PREMIERE DETECTION DU PARVOVIRUS PORCIN A MADAGASCAR

RAZAFINDRAIBE Nivohanitra Perle

PREMIERE DETECTION DU PARVOVIRUS PORCIN A MADAGASCAR

Thèse pour l’obtention du Diplôme d’Etat de Docteur en Médecine Vétérinaire

UNIVERSITE D’ANTANANARIVO

FACULTE DE MEDECINE

DEPARTEMENT D’ENSEIGNEMENT DES SCIENCES

ET MEDECINE VETERINAIRES

ANNEE : 2014 N° : 120

PREMIERE DETECTION DU PARVOVIRUS PORCIN A MADAGASCAR

THESE

Présentée et soutenue publiquement le 27 novembre 2014 à Antananarivo

Par

Mademoiselle RAZAFINDRAIBE Nivohanitra Perle

Née le 04 Octobre 1990 à Arivonimamo

Pour obtenir le grade de

DOCTEUR EN MEDECINE VETERINAIRE

(Diplôme d'Etat)

Directeur de Thèse : Professeur RATSIMBAZAFIMAHEFA RAHANTALALAO Henriette

MEMBRES DU JURY

Président

Juges

: Professeur RATSIMBAZAFIMAHEFA RAHANTALALAO Henriette

: Professeur RANDRIANJAFISAMINDRAKOTROKOKAnnnnnnnn

Nantenaina Soa

Professeur RASAMBAINARIVO Jhon Henri

Rapporteur : Docteur RASAMOELINA ANDRIAMANIVO Harentsoaniaina

MINISTERE DE L’ENSEIGNEMENT SUPERIEUR

ET DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE

--------------

UNIVERSITE D’ANTANANARIVO

------------

FACULTE DE MEDECINE

--------------------

/Fax : 22 277 04 - : BP. 375 Antananarivo

E-mail : [email protected]

I. CONSEIL DE DIRECTION

A. DOYEN Pr. ANDRIAMANARIVO Mamy Lalatiana B. VICE-DOYENS

Médecine Humaine

- Troisième Cycle Long (Internat Qualifiant, Clinicat, Agrégation et Formations Professionalisantes) Pr. RANDRIAMAROTIA Harilalaina Willy Franck Pr. RANTOMALALA Harinirina Yoël Honora - Scolarité

1er et 2ème cycles et communication Pr. RAHARIVELO Adeline Pr. VOLOLONTIANA Hanta Marie Danielle 3ème cycle court (stage interné,

examens de clinique et thèses) Pr. ROBINSON Annick Lalaina - Téléenseignement, LMD et projets Pr. SOLOFOMALALA Gaëtan Duval - Recherche Pr. RAVELOSON Nasolotsiry Enintsoa

Pharmacie Pr. SAMISON Luc Hervé

Médecine Vétérinaire Pr. RATSIMBAZAFIMAHEFA RAHANTALALAO Henriette C. SECRÉTAIRE PRINCIPAL

- Administration Générale et Finances Mme. RASOARIMANALINARIVO Sahondra H.

II. CONSEIL D’ÉTABLISSEMENT

PRÉSIDENT Pr. RATSIMBAZAFIMAHEFA RAHANTALALAO Henriette

III. CHEFS DE DÉPARTEMENT

Biologie Pr. RAKOTO ALSON Aimée Olivat Chirurgie Pr. RANTOMALALA Harinirina Yoël Honora Médecine Pr. RABEARIVONY Nirina Mère et Enfant Pr. ANDRIANAMPANALINARIVO HERY Rakotovao Pharmacie Dr. RAOELISON Guy Emmanuel Santé Publique Pr. RAKOTOMANGA Jean de Dieu Marie Sciences Fondamentales et Mixtes Pr. AHMAD Ahmad Tête et cou Pr. RAZAFINDRABE John Alberto Bam Vétérinaire Pr. RAFATRO Herintsoa

IV. CONSEIL SCIENTIFIQUE

PRÉSIDENT Pr. ANDRIAMANARIVO Mamy Lalatiana

V. COLLÈGE DES ENSEIGNANTS

A- PRÉSIDENT Pr. RAJAONARISON Bertille Hortense

B- ENSEIGNANTS PERMANENTS

B-1- PROFESSEURS TITULAIRES D’ENSEIGNEMENT SUPÉRIEUR ET DE RECHERCHE

DÉPARTEMENT BIOLOGIE

- Immunologie Pr. RASAMINDRAKOTROKA Andry

DÉPARTEMENT MÉDECINE ET SPÉCIALITÉS MÉDICALES

- Dermatologie Pr. RAPELANORO RABENJA Fahafahantsoa - Endocrinologie et métabolisme Pr. RAMAHANDRIDONA Georges - Néphrologie Pr. RAJAONARIVELO Paul Pr. RABENANTOANDRO Rakotomanantsoa - Neurologie Pr. TEHINDRAZANARIVELO Djacoba Alain

DÉPARTEMENT MÈRE ET ENFANT

- Pédiatrie Pr. RAVELOMANANA RAZAFIARIVAO Noëline

DÉPARTEMENT SANTÉ PUBLIQUE

- Administration et Gestion Sanitaire Pr. RATSIMBAZAFIMAHEFA RAHANTALALAO Henriette

- Éducation pour la Santé Pr. ANDRIAMANALINA Nirina Razafindrakoto - Santé Communautaire Pr. RANDRIANARIMANANA Dieudonné - Santé Familiale Pr. RANJALAHY RASOLOFOMANANA Justin - Statistiques et Épidémiologie Pr. RAKOTOMANGA Jean de Dieu Marie

DÉPARTEMENT SCIENCES FONDAMENTALES ET MIXTES

- Anatomie Pathologique Pr. RANDRIANJAFISAMINDRAKOTROKA Nantenaina Soa

DÉPARTEMENT TÊTE ET COU

- Ophtalmologie Pr. ANDRIANTSOA RASOAVELONORO Violette Pr. BERNARDIN Prisca

B-2- PROFESSEURS D’ENSEIGNEMENT SUPÉRIEUR ET DE RECHERCHE


- Hématologie Biologique Pr. RAKOTO ALSON Aimée Olivat

- Parasitologie Pr. RAZANAKOLONA Lala Rasoamialy Soa

DÉPARTEMENT CHIRURGIE

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- Cardiologie Pr. RABEARIVONY Nirina Pr. RAKOTOARIMANANA Solofonirina - Dermatologie Vénérologie Pr. RAMAROZATOVO Lala Soavina - Hépato-Gastro-Entérologie Pr. RAMANAMPAMONJY Rado Manitrala - Maladies Infectieuses Pr. RANDRIA Mamy Jean de Dieu Pr. ANDRIANASOLO Rado Lazasoa - Médecine Interne Pr. VOLOLONTIANA Hanta Marie Danielle - Néphrologie Pr. RANDRIAMAROTIA Harilalaina Willy Franck Pr. RANDRIAMANANTSOA Lova Narindra - Psychiatrie Pr. RAHARIVELO Adeline Pr. RAJAONARISON Bertille Hortense - Radiothérapie - Oncologie Médicale Pr. RAFARAMINO RAZAKANDRAINA Florine - Réanimation Médicale Pr. RAVELOSON Nasolotsiry Enintsoa DÉPARTEMENT MÈRE ET ENFANT

- Gynécologie Obstétrique Pr. ANDRIANAMPANALINARIVO HERY Rakotovao Pr. RANDRIAMBELOMANANA Joseph Anderson - Pédiatrie Pr. RAOBIJAONA Solofoniaina Honoré Pr. ROBINSON Annick Lalaina DÉPARTEMENT SCIENCES FONDAMENTALES ET MIXTES

- Radiodiagnostic et Imagerie Médicale Pr. AHMAD Ahmad

DÉPARTEMENT TÊTE ET COU

- Neurochirurgie Pr. ANDRIAMAMONJY Clément Pr. RABARIJAONA Mamiarisoa - Stomatologie et Chirurgie Maxillo-Faciale Pr. RAZAFINDRABE John Alberto Bam

DÉPARTEMENT VÉTÉRINAIRE

- Pharmacologie Pr. RAFATRO Herintsoa

B-3- MAITRES DE CONFÉRENCES


- Immunologie Dr. RAJAONATAHINA Davidra Hendrison


- Endocrinologie et Métabolisme Dr. RAKOTOMALALA Andrinirina Dave Patrick - Neurologie Dr. ZODALY Noël - Pneumo-phtisiologie Dr. RAKOTOMIZAO Joocelyn Robert Dr. RAKOTOSON Joëlson Lovaniaina DÉPARTEMENT MÈRE ET ENFANT

- Gynécologie Obstétrique Dr. RASOLONJATOVO Jean de la Croix DÉPARTEMENT CHIRURGIE

- Chirurgie Thoracique Dr. RAKOTOARISOA Andriamihaja Jean Claude DÉPARTEMENT SANTE PUBLIQUE

- Santé Publique Dr. RANDRIAMANJAKA Jean Rémi Dr. RATSIMBASOA Claude Arsène


- Sciences Écologiques, Vétérinaires Agronomiques et Bioingénieries Dr. RAHARISON Fidiniaina Sahondra DÉPARTEMENT PHARMACIE

- Pharmacologie Générale Dr. RAMANITRAHASIMBOLA David - Pharmacognosie Dr. RAOELISON Emmanuel Guy - Biochimie Toxicologie Dr. RAJEMIARIMOELISOA Clara Fredeline - Chimie Organique et Analytique Dr. RAKOTONDRAMANANA

Andriamahavola Dina Louisino DÉPARTEMENT SCIENCES FONDAMENTALES ET MIXTES

- Biophysique Dr. RASATA Ravelo Andriamparany

B-4- ASSISTANTS


- Virologie Dr. KOKO - Technologie Mme. RAHARIMALALA Edwige Marie Julie DÉPARTEMENT PHARMACIE

- Procédés de Production, Contrôle et Qualité des Produits de Santé Dr. RAVELOJAONA RATSIMBAZAFIMAHEFA

Hanitra Myriam

C- ENSEIGNANTS NON PERMANENTS

C-1- PROFESSEURS ÉMÉRITES

Pr. ANDRIAMBAO Damasy Pr. ANDRIANANDRASANA Arthur Pr. ANDRIANARISOA Ange Christophe Félix Pr. ANDRIANJATOVO Joseph Pr. AUBRY Pierre Pr. FIDISON Augustin Pr. KAPISY Jules Flaubert Pr. RABARIOELINA Lala Pr. RABENANTOANDRO Casimir Pr. RABETALIANA Désiré Pr. RADESA François de Sales Pr. RAHARIJAONA Vincent Marie Pr. RAJAONA Hyacinthe

Pr. RAKOTOMANGA Robert Pr. RAKOTOMANGA Samuel Pr. RAKOTO - RATSIMAMANGA S. U Pr. RAKOTOVAO Joseph Dieudonné Pr. RAKOTOZAFY Georges Pr. RAMAKAVELO Maurice Philippe Pr. RAMONJA Jean Marie Pr. RANDRIAMAMPANDRY Pr. RANDRIANASOLO Jean Baptiste Olivier Pr. RANDRIARIMANGA Ratsiatery Honoré Blaise Pr. RATSIVALAKA Razafy Pr. RAZANAMPARANY Marcel Pr. ZAFY Albert

C-2- CHARGE D’ENSEIGNEMENT

DÉPARTEMENT CHIRURGIE

- Chirurgie Générale Pr. RAVELOSON Jean Roger DÉPARTEMENT TÊTE ET COU

- ORL et Chirurgie Cervico-Faciale Pr. RAKOTO Fanomezantsoa Andriamparany

VI. SERVICES ADMINISTRATIFS

CHEFS DE SERVICES

TROISIÈME CYCLE LONG Mme. RANIRISOA Voahangy SCOLARITÉ Mme. SOLOFOSAONA R. Sahondranirina AFFAIRES GÉNÉRALES ET PERSONNEL M. RANDRIANJAFIARIMANANA Charles Bruno

VII. IN MEMORIAM

Pr. RAMAHANDRIARIVELO Johnson Pr. RAJAONERA Fréderic Pr. ANDRIAMASOMANANA Veloson Pr. RAKOTOSON Lucette Pr. ANDRIANJATOVO RARISOA Jeannette Dr. RAMAROKOTO Razafindramboa Pr. RAKOTOBE Alfred Pr. ANDRIAMIANDRA Aristide

Dr. RABEDASY Henri Pr. MAHAZOASY Ernest Pr. RATSIFANDRIHAMANANA Bernard Pr. RAZAFINTSALAMA Charles Pr. RANAIVOARISON Milson Jérôme Pr. RASOLONJATOVO Andriananja Pierre Pr. MANAMBELONA Justin Pr. RAZAKASOA Armand

Dr. RAKOTONANAHARY Pr. ANDRIANTSEHENO Raphaël Pr. RANDRIAMBOLOLONA Robin Pr. RAMANANIRINA Clarisse Pr. RALANTOARITSIMBA Zhouder Pr. RANIVOALISON Denys Pr. RAKOTOVAO Rivo Andriamiadana Pr. RAVELOJAONA Hubert Pr. ANDRIAMAMPIHANTONA Emmanuel Pr. RANDRIANONIMANDIMBY Jérôme Pr. RAKOTONIAINA Patrice Pr. RAKOTO-RATSIMAMANGA Albert Pr. RANDRIANARISOLO Raymond

Emile Pr. RAMIALIHARISOA Angeline Pr. RAKOTOBE Pascal Pr. RANAIVOZANANY Andrianady Pr. RANDRIANARIVO Pr. RAKOTOARIMANANA Denis Roland Pr. ANDRIAMANANTSARA Lambosoa Pr. RAHAROLAHY Dhels Pr. ANDRIANJATOVO Jean José Pr. ANDRIANAIVO Paul Armand Pr. RANDRIAMBOLOLONA RASOAZANANY Aimée Pr. RATOVO Fortunat Pr. GIZY Ratiambahoaka Daniel Pr. RASOLOFONDRAIBE Aimé

DEDICACES ET REMERCIEMENTS

AU SEIGNEUR JESUS CHRIST,

Mon Maître souverain.

A MES PARENTS,

A qui je dois ce que je suis devenue aujourd’hui.

Sans vous, je pense que je n’en serai pas là. Votre soutien, même à 1000km pendant ces

7 années, m’a été indispensable. Cette thèse est la finalité de mes études mais aussi de

celle des vos efforts. Merci, je vous aime.

A MA SŒUR HOLY,

Pour m’avoir toujours soutenu et m’avoir permis de faire mes études dans les meilleures

conditions, pour ton aide, pour la confiance et l’affection dont tu as toujours fait preuve.

Je te souhaite à toi aussi de réussir.

A TANTELY, TOKY, TIAVINA, BEBE FAMILY

Pour tout ce qu’ils m’ont apporté. Je vous souhaite tant de belles choses !

A mes amis Mbolatiana et NyAina,

Pour tous ces moments partagés, pour leur présence et leur soutien.

Avec toute mon amitié. Mbolatiana, je te réponds : à ma grande sœur spirituelle !

A FANOMEZANA, A RINA, A TOUTE MA FAMILLE, ET A TOUS MES AMIS,

Idem, Merci de tout mon cœur.

A VINCENT PORPHYRE, Coordinateur du Projet QualiREG et Chercheur au Cirad,

Sincères remerciements.

A TOUS LES ELEVEURS D’ARIVONIMAMO ET D’IMERINTSIATOSIKA

A TOUS CEUX QUI ONT CONTRIBUE DE PRES OU DE LOIN A LA

REALISATION DE CE TRAVAIL

Nos sincères remerciements.

A NOTRE MAITRE DIRECTEUR ET PRESIDENT DE THESE

Madame le Docteur RATSIMBAZAFIMAHEFA RAHANTALALAO Henriette

Professeur Titulaire d’Enseignement Supérieur et de Recherche en Santé

Publique à la Faculté de Médecine de l’Université d’Antananarivo

Vice Doyen responsable Médecine Vétérinaire

C’est un très grand honneur pour nous d’avoir accepté de présider cette thèse.

Veuillez trouver ici l’expression de notre profonde gratitude.

A NOS MAITRES ET HONORABLES JUGES DE THESE

Monsieur le Docteur RANDRIANJAFISAMINDRAKOTROKA Nantenaina Soa

Professeur Titulaire Honoraire d’Enseignement Supérieur et de Recherche en

anatomie pathologie

Enseignant à la Faculté de Médecine et au Département d’Enseignement des

Sciences et de Médecine Vétérinaires

Monsieur le Docteur RASAMBAINARIVO Jhon Henri

Vétérinaire agrégé en Médecine Vétérinaire et en Production Animale

Enseignant au Département d’Enseignement des Sciences et de Médecine

Vétérinaires

Nous sommes particulièrement honorés que vous ayez accepté de juger notre travail.

Veuillez trouver ici l’expression de notre profonde reconnaissance et de nos sentiments

respectueux.

