2 Pfam:Rhodanese Pfam:RhodobacterPufX Pfam:Rhodopsin_N Pfam:RhoGAP Pfam:RhoGEF Pfam:Rhomboid Pfam:Rhomboid_SP Pfam:Rho_Binding Pfam:Rho_GDI Pfam:Rho_N Pfam:Rho_RNA_bind Pfam:RHS Pfam:RHSP Pfam:RHS_repeat Pfam:Rhv Pfam:Rib Pfam:RIB43A Pfam:RibD_C Pfam:Ribonuclease Pfam:Ribonuclease_3 Pfam:Ribonuclease_BN Pfam:Ribonuclease_P Pfam:Ribonuclease_T2 Pfam:Ribonuc_2-5A Pfam:Ribonuc_L-PSP Pfam:Ribonuc_P_40 Pfam:Ribonuc_red_2_N

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80

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Pfam:ROK Pfam:ROKNT Pfam:RolB_RolC Pfam:Romo1 Pfam:rOmpB Pfam:Root_cap Pfam:Rop Pfam:Rossmann-like Pfam:ROS_MUCR Pfam:Rot1 Pfam:Rotamase Pfam:Rotavirus_VP1 Pfam:Rotavirus_VP3 Pfam:Rotavirus_VP7 Pfam:Rota_Capsid_VP6 Pfam:Rota_NS26 Pfam:Rota_NS35 Pfam:Rota_NS53 Pfam:Rota_NS6 Pfam:Rota_NSP3 Pfam:Rota_NSP4 Pfam:Rota_VP2 Pfam:Roughex Pfam:Rox3 Pfam:RP-C Pfam:RP-C_C Pfam:RP1-2 Pfam:RPA Pfam:RPAP1_C Pfam:RPAP1_N Pfam:RPAP2_Rtr1 Pfam:RPA_C Pfam:RPE65 Pfam:RPEL Pfam:RPH3A_effect_N Pfam:RplB Pfam:RPM2 Pfam:Rpn3_C Pfam:RPN7 Pfam:rpo132 Pfam:rpo30_N Pfam:Rpp20 Pfam:Rpr2 Pfam:RPW8

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81

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82

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Pfam:SerH Pfam:Serinc Pfam:Serine_rich Pfam:Serpentine_r_xa Pfam:Serpin Pfam:Serpulina_VSP Pfam:SERTA Pfam:Serum_albumin Pfam:Seryl_tRNA_N Pfam:SET Pfam:SET_assoc Pfam:Sex_peptide Pfam:SF-assemblin Pfam:SF3a60_bindingd Pfam:SF3b1 Pfam:SF3b10 Pfam:Sfi1 Pfam:Sfi1_C Pfam:SfsA Pfam:Sgf11 Pfam:SGL Pfam:SGS Pfam:SGT1 Pfam:SH Pfam:SH2 Pfam:SH3BGR Pfam:SH3BP5 Pfam:SH3_1 Pfam:SH3_2 Pfam:SH3_3 Pfam:SH3_4 Pfam:SH3_5 Pfam:Shal-type Pfam:SHD1 Pfam:She2p Pfam:She9_MDM33 Pfam:Shigella_OspC Pfam:Shikimate_DH Pfam:Shikimate_dh_N Pfam:ShK Pfam:ShlB Pfam:SHMT Pfam:SHNi-TPR Pfam:SHP


83

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Pfam:SIS Pfam:Siva Pfam:SKG6 Pfam:SKI Pfam:SKIP_SNW Pfam:Ski_Sno Pfam:Sklp_toxin Pfam:SKN1 Pfam:Skp1 Pfam:Skp1_POZ Pfam:SK_channel Pfam:SLAM Pfam:SLAP Pfam:SLA_LP_auto_ag Pfam:SLBB Pfam:SLD3 Pfam:Sld5 Pfam:SLEI_Leptospira Pfam:SLH Pfam:SLIDE Pfam:Slp Pfam:SLR1-BP Pfam:SLT Pfam:SLT_beta Pfam:Slu7 Pfam:Slx4 Pfam:SLY Pfam:SlyX Pfam:Smac_DIABLO Pfam:SMC_hinge Pfam:SMC_N Pfam:SMC_Nse1 Pfam:Smg4_UPF3 Pfam:SMI1_KNR4 Pfam:SMK-1 Pfam:SMN Pfam:Smoothelin Pfam:SMP Pfam:SmpA_OmlA Pfam:SmpB Pfam:SMP_2 Pfam:Smr Pfam:Sm_multidrug_ex Pfam:SNAP-25

