Upload
pol-malia
View
217
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
7/25/2019 Selecia asistat de markeri genetici la ovine- Paula Stan.docx
1/11
Selecia asistat de markeri genetici la ovine
Stan Cornelia Paula
1
7/25/2019 Selecia asistat de markeri genetici la ovine- Paula Stan.docx
2/11
Cluj-Napoca
2016
1. Introducere
Selec ia asistat de markeri sau selec ia asistat de marcare (MAS) este un proces prin care un marker (morfologic, biochimic sau unul bazat pe o varia ie de ADNA!N) este utilizatpentru selec ia indirect a unui factor determinant sau determinan i ai unei trsturi de interes"
#eneficiile selec iei asistate de makeri genetici (MAS) la cre terea ovinelor depind de un numr de condi ii relevante pentru ma$oritatea programelor de reproducerecre tere" Aceste condi ii includ e%isten a unui genotip test care prezice diferen ele fenotipice, valoarea economic a acestor diferen e i valoarea informa iei genotipice &n cadrul programului de reproduc iecre tere" 'aloarea informa iei genetice va depinde &n mare msur de conte%tul socioeconomic al programului de reproducerecre tere i de sistemul de produc ie" ntrun sens tehnic, valoarea acestei informa ii este, &n principiu condus de ctre cre terea preciziei de selec ie care rezult din cunoa terea de genotipuri, care la r*ndul su, va fi diferit &ntre animale de la diferite clase de v*rst" n particular, cre terea relativ a preciziei acurate ei selec iei a candida iilor tineri vor fi critice pentru valoarea selec iei asistate de markeri genetici"
Selec ia asistat de markeri este util mai ales pentru trsturi care nu pot fi &mbunt ite cu u urin prin selec ia fenotipic, fie pentru ca acestea sunt dificile de msurat pe animalele tinere (&naintea reproducerii se%uale), fie din cauza heritabilit ii sczute" +rin urmare obiectivelede cre tere sunt discutate &n termeni generali i trsturile potrivite &n mod particular pentru MAS sunt identificate"
2. Trsturi de interes vizate la ovine
+rogramele de reproducerecre tere pentru ovine opereaz, &n general, &ntro industrie
care este bazat pe un nivel sczut de intrri de resurse , adic niveluri sczute de hrnire icosturi reduse a for ei de munc per cap de animal"
substan ial propor ie din produc ia de ovine se gse te &n rile dezvoltate precum Australia, -ran a, Noua .eeland, Africa de Sud i Anglia" Aceste sisteme sunt, deasemenea, bazate predominant pastoral i e%tensiv &n natur"
2
7/25/2019 Selecia asistat de markeri genetici la ovine- Paula Stan.docx
3/11
/nstitutul 0uropean de #ioinformatic (0M#10#/), mai e%act pe siteul M/!/AM!egistr2 (http3444"ebi"ac"ukmiriammaintagsM/!355655578) ne ofer mai multe linkuri cubaze de date pentru locile trsturilor cantitative de origine animal"Aceste baze de date a locilortrsturilor cantitative de origine animal (9he Animal :uantitative 9rait 1oci database Animal:91db) sunt concepute pentru a gzdui &n mod public toate datele disponibile despre :91 i
polimorfismul unei singure nucleotide date de asociere a genei asupra speciilor de animale"Aceste baze de date sunt pe specii3 bovine (Animal ;enome
7/25/2019 Selecia asistat de markeri genetici la ovine- Paula Stan.docx
4/11
9op C :91 asociate
(http3444"animalgenome"orgcgibin:91dbAsummar2 )
4
http://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/OA/summaryhttp://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/OA/summaryhttp://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/OA/summary7/25/2019 Selecia asistat de markeri genetici la ovine- Paula Stan.docx
5/11
Numrul de :91 asociate tipurilor de trsturi
5
7/25/2019 Selecia asistat de markeri genetici la ovine- Paula Stan.docx
6/11
(http3444"animalgenome"orgcgibin:91dbAsummar2=summ?t2peFGtl?,B8Fpub?@Ftrait?758 )
