53
PUBMED 29 novembre 2012

PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

PUBMED

29 novembre 2012

Page 2: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

PUBMEDPiattaforma di accesso alla principalebanca dati bibliografica biomedica, Medline:

• prodotta dalla U.S. National Library of Medicine (NLM)

• sviluppata dal National Center for Biotechnology Information (NCBI)

• accessibile gratuitamente via Web

Page 3: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

PUBMEDSi occupa di:

–medicina –infermieristica e discipline collaterali–odontoiatria –medicina veterinaria –scienze pre-cliniche

Page 4: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

DATI• Indicizza oltre 5500 periodici (quasi la metà

di provenienza USA)

• La copertura è prevalentemente anglosassone (91% dei lavori in inglese: circa 800 periodici in altre lingue)

• Il taglio è clinico

Page 5: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

DATI

• Inviati in maniera automatica dagli editori [PubMed - as supplied by publisher]. Sono compresi gli [Epub ahead of print]

• Presi in carico, ma non ancora indicizzati [PubMed - in process]

• La citazione completata con i MeSH, le eventuali correzioni etc etc [PubMed - indexed for MEDLINE]

Page 6: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

DATI

Il valore aggiunto di PubMed (e delle

banche dati in generale) è dato dal lavoro

umano di indicizzazione e normalizzazioneDATI

Page 7: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

RISULTATI

PubMed fornisce il record bibliografico

e, quando disponibili, l’abstract e il

full-text dell’articolo recuperato.

Page 8: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

COME ACCEDERE

Page 9: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

PUBMED: HOME PAGE

Page 10: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

RICERCA LIBERA 1.

• Dopo aver inserito il termine di ricerca, il sistema suggerisce una lista di termini a partire da quello inserito

• Non è una lista esaustiva• E’ diverso cercare un singolo termine o più termini

Page 11: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

RICERCA LIBERA 2.

• Le singole parole vengono cercate, oltre che nel thesaurus (quando ci sono) usando il campo All Fields HYPERTENSION

Page 12: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

ALL FIELDS

• Il campo “All Fields” comprende tutti i campi di ricerca meno i campi “Place of Publication” e “Transliterated Title”

• I termini fra virgolette e quelli troncati sono cercati in questo campo

Page 13: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

RICERCA LIBERA 3.• Quando digitiamo più termini nella stringa di

ricerca, PubMed attiva l’Automatic Term Mapping

• Tabelle di conversione– Mesh– Titolo della rivista– Autore/Collaboratore

Page 14: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

RICERCA LIBERA. 4• Quando i termini sono trovati all’interno di una

delle tabelle, la ricerca si ferma

• Se i termini non vengono trovati in una tabella, vengono ricercati in AND allargando molto

la ricerca (v. Search details)

Page 15: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

ESEMPIO

Knee surgery

Page 16: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

FRASE ESATTA• Usare le virgolette per trovare una frase “così come

è scritta” (es. “knee surgery”, “molecular biology” o “metabolite reproduction”)

• Usare il troncamento (es. knee surger*)

Page 17: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

TRONCAMENTO • L’asterisco * sostituisce zero o più caratteri

• Alla fine della parola: trova i termini con la stessa radice

• Esclude l’Automatic Term Mapping quindi non vengono ricercati nei Mesh

• Non si applica alle stopword– Parole che non vengono cercate

• a, an, are, be, for...

Page 18: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

FRASE ESATTA: ESEMPIO

Page 19: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

STRUMENTI PER LA RICERCA:

Il thesaurus - MESH

• Vocabolario controllato dei descrittori (sinonimi, acronimi e varianti di lingua vengono normalizzati con un unico termine)

• Strutturato ad albero

Page 20: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

STRUMENTI PER LA RICERCA:

Il thesaurus - MESH

La strategia di ricerca può avvantaggiarsi delle

seguenti opzioni:

• Major topic (termine principale)

• Esplosione o NON esplosione del termine

• Uso dei Sotto descrittori

Page 21: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

STRUMENTI PER LA RICERCA:

Il thesaurus - MESH

• Vantaggi:

– I sinonimi sono inclusi nella ricerca

– Gli articoli trovati sono pertinenti

Page 22: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

I SOTTODESCRITTORI: Mesh subheadings

• Ad ogni termine del thesaurus corrispondono solo i subheadings che lo riguardano

• Riducono il numero di record recuperati secondo l’intenzione di chi ricerca

Page 23: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

STRUMENTI PER LA RICERCA:

Il thesaurus

• Quando ricercare nel thesaurus:– Argomento consolidato (v. tempi di attribuzione dei

descrittori) – I sinonimi sono inclusi nella ricerca – Gli articoli trovati sono pertinenti

• E’ sempre consigliato fare anche la ricerca libera

Page 24: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

RICERCA PER DESCRITTORI 1:

Mesh database

Page 25: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

RICERCA PER DESCRITTORI 2:

Mesh database

Page 26: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

RICERCA PER

DESCRITTORI 3.

Page 27: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

RICERCA PER DESCRITTORI 4.

– Subheadings

– Major topic

– Explosion

– Entry terms (sinonimi)

– Ricercare tramite Search builder

Page 28: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

PAUSA

Page 29: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

CONSIGLIO

• Cercare un termine alla volta

• Unire i termini tra loro con gli operatori booleani

Page 30: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

OPERATORI BOOLEANI

• AND

• OR

• NOT

Page 31: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

ESECUZIONE DEI BOOLEANI 1.

• Il primo operatore da sinistra è eseguito per primo

– influenza AND vaccine OR vaccination

• articoli che contengono sia "influenza" sia "vaccine"

• articoli con "vaccination"

Page 32: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

ESECUZIONE DEI BOOLEANI 2.

• Le parentesi modificano l’ordine di ricerca: i termini fra parentesi sono eseguiti per primi e poi combinati con gli altri

– influenza AND (vaccine OR vaccination)

• “influenza” e “vaccine”

• “influenza” e “vaccination”

Page 33: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

COMBINARE I PASSI DELLA RICERCA

Page 34: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

AMPLIARE LA RICERCA:

Related citations

Page 35: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

LIMITARE LA RICERCA

Page 36: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

LIMITARE LA RICERCA:

Clinical Queries

Page 37: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

LIMITARE LA RICERCA:

Clinical Queries

Page 38: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

VISUALIZZARE I RISULTATI

Page 39: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

FORMATO ABSTRACT con link al full text e a

TROVAMI

Page 40: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

SCARICARE LA VERSIONE ELETTRONICA

Page 41: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

SALVARE I RISULTATI• Send to File• Send to Collections • Send to Order • Citation manager• Send to Clipboard • Send to E-mail• Send to My Bibliography

Page 42: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

SALVARE I RISULTATI:

la clipboard

Page 43: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

SALVARE I RISULTATI:

la clipboard• La Clipboard è un luogo nel quale posso

temporaneamente collocare i miei risultati

• Elimina automaticamente i duplicati

• Nella clipboard posso fare le stesse operazioni consentite nella Main Search Page

Page 44: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

SALVARE I RISULTATI:

la clipboard

• Contiene fino a un massimo di 500 record

• Dal momento in cui smetto di lavorare, resta disponibile per 8 ore

Page 45: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

CITATION SENSOR• Cerca le citazioni bibliografiche a partire dai termini inseriti in libera • Gli articoli trovati dal Citation sensor sono evidenziati

in testa alla lista dei risultati– Smith 2009

Page 46: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

GENE SENSOR • Gene Sensor riconosce i circa 5mln di geni del database Gene; se ne

individua uno nella stringa di ricerca, offre, in un riquadro primo fra i risultati, link a informazioni specifiche in Gene database– a2m liver

Page 47: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

SINGLE CITATION MATCHER

• Per completare citazioni parziali

• Si può compilare anche un solo campo

Page 48: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

MY NCBI

Page 49: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

REGISTRAZIONE

Page 50: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

MY NCBI

Page 51: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

MY NCBI

Page 52: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

CUSTOMIZE THIS PAGE

Page 53: PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica biomedica, Medline: prodotta dalla U.S. National Library

NCBI SITE PREFERENCES