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84

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Pfam:Stk19 Pfam:Stm1_N Pfam:STN Pfam:Stn1 Pfam:stn_TNFRSF12A Pfam:Stomoxyn Pfam:Stonin2_N Pfam:STOP Pfam:Stork_head Pfam:Strabismus Pfam:Streptin-Immun Pfam:Strep_67kDa_ant Pfam:Strep_his_triad Pfam:Strep_SA_rep Pfam:Striatin Pfam:Strumpellin Pfam:Str_synth Pfam:STT3 Pfam:SUA5 Pfam:Sua5_yciO_yrdC Pfam:Subtilosin_A Pfam:Succ_DH_flav_C Pfam:Sucrose_synth Pfam:Suc_Fer-like Pfam:Suf Pfam:SufE Pfam:SUFU Pfam:SUFU_C Pfam:Sugar-bind Pfam:Sugar_tr Pfam:Sugar_transport Pfam:SUI1 Pfam:SulA Pfam:Sulfakinin Pfam:Sulfatase Pfam:Sulfate_transp Pfam:Sulfolobus_pRN Pfam:Sulfotransfer_1 Pfam:Sulfotransfer_2 Pfam:Sulf_coat_C Pfam:Sulphotransf Pfam:SUN Pfam:Suppressor_APC Pfam:Suppressor_P21

Pfam:SUR7 Pfam:SurA_N Pfam:SurE Pfam:SURF1 Pfam:SURF2 Pfam:SURF4 Pfam:SURF6 Pfam:Surface_Ag_2 Pfam:Surface_antigen Pfam:Surfac_D-trimer Pfam:Surf_Ag_VNR Pfam:SURNod19 Pfam:Surp Pfam:SusD Pfam:Sushi Pfam:Sushi_2 Pfam:SUV3_C Pfam:SVA Pfam:Svf1 Pfam:SVM_signal Pfam:SVS_QK Pfam:SWI-SNF_Ssr4 Pfam:Swi3 Pfam:Swi5 Pfam:SWIB Pfam:SWIM Pfam:SWIRM Pfam:Sybindin Pfam:Syd Pfam:SYF2 Pfam:Syja_N Pfam:Symplekin_C Pfam:Synaphin Pfam:Synapsin Pfam:Synapsin_C Pfam:Synapsin_N Pfam:Synaptobrevin Pfam:Syndecan Pfam:SynMuv_product Pfam:Syntaxin Pfam:Syntaxin-18_N Pfam:Syntaxin-6_N Pfam:Synthase_beta Pfam:Synuclein


86

Pfam:SyrA Pfam:SYS1 Pfam:S_100 Pfam:S_layer_C Pfam:S_layer_N Pfam:S_locus_glycop Pfam:T-box Pfam:T4-Gluco-transf Pfam:T4-helicase_C Pfam:T4-helicase_N Pfam:T4SS Pfam:T4_baseplate Pfam:T4_deiodinase Pfam:T4_gp9_10 Pfam:T4_neck-protein Pfam:T4_tail_cap Pfam:T5orf172 Pfam:Ta0938 Pfam:TA0956 Pfam:TACC Pfam:Tachykinin Pfam:Tachystatin_A Pfam:Tachystatin_B Pfam:TACI-CRD2 Pfam:TadE Pfam:Taeniidae_ag Pfam:TAF Pfam:TAF4 Pfam:TAF8_C Pfam:TAFA Pfam:TAFH Pfam:Tafi-CsgC Pfam:Tafi-CsgF Pfam:TAFII28 Pfam:TAFII55_N Pfam:TagA Pfam:Tagatose_6_P_K Pfam:Tail_P2_I Pfam:Tail_tube Pfam:Talin_middle Pfam:TAN Pfam:Tannase Pfam:Tap-RNA_bind Pfam:TAP35_44

Pfam:TAP42 Pfam:Tape_meas_lam_C Pfam:TAP_C Pfam:Taq-exonuc Pfam:TarH Pfam:TAS2R Pfam:Tash_PEST Pfam:Tat Pfam:TatC Pfam:TatD_DNase Pfam:TATR Pfam:TAT_signal Pfam:TAT_ubiq Pfam:Tau95 Pfam:TauD Pfam:TauE Pfam:Tautomerase Pfam:Tax Pfam:Taxilin Pfam:TB Pfam:TB2_DP1_HVA22 Pfam:TBC Pfam:TBCA Pfam:TBCC Pfam:Tbf5 Pfam:TBP Pfam:TBP-binding Pfam:TBPIP Pfam:TBSV_P22 Pfam:TBX Pfam:Tc3_transposase Pfam:TcdB_toxin_midC Pfam:TcdB_toxin_midN Pfam:Tcell_CD4_Cterm Pfam:TCL1_MTCP1 Pfam:TCO89 Pfam:TCP Pfam:Tcp10_C Pfam:Tcp11 Pfam:TcpA Pfam:TcpF Pfam:TcpQ Pfam:TCR_zetazeta Pfam:TctA