A NOTRE RAPPORTEUR DE THESE

Monsieur le Docteur RASAMOELINA ANDRIAMANIVO Harentsoaniaina

Docteur en Médecine Vétérinaire

PhD en Epidémiologie et Maladies Infectieuses

Nous vous remercions d’avoir accepté la direction de ce travail, de toute l’aide que vous

nous avez apportée et de toute l’attention que vous nous avez accordée durant sa

réalisation.

Veuillez trouver ici l’expression de notre profonde gratitude et de notre reconnaissance.

A NOTRE MAITRE ET DOYEN DE LA FACULTE DE MEDECINE

D’ANTANANARIVO

Monsieur le professeur ANDRIAMANARIVO Mamy Lalatiana

Nos respectueuses considérations.

A TOUS NOS MAITRES ET PROFESSEURS DE LA FACULTE DE

MEDECINE et DEPARTEMENT D’ENSEIGNEMENT DES SCIENCES ET DE

MEDECINE VETERINAIRES

Nos vives reconnaissances pour tout l’enseignement et la formation que nos avons

reçus.

SOMMAIRE

SOMMAIRRE

Pages

INTRODUCTION ........................................................................................................... 1

PREMIERE PARTIE : SYNTHESE BIBLIOGRAPHIQUE

I. Généralité sur la filière porcine à Madagascar ..................................................... 3

I.1. Place de l’élevage porcin dans le secteur élevage .............................................. 3

I.2. Répartition du cheptel ........................................................................................ 4

I.3. Zone de production ............................................................................................. 5

I.4. Système de production ....................................................................................... 6

I.4.1. Type d’élevage ................................................................................................ 6

I.4.2. Type de production ......................................................................................... 6

I.4.3. Conduite d’élevage ......................................................................................... 6

I.4.4. Méthodes de reproduction .............................................................................. 7

I.4.5. Alimentation ................................................................................................... 7

I.5. Commercialisation .............................................................................................. 7

II. Rappel théorique sur la parvovirose porcine ........................................................ 8

II.1. Répartition géographique ................................................................................... 8

II.2. Importance économique ..................................................................................... 9

II.3. Etiologie ............................................................................................................. 9

II.4. Propriétés biophysique et biochimiques ........................................................... 10

II.5. Epidémiologie .................................................................................................. 10

II.5.1. Caractère immunologique de l’infection ................................................... 11

II.5.2. Espèces affectées et facteurs de réceptivité .............................................. 11

II.5.3. Sources de contamination ......................................................................... 12

II.5.4. Voies de contamination ............................................................................. 12

II.5.5. Facteurs de risque de la maladie ............................................................... 12

II.6. Signes cliniques ................................................................................................ 12

II.7. Pathogénie ........................................................................................................ 16

II.8. Lésions .............................................................................................................. 18

II.9. Diagnostic ......................................................................................................... 19

I.1.1. Diagnostic clinique ....................................................................................... 19

I.1.2. Diagnostic de laboratoire .............................................................................. 20

II.10. Dispositif général de lutte ................................................................................. 21

DEUXIEME PARTIE : METHODE ET RESULTATS

I. METHODE............................................................................................................. 22

I.1. Zone d’étude ..................................................................................................... 22

I.1.1. Délimitation et situation géographique ......................................................... 22

I.1.2. Climat............................................................................................................ 23

I.1.3. Secteur agricole............................................................................................. 23

I.2. Type d’étude ..................................................................................................... 26

I.3. Période et durée d’étude ................................................................................... 26

I.4. Population d’étude ............................................................................................ 26

I.4.1. Critères d’inclusion pour les élevages .......................................................... 26

I.4.2. Critères d’inclusion pour les porcs ............................................................... 26

I.4.3. Critères d’exclusion pour les porcs ............................................................... 26

I.5. Taille de l’échantillon ....................................................................................... 27

I.6. Mode d’échantillonnage ................................................................................... 27

I.7. Collecte des données ........................................................................................ 27

I.7.1. Prélèvement biologique ................................................................................ 28

I.7.2. Enquête ......................................................................................................... 28

I.7.3. Analyse sérologique ...................................................................................... 29

I.8. Traitement et analyse des données ................................................................... 31

I.8.1. Paramètres à étudier ...................................................................................... 31

I.8.2. Stockage et manipulation des données ......................................................... 37

I.8.3. Modélisation statistique ................................................................................ 37

I.9. Considération éthique ....................................................................................... 31

II. RESULTATS .......................................................................................................... 40

II.1. Description de l’échantillon ............................................................................. 40

II.2. Présentation des élevages ................................................................................. 41

II.2.1. Type d’exploitations.................................................................................. 41

II.2.2. Effectif des animaux ................................................................................. 41

II.2.3. Structure et hygiène générales des exploitations ...................................... 42

II.2.4. Biosécurité de l’exploitation ..................................................................... 44

II.2.5. Gestion de la reproduction ........................................................................ 46

II.2.6. Promiscuité des animaux d’élevage avec des animaux en

nnnnnnnprovenance d’Ambilobe ............................................................................. 47

II.3. Séroprévalence du PPV .................................................................................... 49

II.3.1. Prévalence au niveau élevage.................................................................... 49

II.3.2. Séroprévalence du PPV au niveau animal ................................................ 49

II.3.3. Séroprévalence du PPV en élevage associé à des signes cliniques ........... 50

II.4. Facteurs de risque ............................................................................................. 51

TROISIEME PARTIE : DISCUSSION ...................................................................... 53

CONCLUSION .............................................................................................................. 60

BIBLIOGRAPHIE

ANNEXES

LISTE DES TABLEAUX

Pages

Tableau I : Superficie agricole et surface exploitée en 2001……………………23

Tableau II : Répartition des superficies cultivées par type de culture au

niveau du districtd’Arivonimamo……………………………………24

Tableau III : Variables liées à la structure de l’élevage……………………………32

Tableau IV : Variables liées à l’entretient de bâtiment…………………………….33

Tableau V : Variables liées à la biosécurité de l’exploitation……………………..34

Tableau VI : Variables liées à la gestion de la reproduction……………………….35

Tableau VII : Variables liées à l’animal…………………………………………….36

Tableau VIII : Variables explicatives………………………………………………...36

Tableau IX : Représentation des échantillons par commune……………….............40

Tableau X : Structure générale du bâtiment……………………………………….42

Tableau XI : Entretien du bâtiment………………………………………………...43

Tableau XII : Gestion de la reproduction……………………………………….......47

Tableau XIII : Résultats des analyses sérologiques du PPV au niveau

élevages………………………………………………………………49

Tableau XIV : Résultats des analyses sérologiques pour le PPV au niveau

animal………………………………………………………………...50

Tableau XV : Nombre d’élevages séropositifs avec des signes cliniques

pouvant être liée à une infection par le PPV…………………………51

Tableau XVI : Sélection univariée des variables (p < 0.20)…………………………52

Tableau XVII : Modèle multivariée avec AIC =196,76………………………………53

LISTE DES FIGURES

Pages

Figure 1 : Effectif du cheptel animal par espèce à Madagascar …………………..3

Figure 2 : Répartition du cheptel porcin à Madagascar …………………………..4

Figure 3 : Répartition des effectifs du cheptel porcin par province………………5

Figure 4 : Représentation schématique du PPV et la fonction de

transcription et de réplication de l’ADN…………………………….....9

Figure 5 : Fœtus momifiés de différente taille…………………………………...13

Figure 6 : Fœtus infectés par le PPV (A) Fœtus momifiés d’une

truie infectée expérimentalement par le PPV.

(B) Fœtus momifiés d’une truie infectée

naturellement par le PPV……………………………………………..14

Figure 7 : Avortons d’une truie infectée par le PPV…………………………….14

Figure 8 : Conséquence de l’infection fœtale par le PPV……………………….15

Figure 9 : Représentation schématique de la physiopathologie

du Parvovirus porcin………………………………………………….17

Figure 10 : Embryon d’une truie infectée par le PPV qui présente

des résorptions des fluides et des tissus mous………………………...18

Figure 11 : Tissus fœtaux infectés par le PPV (A) foyer de nécrose

hépatique de fœtus infecté par le PPV (B) Lésions

périvasculaires avec des cellules mononucléaires

dans le cerveau de fœtus infecté par le PPV………………………….19

Figure 12 : Localisation de la zone d’étude……………………………………….22

Figure 13 : Production agricole annuelle en tonne dans la zone d’étude…………24

Figure 14 : Effectif de cheptels au niveau de la zone d’étude…………………….25

Figure 15 : Effectif des animaux par catégorie…………………………………....40

Figure 16 : Répartition des élevages par type d’exploitation……………………...41

Figure 17 : Répartition des exploitations par nombre de porcs élevés…………….41

Figure 18 :

Figure 19 :

Figure 20 :

Figure 21 :

Figure 22 :

Contact entre élevages à travers les matériels et les personnels……....44

Répartition des élevages par type de visiteur………………………….45

Pratique du vide sanitaire dans les exploitations enquêtées…………...45

Prise de mesures prophylactiques lors d’introduction des nouveaux

porcs……………………………………………………………...……..48

Origine des animaux élevés…………………………………………….48

Figure 23 : Répartition des animaux prélevés selon par origine…………………....48

LISTE DES SIGLES ET ABREVIATIONS

ADN : Acide Désoxyribonucléique

AIC : Critère d’information d’Akaïke

DO : Densité Optique

DRZV : Département De Recherches Zootechniques Et Vétérinaires

ELISA : Enzyme linked immunosorbent assay

IF : Immunofluorescence

IHA : Hemagglutination Inhibition

MAP : Maladie D’amaigrissement Du Porcelet

OR : Odds Ratio

PCD : Plan communal de développement

PCR : Polymerase Chain Reaction

PCV2 : Porcine Circovirus Type 2

PMWS : Postweaning Multisystemic Wasting Syndrom

PPV : Parvovirus porcin

PRRS : Porcine Respiratory and Reproductive Syndrome

SDRP : Syndrome dysgénésique et respiratoire porcin

LISTE DES ANNEXES

ANNEXE 1 : Questionnaire d’enquête pour les élevages de porcs

ANNEXE 2 : Fiche d’identification de l’animal

ANNEXE 3 : Liste des vaccins monovalents et bivalents contre le PPV

ANNEXE 4 : Critère d’information d’Akaïke (AIC)

ANNEXE 5 : Résultat de l’analyse univariée

ANNEXE 6 : Odds ratio

INTRODUCTION

1

INTRODUCTION

Le parvovirus porcin (PPV) est l'une des causes majeures de troubles de la

reproduction chez les truies. Cliniquement, la maladie associée à ce virus est

caractérisée par des mortalités fœtales et embryonnaires, des momifications fœtales, des

avortements [1]. Le virus est présent dans le monde entier et l’infection liée existe à

l'état enzootique au niveau des exploitations porcines [2].

Les cinq continents sont touchés par la parvovirose porcine [3-11]. C’est une

maladie négligée en Afrique. Sa présence sur ce continent a été démontrée uniquement

en Afrique du Sud, en Uganda et au Mozambique [12-14].

A Madagascar, la connaissance des maladies de la reproduction porcine reste

de nos jours encore très limitée. En 2010, une étude au niveau des trois communes:

Imerintsiatosika, Mahitsy, Talata Volonondry a confirmé la présence du Circovirus

porcin de type 2 agent causal de la maladie d'amaigrissement des porcelets [15]. La

maladie d'amaigrissement des porcelets est une maladie multifactorielle dont le

parvovirus porcin (PPV) est l'un de ces facteurs [16].

Depuis mars 2011, une forte augmentation des problèmes au niveau du

naissage porcin a été constatée sur les communes d’Arivonimamo et d’Imerintsiatosika :

des momifications fœtales, des mortinatalités, des avortements, des troubles de retour en

chaleur chez les femelles, durée de gestation prolongée. Ces troubles ont engendré

d'énormes pertes économiques pour les éleveurs. La connaissance de la pathologie en

cause pourrait être une des solutions pour diminuer ces pertes.

En égard à ces constats, la question qui se posait était de savoir si les troubles

de la reproduction constatées au niveau des communes d’Arivonimamo et

d’Imerintsiatosika avaient un lien avec la parvovirose porcine. Si la présence du PPV

était confirmée, quels en sont les facteurs de risque favorisant son introduction dans les

élevages?

L’objectif général de cette recherche était la détection de la circulation du

Parvovirus porcin à Madagascar.

2

Cette recherche se base sur les hypothèses suivantes :

i- Le PPV circulerait dans les élevages porcins. La non mise en évidence de sa

présence à Madagascar résulte du fait qu’il n’a jamais été recherché.

ii- Les conditions et le conduit d’élevage ainsi que l’origine et la catégorie de

l’animal détermineraient le risque de propagation et d’entretien du PPV dans les

élevages.

Pour vérifier ces hypothèses, les objectifs spécifiques de l’étude étaient

d’estimer la fréquence du Parvovirus porcin dans la zone d’étude et à plus grande

échelle à Madagascar, ainsi que d’identifier les facteurs de risque associés à l’infection

des élevages et des animaux.

La première partie du travail consiste en une synthèse bibliographique sur

l’élevage porcin à Madagascar, ainsi que sur le PPV. Les deux autres parties traitent de

l’étude de prévalence, des facteurs de risque, et de leurs implications en termes de

recommandations.

PREMIERE PARTIE : SYNTHESE BIBLIOGRAPHIQUE

I. Généralité sur la

L’élevage de porc est très répandu à Madagascar.

concerne l’ensemble du territoire national

non négligeable pour les foyers malgaches. L’introduction de la

(PPA) en 1997 a engendré des pertes économiques considérables

abattage sanitaire et arrêt des activ

1997 et 1999 la moitié du cheptel porcin a été décimée

sous forme enzootique avec des foyers de résurgences

I.1.

Figure

(Adapté par l’auteur à partir des données

2004-2005 élaboré par le Ministère de l’agriculture, de l’élevage et de la pêche)

D’après les données statistiques du recensement agricole en 2004

Madagascar compte 1.3 m

rang du cheptel après l’élevage des volailles (2.3 millions de têtes) et celui des bovins

(9.5 millions de têtes)

têtes de truies et 67 325 verrats. La race locale prédomine aussi bien pour les mâles que

pour les femelles. Le nombre de truies de races améliorées est estimé à 7 723 têtes dont

plus de 5400 têtes pour la province d’Antananarivo. En se référant aux résultats du

Recensement National de l’Agriculture de 1984

enregistré un taux de croissance annuel moyen de 2,7%, malgré l’épidémie de la peste

porcine africaine [18]

69,00%

3

Généralité sur la filière porcine à Madagascar

L’élevage de porc est très répandu à Madagascar. La pratique de cet élevage

concerne l’ensemble du territoire national [17, 18]. Il constitue une source de revenu

non négligeable pour les foyers malgaches. L’introduction de la Peste Porcine Africaine

(PPA) en 1997 a engendré des pertes économiques considérables

abattage sanitaire et arrêt des activités d’environ 1 éleveur sur 5.

1997 et 1999 la moitié du cheptel porcin a été décimée. Aujourd’hui, la maladie circule

sous forme enzootique avec des foyers de résurgences [17].

Place de l’élevage porcin dans le secteur élevage

Figure 1 : Effectif du cheptel animal par espèce à Madagascar

(Adapté par l’auteur à partir des données statistiques du recensement agricole

2005 élaboré par le Ministère de l’agriculture, de l’élevage et de la pêche)

D’après les données statistiques du recensement agricole en 2004

Madagascar compte 1.3 millions de têtes de porcs. La filière porcine tient le troisième


(9.5 millions de têtes) (Figure 1). 179 992 têtes assurent la reproduction dont 112 667

es et 67 325 verrats. La race locale prédomine aussi bien pour les mâles que


400 têtes pour la province d’Antananarivo. En se référant aux résultats du

sement National de l’Agriculture de 1984-1985, l’effectif du cheptel porcin a


].

23,00%

3%2%

3%

69,00%

La pratique de cet élevage

Il constitue une source de revenu

Peste Porcine Africaine

(PPA) en 1997 a engendré des pertes économiques considérables : mortalités directes,

ités d’environ 1 éleveur sur 5. Il est estimé qu’entre

. Aujourd’hui, la maladie circule

Place de l’élevage porcin dans le secteur élevage

ffectif du cheptel animal par espèce à Madagascar

statistiques du recensement agricole

2005 élaboré par le Ministère de l’agriculture, de l’élevage et de la pêche)

D’après les données statistiques du recensement agricole en 2004-2005,

illions de têtes de porcs. La filière porcine tient le troisième


179 992 têtes assurent la reproduction dont 112 667

es et 67 325 verrats. La race locale prédomine aussi bien pour les mâles que


400 têtes pour la province d’Antananarivo. En se référant aux résultats du

1985, l’effectif du cheptel porcin a


bovin

porcin

ovin

caprin

volaille

4

I.2. Répartition du cheptel

Il y a des provinces et régions à forte densité de porcs et d’autres qui ont de

petits effectifs par ménage [19] (Figure 2).

