Recursos de Supercomputación en BSC-CNS, RES … · Recursos de Supercomputación en BSC-CNS, RES & PRACE Sergi Girona . Servicios HPC en Europa 2 TIER-0 Centros europeos ... SO

www.bsc.es

Barcelona, September 12th 2013

Recursos de Supercomputación en

BSC-CNS, RES & PRACE

Sergi Girona

Servicios HPC en Europa

2

TIER-0

Centros europeos

TIER-1 Centros nacionales

TIER-2 Centros regionales y

universidades

+ C

apacid

ad

+ E

quip

os

BARCELONA

SUPERCOMPUTING CENTER

Barcelona Supercomputing Center Centro Nacional de Supercomputación

BSC-CNS objectives: – R&D in Computer, Life, Earth and Engineering Sciences

– Supercomputing services and support to Spanish and

European researchers

BSC-CNS is a consortium that includes: – Spanish Government 51%

– Catalonian Government 37%

– Universitat Politècnica de Catalunya (UPC) 12%

+300 people, 40 countries

4

BSC STAFF 2012 Funding from Personnel Grants 2012

5

EARTH SCIENCES

To develop and implement

global and regional state-

of-the-art models for

short-term air quality

forecast and long-term

climate applications

LIFE SCIENCES

To understand living

organisms by means of

theoretical and

computational methods

(molecular modeling,

genomics, proteomics)

CASE

To develop scientific and

engineering software to

efficiently exploit super-

computing capabilities

(biomedical, geophysics,

COMPUTER

SCIENCES

To influence the way

machines are built,

programmed and used:

programming models,

performance tools, Big

Data, computer

atmospheric, energy,

social and economic simulations)

architecture, energy efficiency

Mission of BSC Scientific Departments

MareNostrum 3

6

48,896 Intel SandyBridge cores at 2.6 GHz

84 Intel Xeon Phi

Peak Performance of 1.1 Petaflops

100.8 TB of main memory

2 PB of disk storage

8.5 PB of archive storage

9th in Europe, 29th in the world (June 2013 Top500 List)

BSC at a glance

Solid Partnerships with Industry

- Repsol, Microsoft, IBM, Intel, Iberdrola, NVIDIA, Samsung - Leading role in ETP4HPC

Computer Sciences

- Architecture, Programming Models, Tools, Cloud and Grid

Education & Training

- UPC, PATC, BMW, Pumps

National & European HPC Infrastructure

- Spanish national HPC lab - PRACE Tier-0 Hosting Partner

Bridge to Latin America

- Extensive network of contacts - Coordinator, RISC and OpenBio projects

+300 staff from +40 countries

- Participation in 79 FP6/7 projects, 14 as coordinator

Key European Research partner

One of only 13 centres recognised with prestigious Severo Ochoa award for excellence

Life Sciences

- Molecular and protein modelling, computational genomics etc.

Earth Sciences

Atmospheric processes and climate change modelling

Computer Applications

- Simulation of complex problems on High Performance Computers

RED ESPAÑOLA

DE SUPERCOMPUTACIÓN

9

RES

La RES es una

infraestructura virtual

distribuida consistente en la

interconexión de

supercomputadores que

gestionan su capacidad de

cálculo y proporcionan

servicio a investigadores

españoles.

RES: Máquinas – MareNostrum3

10

Rendimiento

pico

1,1 PFLOPS

Procesador 6.112 8-core Intel SandyBridge

EP E5-2670/1600 20M 2.6GHz

84 Xeon Phi 5110 P

Memoria 100,8 TB

Disco 2000 TB

Redes Infiniband FDR10, GbE

SO SUSE Linux ES

Equipamiento financiado a través de:

RES: Máquinas – MinoTauro

11

Rendimiento pico 185,78 TFLOPS

Procesador 256 M2090 NVIDIA GPU

256 Intel E5649 2,53 GHz 6-core

Memoria 3 TB

Disco 31 TB

Redes Infiniband QDR, 10 GbE

SO ReddHat Linux

RES: Máquinas – Magerit2

12


Procesador 3.920 IBM Power7 3.3

Memoria 8700 GB

Disco 190 TB

Redes Infiniband, GbE

SO Linux

RES: Máquinas – Altamira2

13

Rendimiento pico 52 TFLOPS

Procesador 316 Intel Xeon CPU E5-2670

2,60GHz

Memoria 10112 GB

Disco 14 TB

Redes Infiniband

SO Scientific Linux 6.2

RES: Máquinas – LaPalma2

14


Procesador 1.024 IBM PowerPC 970

2.3GHz

Memoria 2 TB

Disco 14 + 10 TB

Redes Myrinet, GbE, 10/100

SO SUSE Linux

RES: Máquinas – Tirant2

15


Procesador 2048 IBM PowerPC 970

2.3GHz

Memoria 2 TB

Disco 56 + 40 TB


SO SUSE Linux

RES: Máquinas – Atlante

16


Procesador 336 IBM PowerPC 970 2.3GHz

Memoria 672 GB

Disco 3 + 90 TB


SO SUSE Linux

RES: Máquinas – Picasso

17

Rendimiento pico 63 TFLOPS

Procesador 82 AMD Opteron 6176

96 Intel E5-2670

56 Intel E7-4870

32 GPUS Nvidia Tesla

M2075

Memoria 21 TB

Disco 600 TB Lustre + 260

TB


SO SUSE Linux

RES: Máquinas – Caesaraugusta

18

Rendimiento

pico

25,8 TFLOPS

Procesador 3072 AMD Opteron 6272

2.1GHz

Memoria 12,5 TB

Disco 36 TB Lustre


SO Scientific Linux

RES: Solicitud de acceso

19

Solicitud, protocolo de acceso y publicación de convocatorias cada 4 meses en

www.bsc.es/RES

RES: Soporte

20

Optimización de

código

Paralelización y escalabilidad

Optimización de E/S

Portabilidad

Depuración

Almacenamiento de datos

Difusión científica

Organización de jornadas, cursos y seminarios

Actividades de test

RES: Proceso de revisión de solicitudes

Solicitud

Revisión Técnica

Revisión Científica

Priorización por el Comité de Acceso

Proyecto

evaluado

ANEP

NO

SI

Publicación de evaluación:

Actividades con prioridad

Actividades sin prioridad

Actividades sin acceso

RES: Solicitudes, acceso y consumo

22

0

10000

20000

30000

40000

50000

60000

70000

80000

90000

100000

2006

P2

2006

P3

2006

P4

2007

P1

2007

P2

2007

P3

2008

P1

2008

P2

2008

P3

2009

P1

2009

P2

2009

P3

2010

P1

2010

P2

2010

P3

2011

P1

2011

P2

2011

P3

2012

P1

2012

P2

2012

P3

2013

P1

2013

P2

Kh concedidas Kh consumidas Kh solicitadas

* En 2013 se contabilizan sólo los 2 primeros periodos de acceso (el 2º aún sin finalizar ) debido a que aún no ha terminado el año.

RES: Volumen de actividades

23

12

45

49

37

39

46

45

28

26

20

62

70

74

78

66

66

33

37

19

61

83

79

68

65

57

37

47

21

68

96

81

60

85

99

64

71

0 50 100 150 200 250 300 350

2005

2006

2007

2008

2009

2010

2011

2012

2013

AECT

BCV

MFE

QCM

Proyectos

Anualidad

1.994 actividades desde 2005

* En 2005 RES solo proporcionó recursos durante 3 meses.