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87

Pfam:TetR_C_3 Pfam:TetR_C_4 Pfam:TetR_C_5 Pfam:TetR_N Pfam:Tet_res_leader Pfam:Tex_N Pfam:Tfb2 Pfam:Tfb4 Pfam:TFCD_C Pfam:TFIIA Pfam:TFIIA_gamma_C Pfam:TFIIA_gamma_N Pfam:TFIIB Pfam:TFIID-18kDa Pfam:TFIID-31kDa Pfam:TFIID_20kDa Pfam:TFIID_30kDa Pfam:TFIID_90kDa Pfam:TFIIE-A_C-term Pfam:TFIIE_alpha Pfam:TFIIE_beta Pfam:TFIIF_alpha Pfam:TFIIF_beta Pfam:TFIIH_BTF_p62_N Pfam:TFIIIC_subunit Pfam:TFIIS_C Pfam:TFIIS_M Pfam:TfoX_C Pfam:TfoX_N Pfam:TFR_dimer Pfam:TfuA Pfam:TF_AP-2 Pfam:TF_Otx Pfam:TF_Zn_Ribbon Pfam:TGFb_propeptide Pfam:TGF_beta Pfam:TGF_beta_GS Pfam:TgMIC1 Pfam:TGS Pfam:TGT Pfam:TH1 Pfam:THAP Pfam:Thaumatin Pfam:Thermopsin

Pfam:THF_DHG_CYH Pfam:THF_DHG_CYH_C Pfam:Thg1 Pfam:Thi4 Pfam:Thia_YuaJ Pfam:ThiC Pfam:ThiF Pfam:ThiG Pfam:ThiI Pfam:Thioesterase Pfam:Thiol-ester_cl Pfam:Thiolase_C Pfam:Thiolase_N Pfam:Thiol_cytolysin Pfam:Thionin Pfam:Thioredoxin Pfam:ThiS Pfam:ThiW Pfam:Tho2 Pfam:Thoc2 Pfam:THOC7 Pfam:THP2 Pfam:Thrombin_light Pfam:Thr_dehydrat_C Pfam:Tht1 Pfam:ThuA Pfam:THUMP Pfam:Thy1 Pfam:ThylakoidFormat Pfam:Thymidylate_kin Pfam:Thymidylat_synt Pfam:Thymopoietin Pfam:Thymosin Pfam:Thyroglobulin_1 Pfam:Tic20 Pfam:Tic22 Pfam:tify Pfam:TIG Pfam:TIL Pfam:TilS Pfam:TilS_C Pfam:TIM Pfam:TIM-br_sig_trns Pfam:Tim17

Pfam:TIM21 Pfam:Tim44 Pfam:Tim54 Pfam:TIMELESS Pfam:TIMELESS_C Pfam:TIMP Pfam:Tiny_TM_bacill Pfam:TIP120 Pfam:TIP41 Pfam:TIP49 Pfam:TipAS Pfam:TIP_N Pfam:TIR Pfam:TIR-like Pfam:Tir_receptor_C Pfam:Tir_receptor_M Pfam:Tir_receptor_N Pfam:Tis11B_N Pfam:Tissue_fac Pfam:Titin_Z Pfam:TK Pfam:TLC Pfam:TLD Pfam:TLE_N Pfam:TLP-20 Pfam:TLV_coat Pfam:TM2 Pfam:TMA7 Pfam:TMC Pfam:Tme5_EGF_like Pfam:Tmem26 Pfam:Tmemb_14 Pfam:Tmemb_161AB Pfam:Tmemb_170 Pfam:Tmemb_185A Pfam:Tmemb_18A Pfam:Tmemb_40 Pfam:Tmemb_55A Pfam:Tmemb_9 Pfam:Tmemb_cc2 Pfam:TMEMspv1-c74-12 Pfam:TMF_DNA_bd Pfam:TMF_TATA_bd Pfam:TmoB


88

Pfam:TMP Pfam:TMP-TENI Pfam:Tmp39 Pfam:TMPIT Pfam:Tmpp129 Pfam:TMP_2 Pfam:TMV_coat Pfam:TM_helix Pfam:Tn7_TnsC Pfam:Tn916-Xis Pfam:Tna_leader Pfam:TNF Pfam:TNFR_c6 Pfam:TniB Pfam:TniQ Pfam:TnsA_C Pfam:TnsA_N Pfam:TNV_CP Pfam:TOBE Pfam:TOBE_2 Pfam:Tobravirus_2B Pfam:TOH_N Pfam:TolA Pfam:TolB_N Pfam:Toluene_X Pfam:Tol_Tol_Ttg2 Pfam:TOM13 Pfam:TOM20_plant Pfam:Tom22 Pfam:Tom37 Pfam:Tom37_C Pfam:Tom5 Pfam:Tom7 Pfam:Tombus_movement Pfam:Tombus_P19 Pfam:Tombus_P33 Pfam:TonB Pfam:TonB_dep_Rec Pfam:Topo-VIb_trans Pfam:Topoisom_bac Pfam:Topoisom_I Pfam:Topoisom_IIA_B Pfam:Topoisom_I_N Pfam:Topo_Zn_Ribbon