Figure 2 : Répartition du cheptel porcin à Madagascar

(Source : Unité épidémiologie et socio-économie FOFIFA - DRZV)

Malgré l’incidence de la PPA qui dérange la répartition géographique

habituelle, les plus gros effectifs de porcs sont dans les régions traditionnellement

productrices de cultures vivrières [19]. Antananarivo et Fianarantsoa regroupent 67% de

l’effectif total (Figure 3) [18].

Figure 3

(Adapté par l’auteur

I.3.

Dans la province d’Antananarivo, les lieux de production se trouvent dans la

zone de capitale, les sous

Arivonimamo, Imerintsiatosika, Ambatolampy), Betafo, Antanifotsy, Anjozorobe,

Tsiroanomandidy.

Dans la province d’Antsiranana, la production se concentre premièrement dans

la sous-préfecture d’Ambilobe puis à Andapa.

Dans la province de Fianarantsoa

Mania.

Dans la province de Toliara

Dans la province de Mahajanga

Dans la province

27%

5

3 : Répartition des effectifs du cheptel porcin par province

(Adapté par l’auteur à partir des données statistiques de Recensement Agriculture 2004-2005)

Zone de production

la province d’Antananarivo, les lieux de production se trouvent dans la

zone de capitale, les sous-préfectures l’entourant (Ambohidratrimo, Manjakandriana,


la province d’Antsiranana, la production se concentre premièrement dans

préfecture d’Ambilobe puis à Andapa.

Dans la province de Fianarantsoa : Vangaindrano, Ambohimahasoa, Amoron’i

Dans la province de Toliara : Mahabo, Beroroha et Belo/Tsi

Dans la province de Mahajanga : Port Bergé, Kandreho et Maevatanana.

Dans la province de Toamasina : zone du Lac Alaotra [18]

40%

8%10%

11%4%

épartition des effectifs du cheptel porcin par province

à partir des données statistiques de Recensement

la province d’Antananarivo, les lieux de production se trouvent dans la

dratrimo, Manjakandriana,


la province d’Antsiranana, la production se concentre premièrement dans

: Vangaindrano, Ambohimahasoa, Amoron’i

Mahabo, Beroroha et Belo/Tsiribihina.

: Port Bergé, Kandreho et Maevatanana.

[18]

antananarivo

fianarantsoa

toamasina

mahajanga

toliara

antsiranana

6

I.4. Système de production

I.4.1. Type d’élevage

Deux types d’élevage ont été décrits dans des zones de production porcine :

i- L’élevage traditionnel où les porcs restent en divagation pendant toute la

journée. La nuit ils sont parqués dans des cases ou dans la maison de l’éleveur ;

ii- L’élevage amélioré qui est représenté par l’élevage fermé. Les porcs sont en

claustration permanente dans des cases munies de murs en bois ou en brique.

Ces deux types d’élevage ont été décrits dans trois zones de production porcine

à savoir la commune d’Arivonimamo, la région de Marovoay et celle du lac Alaotra

[20-22].

I.4.2. Type de production

Au sein de ces différents types d’élevage se distinguent les élevages naisseurs,

engraisseurs et naisseur-engraisseurs:

i- Les naisseurs font uniquement du naissage de porcelets (futurs porcs à l’engrais

et futurs reproducteurs) ;

ii- Les engraisseurs produisent des porcs engraissés destinés à la consommation ;

iii- Les naisseur-engraisseurs pratiquent en même temps l’activité de naisseur et

d’engraisseur.

Parmi les naisseurs et les naisseur-engraisseurs, certains éleveurs pratiquent

l’activité de verratier. Ces derniers utilisent leur verrat pour la saillie de truies d’autres

éleveurs [20-22].

I.4.3. Conduite d’élevage

i- Bâtiments

Les bâtiments d’élevage sont à l’image des types d’élevage rencontrés.

Dans l’élevage traditionnel, les porcs sont en divagation. La nuit ils sont mis

soit dans des cases en bois ou en terre battue munie de toiture en matières végétales, soit

dans une pièce de l’habitation de l’éleveur [20-22].

L’élevage amélioré dispose de bâtiments diversifiés pour les animaux: murs en

bois, en terre battue ou en brique (parfois cimentés), sol cimenté et toiture en matières

7

végétales ou en tôle. Dans des productions plus intensives, les porcs sont élevés dans

des bâtiments en dur avec un sol et des murs cimentés et une toiture en tôle [20-22].

ii- Race

Les races de porcs rencontrées sont les races exotiques (Large White ou

Landrace) et locales (kisoa gasy). Au sein des élevages, il existe également des

croisements entre les races exotiques et locales, ou entre les races exotiques elles-

mêmes [20-22].

I.4.4. Méthodes de reproduction

Le mode de reproduction le plus répandu est la monte naturelle. Dans ce cas,

deux schémas peuvent se rencontrer :

i- Soit l’éleveur possède son propre verrat et fait saillir ses truies avec ce dernier ;

ii- Soit il a recours au verrat d’un autre élevage.

L’insémination artificielle se pratique également mais très rarement [20-22].

I.4.5. Alimentation

Dans l’élevage traditionnel, les porcs sont nourris essentiellement avec du son

de riz. Des compléments sont apportés tels que les déchets de cuisine, de la verdure

(fourrage, feuilles de manioc, feuilles de tarot…) ou encore des légumes (cuits ou crus).

Parfois l’éleveur incorpore des sources de protéines (tourteaux, poissons séchés…) et de

vitamines dans l’aliment.

Dans l’élevage amélioré, les éleveurs distribuent de la provende formulée par

eux-mêmes ou fabriquée industriellement.

Tous les produits sont disponibles aux niveaux des marchés locaux aussi bien

les matières premières que les provendes préfabriquées [20-22].

I.5. Commercialisation

Les acteurs de la commercialisation sont représentés par les éleveurs et les

bouchers au niveau local, et par les collecteurs au niveau régional. Les intermédiaires

assurent parfois les échanges entre ces différents acteurs.

Les marchés de porcs vivants, souvent situés à proximité des villes ou des

villages, représentent le lieu privilégié d’achats et de ventes d’animaux.

L’acheminement des porcs se fait le plus souvent à pied. Les animaux destinés à la

8

vente concernent aussi bien les porcs à l’engrais que les reproducteurs (cochette, truie,

verrat). Les échanges se font également entre éleveurs, soit directement entre eux soit

par l’intermédiaire d’une tierce personne.

Le boucher local s’approvisionne directement dans les élevages. L’abattage des

porcs se fait soit dans l’exploitation elle-même soit au niveau des aires d’abattage.

Les collecteurs assurent les échanges entre les régions et collecte des porcs

jusque dans les villages les plus reculés.

Le circuit de commercialisation se fait au rythme des variations saisonnières.

Outre, le pouvoir d’achat de l’éleveur, les achats comme les ventes sont régis par

certaines périodes comme les périodes de fête ou les périodes de soudure des matières

premières pour l’aliment [20-22].

II. Rappel théorique sur la parvovirose porcine

La parvovirose porcine est une maladie virale hautement contagieuse et

pathogène caractérisée par des troubles de la reproduction dans les exploitations

porcines : naisseurs, naisseur-engraisseurs [23, 24]. La maladie se développe

rapidement, chez les truies qui sont exposées au virus par voie oro-nasale, à n’importe

quel moment de la première moitié de la gestation. Par la suite, les porcelets sont en

général infectés par voie transplacentaire avant qu’ils deviennent immunocompétents.

Chez les truies non gestantes, l’infection ne donne pas des symptômes définitifs

évidents et la perte économique n’est pas significative [25]. Les aspects classiques de la

parvovirose porcine sont plus marqués chez les jeunes animaux reproducteurs. Les

études effectuées ont indiqué l’allure enzootique de cette maladie dans la plupart des

troupeaux infectés testés [26]. La présence ubiquitaire du Parvovirus porcin (PPV),

virus responsable de cette maladie, rend la population porcine largement immunisée

[27, 28]. La trace de l’infection laissée par le PPV est facilement vérifiée par la

surveillance sérologique des troupeaux [29].

II.1. Répartition géographique

Le PPV étant ubiquitaire, tous les continents sont touchés par la maladie

notamment en Europe et en Asie [2, 4-13, 30, 31].

9

II.2. Importance économique

L’infection associée au PPV entraine des pertes économiques énormes dans le

monde [24, 32]. Le PPV est la cause infectieuse majeure qui provoque l’augmentation

de taux des échecs de la reproduction dans les élevages porcins [33]. Les pertes sont

très remarquables au niveau du naissage porcin. Elles sont liées aux symptômes apparus

chez les truies et les porcelets infectés par leurs mères durant la gestation :

momifications fœtales et mortalités embryonnaires, mortinatalités, avortements,

prolongation de la durée de gestation, infertilité, porcelets très faibles à la naissance

[34].

II.3. Etiologie

L’agent causal responsable de la parvovirose porcine est le PPV. Le PPV vient

du mot latin « parvus » qui signifie « petit » [35]. L’espèce Porcine parvovirus

appartient à la famille de Parvoviridae, classifié dans le genre Parvovirus. La capside

virale est non enveloppée avec un diamètre d’environ 25 nm, de symétrie icosaèdrale et

composée de 60 copies de protéines structurales (Figure 4) [36, 37].

Figure 4 : Représentation schématique du PPV et la fonction de

transcription et de réplication de l’ADN.

(Source : Thiry Etienne. Maladie virales porcines)

10

Six groupes différents de Parvovirus qui infectent l’espèce porcine ont été

identifiés : Porcine parvovirus classique type 1 (PPV1), PPV2, PPV3 (connu aussi sous

les noms Porcine PARV4, hokovirus, ou partetravirus), PPV4, PPV5, et porcine

bocaviruses (PBoV). Le PPV2 est identifié pour la première fois en Myanmar en 2001,

en Chine de 2006 à 2007 et en Hongrie en 2012 [8]. Le PPV3 a été isolé en Hong Kong

en 2010, le PPV4 a été initialement identifié chez les porcs en USA, diagnostiqués avec

le Porcine circovirus, puis en Chine, en Hongrie et en Afrique. Durant l’étude de

prévalence de PPV4 en USA, un nouvel PPV a été identifié et nommé PPV5 [39]. Tous

les PPV isolés sont antigéniquement similaires, sinon identiques. Toutefois, ses identités

peuvent être établies relativement par des tests sérologiques rigoureux comme la

séroneutralisation (SN), l’inhibition à l’hémagglutination (HI) [40].

II.4. Propriétés biophysique et biochimiques

Le PPV a une densité légère : 1.38-1.395 pour un virion infectieux complet,

1.30-1.315 pour un virion incomplet vide et 1.724 pour un extrait de virion sur le brin

d’ADN [41]. Le virus présente une grande stabilité génétique et antigénique [27]. Il

possède une extrême résistance dans le milieu ambiant et il peut rester infectieux au

moins 4 mois dans les bâtiments antérieurement infectés par les porcs [42]. L’infectivité

du virus, l’activité de l’hémagglutination et l’antigénicité sont remarquablement

résistantes à la chaleur, à une vaste étendue de concentration d’ion hydrogène et aux

enzymes [25]. Le PPV est thermostable, il résiste aux divers désinfectants courant [43].

II.5. Epidémiologie

Le PPV est présent dans le monde entier [2]. L’infection existe à l’état

enzootique dans de nombreuses porcheries. La persistance du virus dans le milieu

extérieur explique sa pérennité dans les exploitations contaminées [27].

11

II.5.1. Caractère immunologique de l’infection

De nombreuses cochettes sont infectées naturellement avant la conception.

Elles développent une immunité active à vie et elles sont protégées des troubles de la

reproduction induits par le virus [27, 44].

L’infection active avec une virémie peut survenir chez les animaux adultes et

cela pourrait être mesuré par la procédure standard de l’inhibition à l’hémagglutination.

Chez un porc naturellement infecté, la virémie survient dans les 6 jours après l’infection

et persiste 1 à 5 jours. Le virus est excrété principalement dans les fèces à partir de 14ème

jours après l’infection et l’anticorps est détecté 7 à 9 jours post-infection par le HI.

L’immunité passive peut persister 4 à 9 mois. Cette durée est liée au titre d’anticorps

que possède la truie [29].

Les truies primipares, qui ne sont pas immunisées (par vaccination ou par

l’infection naturelle), risquent la virémie durant la gestation et l’infection des fœtus [25,

45].

Les porcelets nouveau-nés reçoivent un titre élevé d’anticorps via le colostrum

de leurs mères. Ces titres diminuent progressivement avec l’âge de l’animal. Les jeunes

truies possèdent généralement des anticorps colostraux qui durent jusqu’à l’âge de 3 à 6

mois. Les anticorps qui sont acquis passivement interfèrent avec le développement de

l’immunité active [25, 45].

Un niveau d’anticorps élevé peut prévenir l’infection et un faible niveau

d’anticorps peut minimiser la dissémination de virus par les porcs infectés [46, 47].

Un certain nombre de jeunes truies ne deviennent donc vraiment sensibles à

l’infection que peu de temps avant la fécondation ou en début de gestation. Quand les

truies sont infectées par le PPV avant le 55ème jour de gestation, les porcelets nés sont

infectés mais dépourvus d’anticorps [25].

II.5.2. Espèces affectées et facteurs de réceptivité

Les suidés : les porcs domestiques et sauvages [48].

Les femelles sont affectées surtout les truies primipares et les cochettes [27].

12

II.5.3. Sources de contamination

Les animaux infectés constituent la source principale du virus à travers leurs

excrétions et leurs sécrétions : matières fécales, salives, sécrétions nasales, spermes ;

ainsi que les fœtus momifiés et avortés [27, 49].

Les locaux contaminés peuvent être le réservoir du virus même un an ou plus

après l’apparition de la maladie dans l’exploitation [25].

II.5.4. Voies de contamination

Les plus communes voies des infections prénatales et postnatales des porcelets

sont respectivement la voie transplacentaire et la voie oro-nasale [25].

Les porcs adultes se contaminent par voie orale [27]. L’infection peut aussi

survenir par voie vénérienne lors de la saillie. La contamination intra-utérine entre les

foetus est très fréquente à cause de la dissémination rapide de virus dans l’utérus [50,

26].

II.5.5. Facteurs de risque de la maladie

L’hygiène et la biosécurité des exploitations constituent le premier facteur de

risque à cause de la résistance du PPV dans l’environnement [27].

Les cochettes et les truies primipares non vaccinées sont aussi responsables de

la diffusion et la multiplication du virus au niveau de la ferme [27].

Les verrats pourraient aussi jouer un rôle important dans la propagation de PPV

[50].

La promiscuité des porcs domestiques et des sangliers augmente le risque de la

propagation de PPV [48].

II.6. Signes cliniques

Le PPV est la cause du syndrome SMEDI (Stillbirths, Mummified fetuses,

Embryonic Death, Infertility) : la présence de porcelets momifiés de différentes tailles

(Figures 5,6) mortinatalités, mortalités embryonnaires et infertilité. Il y a d’autres

troubles de la reproduction : retour en chaleur en pleine gestation et retard de retour en

13

chaleur après l’avortement, la naissance de porcelets faibles, l’avortement (Figure7), la

viabilité réduite des nouveau-nés [33, 51].

L’infection de la truie est subclinique. Seules les conséquences sur les

embryons et fœtus sont visibles. Les symptômes se manifestent surtout chez les truies

nullipares et primipares [27]. Il faut remarquer que la truie retourne en œstrus à la suite

de la mortalité embryonnaire précoce et de la résorption des embryons. Elle peut mettre

bas une portée dont une partie est constituée de fœtus momifiés [52]. La portée peut être

aussi de petite taille. La présence de fœtus momifiés peut accroître la durée de la

gestation. L’intervalle de gestation sera aussi augmenté [53].

Figure 5 : Fœtus momifiés de différente taille

(Source : Thiry Etienne. Virologie clinique du porc)

Figure 6

infectée expérimentalement par le PPV. (B) Fœtus momifiés d’une truie infe

Figure

(Source

14

: Fœtus infectés par le PPV (A) Fœtus momifiés d’une truie

infectée expérimentalement par le PPV. (B) Fœtus momifiés d’une truie infe

naturellement par le PPV.

(Source: Mengeling. Disease of swine)

Figure 7 : Avortons d’une truie infectée par le PPV


: Fœtus infectés par le PPV (A) Fœtus momifiés d’une truie

infectée expérimentalement par le PPV. (B) Fœtus momifiés d’une truie infectée

uie infectée par le PPV

: Thiry Etienne. Maladie virales porcines)

15

La circonstance pathologique de la parvovirose porcine dépend principalement

du moment où survient l’exposition de truie au virus pendant la gestation (Figure 8)

[25].

Figure 8 : Conséquence de l’infection fœtale par le PPV


Avant le 30ème jour de gestation : l’infection provoque une mortalité

embryonnaire précoce.

