¿Qué espera un clínico de la biopsia líquida?Aplicaciones ...basesbiologicascancer.com/.../2018/05/Jueves_6.2_Dr.CesarRodrigu… · • El Mapa Genético del Cáncer en un individuo

Coordinación científica:

Dr. Rafael López López

Complejo Hospitalario Universitario de Santiago de

Compostela

Organizado por: Sede:

San Francisco Hotel Monumento

Campillo de San Francisco, 3 - Santiago de

Compostela

César A. Rodríguez

Hospital Universitario de Salamanca-IBSAL

¿Qué espera un clínico de la biopsia

líquida?Aplicaciones reales y potenciales de la Biopsia

Líquida

C. A. Rodríguez Biopsia Líquida 2018

Introducción

Ventajas Clásicas de la Biopsia Diagnóstica vs Biopsia Convencional

Biopsia “estándar”

• Invasiva • Difícil de obtener en algunas localizaciones

• Costosa • Mayor tiempo de procesamiento • Proporción alta de fallo diagnóstico (Tumor insuficiente o ausente) • Dificultad para la realización de biopsias

seriadas a lo largo de la enfermedad • Deterioro de las muestras con el

almacenamiento prolongado • Limitaciones en el análisis de la

Heterogeneidad Tumoral • Dificultad para la evaluación de la

Respuesta al Tratamiento

Biopsia Líquida

• Mínimamente Invasiva • Fácil obtención de la muestra (sangre,

orina, saliva…) • Reducción de Costes • Procesamiento más corto • Baja proporción de fallos • Posibilidad de realización de estudios

seriados a lo largo del proceso. • Mantenimiento de las muestras durante

largos periodos de tiempo • Permite analizar la Heterogeneidad

Tumoral • Permite la evaluación de la Respuesta al

Tratamiento de forma sencila


Murtaza, M. et al. Nat. Commun. 6, 8760 (2015).

Introducción

• El Perfil Molecular de los

tumores evoluciona de forma dinámica a lo largo del tiempo.

• El Mapa Genético del Cáncer en

un individuo es habitualmente heterogeneo:

• En un paciente único, las

lesiones metastásicas pueden ser molecular-mente divergentes.

• El estrés terapéutico sobre

las células tumorales puede modificar dinamicamente el “mapa” genómico de los tumores.


Introducción


Introducción


Siravegna G, et al. Nature Rev Clin Oncol 2017

Introducción


Aplicaciones de la Biopsia Líquida

durante el curso de la Enfermedad


Biopsia Líquida y

Diagnóstico Precoz


Biopsia Líquida y

Diagnóstico Precoz


Pronóstico &

Enfermedad Residual


Pronóstico &

Enfermedad Residual


Tie et al. Sci Transl Med 2016

Pronóstico &

Enfermedad Residual


Selección del Tratamiento &

Monitorización de Respuesta





Longitudinal monitoring during the course of targeted therapy

CDKN2A p.S12*

AKT1 p.E17K

TP53 p.K132N

JAK3 p.T21M

TSC1 p.S1046C

NF1 p.V2420fs

CDH1 p.159_171P

MLL3 p.G292E

CTNNB1 p.A522G

PIK3C2G p.K978N

GATA1 p.K315N

EPHB1 p.I332M

ESR1 p.E380Q

PAK7 p.E494*

MAP2K2 p.E207Q

FLT4 p.R282Q

0

20

40

60

80

100

Mu

tan

t A

llele

Fra

ction (

%)

CDKN2A p.S12*

AKT1 p.E17K

TP53 p.K132N

JAK3 p.T21M

TSC1 p.S1046C

NF1 p.V2420fs

CDH1 p.159_171P

MLL3 p.G292E

CTNNB1 p.A522G

PIK3C2G p.K978N

GATA1 p.K315N

EPHB1 p.I332M

ESR1 p.E380Q

PAK7 p.E494*

MAP2K2 p.E207Q

FLT

4 p.R282Q

0

20

40

60

80

100

Muta

nt A

llele

Fraction (

%)