Pfam:Toprim Pfam:Toprim_N Pfam:Torsin Pfam:Tospo_nucleocap Pfam:Totivirus_coat Pfam:Tower Pfam:Toxin_1 Pfam:Toxin_10 Pfam:Toxin_11 Pfam:Toxin_12 Pfam:Toxin_13 Pfam:Toxin_14 Pfam:Toxin_15 Pfam:Toxin_16 Pfam:Toxin_17 Pfam:Toxin_18 Pfam:Toxin_19 Pfam:Toxin_2 Pfam:Toxin_20 Pfam:Toxin_21 Pfam:Toxin_22 Pfam:Toxin_23 Pfam:Toxin_24 Pfam:Toxin_25 Pfam:Toxin_26 Pfam:Toxin_27 Pfam:Toxin_28 Pfam:Toxin_29 Pfam:Toxin_3 Pfam:Toxin_30 Pfam:Toxin_31 Pfam:Toxin_32 Pfam:Toxin_33 Pfam:Toxin_34 Pfam:Toxin_35 Pfam:Toxin_36 Pfam:Toxin_37 Pfam:Toxin_4 Pfam:Toxin_5 Pfam:Toxin_6 Pfam:Toxin_7 Pfam:Toxin_8 Pfam:Toxin_9 Pfam:Toxin_BmKK4

Pfam:Toxin_R_bind_C Pfam:Toxin_R_bind_N Pfam:Toxin_ToxA Pfam:Toxin_trans Pfam:Toxin_YhaV Pfam:TP1 Pfam:TP2 Pfam:TP6A_N Pfam:TPD52 Pfam:TPK_B1_binding Pfam:TPK_catalytic Pfam:TPMT Pfam:TPPII Pfam:TPPII_N Pfam:TPPK_C Pfam:TPP_enzyme_C Pfam:TPP_enzyme_M Pfam:TPP_enzyme_N Pfam:TPR_1 Pfam:TPR_2 Pfam:TPR_3 Pfam:TPR_4 Pfam:TPR_MLP1_2 Pfam:TPT Pfam:TPX2 Pfam:TPX2_importin Pfam:TP_methylase Pfam:Tr-sialidase_C Pfam:TRA-1_regulated Pfam:TraA Pfam:TraB Pfam:TraC Pfam:TraC_F_IV Pfam:TraD Pfam:TRADD_N Pfam:TraD_N Pfam:TraE Pfam:TraG Pfam:TraG_N Pfam:TraH Pfam:TraH_2 Pfam:TraI Pfam:TraI_2 Pfam:TraK


89

Pfam:TraL Pfam:TRAM Pfam:TRAM1 Pfam:TRAM_LAG1_CLN8 Pfam:TraN Pfam:Transaldolase Pfam:Transcript_VP30 Pfam:Transferase Pfam:Transferrin Pfam:Transformer Pfam:Transglut_C Pfam:Transglut_core Pfam:Transglut_N Pfam:Transglut_prok Pfam:Transgly Pfam:Transglycosylas Pfam:Transgly_assoc Pfam:Transketolase_C Pfam:Transketolase_N Pfam:Transket_pyr Pfam:Translat_reg Pfam:Translin Pfam:Transmemb_17 Pfam:Transpeptidase Pfam:Transport_MerF Pfam:Transposase_1 Pfam:Transposase_11 Pfam:Transposase_12 Pfam:Transposase_14 Pfam:Transposase_17 Pfam:Transposase_2 Pfam:Transposase_20 Pfam:Transposase_21 Pfam:Transposase_22 Pfam:Transposase_23 Pfam:Transposase_24 Pfam:Transposase_25 Pfam:Transposase_27 Pfam:Transposase_28 Pfam:Transposase_29 Pfam:Transposase_30 Pfam:Transposase_31 Pfam:Transposase_32 Pfam:Transposase_34

Pfam:Transposase_35 Pfam:Transposase_36 Pfam:Transposase_37 Pfam:Transposase_5 Pfam:Transposase_7 Pfam:Transposase_8 Pfam:Transposase_9 Pfam:Transposase_mut Pfam:Transposase_Tc5 Pfam:Transposase_Tn5 Pfam:Transp_cyt_pur Pfam:Transp_Tc5_C Pfam:Transthyretin Pfam:Trans_reg_C Pfam:TraO Pfam:TraP Pfam:TRAP-delta Pfam:TRAP-gamma Pfam:TRAPP Pfam:TRAP_alpha Pfam:TRAP_beta Pfam:TraQ Pfam:TraS Pfam:TraT Pfam:TraU Pfam:TRAUB Pfam:TraV Pfam:TraW_N Pfam:TraX Pfam:TraY Pfam:Tra_M Pfam:TrbC Pfam:TrbC_Ftype Pfam:TrbE Pfam:TrbH Pfam:TrbI Pfam:TrbI_Ftype Pfam:TrbL Pfam:TrbM Pfam:TRCF Pfam:Treacle Pfam:Trefoil Pfam:Trehalase Pfam:Trehalase_Ca-bi