Entre 30-70ème jours de gestation : l’infection entraine une momification de

tous les fœtus car leurs systèmes immunitaires ne peuvent pas répondre à l’infection.

Chez les truies gravides infectées après 70ème jour de la gestation : survie des

porcelets. Il faut remarquer que l’infection pourra atteindre les fœtus alors que ses

systèmes immunitaires sont fonctionnels [54, 55].

Le PPV peut entrainer aussi la diarrhée chez les porcelets, mais le PPV ne

réplique pas extensivement dans les épithéliums intestinaux et ne provoque pas des

entérites [56].

Le PPV a aussi été isolé chez les porcelets présentant des lésions vésiculaires

mais son rôle dans ces lésions n’a pas été clairement définit [57]. L’infection par le PPV

n’altère ni la fertilité, ni la libido du verrat [58, 59].

16

II.7. Pathogénie

Les truies ne sont susceptibles aux troubles de la reproduction induites par le

PPV que si l’infection aura lieu durant la première moitié de la gestation [60].

L’apparition de l’immunocompétence fœtale survient aux alentours de 60-70

jours de gestation. Bien que les fœtus puissent mourir de cette infection, ils auront

surtout eu le temps de produire des anticorps spécifiques [54, 55].

L’infection emprunte la voie oro-nasale et parfois la voie vénérienne par du

sperme infecté. Le virus se dissémine par une virémie transitoire, associée à une

hyperthermie et une leucopénie bénigne [27]. Le PPV a un tropisme pour les cellules en

multiplication active, particulièrement les organes lymphoïdes. Ainsi, le virus peut

affecter l’embryon, surtout après la phase d’implantation (soit 14 jours) ou le fœtus. En

cas d’infection d’une truie gravide, le virus traverse le placenta et infecte les embryons

ou les fœtus 10 à 14 jours après le début de l’infection (Figure 9) [51].

A l’issue de l’infection transplacentaire, les embryons meurent et sont résorbés.

Les fœtus meurent de lésions nécrotiques présentes dans de nombreux tissus et organes.

Le PPV provoque une destruction des endothéliums vasculaires [27].

Une fois un fœtus est infecté, les autres pourront être contaminés par

contiguïté, ce qui explique que les fœtus momifiés sont souvent de tailles différentes

[54, 55].

La dissémination intra-utérine du PPV est probablement liée à la période de

l’infection de la mère car si l’infection des embryons est très précoce, ils sont

rapidement résorbés et effectivement deviennent réservoir du virus [51]. Les effets du

PPV dans les ovules, avant la période d’ovulation, ne sont pas connus. Les virus

adhèrent à la surface externe de la zone pellucide des ovules fécondés mais ne peuvent

pas pénétrer dans cette couche. Les chercheurs suggèrent que cette spéculation peut

engendrer une menace aux embryons après l’explosion. La zone pellucide peut protéger

préalablement l’embryon pendant que l’immunité locale se développe [61, 62].

17

Figure 9 : Représentation schématique de la physiopathologie du Parvovirus

porcin


En même temps, le virus entraine des changements utérins incompatibles à la

gestation. En l’absence des réponses immunitaires, le virus se réplique extensivement

dans tous les tissus et par la suite, la plupart des cellules contiennent une quantité

importante d’antigène viral intracytoplasmique et ces antigènes pourraient être détectés

par l’immunoflorescence microscope [25].

La pénétration du virus dans les cellules aboutit à la réplication virale et la mort

cellulaire en même temps. La destruction du système circulatoire du fœtus est indiquée

par l’œdème, hémorragie et accumulation d’une quantité importante de fluide sanguine

dans les cavités naturelles [62].

Quelque soit la voie de contamination, la virémie maternelle est une condition

préalable qui induit l’infection transplacentaire [25, 60].

18

II.8. Lésions

Aucune lésion macroscopique ou microscopique n’est observées chez les truies

non gestantes. Les infiltrations cellulaires décrites chez les fœtus peuvent être induites

par l’infection périnatale [63].

Les truies séronégatives, quand leurs fœtus sont infectés à partir de 70ème jour

de gestation, vont présenter une accumulation focale des cellules mononucléées

adjacentes à l’endomètre et dans la couche épaisse de la lamina propria [64]. Les truies

séropositives présentent aussi une accumulation focale des lymphocytes dans l’utérus

quand leurs fœtus sont infectés [63]. Le virus est largement distribué dans le placenta et

les tissus embryonnaires. Les changements macroscopiques des embryons sont marqués

par les résorptions des fluides et des tissus mous (Figure10) [65].

De nombreux changements macroscopiques sont observés chez les fœtus

infectés avant le développement des réponses immunitaires : augmentation importante

des vaisseaux sanguins sur la surface des fœtus à cause de la congestion et la perte de

sang dans les tissus adjacents, œdème, hémorragie avec accumulation des fluides

sanguines dans les cavités et une décoloration hémorragique qui devient

progressivement très sombre après la mortalité et la déshydratation. Les mêmes

changements sont observés dans le placenta [25].

Figure 10 : Embryon d’une truie infectée par le PPV qui présente des

résorptions des fluides et des tissus mous


Les lésions microscopiques chez les fœtus consistent premièrement à une

nécrose cellulaire extensive dans plusieurs tissus et organes, ensuite les inflammations

et les inclusions intranucléaires (Figure 11A) [66].

19

Chez les fœtus infectés ayant des systèmes immunitaires fonctionnels, les

lésions microscopiques sont des hypertrophies endothéliales et infiltrations des cellules

nucléaires avec des réponses immunitaires [64].

Figure 11 : Tissus fœtaux infectés par le PPV (A) foyer de nécrose hépatique

de fœtus infecté par le PPV (B) Lésions périvasculaires avec des cellules

mononucléaires dans le cerveau de fœtus infecté par le PPV


On observe une méningo-encéphalite caractérisée par des tuméfactions

périvasculaires avec prolifération des cellules adventices, des histiocytes et quelques

cellules plasmatiques chez les porcelets mort-nés infectés par le PPV (Figure 11B).

Cette lésion est pathognomonique de l’infection liée au PPV [53].

II.9. Diagnostic

I.1.1. Diagnostic clinique

Les troubles de la reproduction : augmentation de la momification fœtale et des

retours en chaleur indiquent une infection à PPV. Toutes les autres données

épidémiologiques doivent être considérées : l’allure enzootique de la maladie,

l’implication des truies primipares et cochettes, constatation des autres troubles de la

20

reproduction comme l’avortement, l’infertilité et la prolongation de la durée de la

gestation. Toutefois, la confirmation de la maladie doit être appuyée par un diagnostic

de laboratoire [27, 25].

I.1.2. Diagnostic de laboratoire

Le diagnostic de l’infection liée au PPV est basée par la démonstration de

la présence de PPV ou des antigènes viraux chez les fœtus momifiés de moins de 14cm

de long, ou des anticorps de PPV dans les sérums des fœtus momifiés de plus de 16cm

de long, les truies et les cochettes [25, 67]. L’isolement viral est plus rarement effectué

[3]. L’amplification génique par le PCR (Polymerase Chain Reaction) est réalisée sur

les reins et les poumons du fœtus [68].

i. Recherche des antigènes

L’antigène viral dans les fœtus de moins de 14cm de long pourrait être

démontré par l’immunofluorescence, l’immunodiffusion, l’hémagglutination (HA),

l’ELISA (Enzyme-linked immunosorbent assay) [49, 69, 70].

(1) Hémagglutination :

Les prélèvements utilisés sont les tissus viscéraux (intestins, reins, foie,

poumons). Le diluant le plus couramment utilisé est le Phosphate buffered saline [31].

(2) ELISA antigène :

L’ELISA est une méthode plus sensible (pour la détection des antigènes ou

des anticorps de PPV) que le HA. La présence des antigènes viraux est indiquée par des

anticorps monoclonaux qui se conjuguent avec l’enzyme. La couleur produite lors du

test est relative à la concentration d’antigène dans les sérums examinés. La densité

optique des sérums testés est comparée avec une courbe standard [25].

(3) Immunodiffusion pour la détection d’antigène :

Cette méthode est suffisamment sensible pour détecter l’antigène viral dans les

fœtus momifiés. Les prélèvements sont identiques à ceux du test HA. Le diluant courant

est le Borate buffer (pH 8.6) [25].

21

ii. Recherche d’anticorps

Les tests utilisés pour la détection de la présence des anticorps de PPV chez les

truies, cochettes et les fœtus momifiés sont : le test ELISA, la séroneutralisation (SN),

l’immunodiffusion, l’inhibition à l’hémagglutination (IHA) [25].

Le test IHA est fréquemment utilisé pour la détection et la quantification des

anticorps humoraux de PPV. Les anticorps peuvent être détectés 5 jours après

l’exposition des truies au virus [25].

Le test SN est occasionnellement utilisé pour la détection et la quantification

des anticorps humoraux de PPV. La neutralisation de l’infectivité est usuellement

confirmée par l’absence ou réduction des inclusions intranucléaires ou des cellules

fluorescentes dans les cultures. Ce test est plus sensible que le test HI [25].

II.10. Dispositif général de lutte

En raison de la résistance du virus dans l’environnement et la fréquence de

l’infection et la sensibilité immunologique des jeunes truies vers 5-7 mois, la

vaccination reste le seul moyen de contrôle de la parvovirose porcine [26]. Tous les

vaccins contre la parvovirose chez le porc sont destinés à vacciner la mère et entraver la

transmission transplacentaire lors d'un contact ultérieur avec le virus sauvage. [29]. Pour

ce faire, il faut vacciner les cochettes et les jeunes truies avant de les reproduire [27]. Le

vaccin pourrait être administré plusieurs semaines avant la conception pour assurer

l’immunité pendant la période susceptible de la gestation [71].

Plusieurs variétés de vaccins sont disponibles à l’étranger : les vaccins

parvovirus monovalents et les vaccins combinés [72, 73] (Annexe 3). La plupart des

vaccins contient de virus inactivé et des adjuvants appropriés pour l’inoculation

intramusculaire [74]. En général, les réponses sérologiques fournies par la vaccination

sont inférieurs à celles qui sont conférées par l’infection naturelle. Les titres d’anticorps

diminuent avec le temps. Quelques animaux présentent des anticorps non détectés par le

test HI mais ils sont protégés par l’infection [29].

La vaccination des truies et verrats séronégatifs sont recommandés [25].

DEUXIEME PARTIE : METHODE ET RESULTATS

22

I. METHODE

I.1. Zone d’étude

L’étude s’est déroulée au niveau des deux communes où l'on a constaté de

forts troubles de la reproduction soit Arivonimamo et Imerintsiatosika, deux communes

du District d’Arivonimamo de la région d'Itasy.

Figure 12 : Localisation de la zone d’étude

(Adapté par l’auteur à partir de Google Earth)

I.1.1. Délimitation et situation géographique

La ville d'Arivonimamo, chef lieu de district, est située à 45 km de la capitale

d’Antananarivo, avec une superficie de 120 km2. La commune urbaine d’Arivonimamo

compte 13 fokontany.

23

Située à 27 km d’Antananarivo, sur la route nationale N°01, Imerintsiatosika

fait partie des 22 communes de district d’Arivonimamo. La commune rurale

d’Imerintsiatosika se trouve à 18 km d’Arivonimamo et s’étend sur une superficie de

173 km2.

I.1.2. Climat

Les deux communes font partie du régime climatique tropical d’altitude

supérieure à 900 mètres. Elles sont caractérisées par une température moyenne annuelle

inférieure ou égale à 20°C [75].

L’année comporte deux saisons bien individualisées : une saison pluvieuse et

moyennement chaude, de Novembre à Mars et une autre fraîche et relativement sèche,

durant le reste de l’année. Il existe de nombreux sous-climats [75].

I.1.3. Secteur agricole

i. Agriculture

L’agriculture, comme dans tout Madagascar, constitue l’activité principale au

niveau de la commune urbaine d’Arivonimamo et la commune rurale

d’Imerintsiatosika. En effet, les conditions agro-climatiques et humaines permettent une

vaste gamme de cultures [75].

(1) Superficie agricole :

La potentialité agricole est limitée d’une part par le lessivage du sol ferralitique

et d’autre part par le relief très accidenté (Tableau I) [75].

Tableau I : Superficie agricole et surface exploitée en 2001

District

Superficie cultivable

(Ha)

Superficie cultivée (Ha)

Pourcentage / superficie cultivée

ARIVONIMAMO

60 866

29234

48%

Source : Annuaire statistique agricole de 2001

Les surfaces cultivées sont occupées à 95% par des cultures vivrières (Tableau

II) [75].

Tableau II : R

niveau du district d’Arivonimamo

Culture vivrière

(Ha)

28 294

En général, le calendrier agricole est presque étendu sur toute l’année avec un

rythme plus accéléré pendant la saison

manioc, maïs, patate douce, haricot et la pomme de terre

Figure 13 : Production agricole annuelle

(Adapté par l’auteur à partir de données

La riziculture concerne les deux communes avec une forte production par

rapport aux autres cultures

nettement celle du riz dans la commune rurale d’Imerintsiatosika

0

2000

4000

6000

8000

Riz (en t) Manioc (en t)

24

Répartition des superficies cultivées par type de culture au

niveau du district d’Arivonimamo

Culture de rente

(Ha)

Culture industrielle

(Ha)

15

925

Source : Annuaire statistique agricole de 2001

(2) Production :


rythme plus accéléré pendant la saison pluvieuse [75]. Les principales cultures sont

manioc, maïs, patate douce, haricot et la pomme de terre (Figure 1

Production agricole annuelle en tonne dans la zone d’étude

(Adapté par l’auteur à partir de données statistiques du CIREL

Miarinarivo en 2005)


rapport aux autres cultures (Figure 13). Néanmoins, la production de manioc dépasse

nettement celle du riz dans la commune rurale d’Imerintsiatosika (Figure 1

Manioc (en t)

Pomme de terre

(en t)

Patate douce (ent)

Saonjo (en t)

Arachide (en t)

Maïs (en

Arivonimamo Imerintsiatosika

épartition des superficies cultivées par type de culture au

Culture industrielle

Total

29.234

: Annuaire statistique agricole de 2001


Les principales cultures sont : riz,

e 13) [76].

en tonne dans la zone d’étude

statistiques du CIREL


Néanmoins, la production de manioc dépasse

(Figure 13).

Maïs (en t)

Haricots (en t)

25

ii. Elevage

De part ses climats, ces deux communes est, à tous point de vue, favorable à

l’élevage [76].

A part l’élevage porcin, Imerintsiatosika est considéré par l’évolution de

l’élevage des volailles. L’exploitation bovine n’est pas négligeable (Figure 14). Durant

les trois dernières années, l’élevage porcin occupe une place importante au niveau de la

commune et il a connu un développement remarquable. Selon les données statistiques

dans le Plan Communal de Développement de la commune rurale d’Imerintsiatosika en

2011, l’effectif du cheptel porcin est de 6 514. On peut trouver des éleveurs des porcs

dans tous les 37 fokontany même en pleine ville. On remarque que la commune

d’Imerintsiatosika est le lieu d’approvisionnement en porcelets des communes voisines

(Arivonimamo I, Arivonimamo II, Manalalondo, Ampahimanga,…) [77].

La commune urbaine d’Arivonimamo compte 2 276 têtes de porcs.

L’aviculture et l’élevage bovin tiennent aussi une place non négligeable (Figure 14)

[76].

Figure 14 : Effectif de cheptels au niveau de la zone d’étude

(Adapté par l’auteur à partir de données statistiques du CIREL

Miarinarivo en 2005)

0

2000

4000

6000

8000

10000

12000

14000

16000

18000

Bovins Porcins Volailles

Arivonimamo

Imerintsiatosika

26

I.2. Type d’étude

Afin de répondre aux objectifs de l’étude, une étude transversale descriptive a

été effectuée au sein de la zone d’étude.

I.3. Période et durée d’étude

Les troubles de la reproduction chez les truies au niveau de ces deux

communes ont été observées depuis février 2011. L’étude a été commencée la mi-mars

2013 est terminée le mois d’Août 2014.

I.4. Population d’étude

La population d’étude était les porcs et les éleveurs porcins au niveau des

communes d’Arivonimamo et d’Imerintsiatosika.

I.4.1. Critères d’inclusion pour les élevages

Toutes les exploitations porcines de type améliorée sont inclues dans la

population d’étude.

I.4.2. Critères d’inclusion pour les porcs

Un animal a été inclus dans la population d’étude s’il remplissait l’un des

critères suivants :

Cochette âgée de plus de trois mois quelque soit sa race

Truie : quelque soit sa parité, son âge et sa race

Les femelles en provenance d’Ambilobe qui sont arrivées en moins

d’une semaine quelque soit ses races.

I.4.3. Critères d’exclusion pour les porcs

Etaient exclues de la population d’étude les truies en troisième mois de

gestation.