Liver Metastasis

CDKN2A p.S12*

AKT1 p.E17K

TP53 p.K132N

JAK3 p.T21M

TSC1 p.S1046C

NF1 p.V2420fs

CDH1 p.159_171P

MLL3 p.G292E

CTNNB1 p.A522G

PIK3C2G p.K978N

GATA1 p.K315N

EPHB1 p.I332M

ESR1 p.E380Q

PAK7 p.E494*

MAP2K2 p.E207Q

FLT4 p.R282Q

0

20

40

60

80

100

Muta

nt A

llele

Fra

ction (

%)

Plasma 1

CDKN2A p.S12*

AKT1 p.E17K

TP53 p.K132N

JAK3 p.T21M

TSC1 p.S1046C

NF1 p.V2420fs

CDH1 p.159_171P

MLL3 p.G292E

CTNNB1 p.A522G

PIK3C2G p.K978N

GATA1 p.K315N

EPHB1 p.I332M

ESR1 p.E380Q

PAK7 p.E494*

MAP2K2 p.E207Q

FLT4 p.R282Q

0

20

40

60

80

100

Muta

nt A

llele

Fra

ction (

%)

Plasma 2

CDKN2A p.S12*

AKT1 p.E17K

TP53 p.K132N

JAK3 p.T21M

TSC1 p.S1046C

NF1 p.V2420fs

CDH1 p.159_171P

MLL3 p.G292E

CTNNB1 p.A522G

PIK3C2G p.K978N

GATA1 p.K315N

EPHB1 p.I332M

ESR1 p.E380Q

PAK7 p.E494*

MAP2K2 p.E207Q

FLT4 p.R282Q

0

20

40

60

80

100

Muta

nt A

llele

Fra

ction (

%)

Plasma 3

CDKN2A p.S12*

AKT1 p.E17K

TP53 p.K132N

JAK3 p.T21M

TSC1 p.S1046C

NF1 p.V2420fs

CDH1 p.159_171P

MLL3 p.G292E

CTNNB1 p.A522G

PIK3C2G p.K978N

GATA1 p.K315N

EPHB1 p.I332M

ESR1 p.E380Q

PAK7 p.E494*

MAP2K2 p.E207Q

FLT4 p.R282Q

0

20

40

60

80

100

Muta

nt A

llele

Fra

ction (

%)

Plasma 4

Baseline

2 months

6 months

Disease progression

Pac

litax

el-bas

ed

Anthrac

yclin

e-ba

sed

Cap

ecita

bine

-bas

e

AKT inhibitor

MAF > 50%

MAF 20 - 50%

MAF 5 - 20%

MAF < 5%

MAF: Mutant Allele Fraction

Figure 1

Primary Tumor

Primary breast tumour

Liver Metastasis

De Mattos-Arruda Annals Oncol 2014

Genes

Genes

Mutant

Allele

Fraction

%

Mutant

Allele

Fraction

%




Monitoring Clonal Evolution in Colorectal Cancer with Liquid Biopsy Siravegna G, et al. Nature Rev Clin Oncol 2017




Fribbens et al JCO, 2015













Baselga et al SABCS, 2015




Monitoring Clonal Evolution

& Treatment Decisions

Wan JCM et al Nat Rev Cancer 2017


Monitoring Clonal Evolution

& Treatment Decisions

EGFR T790M mutation in

NSCLC High concordance but

faster detection in ctDNA

Sacher et al JAMAOncol 2016


Conclusiones


+ Hofman P, et al. Virchows Archiv. 2016;469:601-609. ++ Zhang W, et al. Cell Physiol Biochem 2017; 41:755-768

• Lack of standard and convenient techniques • Test variability and assay sensitivity and specificity • Lack of consensus in technical approaches of choice • Absence of information concerning histology or proliferation index • Absence of information concerning tumor microenviroment • Difficulty in sistematically performing immunocytochemistry and in situ

hybridation (CTCs) • Potentially miss biomarkers expressed in the tumor

• Finally, although many studies have been performed to prove the clinical utility, most were retrospective, so more rigorous studies are required to validate the substantial potential of liquid biopsy.

Limitaciones y Desventajas

de la Biopsia Líquida


Limitaciones y Desventajas

de la Biopsia Líquida


Limitaciones y Desafíos Actuales Numerosas

Ventajas Reales y Potenciales

Indudable Presente y Futuro

(inmediato) Prometedor

Conclusiones


Documents

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