Pfam:Trehalose_PPase Pfam:Trehalose_recp Pfam:Trep_dent_lipo Pfam:Trep_Strep Pfam:TRF Pfam:TRF2 Pfam:TrfA Pfam:TRH Pfam:TRI12 Pfam:Tri3 Pfam:TRI5 Pfam:TRI9 Pfam:Triabin Pfam:TRIC Pfam:Tricho_coat Pfam:Trigger_C Pfam:Trigger_N Pfam:TrkA_C Pfam:TrkA_N Pfam:TrkH Pfam:TRM Pfam:Trm112p Pfam:TRM13 Pfam:Trm56 Pfam:TrmB Pfam:TrmE_N Pfam:tRNA-synt_1 Pfam:tRNA-synt_1b Pfam:tRNA-synt_1c Pfam:tRNA-synt_1c_C Pfam:tRNA-synt_1d Pfam:tRNA-synt_1e Pfam:tRNA-synt_1f Pfam:tRNA-synt_1g Pfam:tRNA-synt_2 Pfam:tRNA-synt_2b Pfam:tRNA-synt_2c Pfam:tRNA-synt_2d Pfam:tRNA-synt_2e Pfam:tRNA-Thr_ED Pfam:tRNA_anti Pfam:tRNA_bind Pfam:tRNA_deacylase Pfam:tRNA_int_endo


90

Pfam:tRNA_int_endo_N Pfam:tRNA_lig_CPD Pfam:tRNA_lig_kinase Pfam:tRNA_m1G_MT Pfam:tRNA_Me_trans Pfam:tRNA_NucTransf2 Pfam:tRNA_SAD Pfam:tRNA_synt_1c_R1 Pfam:tRNA_synt_1c_R2 Pfam:tRNA_synt_2f Pfam:tRNA_U5-meth_tr Pfam:Tropomodulin Pfam:Tropomyosin Pfam:Troponin Pfam:Troponin-I_N Pfam:TROVE Pfam:TRP Pfam:TrpBP Pfam:TRP_2 Pfam:Trp_dioxygenase Pfam:Trp_DMAT Pfam:Trp_halogenase Pfam:Trp_leader1 Pfam:Trp_leader2 Pfam:Trp_oprn_chp Pfam:Trp_repressor Pfam:Trp_syntA Pfam:Trp_Tyr_perm Pfam:Trs120 Pfam:TruB-C_2 Pfam:TruB_C Pfam:TruB_N Pfam:TruD Pfam:TrwB_AAD_bind Pfam:TrwC Pfam:Trypan_glycop Pfam:Trypan_glycop_C Pfam:Trypan_PARP Pfam:Trypsin Pfam:Tryp_alpha_amyl Pfam:Tryp_FSAP Pfam:TryThrA_C Pfam:TSA Pfam:TSC22

Pfam:Tsg Pfam:TSGP1 Pfam:TSNR_N Pfam:Tsp45I Pfam:TSP9 Pfam:TspO_MBR Pfam:TSP_1 Pfam:TSP_3 Pfam:TSP_C Pfam:TTKRSYEDQ Pfam:TTL Pfam:TTSSLRR Pfam:TT_ORF1 Pfam:TT_ORF2 Pfam:TT_ORF2a Pfam:Tub Pfam:Tuberculin Pfam:Tuberin Pfam:Tubulin Pfam:Tubulin-binding Pfam:Tubulin_C Pfam:TUDOR Pfam:Tudor-knot Pfam:TUG Pfam:Tup_N Pfam:Turandot Pfam:Tweety Pfam:TYA Pfam:TyeA Pfam:TylF Pfam:Tymo_45kd_70kd Pfam:Tymo_coat Pfam:TypeIII_RM_meth Pfam:Type_III_YscG Pfam:Type_III_YscX Pfam:Tyr-DNA_phospho Pfam:Tyrosinase Pfam:Tyr_Deacylase Pfam:TYW3 Pfam:T_Ag_DNA_bind Pfam:T_hemolysin Pfam:U-box Pfam:U1snRNP70_N Pfam:U3snoRNP10

Pfam:U3_assoc_6 Pfam:U3_snoRNA_assoc Pfam:U5_2-snRNA_bdg Pfam:U6-snRNA_bdg Pfam:U79_P34 Pfam:UAA Pfam:UAF_Rrn10 Pfam:UBA Pfam:UBACT Pfam:UBA_2 Pfam:UBA_3 Pfam:UBA_e1_C Pfam:UBA_e1_thiolCys Pfam:UbiA Pfam:UbiD Pfam:Ubie_methyltran Pfam:Ubiq-assoc Pfam:Ubiq-Cytc-red_N Pfam:ubiquitin Pfam:Ubiq_cyt_C_chap Pfam:UBX Pfam:UCH Pfam:UCN2 Pfam:UcrQ Pfam:UCR_14kD Pfam:UCR_6-4kD Pfam:UCR_Fe-S_N Pfam:UCR_hinge Pfam:UCR_TM Pfam:UCR_UQCRX_QCR9 Pfam:uDENN Pfam:UDG Pfam:UDP-g_GGTase Pfam:UDPGP Pfam:UDPGT Pfam:UDPG_MGDP_dh Pfam:UDPG_MGDP_dh_C Pfam:UDPG_MGDP_dh_N Pfam:UEV Pfam:UFC1 Pfam:UFD1 Pfam:Ufd2P_core Pfam:Ufm1 Pfam:UIM