I.4.4. Critère d’exclusion pour les élevages

Les élevages ne possédaient pas des femelles à prélever au moment de

l’enquête étaient exclus.

27

I.5. Taille de l’échantillon

La taille de l’échantillon est calculée à partir d’une proportion.

� =�2 × �(1 − �)

�2

n : la taille de l’échantillon attendu (le nombre des animaux à prélever)

t : niveau de confiance déduit du taux de confiance (1,96)

e : erreur absolue (5%)

p=87% (prévalence de la parvovirose porcine lors de la détection de PPV chez

les truies en Thaïlande) [3].

Le calcul a été effectué sous le logiciel WinEpiscope2.0 [78].

Ainsi, la détection de cette maladie avait besoin de 165 têtes de porcs.

Le nombre moyen de truies dans chaque élevage dans la zone d’étude a été

estimé à 2 à 3 têtes. Ce qui ramène le nombre d’élevage à enquêter à 165/2,5 égale à 66

élevages (2,5 : moyenne de nombre de truie par élevage).

I.6. Mode d’échantillonnage

Il s’agit d’un échantillonnage empirique.

La sélection des élevages était basée sur l’acceptation des éleveurs après

vérification des critères d’inclusion.

Ensuite, le choix des animaux dans chaque ferme était exhaustif : toutes les

femelles remplissant les critères d’inclusion étaient sélectionnées.

I.7. Collecte des données

La collecte des données consistait à des prélèvements sanguins chez les porcs

femelles, des enquêtes auprès des éleveurs porcins et des analyses sérologiques.

28

I.7.1. Prélèvement biologique

Des prélèvements sanguins sur les porcs ont été effectués le mois de mars et le

mois d’avril 2013. Le sang est prélevé au niveau de la veine jugulaire. La prise se faisait

sur un animal debout pour faciliter la ponction jugulaire et le repérage de la veine. La

contention a été assurée par un lasso métallique placé autour du groin, l’animal

réagissait en tirant en arrière, ce qui exposait la région cervicale. Le manipulateur

portait un casque protecteur pour atténuer les cris de l’animal afin de garder sa

concentration pendant la séance de prélèvement. Le sang était récolté dans un tube sec

de 10 ml, ensuite stocké à 4°C. Chaque tube était identifié par un code représenté par

une succession des chiffres et des lettres à l’aide d’un stylo indélébile. La séparation de

sérum du caillot était effectué le lendemain et les sérums recueillis étaient stockés dans

un congélateur jusqu’au moment où ils étaient acheminés au laboratoire du Département

de Recherche Zootechnique et Vétérinaire (DRZV) où ils sont conservés à -80°C avant

l’analyse.

Vu la différence des statuts sanitaires entre les élevages étudiés, des mesures de

biosécurités ont été prises pour éviter la contamination par des différents agents

pathogènes d’un élevage à un autre : désinfection de tous les matériels, les accessoires

utilisés (bottes, combinaisons, lasso, guide, chaussures) et les mains avant l’entrée et à

la sortie de chaque élevage ; port des bottes et de combinaison imperméables et faciles à

nettoyer. Pour éviter la transmission d’éventuelles maladies entre les animaux, les

matériels utilisés étaient à usages uniques (aiguilles, gants).

I.7.2. Enquête

i. La pré-enquête

Une première version du questionnaire de l’enquête a été élaborée en vue de

tester la fiabilité par une pré-enquête. La pré-enquête nous a permis : de nous

familiariser avec le travail d’enquête, de voir la réaction des éleveurs face à une telle

sollicitation, et d’apporter des modifications au questionnaire.

29

ii. Le questionnaire

Le contenu de la version finale du questionnaire et les fiches par animal

(illustrés en annexe I), adopté après corrections comportaient des questions concernant à

la fois la structure, l’entretien et les renseignements généraux par exploitation.

iii. Déroulement de l’enquête

Les enquêtes ont été effectuées simultanément avec les prélèvements sanguins.

Les informations concernant l’exploitation en générale ont été recueillies en premier

lieu. Elles donnaient tous les renseignements sur le type d’exploitation, le type

d’élevage pratiqué, la taille du cheptel et l’effectif de porcs élevés par catégorie.

Ensuite, une enquête accompagnée d’une observation directe de bâtiment d’élevage a

été effectuée afin de collecter les informations sur la structure générale de la porcherie,

l’entretien et l’hygiène des locaux des animaux. D’autres questions ont été posées afin

de collecter les données relatives à la biosécurité de l’exploitation, la pratique et la

gestion de la reproduction des animaux, l’observation par l’éleveur des problèmes du

naissage et des symptômes qui pourraient être en relation avec la parvovirose porcine.

I.7.3. Analyse sérologique

L’analyse sérologique a été réalisée au laboratoire du DRZV en utilisant le test

ELISA indirect comme méthode. Le kit « LSIV et TM Porcine Parvovirosis – Sérum »

(PPVAC), utilisable sur sérum individuel de porc, a été choisi pour effectuer l’examen.

La préparation de tous les réactifs a été faite avant la réalisation du test.

Mode opératoire

Les échantillons et les contrôles (Contrôles positif et négatif) pré-dilués (1/200

en solution tampon) étaient déposés dans les plaques sensibilisées avec de l’antigène

PPV. Ensuite, une dilution en série des sérums du 1/200 au 1/12800 dans la solution

tampon a été réalisée avant l’agitation douce et la couverture de plaques à l’aide des

adhésifs de plaque. Puis les plaques étaient incubées pendant 1 heure à 37±2°C pour

30

permettre aux antigènes PPV de se lier avec les anticorps anti-PPV présents dans les

échantillons.

Après quatre lavages successifs avec la solution de lavage à raison de 300µl

par cupule, 100 µl de conjugué a été distribué dans chaque cupule. Le conjugué anti-

IgG de porc marqué à la peroxydase ajouté se fixait sur les anticorps préalablement

fixés sur les microcupules. Les plaques étaient agitées doucement et couvertes à l’aide

des nouveaux adhésifs de plaque, puis incubées pendant 1 heure à température ambiante

(21±4°C).

Avant l’addition de substrat dans chaque cupule, les quatre lavages décrits

précédemment ont été procédés. Les plaques sont incubées 10 minutes à température

ambiante (21±4°C) et à l’obscurité sans les couvrir.

La solution Stop a été distribuée dans chaque cupule et dans le même ordre que

le substrat. Après arrêt de la réaction, la coloration reste verte.

La lecture des résultats est réalisée par un spectrophotomètre. Le test a été

validé si :

DOmPC > 1,0

DOmPC – DomNC > 0,7

DOmPC : densité optique moyenne de contrôle positif

DOmNC : densité optique moyenne de contrôle négatif

La positivité de chaque échantillon était déterminée par la valeur de E/P

(Echantillon/Positif).

�/� =DO échantillon − DOmNC

DOmPC – DomNC

Les échantillons positifs possédaient une valeur de E/P supérieur ou égale à

0,15.

31

I.8. Traitement et analyse des données

I.8.1. Paramètres à étudier

De nombreux paramètres au niveau de chaque exploitation et au niveau animal

ont été évoqués, à savoir : l’hygiène et la structure générale de la porcherie, le niveau

de biosécurité, la gestion de la reproduction, la parité des femelles, et l’origine des

animaux.

Les variables explicatives étaient représentées par :

i. Les variables liées à la structure et l’hygiène de l’élevage concernaient

l’étanchéité du mur de la porcherie, l’emplacement et la structure de la

fosse à lisier, le type du sol (Tableau III), le mode de nettoyage de

bâtiment et la fréquence de nettoyage (Tableau IV).

ii. Les variables liées au niveau de biosécurité d’élevage concernaient le

contacte de l’exploitation avec d’autre élevage porcin, la présence et la

fréquence des visiteurs dans l’élevage, la prise des mesures

prophylactiques après introduction des nouveaux animaux, la pratique

de la désinfection, le vide sanitaire et l’implantation de bâtiment

(Tableau V).

iii. Les variables liées à la gestion de la reproduction concernaient la

possession et la location de verrat, la présence des mesures prises après

la saillie (Tableau VI).

iv. Les variables liées à l’animal concernent la catégorie et l’origine

(Tableau VII).

Les variables à expliquer étaient représentées par la séropositivité de l’animal

et de l’élevage (Tableau VIII).

32

Tableau III : Variables liées à la structure de l’élevage

Variables Modalités Type de

variable

Description

Etanchéité du

mur de la

porcherie

Fermé

Semi-

fermé

Variable

qualitative

nominale

Fermé : construction de mur en

dur (brique, béton)

Semi-fermé : indique la

présence des interstices sur le

mur (bois, tôle,…)

Emplacement

de la fosse à

lisier

Près

Moyen

Loin

Variable

qualitative

ordinale

Distance entre la fosse à lisier

et le bâtiment

Structure de

la fosse à lisier

Ouverte

Couverte

Plein air

Variable

qualitative

nominale

Structure de la fosse à lisier

Type du sol Facile à

nettoyer

Difficile

à nettoyer

Variable

qualitative

nominale

Caractéristique du sol de la

porcherie

(facile à nettoyer : caillebotis

béton ; difficile à nettoyer :

bois, terre battue,…)

Evacuation

d’eau Hors

Près

Rien

Variable

qualitative

nominale

Technique de déversement

des eaux provenant de

l’élevage

Source : Auteur

33

Tableau IV : Variables liées à l’entretien de bâtiment

Variables Modalités Type de variable Description

Mode de

nettoyage Avec lavage

Sans lavage

Sans nettoyage

Variable

qualitative

nominale

Mode de nettoyage

de la porcherie

Fréquence de

nettoyage Journalière

Hebdomadaire

Mensuelle

Rien

Variable

qualitative

nominale

Journalière : nettoyage une ou deux fois par jour Hebdomadaire : nettoyage une ou deux fois par semaine

Source : Auteur

34

Tableau V : Variables liées à la biosécurité de l’exploitation

Variables Modalités Type de

variable

Description

Contacte avec

des autres

élevages

Oui

Non

Variable

qualitative

binaire

Présence ou l’absence de contacte (personnel ou matériels) de l’élevage avec d’autre élevage

Visiteurs Oui

Non

Variable

qualitative

binaire

Présence de passage des visiteurs dans l’exploitation

Type de

visiteurs

Personnels

de soin

Autres

Variable

qualitative

nominale

Personnels de soin : visite des vétérinaires ou des techniciens d’élevage dans l’élevage Autres : visite par les bouchers, les grossistes d’abattoir, collecteurs, éleveurs

Mesure après

introduction

des nouveaux

animaux

Oui

Non

Variable

qualitative

binaire

Prise ou non des mesures après l’introduction des nouveaux porcs dans l’élevage (par exemple : quarantaine)

Désinfection Oui

Non

Variable

qualitative

binaire

Pratique de désinfection dans l’exploitation

Vide sanitaire Oui

Non

Variable

qualitative

binaire

Pratique ou non du vide sanitaire

Présence de

clôture OUI

NON

Variable

qualitative

binaire

Présence de clôture autour du bâtiment.

Source : Auteur

35

Tableau VI : Variables liées à la gestion de la reproduction

Variables Modalités Type de variables Description

Possession de

verrat Oui

Non

Variable qualitative

binaire

Présence ou non de mâle reproducteur dans la ferme

Verratier Oui

Non


binaire

Le verrat dans l’exploitation sert pour la saillie des autres femelles hors de l’exploitation

Lieu de saillie Dans

l’élevage

Verratier


nominale

Dans l’élevage : pas de déplacement de truie Verratier : déplacement de truie

Mesure après

saillie Oui

Non


binaire

Prise ou non des mesures après la saillie (par exemple : désinfection, isolation,…)

Source : Auteur

36

Tableau VII : Variables liées à l’animal

Variables Modalités Type de variable

Description

Catégorie Cochette Truie nullipare Truie primipare Truie multipare

Variable

qualitative

ordinale

Catégorie des

femelles

reproductrices au

niveau de

l’exploitation

Origine Arivonimamo

Imerintsiatosika

Ambilobe

Autre

Variable

qualitative

nominale

Provenance des

femelles

Source : Auteur

Tableau VIII : Variables explicatives

Variables Modalités Type de variable Description

Séropositivité de

l’animal

Positif

Négatif


binaire

Séropositivité de

l’animal vis-à-vis

du PPV

Séropositivité de

l’élevage

Positif

Négatif


binaire

Séropositivité de

l’élevage vis-à-vis

du PPV

Source : Auteur

37

I.8.2. Stockage et manipulation des données

Les données ont été stockées sous Microsoft Office Excel 2007.Toutes les

données de l’enquête et d’observations ont été codifiées pour faciliter et permettre leur

traitement et analyse statistique.

i. Caractérisation des élevages

Elle a été faite à l’aide des tris à plat de chaque variable pour déterminer les

fréquences de chaque modalité pour les variables qualitatives et les moyennes pour les

variables quantitatives.

ii. Séroprévalence

Un élevage a été considéré contaminé par le PPV (positif), si au moins un des

animaux testés au niveau de cet élevage s’est relevé positif à l’analyse sérologique (test

ELISA).

iii. Analyses statistiques des données

L’analyse des facteurs de risque a été effectuée sous le logiciel R.3.1.1(R

Development Core Team, 2014). La variable dépendante (variable à expliquer) a été

représentée par la séroprévalence au niveau individu et les variables indépendantes

(variables explicatives) par les facteurs de risque.

Vingt-et-une variables explicatives sont retenues pour la détermination des

facteurs de risque. Les variables étudiées, tirées de la littérature [27, 48,50], sont issues

des questionnaires concernant la structure générale et l’entretien de l’élevage, la

biosécurité de l’exploitation, la gestion de la reproduction, la catégorie des truies ainsi

que l’origine des animaux.

I.8.3. Modélisation statistique

Le type de modèle statistique utilisé dans la première étape a été le modèle

linéaire généralisé mixte (GLMM) avec la fonction logistique comme fonction de lien.

La fonction logistique est un modèle logistique qui permet d’exprimer

l’association entre la maladie et l’exposition au facteur étudié au moyen de l’Odds ratio

ou OR (rapport des côtes) (cf Annexe). C’est un modèle qui permet d’exprimer sous

38

forme de risque (ou de probabilité) la relation entre une variable Y dichotomique et une

ou plusieurs variables Xi, qui peuvent être qualitatives ou quantitatives. Y caractérise la

maladie et les Xi caractérisent les i facteurs de risque [79].

Dans une deuxième étape, les variables sélectionnées dans le premier modèle

ont été réexaminées en utilisant le critère d’information d’Akaïke (AIC) (cf Annexe).

L’AIC représente donc un compromis entre le biais, diminuant avec le nombre

de paramètres, et la parcimonie, volonté de décrire les données avec le plus petit nombre

de paramètres possibles. Le meilleur modèle est celui possédant l’AIC le plus faible.

Le critère d’information d’Akaike est basé sur l’échantillon observé et peuvent

servir à sélectionner le meilleur modèle parmi un ensemble de modèles possibles.

L’équation pour l’obtention de ce critère est représentée dans l’annexe [79].

Pour une facilité de lecture lors de l’interprétation des associations entre les

variables retenues dans le modèle final, au lieu d’interpréter l’Odds ratio en terme de

valeur de l’Odds entre les différentes modalités de variables avec modalité de référence,

l’interprétation a été simplifiée comme une multiplication de risque.

i. Analyse univariée

Elle a permis de présélectionner, parmi les facteurs de risque potentiels, les

variables explicatives ayant une différence significative (cf Annexe). Le seuil de

significativité défini était p < 0,20.

L’analyse univariée a été réalisée pour mettre en relation une à une chaque

variable explicative avec la variable réponse. Une analyse de la variance de chaque

variable a ensuite été effectuée au moyen du test de rapport de vraisemblance. Toutes

les variables ayant p < 0,20 ont été retenues pour l’étape d’analyse multivariée.

ii. Analyse multivariée

Cette analyse consistait à retenir le meilleur modèle ayant le critère

d’information d’Akaïke le plus faible. Dès lors, il s’agissait d’une méthode de stepwise

39

1ou association de méthodes ascendante1 et descendante2 pour écarter les corrélations

avec d’autres variables introduites après coup dans le modèle.

Le modèle final après avoir effectué cette analyse multivariée est donc un

modèle au sein duquel toutes les variables sont significatives. Le seuil de significativité

défini dans l’analyse multivariée est p ≤ 0,05.

I.9. Considération éthique :

Cette recherche respectait la notion de consentement volontaire et éclairé. Elle

respectait aussi la sécurité des truies gestantes, les cochettes, les truies de toutes

catégories qui étaient objets de prélèvement sanguin ainsi que la confidentialité des

secrets des techniques par ferme.

1 Sélection en avant en examinant un modèle avec une seule variable explicative puis introduction une à

une d’autres variables explicatives. 2 Elimination d’une variable la moins significative du modèle.

II. RESULTATS

II.1.