** En 2012 MN no prestó servicio durante 3 meses debido a su proceso de renovación.

*** En 2013 se contabilizan sólo los 2 primeros periodos de acceso debido a que aún no ha finalizado el año.

PARTNERSHIP FOR

ADVANCED COMPUTING IN EUROPE

PRACE: Infraestructura para la investigación

25

PRACE: Objetivos

26

PRACE: Máquinas – FERMI (IBM BG/Q)

27

Rendimiento pico 2,1 PFLOPS

Procesadores 10.240 16-core IBM PowerA2

1.6 GHz

Memoria 160 TB

Disco 2 PB

Redes 5D Torus, GbE

SO Red-Hat EL 6.2

PRACE: Máquinas – CURIE (BullX cluster)

28

Rendimiento pico 2 PFLOPS

Procesadores 1440 8-core Intel Nehalem-EX

X7560 2.26 GHz

10080 8-core Intel Sandy

Bridge EP (E5-2680) 2.7 GHz

288 Intel Westmere 2.66 GHz

288 Nvidia M2090 T20A

Memoria 360 TB

Disco 5 PB

Redes Infiniband QDR, GbE

SO Linux

PRACE: Máquinas – JUQUEEN (IBM BG/Q)

29


Procesadores 28.672 16-core IBM

PowerPC A2 1.6 GHz

Memoria 448 TB

Disco 15,1 PB

Redes 5D Torus, GbE

SO CNK, lightweight proprietary

kernel

PRACE: Máquinas – HERMIT (CRAY XE6)

30


Procesadores 7.104 16-core Dual Socket

AMD Interlagos 2.3GHz

Memoria 126 TB (32-64 GB/node)

Disco 2,7 PB

Redes CRAY Gemini, GbE

SO Cray Linux Environment (CLE)

PRACE: Máquinas – MareNostrum (IBMx iDataPlex)

31

Rendimiento

pico

1,1 PFLOPS

Procesador 6.112 8-core Intel SandyBridge

EP E5-2670/1600 20M 2.6GHz

84 Xeon Phi 5110 P

Memoria 100,8 TB

Disco 2 PB

Redes Infiniband FDR10, GbE

SO SUSE Linux ES

Equipamiento financiado a través de:

PRACE: Máquinas – SuperMUC (IBMx iDataPlex )

32

Rendimiento pico 3.2 PFLOPS

Procesadores 18.432 8-core Sandy Bridge-

EP Intel Xeon E5-2680

820 10-core Westmere-EX

Intel Xeon E7-4870

Memoria >300 TB

Disco 10 PB

Redes Infiniband FDR10

SO SLES

PRACE: Tipos de convocatoria

33

Acceso Preparatorio

Acceso Regular

Acceso como Programa

PRACE: Convocatorias vigentes

34

PRACE: Solicitud de acceso

35

Solicitud:

https://prace-peer-review.cines.fr

PRACE: Proceso de revisión de solicitudes

36

Solicitud

Revisión Técnica

Revisión Científica

Priorización por el Panel de Expertos

Comentarios al solicitante

Réplica del solicitante

Acceso a

recursos

Comunicación y asignación de

recursos Comunicación de feedback

NO SI

Proceso en Regular Calls

Proceso en Preparatory Calls

Proceso en todo tipo de Call

PRACE: Soporte a través del BSC-CNS/ RES

37

Ayuda en la preparación de solicitudes

Transferencia de datos durante y después del acceso

Pruebas de escalabilidad

Portabilidad de código

Evaluación del rendimiento de aplicaciones

Formación en los PRACE Advanced Training Center

Resumen de enlaces

38

www.bsc.es/RES

https://prace-peer-review.cines.fr

http://www.bsc.es/hpc-events-trainings

http://www.bsc.es/marenostrum-support-services/hpc-trainings/prace-trainings

http://www.training.prace-ri.eu

www.bsc.es

Gracias!

39

Next year, save the dates

PRACEdays14, “When Science meets industry”

– User Forum, Industry, Science

– May 20-22, 2014

– Barcelona

8a Jornada de Usuarios de la RES

– September 2014 (9-10?)

– Suggestions?

Documents

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