91

Pfam:UK Pfam:UL11 Pfam:UL2 Pfam:UL40 Pfam:UL73_N Pfam:UL97 Pfam:Umbravirus_LDM Pfam:UME Pfam:UMP1 Pfam:UMPH-1 Pfam:UnbV_ASPIC Pfam:UNC-50 Pfam:UNC-93 Pfam:UNC45-central Pfam:Unstab_antitox Pfam:UN_NPL4 Pfam:UPAR_LY6 Pfam:UPF0004 Pfam:UPF0005 Pfam:UPF0014 Pfam:UPF0016 Pfam:UPF0020 Pfam:UPF0027 Pfam:UPF0029 Pfam:UPF0041 Pfam:UPF0047 Pfam:UPF0051 Pfam:UPF0052 Pfam:UPF0054 Pfam:UPF0057 Pfam:UPF0058 Pfam:UPF0060 Pfam:UPF0061 Pfam:UPF0066 Pfam:UPF0075 Pfam:UPF0079 Pfam:UPF0081 Pfam:UPF0086 Pfam:UPF0089 Pfam:UPF0093 Pfam:UPF0102 Pfam:UPF0104 Pfam:UPF0113 Pfam:UPF0114

Pfam:UPF0118 Pfam:UPF0121 Pfam:UPF0122 Pfam:UPF0125 Pfam:UPF0126 Pfam:UPF0128 Pfam:UPF0137 Pfam:UPF0139 Pfam:UPF0146 Pfam:UPF0147 Pfam:UPF0149 Pfam:UPF0150 Pfam:UPF0153 Pfam:UPF0154 Pfam:UPF0157 Pfam:UPF0158 Pfam:UPF0160 Pfam:UPF0164 Pfam:UPF0167 Pfam:UPF0172 Pfam:UPF0175 Pfam:UPF0179 Pfam:UPF0180 Pfam:UPF0181 Pfam:UPF0182 Pfam:UPF0183 Pfam:UPF0184 Pfam:UPF0193 Pfam:UPF0197 Pfam:UPF0203 Pfam:UPF0220 Pfam:UPF0223 Pfam:UPF0227 Pfam:UPF0228 Pfam:UPF0231 Pfam:UPF0233 Pfam:UPF0236 Pfam:UPF0239 Pfam:UPF0240 Pfam:UPF0242 Pfam:UPF0253 Pfam:UPF0254 Pfam:UPF0257 Pfam:UPF0258

Pfam:UPF0259 Pfam:UPF0261 Pfam:UPF0262 Pfam:UPF0270 Pfam:UPF0278 Pfam:UPF0300 Pfam:UPF0302 Pfam:UPF0506 Pfam:UPF0546 Pfam:UPF0547 Pfam:UPF0552 Pfam:UPF0556 Pfam:UPF0560 Pfam:UPF0561 Pfam:UPF0564 Pfam:UPF0565 Pfam:UPF1_Zn_bind Pfam:Upf2 Pfam:UQ_con Pfam:Urb2 Pfam:Urease_alpha Pfam:Urease_beta Pfam:Urease_gamma Pfam:UreD Pfam:UreE_C Pfam:UreE_N Pfam:UreF Pfam:Ureidogly_hydro Pfam:Uricase Pfam:Urm1 Pfam:URO-D Pfam:Urocanase Pfam:Uroplakin_II Pfam:Urotensin_II Pfam:US2 Pfam:US22 Pfam:Use1 Pfam:Usg Pfam:Usher Pfam:Uso1_p115_C Pfam:Uso1_p115_head Pfam:Usp Pfam:USP7 Pfam:USP8_interact


92

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Pfam:VirB8 Pfam:VirC1 Pfam:VirC2 Pfam:VirD1 Pfam:VirDNA-topo-I_N Pfam:VirE Pfam:VirE1 Pfam:VirE2 Pfam:VirE3 Pfam:VirE_N Pfam:VirionAssem_T7 Pfam:VirJ Pfam:VirK Pfam:Virul_Fac Pfam:Vir_act_alpha_C Pfam:VIT Pfam:VIT1 Pfam:VitD-bind_III Pfam:Vitelline_membr Pfam:Vitellogenin_N Pfam:VKG_Carbox Pfam:VKOR Pfam:VlpA_repeat Pfam:VLPT Pfam:Vma12 Pfam:VMA21 Pfam:Vmethyltransf Pfam:Vmethyltransf_C Pfam:vMSA Pfam:Voltage_CLC Pfam:VOMI Pfam:VP4 Pfam:VP40 Pfam:VP7 Pfam:VP9 Pfam:VPEP Pfam:VPR Pfam:VPS11_C Pfam:Vps16_C Pfam:Vps16_N Pfam:Vps23_core Pfam:Vps26 Pfam:VPS28 Pfam:Vps35