Au total, 60 élevages ont été enquêtés

commune urbaine d’Arivonimamo et les 35 autres au niveau de la commune rurale

d’Imerintsiatosika (Tableau IX).

Tableau IX :

Communes

Arivonimamo

Imerintsiatosika

Total

Au total, 167 prélèvements sanguins de femelles de porc ont été recueillis et

analysés dont 64% était représenté par des cochettes

8%

40

RESULTATS

II.1. Description de l’échantillon

total, 60 élevages ont été enquêtés : 25 ont été pris au niveau de la


(Tableau IX).

Représentation des échantillons par commune

Effectif des élevages enquêtés

Effectif des animaux

Arivonimamo

Imerintsiatosika

25

35

60


analysés dont 64% était représenté par des cochettes (Figure 15).

Figure 15 : Effectif des animaux par catégorie

64%

14% 14%cochettes

truies nullipares

truies primipares

truies multipares

: 25 ont été pris au niveau de la


échantillons par commune

Effectif des animaux prélevés

80

87

167


Effectif des animaux par catégorie

cochettes

truies nullipares

truies primipares

truies multipares

II.2.

Soixante cinq pourcent des exploitations pratiquaient simultanément le

naissage et l’engraissement des porcs. Le 25% produisaient des porcelets sans les

engraisser et seulement 10% des éleveurs enquêtés effectuent l’engraissement des porc

(Figure 16).

Figure 16 : R

La taille moyenne de

têtes par exploitation

Figure 17

0

5

10

15

20

25

0

5

10

15

20

41

II.2. Présentation des élevages

II.2.1. Type d’exploitations



engraisser et seulement 10% des éleveurs enquêtés effectuent l’engraissement des porc

: Répartition des élevages par type d’exploitation

II.2.2. Effectif des animaux

La taille moyenne de l’effectif des porcs est de 14,6 porcs variant de 1 à 90

têtes par exploitation (Figure 17).

17 : Répartition des exploitations par nombre de porcs

6 8

21

<5 [5-10[ [10-20[ [20-30[

19

12

19

3

effectif des exploitations



engraisser et seulement 10% des éleveurs enquêtés effectuent l’engraissement des porcs

exploitation

6 porcs variant de 1 à 90

épartition des exploitations par nombre de porcs élevés

Arivonimamo

Imerintsiatosika

>40

7

42

II.2.3. Structure et hygiène générale des exploitations

Toutes les exploitations disposaient au moins d’un bâtiment d’élevage et les

animaux restaient en claustration permanente.

Tableau X : Structure générale du bâtiment

Effectif des

élevages enquêtés

Pourcentage des


(%)

Mur

Fermée

Semi-fermée

Emplacement de la fosse à lisier

Près (<3m)

Loin (>6m)

Moyen ([3 à 6m [)

Rien

Structure de la fosse à lisier

Ouverte

Plein air

Couverte

Type du sol

Facile à nettoyer

Difficile à nettoyer

Evacuation d’eau

Près de l’élevage

Hors de l’élevage

Rien

41

19

43

9

7

1

45

13

2

50

10

30

22

8

68,3

31,7

71,7

15,0

11,7

1,6

75,0

21,7

3,3

83,3

16,7

50,0

36,7

13,3

43

Plus de la moitié des élevages avaient des murs construits en dur (en brique ou

en brique cimenté ou en terre battue). Le sol était le plus souvent facile à nettoyer

(cimenté ou en pierre). La majorité des élevages possédaient des fosses à lisier ouverte

avec une distance de moins de 3 m par rapport au bâtiment d’élevage, l’emplacement

des déchets des animaux en plein air étant également encore très prisé. Les eaux sortant

de l’élevage étaient évacuées près de bâtiment pour la moitié de l’exploitation et

quelques éleveurs arrivaient à structurer l’évacuation d’eau hors de l’exploitation

(Tableau X). Les toits en chaume et en tôle étaient le plus souvent rencontrés.

Tableau XI : Entretien du bâtiment

Effectif des


Pourcentage des


(%)

Mode de nettoyage

Avec lavage

Sans lavage

Fréquence de nettoyage

Journalière

Mensuelle

Hebdomadaire

49

11

55

4

1

81,7

18,3

91,7

6,7

1,6

Le nettoyage de la porcherie consistait essentiellement sur le balayage suivi de

lavage à grand eau. Pour la plupart des élevages, le balayage se faisait une à deux fois

par jour. Le lavage a été réalisé une fois par jour en général, exceptionnellement

quelques éleveurs qui ne pratiquaient le nettoyage (avec ou sans lavage) qu’une fois par

semaine ou par mois (Tableau XI).

i. Présence de clôture autour du bâtiment

Trente six pourcent des élevages étaient pourvus de clôture.

(63,3%), l’accessibilité des personnes étrangères à l’élevage étaient faciles.

ii. Contact entre

Figure 18 : Contact entre élevages à travers les matériels et les

Quatre-vingts quinze pourcent

exploitations porcines. D’après l’enquête, les 57 éleveurs sur 60 évitaient le partage et

les échanges (l’empreinte et/ou la prête) des matériels d’élevage (brouette,

balaye, tuyau,…). Les personnels chargés de chaque élevage étaient fixes et ne

s’engageaient pas dans d’autres exploitations porcines (Figure 18).

iii. Autorisation de visite dans

Quatre-vingt cinq pourcent des éleveurs acceptaien

fermes. Le taux de visite effectuée par les bouchers, les grossistes d’abattoir, les autres

éleveurs et les collecteurs des porcs pour différentes raisons (achat des porcelets, achat

des porcs engraissés,…) s’élevait à 61

(Figure 19).

57

0

10

20

30

40

50

60

70

Non partage des matériels

44

II.2.4. Biosécurité de l’exploitation

Présence de clôture autour du bâtiment

Trente six pourcent des élevages étaient pourvus de clôture.

3%), l’accessibilité des personnes étrangères à l’élevage étaient faciles.

entre élevages à travers les matériels et les personnels

: Contact entre élevages à travers les matériels et les

vingts quinze pourcent des élevages n’ont pas de contact avec d’autres


les échanges (l’empreinte et/ou la prête) des matériels d’élevage (brouette,



Autorisation de visite dans l’exploitation

vingt cinq pourcent des éleveurs acceptaient les visites dans leurs



des porcs engraissés,…) s’élevait à 61,7%, et celui des personnels de soin est 38

3

60

0

Partage des matériels

Personnels fixes chargés de l'élevage

Personnels non fixes

effectif des exploitaitons

Biosécurité de l’exploitation

Trente six pourcent des élevages étaient pourvus de clôture. Pour le reste

3%), l’accessibilité des personnes étrangères à l’élevage étaient faciles.

à travers les matériels et les personnels

: Contact entre élevages à travers les matériels et les personnels

n’ont pas de contact avec d’autres


les échanges (l’empreinte et/ou la prête) des matériels d’élevage (brouette, pelle, seau,



t les visites dans leurs



lui des personnels de soin est 38,3%

effectif des exploitaitons

Figure

La fréquence de visite au niveau de chaque exploitation dépendait des visiteurs

(collecteurs, éleveurs, vétérinaires,

d’exploitation adopté par les éleveurs (producteurs de porcelets, engraisseurs,…).

iv. Vide sanitaire

Soixante cinq pourcent

durée de 4 jours au minimu

Figure 20 : Pratique du vide sanitaire

0

5

10

15

20

25

30

35

40

personnels de soins

45

Figure 19 : Répartition des élevages par type de visiteur


(collecteurs, éleveurs, vétérinaires, …) que les éleveurs autorisent, ainsi que le type


Vide sanitaire

Soixante cinq pourcent des élevages enquêtés pratiquent le vide sanitaire d’une

durée de 4 jours au minimum et de 30 jours au maximum (Figure 20)

ratique du vide sanitaire dans les exploitations enquêtées

personnels de soins autres visiteurs

23

37

effectifs

65%

35% Elevages qui pratiquaient le vide sanitaire

Elevages qui ne pratiquaient pas le vide sanitaire

: Répartition des élevages par type de visiteur


…) que les éleveurs autorisent, ainsi que le type


pratiquent le vide sanitaire d’une

(Figure 20).

dans les exploitations enquêtées

Elevages qui pratiquaient le vide sanitaire

Elevages qui ne pratiquaient pas le vide sanitaire

v. Mesures prophylactiques lors d’introduction des nouveaux porcs

Lors d’introduction des nouveaux animaux, plus de

éleveurs prennent des mesures prophylactiques

dans la porcherie, utilisation de désinfectant (aux alentours de l’exploitation) et

isolement des nouveaux animaux dès leur arrivée jusqu’à leur sorti

(Figure 21).

Figure 21 :

nouveaux porcs

vi. Désinfection

Cinquante cinq pourcent des éleveurs concouraient à la désinfection de leurs

bâtiments d’élevage et dont la fréquence varie d’un élevage à l’autre. Dans la plupart de

cas, la désinfection ne se pratiquait qu’après des cas de problèmes de santé dans

l’élevage ou dans le village. Les produits de désinfection les plus utilisés par les

éleveurs sont : le peroxymonosulfate de pentapotassium

La majorité (86

utilisaient leurs propres verrats et les mettaient en location aux autres éleveurs. Vingt

pourcent des éleveurs exécutaient la saillie de leurs truies à l’intérieur même de leurs

exploitations. Dans 80% des cas, les éleveurs déplaçaient leur

47%

46

Mesures prophylactiques lors d’introduction des nouveaux porcs

Lors d’introduction des nouveaux animaux, plus de

éleveurs prennent des mesures prophylactiques : brûlage de pneu et des plantes vertes


isolement des nouveaux animaux dès leur arrivée jusqu’à leur sorti

: Prise de mesures prophylactiques lors d’introduction des




ge ou dans le village. Les produits de désinfection les plus utilisés par les

peroxymonosulfate de pentapotassium, dérivé de phénols et le formol.

II.2.5. Gestion de la reproduction

majorité (86,7%) des éleveurs ne possédait pas de verrat,



exploitations. Dans 80% des cas, les éleveurs déplaçaient leurs truies vers le verratier.

53%

47%

Elevage qui prenaient des mesures prophylactiques lors d'introduction des nouveaux porcs

Elevage qui ne prenaient pas des mesures prophylactiques lors d'introduction des nouveaux porcs

Mesures prophylactiques lors d’introduction des nouveaux porcs

Lors d’introduction des nouveaux animaux, plus de la moitié (53%) des

: brûlage de pneu et des plantes vertes


isolement des nouveaux animaux dès leur arrivée jusqu’à leur sortie de l’élevage

Prise de mesures prophylactiques lors d’introduction des




ge ou dans le village. Les produits de désinfection les plus utilisés par les

, dérivé de phénols et le formol.

7%) des éleveurs ne possédait pas de verrat, seulement 3,3%



s truies vers le verratier.

Elevage qui prenaient des mesures prophylactiques lors d'introduction des nouveaux porcs

Elevage qui ne prenaient pas des mesures prophylactiques lors d'introduction des nouveaux porcs

47

La plupart des éleveurs, que ce soient naisseurs ou naisseur-engraisseurs,

n’envisageaient pas des mesures prophylactiques après le retour de leurs truies (Tableau

XII).

Tableau XII : Gestion de la reproduction

Effectif des élevages

enquêtés

Pourcentage des


(%)

Possession de verrat

OUI

NON

Verratier

OUI

NON

Lieu de saillie

Dans l’élevage

Au niveau du verratier

Prise de mesures après saillie

OUI

NON

8

58

2

58

12

48

6

54

13,3

86,7

3,3

96,7

20,0

80,0

10,0

90,0

II.2.6. La promiscuité des animaux d’élevage avec des

animaux en provenance d’Ambilobe

Une faible proportion d’éleveurs (10%) élevait des truies en provenance

d’Ambilobe (Figure 22) et parmi les animaux prélevés, 17,1% étaient originaires

d’Ambilobe (Figure 23).

Figure

0

20

40

60

80

100

0

20

40

60

80

100

48

Figure 22 : Origine des animaux élevés

Figure 23 : Répartition des animaux prélevés par origine

Arivonimamo Imerintsiatosika Ambilobe

2034

6

Effectif des élevages

Arivonimamo Ambilobe Imerintsiatosika

4629

94

Effectif des animaux

: Origine des animaux élevés

: Répartition des animaux prélevés par origine

49

II.3. Séroprévalence du PPV

II.3.1. Prévalence au niveau élevage

Tableau XIII : Résultats des analyses sérologiques du PPV au niveau

La séroprévalence totale de la parvovirose porcine dans les communes

est de 78,3%, soit 47 élevages sur 60. Au niveau de la commune urbaine

d’Arivonimamo, la séroprévalence atteint jusqu’à 80% contre 77,1% au niveau de

la commune rurale d’Imerintsiatosika (Tableau XIII).

II.3.2. La séroprévalence du PPV au niveau animal

Parmi les 167 animaux testés, 111 se sont relevés positifs au test ELISA.

La séroprévalence totale de la parvovirose porcine au niveau animal est de 66,5%.

Celle au niveau des animaux en provenance d’Ambilobe atteint 89,6% contre

56,5% à Arivonimamo et 62,7% à Imerintsiatosika (Tableau XIV).

Communes

Effectif des

élevages prélevés

Effectif des

Elevages positifs

Elevages positifs

(%)

Arivonimamo

Imerintsiatosika

Au niveau des

deux communes

25

35

60

20

30

47

80,0

77,1

78,3

50

Tableau XIV : Résultats des analyses sérologiques pour le PPV au niveau

animal

Communes et

provenance des

animaux

Effectif des

animaux prélevés

Effectif des

animaux

séropositifs

Animaux

séropositifs

(%)

Arivonimamo

Imerintsiatosika

Animaux originaires

d’Ambilobe

46

92

29

26

58

26

56,5

62,7

89,6

II.3.3. Séroprévalence du PPV en élevage associé à des

signes cliniques

Des signes cliniques directement associés à une infection liée au PPV,

notamment les troubles de la reproduction chez les truies, ont été observés par les

éleveurs eux-mêmes dans certaines exploitations durant l’enquête tels que :

Momifications

Mortalités néonatales

Durée de gestation prolongée

Porcelets faibles à la naissance

Problème de retour de chaleur

Avortements

Parmi les 60 élevages enquêtés, 39 présentaient un ou plusieurs de ces signes

cliniques associés à la parvovirose porcine. Parmi ces élevages ayant des signes

cliniques, 89,4% avaient des femelles séropositives au PPV.

Le tableau XV représente la relation entre la séroprévalence du PPV et les

signes cliniques pouvant être associés à celui-ci.

51

Tableau XV : Nombre d’élevages séropositifs avec des signes cliniques

pouvant être liés à une infection par PPV

Communes

Elevages enquêtés

Elevages + signes

cliniques pouvant

êtres associés au

PPV

Elevages

séropositifs +

signes cliniques

associés au PPV

(%)

Arivonimamo

Imerintsiatosika

Au niveau des deux communes

25

35

60

19

20

39

89,4

90,0

89,7

II.4. Les facteurs de risque

L’effectif du cheptel dans chaque élevage, l’implantation de bâtiment, la

présence ou non de clôture autour de l’élevage, la pratique du vide sanitaire, la prise des

mesures lors de l’introduction des porcs, le type de visiteurs, l’existence des problèmes

de naissage dans l’exploitation, la catégorie des femelles et l’origine des animaux

possédaient une valeur de p<0,20. Ainsi, ces neuf variables ont été retenues lors du

modèle initial de l’analyse multivariée. Les valeurs de p et l’Odds ratio de chacun de ces

variables sélectionnées sont représentées dans le tableau XVI.

52

Tableau XVI : Sélection univariée des variables (p < 0.20)

Variable

Modalités

OR

p

IC à 95 %

Cheptel -Moins nombreux

-Nombreux

Réf.

1,03

0,01

1,00 - 1,05

Implantation de

bâtiment

-Isolé

-Non isolé

Réf.

1,13

0,12

0,21 - 2,04

Clôture -OUI

-NON

Réf.

2,29

0,07

1,37 - 3,21

Vide sanitaire -OUI

-NON

Réf.

1,80

0,00

1,79 - 1,81

Mesures lors de

l'introduction des

porcs

-OUI

-NON

Réf.

0,51

0,15

0,43 - 1,44

Visiteurs -Personnels de soin

-Autres visiteurs

Réf.

2,56

0,00

2,55 - 2,56

Problèmes de

naissage antérieurs

-OUI

-NON

Réf.

2,95

0,02

1,98 - 3,92

Catégorie des

femelles

-Cochette

-Truie

Réf.

5,00

0,00

3,96 - 6,05

Origine des

animaux

-Local

-Ambilobe

Réf.

6,06

0,01

4,59 - 7,53

53

L’implantation de bâtiment d’élevage, le vide sanitaire, les mesures lors de

l’introduction des porcs, les visiteurs, les problèmes de naissage antérieurs dans

l’exploitation et l’origine des animaux élevés surgissent comme des facteurs de risque

ayant une influence significative sur la séropositivité du PPV lors de l’analyse

univariée.