Numrul de :91 asociate claselor de trsturi
6
http://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/OA/summary?summ=type&qtl=1,173&pub=114&trait=203http://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/OA/summary?summ=type&qtl=1,173&pub=114&trait=203http://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/OA/summary?summ=type&qtl=1,173&pub=114&trait=2037/25/2019 Selecia asistat de markeri genetici la ovine- Paula Stan.docx
7/11
(http3444"animalgenome"orgcgibin:91dbAsummar2=summ?clasFGtl?,B8Fpub?@Ftrait?758 )
Numrul de :91 asociate cromozomilor
(http3444"animalgenome"orgcgibin:91dbAsummar2=summ?chroFGtl?,B8Fpub?@Ftrait?758 )
7
http://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/OA/summary?summ=clas&qtl=1,173&pub=114&trait=203http://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/OA/summary?summ=clas&qtl=1,173&pub=114&trait=203http://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/OA/summary?summ=clas&qtl=1,173&pub=114&trait=203http://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/OA/summary?summ=chro&qtl=1,173&pub=114&trait=203http://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/OA/summary?summ=chro&qtl=1,173&pub=114&trait=203http://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/OA/summary?summ=clas&qtl=1,173&pub=114&trait=203http://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/OA/summary?summ=clas&qtl=1,173&pub=114&trait=203http://www.animalgenome.org/cgi-bin/QTLdb/OA/summary?summ=chro&qtl=1,173&pub=114&trait=2037/25/2019 Selecia asistat de markeri genetici la ovine- Paula Stan.docx
8/11
2.1 Ovine pentru producie de carne
+rogramele de evaluare genetic pe scar larg pentru ovine se gsesc &n Australia,-ran a, Noua .eeland, Africa de Sud i Anglia" n aceste ri, performan a de &nregistrare pentru
trsturile de carne este destul de avansat, nu numai cu trsturi de greutate msurate, dardeasemenea trsturi legate de calitatea carcasei, cum ar fi esutul adipos i mu chi (bazat pe scanare cu ultrasunete i, &n unele cazuri, scanare tomografic computerizat (
7/25/2019 Selecia asistat de markeri genetici la ovine- Paula Stan.docx
9/11
au fost concludente" mpreun cu frecven e nefavorabile de alele, aceste rezultate fac pu in probabil ca aceste polimorfisme sa fie foarte utile &ntrun program MAS"
2. 3 Ovine pentru producie de ln
!eproduc ia cre terea pentru i &nregistrarea trsturilor de l*n este limitat la c*teva ri"
7/25/2019 Selecia asistat de markeri genetici la ovine- Paula Stan.docx
10/11
Scopul programelor e%perimentale MAS este de a demonstra c pot fi realizate modificrigenetice &n func ie de selec ie genotipic i, prin urmare, s &ncura$eze absorb ia MAS de ctre cresctori comerciali" Deobicei programele sunt deasemenea proiectate, fie pentru a estimaefectele :91 mai clar, fie pentru a confirma rezultatele e%perimentale anterioare&n efectivele dinindustrie"
0%emple de astfel de programe MAS3
Selectarea ovinelor &mpotriva suscebilit ii la scrapie, realizate &n -ran a i Anglia Selec ia asistat de markeri la vine comerciale (MAS Applied to
7/25/2019 Selecia asistat de markeri genetici la ovine- Paula Stan.docx
11/11
7" M/!/AM !egistr2 http3444"animalgenome"orgcgibin:91dbAontrait=trait>/D?87@
8" M/!/AM !egistr2 http3444"animalgenome"orgcgibin:91dbAsummar2@" M/!/AM !egistr2 http3444"animalgenome"orgcgibin:91dbAsummar2=
summ?t2peFGtl?,B8Fpub?@Ftrait?758
C" M/!/AM !egistr2 http3444"animalgenome"orgcgibin:91dbAsummar2=summ?clasFGtl?,B8Fpub?@Ftrait?758
6" M/!/AM !egistr2 http3444"animalgenome"orgcgibin:91dbAsummar2=summ?chroFGtl?,B8Fpub?@Ftrait?758
B" -reking, #"A" i colab" 7557" /dentification of the single base change causing thecallip2ge muscle h2pertroph2 phenot2pe, the onl2 kno4n e%ample of polaroverdominance in mammals" Genome Res.
E"