93

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94

Pfam:YbhQ Pfam:YbjM Pfam:YbjN Pfam:YcaO Pfam:YcbB Pfam:YccV-like Pfam:YceG Pfam:YceI Pfam:Ycf1 Pfam:Ycf15 Pfam:Ycf34 Pfam:Ycf4 Pfam:Ycf54 Pfam:Ycf66_N Pfam:Ycf9 Pfam:YcfA Pfam:YcgL Pfam:YcgR Pfam:YchF-GTPase_C Pfam:YCII Pfam:Ydc2-catalyt Pfam:YdfA_immunity Pfam:YDG_SRA Pfam:ydhR Pfam:YdjC Pfam:Yeast-kill-tox Pfam:Yeast_MT Pfam:YEATS Pfam:YebG Pfam:YecM Pfam:YfaZ Pfam:YfbU Pfam:YfcL Pfam:YfdX Pfam:YfhO Pfam:YfkB Pfam:YflT Pfam:YfmQ Pfam:YgbA_NO Pfam:YgbB Pfam:YGGT Pfam:YhfT Pfam:YhhN Pfam:YhjQ

Pfam:YHS Pfam:YiaAB Pfam:YibE_F Pfam:YicC_N Pfam:YIF1 Pfam:YiiD_Cterm Pfam:Yip1 Pfam:Yippee Pfam:YjbE Pfam:YjcQ Pfam:YjeF_N Pfam:YjgP_YjgQ Pfam:Ykof Pfam:YkuD Pfam:YkuI_C Pfam:YkyA Pfam:YL1 Pfam:YL1_C Pfam:YlaC Pfam:YliH Pfam:YLP Pfam:YMF19 Pfam:YmgB Pfam:YodA Pfam:YojJ Pfam:YolD Pfam:YonK Pfam:YopD Pfam:YopE Pfam:YopE_N Pfam:YopH_N Pfam:YopJ Pfam:YopR_core Pfam:Yopt Pfam:YopX Pfam:YorP Pfam:Yos1 Pfam:YpM Pfam:Yqai Pfam:YqaJ Pfam:YqcI_YcgG Pfam:YqeY Pfam:YqfD Pfam:YqgB

Pfam:YqhG Pfam:YqhR Pfam:YrbL-PhoP_reg Pfam:YscJ_FliF Pfam:YscJ_FliF_C Pfam:YscK Pfam:YscO Pfam:YscW Pfam:YSIRK_signal Pfam:YtfJ_HI0045 Pfam:YTH Pfam:Ytp1 Pfam:YTV Pfam:YtxC Pfam:YugN Pfam:YukD Pfam:YvbH_ext Pfam:YvfG Pfam:YwhD Pfam:YycH Pfam:YycI Pfam:Y_phosphatase Pfam:Y_phosphatase2 Pfam:Y_Y_Y Pfam:z-alpha Pfam:Z1 Pfam:ZapA Pfam:Zds_C Pfam:Zea_mays_MuDR Pfam:Zein Pfam:Zeta_toxin Pfam:zf-4CXXC_R1 Pfam:zf-A20 Pfam:zf-AD Pfam:zf-AN1 Pfam:zf-BED Pfam:zf-B_box Pfam:zf-C2H2 Pfam:zf-C2H2_jaz Pfam:zf-C2HC Pfam:zf-C2HC5 Pfam:zf-C3H1 Pfam:zf-C3HC Pfam:zf-C3HC4


95

Pfam:zf-C4 Pfam:zf-C4H2 Pfam:zf-C4_C Pfam:zf-C4_ClpX Pfam:zf-C4_Topoisom Pfam:zf-C5HC2 Pfam:zf-CCCH Pfam:zf-CCHC Pfam:zf-CCHH Pfam:zf-CDGSH Pfam:zf-CGNR Pfam:zf-CHC2 Pfam:zf-CHCC Pfam:zf-CHY Pfam:zf-CpG_bind_C Pfam:zf-CSL Pfam:zf-CW Pfam:zf-CXXC Pfam:zf-DBF Pfam:zf-DHHC Pfam:zf-DNA_Pol Pfam:zf-DNL Pfam:zf-Dof Pfam:zf-dskA_traR Pfam:zf-FCS Pfam:zf-FPG_IleRS Pfam:zf-GRF Pfam:zf-H2C2 Pfam:ZF-HD_dimer Pfam:zf-HIT Pfam:zf-HYPF Pfam:zf-like Pfam:zf-LITAF-like Pfam:zf-LSD1 Pfam:zf-LYAR Pfam:zf-MIZ Pfam:zf-MYND Pfam:zf-NADH-PPase Pfam:zf-nanos Pfam:zf-NF-X1 Pfam:zf-NPL4 Pfam:zf-Nse Pfam:zf-P11 Pfam:zf-PARP