Le modèle final estimé avec le critère d’information d’Akaïke le plus faible

(AIC 196,76) est représenté dans le tableau XVII.

L’effectif du cheptel dans chaque exploitation et la catégorie des animaux

apparaissent comme facteurs de risque de la parvovirose porcine. L’effectif du cheptel

montre une différence significative (p = 0,01). Pour chaque animal de plus, le risque

d’avoir un animal contaminé par le PPV augmente (OR = 1,03). La catégorie des

femelles élevées a une influence très significative sur la séropositivité de l’animal (p =

0,00). Les truies sont plus infectées que les cochettes (OR = 4,34).

L’analyse multivariée révèle aussi l’absence de la clôture autour de

l’exploitation comme facteur de risque de l’apparition de l’infection liée au PPV (p =

0,05). L’absence de clôture autour de l’élevage augmente le risque pour qu’un animal

soit séropositif (OR= 2,45).

Tableau XVII : Modèle multivariée avec AIC = 196,76

Variable

Modalités

OR

p

IC à 95 %

Cheptel Moins nombreux

1,00

Nombreux

1,03 0,01 1,00 - 1,05

Clôture OUI 1,00

NON

2,45 0,05 1,52 - 3,38

Vide sanitaire

OUI 1,00

NON

2,05 0,14 1,11 - 2,30

Catégorie Cochette 1,00

Truie 4,34 0,01 1,10 - 2,87

TROISIEME PARTIE : DISCUSSION

54

DISCUSSION

Au Mozambique, la détection de la parvovirose porcine a été incitée par la

constatation de troubles de la reproduction chez les truies gestantes au niveau du

naissages porcins [12]. Il en est de même pour notre recherche, le choix des communes

d’Arivonimamo et d’Imerintsiatosika a été basé sur les raisons suivantes :

i- Zone d’élevages porcins de type amélioré avec un grand nombre d’ateliers

naisseur-engraisseurs

ii- Observation des problèmes de la reproduction, remarquables chez les truies

Le choix de prélèvement a été effectué selon le test de laboratoire utilisé. Lors

de l’étude sur le PPV réalisée au Mozambique, comme celle à Madagascar, les

chercheurs ont recours au prélèvement sanguin des femelles de porcs (truies et

cochettes) présentant ou non des signes cliniques en rapport avec la parvovirose porcine

[12].Tandis qu’en Hongrie, plusieurs types de prélèvements ont été saisis en vu de

déterminer la prévalence de cette maladie tels que : les matières fécales de porcs (mâle

ou femelle), les sérums sanguins de porcs femelles, des tissus et des organes de fœtus

momifiés, des fœtus entiers, les semences de verrat. L’examen utilisé était le PCR [6].

D’autres chercheurs faisaient aussi des recherches sur la parvovirose porcine au

niveau des abattoirs. Ils travaillaient seulement sur les truies qui présentent des

problèmes de reproductions comme des fœtus momifiés dans leurs ventres et réalisaient

les prélèvements sur ces truies et leurs portées. Ils prenaient des morceaux de poumons,

des sangs, et des fœtus dans le but d’établir différents examens : PCR, examens

histopathologiques, Immunofluorescence directe [34].

Concernant l’analyse statistique, dans cette étude, les données étaient groupées

donc le modèle adapté pour la recherche des facteurs de risque était le modèle mixte

afin de réduire l’effet de surdispersion [79].

55

De nombreuses exploitations porcines ont rencontré des troubles de la

reproduction chez les truies (momifications fœtales, prolongations de la durée de

gestation des truies, avortement, porcelets faibles à la naissance) qui, par l’augmentation

des femelles atteintes et l’intensification des signes cliniques observés, provoquent des

désastreuses pertes économiques pour les éleveurs, notamment, au niveau des ateliers

naisseurs et naisseur-engraisseurs. Dans la plupart des cas, les éleveurs décidaient

d’abattre les truies qui présentaient ces symptômes dans leurs exploitations. Ces

difficultés de la reproduction porcine semblaient être sans solution pour les acteurs dans

cette filière faute de connaissance de l’origine de la pathologie en cause. Ainsi, notre

recherche a prouvé que le PPV était l’agent causal de ces problèmes de la reproduction.

Dès lors, l’hypothèse relative à la suspicion de la parvovirose porcine a été vérifiée.

D’ailleurs, étant donné que le PPV est ubiquitaire, la confirmation de sa présence à

Madagascar pourrait amener à la prise de décisions en termes de lutte et prévention [2].

Ce ne sont pas que sur les pestes porcines et la maladie de Teschen seulement qu’il faut

se concentrer à Madagascar, il est intéressant aussi de chercher les autres maladies

d’élevage (PPV, PCV2, Maladie d’Aujesky), vu les impactes économiques engendrées

par ces pathologies [15, 80].

La présente étude, réalisée sur les exploitations porcines dans les communes

d’Arivonimamo et d’Imerintsiatosika, est donc la première à démontrer l’existence et la

circulation du PPV dans les élevages porcins malgaches.

Le diagnostic est basé seulement sur la détection des anticorps anti- PPV chez

les cochettes et les truies. Les résultats de l’analyse sérologique indiquent une

séroprévalence élevée du PPV 78.3% en élevage et 69.3% au niveau animal.

La parvovirose porcine est une maladie enzootique, pourtant, plusieurs pays

infectés montrent une séroprévalence élevée (plus de 50%), y compris Madagascar. Des

études menées à Canada, en Hongrie et en Italie ont montré que la prévalence de la

parvovirose porcine allait jusqu’à 100% des troupeaux étudiés et 83.5% au niveau

animal [81, 82]. Une étude transversale de la séroprévalence de PRRSV, de l’ADV

(Aujesky’s Disease Virus) et du PPV à Thaïlande a dénoncé une forte séroprévalence

(99%) du PPV par rapport aux deux autres virus [5].

56

Des prévalences basses du PPV au niveau de quelques pays ont été observées

grâce à l’immunisation des truies et des cochettes [9, 83, 84].

Trois facteurs de risque ont été mis en évidence : l’effectif du cheptel,

l’absence de la clôture autour de l’élevage et la catégorie des femelles.

L’effectif du cheptel porcin élevé au niveau de l’exploitation ressort comme

facteur de risque du PPV. Ce résultat rejoint celui d’une étude de prévalence du PPV et

les facteurs de risque associés dans les exploitations porcines finlandaises [67].

Un seul facteur de risque en rapport avec la biosécurité de l’exploitation a été

signalé : l’absence de la clôture autour de l’élevage. Cependant, dans la recherche

effectuée par Mengelling WL et Paul PS, ils ont pu démontrer l’association entre

l’apparition du PPV et les éléments en rapport avec cette biosécurité, notamment la

négligence de la désinfection et les mesures lors de l’introduction des nouveaux porcs

dans l’élevage (Quarantaine) ainsi que l’absence du vide sanitaire [43].

Le troisième facteur de risque évoqué concerne la catégorie des animaux. Le

risque d’avoir un animal séropositif est augmenté chez les truies. La présente recherche

réaffirme donc les résultats des études effectuées en Finlande et en Croatie : les truies

sont plus infectées que les jeunes cochettes [48, 67]. Par contre, d’autres études

montraient que les cochettes et les truies nullipares sont plus atteintes et celles-ci

augmentent le risque d’avoir une séroprévalence élevée dans une exploitation [28].

Parmi les éléments en rapport avec la structure de l’élevage (étanchéité de mur

de la porcherie, emplacement et structure de la fosse à lisier et la structure de la

plancher), aucun d’entre eux n’est révélé comme facteur de risque du PPV. Ce résultat

est en accord avec l’étude menée en Thaïlande qui a justifié l’absence de relation

significative entre la conformation, le type de bâtiment et la séroprévalence de la

parvovirose porcine [4]. Par contre, une étude réalisée pendant une période

interépizootique du PPV a mentionné l’absence de la fosse à lisier comme un risque

augmentant l’expression de l’infection associée au PPV [43].

57

Aucun élément en rapport avec l’entretien du bâtiment (mode de nettoyage et

fréquence de nettoyage) n’est associé à la séroprévalence du PPV. Ce résultat concorde

avec l’étude des facteurs de risque du PPV en Croatie [48]. La fréquence de nettoyage et

de lavage des locaux ne diminue pas le risque de la survenue de la parvovirose porcine

chez un animal.

Aucune association entre la séroprévalence du PPV et la pratique de la

reproduction n’a été mise en évidence. Alors qu’une étude a mentionnée l’influence

significative entre l’utilisation de verrats d’autres exploitations contaminées par le PPV

et la séroprévalence de cette maladie [50].

Concernant les facteurs liés à l’animal, ici, deux variables ont été pris en

compte telles que l’origine et la catégorie des femelles. Mais d’autres variables sont

aussi à considérer telles que le sexe et l’âge. Une autre étude considérait le sexe des

porcs pour la recherche des facteurs de risque du PPV mais elle prouvait l’absence

significative entre la séroprévalence chez les truies et les verrats [48]. Une étude

effectuée en Allemagne a démontré aussi l’âge des cochettes et des truies comme

facteurs de risque. La séroprévalence du PPV augmente avec l’âge des porcs [5].

Notre étude a démontré que la prévalence du PPV dans chacun des trois

origines (Arivonimamo, Imerintsiatosika, Ambilobe) des porcs testés est élevée. Alors

que l’origine n’a aucune influence significative sur la séroprévalence du PPV. Le même

résultat a été constaté en Chine parce que la maladie y est largement dispersée,

contrairement à l’étude réalisée en Allemagne qui a montré que la séroprévalence du

PPV varie selon la région géographique [5, 7].

Dès lors, la parvovirose porcine peut être considérée comme ubiquitaire à

Madagascar. La provenance des porcs à élever ne change pas le statut sanitaire de

l’animal par rapport au PPV.

La parvovirose porcine peut être supposée comme endémique à Madagascar.

Trois facteurs de risques de la maladie ont été évoqués : l’effectif du cheptel, l’absence

de la clôture autour de l’élevage et la catégorie des animaux. Dans ces conditions, vu les

pertes économiques engendrées par cette pathologie, des stratégies appropriées doivent

58

être mises en place, non seulement des mesures de biosécurité mais surtout un

programme de vaccination des jeunes cochettes et des truies.

Il sera intéressant de sensibiliser les éleveurs et informer les personnels de soin

sur la circulation du PPV à Madagascar. Tous les acteurs dans la filière porcine doivent

être impliqués dans la lutte contre le PPV.

Plusieurs vaccins inactivés monovalents ou bivalents sont déjà commercialisés

(cf Annexe) mais ces vaccins ne sont pas encore disponibles à Madagascar.

En raison de la fréquence de l’infection et de la « fenêtre de sensibilité

immunologique » des jeunes truies vers 5 à 7 mois, la vaccination demeure le principal

moyen de contrôle de cette maladie [85]. Le choix de l’âge à la vaccination est

déterminé par le taux d’anticorps colostraux résiduels. En raison de la difficulté de

connaître le niveau de protection de chaque truie, il est recommandé de faire une double

vaccination des cochettes et des jeunes verrats de telle manière que la deuxième

vaccination se fasse au moins deux semaines avant la mise à la reproduction [27].

A remarquer que les jeunes cochettes et les truies ayant présentées des

symptômes ou des signes cliniques de la parvovirose porcine durant leur première

conception, ne devraient jamais être l’objet de l’euthanasie car après une primo-

infection, elles seront immunisées et capables de montrer leur performance en terme de

reproduction [27].

Les trois facteurs de risque associés à la séroprévalence du PPV identifiés ici

ne peuvent plus être négligés. Ils constituent les premiers éléments à considérer dans le

dispositif de lutte proposée pour mieux maîtriser la maladie.

59

Renforcement de mesures de biosécurité : Même dans une exploitation avec un

effectif élevé et des animaux provenant de différentes origines, comme les autres

maladies virales, le contrôle de la parvovirose porcine repose sur :

i. L’isolement de l’exploitation

Clôture fermée ou semi-fermée autour de l’élevage

Pédiluve obligatoire lors de la visite des personnes étrangères à la

ferme

Eviter au maximum les contacts avec les autres élevages

porcins (aliments des animaux, eau d’abreuvement des animaux,

personnels chargés dans l’élevage, les matériels d’élevage)

ii. La pratique régulière de la désinfection, la désinsectisation et la dératisation

iii. La prise de mesures efficaces lors de l’introduction des nouveaux animaux

Mise en quarantaine des animaux avant de les associer aux autres

Préparation ou réparation de bâtiment : nettoyage avec lavage

intense et désinfection

Amélioration en matière de pratique d’élevage : Elle concerne surtout

l’hygiène générale dans l’élevage pour réduire au maximum la pression d’infection.

Nettoyage régulier des locaux : enlèvement des fèces et urine des

animaux, renouvellement régulier de la litière

Sol facile à nettoyer : sol cimenté ou en pierre, pente de 2%

Eviter le contact de la fosse à lisier et le bâtiment

Maîtrise des conditions d’ambiance dans le bâtiment : ventilation,

température, densité des animaux, longueur à l’auge.

CONCLUSION

60

CONCLUSION

Ce travail effectué au niveau des exploitations porcines justifie la présence du

Parvovirus porcin à Madagascar. Ce virus circule avec une séroprévalence élevée dans

les élevages porcins malgaches : 78,3% en élevage et 66,5% au niveau animal. Les

résultats des analyses statistiques réalisées révèlent trois facteurs intensifiant le risque

d’apparition de la parvovirose porcine. Le premier est en rapport avec le cheptel dans

chaque élevage, la taille élevée des porcs dans l’exploitation ; le deuxième est lié à la

biosécurité des exploitations, l’absence de la clôture autour de l’élevage ; et le dernier

est en rapport avec l’animal, la catégorie des animaux.

Cette étude de prévalence du PPV ne consiste qu’en une première détection et

la recherche des facteurs de risque pouvant être en relation avec celui-ci. Tirées, de cette

recherche donc, de nombreuses investigations qui sont indispensables à la parfaite

maîtrise de la dissémination du PPV. La détermination de la souche virale présente sera

nécessaire pour la mise en place du programme vaccinal le plus adapté, voire même la

production locale de vaccin anti-PPV. Il sera intéressant de réaliser des évaluations des

pertes économiques engendrées par cette maladie ainsi que des études au niveau des

abattoirs en vue de déterminer les incidences clinique des infections liées au PPV.

Les études de détection des maladies porcines à distribution mondiale sont

intéressantes parce que la parvovirose porcine est la deuxième maladie détectée après la

maladie d’amaigrissement de porcelets. Elles permettraient aussi de mieux connaître le

statut sanitaire exact des élevages porcins à Madagascar.

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ANNEXES

ANNEXES

ANNEXE 1 : Questionnaire d’enquête pour les élevages de porcs

Date d’enquête : ……/……/2013

ID élevage :……………………... Commune :………………………

Enquêteur :……………………………………………………………

I. Renseignement général sur l’exploitation

Type d’exploitation Naisseur

Naisseur-engraisseur

Engraisseur

Est-ce que les animaux sont

toujours enfermés, ou ils peuvent

divaguer ?

Est-ce que vous élevez des porcs

en provenance d’Ambilobe ?

Oui / Non

II. Effectif du cheptel porcin

Catégories Nombre Moyenne d’âge par

catégorie

Truie Cochette :

Truie nullipare :

Truie primipare :

Truie multipare :

Verrat

Porcs en engraissement

Porcelets

Porcelets sous-mère

III. Structure et environnement de bâtiment d’élevage

Mur Sol Toiture Clôture Position de bâtiment

par rapport aux

agglomérations

Observation:………………………………………………………………………………

…………………………………………………………………………………………….

Est-ce qu’il y a une fosse à lisier ? OUI NON

Distance par rapport au

bâtiment :…………………….

Structure :

o Couverte

o Ouverte

o Plein air

Evacuation d’eau OUI NON

Si oui :

o Hors de l’élevage

o Dans l’élevage

IV. Hygiène / biosécurité

Est-ce qu’il y a un

pédiluve ?

Oui / Non

Type :

Localisation :

Est-ce vous faits une

désinfection des

bâtiments ?

Oui / Non

Produit utilisé :

Fréquence :

Type :

Est-ce que vous empruntez ou prêtez des matériels d’élevage avec d’autres

exploitations porcines autour de la vôtre ?

OUI / NON

Quels matériels :

……………………………………………………………………………………………

Fréquence d’emprunte / prête :

……………………………………………………………………………………………

Est-ce que vous autorisez de la

visite dans votre ferme ?

OUI / NON

Types de visiteurs :

Fréquence :

Est-ce que le personnel chargé de

votre élevage est fixe ?

OUI / NON

Est-ce qu’il y a une quarantaine

pour les nouveaux animaux ?

OUI / NON

Quelles mesures vous envisagez

lors de l’introduction des nouveaux

animaux ?