Pfam:zf-piccolo Pfam:zf-primase Pfam:zf-RAG1 Pfam:zf-RanBP Pfam:zf-RING-like Pfam:zf-RNPHF Pfam:zf-Sec23_Sec24 Pfam:zf-SNAP50_C Pfam:zf-TAZ Pfam:zf-Tim10_DDP Pfam:zf-TRAF Pfam:zf-TRM13_CCCH Pfam:zf-U1 Pfam:zf-U11-48K Pfam:zf-UBP Pfam:zf-UBR Pfam:zf-XS Pfam:zf-ZPR1 Pfam:Zfx_Zfy_act Pfam:Zip Pfam:ZipA_C Pfam:Zn_clus Pfam:Zn_dep_PLPC Pfam:Zn_peptidase Pfam:Zn_peptidase_2 Pfam:Zona_pellucida Pfam:Zot Pfam:ZU5 Pfam:Zw10 Pfam:ZYG-11_interact Pfam:ZZ PGAM PGA_cap PGRP PH PHB PhBP PHD PhnA_Zn_Ribbon PI3Ka PI3Kc PI3K_C2 PI3K_p85B PI3K_rbd

PIG-X PINc PINT PIPKc Piwi PKD PKS_AT PKS_DH PKS_ER PKS_KR PKS_KS PKS_MT PKS_PP PKS_TE PLAc PLCXc PLCYc PLDc PLEC PLP PlsC Plus3 PMEI POL3Bc POLAc POLBc POLIIIAc POLXc PolyA POP4 PostSET POU POX PP2Ac PP2Cc PP2C_SIG PQQ PreSET PRE_C2HC PriCT_1 Prim-Pol Prim_Zn_Ribbon Pro-kuma_activ PROF


96

ProQ ProRS-C_1 Proteasome_A_N Pro_CA PRP PRY PSA PSI PSN PSP PTB PTBI PTH PTI PTN PTPc PTPc_DSPc PTPc_motif PTX PUA PUG Pumilio PUR PWI PWWP PX PXA PYNP_C QLQ R3H RA RAB rADc RAN RanBD RAP RAS RasGAP RasGEF RasGEFN RBD REC RelA_SpoT RES

Resolvase RGS RHO RHOD RhoGAP RhoGEF Rho_N RIBOc RICIN RIIa RING RINGv RIO RL11 RNAse_Pc RNB Robl_LC7 RPEL RPOL4c RPOL8c RPOL9 RPOLA_N RPOLCX RPOLD RPR RQC RRM RRM_1 RRM_2 RuBisCO_small RUN RWD S1 S4 s48_45 SAA SAF SAM SAM_PNT SAND SANT SAP SAPA SapB

SAR SATase_N SCAN SCP SCPU SCY SEA SEC14 SEC63 Sec63 Sec7 SecA_DEAD SecA_PP_bind SEL1 Sema Semialdhyde_dh SEP SERPIN SET SFM SF_P SH2 SH3 SH3b ShKT SHR3_chaperone signal_peptide Skp1 Sm small_GTPase SMC_hinge SMI1_KNR4 SMR SNc SO SOCS SOCS_box Sorb Spc7 SPEC SPK SpoU_sub_bind SpoVT_AbrB SprT


97

SPRY SPT2 SR SRA SRP54 SRP54_N START STAT_int STE STI STI1 STN STYKc SWAP SWIB SynN S_TKc S_TK_X T5orf172 TAF TAFH TAP_C TarH TBC TBOX TDU TEA TECPR Telomerase_RBD Telo_bind TFIIE TFS2M TFS2N TGc TGFB THAP THEG THN THUMP THY TIFY TilS_C Tim44 TIR

TK TLC TLDc TNF TNFR TOP1Ac TOP1Bc TOP2c TOP4c TOPEUc TOPRIM TPR Transket_pyr transmembrane_domain Trans_reg_C TRASH tRNA_SAD Tryp_SPc TR_FER TR_THY TSP1 TSPc TSPN Tubulin Tubulin_C TUDOR TY TyrKc t_SNARE UAS UBA UBCc Ubox UBQ UBX uDENN UIM UME UTG UTRA VHP VHS VIT VKc

VPS10 VPS9 VWA VWC VWC_def VWC_out VWD WAP WD40 WGR WH1 WH2 WHy WIF WNT1 WR1 WRKY WSC WSN WW WWE X8 XPGI XPGN XTALbg YceI YqgFc Zalpha zf-AD ZipA_C ZM ZnF_A20 ZnF_AN1 ZnF_BED ZnF_C2C2 ZnF_C2H2 ZnF_C2HC ZnF_C3H1 ZnF_C4 ZnF_CDGSH ZnF_CHCC ZnF_DBF ZnF_GATA ZnF_NFX


98

ZnF_PMZ ZnF_Rad18 ZnF_RBZ ZnF_TAZ ZnF_TTF

ZnF_U1 ZnF_UBP ZnF_UBR1 ZnF_ZZ ZnMc

Zn_dep_PLPC Zn_pept ZP Zpr1 ZU5


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