Est-ce que vous pratiquer le vide

sanitaire des locaux ?

OUI / NON

Durée :

Comment vous le procédez ?

Entretenez-vous les locaux d’élevage ?

OUI / NON

Comment vous les entretenez ?

…………………………………………………………………………………

Quels sont les matériels que vous utilisez pour nettoyer les locaux d’élevage ?

…………………………………………………………………………………

V. Gestion de la reproduction

Est-ce que vous avez de verrat ? OUI / NON

Verratier : OUI / NON

Est-ce que vous utilisez de verrat

des autres exploitations ?

OUI / NON

Où est –ce que vous procédez la

saillie de votre truie ?

Avez-vous envisagé des mesures

après la reproduction des animaux ?

OUI / NON

Quelles mesures si oui :

VI. Signes cliniques pouvant être en rapport avec la parvovirose

porcine

Est-ce que vous avez rencontré des problèmes :

o Pendant la période de gestation de votre truie :……………………..

o Lors du mise-bas :…………………………………………………....

o Après la mise-bas :…………………………………………………...

o Ou autres problèmes de la reproduction chez votre truie :…………

ANNEXE 2 : fiche d’identification de l’animal

Commune : Arivonimamo / Imerintsiatosika

Id_Elevage : …………………………………..

Id_Animal : ……………………………………

Id_tube : …………………………………….....

Origine de l’animal :…………………………..

Catégorie de l’animal :

Cochette Truie nullipare Truie primipare Truie multipare

ANNEXE 3: Listes des vaccins monovalents et bivalents contre le

PPV

Vaccins parvovirus monovalents

Vaccins (avec

le nom de

laboratoire

fabriquant)

Type de

vaccin

Voie d’admi-

nistration

Posologie

PARVOJECT

(MERIAL)

Flacon 25

doses (50 ml)

Inactivé

(128

UHA/ml)

En intra-

musculaire

Primo-

vaccination

Rappel

2 x 1 dose (2 ml)

à 3 semaines

d'intervalle (1ère

vaccination 6

semaines avant la

saillie)

1 dose/an

PARVOSUIN

(Codifar)

Flacon de 10

doses

Inactivé (min 256 HAE/dose)

En intra-

musculaire

Truie (âge 7 - 8 m ou 2 m avant la saillie): 1 dose (2 ml) Verrat (âge 7 - 8 m): 1 dose

Truie : 20 - 40 j avant chaque saillie

PORCILIS

PARVO

(Intervet

Belgium)

flacon 50 ml

Inactivé : min 9 log2 HI/ (Adjuv: Diluvac Forte

2 ml)

En intra-

musculaire

Cochette : 2 x 1 dose (2ml) entre 8 - 2 sem avant la saillie Truie : 1 dose 2 sem min avant la saillie Truie (état immunitaire inconnu): 2 x 1 dose à 3 sem d'intervalle

-

Truie : 2 sem avant chaque saillie

SUVAXYN

PARVO (Fort

Dodge A. H.)

flacon 10 x 10

doses (20 ml)

Inactivé :

10exp 6,7

DICT50/ml,

titre SN min

32 (cobaye)

En intra-

musculaire,

en sous-

cutané

Cochette (âge > 6 m): 1 dose (2 ml) 8 - 2 sem avant saillie

Truie : 1 dose/an

Vaccins combinés bivalents

PARVORUVAX (Merial)

Parvovirus porcin inactivé: 128 UHA/2 ml

Erysipelothrix rhusiopathiae inactivé: min 50 UI/2 ml

Vaccin injectable par voie intramusculaire

Posologie:

Primo vaccination : 2 x 1 doses à 3 - 4 semaines d'intervalle (2ème

vaccination au minimum 1 semaine avant 1ère saillie)

Rappel : 1 dose/6 m (périodes d'allaitement)

Flacon 25 doses (50 ml)

PARVOSUIN-MR (Hipra Lab)

Parvovirus du porc (NADL-2), inactivé : min 2048 HAE/2 ml

Erysipelothrix rhusiopathiae (R32E11), inactivé: au minimum 50 IE/2 ml

Adjuvant : huile


Posologie:

Primo vaccination : Cochette, verrat (âge > 7 m): 2 x 1 dose (2 ml) avec 3

- 4 semaines d'intervalle (min 1 semaine avant la saillie)

Rappel : Truie: 1 dose 10 - 15 j après la mise bas

Verrat: 1 dose/an

Flacon 10 x 5 doses (10 ml), 10 x 10 doses (20 ml), 10 x 25 doses, 10 x 50

doses

PORCILIS ERY-PARVO (Intervet Belgium)

Erysipelothrix rhusiopathiae inactivé (M2 sérotype 2): min 50 IE/2 ml

Parvovirus porcin inactivé (PPV 014): min 9 log2 HI

Adjuvant : alpha-tocophérol acétate


Posologie:

Primo vaccination : Cochette: 1 dose (2 ml) 2 semaines avant la saillie

(Rouget du porc: 4 semaines avant ou après le

vaccin ci-dessus, vacciner avec vaccin pour Rouget du

porc ou vaccin combiné Rouget de porc-Parvo)

Rappel: Truie: 1 dose pendant chaque période de lactation, au moins 2

semaines avant saillie

Flacon 25 doses

SUVAXYN PARVO/E (Fort Dodge A. H.)

Chaque dose (2 ml) contient:

Parvovirus porcin (souche S-80), inactivé: titre IHA 160 chez le lapin

Erysipelothrix rhusiopathiae (souche B-7, sérotype 2), inactivé: potency

selon le Ph Eur


Posologie:

Primo vaccination : Cochette (âge > 5 m) et truie: 2 x 1 dose à 3 - 4

semaines d'intervalle, 2ème dose min 4 semaines avant la saillie

Rappel: 1 dose 3 - 4 avant la saillie

Flacon 10 doses, 2 x 25 doses

Annexe 4 : Critère d’information d’Akaïke (AIC)

Le critère AIC s’applique aux modèles estimés par une méthode du

maximum de vraisemblance : les analyses de variance, les régressions linéaires

multiples, les régressions logistiques et de Poisson peuvent rentrer dans ce cadre.

Le critère AIC est défini par :

AIC = −2 log L + 2k

Avec : L : Vraisemblance maximisée,

k : nombre du paramètres du modèle (correspond au nombre de descripteurs

pour un modèle linéaire par rapport aux paramètres),

Le critère d’information d’Akaike est basé sur l’échantillon observé et peuvent

servir à sélectionner le meilleur modèle parmi un ensemble de modèles possibles.

Lorsque le vrai processus générateur de données se trouve dans cet ensemble et que

l’échantillon est assez grand par rapport au nombre de paramètres, le rôle de ces

méthodes est clairement de l’identifier parmi toutes les possibilités contenues dans

l’ensemble. Il est donc naturel de chercher à évaluer la convergence des différents

critères, c’est-à-dire la convergence de l’ordre des modèles estimés par rapport à

l’ensemble des vrais processus.

Annexe 5 : Résultat de l’analyse univariée

Variable Modalités Coefficient OR p

Type de production Engraisseur Ref

Naisseur 0,49 1,64 0,52

Naisseur-engraisseur 0,88 2,41

Cheptel Nombreux Ref

Moins nombreux 0,03 1,03 0,01

Verratier Verratier Ref

Pas de verrat 1,08 2,94 0,26

Déplacement truie OUI Ref

NON 0,44 1,56 0,44 Implantation de bâtiment Isolé Ref

Non isolé 0,12 1,13 0,12

Clôture Clôturé Ref

Non clôturé 0,83 2,29 0,07

Mur Fermé Ref

Semi-fermé 0,20 1,22 0,71

Plancher Facile à nettoyer Ref

difficile à nettoyer 0,22 1,24 0,76

Evacuation eau Hors de l'élevage Ref

Près de l'élevage -0,80 0,45

Rien -0,41 0,66 0,27 Distance fosse à lisier Loin Ref

Près 0,17 1,18 0,78

Lavage OUI Ref

NON -0,05 0,95 0,94

Désinfection OUI Ref

NON -0,43 0,65 0,36

Vide sanitaire OUI Ref

NON 0,59 1,80 0,00 Mesures lors de l'introduction des porcs OUI Ref

NON -0,68 0,51 0,15

Mesures après saillie OUI Ref

NON 1,02 2,77 0,24 Contacte avec les autres élevages OUI Ref

NON

-17,09 0,00 0,99

Variable

Modalités

Coefficient

OR

p

Visiteurs Personnels de soin Ref

Autres visiteurs 0,94 2,56 0,00

Fréquence visiteur Moins fréquent Ref

Fréquent -0,11 0,90 0,84 Problèmes de naissage antérieurs OUI Ref

NON 1,08 2,95 0,02 Catégorie des femelles Cochette Ref

Truie 1,61 5,00 0,00

Origine des animaux Local Ref

Ambilobe 1,80 6,06 0,01

Ref : variable référence

Annexe 6 : Odds ratio

Pour mesurer l’association entre X (variable explicative) et Y(variable à

expliquer), on utilise en épidémiologie l’odds ratio ou rapport des côtes.

La côte d’un évènement de probabilité p s’écrit p = p / (1 Ŕ p). Il s’agit du

quotient entre la probabilité d’un évènement et la probabilité de non-survenue de

l’évènement ayant une chance sur deux de se réalise.

L’OR (ou rapport des côtes en français) est défini pour 2 probabilités p0 et p1

par la formule suivante :

�� =�� /(� − ��)

��/(� − ��)

p1 est la probabilité de l’évènement chez les exposés à l’infection

po est la probabilité de l’évènement chez les non exposés à l’infection

Le calcul de l’OR sur l’échantillon va permettre par la suite de déduire des

informations sur la population totale au moyen de l’intervalle de confiance (IC). L’IC

peut être calculée par deux méthodes :

Méthode de Woolf (méthode des logits) pour probabilité alpha = 0,05 :

Intervalle de confiance = (e)LN (OR) ± 1,96(1/A+1/B+1/C+1/D) 1/2

Méthode de Miettinen pour probabilité alpha = 0,05 :

Intervalle de confiance = (e)LN (OR)* [1 ± 1,96 / (Khi carré) 1/2]

Si OR (ou RC) = (A*D/B*C)

PERMIS D’IMPRIMER

LU ET APPROUVE

Le Directeur de Thèse,

Signé : Professeur RATSIMBAZAFIMAHEFA RAHANTALALAO Henriette

VU ET PERMIS D’IMPRIMER

Le Doyen de la Faculté de Médecine d’Antananarivo,

Signé : Professeur ANDRIAMANARIVO Mamy Lalatiana

VELIRANO

Eto anatrehan’i Zanahary, eto anoloan’ireo mpikambana ao amin’ny Holafitra

Nasionalin’ny Dokotera Veterinera Malagasy sy ireo mpampianatra ahy, mianiana aho

fa hitandro lalandava ary hitaiza ny haja amam-boninahitry ny Dokotera Veterinera sy

ny asa. Noho izany dia manome toky ary mianiana aho fa:

- Hanatanteraka ny asako eo ambany fifehezan’ny fitsipika misy ary hanaja ny rariny

sy ny hitsiny

- Tsy hivadi-belirano amin’ny lalàn’ny voninahitra, ny fahamendrehana, ny fanajana

ny rariny sy ny fitsipim-pitondran-tena eo am-panatanterahana ny asa maha Dokotera

Veterinera. Hanaja ireo nampianatra ahy, ny fitsipiky ny haikanto. Hampiseho ny

sitraka sy fankatelemana amin’izy ireo ka tsy hivaona amin’ny soa nampianarin’izy ireo

ahy.

- Hanaja ny ain’ny biby, hijoro ho toa sy andry iankinan’ny fiarovana ny

fahasalaman’izy ireo sy ho fanatsarana ny fiainany ary hikatsaka ny fivoaran’ny

fahasalaman’ny olombelona sy ny toe-piainany

- Hitazona ho ahy samirery ny tsiambaratelon’ny asako

- Hiasa ho an’ny fiarovana ny tontolo iainana sy hiezaka ho an’ny fisian’ny fiainana

mirindra ho an’ny zava-manan’aina rehetra ary hikatsaka ny fanatanterahana ny

fisian’ny rehetra ilaina eo amin’ny fiaraha-monina tsy misy raoraon’ny olombelona sy

ny biby

- Hiezaka hahafehy ireo fahalalana vaovao sy haitao momba ny fitsaboana biby ary

hampita izany amin’ny hafa ao anatin’ny fitandroana ny fifanakalozana amin’ny hairaha

mifandray amin’izany mba hitondra fivoarana ho azy

- Na oviana na oviana aho tsy hampiasa ny fahalalako sy ny toerana misy ahy hitondra

ho amin’ny fahalovana sy hitarika fihetsika tsy mendrika.

- Ho toavin’ny mpiara-belona amiko anie aho raha mahatanteraka ny velirano nataoko.

Ho rakotry ny henatra sy ho rabirabian’ny mpiray asa amiko kosa aho raha mivadika

amin’izany.

Full name: RAZAFINDRAIBE Nivohanitra Perle

Title of thesis: FIRST DETECTION OF PORCINE PARVOVIRUS IN

MADAGASCAR

Heading: Epidemiology and Infectious Disease

Number of pages: 60 Number of tables: 17

Number of figure: 23 Number of annexes: 6

Number of bibliographical references: 85

SUMMARY

Introduction: Porcine parvovirus as a major cause of maternal reproductive failure in

swine. The Porcine parvovirus is ubiquitous among swine throughout in the world. The

objective in this research was to detect the existence of this virus in Madagascar and to

determine the risk factors associated.

Materials and methods: Transversal investigation was made at porcine farms and pigs

from Ambilobe in two communes in the Itasy region. The study period was from March

till April 2013. Serological analysis of pigs serums from farms and pigs collected from

Ambilobe was done.

Result: Porcine parvovirus circulates with high rates: 78,3% of the studies farms and

66,5% of the sows tested by the virus. The study of risk factor shows that the high

prevalence is in relation with the pig number in the farm, the absence of fence around

farms and female pig category.

Conclusion: The porcine parvovirus exists in Madagascar with high prevalence. The

disease should not be neglect because of its impacts on swine reproduction. Vaccination

and risks factors control are the best way to prevent it. Farmers education should be

given about mean of preventions.

Key words: Diagnostic, Epidemiology, Porcine parvovirus, risk factors,

seroprevalence

Director of thesis: Professor RATSIMBAZAFIMAHEFA RAHANTALALAO

Henriette

Reporter of thesis: Doctor RASAMOELINA ANDRIAMANIVO Harentsoaniaina

Author’s address: Cité Universitaire Ambatomaro Bloc 202B

Nom et Prénoms : RAZAFINDRAIBE Nivohanitra Perle

Titre de la thèse: « PREMIERE DETECTION DU PARVOVIRUS PORCIN

A MADAGASCAR »

Rubrique: Epidemiologie et maladie infectieuse

Nombre de page : 60 Nombre de tableau : 17

Nombre de figure : 23 Nombre d’annexes : 6

Nombre de bibliographie : 85

RESUME

Introduction : La parvovirose porcine est l’une des causes majeures de troubles de la

reproduction chez les truies. Le Porcine parvovirus, virus responsable de la maladie est

ubiquitaire. Notre étude vise à détecter l’existence du Porcine parvovirus à Madagascar

et de déterminer les facteurs de risque associés à la parvovirose porcine.

Matériels et méthodes : Nous avons effectué une enquête transversale au niveau des

élevages porcins de type amélioré et chez les porcs en provenance d’Ambilobe dans

deux communes de la région d’Itasy. La période étudié s’étend de Mars en Avril 2013.

Une analyse sérologique des sérums de porcs issus de ces porcs ont été effectué.

Résultat : Le Parvovirus porcin circule avec une séroprévalence élevée : 78,3% des

élevages sont touchés et 66,5% des truies et cochettes. L’étude des facteurs de risques

montre que la forte prévalence est liée au nombre de porcs élevé dans l’élevage, à

l’absence de clôture autour des élevages et à la catégorie des femelles.

Conclusion : La parvovirose porcine existe à Madagascar avec une prévalence élevée.

La maladie est à ne pas négliger du fait de son impact sur la reproduction porcine. La

prévention par la vaccination et la maitrise des facteurs de risque sont les moyens de

lutte efficace contre la maladie. Des sensibilisations des éleveurs permettront de mettre

au point ces moyens de lutte.

Mots clés : Diagnostic, Epidémiologie, facteurs de risque, Parvovirus porcin,

séroprévalence

Directeur de thèse : Professeur RATSIMBAZAFIMAHEFA RAHANTALALAO

Henriette

Rapporteur de thèse : Docteur RASAMOELINA ANDDRIAMANIVO Harentsoaniaina

Adresse de l’auteur : Cité Universitaire Ambatomaro Bloc 202B

Documents

PREMIERE DETECTION DU PARVOVIRUS PORCIN A MADAGASCAR